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PulseNet en la atención de
Enfermedades Transmitidas por
Alimentos
Comisión de Control Analítico y Ampliación de Cobertura
Fecha: 4 de Mayo 2017
Contenido
Enfermedades Transmitidas por Alimentos (ETA) Las ETA, son un problema cada vez más importante a nivel internacional y en cada uno de los países
debido, entre otras cosas, al intercambio comercial y al intenso movimiento de las personas.
Algunos patógenos bacterianos implicados en las ETA son:
• Salmonella
• Vibrio cholerae
• Clostridium botulinum
• Staphylococcus aureus
• Los emergentes: Escherichia coli O157,
Listeria monocytogenes y
Campylobacter spp.
El elemento clave para el reconocimiento y control de brotes es la capacidad de análisis de los
patógenos:
AISLADOS DE HUMANOS FUENTES DE CONTAMINACIÓN
Para ello, se requieren metodologías de biología molecular que permiten establecer la relación del
DNA entre las bacterias aisladas y determinar el grado de identidad genético entre ellas para
identificar el agente infeccioso causal de la patología y la fuente de infección.
Denominación
Genérica: Subtipificación molecular
Estrategias Analíticas para la Atención a ETAs
El Centro para el Control de las Enfermedades (CDC), de USA ha desarrollado desde el año de 1996
una Red Nacional de Sub-tipificación Molecular para la vigilancia de las ETA, que se denomina PulseNet.
PulseNet se basa en la utilización de un proceso denominado electroforesis en campo pulsado
(PFGE) que facilita la migración de fragmentos de DNA a través del gel de agarosa como consecuencia de un cambio constante del campo eléctrico durante la electroforesis.
Creación de la Red PulseNet Internacional
Electroforesis en Campos Pulsados
PulseNet Internacional Desde el año 2000 se han creado redes PulseNet en todo el mundo, de tal forma que en la
actualidad la Red PulseNet internacional se encuentra conformada por 88 países miembros de las
siguientes siete regiones: África, la región Asia-Pacífico, Canadá, Europa, América Latina y Caribe,
Medio Oriente y Estados Unidos.
Propósito y misión de PulseNet Internacional
El propósito de PulseNet Internacional es salvar vidas y reducir las pérdidas sociales y económicas
mundiales causadas por las enfermedades transmitidas por el agua y los alimentos.
Su misión es mantener redes mundiales de laboratorios regionales y nacionales que utilicen métodos
normalizados de genotipificación y compartan inmediatamente la información con el fin de mejorar la
vigilancia y alertar prontamente de los brotes de enfermedades transmitidas por agua y alimentos,
los patógenos emergentes y los actos de bioterrorismo.
Objetivos de PulseNet Internacional
Sus objetivos consisten en participar en la investigación de brotes de infecciones transmitidas por los
alimentos y facilitar el pronto reconocimiento de los conglomerados de casos de esas enfermedades
que puedan representar brotes de fuentes comunes mediante la vigilancia molecular de las
infecciones en el ámbito mundial a través de:
• Alianzas con los laboratorios de referencia de todo el mundo.
• El aumento de la capacidad de vigilancia molecular de las infecciones transmitidas por los
alimentos.
• La colaboración en el desarrollo, validación y aplicación de los métodos de subtipificación
normalizados a nivel mundial que se utilizarán en las redes.
• La realización de estudios colaborativos sobre la distribución y propagación geográfica de
diferentes clones de patógenos transmitidos por los alimentos.
Funcionamiento de PulseNet
Los participantes en PulseNet determinan mediante PFGE la huella genética de bacterias patógenas
aisladas en seres humanos y en fuentes ambientales, alimentos y animales sospechosos, utilizando
para ello equipos y métodos normalizados. Una vez que se han obtenido los patrones de PFGE, se
introducen en una base de datos electrónica local de huellas genéticas. Los participantes certificados
en PulseNet envían sus resultados directamente a un servidor central de su país o región, y comparten
informaciones en su foro de debate regional de PulseNet.
De esta forma, PulseNet desempeña un importante papel en la detección de brotes geográficamente
dispersos.
En 2010 se Implementó la técnica de
Electroforesis en Gel de Campos Pulsados
(Pulse-Field Gel Electrophoresis - PFGE) en el
Instituto de Diagnóstico y Referencia
Epidemiológicos (InDRE).
Integración de México a PulseNet
Pulsenet AL y C es coordinada por la Organización Panamericana de la
Salud (OPS/OMS), y el Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas
(ANLIS) "Dr.Carlos G. Malbrán, de Argentina
Red PulseNet México
Estructura Orgánica:
• Administrador de la Base de Datos para cada microorganismo
• Miembros certificados ante la Red
• Coordinación Técnica
– InDRE
– SENASICA
– COFEPRIS
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✓ Iniciativa que ha sido apoyada por OPS/OMS y tomada como ejemplo de armonización
intersectorial en la región.
✓Reglamento de Funcionamiento de la Red PulseNet para América Latina y el Caribe.
Art. 19. “Cada miembro de la red promoverá la creación de redes de subtipificación en
cada uno de los países miembros”.
✓ El InDRE es el coordinador de los trabajos para la creación de la Red Mexicana, lo que
incluye el proceso de certificación de SENASICA y COFEPRIS, en la Red
Latinoamericana y del Caribe.
Conformación Red PulseNet México
Los componentes:
I. Los sistemas nacionales de vigilancia epidemiológica, monitoreo de contaminantes de
alimentos.
II. La coordinación de la Red PulseNet MEX responsable de la comunicación, la supervisión de
las actividades de la red, del programa de capacitación y de la creación y mantenimiento del
sistema de calidad.
III. Un sistema de comunicación a través de reuniones periódicas
IV. Un programa de capacitación continúo.
V. Un programa de certificación y verificación periódica del desempeño de los laboratorios
relativos a la red de PulseNet Mex, realizadas de acuerdo a protocolos estandarizados y
validados.
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Red PulseNet México
Misión
Contribuir a reducir el impacto en salud, económico y social de las
ETA mediante el uso de técnicas moleculares de subtipificación
integradas a los sistemas de vigilancia epidemiológica del país.
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Red PulseNet México
Objetivos:
I. Fortalecer la capacidad de detección e investigación de brotes de ETA, la
identificación de fuentes de contaminación, vehículos y rutas de diseminación
II. Apoyar el reconocimiento y la detección temprana de patógenos emergentes
III. Fortalecer las capacidades nacionales en la vigilancia de ETA, facilitando la
capacidad de respuesta de los miembros de la Red
IV. Promover la comunicación entre los miembros de la Red
V. Fortalecer la cooperación técnico-científica entre los miembros de la Red.
VI. Facilitar la generación e intercambio de información entre las instancias en la
vigilancia, monitoreo e investigación de brotes.
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Red PulseNet México
• Asistencia y apoyo de la Q.B.P. Guadalupe Adriana Galicia Nicolás, a curso
Bionumerics dirigido a personal de SENASICA y COFEPRIS. Mayo 2015.
• 1er Simposium Internacional de Secuenciación de Nueva Generación. Mayo de
2015.
• Desarrollo de Lineamientos para la Red Mexicana de PulseNet. InDRE-SENASICA-
COFEPRIS. Julio de 2015.
• 2° Curso -Taller de Secuenciación Masiva de Genomas Bacterianos. Agosto 2015
• Solicitud de COFEPRIS y SENASICA a InDRE para la obtención de cepas de
Salmonella spp para certificación de PFGE. Agosto 2015
Actividades realizadas por la Red PulseNet México
Creación de la Red Mexicana de PulseNet
• Presentación de la Red Mexicana de PulseNet a la Red Internacional
Noviembre de 2015.
• La Comisión de Control Analítico y Ampliación de Cobertura de la COFEPRIS,
obtuvo la certificación de un Químico Analista para Salmonella spp. Agosto
2016.
Inserción de Nuevas metodologías de Análisis
• Dado los avances tecnológicos en los métodos moleculares, en la actualidad tanto
la Red Pulsenet Internacional, como Latino América y Caribe, y en específico
México, se encuentran en la generación de protocolos y pipelines para el análisis
genómico mediante técnica de Secuenciación del Genoma Completo (WGS).
Conclusiones
1. La PFGE es una técnica estandarizada que permite detectar la fuente de origen y la vía de transmisión del brote, así
como la circulación de cepas nuevas.
2. Es una herramienta que conecta a los países de Latinoamérica y del Caribe, ya que permite:
a) Comparar las cepas circulantes en los distintos países y entre los estados de un mismo país.
b) Comparar las cepas causales en los distintos países y entre los estados de un mismo país.
c) El mapeo de cepas por regiones.
d) Trazabilidad e identificación de los factores de riesgo.
3. Proporciona información que contribuye a la toma de decisiones para generar acciones que mejoren el control e
inocuidad de los alimentos, lo que favorece la Salud Pública, el comercio y el turismo.
4. Permitirá fortalecer la interacción entre las áreas de epidemiología, producto primario y comercialización para el
fortalecimiento de la vigilancia integral de la cadena alimentaria.
5. Redes de colaboración como Pulsenet AL y C propician el aprendizaje y la interacción entre pares, lo que ha creado
una red mundial de profesionales que se encuentran en constante comunicación.
6. Es importante considerar, que a pesar de que la PFGE es una herramienta útil para la detección de microorganismos,
en la actualidad nos encontramos en la migración metodológica para la aplicación de tecnologías de vanguardia, tales
como la Secuenciación del Genoma Completo, al ser ésta más específica, universal, precisa y sensible en sus resultados.
GRACIAS
M en MM Dianelly Yazmín Collí Magaña
Gerente de Análisis y Desarrollo de Pruebas Inmunoquímicas y
Biología Molecular
Comisión de Control Analítico y Ampliación de Cobertura
Fecha: 4 de Mayo del 2017
Somos COFEPRIS,
somos ARN