pulsenet américa latina 5 ta reunión anual cdc-inei-anlis-ops/oms buenos aires, argentina
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Fortalecimiento y avances de la vigilancia molecular de Salmonella spp. Colombia, 2006 – Julio 2007. Grupo de Microbiología Instituto Nacional de Salud Bogotá, Colombia. PulseNet América Latina 5 ta reunión anual CDC-INEI-ANLIS-OPS/OMS Buenos Aires, Argentina - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
PulseNet América Latina 5ta reunión anual CDC-INEI-ANLIS-OPS/OMSBuenos Aires, Argentina Octubre 23-25 de 2007
Fortalecimiento y avances de la vigilancia molecular de Salmonella spp.
Colombia, 2006 – Julio 2007
Grupo de MicrobiologíaInstituto Nacional de Salud
Bogotá, Colombia
Vigilancia por el laboratorio: molecular y fenotípica de Salmonella spp., uno de los principales agentes implicados en la enfermedad diarreica aguda.
Objetivo
Fortalecer el sistema de vigilancia epidemiológica de la salmonelosis en Colombia través de la subtipificación molecular - PFGE de los serotipos de Salmonella Typhimurium y Typhi y de todos los serotipos epidemiológicamente relacionados con brotes.
Línea de investigación institucional
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1
1
1
2
2
2
3
4
4
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4
11
32
35
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86
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0 20 40 60 80 100 120 140 160 180
Arauca
Cesar
Guajira
N/Santander
Amazonas
Casanare
Meta
Risaralda
Caldas
Atlantico
Huila
Magdalena
Tolima
Santander
Valle
Nariño
Bogotá
Antioquia
2006 2007
Número de aislamientos de Salmonella spp., enviados por departamento Colombia, 2006- Julio de 2007
Fuente: Grupo Microbiología, INS, - http://www.ins.gov.co/investigacion
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os
2006 Julio-2007
Distribución de los aislamientos de Salmonella spp por serotipo
Colombia, 2006 – Julio de 2007%
Fuente: Grupo Microbiología, INS, - http://www.ins.gov.co/investigacion
Distribución de los patrones de multirresistencia en aislamientos de Salmonella Typhimurium
2006
Julio 2007
Patrón de resistencian°
aislamientos%
C, Amp, Te, Amc, S 21 13.9SXT, Amp, Te, S 20 13.2SXT, Amp, Te 16 10.6Otros patrones demultirresistencia = 14
44 29.1
Resistentes a 1 ó 2 antibióticos 41 27.2Sensibles 9 6.0
Total 151 100.0
n°aislamientos
%
SXT, Amp, Te, S 22 19.0C, Amp, Te, AMC, S 12 10.3Otros patrones de multirresistencia =16
35 30.2
43 37.1Sensibles 4 3.4
Total 116 100.0
Resistentes a 1 ó 2 antibióticos
Patrón de resistencia
Criterio de selección de los aislamientos de Salmonella para estudio por PFGE -2007
Todos los aislamientos de S. Typhimurium y S. Typhi recuperados por los laboratorios de salud pública
Todos los serotipos relacionados epidemiológicamente con brotes
Total de aislamientos de Salmonella subtipificados por PFGE - XbaI
Serotipos deSalmonella
Año
2006 2007
n aislamientos
Typhimurium 87 116
Typhi 21 14
Enteritidis 4 -
Muenster 3 -
Essen - 2
Sandiego - 2
Total 116 134
Patrones prevalentes de PFGE - XbaI en aislamientos de Salmonella Typhimurium
COIN.06.JPX.X01 n %0062 17 19.60011 6 6.90194 6 6.90013,0219 (5 c/u) 10 11.5Otros patrones 37 42.5Con un patrón PFGE
11 12.6
Total 87 100
COIN.07.JPX.X01 n %0168 32 27.60062 21 18.10216 11 9.50013 7 6.0Otros patrones 31 26.7Con un patrón PFGE
14 12.1
Total 116 100
2006 (87/151) Nuevos patrones de PFGE = 25
2007 (116/116)Nuevos patrones de PFGE = 15
Dice (Opt:1.50%) (Tol 1.5%-1.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]
100
959085807570656055
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12
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49
209
230
7
208
20
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37
87
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72
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204
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8
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COIN07.JPX.X01.0011
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COIN07.JPX.X01.0168
COIN07.JPX.X01.0168
COIN07.JPX.X01.0168
COIN07.JPX.X01.0265
COIN07.JPX.X01.0239
COIN07.JPX.X01.0239
COIN07.JPX.X01.0239
COIN07.JPX.X01.0239
COIN07.JPX.X01.0254
COIN07.JPX.X01.0262
COIN07.JPX.X01.0262
COIN07.JPX.X01.0268
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51.2%
Dendrograma-PFGE-XbaI S. Typhimurium
Enero – Julio de 2007
Patrón prevalente COIN07JPX.X01.0168
Mesn°
aislamientos
Localización/
(n aislamientos)
Febrero 11Antioquia (9)
Bogotá (2)
Marzo 2 Bogotá (2)
Abril 8 Antioquia
Mayo 7 Antioquia
Junio 2Antioquia (1)
Bogotá (1)
Julio 2 Antioquia
Total 32Antioquia (27)
Bogotá (5)
COIN.06.JPP.X01 n %
0005 8 38.10064 3 14.30063 2 9.5Con un patrón PFGE
8 38.1
Total 21 100.0
COIN.07.JPP.X01 n %
0031 4 28.6
0002 3 21.40067 2 14.3Con un patrón PFGE
5 35.7
Total 14 100.0
2006Nuevos patrones de PFGE = 10
2007Nuevos patrones de PFGE = 6
Patrones prevalentes de PFGE - XbaI en aislamientos de Salmonella Typhi
Brotes de Salmonella confirmados con XbaI y BlnI 2006 – 2007
2006 (n=5)
2007 (n= 6)
Fecha Serotipo Departamento Laboratorio Fuenten
aislamientosPatrón PFGE
HuevoMateria fecal
05/04/2006 Typhi Antioquia Clínica Saludcoop Materia fecal 2 COINJPP.X01.000505/04/2006 Typhimurium Antioquia LSP Materia fecal 2 COINJPX.X01.0194
14/06/2006Variante Typhimurium
Nariño LSP Materia fecal 9 COINJPX.X01.0219
15/03/2006 Weltevreden Atlántico LSP Materia fecal 2 COINJQP.X01.0001
31/01/2007 Typhimurium BogotáClínicaDel Niño
Materia fecal2
COINJPX.X01.0195
Absceso hepático 1
Secreciónmediastino 1
19/02/2007 Typhimurium Antioquia HPTU Materia fecal COINJPX.X01.001326/04/2007 Essen Antioquia HPTU Materia fecal 2 COINESN.X01.000119/06/2007 Sandiego Bogotá H. San Ignacio Materia fecal 2 COIN.JLX.X01.000119/07/2007 Typhimurium Antioquia H. Infantil Materia fecal 2 COIN.JPX.X01.0216
27/02/2006 Nariño LSP 2 COINJEP.X010045Enteritidis
COINJPX.X01.015406/02/2007 Typhimurium Clínica ShaioBogotá
Actualización del programa GelCompar II Version 4.6 - Gracias al apoyo del comité coordinador PulseNet – LA
Comunicación oportuna de los resultados - alerta telefónica
Muñoz N, Realpe ME, Ovalle MV, Castañeda E, Patiño L, Gómez ME et al.Informe anual de la vigilancia fenotípica y molecular de Salmonella en Colombia. IQEN Mayo 2007
Actualización de la página web con los datos de vigilancia de Salmonella: www.ins.gov.co/investigacion.
Acciones en la vigilancia PulseNet – Colombia, 2006 – Julio de 2007
Participación reunión semanal del Comité de Vigilancia Epidemiológica (COVE)- INS
Divulgación de los resultados de la vigilancia molecular
Comentarios Disponible una base de datos nacional con los patrones electroforéticos
de 9 serotipos de SalmonellaSalmonella. .
Retroalimentación con los resultados de la vigilancia a los laboratorios participantes
La subtipificación molecular de Salmonella ha permitido al laboratorio reconocer brotes difusos y confirmar los brotes en lo posible en tiempo real
En Colombia para fortalecer la vigilancia de patógenos relacionados con ETA, se está desarrollando dos proyectos de vigilancia, convenio ínter administrativo Ministerio de Protección Social-INS 205/2006
1- Estudio de factores de riesgos asociados a la transmisión de ETA en expendios de alimentos en 5 ciudades capitales del país
2- Estudio de la factibilidad técnica y operativa para la vigilancia de Campylobacter spp como agente patógenos de alimentos en Colombia
PULSENET INTERNACIONAL
Serotipo Fecha Respuesta de Colombia
S. Tennessee Febrero, 2007 Dos aislamientos 2001 - 2004
S. Wandsworth Junio, 2007 Este serotipo no ha sido recuperado
S. Muenchen Pennsylvania, : Junio 2007
Se estudiaron 21 aislamientos de S. Muenchen recuperados de 1998-2007
10 patrones: COIN07.JJ6.X01.0001 - 0010, ninguno relacionado con el brote
S. Typhimurium USA, Septiembre 25 de 2007
Este serotipo no ha sido recuperado
Respuesta rápida al estudio de brotes USA: Ahmed M. Elsedawy
Instituto Nacional de Salud – Bogotá, Colombia
Propuestas de trabajo 2007-2008
Actividades de subtipificación en el marco del sistema de vigilancia en Colombia - 1
Incluir en la vigilancia molecular el estudio de
los serotipos de Salmonella relacionados con
procesos extraintestinales. (Recomendación -
PulseNet-LA).
Fuente Derby Dublin Enteritidis Javiana Kumbole NewportParatyphi
BUganda Panama Poona Gaminara Miami Warragul
Hemocultivo 1 3 16 1 1 1 1 1LCR 1 1Líquido corporal estéril 1 1Médula ósea 1Secreción 1 1 1
Hemocultivo 2 11 2 1 1 1 1LCR 1Secreción 1TOTAL 1 6 29 4 1 1 1 4 2 2 1 1 1
2006
Julio de 2007
• Obtener la certificación en PFGE para Shigella sonnei y Shigella flexneri
• Incorporar de rutina la subtipificación molecular de Shigella sonnei y Shigella flexneri para establecer la base de datos nacional.
Actividades de subtipificación en el marco del sistema de vigilancia en Colombia -2
¿ Existe relación genética entre los aislamientos de Salmonella asociados con brotes en América latina?
Comparación de los perfiles de PFGE de los aislamientos de Salmonella spp asociados a brotes en la región.
¿ Cuál es la epidemiología molecular de los aislamientos de Salmonella Typhimurium multirresistentes recuperados de muestras clínicas, alimentos y animales para consumo humano en América Latina?
Epidemiología molecular de aislamientos de S. Typhimurium multirresistentes recuperados de muestras clínicas, alimentos y de animales para consumo humano en América Latina?
Para responder a las preguntas de investigación
Propuesta proyectos de investigación regional