genética médica news número 20

29
Genética Médica News Volumen 2 Número 20 24 Marzo 2015 2015 | Núm. 20 | Vol. 2 | Genética Médica News |1 revistageneticamedica.com ISSN 23865113 MedigenePress S.L http://revistageneticamedica.com/ Preocupación ante la edición del genoma en embriones humanos Estándares y recomendaciones para la interpretación de variantes genéticas Un análisis de sangre para detectar mutaciones del gen EGFR en cáncer de pulmón Nuevas claves sobre la susceptibilidad genética a la tuberculosis Y mucho más... En este número:

Upload: medigene

Post on 08-Apr-2016

241 views

Category:

Documents


1 download

DESCRIPTION

Genética Médica News es una revista en formato newsletter cuyo objetivo es comunicar los últimos avances en el área de la Genética Médica y la Medicina Genómica para promover la comprensión e interés en la materia entre los investigadores del área de la Biomedicina y profesionales de la salud. En el último número de Genética Médica News: Noticias: • Nuevo síndrome causado por mutaciones en el gen AFF4 • Contribución de las CNV multialélicas a la variabilidad genética humana • Información parcial en muchos sitios de Internet que ofrecen servicios genéticos para la medicina personalizada en cáncer • Polémica y preocupación ante la edición del genoma en embriones humanos • Estándares y recomendaciones para la interpretación de variantes genéticas en laboratorios clínicos • Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de cáncer • Alteración de los genes “más grandes” del genoma en el síndrome de Rett • ¿A quién beneficia el diagnóstico genético de una enfermedad? • U

TRANSCRIPT

Page 1: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News Volumen 2 Nuacutemero 20 24 Marzo 2015

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 1

revistageneticamedicacom ISSN 2386‐5113

MedigenePress SL

httprevistageneticamedicacom

bull Preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos

bull Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas

bull Un anaacutelisis de sangre para detectar mutaciones del gen EGFR en caacutencer de pulmoacuten

bull Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Y mucho maacutes

En este nuacutemero

Ruben Artero Allepuz

Universitat de Valegravencia

Mordf Joseacute Calasanz Abinzano

Universidad de Navarra

Aacutengel Carracedo

Universidad Santiago de Compostela

Juan Cruz Cigudosa

Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegi‐

cas

Carmen Espinoacutes Armero

CIBER de Enfermedades Raras (CIBERER)

Centro de Investigacioacuten Priacutencipe Felipe (CIPF)

Manel Esteller

Instituto de Investigacioacuten Biomeacutedica de Bell‐

vitge (IDIBELL)

Universitat de Barcelona

Xavier Estivill

Centro de Regulacioacuten Genoacutemica Barcelona

Jaime Font de Mora

Instituto de Investigacioacuten Sanitaria IIS‐La Fe

Javier Garciacutea Planells

Instituto de Medicina Genoacutemica

Joseacute Miguel Garciacutea Sagredo

Universidad de Alcalaacute

Roser Gonzaacutelez

Universitat de Barcelona

Juan de Dios Garciacutea Diacuteaz

Hospital Universitario Priacutencipe de Asturias

Universidad de Alcalaacute de Henares

Encarnacioacuten Guilleacuten Navarro

Hospital Cliacutenico Universitario Virgen de la

Arrixaca

UCAM‐Universidad Catoacutelica de Murcia

CIBER de Enfermedades Raras (CIBERER)‐

ISCIII

Adolfo Loacutepez de Munain Arregui

Hospital Universitario Donostia

Instituto Biodonostia

Joseacute Antonio Loacutepez Guerrero

Fundacioacuten del Instituto Valenciano de On‐

cologiacutea (IVO)

Carlos Loacutepez Otiacuten

Universidad de Oviedo

Joseacute Antonio Lorente Acosta

Centro Pfizer‐Universidad de Granada‐ Junta

de Andaluciacutea de Genoacutemica e Investigacioacuten

Oncoloacutegica (GENYO)

Ana Lluch

Hospital Cliacutenico de Valencia Hospital

Universitat de Valegravencia

Julio Ceacutesar Martiacuten Rodriacuteguez

Iviomics SL Instituto Universitario IVI Valen‐

cia

Francisco Martiacutenez Castellano

Hospital Universitario y Politeacutecnico la Fe de

Valencia

Joseacute Mariacutea Millaacuten

Instituto de Investigacioacuten Sanitaria IIS‐La Fe

CIBERER‐Biobank

CIBER de Enfermedades Raras (CIBERER)

Mordf Dolores Moltoacute

Universitat de Valegravencia

CIBER de Salud Mental (CIBERSAM)

Lorenzo Montserrat Iglesias

Complejo Hospitalario Universitario A Coruntildea

Health in Code

M Carolina Ortube

The Jules Stein Eye Instituye

University of California Los Angeles (UCLA)

Federico Vicente Pallardoacute Calatayud

Universitat de Valegravencia

Antonio Peacuterez Ayteacutes

Hospital Universitario y Politeacutecnico la Fe de

Valencia

Luis Peacuterez Jurado

Universitat Pompeu Fabra Barcelona

Oacutescar Puig

Translational Clinical Research Center

Roche New York

Ramiro Quiroga de la Cruz

Hospital Universitario y Politeacutecnico La Fe de

Valencia

Feliciano Ramos

Universidad de Zaragoza

Joaquiacuten Rueda Puente

Universidad Miguel Hernaacutendez

Eduardo Vilar Saacutenchez

MD Anderson Cancer Center Houston

EEUU

Geneacutetica Meacutedica News

ISSN 2386‐5113

Universitat de Valegravencia

Departamento de Geneacutetica

cDoctor Moliner 50

Burjassot (Valencia)

ESPANtildeA

Oficina Editorial

redaccionmedigenees

Publicidad

infomedigenees

Direccioacuten Dr Manuel Peacuterez Alonso

Profesor Titular

Departamento de Geneacutetica

Universitat de Valegravencia

Redaccioacuten y edicioacuten Dra Amparo Tolosa

Publicidad Loreto Crespo

Marketing y presencia en

Internet Vicent Ferrer

Geneacutetica Meacutedica News

MedigenePress SL sus trabajadores y colaboradores no asumen ninguna responsabilidad derivada del uso incorrecto de la informacioacuten facilitada en la paacutegina web

revistageneticamedicacom y en el boletiacuten de noticias Geneacutetica Meacutedica News o de la presencia de errores u omisiones La mencioacuten de cualquier meacutetodo terapia

tratamiento o servicio no debe ser considerado una garantiacutea para su utilizacioacuten El contenido de Geneacutetica Meacutedica News tiene una uacutenica finalidad informativa De‐

terminar el tratamiento adecuado para un paciente es responsabilidad de los meacutedicos y facultativos El contenido de la publicacioacuten Geneacutetica Meacutedica News no es en

modo alguno sustituto del consejo proporcionado por personal profesional de la salud cualificado MedigenePress SL recomienda consultar de forma indepen‐

diente otras fuentes asiacute como a otros profesionales antes de confiar en la fiabilidad de un tratamiento

La presente obra estaacute bajo una licencia de Creative Commons Reconocimiento 40 Internacional

2 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Comiteacute Editorial y Cientiacutefico

Visita nuestra web

wwwrevistageneticamedicacom

MedigenePress SL

En este nuacutemero

Geneacutetica Meacutedica News

bull Nuevo siacutendrome causado por mutaciones en el gen AFF4 5

bull Contribucioacuten de las CNV multialeacutelicas a la variabilidad geneacutetica humana 7

bull Informacioacuten parcial en muchos sitios de Internet que ofrecen servicios geneacuteticos para la

medicina personalizada en caacutencer8

bull Poleacutemica y preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos 10

bull Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en

laboratorios cliacutenicos12

bull Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer 14

bull Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett 16

bull iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad 18

bull Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen

EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten19

bull Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis 21

bull Noticias Cortas 24

bull Congresos 29

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 3

revistageneticamedicacom

En portada

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de Enfermedades Instituto Nacional de

Salud EEUU

La revista Geneacute ca Meacutedica acepta ar culos enviados para su publicacioacuten en las secciones de

Actualidad y opinioacuten

bull Ar culos de opinioacutenComentariosCartas al director

bull Resentildeas de inves gaciones de los autores

Trabajos de inves gacioacuten

bull Casos cliacutenicos

bull Revisiones

Las normas de publicacioacuten en Geneacute ca Meacutedica siguen las recomendaciones del Interna onal Commi eee of Medical Journal Editors (ICMJE) depositadas en h pwwwicmjeorgrecommenda onsbrowse

Enviacuteo de trabajos

Los manuscritos des nados a su publicacioacuten se remi raacuten por correo electroacutenico a redaccioacutenmedigenecom

Aceptacioacuten revisioacuten y publicacioacuten de los trabajos

Seccioacuten de actualidad y opinioacuten

Los ar culos de la seccioacuten de actualidad y opinioacuten no se someten a revisioacuten externa aunque siacute se evaluaraacute por el personal de redaccioacuten y direccioacuten su adecuacioacuten al es lo y contenido de la revista asiacute como el rigor e intereacutes para el lector Los ar culos seraacuten revisados por la redaccioacuten y su aceptacioacuten comunicada a los autores En caso de duda la aceptacioacuten seraacute evaluada por el comiteacute editorial

Las normas especiacuteficas para las resentildeas de inves gacioacuten son las siguientes

Para enviar resentildeas de inves gacioacuten relacionadas con la Geneacute ca Meacutedica y Medicina Genoacutemica a Geneacute ca Meacutedica News los autores deberaacuten enviar un correo electroacutenico con el ar culo en formato Word a la siguiente direccioacuten redac-cionmedigenees

Se aceptaraacuten resentildeas de ar culos ya publicados o en edicioacuten avanzada online cuyos autores esteacuten incluidos en la publica-cioacuten mencionada en la referencia bibliograacutefica o que formen parte de oficinas de prensa o comunicacioacuten de los centros de inves gacioacuten que par cipan en la publicacioacuten

El enviacuteo de ar culos implica la aceptacioacuten de su publicacioacuten bajo la misma licencia que la Newsle er esto es Licencia Crea ve Commons Reconocimiento 40 Internacional

Normas de edicioacuten

bull Formato Word

bull Liacutemite de 7000 caracteres (incluyendo referencia y

fuentes)

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Autores y afiliaciones

bull Cuerpo del ar culo incluyendo referencia y fuente

bull Referencia bibliograacutefica Formato Pubmed (ver apartado

de referencias bibliograacuteficas)

bull Fuente (en caso de aparecer la nota informa va en el si o

web del centro de inves gacioacuten)

bull Palabras clave

bull Resumen (hasta 30 palabras)

En el caso de desear incluir una imagen el formato acepta-do seraacute jpg y los autores deberaacuten indicar que los derechos de la imagen les pertenecen y autorizar la u lizacioacuten de la imagen por parte de Geneacute ca Meacutedica News

Las normas especiacuteficas para los ar culos de opinioacuten son las siguientes

bull Formato Word

bull Liacutemite de 7000 caracteres (incluyendo referencia y

fuentes)

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Autores y afiliaciones

bull Cuerpo del ar culo incluyendo referencia y fuente

bull Referencias bibliograacuteficas si fuera necesario (ver el

formato en la seccioacuten correspondiente)

bull Fuente en caso necesario

bull Palabras clave

Trabajos de inves gacioacuten

La aceptacioacuten o no de los ar culos de inves gacioacuten seraacute evaluada inicialmente por el equipo editorial y en caso de cumplir los requisitos de publicacioacuten se iniciaraacute el proceso de revisioacuten con el enviacuteo de los originales a dos revisores cualificados de forma ciega En caso necesario se establece-raacute contacto con los autores para comunicar los comentarios de los revisores y para correcciones o revisiones Los evaluadores podraacuten aprobar el ar culo solicitar modifica-ciones que requieran de nueva revisioacuten o rechazar el ar culo En el caso de que uno de los revisores apruebe el ar culo y otro lo rechace se solicitaraacute la revisioacuten de un tercero

Normas de edicioacuten para los casos cliacutenicos (ar culos de correlacioacuten geno pofeno po o de caracterizacioacuten geneacute ca de pacientes)

bull Formato Word

bull Liacutemite de 20000 caracteres incluyendo bibliogra a

resumen tablas pies de figuras y anexos

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Informacioacuten de los autores (incluyendo nombre

afiliacioacuten y contacto)

bull Palabras clave

bull Resumen (hasta 300 palabras)

bull Cuerpo del ar culo estructurado de manera loacutegica

incluyendo referencias y fuentes

bull Las citas bibliograacuteficas se incluiraacuten dentro del texto

siguiendo el sistema Harvard Ejemplo (Garciacutea 2014)

bull Agradecimientos (opcional)

bull Patrocinios o becas cuando sea necesario

bull Referencias bibliograacuteficas tras el texto principal del

ar culo bajo el epiacutegrafe ldquoReferenciasrdquo en el formato requerido (ver apartado de referencias bibliograacuteficas)

bull Graacuteficas o imaacutegenes y el texto adjunto al final del docu-

mento

Normas de edicioacuten para las revisiones (ar culos en los que se revisa el estado actual de temas relacionados con la geneacute ca meacutedica)

Formato Word

bull Liacutemite de 40000 caracteres incluyendo bibliogra a

resumen tablas pies de figuras y anexos

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Informacioacuten de los autores (incluyendo nombre

afiliacioacuten y contacto)

bull Palabras clave

bull Resumen (hasta 400 palabras)

bull Cuerpo del ar culo estructurado de manera loacutegica

incluyendo referencias y fuentes

bull Las citas bibliograacuteficas se incluiraacuten dentro del texto

siguiendo el sistema Harvard Ejemplo (Garciacutea 2014)

bull Agradecimientos (opcional)

bull Patrocinios o becas cuando sea necesario

bull Referencias bibliograacuteficas tras el texto principal del

ar culo bajo el epiacutegrafe ldquoReferenciasrdquo en el formato requerido (ver apartado de referencias bibliograacuteficas)

bull Graacuteficas o imaacutegenes y el texto adjunto al final del docu-

mento

En el caso de incluir imaacutegenes eacutestas se presentaraacuten aparte de forma numerada y con su correspondiente tulo y leyenda Los formatos aceptados seraacuten jpg o ff Asiacute mismo el enviacuteo de imaacutegenes o ilustraciones conlleva el compromiso por parte de los autores de poseer los derechos de repro-duccioacuten de las mismas o en caso alterna vo de que el material enviado es libre de derechos

Para garan zar la revisioacuten ciega el tulo la informacioacuten de los autores y palabras clave iraacuten en la primera paacutegina que seraacute eliminada en el proceso de revisioacuten Ademaacutes el resto del ar culo no incluiraacute ninguna informacioacuten mediante la cual se pudiera iden ficar a los autores

Responsabilidades de los autores

Al enviar un trabajo a esta revista los autores aceptan

bull Que el ar culo es un trabajo original y no ha sido previa-

mente publicado ni enviado a otra publicacioacuten simultaacutenea-mente

bull Que todos los autores han contribuido intelectualmente

en el trabajo enviado

bull Que todos los autores han leiacutedo y aprobado la versioacuten

final

bull Los teacuterminos de la poliacute ca editorial de Geneacute ca Meacutedica

en lo que se refiere a derechos de autor y editor

Se en ende que en el caso de las resentildeas de inves gacioacuten al tratarse de resuacutemenes de ar culos ya publicados en otras revistas la informacioacuten no sea original

Ademaacutes los autores haraacuten una declaracioacuten de ausencia de conflictos de intereses

Normas bibliograacuteficas

Referencias bibliograacuteficas en el texto

Dentro del texto principal las referencias bibliograacuteficas se presentaraacuten de modo abreviado siguiendo el sistema Harvard o autor-antildeo entre pareacutentesis Ejemplo (Garciacutea 1978)

Referencias

La informacioacuten completa (autor tulo antildeo editorial o publicacioacuten nuacutemero) de las referencias bibliograacuteficas se mostraraacute despueacutes del texto principal bajo el epiacutegrafe de ldquoReferenciasrdquo En este apartado deben encontrarse todas las referencias bibliograacuteficas incluidas en el texto del mismo modo que todas las referencias de la lista deben de mencio-narse en el texto Las referencias estaraacuten ordenadas alfabeacute-camente por autores

El formato a seguir de las referencias seraacute el siguiente

‐ Ar culos

En los ar culos con maacutes de dos autores se mostraraacute uacutenica-mente al primero de ellos seguido de et al

Crick FH et al Is DNA really a double helix J Mol Biol 1979 Apr 15129(3)449-57 doi1010160022-2836(79)90506-0

‐ Libros y capiacutetulos de libro

Jorde LB et al Medical Gene cs Fourth Edi on 2010 Mosby Philadelphia ISBN 978-0-323-05373-0

‐ Paacuteginas de internet (indicar entre corchetes la fecha de la uacutel ma visita)

Revista Geneacute ca Meacutedica News URL h previstagene camedicacom [01-01-2015]

‐ Publicaciones electroacutenicas o recursos dentro de una paacutegina web (indicar entre corchetes si fuera necesario la fecha de la uacutel ma consulta

Lista de las enfermedades raras por orden alfabeacute co Informes Perioacutedicos de Orphanet Serie Enfermedades Raras Julio 2014 URL h pwwworphanetorphacomcahiersdocsESLista_de_enfermedades_raras_por_orden_alfabe copdf

Responsabilidades eacute cas

Consen miento informado Los ar culos en los que se lleva acabo inves gacioacuten en seres humanos deben regirse por los principios acordados en la Declaracioacuten de Helsinki y mani-festar en el apartado de meacutetodos que tanto el procedimien-to como el consen miento informado fueron aprobados por el correspondiente Comiteacute de Eacute ca de la ins tucioacuten Si en alguacuten caso especialmente en el de los ar culos de Caso Cliacutenico es posible iden ficar a alguacuten paciente o se desea publicar una fotogra a de eacuteste deberaacute presentarse el consen miento informado o en caso de ser menor el consen miento de sus padres o tutores

Ensayos cliacutenicos Para publicar manuscritos que incluyan ensayos cliacutenicos deberaacute enviarse junto con el documento una copia de la aprobacioacuten de las autoridades sanitarias de los paiacuteses en los que se ha desarrollado la inves gacioacuten experimental

Experimentos con animales En caso de presentar datos de experimentacioacuten con animales deberaacute facilitarse la declara-cioacuten del cumplimiento con la norma va europea y espantildeola (Real decreto 532013 de 1 de febrero por el que se esta-blecen las normas baacutesicas aplicables para la proteccioacuten de los animales u lizados en experimentacioacuten y otros fines cien ficos incluyendo la docencia)

Geneacutetica Meacutedica News

4 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

NORMAS DE PUBLICACIOacuteN E INSTRUCCIONES PARA LOS AUTORES

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 5

revistageneticamedicacom

Nuevo siacutendrome causado por mutaciones en el gen AFF4

La regulacioacuten de la transcripcioacuten proceso por el que

las instrucciones en el ADN son copiadas al RNA es

crucial para el correcto funcionamiento de las ceacutelulas

Especialmente durante el desarrollo embrionario

cualquier alteracioacuten en este mecanismo puede tener

consecuencias importantes en el individuo

Investigadores del Childrenrsquos Hospital of Philadelphia

han identificado un nuevo siacutendrome causado por mu‐

taciones de novo en el gen AFF4 implicado en la re‐

gulacioacuten de la transcripcioacuten durante el desarrollo

resultado que arroja luz sobre los mecanismos de

accioacuten que intervienen en este proceso a lo largo del

desarrollo y sus efectos sobre el programa de expre‐

sioacuten del genoma humano

Mediante secuenciacioacuten del exoma completo los in‐

vestigadores dirigidos por Ian D

Krantz encontraron mutaciones que provocaban un

cambio de aminoaacutecido en el gen AFF4 en tres nintildeos

con un siacutendrome nuevo que comparte varios de los

rasgos tiacutepicos del siacutendrome de Cornelia de Lange

Este nuevo cuadro cliacutenico recibioacute el nombre de

CHOPS acroacutenimo en ingleacutes derivado de los siacutento‐

mas que se presentan desorden cognitivo con rasgos

faciales caracteriacutesticos defectos cardiacuteacos obesidad

problemas pulmonares baja estatura y displasia es‐

queleacutetica

AFF4 codifica para uno de los componentes del com‐

plejo de super elongacioacuten (SEC en sus siglas en in‐

gleacutes) grupo de proteiacutenas encargadas de controlar la

fase de elongacioacuten de la transcripcioacuten en la que la

ARN polimerasa II cataliza la produccioacuten de la cadena

de ARN En los nintildeos con mutaciones en el gen AFF4

las mutaciones provocan resistencia a la degradacioacuten

de la proteiacutena AFF4 por lo que esta se acumula mo‐

dificando la distribucioacuten de la ARN polimerasa II en el

genoma y con ella el patroacuten de expresioacuten que mues‐

tran las ceacutelulas de los pacientes ambos mecanismos

confirmados por los investigadores a traveacutes de expe‐

rimentos de inhibicioacuten de la expresioacuten del gen

Dada la similitud fenotiacutepica entre el nuevo siacutendrome

y el siacutendrome de Cornelia de Lange los investigado‐

res compararon la expresioacuten geacutenica de fibroblastos

obtenidos de ambos tipos de pacientes encontrando

patrones similares en ambas condiciones lo que apo‐

ya la hipoacutetesis de que en ambas condiciones inter‐

vengan procesos patoloacutegicos comunes A traveacutes de

Transcripcioacuten produccioacuten de ARN mensajero Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

6 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

diferentes experimentos el equipo de Krantz deter‐

minoacute que la distribucioacuten alterada de AFF4 afecta a la

unioacuten de la cohesina a la ARN polimerasa II en el siacuten‐

drome CHOPS de forma inversa a lo que sucede en

el siacutendrome de Cornelia de Lange en el que la distri‐

bucioacuten alterada de la cohesina afecta a la unioacuten de

AFF4 Asiacute los investigadores confirmaron mecanis‐

mos comunes en ambas enfermedades

El siacutendrome CHOPS constituye el primer desorden

del desarrollo humano causado por mutaciones en la

liacutenea germinal en el gen AFF4 Las conclusiones del

trabajo ponen de manifiesto la importancia de la re‐

gulacioacuten de la funcioacuten de la ARN polimerasa II para el

correcto funcionamiento del programa de expresioacuten

geacutenica durante la embriogeacutenesis humana y ofrecen

una nueva perspectiva para los pacientes que presen‐

ten los siacutentomas del nuevo siacutendrome ldquoLos resultados

de la investigacioacuten ofrecen beneficios praacutecticos y

emocionales para las familiasrdquo indica Krantz que ya

participoacute en la identificacioacuten del primer gen asociado

al siacutendrome de Cornelia de Lange ldquoLos meacutedicos po‐

driacutean solicitar pruebas maacutes apropiadas para monito‐

rizar y manejar cuestiones meacutedicas especiacuteficas deri‐

vadas del siacutendrome CHOPS Esto significa tambieacuten

que las familias y los nintildeos pueden finalizar su lsquoodisea

diagnoacutesticarsquo‐ la procesioacuten frustrante de pruebas y

tratamientos sin eacutexito que se produce de forma fre‐

cuente al tratar de encontrar respuesta para las fami‐

lias que tienen un nintildeo afectado por un desorden

complejo no diagnosticadordquo

Referencia Izumi K et al Germline gain‐of‐function

mutations in AFF4 cause a developmental syndrome

functionally linking the super elongation complex and

cohesin Nat Genet 2015 Mar 2 doi 101038

ng3229

Fuente httpwwwnewswisecom

Pese a que normalmente se considera que todos los

miembros de la especie humana contienen la misma

cantidad de material hereditario en sus ceacutelulas lo

cierto es que en muacuteltiples regiones geacutenicas los geno‐

mas humanos presentan variabilidad en el nuacutemero

de copias de algunos segmentos del ADN Un caso

especial de CNV como se denomina a este tipo de

polimorfismo geneacutetico (de copy number variation en

ingleacutes) son las CNV multialeacutelicas que se presentan

en un nuacutemero de estados o alelos mayor de dos Las

CNV multialeacutelicas son difiacuteciles de analizar debido a

algunas limitaciones teacutecnicas la incapacidad de dis‐

criminar entre el nuacutemero de estados consecutivos

(por ejemplo nueve o diez) mediante teacutecnicas comu‐

nes como los microarrays o la PCR cuantitativa ruti‐

naria y el amplio rango de nuacutemeros de copias con los

que se pueden en el genoma desde dos hasta doce o

maacutes copias

Un equipo formado por investigadores de la Universi‐

dad de Harvard y del centro de Biologiacutea Digital de la

empresa biotecnoloacutegica Bio‐Rad ha sobrepasado

estas limitaciones mediante la combinacioacuten de la

secuenciacioacuten masiva del genoma completo y la PCR

digital permitiendo estimar la contribucioacuten de las

CNV multialeacutelicas a la variabilidad humana

Con el objetivo de identificar el nuacutemero de copias

alelos y haplotipos (combinaciones de alelos en un

mismo cromosoma) de las CNV multialeacutelicas de ma‐

yor tamantildeo los investigadores analizaron casi 850

genomas obtenidos por secuenciacioacuten masiva en el

proyecto de los 1000 genomas Entre las maacutes de

3800 CNVs encontradas por meacutetodos computacio‐

nales cerca de 1400 presentaban maacutes de tres alelos

posibles A continuacioacuten la aproximacioacuten compu‐

tacional fue validada mediante ddPCRTM PCR digital

que incluye la emulsioacuten y fraccionamiento de la

muestra en miles de gotitas en las que se lleva a ca‐

bo la reaccioacuten de amplificacioacuten de forma indepen‐

diente

Los resultados del trabajo indican que las CNV multi‐

aleacutelicas afectan ampliamente a los genes y a su ex‐

presioacuten siendo la principal fuente de variacioacuten de la

dosis geacutenica en humanos (hasta un 88 de la variabi‐

lidad) Dicha variacioacuten ademaacutes influye fuertemente

en los niveles de expresioacuten

ldquoDespueacutes de un largo periodo de no ser capaces de

llevar a cabo anaacutelisis geneacuteticos precisos de las CNVs

multialeacutelicas en geneacutetica humana estas herramien‐

tas ndash tanto la secuenciacioacuten del genoma completo

como los aacutegiles ensayos de ddPCRTM‐ podraacuten permi‐

tir anaacutelisis cuidadosos de CNV multialeacutelicas en cohor‐

tes humanasrdquo indica Steven McCarroll profesor de

la Universidad de Harvard y director del trabajo ldquoDe

modo tranquilizador estas aproximaciones parecen

proporcionar resultados que concuerdan entre siacuterdquo

Las conclusiones del trabajo abren diferentes frentes

de trabajo desde evaluar el efecto de las combina‐

ciones de alelos en cada locus a analizar el impacto

de su variacioacuten en los fenotipos humanos Dado su

efecto sobre la dosis geacutenica o los niveles de expre‐

sioacuten y la asociacioacuten de genes localizados en las CNVs

con diversas enfermedades humanas es de esperar

que el estudio de las CNVs multialeacutelicas arroje nueva

luz sobre su influencia en diferentes patologiacuteas Del

mismo modo las CNVs podriacutean influir en la respuesta

a faacutermacos contribucioacuten que algunos investigadores

ya indican que estaacute siendo infraestimada

Referencia Handsaker RE et al Large multiallelic copy number variations in humans Nat Genet 2015

Mar47(3)296‐303 doi 101038ng3200

Fuente httpwwweurekalertorg

pub_releases2015‐03cg‐sn030215php

Contribucioacuten de las CNV multialeacutelicas a la variabilidad geneacutetica humana

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 7

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Informacioacuten parcial en muchos sitios de Internet que ofrecen servicios geneacuteticos para la medicina personalizada en caacutencer

Durante los uacuteltimos antildeos el raacutepido crecimiento en la

capacidad de llevar a cabo diagnoacutestico geneacutetico ha

propiciado la aparicioacuten de diferentes sitios de Inter‐

net en los que se ofrecen servicios geneacuteticos La exis‐

tencia de este tipo de carteras de servicios y su facili‐

dad de acceso representan un gran potencial para

extender la utilizacioacuten del diagnoacutestico geneacutetico den‐

tro de la comunidad meacutedica asiacute como mejorar la ca‐

pacidad predictiva o la posibilidad de tomar decisio‐

nes sobre tratamiento de los pacientes Sin embargo

la comercializacioacuten por Internet de pruebas geneacuteticas

en el contexto de la medicina personalizada no estaacute

regulada lo que ha aumentado la preocupacioacuten de

los investigadores y profesionales meacutedicos ya que

muchas de ellas pueden no tener utilidad cliacutenica

Un reciente estudio del Instituto del Caacutencer Dana‐

Farber publicado en el Journal of the National Cancer

Institute ha evaluado los sitios de Internet que ofre‐

cen pruebas geneacuteticas para la medicina personaliza‐

da en caacutencer y concluido que a menudo se exagera

en ellos los beneficios al tiempo que se minimizan o

ignoran las limitaciones

En el estudio los investigadores analizaron la infor‐

macioacuten de 55 sitios de Internet (identificados por

buacutesquedas de palabras en ingleacutes) que comercializan

productos geneacuteticos para la medicina personalizada

del caacutencer patrocinados bien por empresas comer‐

ciales instituciones acadeacutemicas centros de investi‐

gacioacuten o meacutedicos individuales El criterio para consi‐

Museo de Ciencias de Londres Imagen John Goode (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 9

revistageneticamedicacom

derar uno de estos productos fue el de ldquoproductos o

servicios que pueden ser utilizados para llevar a cabo

un manejo individualizado del paciente basaacutendose

en datos genoacutemicos o derivados de tumoresrdquo

ldquoQueriacuteamos ver si los consumidores reciben una ima‐

gen equilibrada de los beneficios y limitaciones de

estos serviciosrdquo indica Stacy Gray primera autora

del trabajo ldquoEncontramos mucha variabilidad Parte

de la informacioacuten es buena pero toda ella necesita

ser analizada criacuteticamente por los consumidores y

profesionales sanitariosrdquo

Los investigadores encontraron que un 85 de los

sitios evaluados incluiacutean informacioacuten sobre los bene‐

ficios de sus productos pero apenas el 27 incluiacutea

informacioacuten de sus limitaciones Ademaacutes la mayor

parte de los servicios geneacuteticos ofertados dirigidos

hacia la identificacioacuten de variantes somaacuteticas esto

es no heredadas de los padres y desarrolladas a lo

largo de la vida del individuo incluiacutean pruebas no

estaacutendar o no validadas (definidas por los autores

como pruebas basadas en sugerencias inferidas o sin

evidencias de que la salud mejoraraacute al utilizar datos

de alteraciones genoacutemicas) En este sentido en la

actualidad la estandarizacioacuten de pruebas molecula‐

res y geneacuteticas en el contexto del caacutencer constituye

un problema a resolver ya que el tratamiento perso‐

nalizado contra el caacutencer evoluciona maacutes raacutepido de lo

que las organizaciones profesionales pueden asimilar

para elaborar protocolos de estandarizacioacuten

A raiacutez de los resultados obtenidos del anaacutelisis de los

sitios de Internet los autores indican que hasta que

los anaacutelisis genoacutemicos esteacuten maacutes regulados en medi‐

cina en general y en medicina personalizada en par‐

ticular los profesionales meacutedicos seraacuten los responsa‐

bles de guiar a los pacientes a lo largo del proceso y

ayudarles a entender conceptos como el de validez

cliacutenica utilidad cliacutenica o la generalizacioacuten de resulta‐

dos de investigacioacuten Esto advierten no seraacute posible

si dichos profesionales no estaacuten versados en genoacutemi‐

ca Sin la educacioacuten y formacioacuten adecuada de estos

profesionales tanto la integracioacuten de las pruebas

geneacuteticas y genoacutemicas en la praacutectica cliacutenica como su

oacuteptima utilizacioacuten se veraacuten limitadas significativa‐

mente

Asiacute a pesar de su gran potencial la venta de produc‐

tos geneacuteticos relacionados con la medicina personali‐

zada por Internet podriacutea resultar perjudicial si aporta

productos de beneficio no probado o si los resultados

que se puedan obtener son indiferentes para la situa‐

cioacuten del paciente En estos momentos dada la am‐

plia variedad de servicios disponibles en algunos paiacute‐

ses la informacioacuten y capacidad criacutetica de los profe‐

sionales de la salud es crucial para identificar aquellos

basados en evidencias robustas contrastadas y vali‐

dadas

Referencias

Gray SW et al Marketing of personalized cancer care

on the web an analysis of internet websites J Natl

Cancer Inst 2015 Mar 5107(5) pii djv030 doi

101093jncidjv030

Garber K Oncologists push beyond new lung cancer

genomic testing guidelines J Natl Cancer Inst 2015

Feb 12107(2) pii djv023 doi 101093jncidjv023

Fuente httpwwwdana‐farberorgNewsroom

Geneacutetica Meacutedica News

10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Poleacutemica y preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos

Las nuevas teacutecnicas de edicioacuten del genoma han

abierto la posibilidad de modificar de forma precisa

el ADN humano La tecnologiacutea seguacuten un gran nuacuteme‐

ro de especialistas ya estaacute puesta a punto Las con‐

secuencias de su aplicacioacuten sin embargo todaviacutea se

desconocen

Un antildeo despueacutes de que se obtuvieran con eacutexito los

primeros primates adultos con mutaciones especiacutefi‐

cas introducidas mediante teacutecnicas de edicioacuten del

genoma los intensos rumores de que ya se ha modi‐

ficado el genoma en embriones humanos han levan‐

tado la voz de alarma en la comunidad cientiacutefica Di‐

chos rumores parecen tener fundamento ya que el

equipo de Nature News ha comunicado que varios

investigadores que no desean hacer puacuteblicos sus

nombres han informado de la existencia de diversos

trabajos en los que se ha modificado el genoma en

embriones humanos que estaacuten siendo considerados

para su publicacioacuten Ante esta posibilidad la respues‐

ta no se ha hecho esperar y cinco expertos en teacutecni‐

cas de edicioacuten del genoma han publicado un comen‐

tario en el que solicitan una moratoria por parte de la

comunidad cientiacutefica al completo para retrasar la

utilizacioacuten de esta tecnologiacutea en humanos y en el que

urgen a iniciar el diaacutelogo sobre si deberiacutean de llevarse

a cabo investigaciones futuras que conlleven la modi‐

ficacioacuten geneacutetica de ceacutelulas germinales en la especie

humana y en queacute circunstancias deberiacutean permitirse

Editando directamente el genoma de un embrioacuten en

el estadiacuteo de una ceacutelula se puede llegar a obtener un

individuo con todas sus ceacutelulas modificadas No obs‐

tante la tasa con la que esto se consigue es baja y

existe la posibilidad de que se genere un mosaico

esto es que el organismo obtenido no tenga la mis‐

Imagen National Human Genome Research Institute wwwgenomeorg

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 11

revistageneticamedicacom

ma composicioacuten geneacutetica en todas sus ceacutelulas Debi‐

do a esta razoacuten la aproximacioacuten requiere la genera‐

cioacuten de un gran nuacutemero de embriones para obtener

uno completamente modificado Otro planteamien‐

to es la obtencioacuten de ceacutelulas germinales (oacutevulos y

espermatozoides) modificadas con los que poste‐

riormente llevar a cabo la fecundacioacuten Mediante

este meacutetodo se pueden generar multitud de ceacutelulas o

embriones modificados entre los que se podriacutean se‐

leccionar aquellos que incluyen el cambio Una vez

desarrollados en adultos los individuos modificados

podriacutean transmitir parte de su genoma editado a su

descendencia

Las aplicaciones meacutedicas de una modificacioacuten preci‐

sa y dirigida del genoma humano en embriones son

inmediatas ya que su utilizacioacuten evitariacutea la transmi‐

sioacuten de enfermedades causadas por mutaciones pa‐

togeacutenicas a la descendencia Sin embargo no se sa‐

be si esta modificacioacuten del genoma podriacutea generar

problemas despueacutes del nacimiento o a largo plazo ni

las consecuencias que podriacutea haber a nivel de la es‐

pecie humana en su conjunto en las sucesivas gene‐

raciones Sin olvidar que aunque la intencioacuten inicial

fuera exclusivamente terapeacuteutica la tecnologiacutea pue‐

de potencialmente introducir cambios relacionados

con otras caracteriacutesticas leacutease color de ojos de pe‐

lohellipy la facilidad con la que se puede utilizar podriacutea

derivar en el temido disentildeo de ldquonintildeos a la cartardquo En

cualquier caso en su comentario titulado ldquoNo editad

la liacutenea germinal humanardquo los investigadores sentildea‐

lan que sean o no filosoacutefica o eacuteticamente justifica‐

bles estas aplicaciones son irrelevantes hasta que

sea posible demostrar que su utilizacioacuten es segura y

se obtengan datos reproducibles a traveacutes de muacutelti‐

ples generaciones

Ademaacutes de la preocupacioacuten por las implicaciones

eacuteticas y de seguridad que conlleva la utilizacioacuten de

teacutecnicas de edicioacuten del genoma en la liacutenea germinal

humana los cientiacuteficos temen que el impacto negati‐

vo generado por la poleacutemica pueda afectar a la utili‐

zacioacuten de las teacutecnicas de edicioacuten en ceacutelulas de la liacutenea

somaacutetica (ceacutelulas que no se transmiten a la descen‐

dencia) la cual estaacute generando resultados muy pro‐

metedores para el tratamiento de diversas enferme‐

dades humanas

En cuanto a las consideraciones legales aunque mu‐

chos paiacuteses no tienen una legislacioacuten que permita o

prohiacuteba la ingenieriacutea geneacutetica en humanos por con‐

siderar esta aacuterea como algo experimental en los paiacute‐

ses donde siacute existen leyes relativas a la modificacioacuten

geneacutetica esta praacutectica estaacute prohibida en humanos al

igual que en muchos casos lo estaacute la modificacioacuten de

la liacutenea germinal No obstante conviene tener en

cuenta que la mayor parte de las normativas fueron

instauradas antes de que la avanzada teacutecnica de

CRISPR estuviera disponible por lo que podriacutean ser

modificadas para aceptar la intervencioacuten terapeacuteutica

En cualquier caso la poleacutemica estaacute servida Algunos

investigadores como David Sinclair de la Universi‐

dad de Harvard indican que la pregunta no es si la

obtencioacuten de embriones humanos modificados ten‐

draacute lugar o no sino maacutes bien cuaacutendo seraacute llevada a

cabo

Referencias

Lanphier E et al Donrsquot edit the human germ line Na‐

ture 2015 March 12 Doi 101038519410a

Regalado A Engineering the Perfect Baby MIT Tech

Rev 2015 httpwwwtechnologyreviewcom

featuredstory535661engineering‐the‐perfect‐baby

Cyranoski D Scientists sound alarm over DNA editing

of human embryos Nature News 2015 Doi 101038

nature201517110

Geneacutetica Meacutedica News

12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en laboratorios cliacutenicos

El Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas (ACMG

en sus siglas en ingleacutes) y la Asociacioacuten de Patologiacutea

Molecular de EEUU acaban de publicar una serie de

estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten

de variantes geneacuteticas en los laboratorios cliacutenicos

El objetivo del trabajo seguacuten sus autores es crear un

recurso educativo para los profesionales de la geneacuteti‐

ca que trabajan en laboratorios cliacutenicos y con ello

aumentar la calidad de los servicios proporcionados

que cada vez incluyen maacutes pruebas genoacutemicas ge‐

notipacioacuten anaacutelisis de genes individuales paneles

geacutenicos exomas genomas transcriptomashellip

La primera parte del trabajo estaacute centrada en consi‐

deraciones de tipo general como la necesidad de

definir los conceptos utilizados en los laboratorios de

geneacutetica cliacutenica de forma homogeacutenea y utilizar una

nomenclatura uniforme que no pueda llevar a equi‐

vocaciones Ante la posible confusioacuten entre los teacutermi‐

nos mutacioacuten (cambio permanente en la secuencia

de nucleoacutetidos) y polimorfismo (variante con una fre‐

cuencia superior al 1) o la asuncioacuten erroacutenea de ca‐

racteriacutesticas negativas para mutacioacuten y positivas para

polimorfismo los autores recomiendan utilizar siem‐

pre el teacutermino variante acompantildeado de modificado‐

res que especifiquen su grado de patogenicidad

(patogeacutenico probablemente patogeacutenico significado

incierto probablemente benigna benigna) Respec‐

to a la nomenclatura los autores recomiendan la que

mantiene la Sociedad de Variacioacuten del Genoma Hu‐

mano (httpwwwhgvsorg) y en cualquier caso

aconsejan que los laboratorios indiquen queacute nomen‐

clatura y versioacuten utilizan en sus informes

En el trabajo se incluyen tambieacuten dos importantes

recursos para los laboratorios cliacutenicos En primer lu‐

gar un listado de bases de datos poblacionales (con

informacioacuten de las frecuencias de las variantes en

diferentes poblaciones) y de enfermedades

(variantes encontradas en pacientes y evaluacioacuten de

patogenicidad) Aunque la utilidad de estas bases de

datos es indudable los autores recuerdan que los

laboratorios cliacutenicos deberaacuten tener en cuenta la fre‐

cuencia con que se actualiza la informacioacuten en los

repositorios los meacutetodos de validacioacuten nomenclatu‐

rahellip En segundo lugar los autores incluyen tambieacuten

Diagnoacutestico y consejo geneacutetico Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 13

revistageneticamedicacom

un listado de diferentes programas de prediccioacuten

computacional in silico de mutaciones que afectan a

la pauta de lectura de los genes o a los sitios de pro‐

cesado del ARN mensajero asiacute como del grado de

conservacioacuten de las posiciones nucleotiacutedicas

El segundo bloque del artiacuteculo se centra en los crite‐

rios para interpretar las variantes geneacuteticas identifi‐

cadas y evaluar su grado de patogenicidad en rela‐

cioacuten con enfermedades mendelianas diferenciando

en dos bloques variantes patogeacutenicas o probable‐

mente patogeacutenicas y variantes benignas o probable‐

mente patogeacutenicas

A continuacioacuten los autores hablan sobre la forma de

presentar los resultados sobre variantes geneacuteticas

en definitiva el producto final de los laboratorios cliacute‐

nicos Asiacute los informes deberiacutean incluir los resultados

presentados de forma estructurada la interpretacioacuten

de los mismos junto con las evidencias en las que

estaacute basada referencias metodologiacutea y descargo de

responsabilidades cuando sea necesario Ademaacutes de

las situaciones generales en el trabajo se incorporan

consideraciones especiales como las variantes de

significado incierto el anaacutelisis de individuos sanos

los hallazgos inesperados variantes mitocondriales

variantes implicadas en el metabolismo de faacutermacos

o enfermedades complejas

Por uacuteltimo los autores incluyen una seccioacuten sobre

coacutemo deberiacutean utilizar las recomendaciones los pro‐

fesionales de la salud Teniendo en cuenta que el ob‐

jetivo principal de las pruebas geneacuteticas llevadas a

cabo en un laboratorio cliacutenico es dirigir o apoyar la

toma de decisiones meacutedicas a traveacutes de la identifica‐

cioacuten de las causas de la enfermedad o de factores

que afecten a la respuesta a determinados faacutermacos

los autores reconocen la interaccioacuten y el trabajo cola‐

borativo entre los profesionales meacutedicos que tratan a

los pacientes y los del laboratorio encargado de reali‐

zar las pruebas como algo crucial Los resultados de

cada paciente deben ser evaluados por el laboratorio

y el meacutedico responsable dentro del contexto de la

historia meacutedica y familiar del paciente y la identifica‐

cioacuten de una nueva variante geneacutetica no debe ser asu‐

mida como relevante simplemente porque sea rara

nueva o de novo (no heredada) Ademaacutes en la medi‐

da de lo posible la toma de decisiones a partir de los

resultados geneacuteticos deberiacutea complementarse con

informacioacuten cliacutenica adicional

El creciente nuacutemero de pruebas geneacuteticas disponi‐

bles en la actualidad requiere el desarrollo de estaacuten‐

dares para los diferentes laboratorios cliacutenicos encar‐

gados de realizarlas maacutes allaacute de las normas de cali‐

dad asiacute como de recomendaciones para interpretar

las variantes geneacuteticas que puedan ser identificadas

en el anaacutelisis Iniciativas como la llevada a cabo por el

ACMG y la Asociacioacuten de Patologiacutea Molecular favore‐

cen la estandarizacioacuten de conceptos y facilitan la to‐

ma de decisiones basadas en resultados geneacuteticos al

tiempo que contribuyen a mejorar la calidad de los

servicios de los laboratorios

Referencia Richards S et al Standards and guideli‐

nes for the interpretation of sequence variants a joint

consensus recommendation of the American College of

Medical Genetics and Genomics and the Association

for Molecular Pathology Genet Med 2015 Mar 5 doi

101038gim201530

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 2: Genética Médica News Número 20

Ruben Artero Allepuz

Universitat de Valegravencia

Mordf Joseacute Calasanz Abinzano

Universidad de Navarra

Aacutengel Carracedo

Universidad Santiago de Compostela

Juan Cruz Cigudosa

Centro Nacional de Investigaciones Oncoloacutegi‐

cas

Carmen Espinoacutes Armero

CIBER de Enfermedades Raras (CIBERER)

Centro de Investigacioacuten Priacutencipe Felipe (CIPF)

Manel Esteller

Instituto de Investigacioacuten Biomeacutedica de Bell‐

vitge (IDIBELL)

Universitat de Barcelona

Xavier Estivill

Centro de Regulacioacuten Genoacutemica Barcelona

Jaime Font de Mora

Instituto de Investigacioacuten Sanitaria IIS‐La Fe

Javier Garciacutea Planells

Instituto de Medicina Genoacutemica

Joseacute Miguel Garciacutea Sagredo

Universidad de Alcalaacute

Roser Gonzaacutelez

Universitat de Barcelona

Juan de Dios Garciacutea Diacuteaz

Hospital Universitario Priacutencipe de Asturias

Universidad de Alcalaacute de Henares

Encarnacioacuten Guilleacuten Navarro

Hospital Cliacutenico Universitario Virgen de la

Arrixaca

UCAM‐Universidad Catoacutelica de Murcia

CIBER de Enfermedades Raras (CIBERER)‐

ISCIII

Adolfo Loacutepez de Munain Arregui

Hospital Universitario Donostia

Instituto Biodonostia

Joseacute Antonio Loacutepez Guerrero

Fundacioacuten del Instituto Valenciano de On‐

cologiacutea (IVO)

Carlos Loacutepez Otiacuten

Universidad de Oviedo

Joseacute Antonio Lorente Acosta

Centro Pfizer‐Universidad de Granada‐ Junta

de Andaluciacutea de Genoacutemica e Investigacioacuten

Oncoloacutegica (GENYO)

Ana Lluch

Hospital Cliacutenico de Valencia Hospital

Universitat de Valegravencia

Julio Ceacutesar Martiacuten Rodriacuteguez

Iviomics SL Instituto Universitario IVI Valen‐

cia

Francisco Martiacutenez Castellano

Hospital Universitario y Politeacutecnico la Fe de

Valencia

Joseacute Mariacutea Millaacuten

Instituto de Investigacioacuten Sanitaria IIS‐La Fe

CIBERER‐Biobank

CIBER de Enfermedades Raras (CIBERER)

Mordf Dolores Moltoacute

Universitat de Valegravencia

CIBER de Salud Mental (CIBERSAM)

Lorenzo Montserrat Iglesias

Complejo Hospitalario Universitario A Coruntildea

Health in Code

M Carolina Ortube

The Jules Stein Eye Instituye

University of California Los Angeles (UCLA)

Federico Vicente Pallardoacute Calatayud

Universitat de Valegravencia

Antonio Peacuterez Ayteacutes

Hospital Universitario y Politeacutecnico la Fe de

Valencia

Luis Peacuterez Jurado

Universitat Pompeu Fabra Barcelona

Oacutescar Puig

Translational Clinical Research Center

Roche New York

Ramiro Quiroga de la Cruz

Hospital Universitario y Politeacutecnico La Fe de

Valencia

Feliciano Ramos

Universidad de Zaragoza

Joaquiacuten Rueda Puente

Universidad Miguel Hernaacutendez

Eduardo Vilar Saacutenchez

MD Anderson Cancer Center Houston

EEUU

Geneacutetica Meacutedica News

ISSN 2386‐5113

Universitat de Valegravencia

Departamento de Geneacutetica

cDoctor Moliner 50

Burjassot (Valencia)

ESPANtildeA

Oficina Editorial

redaccionmedigenees

Publicidad

infomedigenees

Direccioacuten Dr Manuel Peacuterez Alonso

Profesor Titular

Departamento de Geneacutetica

Universitat de Valegravencia

Redaccioacuten y edicioacuten Dra Amparo Tolosa

Publicidad Loreto Crespo

Marketing y presencia en

Internet Vicent Ferrer

Geneacutetica Meacutedica News

MedigenePress SL sus trabajadores y colaboradores no asumen ninguna responsabilidad derivada del uso incorrecto de la informacioacuten facilitada en la paacutegina web

revistageneticamedicacom y en el boletiacuten de noticias Geneacutetica Meacutedica News o de la presencia de errores u omisiones La mencioacuten de cualquier meacutetodo terapia

tratamiento o servicio no debe ser considerado una garantiacutea para su utilizacioacuten El contenido de Geneacutetica Meacutedica News tiene una uacutenica finalidad informativa De‐

terminar el tratamiento adecuado para un paciente es responsabilidad de los meacutedicos y facultativos El contenido de la publicacioacuten Geneacutetica Meacutedica News no es en

modo alguno sustituto del consejo proporcionado por personal profesional de la salud cualificado MedigenePress SL recomienda consultar de forma indepen‐

diente otras fuentes asiacute como a otros profesionales antes de confiar en la fiabilidad de un tratamiento

La presente obra estaacute bajo una licencia de Creative Commons Reconocimiento 40 Internacional

2 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Comiteacute Editorial y Cientiacutefico

Visita nuestra web

wwwrevistageneticamedicacom

MedigenePress SL

En este nuacutemero

Geneacutetica Meacutedica News

bull Nuevo siacutendrome causado por mutaciones en el gen AFF4 5

bull Contribucioacuten de las CNV multialeacutelicas a la variabilidad geneacutetica humana 7

bull Informacioacuten parcial en muchos sitios de Internet que ofrecen servicios geneacuteticos para la

medicina personalizada en caacutencer8

bull Poleacutemica y preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos 10

bull Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en

laboratorios cliacutenicos12

bull Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer 14

bull Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett 16

bull iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad 18

bull Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen

EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten19

bull Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis 21

bull Noticias Cortas 24

bull Congresos 29

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 3

revistageneticamedicacom

En portada

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de Enfermedades Instituto Nacional de

Salud EEUU

La revista Geneacute ca Meacutedica acepta ar culos enviados para su publicacioacuten en las secciones de

Actualidad y opinioacuten

bull Ar culos de opinioacutenComentariosCartas al director

bull Resentildeas de inves gaciones de los autores

Trabajos de inves gacioacuten

bull Casos cliacutenicos

bull Revisiones

Las normas de publicacioacuten en Geneacute ca Meacutedica siguen las recomendaciones del Interna onal Commi eee of Medical Journal Editors (ICMJE) depositadas en h pwwwicmjeorgrecommenda onsbrowse

Enviacuteo de trabajos

Los manuscritos des nados a su publicacioacuten se remi raacuten por correo electroacutenico a redaccioacutenmedigenecom

Aceptacioacuten revisioacuten y publicacioacuten de los trabajos

Seccioacuten de actualidad y opinioacuten

Los ar culos de la seccioacuten de actualidad y opinioacuten no se someten a revisioacuten externa aunque siacute se evaluaraacute por el personal de redaccioacuten y direccioacuten su adecuacioacuten al es lo y contenido de la revista asiacute como el rigor e intereacutes para el lector Los ar culos seraacuten revisados por la redaccioacuten y su aceptacioacuten comunicada a los autores En caso de duda la aceptacioacuten seraacute evaluada por el comiteacute editorial

Las normas especiacuteficas para las resentildeas de inves gacioacuten son las siguientes

Para enviar resentildeas de inves gacioacuten relacionadas con la Geneacute ca Meacutedica y Medicina Genoacutemica a Geneacute ca Meacutedica News los autores deberaacuten enviar un correo electroacutenico con el ar culo en formato Word a la siguiente direccioacuten redac-cionmedigenees

Se aceptaraacuten resentildeas de ar culos ya publicados o en edicioacuten avanzada online cuyos autores esteacuten incluidos en la publica-cioacuten mencionada en la referencia bibliograacutefica o que formen parte de oficinas de prensa o comunicacioacuten de los centros de inves gacioacuten que par cipan en la publicacioacuten

El enviacuteo de ar culos implica la aceptacioacuten de su publicacioacuten bajo la misma licencia que la Newsle er esto es Licencia Crea ve Commons Reconocimiento 40 Internacional

Normas de edicioacuten

bull Formato Word

bull Liacutemite de 7000 caracteres (incluyendo referencia y

fuentes)

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Autores y afiliaciones

bull Cuerpo del ar culo incluyendo referencia y fuente

bull Referencia bibliograacutefica Formato Pubmed (ver apartado

de referencias bibliograacuteficas)

bull Fuente (en caso de aparecer la nota informa va en el si o

web del centro de inves gacioacuten)

bull Palabras clave

bull Resumen (hasta 30 palabras)

En el caso de desear incluir una imagen el formato acepta-do seraacute jpg y los autores deberaacuten indicar que los derechos de la imagen les pertenecen y autorizar la u lizacioacuten de la imagen por parte de Geneacute ca Meacutedica News

Las normas especiacuteficas para los ar culos de opinioacuten son las siguientes

bull Formato Word

bull Liacutemite de 7000 caracteres (incluyendo referencia y

fuentes)

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Autores y afiliaciones

bull Cuerpo del ar culo incluyendo referencia y fuente

bull Referencias bibliograacuteficas si fuera necesario (ver el

formato en la seccioacuten correspondiente)

bull Fuente en caso necesario

bull Palabras clave

Trabajos de inves gacioacuten

La aceptacioacuten o no de los ar culos de inves gacioacuten seraacute evaluada inicialmente por el equipo editorial y en caso de cumplir los requisitos de publicacioacuten se iniciaraacute el proceso de revisioacuten con el enviacuteo de los originales a dos revisores cualificados de forma ciega En caso necesario se establece-raacute contacto con los autores para comunicar los comentarios de los revisores y para correcciones o revisiones Los evaluadores podraacuten aprobar el ar culo solicitar modifica-ciones que requieran de nueva revisioacuten o rechazar el ar culo En el caso de que uno de los revisores apruebe el ar culo y otro lo rechace se solicitaraacute la revisioacuten de un tercero

Normas de edicioacuten para los casos cliacutenicos (ar culos de correlacioacuten geno pofeno po o de caracterizacioacuten geneacute ca de pacientes)

bull Formato Word

bull Liacutemite de 20000 caracteres incluyendo bibliogra a

resumen tablas pies de figuras y anexos

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Informacioacuten de los autores (incluyendo nombre

afiliacioacuten y contacto)

bull Palabras clave

bull Resumen (hasta 300 palabras)

bull Cuerpo del ar culo estructurado de manera loacutegica

incluyendo referencias y fuentes

bull Las citas bibliograacuteficas se incluiraacuten dentro del texto

siguiendo el sistema Harvard Ejemplo (Garciacutea 2014)

bull Agradecimientos (opcional)

bull Patrocinios o becas cuando sea necesario

bull Referencias bibliograacuteficas tras el texto principal del

ar culo bajo el epiacutegrafe ldquoReferenciasrdquo en el formato requerido (ver apartado de referencias bibliograacuteficas)

bull Graacuteficas o imaacutegenes y el texto adjunto al final del docu-

mento

Normas de edicioacuten para las revisiones (ar culos en los que se revisa el estado actual de temas relacionados con la geneacute ca meacutedica)

Formato Word

bull Liacutemite de 40000 caracteres incluyendo bibliogra a

resumen tablas pies de figuras y anexos

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Informacioacuten de los autores (incluyendo nombre

afiliacioacuten y contacto)

bull Palabras clave

bull Resumen (hasta 400 palabras)

bull Cuerpo del ar culo estructurado de manera loacutegica

incluyendo referencias y fuentes

bull Las citas bibliograacuteficas se incluiraacuten dentro del texto

siguiendo el sistema Harvard Ejemplo (Garciacutea 2014)

bull Agradecimientos (opcional)

bull Patrocinios o becas cuando sea necesario

bull Referencias bibliograacuteficas tras el texto principal del

ar culo bajo el epiacutegrafe ldquoReferenciasrdquo en el formato requerido (ver apartado de referencias bibliograacuteficas)

bull Graacuteficas o imaacutegenes y el texto adjunto al final del docu-

mento

En el caso de incluir imaacutegenes eacutestas se presentaraacuten aparte de forma numerada y con su correspondiente tulo y leyenda Los formatos aceptados seraacuten jpg o ff Asiacute mismo el enviacuteo de imaacutegenes o ilustraciones conlleva el compromiso por parte de los autores de poseer los derechos de repro-duccioacuten de las mismas o en caso alterna vo de que el material enviado es libre de derechos

Para garan zar la revisioacuten ciega el tulo la informacioacuten de los autores y palabras clave iraacuten en la primera paacutegina que seraacute eliminada en el proceso de revisioacuten Ademaacutes el resto del ar culo no incluiraacute ninguna informacioacuten mediante la cual se pudiera iden ficar a los autores

Responsabilidades de los autores

Al enviar un trabajo a esta revista los autores aceptan

bull Que el ar culo es un trabajo original y no ha sido previa-

mente publicado ni enviado a otra publicacioacuten simultaacutenea-mente

bull Que todos los autores han contribuido intelectualmente

en el trabajo enviado

bull Que todos los autores han leiacutedo y aprobado la versioacuten

final

bull Los teacuterminos de la poliacute ca editorial de Geneacute ca Meacutedica

en lo que se refiere a derechos de autor y editor

Se en ende que en el caso de las resentildeas de inves gacioacuten al tratarse de resuacutemenes de ar culos ya publicados en otras revistas la informacioacuten no sea original

Ademaacutes los autores haraacuten una declaracioacuten de ausencia de conflictos de intereses

Normas bibliograacuteficas

Referencias bibliograacuteficas en el texto

Dentro del texto principal las referencias bibliograacuteficas se presentaraacuten de modo abreviado siguiendo el sistema Harvard o autor-antildeo entre pareacutentesis Ejemplo (Garciacutea 1978)

Referencias

La informacioacuten completa (autor tulo antildeo editorial o publicacioacuten nuacutemero) de las referencias bibliograacuteficas se mostraraacute despueacutes del texto principal bajo el epiacutegrafe de ldquoReferenciasrdquo En este apartado deben encontrarse todas las referencias bibliograacuteficas incluidas en el texto del mismo modo que todas las referencias de la lista deben de mencio-narse en el texto Las referencias estaraacuten ordenadas alfabeacute-camente por autores

El formato a seguir de las referencias seraacute el siguiente

‐ Ar culos

En los ar culos con maacutes de dos autores se mostraraacute uacutenica-mente al primero de ellos seguido de et al

Crick FH et al Is DNA really a double helix J Mol Biol 1979 Apr 15129(3)449-57 doi1010160022-2836(79)90506-0

‐ Libros y capiacutetulos de libro

Jorde LB et al Medical Gene cs Fourth Edi on 2010 Mosby Philadelphia ISBN 978-0-323-05373-0

‐ Paacuteginas de internet (indicar entre corchetes la fecha de la uacutel ma visita)

Revista Geneacute ca Meacutedica News URL h previstagene camedicacom [01-01-2015]

‐ Publicaciones electroacutenicas o recursos dentro de una paacutegina web (indicar entre corchetes si fuera necesario la fecha de la uacutel ma consulta

Lista de las enfermedades raras por orden alfabeacute co Informes Perioacutedicos de Orphanet Serie Enfermedades Raras Julio 2014 URL h pwwworphanetorphacomcahiersdocsESLista_de_enfermedades_raras_por_orden_alfabe copdf

Responsabilidades eacute cas

Consen miento informado Los ar culos en los que se lleva acabo inves gacioacuten en seres humanos deben regirse por los principios acordados en la Declaracioacuten de Helsinki y mani-festar en el apartado de meacutetodos que tanto el procedimien-to como el consen miento informado fueron aprobados por el correspondiente Comiteacute de Eacute ca de la ins tucioacuten Si en alguacuten caso especialmente en el de los ar culos de Caso Cliacutenico es posible iden ficar a alguacuten paciente o se desea publicar una fotogra a de eacuteste deberaacute presentarse el consen miento informado o en caso de ser menor el consen miento de sus padres o tutores

Ensayos cliacutenicos Para publicar manuscritos que incluyan ensayos cliacutenicos deberaacute enviarse junto con el documento una copia de la aprobacioacuten de las autoridades sanitarias de los paiacuteses en los que se ha desarrollado la inves gacioacuten experimental

Experimentos con animales En caso de presentar datos de experimentacioacuten con animales deberaacute facilitarse la declara-cioacuten del cumplimiento con la norma va europea y espantildeola (Real decreto 532013 de 1 de febrero por el que se esta-blecen las normas baacutesicas aplicables para la proteccioacuten de los animales u lizados en experimentacioacuten y otros fines cien ficos incluyendo la docencia)

Geneacutetica Meacutedica News

4 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

NORMAS DE PUBLICACIOacuteN E INSTRUCCIONES PARA LOS AUTORES

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 5

revistageneticamedicacom

Nuevo siacutendrome causado por mutaciones en el gen AFF4

La regulacioacuten de la transcripcioacuten proceso por el que

las instrucciones en el ADN son copiadas al RNA es

crucial para el correcto funcionamiento de las ceacutelulas

Especialmente durante el desarrollo embrionario

cualquier alteracioacuten en este mecanismo puede tener

consecuencias importantes en el individuo

Investigadores del Childrenrsquos Hospital of Philadelphia

han identificado un nuevo siacutendrome causado por mu‐

taciones de novo en el gen AFF4 implicado en la re‐

gulacioacuten de la transcripcioacuten durante el desarrollo

resultado que arroja luz sobre los mecanismos de

accioacuten que intervienen en este proceso a lo largo del

desarrollo y sus efectos sobre el programa de expre‐

sioacuten del genoma humano

Mediante secuenciacioacuten del exoma completo los in‐

vestigadores dirigidos por Ian D

Krantz encontraron mutaciones que provocaban un

cambio de aminoaacutecido en el gen AFF4 en tres nintildeos

con un siacutendrome nuevo que comparte varios de los

rasgos tiacutepicos del siacutendrome de Cornelia de Lange

Este nuevo cuadro cliacutenico recibioacute el nombre de

CHOPS acroacutenimo en ingleacutes derivado de los siacutento‐

mas que se presentan desorden cognitivo con rasgos

faciales caracteriacutesticos defectos cardiacuteacos obesidad

problemas pulmonares baja estatura y displasia es‐

queleacutetica

AFF4 codifica para uno de los componentes del com‐

plejo de super elongacioacuten (SEC en sus siglas en in‐

gleacutes) grupo de proteiacutenas encargadas de controlar la

fase de elongacioacuten de la transcripcioacuten en la que la

ARN polimerasa II cataliza la produccioacuten de la cadena

de ARN En los nintildeos con mutaciones en el gen AFF4

las mutaciones provocan resistencia a la degradacioacuten

de la proteiacutena AFF4 por lo que esta se acumula mo‐

dificando la distribucioacuten de la ARN polimerasa II en el

genoma y con ella el patroacuten de expresioacuten que mues‐

tran las ceacutelulas de los pacientes ambos mecanismos

confirmados por los investigadores a traveacutes de expe‐

rimentos de inhibicioacuten de la expresioacuten del gen

Dada la similitud fenotiacutepica entre el nuevo siacutendrome

y el siacutendrome de Cornelia de Lange los investigado‐

res compararon la expresioacuten geacutenica de fibroblastos

obtenidos de ambos tipos de pacientes encontrando

patrones similares en ambas condiciones lo que apo‐

ya la hipoacutetesis de que en ambas condiciones inter‐

vengan procesos patoloacutegicos comunes A traveacutes de

Transcripcioacuten produccioacuten de ARN mensajero Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

6 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

diferentes experimentos el equipo de Krantz deter‐

minoacute que la distribucioacuten alterada de AFF4 afecta a la

unioacuten de la cohesina a la ARN polimerasa II en el siacuten‐

drome CHOPS de forma inversa a lo que sucede en

el siacutendrome de Cornelia de Lange en el que la distri‐

bucioacuten alterada de la cohesina afecta a la unioacuten de

AFF4 Asiacute los investigadores confirmaron mecanis‐

mos comunes en ambas enfermedades

El siacutendrome CHOPS constituye el primer desorden

del desarrollo humano causado por mutaciones en la

liacutenea germinal en el gen AFF4 Las conclusiones del

trabajo ponen de manifiesto la importancia de la re‐

gulacioacuten de la funcioacuten de la ARN polimerasa II para el

correcto funcionamiento del programa de expresioacuten

geacutenica durante la embriogeacutenesis humana y ofrecen

una nueva perspectiva para los pacientes que presen‐

ten los siacutentomas del nuevo siacutendrome ldquoLos resultados

de la investigacioacuten ofrecen beneficios praacutecticos y

emocionales para las familiasrdquo indica Krantz que ya

participoacute en la identificacioacuten del primer gen asociado

al siacutendrome de Cornelia de Lange ldquoLos meacutedicos po‐

driacutean solicitar pruebas maacutes apropiadas para monito‐

rizar y manejar cuestiones meacutedicas especiacuteficas deri‐

vadas del siacutendrome CHOPS Esto significa tambieacuten

que las familias y los nintildeos pueden finalizar su lsquoodisea

diagnoacutesticarsquo‐ la procesioacuten frustrante de pruebas y

tratamientos sin eacutexito que se produce de forma fre‐

cuente al tratar de encontrar respuesta para las fami‐

lias que tienen un nintildeo afectado por un desorden

complejo no diagnosticadordquo

Referencia Izumi K et al Germline gain‐of‐function

mutations in AFF4 cause a developmental syndrome

functionally linking the super elongation complex and

cohesin Nat Genet 2015 Mar 2 doi 101038

ng3229

Fuente httpwwwnewswisecom

Pese a que normalmente se considera que todos los

miembros de la especie humana contienen la misma

cantidad de material hereditario en sus ceacutelulas lo

cierto es que en muacuteltiples regiones geacutenicas los geno‐

mas humanos presentan variabilidad en el nuacutemero

de copias de algunos segmentos del ADN Un caso

especial de CNV como se denomina a este tipo de

polimorfismo geneacutetico (de copy number variation en

ingleacutes) son las CNV multialeacutelicas que se presentan

en un nuacutemero de estados o alelos mayor de dos Las

CNV multialeacutelicas son difiacuteciles de analizar debido a

algunas limitaciones teacutecnicas la incapacidad de dis‐

criminar entre el nuacutemero de estados consecutivos

(por ejemplo nueve o diez) mediante teacutecnicas comu‐

nes como los microarrays o la PCR cuantitativa ruti‐

naria y el amplio rango de nuacutemeros de copias con los

que se pueden en el genoma desde dos hasta doce o

maacutes copias

Un equipo formado por investigadores de la Universi‐

dad de Harvard y del centro de Biologiacutea Digital de la

empresa biotecnoloacutegica Bio‐Rad ha sobrepasado

estas limitaciones mediante la combinacioacuten de la

secuenciacioacuten masiva del genoma completo y la PCR

digital permitiendo estimar la contribucioacuten de las

CNV multialeacutelicas a la variabilidad humana

Con el objetivo de identificar el nuacutemero de copias

alelos y haplotipos (combinaciones de alelos en un

mismo cromosoma) de las CNV multialeacutelicas de ma‐

yor tamantildeo los investigadores analizaron casi 850

genomas obtenidos por secuenciacioacuten masiva en el

proyecto de los 1000 genomas Entre las maacutes de

3800 CNVs encontradas por meacutetodos computacio‐

nales cerca de 1400 presentaban maacutes de tres alelos

posibles A continuacioacuten la aproximacioacuten compu‐

tacional fue validada mediante ddPCRTM PCR digital

que incluye la emulsioacuten y fraccionamiento de la

muestra en miles de gotitas en las que se lleva a ca‐

bo la reaccioacuten de amplificacioacuten de forma indepen‐

diente

Los resultados del trabajo indican que las CNV multi‐

aleacutelicas afectan ampliamente a los genes y a su ex‐

presioacuten siendo la principal fuente de variacioacuten de la

dosis geacutenica en humanos (hasta un 88 de la variabi‐

lidad) Dicha variacioacuten ademaacutes influye fuertemente

en los niveles de expresioacuten

ldquoDespueacutes de un largo periodo de no ser capaces de

llevar a cabo anaacutelisis geneacuteticos precisos de las CNVs

multialeacutelicas en geneacutetica humana estas herramien‐

tas ndash tanto la secuenciacioacuten del genoma completo

como los aacutegiles ensayos de ddPCRTM‐ podraacuten permi‐

tir anaacutelisis cuidadosos de CNV multialeacutelicas en cohor‐

tes humanasrdquo indica Steven McCarroll profesor de

la Universidad de Harvard y director del trabajo ldquoDe

modo tranquilizador estas aproximaciones parecen

proporcionar resultados que concuerdan entre siacuterdquo

Las conclusiones del trabajo abren diferentes frentes

de trabajo desde evaluar el efecto de las combina‐

ciones de alelos en cada locus a analizar el impacto

de su variacioacuten en los fenotipos humanos Dado su

efecto sobre la dosis geacutenica o los niveles de expre‐

sioacuten y la asociacioacuten de genes localizados en las CNVs

con diversas enfermedades humanas es de esperar

que el estudio de las CNVs multialeacutelicas arroje nueva

luz sobre su influencia en diferentes patologiacuteas Del

mismo modo las CNVs podriacutean influir en la respuesta

a faacutermacos contribucioacuten que algunos investigadores

ya indican que estaacute siendo infraestimada

Referencia Handsaker RE et al Large multiallelic copy number variations in humans Nat Genet 2015

Mar47(3)296‐303 doi 101038ng3200

Fuente httpwwweurekalertorg

pub_releases2015‐03cg‐sn030215php

Contribucioacuten de las CNV multialeacutelicas a la variabilidad geneacutetica humana

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 7

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Informacioacuten parcial en muchos sitios de Internet que ofrecen servicios geneacuteticos para la medicina personalizada en caacutencer

Durante los uacuteltimos antildeos el raacutepido crecimiento en la

capacidad de llevar a cabo diagnoacutestico geneacutetico ha

propiciado la aparicioacuten de diferentes sitios de Inter‐

net en los que se ofrecen servicios geneacuteticos La exis‐

tencia de este tipo de carteras de servicios y su facili‐

dad de acceso representan un gran potencial para

extender la utilizacioacuten del diagnoacutestico geneacutetico den‐

tro de la comunidad meacutedica asiacute como mejorar la ca‐

pacidad predictiva o la posibilidad de tomar decisio‐

nes sobre tratamiento de los pacientes Sin embargo

la comercializacioacuten por Internet de pruebas geneacuteticas

en el contexto de la medicina personalizada no estaacute

regulada lo que ha aumentado la preocupacioacuten de

los investigadores y profesionales meacutedicos ya que

muchas de ellas pueden no tener utilidad cliacutenica

Un reciente estudio del Instituto del Caacutencer Dana‐

Farber publicado en el Journal of the National Cancer

Institute ha evaluado los sitios de Internet que ofre‐

cen pruebas geneacuteticas para la medicina personaliza‐

da en caacutencer y concluido que a menudo se exagera

en ellos los beneficios al tiempo que se minimizan o

ignoran las limitaciones

En el estudio los investigadores analizaron la infor‐

macioacuten de 55 sitios de Internet (identificados por

buacutesquedas de palabras en ingleacutes) que comercializan

productos geneacuteticos para la medicina personalizada

del caacutencer patrocinados bien por empresas comer‐

ciales instituciones acadeacutemicas centros de investi‐

gacioacuten o meacutedicos individuales El criterio para consi‐

Museo de Ciencias de Londres Imagen John Goode (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 9

revistageneticamedicacom

derar uno de estos productos fue el de ldquoproductos o

servicios que pueden ser utilizados para llevar a cabo

un manejo individualizado del paciente basaacutendose

en datos genoacutemicos o derivados de tumoresrdquo

ldquoQueriacuteamos ver si los consumidores reciben una ima‐

gen equilibrada de los beneficios y limitaciones de

estos serviciosrdquo indica Stacy Gray primera autora

del trabajo ldquoEncontramos mucha variabilidad Parte

de la informacioacuten es buena pero toda ella necesita

ser analizada criacuteticamente por los consumidores y

profesionales sanitariosrdquo

Los investigadores encontraron que un 85 de los

sitios evaluados incluiacutean informacioacuten sobre los bene‐

ficios de sus productos pero apenas el 27 incluiacutea

informacioacuten de sus limitaciones Ademaacutes la mayor

parte de los servicios geneacuteticos ofertados dirigidos

hacia la identificacioacuten de variantes somaacuteticas esto

es no heredadas de los padres y desarrolladas a lo

largo de la vida del individuo incluiacutean pruebas no

estaacutendar o no validadas (definidas por los autores

como pruebas basadas en sugerencias inferidas o sin

evidencias de que la salud mejoraraacute al utilizar datos

de alteraciones genoacutemicas) En este sentido en la

actualidad la estandarizacioacuten de pruebas molecula‐

res y geneacuteticas en el contexto del caacutencer constituye

un problema a resolver ya que el tratamiento perso‐

nalizado contra el caacutencer evoluciona maacutes raacutepido de lo

que las organizaciones profesionales pueden asimilar

para elaborar protocolos de estandarizacioacuten

A raiacutez de los resultados obtenidos del anaacutelisis de los

sitios de Internet los autores indican que hasta que

los anaacutelisis genoacutemicos esteacuten maacutes regulados en medi‐

cina en general y en medicina personalizada en par‐

ticular los profesionales meacutedicos seraacuten los responsa‐

bles de guiar a los pacientes a lo largo del proceso y

ayudarles a entender conceptos como el de validez

cliacutenica utilidad cliacutenica o la generalizacioacuten de resulta‐

dos de investigacioacuten Esto advierten no seraacute posible

si dichos profesionales no estaacuten versados en genoacutemi‐

ca Sin la educacioacuten y formacioacuten adecuada de estos

profesionales tanto la integracioacuten de las pruebas

geneacuteticas y genoacutemicas en la praacutectica cliacutenica como su

oacuteptima utilizacioacuten se veraacuten limitadas significativa‐

mente

Asiacute a pesar de su gran potencial la venta de produc‐

tos geneacuteticos relacionados con la medicina personali‐

zada por Internet podriacutea resultar perjudicial si aporta

productos de beneficio no probado o si los resultados

que se puedan obtener son indiferentes para la situa‐

cioacuten del paciente En estos momentos dada la am‐

plia variedad de servicios disponibles en algunos paiacute‐

ses la informacioacuten y capacidad criacutetica de los profe‐

sionales de la salud es crucial para identificar aquellos

basados en evidencias robustas contrastadas y vali‐

dadas

Referencias

Gray SW et al Marketing of personalized cancer care

on the web an analysis of internet websites J Natl

Cancer Inst 2015 Mar 5107(5) pii djv030 doi

101093jncidjv030

Garber K Oncologists push beyond new lung cancer

genomic testing guidelines J Natl Cancer Inst 2015

Feb 12107(2) pii djv023 doi 101093jncidjv023

Fuente httpwwwdana‐farberorgNewsroom

Geneacutetica Meacutedica News

10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Poleacutemica y preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos

Las nuevas teacutecnicas de edicioacuten del genoma han

abierto la posibilidad de modificar de forma precisa

el ADN humano La tecnologiacutea seguacuten un gran nuacuteme‐

ro de especialistas ya estaacute puesta a punto Las con‐

secuencias de su aplicacioacuten sin embargo todaviacutea se

desconocen

Un antildeo despueacutes de que se obtuvieran con eacutexito los

primeros primates adultos con mutaciones especiacutefi‐

cas introducidas mediante teacutecnicas de edicioacuten del

genoma los intensos rumores de que ya se ha modi‐

ficado el genoma en embriones humanos han levan‐

tado la voz de alarma en la comunidad cientiacutefica Di‐

chos rumores parecen tener fundamento ya que el

equipo de Nature News ha comunicado que varios

investigadores que no desean hacer puacuteblicos sus

nombres han informado de la existencia de diversos

trabajos en los que se ha modificado el genoma en

embriones humanos que estaacuten siendo considerados

para su publicacioacuten Ante esta posibilidad la respues‐

ta no se ha hecho esperar y cinco expertos en teacutecni‐

cas de edicioacuten del genoma han publicado un comen‐

tario en el que solicitan una moratoria por parte de la

comunidad cientiacutefica al completo para retrasar la

utilizacioacuten de esta tecnologiacutea en humanos y en el que

urgen a iniciar el diaacutelogo sobre si deberiacutean de llevarse

a cabo investigaciones futuras que conlleven la modi‐

ficacioacuten geneacutetica de ceacutelulas germinales en la especie

humana y en queacute circunstancias deberiacutean permitirse

Editando directamente el genoma de un embrioacuten en

el estadiacuteo de una ceacutelula se puede llegar a obtener un

individuo con todas sus ceacutelulas modificadas No obs‐

tante la tasa con la que esto se consigue es baja y

existe la posibilidad de que se genere un mosaico

esto es que el organismo obtenido no tenga la mis‐

Imagen National Human Genome Research Institute wwwgenomeorg

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 11

revistageneticamedicacom

ma composicioacuten geneacutetica en todas sus ceacutelulas Debi‐

do a esta razoacuten la aproximacioacuten requiere la genera‐

cioacuten de un gran nuacutemero de embriones para obtener

uno completamente modificado Otro planteamien‐

to es la obtencioacuten de ceacutelulas germinales (oacutevulos y

espermatozoides) modificadas con los que poste‐

riormente llevar a cabo la fecundacioacuten Mediante

este meacutetodo se pueden generar multitud de ceacutelulas o

embriones modificados entre los que se podriacutean se‐

leccionar aquellos que incluyen el cambio Una vez

desarrollados en adultos los individuos modificados

podriacutean transmitir parte de su genoma editado a su

descendencia

Las aplicaciones meacutedicas de una modificacioacuten preci‐

sa y dirigida del genoma humano en embriones son

inmediatas ya que su utilizacioacuten evitariacutea la transmi‐

sioacuten de enfermedades causadas por mutaciones pa‐

togeacutenicas a la descendencia Sin embargo no se sa‐

be si esta modificacioacuten del genoma podriacutea generar

problemas despueacutes del nacimiento o a largo plazo ni

las consecuencias que podriacutea haber a nivel de la es‐

pecie humana en su conjunto en las sucesivas gene‐

raciones Sin olvidar que aunque la intencioacuten inicial

fuera exclusivamente terapeacuteutica la tecnologiacutea pue‐

de potencialmente introducir cambios relacionados

con otras caracteriacutesticas leacutease color de ojos de pe‐

lohellipy la facilidad con la que se puede utilizar podriacutea

derivar en el temido disentildeo de ldquonintildeos a la cartardquo En

cualquier caso en su comentario titulado ldquoNo editad

la liacutenea germinal humanardquo los investigadores sentildea‐

lan que sean o no filosoacutefica o eacuteticamente justifica‐

bles estas aplicaciones son irrelevantes hasta que

sea posible demostrar que su utilizacioacuten es segura y

se obtengan datos reproducibles a traveacutes de muacutelti‐

ples generaciones

Ademaacutes de la preocupacioacuten por las implicaciones

eacuteticas y de seguridad que conlleva la utilizacioacuten de

teacutecnicas de edicioacuten del genoma en la liacutenea germinal

humana los cientiacuteficos temen que el impacto negati‐

vo generado por la poleacutemica pueda afectar a la utili‐

zacioacuten de las teacutecnicas de edicioacuten en ceacutelulas de la liacutenea

somaacutetica (ceacutelulas que no se transmiten a la descen‐

dencia) la cual estaacute generando resultados muy pro‐

metedores para el tratamiento de diversas enferme‐

dades humanas

En cuanto a las consideraciones legales aunque mu‐

chos paiacuteses no tienen una legislacioacuten que permita o

prohiacuteba la ingenieriacutea geneacutetica en humanos por con‐

siderar esta aacuterea como algo experimental en los paiacute‐

ses donde siacute existen leyes relativas a la modificacioacuten

geneacutetica esta praacutectica estaacute prohibida en humanos al

igual que en muchos casos lo estaacute la modificacioacuten de

la liacutenea germinal No obstante conviene tener en

cuenta que la mayor parte de las normativas fueron

instauradas antes de que la avanzada teacutecnica de

CRISPR estuviera disponible por lo que podriacutean ser

modificadas para aceptar la intervencioacuten terapeacuteutica

En cualquier caso la poleacutemica estaacute servida Algunos

investigadores como David Sinclair de la Universi‐

dad de Harvard indican que la pregunta no es si la

obtencioacuten de embriones humanos modificados ten‐

draacute lugar o no sino maacutes bien cuaacutendo seraacute llevada a

cabo

Referencias

Lanphier E et al Donrsquot edit the human germ line Na‐

ture 2015 March 12 Doi 101038519410a

Regalado A Engineering the Perfect Baby MIT Tech

Rev 2015 httpwwwtechnologyreviewcom

featuredstory535661engineering‐the‐perfect‐baby

Cyranoski D Scientists sound alarm over DNA editing

of human embryos Nature News 2015 Doi 101038

nature201517110

Geneacutetica Meacutedica News

12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en laboratorios cliacutenicos

El Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas (ACMG

en sus siglas en ingleacutes) y la Asociacioacuten de Patologiacutea

Molecular de EEUU acaban de publicar una serie de

estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten

de variantes geneacuteticas en los laboratorios cliacutenicos

El objetivo del trabajo seguacuten sus autores es crear un

recurso educativo para los profesionales de la geneacuteti‐

ca que trabajan en laboratorios cliacutenicos y con ello

aumentar la calidad de los servicios proporcionados

que cada vez incluyen maacutes pruebas genoacutemicas ge‐

notipacioacuten anaacutelisis de genes individuales paneles

geacutenicos exomas genomas transcriptomashellip

La primera parte del trabajo estaacute centrada en consi‐

deraciones de tipo general como la necesidad de

definir los conceptos utilizados en los laboratorios de

geneacutetica cliacutenica de forma homogeacutenea y utilizar una

nomenclatura uniforme que no pueda llevar a equi‐

vocaciones Ante la posible confusioacuten entre los teacutermi‐

nos mutacioacuten (cambio permanente en la secuencia

de nucleoacutetidos) y polimorfismo (variante con una fre‐

cuencia superior al 1) o la asuncioacuten erroacutenea de ca‐

racteriacutesticas negativas para mutacioacuten y positivas para

polimorfismo los autores recomiendan utilizar siem‐

pre el teacutermino variante acompantildeado de modificado‐

res que especifiquen su grado de patogenicidad

(patogeacutenico probablemente patogeacutenico significado

incierto probablemente benigna benigna) Respec‐

to a la nomenclatura los autores recomiendan la que

mantiene la Sociedad de Variacioacuten del Genoma Hu‐

mano (httpwwwhgvsorg) y en cualquier caso

aconsejan que los laboratorios indiquen queacute nomen‐

clatura y versioacuten utilizan en sus informes

En el trabajo se incluyen tambieacuten dos importantes

recursos para los laboratorios cliacutenicos En primer lu‐

gar un listado de bases de datos poblacionales (con

informacioacuten de las frecuencias de las variantes en

diferentes poblaciones) y de enfermedades

(variantes encontradas en pacientes y evaluacioacuten de

patogenicidad) Aunque la utilidad de estas bases de

datos es indudable los autores recuerdan que los

laboratorios cliacutenicos deberaacuten tener en cuenta la fre‐

cuencia con que se actualiza la informacioacuten en los

repositorios los meacutetodos de validacioacuten nomenclatu‐

rahellip En segundo lugar los autores incluyen tambieacuten

Diagnoacutestico y consejo geneacutetico Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 13

revistageneticamedicacom

un listado de diferentes programas de prediccioacuten

computacional in silico de mutaciones que afectan a

la pauta de lectura de los genes o a los sitios de pro‐

cesado del ARN mensajero asiacute como del grado de

conservacioacuten de las posiciones nucleotiacutedicas

El segundo bloque del artiacuteculo se centra en los crite‐

rios para interpretar las variantes geneacuteticas identifi‐

cadas y evaluar su grado de patogenicidad en rela‐

cioacuten con enfermedades mendelianas diferenciando

en dos bloques variantes patogeacutenicas o probable‐

mente patogeacutenicas y variantes benignas o probable‐

mente patogeacutenicas

A continuacioacuten los autores hablan sobre la forma de

presentar los resultados sobre variantes geneacuteticas

en definitiva el producto final de los laboratorios cliacute‐

nicos Asiacute los informes deberiacutean incluir los resultados

presentados de forma estructurada la interpretacioacuten

de los mismos junto con las evidencias en las que

estaacute basada referencias metodologiacutea y descargo de

responsabilidades cuando sea necesario Ademaacutes de

las situaciones generales en el trabajo se incorporan

consideraciones especiales como las variantes de

significado incierto el anaacutelisis de individuos sanos

los hallazgos inesperados variantes mitocondriales

variantes implicadas en el metabolismo de faacutermacos

o enfermedades complejas

Por uacuteltimo los autores incluyen una seccioacuten sobre

coacutemo deberiacutean utilizar las recomendaciones los pro‐

fesionales de la salud Teniendo en cuenta que el ob‐

jetivo principal de las pruebas geneacuteticas llevadas a

cabo en un laboratorio cliacutenico es dirigir o apoyar la

toma de decisiones meacutedicas a traveacutes de la identifica‐

cioacuten de las causas de la enfermedad o de factores

que afecten a la respuesta a determinados faacutermacos

los autores reconocen la interaccioacuten y el trabajo cola‐

borativo entre los profesionales meacutedicos que tratan a

los pacientes y los del laboratorio encargado de reali‐

zar las pruebas como algo crucial Los resultados de

cada paciente deben ser evaluados por el laboratorio

y el meacutedico responsable dentro del contexto de la

historia meacutedica y familiar del paciente y la identifica‐

cioacuten de una nueva variante geneacutetica no debe ser asu‐

mida como relevante simplemente porque sea rara

nueva o de novo (no heredada) Ademaacutes en la medi‐

da de lo posible la toma de decisiones a partir de los

resultados geneacuteticos deberiacutea complementarse con

informacioacuten cliacutenica adicional

El creciente nuacutemero de pruebas geneacuteticas disponi‐

bles en la actualidad requiere el desarrollo de estaacuten‐

dares para los diferentes laboratorios cliacutenicos encar‐

gados de realizarlas maacutes allaacute de las normas de cali‐

dad asiacute como de recomendaciones para interpretar

las variantes geneacuteticas que puedan ser identificadas

en el anaacutelisis Iniciativas como la llevada a cabo por el

ACMG y la Asociacioacuten de Patologiacutea Molecular favore‐

cen la estandarizacioacuten de conceptos y facilitan la to‐

ma de decisiones basadas en resultados geneacuteticos al

tiempo que contribuyen a mejorar la calidad de los

servicios de los laboratorios

Referencia Richards S et al Standards and guideli‐

nes for the interpretation of sequence variants a joint

consensus recommendation of the American College of

Medical Genetics and Genomics and the Association

for Molecular Pathology Genet Med 2015 Mar 5 doi

101038gim201530

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 3: Genética Médica News Número 20

En este nuacutemero

Geneacutetica Meacutedica News

bull Nuevo siacutendrome causado por mutaciones en el gen AFF4 5

bull Contribucioacuten de las CNV multialeacutelicas a la variabilidad geneacutetica humana 7

bull Informacioacuten parcial en muchos sitios de Internet que ofrecen servicios geneacuteticos para la

medicina personalizada en caacutencer8

bull Poleacutemica y preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos 10

bull Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en

laboratorios cliacutenicos12

bull Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer 14

bull Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett 16

bull iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad 18

bull Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen

EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten19

bull Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis 21

bull Noticias Cortas 24

bull Congresos 29

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 3

revistageneticamedicacom

En portada

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de Enfermedades Instituto Nacional de

Salud EEUU

La revista Geneacute ca Meacutedica acepta ar culos enviados para su publicacioacuten en las secciones de

Actualidad y opinioacuten

bull Ar culos de opinioacutenComentariosCartas al director

bull Resentildeas de inves gaciones de los autores

Trabajos de inves gacioacuten

bull Casos cliacutenicos

bull Revisiones

Las normas de publicacioacuten en Geneacute ca Meacutedica siguen las recomendaciones del Interna onal Commi eee of Medical Journal Editors (ICMJE) depositadas en h pwwwicmjeorgrecommenda onsbrowse

Enviacuteo de trabajos

Los manuscritos des nados a su publicacioacuten se remi raacuten por correo electroacutenico a redaccioacutenmedigenecom

Aceptacioacuten revisioacuten y publicacioacuten de los trabajos

Seccioacuten de actualidad y opinioacuten

Los ar culos de la seccioacuten de actualidad y opinioacuten no se someten a revisioacuten externa aunque siacute se evaluaraacute por el personal de redaccioacuten y direccioacuten su adecuacioacuten al es lo y contenido de la revista asiacute como el rigor e intereacutes para el lector Los ar culos seraacuten revisados por la redaccioacuten y su aceptacioacuten comunicada a los autores En caso de duda la aceptacioacuten seraacute evaluada por el comiteacute editorial

Las normas especiacuteficas para las resentildeas de inves gacioacuten son las siguientes

Para enviar resentildeas de inves gacioacuten relacionadas con la Geneacute ca Meacutedica y Medicina Genoacutemica a Geneacute ca Meacutedica News los autores deberaacuten enviar un correo electroacutenico con el ar culo en formato Word a la siguiente direccioacuten redac-cionmedigenees

Se aceptaraacuten resentildeas de ar culos ya publicados o en edicioacuten avanzada online cuyos autores esteacuten incluidos en la publica-cioacuten mencionada en la referencia bibliograacutefica o que formen parte de oficinas de prensa o comunicacioacuten de los centros de inves gacioacuten que par cipan en la publicacioacuten

El enviacuteo de ar culos implica la aceptacioacuten de su publicacioacuten bajo la misma licencia que la Newsle er esto es Licencia Crea ve Commons Reconocimiento 40 Internacional

Normas de edicioacuten

bull Formato Word

bull Liacutemite de 7000 caracteres (incluyendo referencia y

fuentes)

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Autores y afiliaciones

bull Cuerpo del ar culo incluyendo referencia y fuente

bull Referencia bibliograacutefica Formato Pubmed (ver apartado

de referencias bibliograacuteficas)

bull Fuente (en caso de aparecer la nota informa va en el si o

web del centro de inves gacioacuten)

bull Palabras clave

bull Resumen (hasta 30 palabras)

En el caso de desear incluir una imagen el formato acepta-do seraacute jpg y los autores deberaacuten indicar que los derechos de la imagen les pertenecen y autorizar la u lizacioacuten de la imagen por parte de Geneacute ca Meacutedica News

Las normas especiacuteficas para los ar culos de opinioacuten son las siguientes

bull Formato Word

bull Liacutemite de 7000 caracteres (incluyendo referencia y

fuentes)

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Autores y afiliaciones

bull Cuerpo del ar culo incluyendo referencia y fuente

bull Referencias bibliograacuteficas si fuera necesario (ver el

formato en la seccioacuten correspondiente)

bull Fuente en caso necesario

bull Palabras clave

Trabajos de inves gacioacuten

La aceptacioacuten o no de los ar culos de inves gacioacuten seraacute evaluada inicialmente por el equipo editorial y en caso de cumplir los requisitos de publicacioacuten se iniciaraacute el proceso de revisioacuten con el enviacuteo de los originales a dos revisores cualificados de forma ciega En caso necesario se establece-raacute contacto con los autores para comunicar los comentarios de los revisores y para correcciones o revisiones Los evaluadores podraacuten aprobar el ar culo solicitar modifica-ciones que requieran de nueva revisioacuten o rechazar el ar culo En el caso de que uno de los revisores apruebe el ar culo y otro lo rechace se solicitaraacute la revisioacuten de un tercero

Normas de edicioacuten para los casos cliacutenicos (ar culos de correlacioacuten geno pofeno po o de caracterizacioacuten geneacute ca de pacientes)

bull Formato Word

bull Liacutemite de 20000 caracteres incluyendo bibliogra a

resumen tablas pies de figuras y anexos

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Informacioacuten de los autores (incluyendo nombre

afiliacioacuten y contacto)

bull Palabras clave

bull Resumen (hasta 300 palabras)

bull Cuerpo del ar culo estructurado de manera loacutegica

incluyendo referencias y fuentes

bull Las citas bibliograacuteficas se incluiraacuten dentro del texto

siguiendo el sistema Harvard Ejemplo (Garciacutea 2014)

bull Agradecimientos (opcional)

bull Patrocinios o becas cuando sea necesario

bull Referencias bibliograacuteficas tras el texto principal del

ar culo bajo el epiacutegrafe ldquoReferenciasrdquo en el formato requerido (ver apartado de referencias bibliograacuteficas)

bull Graacuteficas o imaacutegenes y el texto adjunto al final del docu-

mento

Normas de edicioacuten para las revisiones (ar culos en los que se revisa el estado actual de temas relacionados con la geneacute ca meacutedica)

Formato Word

bull Liacutemite de 40000 caracteres incluyendo bibliogra a

resumen tablas pies de figuras y anexos

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Informacioacuten de los autores (incluyendo nombre

afiliacioacuten y contacto)

bull Palabras clave

bull Resumen (hasta 400 palabras)

bull Cuerpo del ar culo estructurado de manera loacutegica

incluyendo referencias y fuentes

bull Las citas bibliograacuteficas se incluiraacuten dentro del texto

siguiendo el sistema Harvard Ejemplo (Garciacutea 2014)

bull Agradecimientos (opcional)

bull Patrocinios o becas cuando sea necesario

bull Referencias bibliograacuteficas tras el texto principal del

ar culo bajo el epiacutegrafe ldquoReferenciasrdquo en el formato requerido (ver apartado de referencias bibliograacuteficas)

bull Graacuteficas o imaacutegenes y el texto adjunto al final del docu-

mento

En el caso de incluir imaacutegenes eacutestas se presentaraacuten aparte de forma numerada y con su correspondiente tulo y leyenda Los formatos aceptados seraacuten jpg o ff Asiacute mismo el enviacuteo de imaacutegenes o ilustraciones conlleva el compromiso por parte de los autores de poseer los derechos de repro-duccioacuten de las mismas o en caso alterna vo de que el material enviado es libre de derechos

Para garan zar la revisioacuten ciega el tulo la informacioacuten de los autores y palabras clave iraacuten en la primera paacutegina que seraacute eliminada en el proceso de revisioacuten Ademaacutes el resto del ar culo no incluiraacute ninguna informacioacuten mediante la cual se pudiera iden ficar a los autores

Responsabilidades de los autores

Al enviar un trabajo a esta revista los autores aceptan

bull Que el ar culo es un trabajo original y no ha sido previa-

mente publicado ni enviado a otra publicacioacuten simultaacutenea-mente

bull Que todos los autores han contribuido intelectualmente

en el trabajo enviado

bull Que todos los autores han leiacutedo y aprobado la versioacuten

final

bull Los teacuterminos de la poliacute ca editorial de Geneacute ca Meacutedica

en lo que se refiere a derechos de autor y editor

Se en ende que en el caso de las resentildeas de inves gacioacuten al tratarse de resuacutemenes de ar culos ya publicados en otras revistas la informacioacuten no sea original

Ademaacutes los autores haraacuten una declaracioacuten de ausencia de conflictos de intereses

Normas bibliograacuteficas

Referencias bibliograacuteficas en el texto

Dentro del texto principal las referencias bibliograacuteficas se presentaraacuten de modo abreviado siguiendo el sistema Harvard o autor-antildeo entre pareacutentesis Ejemplo (Garciacutea 1978)

Referencias

La informacioacuten completa (autor tulo antildeo editorial o publicacioacuten nuacutemero) de las referencias bibliograacuteficas se mostraraacute despueacutes del texto principal bajo el epiacutegrafe de ldquoReferenciasrdquo En este apartado deben encontrarse todas las referencias bibliograacuteficas incluidas en el texto del mismo modo que todas las referencias de la lista deben de mencio-narse en el texto Las referencias estaraacuten ordenadas alfabeacute-camente por autores

El formato a seguir de las referencias seraacute el siguiente

‐ Ar culos

En los ar culos con maacutes de dos autores se mostraraacute uacutenica-mente al primero de ellos seguido de et al

Crick FH et al Is DNA really a double helix J Mol Biol 1979 Apr 15129(3)449-57 doi1010160022-2836(79)90506-0

‐ Libros y capiacutetulos de libro

Jorde LB et al Medical Gene cs Fourth Edi on 2010 Mosby Philadelphia ISBN 978-0-323-05373-0

‐ Paacuteginas de internet (indicar entre corchetes la fecha de la uacutel ma visita)

Revista Geneacute ca Meacutedica News URL h previstagene camedicacom [01-01-2015]

‐ Publicaciones electroacutenicas o recursos dentro de una paacutegina web (indicar entre corchetes si fuera necesario la fecha de la uacutel ma consulta

Lista de las enfermedades raras por orden alfabeacute co Informes Perioacutedicos de Orphanet Serie Enfermedades Raras Julio 2014 URL h pwwworphanetorphacomcahiersdocsESLista_de_enfermedades_raras_por_orden_alfabe copdf

Responsabilidades eacute cas

Consen miento informado Los ar culos en los que se lleva acabo inves gacioacuten en seres humanos deben regirse por los principios acordados en la Declaracioacuten de Helsinki y mani-festar en el apartado de meacutetodos que tanto el procedimien-to como el consen miento informado fueron aprobados por el correspondiente Comiteacute de Eacute ca de la ins tucioacuten Si en alguacuten caso especialmente en el de los ar culos de Caso Cliacutenico es posible iden ficar a alguacuten paciente o se desea publicar una fotogra a de eacuteste deberaacute presentarse el consen miento informado o en caso de ser menor el consen miento de sus padres o tutores

Ensayos cliacutenicos Para publicar manuscritos que incluyan ensayos cliacutenicos deberaacute enviarse junto con el documento una copia de la aprobacioacuten de las autoridades sanitarias de los paiacuteses en los que se ha desarrollado la inves gacioacuten experimental

Experimentos con animales En caso de presentar datos de experimentacioacuten con animales deberaacute facilitarse la declara-cioacuten del cumplimiento con la norma va europea y espantildeola (Real decreto 532013 de 1 de febrero por el que se esta-blecen las normas baacutesicas aplicables para la proteccioacuten de los animales u lizados en experimentacioacuten y otros fines cien ficos incluyendo la docencia)

Geneacutetica Meacutedica News

4 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

NORMAS DE PUBLICACIOacuteN E INSTRUCCIONES PARA LOS AUTORES

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 5

revistageneticamedicacom

Nuevo siacutendrome causado por mutaciones en el gen AFF4

La regulacioacuten de la transcripcioacuten proceso por el que

las instrucciones en el ADN son copiadas al RNA es

crucial para el correcto funcionamiento de las ceacutelulas

Especialmente durante el desarrollo embrionario

cualquier alteracioacuten en este mecanismo puede tener

consecuencias importantes en el individuo

Investigadores del Childrenrsquos Hospital of Philadelphia

han identificado un nuevo siacutendrome causado por mu‐

taciones de novo en el gen AFF4 implicado en la re‐

gulacioacuten de la transcripcioacuten durante el desarrollo

resultado que arroja luz sobre los mecanismos de

accioacuten que intervienen en este proceso a lo largo del

desarrollo y sus efectos sobre el programa de expre‐

sioacuten del genoma humano

Mediante secuenciacioacuten del exoma completo los in‐

vestigadores dirigidos por Ian D

Krantz encontraron mutaciones que provocaban un

cambio de aminoaacutecido en el gen AFF4 en tres nintildeos

con un siacutendrome nuevo que comparte varios de los

rasgos tiacutepicos del siacutendrome de Cornelia de Lange

Este nuevo cuadro cliacutenico recibioacute el nombre de

CHOPS acroacutenimo en ingleacutes derivado de los siacutento‐

mas que se presentan desorden cognitivo con rasgos

faciales caracteriacutesticos defectos cardiacuteacos obesidad

problemas pulmonares baja estatura y displasia es‐

queleacutetica

AFF4 codifica para uno de los componentes del com‐

plejo de super elongacioacuten (SEC en sus siglas en in‐

gleacutes) grupo de proteiacutenas encargadas de controlar la

fase de elongacioacuten de la transcripcioacuten en la que la

ARN polimerasa II cataliza la produccioacuten de la cadena

de ARN En los nintildeos con mutaciones en el gen AFF4

las mutaciones provocan resistencia a la degradacioacuten

de la proteiacutena AFF4 por lo que esta se acumula mo‐

dificando la distribucioacuten de la ARN polimerasa II en el

genoma y con ella el patroacuten de expresioacuten que mues‐

tran las ceacutelulas de los pacientes ambos mecanismos

confirmados por los investigadores a traveacutes de expe‐

rimentos de inhibicioacuten de la expresioacuten del gen

Dada la similitud fenotiacutepica entre el nuevo siacutendrome

y el siacutendrome de Cornelia de Lange los investigado‐

res compararon la expresioacuten geacutenica de fibroblastos

obtenidos de ambos tipos de pacientes encontrando

patrones similares en ambas condiciones lo que apo‐

ya la hipoacutetesis de que en ambas condiciones inter‐

vengan procesos patoloacutegicos comunes A traveacutes de

Transcripcioacuten produccioacuten de ARN mensajero Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

6 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

diferentes experimentos el equipo de Krantz deter‐

minoacute que la distribucioacuten alterada de AFF4 afecta a la

unioacuten de la cohesina a la ARN polimerasa II en el siacuten‐

drome CHOPS de forma inversa a lo que sucede en

el siacutendrome de Cornelia de Lange en el que la distri‐

bucioacuten alterada de la cohesina afecta a la unioacuten de

AFF4 Asiacute los investigadores confirmaron mecanis‐

mos comunes en ambas enfermedades

El siacutendrome CHOPS constituye el primer desorden

del desarrollo humano causado por mutaciones en la

liacutenea germinal en el gen AFF4 Las conclusiones del

trabajo ponen de manifiesto la importancia de la re‐

gulacioacuten de la funcioacuten de la ARN polimerasa II para el

correcto funcionamiento del programa de expresioacuten

geacutenica durante la embriogeacutenesis humana y ofrecen

una nueva perspectiva para los pacientes que presen‐

ten los siacutentomas del nuevo siacutendrome ldquoLos resultados

de la investigacioacuten ofrecen beneficios praacutecticos y

emocionales para las familiasrdquo indica Krantz que ya

participoacute en la identificacioacuten del primer gen asociado

al siacutendrome de Cornelia de Lange ldquoLos meacutedicos po‐

driacutean solicitar pruebas maacutes apropiadas para monito‐

rizar y manejar cuestiones meacutedicas especiacuteficas deri‐

vadas del siacutendrome CHOPS Esto significa tambieacuten

que las familias y los nintildeos pueden finalizar su lsquoodisea

diagnoacutesticarsquo‐ la procesioacuten frustrante de pruebas y

tratamientos sin eacutexito que se produce de forma fre‐

cuente al tratar de encontrar respuesta para las fami‐

lias que tienen un nintildeo afectado por un desorden

complejo no diagnosticadordquo

Referencia Izumi K et al Germline gain‐of‐function

mutations in AFF4 cause a developmental syndrome

functionally linking the super elongation complex and

cohesin Nat Genet 2015 Mar 2 doi 101038

ng3229

Fuente httpwwwnewswisecom

Pese a que normalmente se considera que todos los

miembros de la especie humana contienen la misma

cantidad de material hereditario en sus ceacutelulas lo

cierto es que en muacuteltiples regiones geacutenicas los geno‐

mas humanos presentan variabilidad en el nuacutemero

de copias de algunos segmentos del ADN Un caso

especial de CNV como se denomina a este tipo de

polimorfismo geneacutetico (de copy number variation en

ingleacutes) son las CNV multialeacutelicas que se presentan

en un nuacutemero de estados o alelos mayor de dos Las

CNV multialeacutelicas son difiacuteciles de analizar debido a

algunas limitaciones teacutecnicas la incapacidad de dis‐

criminar entre el nuacutemero de estados consecutivos

(por ejemplo nueve o diez) mediante teacutecnicas comu‐

nes como los microarrays o la PCR cuantitativa ruti‐

naria y el amplio rango de nuacutemeros de copias con los

que se pueden en el genoma desde dos hasta doce o

maacutes copias

Un equipo formado por investigadores de la Universi‐

dad de Harvard y del centro de Biologiacutea Digital de la

empresa biotecnoloacutegica Bio‐Rad ha sobrepasado

estas limitaciones mediante la combinacioacuten de la

secuenciacioacuten masiva del genoma completo y la PCR

digital permitiendo estimar la contribucioacuten de las

CNV multialeacutelicas a la variabilidad humana

Con el objetivo de identificar el nuacutemero de copias

alelos y haplotipos (combinaciones de alelos en un

mismo cromosoma) de las CNV multialeacutelicas de ma‐

yor tamantildeo los investigadores analizaron casi 850

genomas obtenidos por secuenciacioacuten masiva en el

proyecto de los 1000 genomas Entre las maacutes de

3800 CNVs encontradas por meacutetodos computacio‐

nales cerca de 1400 presentaban maacutes de tres alelos

posibles A continuacioacuten la aproximacioacuten compu‐

tacional fue validada mediante ddPCRTM PCR digital

que incluye la emulsioacuten y fraccionamiento de la

muestra en miles de gotitas en las que se lleva a ca‐

bo la reaccioacuten de amplificacioacuten de forma indepen‐

diente

Los resultados del trabajo indican que las CNV multi‐

aleacutelicas afectan ampliamente a los genes y a su ex‐

presioacuten siendo la principal fuente de variacioacuten de la

dosis geacutenica en humanos (hasta un 88 de la variabi‐

lidad) Dicha variacioacuten ademaacutes influye fuertemente

en los niveles de expresioacuten

ldquoDespueacutes de un largo periodo de no ser capaces de

llevar a cabo anaacutelisis geneacuteticos precisos de las CNVs

multialeacutelicas en geneacutetica humana estas herramien‐

tas ndash tanto la secuenciacioacuten del genoma completo

como los aacutegiles ensayos de ddPCRTM‐ podraacuten permi‐

tir anaacutelisis cuidadosos de CNV multialeacutelicas en cohor‐

tes humanasrdquo indica Steven McCarroll profesor de

la Universidad de Harvard y director del trabajo ldquoDe

modo tranquilizador estas aproximaciones parecen

proporcionar resultados que concuerdan entre siacuterdquo

Las conclusiones del trabajo abren diferentes frentes

de trabajo desde evaluar el efecto de las combina‐

ciones de alelos en cada locus a analizar el impacto

de su variacioacuten en los fenotipos humanos Dado su

efecto sobre la dosis geacutenica o los niveles de expre‐

sioacuten y la asociacioacuten de genes localizados en las CNVs

con diversas enfermedades humanas es de esperar

que el estudio de las CNVs multialeacutelicas arroje nueva

luz sobre su influencia en diferentes patologiacuteas Del

mismo modo las CNVs podriacutean influir en la respuesta

a faacutermacos contribucioacuten que algunos investigadores

ya indican que estaacute siendo infraestimada

Referencia Handsaker RE et al Large multiallelic copy number variations in humans Nat Genet 2015

Mar47(3)296‐303 doi 101038ng3200

Fuente httpwwweurekalertorg

pub_releases2015‐03cg‐sn030215php

Contribucioacuten de las CNV multialeacutelicas a la variabilidad geneacutetica humana

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 7

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Informacioacuten parcial en muchos sitios de Internet que ofrecen servicios geneacuteticos para la medicina personalizada en caacutencer

Durante los uacuteltimos antildeos el raacutepido crecimiento en la

capacidad de llevar a cabo diagnoacutestico geneacutetico ha

propiciado la aparicioacuten de diferentes sitios de Inter‐

net en los que se ofrecen servicios geneacuteticos La exis‐

tencia de este tipo de carteras de servicios y su facili‐

dad de acceso representan un gran potencial para

extender la utilizacioacuten del diagnoacutestico geneacutetico den‐

tro de la comunidad meacutedica asiacute como mejorar la ca‐

pacidad predictiva o la posibilidad de tomar decisio‐

nes sobre tratamiento de los pacientes Sin embargo

la comercializacioacuten por Internet de pruebas geneacuteticas

en el contexto de la medicina personalizada no estaacute

regulada lo que ha aumentado la preocupacioacuten de

los investigadores y profesionales meacutedicos ya que

muchas de ellas pueden no tener utilidad cliacutenica

Un reciente estudio del Instituto del Caacutencer Dana‐

Farber publicado en el Journal of the National Cancer

Institute ha evaluado los sitios de Internet que ofre‐

cen pruebas geneacuteticas para la medicina personaliza‐

da en caacutencer y concluido que a menudo se exagera

en ellos los beneficios al tiempo que se minimizan o

ignoran las limitaciones

En el estudio los investigadores analizaron la infor‐

macioacuten de 55 sitios de Internet (identificados por

buacutesquedas de palabras en ingleacutes) que comercializan

productos geneacuteticos para la medicina personalizada

del caacutencer patrocinados bien por empresas comer‐

ciales instituciones acadeacutemicas centros de investi‐

gacioacuten o meacutedicos individuales El criterio para consi‐

Museo de Ciencias de Londres Imagen John Goode (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 9

revistageneticamedicacom

derar uno de estos productos fue el de ldquoproductos o

servicios que pueden ser utilizados para llevar a cabo

un manejo individualizado del paciente basaacutendose

en datos genoacutemicos o derivados de tumoresrdquo

ldquoQueriacuteamos ver si los consumidores reciben una ima‐

gen equilibrada de los beneficios y limitaciones de

estos serviciosrdquo indica Stacy Gray primera autora

del trabajo ldquoEncontramos mucha variabilidad Parte

de la informacioacuten es buena pero toda ella necesita

ser analizada criacuteticamente por los consumidores y

profesionales sanitariosrdquo

Los investigadores encontraron que un 85 de los

sitios evaluados incluiacutean informacioacuten sobre los bene‐

ficios de sus productos pero apenas el 27 incluiacutea

informacioacuten de sus limitaciones Ademaacutes la mayor

parte de los servicios geneacuteticos ofertados dirigidos

hacia la identificacioacuten de variantes somaacuteticas esto

es no heredadas de los padres y desarrolladas a lo

largo de la vida del individuo incluiacutean pruebas no

estaacutendar o no validadas (definidas por los autores

como pruebas basadas en sugerencias inferidas o sin

evidencias de que la salud mejoraraacute al utilizar datos

de alteraciones genoacutemicas) En este sentido en la

actualidad la estandarizacioacuten de pruebas molecula‐

res y geneacuteticas en el contexto del caacutencer constituye

un problema a resolver ya que el tratamiento perso‐

nalizado contra el caacutencer evoluciona maacutes raacutepido de lo

que las organizaciones profesionales pueden asimilar

para elaborar protocolos de estandarizacioacuten

A raiacutez de los resultados obtenidos del anaacutelisis de los

sitios de Internet los autores indican que hasta que

los anaacutelisis genoacutemicos esteacuten maacutes regulados en medi‐

cina en general y en medicina personalizada en par‐

ticular los profesionales meacutedicos seraacuten los responsa‐

bles de guiar a los pacientes a lo largo del proceso y

ayudarles a entender conceptos como el de validez

cliacutenica utilidad cliacutenica o la generalizacioacuten de resulta‐

dos de investigacioacuten Esto advierten no seraacute posible

si dichos profesionales no estaacuten versados en genoacutemi‐

ca Sin la educacioacuten y formacioacuten adecuada de estos

profesionales tanto la integracioacuten de las pruebas

geneacuteticas y genoacutemicas en la praacutectica cliacutenica como su

oacuteptima utilizacioacuten se veraacuten limitadas significativa‐

mente

Asiacute a pesar de su gran potencial la venta de produc‐

tos geneacuteticos relacionados con la medicina personali‐

zada por Internet podriacutea resultar perjudicial si aporta

productos de beneficio no probado o si los resultados

que se puedan obtener son indiferentes para la situa‐

cioacuten del paciente En estos momentos dada la am‐

plia variedad de servicios disponibles en algunos paiacute‐

ses la informacioacuten y capacidad criacutetica de los profe‐

sionales de la salud es crucial para identificar aquellos

basados en evidencias robustas contrastadas y vali‐

dadas

Referencias

Gray SW et al Marketing of personalized cancer care

on the web an analysis of internet websites J Natl

Cancer Inst 2015 Mar 5107(5) pii djv030 doi

101093jncidjv030

Garber K Oncologists push beyond new lung cancer

genomic testing guidelines J Natl Cancer Inst 2015

Feb 12107(2) pii djv023 doi 101093jncidjv023

Fuente httpwwwdana‐farberorgNewsroom

Geneacutetica Meacutedica News

10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Poleacutemica y preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos

Las nuevas teacutecnicas de edicioacuten del genoma han

abierto la posibilidad de modificar de forma precisa

el ADN humano La tecnologiacutea seguacuten un gran nuacuteme‐

ro de especialistas ya estaacute puesta a punto Las con‐

secuencias de su aplicacioacuten sin embargo todaviacutea se

desconocen

Un antildeo despueacutes de que se obtuvieran con eacutexito los

primeros primates adultos con mutaciones especiacutefi‐

cas introducidas mediante teacutecnicas de edicioacuten del

genoma los intensos rumores de que ya se ha modi‐

ficado el genoma en embriones humanos han levan‐

tado la voz de alarma en la comunidad cientiacutefica Di‐

chos rumores parecen tener fundamento ya que el

equipo de Nature News ha comunicado que varios

investigadores que no desean hacer puacuteblicos sus

nombres han informado de la existencia de diversos

trabajos en los que se ha modificado el genoma en

embriones humanos que estaacuten siendo considerados

para su publicacioacuten Ante esta posibilidad la respues‐

ta no se ha hecho esperar y cinco expertos en teacutecni‐

cas de edicioacuten del genoma han publicado un comen‐

tario en el que solicitan una moratoria por parte de la

comunidad cientiacutefica al completo para retrasar la

utilizacioacuten de esta tecnologiacutea en humanos y en el que

urgen a iniciar el diaacutelogo sobre si deberiacutean de llevarse

a cabo investigaciones futuras que conlleven la modi‐

ficacioacuten geneacutetica de ceacutelulas germinales en la especie

humana y en queacute circunstancias deberiacutean permitirse

Editando directamente el genoma de un embrioacuten en

el estadiacuteo de una ceacutelula se puede llegar a obtener un

individuo con todas sus ceacutelulas modificadas No obs‐

tante la tasa con la que esto se consigue es baja y

existe la posibilidad de que se genere un mosaico

esto es que el organismo obtenido no tenga la mis‐

Imagen National Human Genome Research Institute wwwgenomeorg

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 11

revistageneticamedicacom

ma composicioacuten geneacutetica en todas sus ceacutelulas Debi‐

do a esta razoacuten la aproximacioacuten requiere la genera‐

cioacuten de un gran nuacutemero de embriones para obtener

uno completamente modificado Otro planteamien‐

to es la obtencioacuten de ceacutelulas germinales (oacutevulos y

espermatozoides) modificadas con los que poste‐

riormente llevar a cabo la fecundacioacuten Mediante

este meacutetodo se pueden generar multitud de ceacutelulas o

embriones modificados entre los que se podriacutean se‐

leccionar aquellos que incluyen el cambio Una vez

desarrollados en adultos los individuos modificados

podriacutean transmitir parte de su genoma editado a su

descendencia

Las aplicaciones meacutedicas de una modificacioacuten preci‐

sa y dirigida del genoma humano en embriones son

inmediatas ya que su utilizacioacuten evitariacutea la transmi‐

sioacuten de enfermedades causadas por mutaciones pa‐

togeacutenicas a la descendencia Sin embargo no se sa‐

be si esta modificacioacuten del genoma podriacutea generar

problemas despueacutes del nacimiento o a largo plazo ni

las consecuencias que podriacutea haber a nivel de la es‐

pecie humana en su conjunto en las sucesivas gene‐

raciones Sin olvidar que aunque la intencioacuten inicial

fuera exclusivamente terapeacuteutica la tecnologiacutea pue‐

de potencialmente introducir cambios relacionados

con otras caracteriacutesticas leacutease color de ojos de pe‐

lohellipy la facilidad con la que se puede utilizar podriacutea

derivar en el temido disentildeo de ldquonintildeos a la cartardquo En

cualquier caso en su comentario titulado ldquoNo editad

la liacutenea germinal humanardquo los investigadores sentildea‐

lan que sean o no filosoacutefica o eacuteticamente justifica‐

bles estas aplicaciones son irrelevantes hasta que

sea posible demostrar que su utilizacioacuten es segura y

se obtengan datos reproducibles a traveacutes de muacutelti‐

ples generaciones

Ademaacutes de la preocupacioacuten por las implicaciones

eacuteticas y de seguridad que conlleva la utilizacioacuten de

teacutecnicas de edicioacuten del genoma en la liacutenea germinal

humana los cientiacuteficos temen que el impacto negati‐

vo generado por la poleacutemica pueda afectar a la utili‐

zacioacuten de las teacutecnicas de edicioacuten en ceacutelulas de la liacutenea

somaacutetica (ceacutelulas que no se transmiten a la descen‐

dencia) la cual estaacute generando resultados muy pro‐

metedores para el tratamiento de diversas enferme‐

dades humanas

En cuanto a las consideraciones legales aunque mu‐

chos paiacuteses no tienen una legislacioacuten que permita o

prohiacuteba la ingenieriacutea geneacutetica en humanos por con‐

siderar esta aacuterea como algo experimental en los paiacute‐

ses donde siacute existen leyes relativas a la modificacioacuten

geneacutetica esta praacutectica estaacute prohibida en humanos al

igual que en muchos casos lo estaacute la modificacioacuten de

la liacutenea germinal No obstante conviene tener en

cuenta que la mayor parte de las normativas fueron

instauradas antes de que la avanzada teacutecnica de

CRISPR estuviera disponible por lo que podriacutean ser

modificadas para aceptar la intervencioacuten terapeacuteutica

En cualquier caso la poleacutemica estaacute servida Algunos

investigadores como David Sinclair de la Universi‐

dad de Harvard indican que la pregunta no es si la

obtencioacuten de embriones humanos modificados ten‐

draacute lugar o no sino maacutes bien cuaacutendo seraacute llevada a

cabo

Referencias

Lanphier E et al Donrsquot edit the human germ line Na‐

ture 2015 March 12 Doi 101038519410a

Regalado A Engineering the Perfect Baby MIT Tech

Rev 2015 httpwwwtechnologyreviewcom

featuredstory535661engineering‐the‐perfect‐baby

Cyranoski D Scientists sound alarm over DNA editing

of human embryos Nature News 2015 Doi 101038

nature201517110

Geneacutetica Meacutedica News

12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en laboratorios cliacutenicos

El Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas (ACMG

en sus siglas en ingleacutes) y la Asociacioacuten de Patologiacutea

Molecular de EEUU acaban de publicar una serie de

estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten

de variantes geneacuteticas en los laboratorios cliacutenicos

El objetivo del trabajo seguacuten sus autores es crear un

recurso educativo para los profesionales de la geneacuteti‐

ca que trabajan en laboratorios cliacutenicos y con ello

aumentar la calidad de los servicios proporcionados

que cada vez incluyen maacutes pruebas genoacutemicas ge‐

notipacioacuten anaacutelisis de genes individuales paneles

geacutenicos exomas genomas transcriptomashellip

La primera parte del trabajo estaacute centrada en consi‐

deraciones de tipo general como la necesidad de

definir los conceptos utilizados en los laboratorios de

geneacutetica cliacutenica de forma homogeacutenea y utilizar una

nomenclatura uniforme que no pueda llevar a equi‐

vocaciones Ante la posible confusioacuten entre los teacutermi‐

nos mutacioacuten (cambio permanente en la secuencia

de nucleoacutetidos) y polimorfismo (variante con una fre‐

cuencia superior al 1) o la asuncioacuten erroacutenea de ca‐

racteriacutesticas negativas para mutacioacuten y positivas para

polimorfismo los autores recomiendan utilizar siem‐

pre el teacutermino variante acompantildeado de modificado‐

res que especifiquen su grado de patogenicidad

(patogeacutenico probablemente patogeacutenico significado

incierto probablemente benigna benigna) Respec‐

to a la nomenclatura los autores recomiendan la que

mantiene la Sociedad de Variacioacuten del Genoma Hu‐

mano (httpwwwhgvsorg) y en cualquier caso

aconsejan que los laboratorios indiquen queacute nomen‐

clatura y versioacuten utilizan en sus informes

En el trabajo se incluyen tambieacuten dos importantes

recursos para los laboratorios cliacutenicos En primer lu‐

gar un listado de bases de datos poblacionales (con

informacioacuten de las frecuencias de las variantes en

diferentes poblaciones) y de enfermedades

(variantes encontradas en pacientes y evaluacioacuten de

patogenicidad) Aunque la utilidad de estas bases de

datos es indudable los autores recuerdan que los

laboratorios cliacutenicos deberaacuten tener en cuenta la fre‐

cuencia con que se actualiza la informacioacuten en los

repositorios los meacutetodos de validacioacuten nomenclatu‐

rahellip En segundo lugar los autores incluyen tambieacuten

Diagnoacutestico y consejo geneacutetico Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 13

revistageneticamedicacom

un listado de diferentes programas de prediccioacuten

computacional in silico de mutaciones que afectan a

la pauta de lectura de los genes o a los sitios de pro‐

cesado del ARN mensajero asiacute como del grado de

conservacioacuten de las posiciones nucleotiacutedicas

El segundo bloque del artiacuteculo se centra en los crite‐

rios para interpretar las variantes geneacuteticas identifi‐

cadas y evaluar su grado de patogenicidad en rela‐

cioacuten con enfermedades mendelianas diferenciando

en dos bloques variantes patogeacutenicas o probable‐

mente patogeacutenicas y variantes benignas o probable‐

mente patogeacutenicas

A continuacioacuten los autores hablan sobre la forma de

presentar los resultados sobre variantes geneacuteticas

en definitiva el producto final de los laboratorios cliacute‐

nicos Asiacute los informes deberiacutean incluir los resultados

presentados de forma estructurada la interpretacioacuten

de los mismos junto con las evidencias en las que

estaacute basada referencias metodologiacutea y descargo de

responsabilidades cuando sea necesario Ademaacutes de

las situaciones generales en el trabajo se incorporan

consideraciones especiales como las variantes de

significado incierto el anaacutelisis de individuos sanos

los hallazgos inesperados variantes mitocondriales

variantes implicadas en el metabolismo de faacutermacos

o enfermedades complejas

Por uacuteltimo los autores incluyen una seccioacuten sobre

coacutemo deberiacutean utilizar las recomendaciones los pro‐

fesionales de la salud Teniendo en cuenta que el ob‐

jetivo principal de las pruebas geneacuteticas llevadas a

cabo en un laboratorio cliacutenico es dirigir o apoyar la

toma de decisiones meacutedicas a traveacutes de la identifica‐

cioacuten de las causas de la enfermedad o de factores

que afecten a la respuesta a determinados faacutermacos

los autores reconocen la interaccioacuten y el trabajo cola‐

borativo entre los profesionales meacutedicos que tratan a

los pacientes y los del laboratorio encargado de reali‐

zar las pruebas como algo crucial Los resultados de

cada paciente deben ser evaluados por el laboratorio

y el meacutedico responsable dentro del contexto de la

historia meacutedica y familiar del paciente y la identifica‐

cioacuten de una nueva variante geneacutetica no debe ser asu‐

mida como relevante simplemente porque sea rara

nueva o de novo (no heredada) Ademaacutes en la medi‐

da de lo posible la toma de decisiones a partir de los

resultados geneacuteticos deberiacutea complementarse con

informacioacuten cliacutenica adicional

El creciente nuacutemero de pruebas geneacuteticas disponi‐

bles en la actualidad requiere el desarrollo de estaacuten‐

dares para los diferentes laboratorios cliacutenicos encar‐

gados de realizarlas maacutes allaacute de las normas de cali‐

dad asiacute como de recomendaciones para interpretar

las variantes geneacuteticas que puedan ser identificadas

en el anaacutelisis Iniciativas como la llevada a cabo por el

ACMG y la Asociacioacuten de Patologiacutea Molecular favore‐

cen la estandarizacioacuten de conceptos y facilitan la to‐

ma de decisiones basadas en resultados geneacuteticos al

tiempo que contribuyen a mejorar la calidad de los

servicios de los laboratorios

Referencia Richards S et al Standards and guideli‐

nes for the interpretation of sequence variants a joint

consensus recommendation of the American College of

Medical Genetics and Genomics and the Association

for Molecular Pathology Genet Med 2015 Mar 5 doi

101038gim201530

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 4: Genética Médica News Número 20

La revista Geneacute ca Meacutedica acepta ar culos enviados para su publicacioacuten en las secciones de

Actualidad y opinioacuten

bull Ar culos de opinioacutenComentariosCartas al director

bull Resentildeas de inves gaciones de los autores

Trabajos de inves gacioacuten

bull Casos cliacutenicos

bull Revisiones

Las normas de publicacioacuten en Geneacute ca Meacutedica siguen las recomendaciones del Interna onal Commi eee of Medical Journal Editors (ICMJE) depositadas en h pwwwicmjeorgrecommenda onsbrowse

Enviacuteo de trabajos

Los manuscritos des nados a su publicacioacuten se remi raacuten por correo electroacutenico a redaccioacutenmedigenecom

Aceptacioacuten revisioacuten y publicacioacuten de los trabajos

Seccioacuten de actualidad y opinioacuten

Los ar culos de la seccioacuten de actualidad y opinioacuten no se someten a revisioacuten externa aunque siacute se evaluaraacute por el personal de redaccioacuten y direccioacuten su adecuacioacuten al es lo y contenido de la revista asiacute como el rigor e intereacutes para el lector Los ar culos seraacuten revisados por la redaccioacuten y su aceptacioacuten comunicada a los autores En caso de duda la aceptacioacuten seraacute evaluada por el comiteacute editorial

Las normas especiacuteficas para las resentildeas de inves gacioacuten son las siguientes

Para enviar resentildeas de inves gacioacuten relacionadas con la Geneacute ca Meacutedica y Medicina Genoacutemica a Geneacute ca Meacutedica News los autores deberaacuten enviar un correo electroacutenico con el ar culo en formato Word a la siguiente direccioacuten redac-cionmedigenees

Se aceptaraacuten resentildeas de ar culos ya publicados o en edicioacuten avanzada online cuyos autores esteacuten incluidos en la publica-cioacuten mencionada en la referencia bibliograacutefica o que formen parte de oficinas de prensa o comunicacioacuten de los centros de inves gacioacuten que par cipan en la publicacioacuten

El enviacuteo de ar culos implica la aceptacioacuten de su publicacioacuten bajo la misma licencia que la Newsle er esto es Licencia Crea ve Commons Reconocimiento 40 Internacional

Normas de edicioacuten

bull Formato Word

bull Liacutemite de 7000 caracteres (incluyendo referencia y

fuentes)

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Autores y afiliaciones

bull Cuerpo del ar culo incluyendo referencia y fuente

bull Referencia bibliograacutefica Formato Pubmed (ver apartado

de referencias bibliograacuteficas)

bull Fuente (en caso de aparecer la nota informa va en el si o

web del centro de inves gacioacuten)

bull Palabras clave

bull Resumen (hasta 30 palabras)

En el caso de desear incluir una imagen el formato acepta-do seraacute jpg y los autores deberaacuten indicar que los derechos de la imagen les pertenecen y autorizar la u lizacioacuten de la imagen por parte de Geneacute ca Meacutedica News

Las normas especiacuteficas para los ar culos de opinioacuten son las siguientes

bull Formato Word

bull Liacutemite de 7000 caracteres (incluyendo referencia y

fuentes)

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Autores y afiliaciones

bull Cuerpo del ar culo incluyendo referencia y fuente

bull Referencias bibliograacuteficas si fuera necesario (ver el

formato en la seccioacuten correspondiente)

bull Fuente en caso necesario

bull Palabras clave

Trabajos de inves gacioacuten

La aceptacioacuten o no de los ar culos de inves gacioacuten seraacute evaluada inicialmente por el equipo editorial y en caso de cumplir los requisitos de publicacioacuten se iniciaraacute el proceso de revisioacuten con el enviacuteo de los originales a dos revisores cualificados de forma ciega En caso necesario se establece-raacute contacto con los autores para comunicar los comentarios de los revisores y para correcciones o revisiones Los evaluadores podraacuten aprobar el ar culo solicitar modifica-ciones que requieran de nueva revisioacuten o rechazar el ar culo En el caso de que uno de los revisores apruebe el ar culo y otro lo rechace se solicitaraacute la revisioacuten de un tercero

Normas de edicioacuten para los casos cliacutenicos (ar culos de correlacioacuten geno pofeno po o de caracterizacioacuten geneacute ca de pacientes)

bull Formato Word

bull Liacutemite de 20000 caracteres incluyendo bibliogra a

resumen tablas pies de figuras y anexos

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Informacioacuten de los autores (incluyendo nombre

afiliacioacuten y contacto)

bull Palabras clave

bull Resumen (hasta 300 palabras)

bull Cuerpo del ar culo estructurado de manera loacutegica

incluyendo referencias y fuentes

bull Las citas bibliograacuteficas se incluiraacuten dentro del texto

siguiendo el sistema Harvard Ejemplo (Garciacutea 2014)

bull Agradecimientos (opcional)

bull Patrocinios o becas cuando sea necesario

bull Referencias bibliograacuteficas tras el texto principal del

ar culo bajo el epiacutegrafe ldquoReferenciasrdquo en el formato requerido (ver apartado de referencias bibliograacuteficas)

bull Graacuteficas o imaacutegenes y el texto adjunto al final del docu-

mento

Normas de edicioacuten para las revisiones (ar culos en los que se revisa el estado actual de temas relacionados con la geneacute ca meacutedica)

Formato Word

bull Liacutemite de 40000 caracteres incluyendo bibliogra a

resumen tablas pies de figuras y anexos

bull Estructura

bull Tiacutetulo

bull Informacioacuten de los autores (incluyendo nombre

afiliacioacuten y contacto)

bull Palabras clave

bull Resumen (hasta 400 palabras)

bull Cuerpo del ar culo estructurado de manera loacutegica

incluyendo referencias y fuentes

bull Las citas bibliograacuteficas se incluiraacuten dentro del texto

siguiendo el sistema Harvard Ejemplo (Garciacutea 2014)

bull Agradecimientos (opcional)

bull Patrocinios o becas cuando sea necesario

bull Referencias bibliograacuteficas tras el texto principal del

ar culo bajo el epiacutegrafe ldquoReferenciasrdquo en el formato requerido (ver apartado de referencias bibliograacuteficas)

bull Graacuteficas o imaacutegenes y el texto adjunto al final del docu-

mento

En el caso de incluir imaacutegenes eacutestas se presentaraacuten aparte de forma numerada y con su correspondiente tulo y leyenda Los formatos aceptados seraacuten jpg o ff Asiacute mismo el enviacuteo de imaacutegenes o ilustraciones conlleva el compromiso por parte de los autores de poseer los derechos de repro-duccioacuten de las mismas o en caso alterna vo de que el material enviado es libre de derechos

Para garan zar la revisioacuten ciega el tulo la informacioacuten de los autores y palabras clave iraacuten en la primera paacutegina que seraacute eliminada en el proceso de revisioacuten Ademaacutes el resto del ar culo no incluiraacute ninguna informacioacuten mediante la cual se pudiera iden ficar a los autores

Responsabilidades de los autores

Al enviar un trabajo a esta revista los autores aceptan

bull Que el ar culo es un trabajo original y no ha sido previa-

mente publicado ni enviado a otra publicacioacuten simultaacutenea-mente

bull Que todos los autores han contribuido intelectualmente

en el trabajo enviado

bull Que todos los autores han leiacutedo y aprobado la versioacuten

final

bull Los teacuterminos de la poliacute ca editorial de Geneacute ca Meacutedica

en lo que se refiere a derechos de autor y editor

Se en ende que en el caso de las resentildeas de inves gacioacuten al tratarse de resuacutemenes de ar culos ya publicados en otras revistas la informacioacuten no sea original

Ademaacutes los autores haraacuten una declaracioacuten de ausencia de conflictos de intereses

Normas bibliograacuteficas

Referencias bibliograacuteficas en el texto

Dentro del texto principal las referencias bibliograacuteficas se presentaraacuten de modo abreviado siguiendo el sistema Harvard o autor-antildeo entre pareacutentesis Ejemplo (Garciacutea 1978)

Referencias

La informacioacuten completa (autor tulo antildeo editorial o publicacioacuten nuacutemero) de las referencias bibliograacuteficas se mostraraacute despueacutes del texto principal bajo el epiacutegrafe de ldquoReferenciasrdquo En este apartado deben encontrarse todas las referencias bibliograacuteficas incluidas en el texto del mismo modo que todas las referencias de la lista deben de mencio-narse en el texto Las referencias estaraacuten ordenadas alfabeacute-camente por autores

El formato a seguir de las referencias seraacute el siguiente

‐ Ar culos

En los ar culos con maacutes de dos autores se mostraraacute uacutenica-mente al primero de ellos seguido de et al

Crick FH et al Is DNA really a double helix J Mol Biol 1979 Apr 15129(3)449-57 doi1010160022-2836(79)90506-0

‐ Libros y capiacutetulos de libro

Jorde LB et al Medical Gene cs Fourth Edi on 2010 Mosby Philadelphia ISBN 978-0-323-05373-0

‐ Paacuteginas de internet (indicar entre corchetes la fecha de la uacutel ma visita)

Revista Geneacute ca Meacutedica News URL h previstagene camedicacom [01-01-2015]

‐ Publicaciones electroacutenicas o recursos dentro de una paacutegina web (indicar entre corchetes si fuera necesario la fecha de la uacutel ma consulta

Lista de las enfermedades raras por orden alfabeacute co Informes Perioacutedicos de Orphanet Serie Enfermedades Raras Julio 2014 URL h pwwworphanetorphacomcahiersdocsESLista_de_enfermedades_raras_por_orden_alfabe copdf

Responsabilidades eacute cas

Consen miento informado Los ar culos en los que se lleva acabo inves gacioacuten en seres humanos deben regirse por los principios acordados en la Declaracioacuten de Helsinki y mani-festar en el apartado de meacutetodos que tanto el procedimien-to como el consen miento informado fueron aprobados por el correspondiente Comiteacute de Eacute ca de la ins tucioacuten Si en alguacuten caso especialmente en el de los ar culos de Caso Cliacutenico es posible iden ficar a alguacuten paciente o se desea publicar una fotogra a de eacuteste deberaacute presentarse el consen miento informado o en caso de ser menor el consen miento de sus padres o tutores

Ensayos cliacutenicos Para publicar manuscritos que incluyan ensayos cliacutenicos deberaacute enviarse junto con el documento una copia de la aprobacioacuten de las autoridades sanitarias de los paiacuteses en los que se ha desarrollado la inves gacioacuten experimental

Experimentos con animales En caso de presentar datos de experimentacioacuten con animales deberaacute facilitarse la declara-cioacuten del cumplimiento con la norma va europea y espantildeola (Real decreto 532013 de 1 de febrero por el que se esta-blecen las normas baacutesicas aplicables para la proteccioacuten de los animales u lizados en experimentacioacuten y otros fines cien ficos incluyendo la docencia)

Geneacutetica Meacutedica News

4 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

NORMAS DE PUBLICACIOacuteN E INSTRUCCIONES PARA LOS AUTORES

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 5

revistageneticamedicacom

Nuevo siacutendrome causado por mutaciones en el gen AFF4

La regulacioacuten de la transcripcioacuten proceso por el que

las instrucciones en el ADN son copiadas al RNA es

crucial para el correcto funcionamiento de las ceacutelulas

Especialmente durante el desarrollo embrionario

cualquier alteracioacuten en este mecanismo puede tener

consecuencias importantes en el individuo

Investigadores del Childrenrsquos Hospital of Philadelphia

han identificado un nuevo siacutendrome causado por mu‐

taciones de novo en el gen AFF4 implicado en la re‐

gulacioacuten de la transcripcioacuten durante el desarrollo

resultado que arroja luz sobre los mecanismos de

accioacuten que intervienen en este proceso a lo largo del

desarrollo y sus efectos sobre el programa de expre‐

sioacuten del genoma humano

Mediante secuenciacioacuten del exoma completo los in‐

vestigadores dirigidos por Ian D

Krantz encontraron mutaciones que provocaban un

cambio de aminoaacutecido en el gen AFF4 en tres nintildeos

con un siacutendrome nuevo que comparte varios de los

rasgos tiacutepicos del siacutendrome de Cornelia de Lange

Este nuevo cuadro cliacutenico recibioacute el nombre de

CHOPS acroacutenimo en ingleacutes derivado de los siacutento‐

mas que se presentan desorden cognitivo con rasgos

faciales caracteriacutesticos defectos cardiacuteacos obesidad

problemas pulmonares baja estatura y displasia es‐

queleacutetica

AFF4 codifica para uno de los componentes del com‐

plejo de super elongacioacuten (SEC en sus siglas en in‐

gleacutes) grupo de proteiacutenas encargadas de controlar la

fase de elongacioacuten de la transcripcioacuten en la que la

ARN polimerasa II cataliza la produccioacuten de la cadena

de ARN En los nintildeos con mutaciones en el gen AFF4

las mutaciones provocan resistencia a la degradacioacuten

de la proteiacutena AFF4 por lo que esta se acumula mo‐

dificando la distribucioacuten de la ARN polimerasa II en el

genoma y con ella el patroacuten de expresioacuten que mues‐

tran las ceacutelulas de los pacientes ambos mecanismos

confirmados por los investigadores a traveacutes de expe‐

rimentos de inhibicioacuten de la expresioacuten del gen

Dada la similitud fenotiacutepica entre el nuevo siacutendrome

y el siacutendrome de Cornelia de Lange los investigado‐

res compararon la expresioacuten geacutenica de fibroblastos

obtenidos de ambos tipos de pacientes encontrando

patrones similares en ambas condiciones lo que apo‐

ya la hipoacutetesis de que en ambas condiciones inter‐

vengan procesos patoloacutegicos comunes A traveacutes de

Transcripcioacuten produccioacuten de ARN mensajero Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

6 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

diferentes experimentos el equipo de Krantz deter‐

minoacute que la distribucioacuten alterada de AFF4 afecta a la

unioacuten de la cohesina a la ARN polimerasa II en el siacuten‐

drome CHOPS de forma inversa a lo que sucede en

el siacutendrome de Cornelia de Lange en el que la distri‐

bucioacuten alterada de la cohesina afecta a la unioacuten de

AFF4 Asiacute los investigadores confirmaron mecanis‐

mos comunes en ambas enfermedades

El siacutendrome CHOPS constituye el primer desorden

del desarrollo humano causado por mutaciones en la

liacutenea germinal en el gen AFF4 Las conclusiones del

trabajo ponen de manifiesto la importancia de la re‐

gulacioacuten de la funcioacuten de la ARN polimerasa II para el

correcto funcionamiento del programa de expresioacuten

geacutenica durante la embriogeacutenesis humana y ofrecen

una nueva perspectiva para los pacientes que presen‐

ten los siacutentomas del nuevo siacutendrome ldquoLos resultados

de la investigacioacuten ofrecen beneficios praacutecticos y

emocionales para las familiasrdquo indica Krantz que ya

participoacute en la identificacioacuten del primer gen asociado

al siacutendrome de Cornelia de Lange ldquoLos meacutedicos po‐

driacutean solicitar pruebas maacutes apropiadas para monito‐

rizar y manejar cuestiones meacutedicas especiacuteficas deri‐

vadas del siacutendrome CHOPS Esto significa tambieacuten

que las familias y los nintildeos pueden finalizar su lsquoodisea

diagnoacutesticarsquo‐ la procesioacuten frustrante de pruebas y

tratamientos sin eacutexito que se produce de forma fre‐

cuente al tratar de encontrar respuesta para las fami‐

lias que tienen un nintildeo afectado por un desorden

complejo no diagnosticadordquo

Referencia Izumi K et al Germline gain‐of‐function

mutations in AFF4 cause a developmental syndrome

functionally linking the super elongation complex and

cohesin Nat Genet 2015 Mar 2 doi 101038

ng3229

Fuente httpwwwnewswisecom

Pese a que normalmente se considera que todos los

miembros de la especie humana contienen la misma

cantidad de material hereditario en sus ceacutelulas lo

cierto es que en muacuteltiples regiones geacutenicas los geno‐

mas humanos presentan variabilidad en el nuacutemero

de copias de algunos segmentos del ADN Un caso

especial de CNV como se denomina a este tipo de

polimorfismo geneacutetico (de copy number variation en

ingleacutes) son las CNV multialeacutelicas que se presentan

en un nuacutemero de estados o alelos mayor de dos Las

CNV multialeacutelicas son difiacuteciles de analizar debido a

algunas limitaciones teacutecnicas la incapacidad de dis‐

criminar entre el nuacutemero de estados consecutivos

(por ejemplo nueve o diez) mediante teacutecnicas comu‐

nes como los microarrays o la PCR cuantitativa ruti‐

naria y el amplio rango de nuacutemeros de copias con los

que se pueden en el genoma desde dos hasta doce o

maacutes copias

Un equipo formado por investigadores de la Universi‐

dad de Harvard y del centro de Biologiacutea Digital de la

empresa biotecnoloacutegica Bio‐Rad ha sobrepasado

estas limitaciones mediante la combinacioacuten de la

secuenciacioacuten masiva del genoma completo y la PCR

digital permitiendo estimar la contribucioacuten de las

CNV multialeacutelicas a la variabilidad humana

Con el objetivo de identificar el nuacutemero de copias

alelos y haplotipos (combinaciones de alelos en un

mismo cromosoma) de las CNV multialeacutelicas de ma‐

yor tamantildeo los investigadores analizaron casi 850

genomas obtenidos por secuenciacioacuten masiva en el

proyecto de los 1000 genomas Entre las maacutes de

3800 CNVs encontradas por meacutetodos computacio‐

nales cerca de 1400 presentaban maacutes de tres alelos

posibles A continuacioacuten la aproximacioacuten compu‐

tacional fue validada mediante ddPCRTM PCR digital

que incluye la emulsioacuten y fraccionamiento de la

muestra en miles de gotitas en las que se lleva a ca‐

bo la reaccioacuten de amplificacioacuten de forma indepen‐

diente

Los resultados del trabajo indican que las CNV multi‐

aleacutelicas afectan ampliamente a los genes y a su ex‐

presioacuten siendo la principal fuente de variacioacuten de la

dosis geacutenica en humanos (hasta un 88 de la variabi‐

lidad) Dicha variacioacuten ademaacutes influye fuertemente

en los niveles de expresioacuten

ldquoDespueacutes de un largo periodo de no ser capaces de

llevar a cabo anaacutelisis geneacuteticos precisos de las CNVs

multialeacutelicas en geneacutetica humana estas herramien‐

tas ndash tanto la secuenciacioacuten del genoma completo

como los aacutegiles ensayos de ddPCRTM‐ podraacuten permi‐

tir anaacutelisis cuidadosos de CNV multialeacutelicas en cohor‐

tes humanasrdquo indica Steven McCarroll profesor de

la Universidad de Harvard y director del trabajo ldquoDe

modo tranquilizador estas aproximaciones parecen

proporcionar resultados que concuerdan entre siacuterdquo

Las conclusiones del trabajo abren diferentes frentes

de trabajo desde evaluar el efecto de las combina‐

ciones de alelos en cada locus a analizar el impacto

de su variacioacuten en los fenotipos humanos Dado su

efecto sobre la dosis geacutenica o los niveles de expre‐

sioacuten y la asociacioacuten de genes localizados en las CNVs

con diversas enfermedades humanas es de esperar

que el estudio de las CNVs multialeacutelicas arroje nueva

luz sobre su influencia en diferentes patologiacuteas Del

mismo modo las CNVs podriacutean influir en la respuesta

a faacutermacos contribucioacuten que algunos investigadores

ya indican que estaacute siendo infraestimada

Referencia Handsaker RE et al Large multiallelic copy number variations in humans Nat Genet 2015

Mar47(3)296‐303 doi 101038ng3200

Fuente httpwwweurekalertorg

pub_releases2015‐03cg‐sn030215php

Contribucioacuten de las CNV multialeacutelicas a la variabilidad geneacutetica humana

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 7

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Informacioacuten parcial en muchos sitios de Internet que ofrecen servicios geneacuteticos para la medicina personalizada en caacutencer

Durante los uacuteltimos antildeos el raacutepido crecimiento en la

capacidad de llevar a cabo diagnoacutestico geneacutetico ha

propiciado la aparicioacuten de diferentes sitios de Inter‐

net en los que se ofrecen servicios geneacuteticos La exis‐

tencia de este tipo de carteras de servicios y su facili‐

dad de acceso representan un gran potencial para

extender la utilizacioacuten del diagnoacutestico geneacutetico den‐

tro de la comunidad meacutedica asiacute como mejorar la ca‐

pacidad predictiva o la posibilidad de tomar decisio‐

nes sobre tratamiento de los pacientes Sin embargo

la comercializacioacuten por Internet de pruebas geneacuteticas

en el contexto de la medicina personalizada no estaacute

regulada lo que ha aumentado la preocupacioacuten de

los investigadores y profesionales meacutedicos ya que

muchas de ellas pueden no tener utilidad cliacutenica

Un reciente estudio del Instituto del Caacutencer Dana‐

Farber publicado en el Journal of the National Cancer

Institute ha evaluado los sitios de Internet que ofre‐

cen pruebas geneacuteticas para la medicina personaliza‐

da en caacutencer y concluido que a menudo se exagera

en ellos los beneficios al tiempo que se minimizan o

ignoran las limitaciones

En el estudio los investigadores analizaron la infor‐

macioacuten de 55 sitios de Internet (identificados por

buacutesquedas de palabras en ingleacutes) que comercializan

productos geneacuteticos para la medicina personalizada

del caacutencer patrocinados bien por empresas comer‐

ciales instituciones acadeacutemicas centros de investi‐

gacioacuten o meacutedicos individuales El criterio para consi‐

Museo de Ciencias de Londres Imagen John Goode (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 9

revistageneticamedicacom

derar uno de estos productos fue el de ldquoproductos o

servicios que pueden ser utilizados para llevar a cabo

un manejo individualizado del paciente basaacutendose

en datos genoacutemicos o derivados de tumoresrdquo

ldquoQueriacuteamos ver si los consumidores reciben una ima‐

gen equilibrada de los beneficios y limitaciones de

estos serviciosrdquo indica Stacy Gray primera autora

del trabajo ldquoEncontramos mucha variabilidad Parte

de la informacioacuten es buena pero toda ella necesita

ser analizada criacuteticamente por los consumidores y

profesionales sanitariosrdquo

Los investigadores encontraron que un 85 de los

sitios evaluados incluiacutean informacioacuten sobre los bene‐

ficios de sus productos pero apenas el 27 incluiacutea

informacioacuten de sus limitaciones Ademaacutes la mayor

parte de los servicios geneacuteticos ofertados dirigidos

hacia la identificacioacuten de variantes somaacuteticas esto

es no heredadas de los padres y desarrolladas a lo

largo de la vida del individuo incluiacutean pruebas no

estaacutendar o no validadas (definidas por los autores

como pruebas basadas en sugerencias inferidas o sin

evidencias de que la salud mejoraraacute al utilizar datos

de alteraciones genoacutemicas) En este sentido en la

actualidad la estandarizacioacuten de pruebas molecula‐

res y geneacuteticas en el contexto del caacutencer constituye

un problema a resolver ya que el tratamiento perso‐

nalizado contra el caacutencer evoluciona maacutes raacutepido de lo

que las organizaciones profesionales pueden asimilar

para elaborar protocolos de estandarizacioacuten

A raiacutez de los resultados obtenidos del anaacutelisis de los

sitios de Internet los autores indican que hasta que

los anaacutelisis genoacutemicos esteacuten maacutes regulados en medi‐

cina en general y en medicina personalizada en par‐

ticular los profesionales meacutedicos seraacuten los responsa‐

bles de guiar a los pacientes a lo largo del proceso y

ayudarles a entender conceptos como el de validez

cliacutenica utilidad cliacutenica o la generalizacioacuten de resulta‐

dos de investigacioacuten Esto advierten no seraacute posible

si dichos profesionales no estaacuten versados en genoacutemi‐

ca Sin la educacioacuten y formacioacuten adecuada de estos

profesionales tanto la integracioacuten de las pruebas

geneacuteticas y genoacutemicas en la praacutectica cliacutenica como su

oacuteptima utilizacioacuten se veraacuten limitadas significativa‐

mente

Asiacute a pesar de su gran potencial la venta de produc‐

tos geneacuteticos relacionados con la medicina personali‐

zada por Internet podriacutea resultar perjudicial si aporta

productos de beneficio no probado o si los resultados

que se puedan obtener son indiferentes para la situa‐

cioacuten del paciente En estos momentos dada la am‐

plia variedad de servicios disponibles en algunos paiacute‐

ses la informacioacuten y capacidad criacutetica de los profe‐

sionales de la salud es crucial para identificar aquellos

basados en evidencias robustas contrastadas y vali‐

dadas

Referencias

Gray SW et al Marketing of personalized cancer care

on the web an analysis of internet websites J Natl

Cancer Inst 2015 Mar 5107(5) pii djv030 doi

101093jncidjv030

Garber K Oncologists push beyond new lung cancer

genomic testing guidelines J Natl Cancer Inst 2015

Feb 12107(2) pii djv023 doi 101093jncidjv023

Fuente httpwwwdana‐farberorgNewsroom

Geneacutetica Meacutedica News

10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Poleacutemica y preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos

Las nuevas teacutecnicas de edicioacuten del genoma han

abierto la posibilidad de modificar de forma precisa

el ADN humano La tecnologiacutea seguacuten un gran nuacuteme‐

ro de especialistas ya estaacute puesta a punto Las con‐

secuencias de su aplicacioacuten sin embargo todaviacutea se

desconocen

Un antildeo despueacutes de que se obtuvieran con eacutexito los

primeros primates adultos con mutaciones especiacutefi‐

cas introducidas mediante teacutecnicas de edicioacuten del

genoma los intensos rumores de que ya se ha modi‐

ficado el genoma en embriones humanos han levan‐

tado la voz de alarma en la comunidad cientiacutefica Di‐

chos rumores parecen tener fundamento ya que el

equipo de Nature News ha comunicado que varios

investigadores que no desean hacer puacuteblicos sus

nombres han informado de la existencia de diversos

trabajos en los que se ha modificado el genoma en

embriones humanos que estaacuten siendo considerados

para su publicacioacuten Ante esta posibilidad la respues‐

ta no se ha hecho esperar y cinco expertos en teacutecni‐

cas de edicioacuten del genoma han publicado un comen‐

tario en el que solicitan una moratoria por parte de la

comunidad cientiacutefica al completo para retrasar la

utilizacioacuten de esta tecnologiacutea en humanos y en el que

urgen a iniciar el diaacutelogo sobre si deberiacutean de llevarse

a cabo investigaciones futuras que conlleven la modi‐

ficacioacuten geneacutetica de ceacutelulas germinales en la especie

humana y en queacute circunstancias deberiacutean permitirse

Editando directamente el genoma de un embrioacuten en

el estadiacuteo de una ceacutelula se puede llegar a obtener un

individuo con todas sus ceacutelulas modificadas No obs‐

tante la tasa con la que esto se consigue es baja y

existe la posibilidad de que se genere un mosaico

esto es que el organismo obtenido no tenga la mis‐

Imagen National Human Genome Research Institute wwwgenomeorg

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 11

revistageneticamedicacom

ma composicioacuten geneacutetica en todas sus ceacutelulas Debi‐

do a esta razoacuten la aproximacioacuten requiere la genera‐

cioacuten de un gran nuacutemero de embriones para obtener

uno completamente modificado Otro planteamien‐

to es la obtencioacuten de ceacutelulas germinales (oacutevulos y

espermatozoides) modificadas con los que poste‐

riormente llevar a cabo la fecundacioacuten Mediante

este meacutetodo se pueden generar multitud de ceacutelulas o

embriones modificados entre los que se podriacutean se‐

leccionar aquellos que incluyen el cambio Una vez

desarrollados en adultos los individuos modificados

podriacutean transmitir parte de su genoma editado a su

descendencia

Las aplicaciones meacutedicas de una modificacioacuten preci‐

sa y dirigida del genoma humano en embriones son

inmediatas ya que su utilizacioacuten evitariacutea la transmi‐

sioacuten de enfermedades causadas por mutaciones pa‐

togeacutenicas a la descendencia Sin embargo no se sa‐

be si esta modificacioacuten del genoma podriacutea generar

problemas despueacutes del nacimiento o a largo plazo ni

las consecuencias que podriacutea haber a nivel de la es‐

pecie humana en su conjunto en las sucesivas gene‐

raciones Sin olvidar que aunque la intencioacuten inicial

fuera exclusivamente terapeacuteutica la tecnologiacutea pue‐

de potencialmente introducir cambios relacionados

con otras caracteriacutesticas leacutease color de ojos de pe‐

lohellipy la facilidad con la que se puede utilizar podriacutea

derivar en el temido disentildeo de ldquonintildeos a la cartardquo En

cualquier caso en su comentario titulado ldquoNo editad

la liacutenea germinal humanardquo los investigadores sentildea‐

lan que sean o no filosoacutefica o eacuteticamente justifica‐

bles estas aplicaciones son irrelevantes hasta que

sea posible demostrar que su utilizacioacuten es segura y

se obtengan datos reproducibles a traveacutes de muacutelti‐

ples generaciones

Ademaacutes de la preocupacioacuten por las implicaciones

eacuteticas y de seguridad que conlleva la utilizacioacuten de

teacutecnicas de edicioacuten del genoma en la liacutenea germinal

humana los cientiacuteficos temen que el impacto negati‐

vo generado por la poleacutemica pueda afectar a la utili‐

zacioacuten de las teacutecnicas de edicioacuten en ceacutelulas de la liacutenea

somaacutetica (ceacutelulas que no se transmiten a la descen‐

dencia) la cual estaacute generando resultados muy pro‐

metedores para el tratamiento de diversas enferme‐

dades humanas

En cuanto a las consideraciones legales aunque mu‐

chos paiacuteses no tienen una legislacioacuten que permita o

prohiacuteba la ingenieriacutea geneacutetica en humanos por con‐

siderar esta aacuterea como algo experimental en los paiacute‐

ses donde siacute existen leyes relativas a la modificacioacuten

geneacutetica esta praacutectica estaacute prohibida en humanos al

igual que en muchos casos lo estaacute la modificacioacuten de

la liacutenea germinal No obstante conviene tener en

cuenta que la mayor parte de las normativas fueron

instauradas antes de que la avanzada teacutecnica de

CRISPR estuviera disponible por lo que podriacutean ser

modificadas para aceptar la intervencioacuten terapeacuteutica

En cualquier caso la poleacutemica estaacute servida Algunos

investigadores como David Sinclair de la Universi‐

dad de Harvard indican que la pregunta no es si la

obtencioacuten de embriones humanos modificados ten‐

draacute lugar o no sino maacutes bien cuaacutendo seraacute llevada a

cabo

Referencias

Lanphier E et al Donrsquot edit the human germ line Na‐

ture 2015 March 12 Doi 101038519410a

Regalado A Engineering the Perfect Baby MIT Tech

Rev 2015 httpwwwtechnologyreviewcom

featuredstory535661engineering‐the‐perfect‐baby

Cyranoski D Scientists sound alarm over DNA editing

of human embryos Nature News 2015 Doi 101038

nature201517110

Geneacutetica Meacutedica News

12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en laboratorios cliacutenicos

El Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas (ACMG

en sus siglas en ingleacutes) y la Asociacioacuten de Patologiacutea

Molecular de EEUU acaban de publicar una serie de

estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten

de variantes geneacuteticas en los laboratorios cliacutenicos

El objetivo del trabajo seguacuten sus autores es crear un

recurso educativo para los profesionales de la geneacuteti‐

ca que trabajan en laboratorios cliacutenicos y con ello

aumentar la calidad de los servicios proporcionados

que cada vez incluyen maacutes pruebas genoacutemicas ge‐

notipacioacuten anaacutelisis de genes individuales paneles

geacutenicos exomas genomas transcriptomashellip

La primera parte del trabajo estaacute centrada en consi‐

deraciones de tipo general como la necesidad de

definir los conceptos utilizados en los laboratorios de

geneacutetica cliacutenica de forma homogeacutenea y utilizar una

nomenclatura uniforme que no pueda llevar a equi‐

vocaciones Ante la posible confusioacuten entre los teacutermi‐

nos mutacioacuten (cambio permanente en la secuencia

de nucleoacutetidos) y polimorfismo (variante con una fre‐

cuencia superior al 1) o la asuncioacuten erroacutenea de ca‐

racteriacutesticas negativas para mutacioacuten y positivas para

polimorfismo los autores recomiendan utilizar siem‐

pre el teacutermino variante acompantildeado de modificado‐

res que especifiquen su grado de patogenicidad

(patogeacutenico probablemente patogeacutenico significado

incierto probablemente benigna benigna) Respec‐

to a la nomenclatura los autores recomiendan la que

mantiene la Sociedad de Variacioacuten del Genoma Hu‐

mano (httpwwwhgvsorg) y en cualquier caso

aconsejan que los laboratorios indiquen queacute nomen‐

clatura y versioacuten utilizan en sus informes

En el trabajo se incluyen tambieacuten dos importantes

recursos para los laboratorios cliacutenicos En primer lu‐

gar un listado de bases de datos poblacionales (con

informacioacuten de las frecuencias de las variantes en

diferentes poblaciones) y de enfermedades

(variantes encontradas en pacientes y evaluacioacuten de

patogenicidad) Aunque la utilidad de estas bases de

datos es indudable los autores recuerdan que los

laboratorios cliacutenicos deberaacuten tener en cuenta la fre‐

cuencia con que se actualiza la informacioacuten en los

repositorios los meacutetodos de validacioacuten nomenclatu‐

rahellip En segundo lugar los autores incluyen tambieacuten

Diagnoacutestico y consejo geneacutetico Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 13

revistageneticamedicacom

un listado de diferentes programas de prediccioacuten

computacional in silico de mutaciones que afectan a

la pauta de lectura de los genes o a los sitios de pro‐

cesado del ARN mensajero asiacute como del grado de

conservacioacuten de las posiciones nucleotiacutedicas

El segundo bloque del artiacuteculo se centra en los crite‐

rios para interpretar las variantes geneacuteticas identifi‐

cadas y evaluar su grado de patogenicidad en rela‐

cioacuten con enfermedades mendelianas diferenciando

en dos bloques variantes patogeacutenicas o probable‐

mente patogeacutenicas y variantes benignas o probable‐

mente patogeacutenicas

A continuacioacuten los autores hablan sobre la forma de

presentar los resultados sobre variantes geneacuteticas

en definitiva el producto final de los laboratorios cliacute‐

nicos Asiacute los informes deberiacutean incluir los resultados

presentados de forma estructurada la interpretacioacuten

de los mismos junto con las evidencias en las que

estaacute basada referencias metodologiacutea y descargo de

responsabilidades cuando sea necesario Ademaacutes de

las situaciones generales en el trabajo se incorporan

consideraciones especiales como las variantes de

significado incierto el anaacutelisis de individuos sanos

los hallazgos inesperados variantes mitocondriales

variantes implicadas en el metabolismo de faacutermacos

o enfermedades complejas

Por uacuteltimo los autores incluyen una seccioacuten sobre

coacutemo deberiacutean utilizar las recomendaciones los pro‐

fesionales de la salud Teniendo en cuenta que el ob‐

jetivo principal de las pruebas geneacuteticas llevadas a

cabo en un laboratorio cliacutenico es dirigir o apoyar la

toma de decisiones meacutedicas a traveacutes de la identifica‐

cioacuten de las causas de la enfermedad o de factores

que afecten a la respuesta a determinados faacutermacos

los autores reconocen la interaccioacuten y el trabajo cola‐

borativo entre los profesionales meacutedicos que tratan a

los pacientes y los del laboratorio encargado de reali‐

zar las pruebas como algo crucial Los resultados de

cada paciente deben ser evaluados por el laboratorio

y el meacutedico responsable dentro del contexto de la

historia meacutedica y familiar del paciente y la identifica‐

cioacuten de una nueva variante geneacutetica no debe ser asu‐

mida como relevante simplemente porque sea rara

nueva o de novo (no heredada) Ademaacutes en la medi‐

da de lo posible la toma de decisiones a partir de los

resultados geneacuteticos deberiacutea complementarse con

informacioacuten cliacutenica adicional

El creciente nuacutemero de pruebas geneacuteticas disponi‐

bles en la actualidad requiere el desarrollo de estaacuten‐

dares para los diferentes laboratorios cliacutenicos encar‐

gados de realizarlas maacutes allaacute de las normas de cali‐

dad asiacute como de recomendaciones para interpretar

las variantes geneacuteticas que puedan ser identificadas

en el anaacutelisis Iniciativas como la llevada a cabo por el

ACMG y la Asociacioacuten de Patologiacutea Molecular favore‐

cen la estandarizacioacuten de conceptos y facilitan la to‐

ma de decisiones basadas en resultados geneacuteticos al

tiempo que contribuyen a mejorar la calidad de los

servicios de los laboratorios

Referencia Richards S et al Standards and guideli‐

nes for the interpretation of sequence variants a joint

consensus recommendation of the American College of

Medical Genetics and Genomics and the Association

for Molecular Pathology Genet Med 2015 Mar 5 doi

101038gim201530

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 5: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 5

revistageneticamedicacom

Nuevo siacutendrome causado por mutaciones en el gen AFF4

La regulacioacuten de la transcripcioacuten proceso por el que

las instrucciones en el ADN son copiadas al RNA es

crucial para el correcto funcionamiento de las ceacutelulas

Especialmente durante el desarrollo embrionario

cualquier alteracioacuten en este mecanismo puede tener

consecuencias importantes en el individuo

Investigadores del Childrenrsquos Hospital of Philadelphia

han identificado un nuevo siacutendrome causado por mu‐

taciones de novo en el gen AFF4 implicado en la re‐

gulacioacuten de la transcripcioacuten durante el desarrollo

resultado que arroja luz sobre los mecanismos de

accioacuten que intervienen en este proceso a lo largo del

desarrollo y sus efectos sobre el programa de expre‐

sioacuten del genoma humano

Mediante secuenciacioacuten del exoma completo los in‐

vestigadores dirigidos por Ian D

Krantz encontraron mutaciones que provocaban un

cambio de aminoaacutecido en el gen AFF4 en tres nintildeos

con un siacutendrome nuevo que comparte varios de los

rasgos tiacutepicos del siacutendrome de Cornelia de Lange

Este nuevo cuadro cliacutenico recibioacute el nombre de

CHOPS acroacutenimo en ingleacutes derivado de los siacutento‐

mas que se presentan desorden cognitivo con rasgos

faciales caracteriacutesticos defectos cardiacuteacos obesidad

problemas pulmonares baja estatura y displasia es‐

queleacutetica

AFF4 codifica para uno de los componentes del com‐

plejo de super elongacioacuten (SEC en sus siglas en in‐

gleacutes) grupo de proteiacutenas encargadas de controlar la

fase de elongacioacuten de la transcripcioacuten en la que la

ARN polimerasa II cataliza la produccioacuten de la cadena

de ARN En los nintildeos con mutaciones en el gen AFF4

las mutaciones provocan resistencia a la degradacioacuten

de la proteiacutena AFF4 por lo que esta se acumula mo‐

dificando la distribucioacuten de la ARN polimerasa II en el

genoma y con ella el patroacuten de expresioacuten que mues‐

tran las ceacutelulas de los pacientes ambos mecanismos

confirmados por los investigadores a traveacutes de expe‐

rimentos de inhibicioacuten de la expresioacuten del gen

Dada la similitud fenotiacutepica entre el nuevo siacutendrome

y el siacutendrome de Cornelia de Lange los investigado‐

res compararon la expresioacuten geacutenica de fibroblastos

obtenidos de ambos tipos de pacientes encontrando

patrones similares en ambas condiciones lo que apo‐

ya la hipoacutetesis de que en ambas condiciones inter‐

vengan procesos patoloacutegicos comunes A traveacutes de

Transcripcioacuten produccioacuten de ARN mensajero Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

6 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

diferentes experimentos el equipo de Krantz deter‐

minoacute que la distribucioacuten alterada de AFF4 afecta a la

unioacuten de la cohesina a la ARN polimerasa II en el siacuten‐

drome CHOPS de forma inversa a lo que sucede en

el siacutendrome de Cornelia de Lange en el que la distri‐

bucioacuten alterada de la cohesina afecta a la unioacuten de

AFF4 Asiacute los investigadores confirmaron mecanis‐

mos comunes en ambas enfermedades

El siacutendrome CHOPS constituye el primer desorden

del desarrollo humano causado por mutaciones en la

liacutenea germinal en el gen AFF4 Las conclusiones del

trabajo ponen de manifiesto la importancia de la re‐

gulacioacuten de la funcioacuten de la ARN polimerasa II para el

correcto funcionamiento del programa de expresioacuten

geacutenica durante la embriogeacutenesis humana y ofrecen

una nueva perspectiva para los pacientes que presen‐

ten los siacutentomas del nuevo siacutendrome ldquoLos resultados

de la investigacioacuten ofrecen beneficios praacutecticos y

emocionales para las familiasrdquo indica Krantz que ya

participoacute en la identificacioacuten del primer gen asociado

al siacutendrome de Cornelia de Lange ldquoLos meacutedicos po‐

driacutean solicitar pruebas maacutes apropiadas para monito‐

rizar y manejar cuestiones meacutedicas especiacuteficas deri‐

vadas del siacutendrome CHOPS Esto significa tambieacuten

que las familias y los nintildeos pueden finalizar su lsquoodisea

diagnoacutesticarsquo‐ la procesioacuten frustrante de pruebas y

tratamientos sin eacutexito que se produce de forma fre‐

cuente al tratar de encontrar respuesta para las fami‐

lias que tienen un nintildeo afectado por un desorden

complejo no diagnosticadordquo

Referencia Izumi K et al Germline gain‐of‐function

mutations in AFF4 cause a developmental syndrome

functionally linking the super elongation complex and

cohesin Nat Genet 2015 Mar 2 doi 101038

ng3229

Fuente httpwwwnewswisecom

Pese a que normalmente se considera que todos los

miembros de la especie humana contienen la misma

cantidad de material hereditario en sus ceacutelulas lo

cierto es que en muacuteltiples regiones geacutenicas los geno‐

mas humanos presentan variabilidad en el nuacutemero

de copias de algunos segmentos del ADN Un caso

especial de CNV como se denomina a este tipo de

polimorfismo geneacutetico (de copy number variation en

ingleacutes) son las CNV multialeacutelicas que se presentan

en un nuacutemero de estados o alelos mayor de dos Las

CNV multialeacutelicas son difiacuteciles de analizar debido a

algunas limitaciones teacutecnicas la incapacidad de dis‐

criminar entre el nuacutemero de estados consecutivos

(por ejemplo nueve o diez) mediante teacutecnicas comu‐

nes como los microarrays o la PCR cuantitativa ruti‐

naria y el amplio rango de nuacutemeros de copias con los

que se pueden en el genoma desde dos hasta doce o

maacutes copias

Un equipo formado por investigadores de la Universi‐

dad de Harvard y del centro de Biologiacutea Digital de la

empresa biotecnoloacutegica Bio‐Rad ha sobrepasado

estas limitaciones mediante la combinacioacuten de la

secuenciacioacuten masiva del genoma completo y la PCR

digital permitiendo estimar la contribucioacuten de las

CNV multialeacutelicas a la variabilidad humana

Con el objetivo de identificar el nuacutemero de copias

alelos y haplotipos (combinaciones de alelos en un

mismo cromosoma) de las CNV multialeacutelicas de ma‐

yor tamantildeo los investigadores analizaron casi 850

genomas obtenidos por secuenciacioacuten masiva en el

proyecto de los 1000 genomas Entre las maacutes de

3800 CNVs encontradas por meacutetodos computacio‐

nales cerca de 1400 presentaban maacutes de tres alelos

posibles A continuacioacuten la aproximacioacuten compu‐

tacional fue validada mediante ddPCRTM PCR digital

que incluye la emulsioacuten y fraccionamiento de la

muestra en miles de gotitas en las que se lleva a ca‐

bo la reaccioacuten de amplificacioacuten de forma indepen‐

diente

Los resultados del trabajo indican que las CNV multi‐

aleacutelicas afectan ampliamente a los genes y a su ex‐

presioacuten siendo la principal fuente de variacioacuten de la

dosis geacutenica en humanos (hasta un 88 de la variabi‐

lidad) Dicha variacioacuten ademaacutes influye fuertemente

en los niveles de expresioacuten

ldquoDespueacutes de un largo periodo de no ser capaces de

llevar a cabo anaacutelisis geneacuteticos precisos de las CNVs

multialeacutelicas en geneacutetica humana estas herramien‐

tas ndash tanto la secuenciacioacuten del genoma completo

como los aacutegiles ensayos de ddPCRTM‐ podraacuten permi‐

tir anaacutelisis cuidadosos de CNV multialeacutelicas en cohor‐

tes humanasrdquo indica Steven McCarroll profesor de

la Universidad de Harvard y director del trabajo ldquoDe

modo tranquilizador estas aproximaciones parecen

proporcionar resultados que concuerdan entre siacuterdquo

Las conclusiones del trabajo abren diferentes frentes

de trabajo desde evaluar el efecto de las combina‐

ciones de alelos en cada locus a analizar el impacto

de su variacioacuten en los fenotipos humanos Dado su

efecto sobre la dosis geacutenica o los niveles de expre‐

sioacuten y la asociacioacuten de genes localizados en las CNVs

con diversas enfermedades humanas es de esperar

que el estudio de las CNVs multialeacutelicas arroje nueva

luz sobre su influencia en diferentes patologiacuteas Del

mismo modo las CNVs podriacutean influir en la respuesta

a faacutermacos contribucioacuten que algunos investigadores

ya indican que estaacute siendo infraestimada

Referencia Handsaker RE et al Large multiallelic copy number variations in humans Nat Genet 2015

Mar47(3)296‐303 doi 101038ng3200

Fuente httpwwweurekalertorg

pub_releases2015‐03cg‐sn030215php

Contribucioacuten de las CNV multialeacutelicas a la variabilidad geneacutetica humana

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 7

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Informacioacuten parcial en muchos sitios de Internet que ofrecen servicios geneacuteticos para la medicina personalizada en caacutencer

Durante los uacuteltimos antildeos el raacutepido crecimiento en la

capacidad de llevar a cabo diagnoacutestico geneacutetico ha

propiciado la aparicioacuten de diferentes sitios de Inter‐

net en los que se ofrecen servicios geneacuteticos La exis‐

tencia de este tipo de carteras de servicios y su facili‐

dad de acceso representan un gran potencial para

extender la utilizacioacuten del diagnoacutestico geneacutetico den‐

tro de la comunidad meacutedica asiacute como mejorar la ca‐

pacidad predictiva o la posibilidad de tomar decisio‐

nes sobre tratamiento de los pacientes Sin embargo

la comercializacioacuten por Internet de pruebas geneacuteticas

en el contexto de la medicina personalizada no estaacute

regulada lo que ha aumentado la preocupacioacuten de

los investigadores y profesionales meacutedicos ya que

muchas de ellas pueden no tener utilidad cliacutenica

Un reciente estudio del Instituto del Caacutencer Dana‐

Farber publicado en el Journal of the National Cancer

Institute ha evaluado los sitios de Internet que ofre‐

cen pruebas geneacuteticas para la medicina personaliza‐

da en caacutencer y concluido que a menudo se exagera

en ellos los beneficios al tiempo que se minimizan o

ignoran las limitaciones

En el estudio los investigadores analizaron la infor‐

macioacuten de 55 sitios de Internet (identificados por

buacutesquedas de palabras en ingleacutes) que comercializan

productos geneacuteticos para la medicina personalizada

del caacutencer patrocinados bien por empresas comer‐

ciales instituciones acadeacutemicas centros de investi‐

gacioacuten o meacutedicos individuales El criterio para consi‐

Museo de Ciencias de Londres Imagen John Goode (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 9

revistageneticamedicacom

derar uno de estos productos fue el de ldquoproductos o

servicios que pueden ser utilizados para llevar a cabo

un manejo individualizado del paciente basaacutendose

en datos genoacutemicos o derivados de tumoresrdquo

ldquoQueriacuteamos ver si los consumidores reciben una ima‐

gen equilibrada de los beneficios y limitaciones de

estos serviciosrdquo indica Stacy Gray primera autora

del trabajo ldquoEncontramos mucha variabilidad Parte

de la informacioacuten es buena pero toda ella necesita

ser analizada criacuteticamente por los consumidores y

profesionales sanitariosrdquo

Los investigadores encontraron que un 85 de los

sitios evaluados incluiacutean informacioacuten sobre los bene‐

ficios de sus productos pero apenas el 27 incluiacutea

informacioacuten de sus limitaciones Ademaacutes la mayor

parte de los servicios geneacuteticos ofertados dirigidos

hacia la identificacioacuten de variantes somaacuteticas esto

es no heredadas de los padres y desarrolladas a lo

largo de la vida del individuo incluiacutean pruebas no

estaacutendar o no validadas (definidas por los autores

como pruebas basadas en sugerencias inferidas o sin

evidencias de que la salud mejoraraacute al utilizar datos

de alteraciones genoacutemicas) En este sentido en la

actualidad la estandarizacioacuten de pruebas molecula‐

res y geneacuteticas en el contexto del caacutencer constituye

un problema a resolver ya que el tratamiento perso‐

nalizado contra el caacutencer evoluciona maacutes raacutepido de lo

que las organizaciones profesionales pueden asimilar

para elaborar protocolos de estandarizacioacuten

A raiacutez de los resultados obtenidos del anaacutelisis de los

sitios de Internet los autores indican que hasta que

los anaacutelisis genoacutemicos esteacuten maacutes regulados en medi‐

cina en general y en medicina personalizada en par‐

ticular los profesionales meacutedicos seraacuten los responsa‐

bles de guiar a los pacientes a lo largo del proceso y

ayudarles a entender conceptos como el de validez

cliacutenica utilidad cliacutenica o la generalizacioacuten de resulta‐

dos de investigacioacuten Esto advierten no seraacute posible

si dichos profesionales no estaacuten versados en genoacutemi‐

ca Sin la educacioacuten y formacioacuten adecuada de estos

profesionales tanto la integracioacuten de las pruebas

geneacuteticas y genoacutemicas en la praacutectica cliacutenica como su

oacuteptima utilizacioacuten se veraacuten limitadas significativa‐

mente

Asiacute a pesar de su gran potencial la venta de produc‐

tos geneacuteticos relacionados con la medicina personali‐

zada por Internet podriacutea resultar perjudicial si aporta

productos de beneficio no probado o si los resultados

que se puedan obtener son indiferentes para la situa‐

cioacuten del paciente En estos momentos dada la am‐

plia variedad de servicios disponibles en algunos paiacute‐

ses la informacioacuten y capacidad criacutetica de los profe‐

sionales de la salud es crucial para identificar aquellos

basados en evidencias robustas contrastadas y vali‐

dadas

Referencias

Gray SW et al Marketing of personalized cancer care

on the web an analysis of internet websites J Natl

Cancer Inst 2015 Mar 5107(5) pii djv030 doi

101093jncidjv030

Garber K Oncologists push beyond new lung cancer

genomic testing guidelines J Natl Cancer Inst 2015

Feb 12107(2) pii djv023 doi 101093jncidjv023

Fuente httpwwwdana‐farberorgNewsroom

Geneacutetica Meacutedica News

10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Poleacutemica y preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos

Las nuevas teacutecnicas de edicioacuten del genoma han

abierto la posibilidad de modificar de forma precisa

el ADN humano La tecnologiacutea seguacuten un gran nuacuteme‐

ro de especialistas ya estaacute puesta a punto Las con‐

secuencias de su aplicacioacuten sin embargo todaviacutea se

desconocen

Un antildeo despueacutes de que se obtuvieran con eacutexito los

primeros primates adultos con mutaciones especiacutefi‐

cas introducidas mediante teacutecnicas de edicioacuten del

genoma los intensos rumores de que ya se ha modi‐

ficado el genoma en embriones humanos han levan‐

tado la voz de alarma en la comunidad cientiacutefica Di‐

chos rumores parecen tener fundamento ya que el

equipo de Nature News ha comunicado que varios

investigadores que no desean hacer puacuteblicos sus

nombres han informado de la existencia de diversos

trabajos en los que se ha modificado el genoma en

embriones humanos que estaacuten siendo considerados

para su publicacioacuten Ante esta posibilidad la respues‐

ta no se ha hecho esperar y cinco expertos en teacutecni‐

cas de edicioacuten del genoma han publicado un comen‐

tario en el que solicitan una moratoria por parte de la

comunidad cientiacutefica al completo para retrasar la

utilizacioacuten de esta tecnologiacutea en humanos y en el que

urgen a iniciar el diaacutelogo sobre si deberiacutean de llevarse

a cabo investigaciones futuras que conlleven la modi‐

ficacioacuten geneacutetica de ceacutelulas germinales en la especie

humana y en queacute circunstancias deberiacutean permitirse

Editando directamente el genoma de un embrioacuten en

el estadiacuteo de una ceacutelula se puede llegar a obtener un

individuo con todas sus ceacutelulas modificadas No obs‐

tante la tasa con la que esto se consigue es baja y

existe la posibilidad de que se genere un mosaico

esto es que el organismo obtenido no tenga la mis‐

Imagen National Human Genome Research Institute wwwgenomeorg

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 11

revistageneticamedicacom

ma composicioacuten geneacutetica en todas sus ceacutelulas Debi‐

do a esta razoacuten la aproximacioacuten requiere la genera‐

cioacuten de un gran nuacutemero de embriones para obtener

uno completamente modificado Otro planteamien‐

to es la obtencioacuten de ceacutelulas germinales (oacutevulos y

espermatozoides) modificadas con los que poste‐

riormente llevar a cabo la fecundacioacuten Mediante

este meacutetodo se pueden generar multitud de ceacutelulas o

embriones modificados entre los que se podriacutean se‐

leccionar aquellos que incluyen el cambio Una vez

desarrollados en adultos los individuos modificados

podriacutean transmitir parte de su genoma editado a su

descendencia

Las aplicaciones meacutedicas de una modificacioacuten preci‐

sa y dirigida del genoma humano en embriones son

inmediatas ya que su utilizacioacuten evitariacutea la transmi‐

sioacuten de enfermedades causadas por mutaciones pa‐

togeacutenicas a la descendencia Sin embargo no se sa‐

be si esta modificacioacuten del genoma podriacutea generar

problemas despueacutes del nacimiento o a largo plazo ni

las consecuencias que podriacutea haber a nivel de la es‐

pecie humana en su conjunto en las sucesivas gene‐

raciones Sin olvidar que aunque la intencioacuten inicial

fuera exclusivamente terapeacuteutica la tecnologiacutea pue‐

de potencialmente introducir cambios relacionados

con otras caracteriacutesticas leacutease color de ojos de pe‐

lohellipy la facilidad con la que se puede utilizar podriacutea

derivar en el temido disentildeo de ldquonintildeos a la cartardquo En

cualquier caso en su comentario titulado ldquoNo editad

la liacutenea germinal humanardquo los investigadores sentildea‐

lan que sean o no filosoacutefica o eacuteticamente justifica‐

bles estas aplicaciones son irrelevantes hasta que

sea posible demostrar que su utilizacioacuten es segura y

se obtengan datos reproducibles a traveacutes de muacutelti‐

ples generaciones

Ademaacutes de la preocupacioacuten por las implicaciones

eacuteticas y de seguridad que conlleva la utilizacioacuten de

teacutecnicas de edicioacuten del genoma en la liacutenea germinal

humana los cientiacuteficos temen que el impacto negati‐

vo generado por la poleacutemica pueda afectar a la utili‐

zacioacuten de las teacutecnicas de edicioacuten en ceacutelulas de la liacutenea

somaacutetica (ceacutelulas que no se transmiten a la descen‐

dencia) la cual estaacute generando resultados muy pro‐

metedores para el tratamiento de diversas enferme‐

dades humanas

En cuanto a las consideraciones legales aunque mu‐

chos paiacuteses no tienen una legislacioacuten que permita o

prohiacuteba la ingenieriacutea geneacutetica en humanos por con‐

siderar esta aacuterea como algo experimental en los paiacute‐

ses donde siacute existen leyes relativas a la modificacioacuten

geneacutetica esta praacutectica estaacute prohibida en humanos al

igual que en muchos casos lo estaacute la modificacioacuten de

la liacutenea germinal No obstante conviene tener en

cuenta que la mayor parte de las normativas fueron

instauradas antes de que la avanzada teacutecnica de

CRISPR estuviera disponible por lo que podriacutean ser

modificadas para aceptar la intervencioacuten terapeacuteutica

En cualquier caso la poleacutemica estaacute servida Algunos

investigadores como David Sinclair de la Universi‐

dad de Harvard indican que la pregunta no es si la

obtencioacuten de embriones humanos modificados ten‐

draacute lugar o no sino maacutes bien cuaacutendo seraacute llevada a

cabo

Referencias

Lanphier E et al Donrsquot edit the human germ line Na‐

ture 2015 March 12 Doi 101038519410a

Regalado A Engineering the Perfect Baby MIT Tech

Rev 2015 httpwwwtechnologyreviewcom

featuredstory535661engineering‐the‐perfect‐baby

Cyranoski D Scientists sound alarm over DNA editing

of human embryos Nature News 2015 Doi 101038

nature201517110

Geneacutetica Meacutedica News

12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en laboratorios cliacutenicos

El Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas (ACMG

en sus siglas en ingleacutes) y la Asociacioacuten de Patologiacutea

Molecular de EEUU acaban de publicar una serie de

estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten

de variantes geneacuteticas en los laboratorios cliacutenicos

El objetivo del trabajo seguacuten sus autores es crear un

recurso educativo para los profesionales de la geneacuteti‐

ca que trabajan en laboratorios cliacutenicos y con ello

aumentar la calidad de los servicios proporcionados

que cada vez incluyen maacutes pruebas genoacutemicas ge‐

notipacioacuten anaacutelisis de genes individuales paneles

geacutenicos exomas genomas transcriptomashellip

La primera parte del trabajo estaacute centrada en consi‐

deraciones de tipo general como la necesidad de

definir los conceptos utilizados en los laboratorios de

geneacutetica cliacutenica de forma homogeacutenea y utilizar una

nomenclatura uniforme que no pueda llevar a equi‐

vocaciones Ante la posible confusioacuten entre los teacutermi‐

nos mutacioacuten (cambio permanente en la secuencia

de nucleoacutetidos) y polimorfismo (variante con una fre‐

cuencia superior al 1) o la asuncioacuten erroacutenea de ca‐

racteriacutesticas negativas para mutacioacuten y positivas para

polimorfismo los autores recomiendan utilizar siem‐

pre el teacutermino variante acompantildeado de modificado‐

res que especifiquen su grado de patogenicidad

(patogeacutenico probablemente patogeacutenico significado

incierto probablemente benigna benigna) Respec‐

to a la nomenclatura los autores recomiendan la que

mantiene la Sociedad de Variacioacuten del Genoma Hu‐

mano (httpwwwhgvsorg) y en cualquier caso

aconsejan que los laboratorios indiquen queacute nomen‐

clatura y versioacuten utilizan en sus informes

En el trabajo se incluyen tambieacuten dos importantes

recursos para los laboratorios cliacutenicos En primer lu‐

gar un listado de bases de datos poblacionales (con

informacioacuten de las frecuencias de las variantes en

diferentes poblaciones) y de enfermedades

(variantes encontradas en pacientes y evaluacioacuten de

patogenicidad) Aunque la utilidad de estas bases de

datos es indudable los autores recuerdan que los

laboratorios cliacutenicos deberaacuten tener en cuenta la fre‐

cuencia con que se actualiza la informacioacuten en los

repositorios los meacutetodos de validacioacuten nomenclatu‐

rahellip En segundo lugar los autores incluyen tambieacuten

Diagnoacutestico y consejo geneacutetico Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 13

revistageneticamedicacom

un listado de diferentes programas de prediccioacuten

computacional in silico de mutaciones que afectan a

la pauta de lectura de los genes o a los sitios de pro‐

cesado del ARN mensajero asiacute como del grado de

conservacioacuten de las posiciones nucleotiacutedicas

El segundo bloque del artiacuteculo se centra en los crite‐

rios para interpretar las variantes geneacuteticas identifi‐

cadas y evaluar su grado de patogenicidad en rela‐

cioacuten con enfermedades mendelianas diferenciando

en dos bloques variantes patogeacutenicas o probable‐

mente patogeacutenicas y variantes benignas o probable‐

mente patogeacutenicas

A continuacioacuten los autores hablan sobre la forma de

presentar los resultados sobre variantes geneacuteticas

en definitiva el producto final de los laboratorios cliacute‐

nicos Asiacute los informes deberiacutean incluir los resultados

presentados de forma estructurada la interpretacioacuten

de los mismos junto con las evidencias en las que

estaacute basada referencias metodologiacutea y descargo de

responsabilidades cuando sea necesario Ademaacutes de

las situaciones generales en el trabajo se incorporan

consideraciones especiales como las variantes de

significado incierto el anaacutelisis de individuos sanos

los hallazgos inesperados variantes mitocondriales

variantes implicadas en el metabolismo de faacutermacos

o enfermedades complejas

Por uacuteltimo los autores incluyen una seccioacuten sobre

coacutemo deberiacutean utilizar las recomendaciones los pro‐

fesionales de la salud Teniendo en cuenta que el ob‐

jetivo principal de las pruebas geneacuteticas llevadas a

cabo en un laboratorio cliacutenico es dirigir o apoyar la

toma de decisiones meacutedicas a traveacutes de la identifica‐

cioacuten de las causas de la enfermedad o de factores

que afecten a la respuesta a determinados faacutermacos

los autores reconocen la interaccioacuten y el trabajo cola‐

borativo entre los profesionales meacutedicos que tratan a

los pacientes y los del laboratorio encargado de reali‐

zar las pruebas como algo crucial Los resultados de

cada paciente deben ser evaluados por el laboratorio

y el meacutedico responsable dentro del contexto de la

historia meacutedica y familiar del paciente y la identifica‐

cioacuten de una nueva variante geneacutetica no debe ser asu‐

mida como relevante simplemente porque sea rara

nueva o de novo (no heredada) Ademaacutes en la medi‐

da de lo posible la toma de decisiones a partir de los

resultados geneacuteticos deberiacutea complementarse con

informacioacuten cliacutenica adicional

El creciente nuacutemero de pruebas geneacuteticas disponi‐

bles en la actualidad requiere el desarrollo de estaacuten‐

dares para los diferentes laboratorios cliacutenicos encar‐

gados de realizarlas maacutes allaacute de las normas de cali‐

dad asiacute como de recomendaciones para interpretar

las variantes geneacuteticas que puedan ser identificadas

en el anaacutelisis Iniciativas como la llevada a cabo por el

ACMG y la Asociacioacuten de Patologiacutea Molecular favore‐

cen la estandarizacioacuten de conceptos y facilitan la to‐

ma de decisiones basadas en resultados geneacuteticos al

tiempo que contribuyen a mejorar la calidad de los

servicios de los laboratorios

Referencia Richards S et al Standards and guideli‐

nes for the interpretation of sequence variants a joint

consensus recommendation of the American College of

Medical Genetics and Genomics and the Association

for Molecular Pathology Genet Med 2015 Mar 5 doi

101038gim201530

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 6: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

6 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

diferentes experimentos el equipo de Krantz deter‐

minoacute que la distribucioacuten alterada de AFF4 afecta a la

unioacuten de la cohesina a la ARN polimerasa II en el siacuten‐

drome CHOPS de forma inversa a lo que sucede en

el siacutendrome de Cornelia de Lange en el que la distri‐

bucioacuten alterada de la cohesina afecta a la unioacuten de

AFF4 Asiacute los investigadores confirmaron mecanis‐

mos comunes en ambas enfermedades

El siacutendrome CHOPS constituye el primer desorden

del desarrollo humano causado por mutaciones en la

liacutenea germinal en el gen AFF4 Las conclusiones del

trabajo ponen de manifiesto la importancia de la re‐

gulacioacuten de la funcioacuten de la ARN polimerasa II para el

correcto funcionamiento del programa de expresioacuten

geacutenica durante la embriogeacutenesis humana y ofrecen

una nueva perspectiva para los pacientes que presen‐

ten los siacutentomas del nuevo siacutendrome ldquoLos resultados

de la investigacioacuten ofrecen beneficios praacutecticos y

emocionales para las familiasrdquo indica Krantz que ya

participoacute en la identificacioacuten del primer gen asociado

al siacutendrome de Cornelia de Lange ldquoLos meacutedicos po‐

driacutean solicitar pruebas maacutes apropiadas para monito‐

rizar y manejar cuestiones meacutedicas especiacuteficas deri‐

vadas del siacutendrome CHOPS Esto significa tambieacuten

que las familias y los nintildeos pueden finalizar su lsquoodisea

diagnoacutesticarsquo‐ la procesioacuten frustrante de pruebas y

tratamientos sin eacutexito que se produce de forma fre‐

cuente al tratar de encontrar respuesta para las fami‐

lias que tienen un nintildeo afectado por un desorden

complejo no diagnosticadordquo

Referencia Izumi K et al Germline gain‐of‐function

mutations in AFF4 cause a developmental syndrome

functionally linking the super elongation complex and

cohesin Nat Genet 2015 Mar 2 doi 101038

ng3229

Fuente httpwwwnewswisecom

Pese a que normalmente se considera que todos los

miembros de la especie humana contienen la misma

cantidad de material hereditario en sus ceacutelulas lo

cierto es que en muacuteltiples regiones geacutenicas los geno‐

mas humanos presentan variabilidad en el nuacutemero

de copias de algunos segmentos del ADN Un caso

especial de CNV como se denomina a este tipo de

polimorfismo geneacutetico (de copy number variation en

ingleacutes) son las CNV multialeacutelicas que se presentan

en un nuacutemero de estados o alelos mayor de dos Las

CNV multialeacutelicas son difiacuteciles de analizar debido a

algunas limitaciones teacutecnicas la incapacidad de dis‐

criminar entre el nuacutemero de estados consecutivos

(por ejemplo nueve o diez) mediante teacutecnicas comu‐

nes como los microarrays o la PCR cuantitativa ruti‐

naria y el amplio rango de nuacutemeros de copias con los

que se pueden en el genoma desde dos hasta doce o

maacutes copias

Un equipo formado por investigadores de la Universi‐

dad de Harvard y del centro de Biologiacutea Digital de la

empresa biotecnoloacutegica Bio‐Rad ha sobrepasado

estas limitaciones mediante la combinacioacuten de la

secuenciacioacuten masiva del genoma completo y la PCR

digital permitiendo estimar la contribucioacuten de las

CNV multialeacutelicas a la variabilidad humana

Con el objetivo de identificar el nuacutemero de copias

alelos y haplotipos (combinaciones de alelos en un

mismo cromosoma) de las CNV multialeacutelicas de ma‐

yor tamantildeo los investigadores analizaron casi 850

genomas obtenidos por secuenciacioacuten masiva en el

proyecto de los 1000 genomas Entre las maacutes de

3800 CNVs encontradas por meacutetodos computacio‐

nales cerca de 1400 presentaban maacutes de tres alelos

posibles A continuacioacuten la aproximacioacuten compu‐

tacional fue validada mediante ddPCRTM PCR digital

que incluye la emulsioacuten y fraccionamiento de la

muestra en miles de gotitas en las que se lleva a ca‐

bo la reaccioacuten de amplificacioacuten de forma indepen‐

diente

Los resultados del trabajo indican que las CNV multi‐

aleacutelicas afectan ampliamente a los genes y a su ex‐

presioacuten siendo la principal fuente de variacioacuten de la

dosis geacutenica en humanos (hasta un 88 de la variabi‐

lidad) Dicha variacioacuten ademaacutes influye fuertemente

en los niveles de expresioacuten

ldquoDespueacutes de un largo periodo de no ser capaces de

llevar a cabo anaacutelisis geneacuteticos precisos de las CNVs

multialeacutelicas en geneacutetica humana estas herramien‐

tas ndash tanto la secuenciacioacuten del genoma completo

como los aacutegiles ensayos de ddPCRTM‐ podraacuten permi‐

tir anaacutelisis cuidadosos de CNV multialeacutelicas en cohor‐

tes humanasrdquo indica Steven McCarroll profesor de

la Universidad de Harvard y director del trabajo ldquoDe

modo tranquilizador estas aproximaciones parecen

proporcionar resultados que concuerdan entre siacuterdquo

Las conclusiones del trabajo abren diferentes frentes

de trabajo desde evaluar el efecto de las combina‐

ciones de alelos en cada locus a analizar el impacto

de su variacioacuten en los fenotipos humanos Dado su

efecto sobre la dosis geacutenica o los niveles de expre‐

sioacuten y la asociacioacuten de genes localizados en las CNVs

con diversas enfermedades humanas es de esperar

que el estudio de las CNVs multialeacutelicas arroje nueva

luz sobre su influencia en diferentes patologiacuteas Del

mismo modo las CNVs podriacutean influir en la respuesta

a faacutermacos contribucioacuten que algunos investigadores

ya indican que estaacute siendo infraestimada

Referencia Handsaker RE et al Large multiallelic copy number variations in humans Nat Genet 2015

Mar47(3)296‐303 doi 101038ng3200

Fuente httpwwweurekalertorg

pub_releases2015‐03cg‐sn030215php

Contribucioacuten de las CNV multialeacutelicas a la variabilidad geneacutetica humana

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 7

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Informacioacuten parcial en muchos sitios de Internet que ofrecen servicios geneacuteticos para la medicina personalizada en caacutencer

Durante los uacuteltimos antildeos el raacutepido crecimiento en la

capacidad de llevar a cabo diagnoacutestico geneacutetico ha

propiciado la aparicioacuten de diferentes sitios de Inter‐

net en los que se ofrecen servicios geneacuteticos La exis‐

tencia de este tipo de carteras de servicios y su facili‐

dad de acceso representan un gran potencial para

extender la utilizacioacuten del diagnoacutestico geneacutetico den‐

tro de la comunidad meacutedica asiacute como mejorar la ca‐

pacidad predictiva o la posibilidad de tomar decisio‐

nes sobre tratamiento de los pacientes Sin embargo

la comercializacioacuten por Internet de pruebas geneacuteticas

en el contexto de la medicina personalizada no estaacute

regulada lo que ha aumentado la preocupacioacuten de

los investigadores y profesionales meacutedicos ya que

muchas de ellas pueden no tener utilidad cliacutenica

Un reciente estudio del Instituto del Caacutencer Dana‐

Farber publicado en el Journal of the National Cancer

Institute ha evaluado los sitios de Internet que ofre‐

cen pruebas geneacuteticas para la medicina personaliza‐

da en caacutencer y concluido que a menudo se exagera

en ellos los beneficios al tiempo que se minimizan o

ignoran las limitaciones

En el estudio los investigadores analizaron la infor‐

macioacuten de 55 sitios de Internet (identificados por

buacutesquedas de palabras en ingleacutes) que comercializan

productos geneacuteticos para la medicina personalizada

del caacutencer patrocinados bien por empresas comer‐

ciales instituciones acadeacutemicas centros de investi‐

gacioacuten o meacutedicos individuales El criterio para consi‐

Museo de Ciencias de Londres Imagen John Goode (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 9

revistageneticamedicacom

derar uno de estos productos fue el de ldquoproductos o

servicios que pueden ser utilizados para llevar a cabo

un manejo individualizado del paciente basaacutendose

en datos genoacutemicos o derivados de tumoresrdquo

ldquoQueriacuteamos ver si los consumidores reciben una ima‐

gen equilibrada de los beneficios y limitaciones de

estos serviciosrdquo indica Stacy Gray primera autora

del trabajo ldquoEncontramos mucha variabilidad Parte

de la informacioacuten es buena pero toda ella necesita

ser analizada criacuteticamente por los consumidores y

profesionales sanitariosrdquo

Los investigadores encontraron que un 85 de los

sitios evaluados incluiacutean informacioacuten sobre los bene‐

ficios de sus productos pero apenas el 27 incluiacutea

informacioacuten de sus limitaciones Ademaacutes la mayor

parte de los servicios geneacuteticos ofertados dirigidos

hacia la identificacioacuten de variantes somaacuteticas esto

es no heredadas de los padres y desarrolladas a lo

largo de la vida del individuo incluiacutean pruebas no

estaacutendar o no validadas (definidas por los autores

como pruebas basadas en sugerencias inferidas o sin

evidencias de que la salud mejoraraacute al utilizar datos

de alteraciones genoacutemicas) En este sentido en la

actualidad la estandarizacioacuten de pruebas molecula‐

res y geneacuteticas en el contexto del caacutencer constituye

un problema a resolver ya que el tratamiento perso‐

nalizado contra el caacutencer evoluciona maacutes raacutepido de lo

que las organizaciones profesionales pueden asimilar

para elaborar protocolos de estandarizacioacuten

A raiacutez de los resultados obtenidos del anaacutelisis de los

sitios de Internet los autores indican que hasta que

los anaacutelisis genoacutemicos esteacuten maacutes regulados en medi‐

cina en general y en medicina personalizada en par‐

ticular los profesionales meacutedicos seraacuten los responsa‐

bles de guiar a los pacientes a lo largo del proceso y

ayudarles a entender conceptos como el de validez

cliacutenica utilidad cliacutenica o la generalizacioacuten de resulta‐

dos de investigacioacuten Esto advierten no seraacute posible

si dichos profesionales no estaacuten versados en genoacutemi‐

ca Sin la educacioacuten y formacioacuten adecuada de estos

profesionales tanto la integracioacuten de las pruebas

geneacuteticas y genoacutemicas en la praacutectica cliacutenica como su

oacuteptima utilizacioacuten se veraacuten limitadas significativa‐

mente

Asiacute a pesar de su gran potencial la venta de produc‐

tos geneacuteticos relacionados con la medicina personali‐

zada por Internet podriacutea resultar perjudicial si aporta

productos de beneficio no probado o si los resultados

que se puedan obtener son indiferentes para la situa‐

cioacuten del paciente En estos momentos dada la am‐

plia variedad de servicios disponibles en algunos paiacute‐

ses la informacioacuten y capacidad criacutetica de los profe‐

sionales de la salud es crucial para identificar aquellos

basados en evidencias robustas contrastadas y vali‐

dadas

Referencias

Gray SW et al Marketing of personalized cancer care

on the web an analysis of internet websites J Natl

Cancer Inst 2015 Mar 5107(5) pii djv030 doi

101093jncidjv030

Garber K Oncologists push beyond new lung cancer

genomic testing guidelines J Natl Cancer Inst 2015

Feb 12107(2) pii djv023 doi 101093jncidjv023

Fuente httpwwwdana‐farberorgNewsroom

Geneacutetica Meacutedica News

10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Poleacutemica y preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos

Las nuevas teacutecnicas de edicioacuten del genoma han

abierto la posibilidad de modificar de forma precisa

el ADN humano La tecnologiacutea seguacuten un gran nuacuteme‐

ro de especialistas ya estaacute puesta a punto Las con‐

secuencias de su aplicacioacuten sin embargo todaviacutea se

desconocen

Un antildeo despueacutes de que se obtuvieran con eacutexito los

primeros primates adultos con mutaciones especiacutefi‐

cas introducidas mediante teacutecnicas de edicioacuten del

genoma los intensos rumores de que ya se ha modi‐

ficado el genoma en embriones humanos han levan‐

tado la voz de alarma en la comunidad cientiacutefica Di‐

chos rumores parecen tener fundamento ya que el

equipo de Nature News ha comunicado que varios

investigadores que no desean hacer puacuteblicos sus

nombres han informado de la existencia de diversos

trabajos en los que se ha modificado el genoma en

embriones humanos que estaacuten siendo considerados

para su publicacioacuten Ante esta posibilidad la respues‐

ta no se ha hecho esperar y cinco expertos en teacutecni‐

cas de edicioacuten del genoma han publicado un comen‐

tario en el que solicitan una moratoria por parte de la

comunidad cientiacutefica al completo para retrasar la

utilizacioacuten de esta tecnologiacutea en humanos y en el que

urgen a iniciar el diaacutelogo sobre si deberiacutean de llevarse

a cabo investigaciones futuras que conlleven la modi‐

ficacioacuten geneacutetica de ceacutelulas germinales en la especie

humana y en queacute circunstancias deberiacutean permitirse

Editando directamente el genoma de un embrioacuten en

el estadiacuteo de una ceacutelula se puede llegar a obtener un

individuo con todas sus ceacutelulas modificadas No obs‐

tante la tasa con la que esto se consigue es baja y

existe la posibilidad de que se genere un mosaico

esto es que el organismo obtenido no tenga la mis‐

Imagen National Human Genome Research Institute wwwgenomeorg

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 11

revistageneticamedicacom

ma composicioacuten geneacutetica en todas sus ceacutelulas Debi‐

do a esta razoacuten la aproximacioacuten requiere la genera‐

cioacuten de un gran nuacutemero de embriones para obtener

uno completamente modificado Otro planteamien‐

to es la obtencioacuten de ceacutelulas germinales (oacutevulos y

espermatozoides) modificadas con los que poste‐

riormente llevar a cabo la fecundacioacuten Mediante

este meacutetodo se pueden generar multitud de ceacutelulas o

embriones modificados entre los que se podriacutean se‐

leccionar aquellos que incluyen el cambio Una vez

desarrollados en adultos los individuos modificados

podriacutean transmitir parte de su genoma editado a su

descendencia

Las aplicaciones meacutedicas de una modificacioacuten preci‐

sa y dirigida del genoma humano en embriones son

inmediatas ya que su utilizacioacuten evitariacutea la transmi‐

sioacuten de enfermedades causadas por mutaciones pa‐

togeacutenicas a la descendencia Sin embargo no se sa‐

be si esta modificacioacuten del genoma podriacutea generar

problemas despueacutes del nacimiento o a largo plazo ni

las consecuencias que podriacutea haber a nivel de la es‐

pecie humana en su conjunto en las sucesivas gene‐

raciones Sin olvidar que aunque la intencioacuten inicial

fuera exclusivamente terapeacuteutica la tecnologiacutea pue‐

de potencialmente introducir cambios relacionados

con otras caracteriacutesticas leacutease color de ojos de pe‐

lohellipy la facilidad con la que se puede utilizar podriacutea

derivar en el temido disentildeo de ldquonintildeos a la cartardquo En

cualquier caso en su comentario titulado ldquoNo editad

la liacutenea germinal humanardquo los investigadores sentildea‐

lan que sean o no filosoacutefica o eacuteticamente justifica‐

bles estas aplicaciones son irrelevantes hasta que

sea posible demostrar que su utilizacioacuten es segura y

se obtengan datos reproducibles a traveacutes de muacutelti‐

ples generaciones

Ademaacutes de la preocupacioacuten por las implicaciones

eacuteticas y de seguridad que conlleva la utilizacioacuten de

teacutecnicas de edicioacuten del genoma en la liacutenea germinal

humana los cientiacuteficos temen que el impacto negati‐

vo generado por la poleacutemica pueda afectar a la utili‐

zacioacuten de las teacutecnicas de edicioacuten en ceacutelulas de la liacutenea

somaacutetica (ceacutelulas que no se transmiten a la descen‐

dencia) la cual estaacute generando resultados muy pro‐

metedores para el tratamiento de diversas enferme‐

dades humanas

En cuanto a las consideraciones legales aunque mu‐

chos paiacuteses no tienen una legislacioacuten que permita o

prohiacuteba la ingenieriacutea geneacutetica en humanos por con‐

siderar esta aacuterea como algo experimental en los paiacute‐

ses donde siacute existen leyes relativas a la modificacioacuten

geneacutetica esta praacutectica estaacute prohibida en humanos al

igual que en muchos casos lo estaacute la modificacioacuten de

la liacutenea germinal No obstante conviene tener en

cuenta que la mayor parte de las normativas fueron

instauradas antes de que la avanzada teacutecnica de

CRISPR estuviera disponible por lo que podriacutean ser

modificadas para aceptar la intervencioacuten terapeacuteutica

En cualquier caso la poleacutemica estaacute servida Algunos

investigadores como David Sinclair de la Universi‐

dad de Harvard indican que la pregunta no es si la

obtencioacuten de embriones humanos modificados ten‐

draacute lugar o no sino maacutes bien cuaacutendo seraacute llevada a

cabo

Referencias

Lanphier E et al Donrsquot edit the human germ line Na‐

ture 2015 March 12 Doi 101038519410a

Regalado A Engineering the Perfect Baby MIT Tech

Rev 2015 httpwwwtechnologyreviewcom

featuredstory535661engineering‐the‐perfect‐baby

Cyranoski D Scientists sound alarm over DNA editing

of human embryos Nature News 2015 Doi 101038

nature201517110

Geneacutetica Meacutedica News

12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en laboratorios cliacutenicos

El Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas (ACMG

en sus siglas en ingleacutes) y la Asociacioacuten de Patologiacutea

Molecular de EEUU acaban de publicar una serie de

estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten

de variantes geneacuteticas en los laboratorios cliacutenicos

El objetivo del trabajo seguacuten sus autores es crear un

recurso educativo para los profesionales de la geneacuteti‐

ca que trabajan en laboratorios cliacutenicos y con ello

aumentar la calidad de los servicios proporcionados

que cada vez incluyen maacutes pruebas genoacutemicas ge‐

notipacioacuten anaacutelisis de genes individuales paneles

geacutenicos exomas genomas transcriptomashellip

La primera parte del trabajo estaacute centrada en consi‐

deraciones de tipo general como la necesidad de

definir los conceptos utilizados en los laboratorios de

geneacutetica cliacutenica de forma homogeacutenea y utilizar una

nomenclatura uniforme que no pueda llevar a equi‐

vocaciones Ante la posible confusioacuten entre los teacutermi‐

nos mutacioacuten (cambio permanente en la secuencia

de nucleoacutetidos) y polimorfismo (variante con una fre‐

cuencia superior al 1) o la asuncioacuten erroacutenea de ca‐

racteriacutesticas negativas para mutacioacuten y positivas para

polimorfismo los autores recomiendan utilizar siem‐

pre el teacutermino variante acompantildeado de modificado‐

res que especifiquen su grado de patogenicidad

(patogeacutenico probablemente patogeacutenico significado

incierto probablemente benigna benigna) Respec‐

to a la nomenclatura los autores recomiendan la que

mantiene la Sociedad de Variacioacuten del Genoma Hu‐

mano (httpwwwhgvsorg) y en cualquier caso

aconsejan que los laboratorios indiquen queacute nomen‐

clatura y versioacuten utilizan en sus informes

En el trabajo se incluyen tambieacuten dos importantes

recursos para los laboratorios cliacutenicos En primer lu‐

gar un listado de bases de datos poblacionales (con

informacioacuten de las frecuencias de las variantes en

diferentes poblaciones) y de enfermedades

(variantes encontradas en pacientes y evaluacioacuten de

patogenicidad) Aunque la utilidad de estas bases de

datos es indudable los autores recuerdan que los

laboratorios cliacutenicos deberaacuten tener en cuenta la fre‐

cuencia con que se actualiza la informacioacuten en los

repositorios los meacutetodos de validacioacuten nomenclatu‐

rahellip En segundo lugar los autores incluyen tambieacuten

Diagnoacutestico y consejo geneacutetico Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 13

revistageneticamedicacom

un listado de diferentes programas de prediccioacuten

computacional in silico de mutaciones que afectan a

la pauta de lectura de los genes o a los sitios de pro‐

cesado del ARN mensajero asiacute como del grado de

conservacioacuten de las posiciones nucleotiacutedicas

El segundo bloque del artiacuteculo se centra en los crite‐

rios para interpretar las variantes geneacuteticas identifi‐

cadas y evaluar su grado de patogenicidad en rela‐

cioacuten con enfermedades mendelianas diferenciando

en dos bloques variantes patogeacutenicas o probable‐

mente patogeacutenicas y variantes benignas o probable‐

mente patogeacutenicas

A continuacioacuten los autores hablan sobre la forma de

presentar los resultados sobre variantes geneacuteticas

en definitiva el producto final de los laboratorios cliacute‐

nicos Asiacute los informes deberiacutean incluir los resultados

presentados de forma estructurada la interpretacioacuten

de los mismos junto con las evidencias en las que

estaacute basada referencias metodologiacutea y descargo de

responsabilidades cuando sea necesario Ademaacutes de

las situaciones generales en el trabajo se incorporan

consideraciones especiales como las variantes de

significado incierto el anaacutelisis de individuos sanos

los hallazgos inesperados variantes mitocondriales

variantes implicadas en el metabolismo de faacutermacos

o enfermedades complejas

Por uacuteltimo los autores incluyen una seccioacuten sobre

coacutemo deberiacutean utilizar las recomendaciones los pro‐

fesionales de la salud Teniendo en cuenta que el ob‐

jetivo principal de las pruebas geneacuteticas llevadas a

cabo en un laboratorio cliacutenico es dirigir o apoyar la

toma de decisiones meacutedicas a traveacutes de la identifica‐

cioacuten de las causas de la enfermedad o de factores

que afecten a la respuesta a determinados faacutermacos

los autores reconocen la interaccioacuten y el trabajo cola‐

borativo entre los profesionales meacutedicos que tratan a

los pacientes y los del laboratorio encargado de reali‐

zar las pruebas como algo crucial Los resultados de

cada paciente deben ser evaluados por el laboratorio

y el meacutedico responsable dentro del contexto de la

historia meacutedica y familiar del paciente y la identifica‐

cioacuten de una nueva variante geneacutetica no debe ser asu‐

mida como relevante simplemente porque sea rara

nueva o de novo (no heredada) Ademaacutes en la medi‐

da de lo posible la toma de decisiones a partir de los

resultados geneacuteticos deberiacutea complementarse con

informacioacuten cliacutenica adicional

El creciente nuacutemero de pruebas geneacuteticas disponi‐

bles en la actualidad requiere el desarrollo de estaacuten‐

dares para los diferentes laboratorios cliacutenicos encar‐

gados de realizarlas maacutes allaacute de las normas de cali‐

dad asiacute como de recomendaciones para interpretar

las variantes geneacuteticas que puedan ser identificadas

en el anaacutelisis Iniciativas como la llevada a cabo por el

ACMG y la Asociacioacuten de Patologiacutea Molecular favore‐

cen la estandarizacioacuten de conceptos y facilitan la to‐

ma de decisiones basadas en resultados geneacuteticos al

tiempo que contribuyen a mejorar la calidad de los

servicios de los laboratorios

Referencia Richards S et al Standards and guideli‐

nes for the interpretation of sequence variants a joint

consensus recommendation of the American College of

Medical Genetics and Genomics and the Association

for Molecular Pathology Genet Med 2015 Mar 5 doi

101038gim201530

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 7: Genética Médica News Número 20

Pese a que normalmente se considera que todos los

miembros de la especie humana contienen la misma

cantidad de material hereditario en sus ceacutelulas lo

cierto es que en muacuteltiples regiones geacutenicas los geno‐

mas humanos presentan variabilidad en el nuacutemero

de copias de algunos segmentos del ADN Un caso

especial de CNV como se denomina a este tipo de

polimorfismo geneacutetico (de copy number variation en

ingleacutes) son las CNV multialeacutelicas que se presentan

en un nuacutemero de estados o alelos mayor de dos Las

CNV multialeacutelicas son difiacuteciles de analizar debido a

algunas limitaciones teacutecnicas la incapacidad de dis‐

criminar entre el nuacutemero de estados consecutivos

(por ejemplo nueve o diez) mediante teacutecnicas comu‐

nes como los microarrays o la PCR cuantitativa ruti‐

naria y el amplio rango de nuacutemeros de copias con los

que se pueden en el genoma desde dos hasta doce o

maacutes copias

Un equipo formado por investigadores de la Universi‐

dad de Harvard y del centro de Biologiacutea Digital de la

empresa biotecnoloacutegica Bio‐Rad ha sobrepasado

estas limitaciones mediante la combinacioacuten de la

secuenciacioacuten masiva del genoma completo y la PCR

digital permitiendo estimar la contribucioacuten de las

CNV multialeacutelicas a la variabilidad humana

Con el objetivo de identificar el nuacutemero de copias

alelos y haplotipos (combinaciones de alelos en un

mismo cromosoma) de las CNV multialeacutelicas de ma‐

yor tamantildeo los investigadores analizaron casi 850

genomas obtenidos por secuenciacioacuten masiva en el

proyecto de los 1000 genomas Entre las maacutes de

3800 CNVs encontradas por meacutetodos computacio‐

nales cerca de 1400 presentaban maacutes de tres alelos

posibles A continuacioacuten la aproximacioacuten compu‐

tacional fue validada mediante ddPCRTM PCR digital

que incluye la emulsioacuten y fraccionamiento de la

muestra en miles de gotitas en las que se lleva a ca‐

bo la reaccioacuten de amplificacioacuten de forma indepen‐

diente

Los resultados del trabajo indican que las CNV multi‐

aleacutelicas afectan ampliamente a los genes y a su ex‐

presioacuten siendo la principal fuente de variacioacuten de la

dosis geacutenica en humanos (hasta un 88 de la variabi‐

lidad) Dicha variacioacuten ademaacutes influye fuertemente

en los niveles de expresioacuten

ldquoDespueacutes de un largo periodo de no ser capaces de

llevar a cabo anaacutelisis geneacuteticos precisos de las CNVs

multialeacutelicas en geneacutetica humana estas herramien‐

tas ndash tanto la secuenciacioacuten del genoma completo

como los aacutegiles ensayos de ddPCRTM‐ podraacuten permi‐

tir anaacutelisis cuidadosos de CNV multialeacutelicas en cohor‐

tes humanasrdquo indica Steven McCarroll profesor de

la Universidad de Harvard y director del trabajo ldquoDe

modo tranquilizador estas aproximaciones parecen

proporcionar resultados que concuerdan entre siacuterdquo

Las conclusiones del trabajo abren diferentes frentes

de trabajo desde evaluar el efecto de las combina‐

ciones de alelos en cada locus a analizar el impacto

de su variacioacuten en los fenotipos humanos Dado su

efecto sobre la dosis geacutenica o los niveles de expre‐

sioacuten y la asociacioacuten de genes localizados en las CNVs

con diversas enfermedades humanas es de esperar

que el estudio de las CNVs multialeacutelicas arroje nueva

luz sobre su influencia en diferentes patologiacuteas Del

mismo modo las CNVs podriacutean influir en la respuesta

a faacutermacos contribucioacuten que algunos investigadores

ya indican que estaacute siendo infraestimada

Referencia Handsaker RE et al Large multiallelic copy number variations in humans Nat Genet 2015

Mar47(3)296‐303 doi 101038ng3200

Fuente httpwwweurekalertorg

pub_releases2015‐03cg‐sn030215php

Contribucioacuten de las CNV multialeacutelicas a la variabilidad geneacutetica humana

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 7

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Informacioacuten parcial en muchos sitios de Internet que ofrecen servicios geneacuteticos para la medicina personalizada en caacutencer

Durante los uacuteltimos antildeos el raacutepido crecimiento en la

capacidad de llevar a cabo diagnoacutestico geneacutetico ha

propiciado la aparicioacuten de diferentes sitios de Inter‐

net en los que se ofrecen servicios geneacuteticos La exis‐

tencia de este tipo de carteras de servicios y su facili‐

dad de acceso representan un gran potencial para

extender la utilizacioacuten del diagnoacutestico geneacutetico den‐

tro de la comunidad meacutedica asiacute como mejorar la ca‐

pacidad predictiva o la posibilidad de tomar decisio‐

nes sobre tratamiento de los pacientes Sin embargo

la comercializacioacuten por Internet de pruebas geneacuteticas

en el contexto de la medicina personalizada no estaacute

regulada lo que ha aumentado la preocupacioacuten de

los investigadores y profesionales meacutedicos ya que

muchas de ellas pueden no tener utilidad cliacutenica

Un reciente estudio del Instituto del Caacutencer Dana‐

Farber publicado en el Journal of the National Cancer

Institute ha evaluado los sitios de Internet que ofre‐

cen pruebas geneacuteticas para la medicina personaliza‐

da en caacutencer y concluido que a menudo se exagera

en ellos los beneficios al tiempo que se minimizan o

ignoran las limitaciones

En el estudio los investigadores analizaron la infor‐

macioacuten de 55 sitios de Internet (identificados por

buacutesquedas de palabras en ingleacutes) que comercializan

productos geneacuteticos para la medicina personalizada

del caacutencer patrocinados bien por empresas comer‐

ciales instituciones acadeacutemicas centros de investi‐

gacioacuten o meacutedicos individuales El criterio para consi‐

Museo de Ciencias de Londres Imagen John Goode (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 9

revistageneticamedicacom

derar uno de estos productos fue el de ldquoproductos o

servicios que pueden ser utilizados para llevar a cabo

un manejo individualizado del paciente basaacutendose

en datos genoacutemicos o derivados de tumoresrdquo

ldquoQueriacuteamos ver si los consumidores reciben una ima‐

gen equilibrada de los beneficios y limitaciones de

estos serviciosrdquo indica Stacy Gray primera autora

del trabajo ldquoEncontramos mucha variabilidad Parte

de la informacioacuten es buena pero toda ella necesita

ser analizada criacuteticamente por los consumidores y

profesionales sanitariosrdquo

Los investigadores encontraron que un 85 de los

sitios evaluados incluiacutean informacioacuten sobre los bene‐

ficios de sus productos pero apenas el 27 incluiacutea

informacioacuten de sus limitaciones Ademaacutes la mayor

parte de los servicios geneacuteticos ofertados dirigidos

hacia la identificacioacuten de variantes somaacuteticas esto

es no heredadas de los padres y desarrolladas a lo

largo de la vida del individuo incluiacutean pruebas no

estaacutendar o no validadas (definidas por los autores

como pruebas basadas en sugerencias inferidas o sin

evidencias de que la salud mejoraraacute al utilizar datos

de alteraciones genoacutemicas) En este sentido en la

actualidad la estandarizacioacuten de pruebas molecula‐

res y geneacuteticas en el contexto del caacutencer constituye

un problema a resolver ya que el tratamiento perso‐

nalizado contra el caacutencer evoluciona maacutes raacutepido de lo

que las organizaciones profesionales pueden asimilar

para elaborar protocolos de estandarizacioacuten

A raiacutez de los resultados obtenidos del anaacutelisis de los

sitios de Internet los autores indican que hasta que

los anaacutelisis genoacutemicos esteacuten maacutes regulados en medi‐

cina en general y en medicina personalizada en par‐

ticular los profesionales meacutedicos seraacuten los responsa‐

bles de guiar a los pacientes a lo largo del proceso y

ayudarles a entender conceptos como el de validez

cliacutenica utilidad cliacutenica o la generalizacioacuten de resulta‐

dos de investigacioacuten Esto advierten no seraacute posible

si dichos profesionales no estaacuten versados en genoacutemi‐

ca Sin la educacioacuten y formacioacuten adecuada de estos

profesionales tanto la integracioacuten de las pruebas

geneacuteticas y genoacutemicas en la praacutectica cliacutenica como su

oacuteptima utilizacioacuten se veraacuten limitadas significativa‐

mente

Asiacute a pesar de su gran potencial la venta de produc‐

tos geneacuteticos relacionados con la medicina personali‐

zada por Internet podriacutea resultar perjudicial si aporta

productos de beneficio no probado o si los resultados

que se puedan obtener son indiferentes para la situa‐

cioacuten del paciente En estos momentos dada la am‐

plia variedad de servicios disponibles en algunos paiacute‐

ses la informacioacuten y capacidad criacutetica de los profe‐

sionales de la salud es crucial para identificar aquellos

basados en evidencias robustas contrastadas y vali‐

dadas

Referencias

Gray SW et al Marketing of personalized cancer care

on the web an analysis of internet websites J Natl

Cancer Inst 2015 Mar 5107(5) pii djv030 doi

101093jncidjv030

Garber K Oncologists push beyond new lung cancer

genomic testing guidelines J Natl Cancer Inst 2015

Feb 12107(2) pii djv023 doi 101093jncidjv023

Fuente httpwwwdana‐farberorgNewsroom

Geneacutetica Meacutedica News

10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Poleacutemica y preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos

Las nuevas teacutecnicas de edicioacuten del genoma han

abierto la posibilidad de modificar de forma precisa

el ADN humano La tecnologiacutea seguacuten un gran nuacuteme‐

ro de especialistas ya estaacute puesta a punto Las con‐

secuencias de su aplicacioacuten sin embargo todaviacutea se

desconocen

Un antildeo despueacutes de que se obtuvieran con eacutexito los

primeros primates adultos con mutaciones especiacutefi‐

cas introducidas mediante teacutecnicas de edicioacuten del

genoma los intensos rumores de que ya se ha modi‐

ficado el genoma en embriones humanos han levan‐

tado la voz de alarma en la comunidad cientiacutefica Di‐

chos rumores parecen tener fundamento ya que el

equipo de Nature News ha comunicado que varios

investigadores que no desean hacer puacuteblicos sus

nombres han informado de la existencia de diversos

trabajos en los que se ha modificado el genoma en

embriones humanos que estaacuten siendo considerados

para su publicacioacuten Ante esta posibilidad la respues‐

ta no se ha hecho esperar y cinco expertos en teacutecni‐

cas de edicioacuten del genoma han publicado un comen‐

tario en el que solicitan una moratoria por parte de la

comunidad cientiacutefica al completo para retrasar la

utilizacioacuten de esta tecnologiacutea en humanos y en el que

urgen a iniciar el diaacutelogo sobre si deberiacutean de llevarse

a cabo investigaciones futuras que conlleven la modi‐

ficacioacuten geneacutetica de ceacutelulas germinales en la especie

humana y en queacute circunstancias deberiacutean permitirse

Editando directamente el genoma de un embrioacuten en

el estadiacuteo de una ceacutelula se puede llegar a obtener un

individuo con todas sus ceacutelulas modificadas No obs‐

tante la tasa con la que esto se consigue es baja y

existe la posibilidad de que se genere un mosaico

esto es que el organismo obtenido no tenga la mis‐

Imagen National Human Genome Research Institute wwwgenomeorg

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 11

revistageneticamedicacom

ma composicioacuten geneacutetica en todas sus ceacutelulas Debi‐

do a esta razoacuten la aproximacioacuten requiere la genera‐

cioacuten de un gran nuacutemero de embriones para obtener

uno completamente modificado Otro planteamien‐

to es la obtencioacuten de ceacutelulas germinales (oacutevulos y

espermatozoides) modificadas con los que poste‐

riormente llevar a cabo la fecundacioacuten Mediante

este meacutetodo se pueden generar multitud de ceacutelulas o

embriones modificados entre los que se podriacutean se‐

leccionar aquellos que incluyen el cambio Una vez

desarrollados en adultos los individuos modificados

podriacutean transmitir parte de su genoma editado a su

descendencia

Las aplicaciones meacutedicas de una modificacioacuten preci‐

sa y dirigida del genoma humano en embriones son

inmediatas ya que su utilizacioacuten evitariacutea la transmi‐

sioacuten de enfermedades causadas por mutaciones pa‐

togeacutenicas a la descendencia Sin embargo no se sa‐

be si esta modificacioacuten del genoma podriacutea generar

problemas despueacutes del nacimiento o a largo plazo ni

las consecuencias que podriacutea haber a nivel de la es‐

pecie humana en su conjunto en las sucesivas gene‐

raciones Sin olvidar que aunque la intencioacuten inicial

fuera exclusivamente terapeacuteutica la tecnologiacutea pue‐

de potencialmente introducir cambios relacionados

con otras caracteriacutesticas leacutease color de ojos de pe‐

lohellipy la facilidad con la que se puede utilizar podriacutea

derivar en el temido disentildeo de ldquonintildeos a la cartardquo En

cualquier caso en su comentario titulado ldquoNo editad

la liacutenea germinal humanardquo los investigadores sentildea‐

lan que sean o no filosoacutefica o eacuteticamente justifica‐

bles estas aplicaciones son irrelevantes hasta que

sea posible demostrar que su utilizacioacuten es segura y

se obtengan datos reproducibles a traveacutes de muacutelti‐

ples generaciones

Ademaacutes de la preocupacioacuten por las implicaciones

eacuteticas y de seguridad que conlleva la utilizacioacuten de

teacutecnicas de edicioacuten del genoma en la liacutenea germinal

humana los cientiacuteficos temen que el impacto negati‐

vo generado por la poleacutemica pueda afectar a la utili‐

zacioacuten de las teacutecnicas de edicioacuten en ceacutelulas de la liacutenea

somaacutetica (ceacutelulas que no se transmiten a la descen‐

dencia) la cual estaacute generando resultados muy pro‐

metedores para el tratamiento de diversas enferme‐

dades humanas

En cuanto a las consideraciones legales aunque mu‐

chos paiacuteses no tienen una legislacioacuten que permita o

prohiacuteba la ingenieriacutea geneacutetica en humanos por con‐

siderar esta aacuterea como algo experimental en los paiacute‐

ses donde siacute existen leyes relativas a la modificacioacuten

geneacutetica esta praacutectica estaacute prohibida en humanos al

igual que en muchos casos lo estaacute la modificacioacuten de

la liacutenea germinal No obstante conviene tener en

cuenta que la mayor parte de las normativas fueron

instauradas antes de que la avanzada teacutecnica de

CRISPR estuviera disponible por lo que podriacutean ser

modificadas para aceptar la intervencioacuten terapeacuteutica

En cualquier caso la poleacutemica estaacute servida Algunos

investigadores como David Sinclair de la Universi‐

dad de Harvard indican que la pregunta no es si la

obtencioacuten de embriones humanos modificados ten‐

draacute lugar o no sino maacutes bien cuaacutendo seraacute llevada a

cabo

Referencias

Lanphier E et al Donrsquot edit the human germ line Na‐

ture 2015 March 12 Doi 101038519410a

Regalado A Engineering the Perfect Baby MIT Tech

Rev 2015 httpwwwtechnologyreviewcom

featuredstory535661engineering‐the‐perfect‐baby

Cyranoski D Scientists sound alarm over DNA editing

of human embryos Nature News 2015 Doi 101038

nature201517110

Geneacutetica Meacutedica News

12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en laboratorios cliacutenicos

El Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas (ACMG

en sus siglas en ingleacutes) y la Asociacioacuten de Patologiacutea

Molecular de EEUU acaban de publicar una serie de

estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten

de variantes geneacuteticas en los laboratorios cliacutenicos

El objetivo del trabajo seguacuten sus autores es crear un

recurso educativo para los profesionales de la geneacuteti‐

ca que trabajan en laboratorios cliacutenicos y con ello

aumentar la calidad de los servicios proporcionados

que cada vez incluyen maacutes pruebas genoacutemicas ge‐

notipacioacuten anaacutelisis de genes individuales paneles

geacutenicos exomas genomas transcriptomashellip

La primera parte del trabajo estaacute centrada en consi‐

deraciones de tipo general como la necesidad de

definir los conceptos utilizados en los laboratorios de

geneacutetica cliacutenica de forma homogeacutenea y utilizar una

nomenclatura uniforme que no pueda llevar a equi‐

vocaciones Ante la posible confusioacuten entre los teacutermi‐

nos mutacioacuten (cambio permanente en la secuencia

de nucleoacutetidos) y polimorfismo (variante con una fre‐

cuencia superior al 1) o la asuncioacuten erroacutenea de ca‐

racteriacutesticas negativas para mutacioacuten y positivas para

polimorfismo los autores recomiendan utilizar siem‐

pre el teacutermino variante acompantildeado de modificado‐

res que especifiquen su grado de patogenicidad

(patogeacutenico probablemente patogeacutenico significado

incierto probablemente benigna benigna) Respec‐

to a la nomenclatura los autores recomiendan la que

mantiene la Sociedad de Variacioacuten del Genoma Hu‐

mano (httpwwwhgvsorg) y en cualquier caso

aconsejan que los laboratorios indiquen queacute nomen‐

clatura y versioacuten utilizan en sus informes

En el trabajo se incluyen tambieacuten dos importantes

recursos para los laboratorios cliacutenicos En primer lu‐

gar un listado de bases de datos poblacionales (con

informacioacuten de las frecuencias de las variantes en

diferentes poblaciones) y de enfermedades

(variantes encontradas en pacientes y evaluacioacuten de

patogenicidad) Aunque la utilidad de estas bases de

datos es indudable los autores recuerdan que los

laboratorios cliacutenicos deberaacuten tener en cuenta la fre‐

cuencia con que se actualiza la informacioacuten en los

repositorios los meacutetodos de validacioacuten nomenclatu‐

rahellip En segundo lugar los autores incluyen tambieacuten

Diagnoacutestico y consejo geneacutetico Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 13

revistageneticamedicacom

un listado de diferentes programas de prediccioacuten

computacional in silico de mutaciones que afectan a

la pauta de lectura de los genes o a los sitios de pro‐

cesado del ARN mensajero asiacute como del grado de

conservacioacuten de las posiciones nucleotiacutedicas

El segundo bloque del artiacuteculo se centra en los crite‐

rios para interpretar las variantes geneacuteticas identifi‐

cadas y evaluar su grado de patogenicidad en rela‐

cioacuten con enfermedades mendelianas diferenciando

en dos bloques variantes patogeacutenicas o probable‐

mente patogeacutenicas y variantes benignas o probable‐

mente patogeacutenicas

A continuacioacuten los autores hablan sobre la forma de

presentar los resultados sobre variantes geneacuteticas

en definitiva el producto final de los laboratorios cliacute‐

nicos Asiacute los informes deberiacutean incluir los resultados

presentados de forma estructurada la interpretacioacuten

de los mismos junto con las evidencias en las que

estaacute basada referencias metodologiacutea y descargo de

responsabilidades cuando sea necesario Ademaacutes de

las situaciones generales en el trabajo se incorporan

consideraciones especiales como las variantes de

significado incierto el anaacutelisis de individuos sanos

los hallazgos inesperados variantes mitocondriales

variantes implicadas en el metabolismo de faacutermacos

o enfermedades complejas

Por uacuteltimo los autores incluyen una seccioacuten sobre

coacutemo deberiacutean utilizar las recomendaciones los pro‐

fesionales de la salud Teniendo en cuenta que el ob‐

jetivo principal de las pruebas geneacuteticas llevadas a

cabo en un laboratorio cliacutenico es dirigir o apoyar la

toma de decisiones meacutedicas a traveacutes de la identifica‐

cioacuten de las causas de la enfermedad o de factores

que afecten a la respuesta a determinados faacutermacos

los autores reconocen la interaccioacuten y el trabajo cola‐

borativo entre los profesionales meacutedicos que tratan a

los pacientes y los del laboratorio encargado de reali‐

zar las pruebas como algo crucial Los resultados de

cada paciente deben ser evaluados por el laboratorio

y el meacutedico responsable dentro del contexto de la

historia meacutedica y familiar del paciente y la identifica‐

cioacuten de una nueva variante geneacutetica no debe ser asu‐

mida como relevante simplemente porque sea rara

nueva o de novo (no heredada) Ademaacutes en la medi‐

da de lo posible la toma de decisiones a partir de los

resultados geneacuteticos deberiacutea complementarse con

informacioacuten cliacutenica adicional

El creciente nuacutemero de pruebas geneacuteticas disponi‐

bles en la actualidad requiere el desarrollo de estaacuten‐

dares para los diferentes laboratorios cliacutenicos encar‐

gados de realizarlas maacutes allaacute de las normas de cali‐

dad asiacute como de recomendaciones para interpretar

las variantes geneacuteticas que puedan ser identificadas

en el anaacutelisis Iniciativas como la llevada a cabo por el

ACMG y la Asociacioacuten de Patologiacutea Molecular favore‐

cen la estandarizacioacuten de conceptos y facilitan la to‐

ma de decisiones basadas en resultados geneacuteticos al

tiempo que contribuyen a mejorar la calidad de los

servicios de los laboratorios

Referencia Richards S et al Standards and guideli‐

nes for the interpretation of sequence variants a joint

consensus recommendation of the American College of

Medical Genetics and Genomics and the Association

for Molecular Pathology Genet Med 2015 Mar 5 doi

101038gim201530

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 8: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

8 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Informacioacuten parcial en muchos sitios de Internet que ofrecen servicios geneacuteticos para la medicina personalizada en caacutencer

Durante los uacuteltimos antildeos el raacutepido crecimiento en la

capacidad de llevar a cabo diagnoacutestico geneacutetico ha

propiciado la aparicioacuten de diferentes sitios de Inter‐

net en los que se ofrecen servicios geneacuteticos La exis‐

tencia de este tipo de carteras de servicios y su facili‐

dad de acceso representan un gran potencial para

extender la utilizacioacuten del diagnoacutestico geneacutetico den‐

tro de la comunidad meacutedica asiacute como mejorar la ca‐

pacidad predictiva o la posibilidad de tomar decisio‐

nes sobre tratamiento de los pacientes Sin embargo

la comercializacioacuten por Internet de pruebas geneacuteticas

en el contexto de la medicina personalizada no estaacute

regulada lo que ha aumentado la preocupacioacuten de

los investigadores y profesionales meacutedicos ya que

muchas de ellas pueden no tener utilidad cliacutenica

Un reciente estudio del Instituto del Caacutencer Dana‐

Farber publicado en el Journal of the National Cancer

Institute ha evaluado los sitios de Internet que ofre‐

cen pruebas geneacuteticas para la medicina personaliza‐

da en caacutencer y concluido que a menudo se exagera

en ellos los beneficios al tiempo que se minimizan o

ignoran las limitaciones

En el estudio los investigadores analizaron la infor‐

macioacuten de 55 sitios de Internet (identificados por

buacutesquedas de palabras en ingleacutes) que comercializan

productos geneacuteticos para la medicina personalizada

del caacutencer patrocinados bien por empresas comer‐

ciales instituciones acadeacutemicas centros de investi‐

gacioacuten o meacutedicos individuales El criterio para consi‐

Museo de Ciencias de Londres Imagen John Goode (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 9

revistageneticamedicacom

derar uno de estos productos fue el de ldquoproductos o

servicios que pueden ser utilizados para llevar a cabo

un manejo individualizado del paciente basaacutendose

en datos genoacutemicos o derivados de tumoresrdquo

ldquoQueriacuteamos ver si los consumidores reciben una ima‐

gen equilibrada de los beneficios y limitaciones de

estos serviciosrdquo indica Stacy Gray primera autora

del trabajo ldquoEncontramos mucha variabilidad Parte

de la informacioacuten es buena pero toda ella necesita

ser analizada criacuteticamente por los consumidores y

profesionales sanitariosrdquo

Los investigadores encontraron que un 85 de los

sitios evaluados incluiacutean informacioacuten sobre los bene‐

ficios de sus productos pero apenas el 27 incluiacutea

informacioacuten de sus limitaciones Ademaacutes la mayor

parte de los servicios geneacuteticos ofertados dirigidos

hacia la identificacioacuten de variantes somaacuteticas esto

es no heredadas de los padres y desarrolladas a lo

largo de la vida del individuo incluiacutean pruebas no

estaacutendar o no validadas (definidas por los autores

como pruebas basadas en sugerencias inferidas o sin

evidencias de que la salud mejoraraacute al utilizar datos

de alteraciones genoacutemicas) En este sentido en la

actualidad la estandarizacioacuten de pruebas molecula‐

res y geneacuteticas en el contexto del caacutencer constituye

un problema a resolver ya que el tratamiento perso‐

nalizado contra el caacutencer evoluciona maacutes raacutepido de lo

que las organizaciones profesionales pueden asimilar

para elaborar protocolos de estandarizacioacuten

A raiacutez de los resultados obtenidos del anaacutelisis de los

sitios de Internet los autores indican que hasta que

los anaacutelisis genoacutemicos esteacuten maacutes regulados en medi‐

cina en general y en medicina personalizada en par‐

ticular los profesionales meacutedicos seraacuten los responsa‐

bles de guiar a los pacientes a lo largo del proceso y

ayudarles a entender conceptos como el de validez

cliacutenica utilidad cliacutenica o la generalizacioacuten de resulta‐

dos de investigacioacuten Esto advierten no seraacute posible

si dichos profesionales no estaacuten versados en genoacutemi‐

ca Sin la educacioacuten y formacioacuten adecuada de estos

profesionales tanto la integracioacuten de las pruebas

geneacuteticas y genoacutemicas en la praacutectica cliacutenica como su

oacuteptima utilizacioacuten se veraacuten limitadas significativa‐

mente

Asiacute a pesar de su gran potencial la venta de produc‐

tos geneacuteticos relacionados con la medicina personali‐

zada por Internet podriacutea resultar perjudicial si aporta

productos de beneficio no probado o si los resultados

que se puedan obtener son indiferentes para la situa‐

cioacuten del paciente En estos momentos dada la am‐

plia variedad de servicios disponibles en algunos paiacute‐

ses la informacioacuten y capacidad criacutetica de los profe‐

sionales de la salud es crucial para identificar aquellos

basados en evidencias robustas contrastadas y vali‐

dadas

Referencias

Gray SW et al Marketing of personalized cancer care

on the web an analysis of internet websites J Natl

Cancer Inst 2015 Mar 5107(5) pii djv030 doi

101093jncidjv030

Garber K Oncologists push beyond new lung cancer

genomic testing guidelines J Natl Cancer Inst 2015

Feb 12107(2) pii djv023 doi 101093jncidjv023

Fuente httpwwwdana‐farberorgNewsroom

Geneacutetica Meacutedica News

10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Poleacutemica y preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos

Las nuevas teacutecnicas de edicioacuten del genoma han

abierto la posibilidad de modificar de forma precisa

el ADN humano La tecnologiacutea seguacuten un gran nuacuteme‐

ro de especialistas ya estaacute puesta a punto Las con‐

secuencias de su aplicacioacuten sin embargo todaviacutea se

desconocen

Un antildeo despueacutes de que se obtuvieran con eacutexito los

primeros primates adultos con mutaciones especiacutefi‐

cas introducidas mediante teacutecnicas de edicioacuten del

genoma los intensos rumores de que ya se ha modi‐

ficado el genoma en embriones humanos han levan‐

tado la voz de alarma en la comunidad cientiacutefica Di‐

chos rumores parecen tener fundamento ya que el

equipo de Nature News ha comunicado que varios

investigadores que no desean hacer puacuteblicos sus

nombres han informado de la existencia de diversos

trabajos en los que se ha modificado el genoma en

embriones humanos que estaacuten siendo considerados

para su publicacioacuten Ante esta posibilidad la respues‐

ta no se ha hecho esperar y cinco expertos en teacutecni‐

cas de edicioacuten del genoma han publicado un comen‐

tario en el que solicitan una moratoria por parte de la

comunidad cientiacutefica al completo para retrasar la

utilizacioacuten de esta tecnologiacutea en humanos y en el que

urgen a iniciar el diaacutelogo sobre si deberiacutean de llevarse

a cabo investigaciones futuras que conlleven la modi‐

ficacioacuten geneacutetica de ceacutelulas germinales en la especie

humana y en queacute circunstancias deberiacutean permitirse

Editando directamente el genoma de un embrioacuten en

el estadiacuteo de una ceacutelula se puede llegar a obtener un

individuo con todas sus ceacutelulas modificadas No obs‐

tante la tasa con la que esto se consigue es baja y

existe la posibilidad de que se genere un mosaico

esto es que el organismo obtenido no tenga la mis‐

Imagen National Human Genome Research Institute wwwgenomeorg

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 11

revistageneticamedicacom

ma composicioacuten geneacutetica en todas sus ceacutelulas Debi‐

do a esta razoacuten la aproximacioacuten requiere la genera‐

cioacuten de un gran nuacutemero de embriones para obtener

uno completamente modificado Otro planteamien‐

to es la obtencioacuten de ceacutelulas germinales (oacutevulos y

espermatozoides) modificadas con los que poste‐

riormente llevar a cabo la fecundacioacuten Mediante

este meacutetodo se pueden generar multitud de ceacutelulas o

embriones modificados entre los que se podriacutean se‐

leccionar aquellos que incluyen el cambio Una vez

desarrollados en adultos los individuos modificados

podriacutean transmitir parte de su genoma editado a su

descendencia

Las aplicaciones meacutedicas de una modificacioacuten preci‐

sa y dirigida del genoma humano en embriones son

inmediatas ya que su utilizacioacuten evitariacutea la transmi‐

sioacuten de enfermedades causadas por mutaciones pa‐

togeacutenicas a la descendencia Sin embargo no se sa‐

be si esta modificacioacuten del genoma podriacutea generar

problemas despueacutes del nacimiento o a largo plazo ni

las consecuencias que podriacutea haber a nivel de la es‐

pecie humana en su conjunto en las sucesivas gene‐

raciones Sin olvidar que aunque la intencioacuten inicial

fuera exclusivamente terapeacuteutica la tecnologiacutea pue‐

de potencialmente introducir cambios relacionados

con otras caracteriacutesticas leacutease color de ojos de pe‐

lohellipy la facilidad con la que se puede utilizar podriacutea

derivar en el temido disentildeo de ldquonintildeos a la cartardquo En

cualquier caso en su comentario titulado ldquoNo editad

la liacutenea germinal humanardquo los investigadores sentildea‐

lan que sean o no filosoacutefica o eacuteticamente justifica‐

bles estas aplicaciones son irrelevantes hasta que

sea posible demostrar que su utilizacioacuten es segura y

se obtengan datos reproducibles a traveacutes de muacutelti‐

ples generaciones

Ademaacutes de la preocupacioacuten por las implicaciones

eacuteticas y de seguridad que conlleva la utilizacioacuten de

teacutecnicas de edicioacuten del genoma en la liacutenea germinal

humana los cientiacuteficos temen que el impacto negati‐

vo generado por la poleacutemica pueda afectar a la utili‐

zacioacuten de las teacutecnicas de edicioacuten en ceacutelulas de la liacutenea

somaacutetica (ceacutelulas que no se transmiten a la descen‐

dencia) la cual estaacute generando resultados muy pro‐

metedores para el tratamiento de diversas enferme‐

dades humanas

En cuanto a las consideraciones legales aunque mu‐

chos paiacuteses no tienen una legislacioacuten que permita o

prohiacuteba la ingenieriacutea geneacutetica en humanos por con‐

siderar esta aacuterea como algo experimental en los paiacute‐

ses donde siacute existen leyes relativas a la modificacioacuten

geneacutetica esta praacutectica estaacute prohibida en humanos al

igual que en muchos casos lo estaacute la modificacioacuten de

la liacutenea germinal No obstante conviene tener en

cuenta que la mayor parte de las normativas fueron

instauradas antes de que la avanzada teacutecnica de

CRISPR estuviera disponible por lo que podriacutean ser

modificadas para aceptar la intervencioacuten terapeacuteutica

En cualquier caso la poleacutemica estaacute servida Algunos

investigadores como David Sinclair de la Universi‐

dad de Harvard indican que la pregunta no es si la

obtencioacuten de embriones humanos modificados ten‐

draacute lugar o no sino maacutes bien cuaacutendo seraacute llevada a

cabo

Referencias

Lanphier E et al Donrsquot edit the human germ line Na‐

ture 2015 March 12 Doi 101038519410a

Regalado A Engineering the Perfect Baby MIT Tech

Rev 2015 httpwwwtechnologyreviewcom

featuredstory535661engineering‐the‐perfect‐baby

Cyranoski D Scientists sound alarm over DNA editing

of human embryos Nature News 2015 Doi 101038

nature201517110

Geneacutetica Meacutedica News

12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en laboratorios cliacutenicos

El Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas (ACMG

en sus siglas en ingleacutes) y la Asociacioacuten de Patologiacutea

Molecular de EEUU acaban de publicar una serie de

estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten

de variantes geneacuteticas en los laboratorios cliacutenicos

El objetivo del trabajo seguacuten sus autores es crear un

recurso educativo para los profesionales de la geneacuteti‐

ca que trabajan en laboratorios cliacutenicos y con ello

aumentar la calidad de los servicios proporcionados

que cada vez incluyen maacutes pruebas genoacutemicas ge‐

notipacioacuten anaacutelisis de genes individuales paneles

geacutenicos exomas genomas transcriptomashellip

La primera parte del trabajo estaacute centrada en consi‐

deraciones de tipo general como la necesidad de

definir los conceptos utilizados en los laboratorios de

geneacutetica cliacutenica de forma homogeacutenea y utilizar una

nomenclatura uniforme que no pueda llevar a equi‐

vocaciones Ante la posible confusioacuten entre los teacutermi‐

nos mutacioacuten (cambio permanente en la secuencia

de nucleoacutetidos) y polimorfismo (variante con una fre‐

cuencia superior al 1) o la asuncioacuten erroacutenea de ca‐

racteriacutesticas negativas para mutacioacuten y positivas para

polimorfismo los autores recomiendan utilizar siem‐

pre el teacutermino variante acompantildeado de modificado‐

res que especifiquen su grado de patogenicidad

(patogeacutenico probablemente patogeacutenico significado

incierto probablemente benigna benigna) Respec‐

to a la nomenclatura los autores recomiendan la que

mantiene la Sociedad de Variacioacuten del Genoma Hu‐

mano (httpwwwhgvsorg) y en cualquier caso

aconsejan que los laboratorios indiquen queacute nomen‐

clatura y versioacuten utilizan en sus informes

En el trabajo se incluyen tambieacuten dos importantes

recursos para los laboratorios cliacutenicos En primer lu‐

gar un listado de bases de datos poblacionales (con

informacioacuten de las frecuencias de las variantes en

diferentes poblaciones) y de enfermedades

(variantes encontradas en pacientes y evaluacioacuten de

patogenicidad) Aunque la utilidad de estas bases de

datos es indudable los autores recuerdan que los

laboratorios cliacutenicos deberaacuten tener en cuenta la fre‐

cuencia con que se actualiza la informacioacuten en los

repositorios los meacutetodos de validacioacuten nomenclatu‐

rahellip En segundo lugar los autores incluyen tambieacuten

Diagnoacutestico y consejo geneacutetico Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 13

revistageneticamedicacom

un listado de diferentes programas de prediccioacuten

computacional in silico de mutaciones que afectan a

la pauta de lectura de los genes o a los sitios de pro‐

cesado del ARN mensajero asiacute como del grado de

conservacioacuten de las posiciones nucleotiacutedicas

El segundo bloque del artiacuteculo se centra en los crite‐

rios para interpretar las variantes geneacuteticas identifi‐

cadas y evaluar su grado de patogenicidad en rela‐

cioacuten con enfermedades mendelianas diferenciando

en dos bloques variantes patogeacutenicas o probable‐

mente patogeacutenicas y variantes benignas o probable‐

mente patogeacutenicas

A continuacioacuten los autores hablan sobre la forma de

presentar los resultados sobre variantes geneacuteticas

en definitiva el producto final de los laboratorios cliacute‐

nicos Asiacute los informes deberiacutean incluir los resultados

presentados de forma estructurada la interpretacioacuten

de los mismos junto con las evidencias en las que

estaacute basada referencias metodologiacutea y descargo de

responsabilidades cuando sea necesario Ademaacutes de

las situaciones generales en el trabajo se incorporan

consideraciones especiales como las variantes de

significado incierto el anaacutelisis de individuos sanos

los hallazgos inesperados variantes mitocondriales

variantes implicadas en el metabolismo de faacutermacos

o enfermedades complejas

Por uacuteltimo los autores incluyen una seccioacuten sobre

coacutemo deberiacutean utilizar las recomendaciones los pro‐

fesionales de la salud Teniendo en cuenta que el ob‐

jetivo principal de las pruebas geneacuteticas llevadas a

cabo en un laboratorio cliacutenico es dirigir o apoyar la

toma de decisiones meacutedicas a traveacutes de la identifica‐

cioacuten de las causas de la enfermedad o de factores

que afecten a la respuesta a determinados faacutermacos

los autores reconocen la interaccioacuten y el trabajo cola‐

borativo entre los profesionales meacutedicos que tratan a

los pacientes y los del laboratorio encargado de reali‐

zar las pruebas como algo crucial Los resultados de

cada paciente deben ser evaluados por el laboratorio

y el meacutedico responsable dentro del contexto de la

historia meacutedica y familiar del paciente y la identifica‐

cioacuten de una nueva variante geneacutetica no debe ser asu‐

mida como relevante simplemente porque sea rara

nueva o de novo (no heredada) Ademaacutes en la medi‐

da de lo posible la toma de decisiones a partir de los

resultados geneacuteticos deberiacutea complementarse con

informacioacuten cliacutenica adicional

El creciente nuacutemero de pruebas geneacuteticas disponi‐

bles en la actualidad requiere el desarrollo de estaacuten‐

dares para los diferentes laboratorios cliacutenicos encar‐

gados de realizarlas maacutes allaacute de las normas de cali‐

dad asiacute como de recomendaciones para interpretar

las variantes geneacuteticas que puedan ser identificadas

en el anaacutelisis Iniciativas como la llevada a cabo por el

ACMG y la Asociacioacuten de Patologiacutea Molecular favore‐

cen la estandarizacioacuten de conceptos y facilitan la to‐

ma de decisiones basadas en resultados geneacuteticos al

tiempo que contribuyen a mejorar la calidad de los

servicios de los laboratorios

Referencia Richards S et al Standards and guideli‐

nes for the interpretation of sequence variants a joint

consensus recommendation of the American College of

Medical Genetics and Genomics and the Association

for Molecular Pathology Genet Med 2015 Mar 5 doi

101038gim201530

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 9: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 9

revistageneticamedicacom

derar uno de estos productos fue el de ldquoproductos o

servicios que pueden ser utilizados para llevar a cabo

un manejo individualizado del paciente basaacutendose

en datos genoacutemicos o derivados de tumoresrdquo

ldquoQueriacuteamos ver si los consumidores reciben una ima‐

gen equilibrada de los beneficios y limitaciones de

estos serviciosrdquo indica Stacy Gray primera autora

del trabajo ldquoEncontramos mucha variabilidad Parte

de la informacioacuten es buena pero toda ella necesita

ser analizada criacuteticamente por los consumidores y

profesionales sanitariosrdquo

Los investigadores encontraron que un 85 de los

sitios evaluados incluiacutean informacioacuten sobre los bene‐

ficios de sus productos pero apenas el 27 incluiacutea

informacioacuten de sus limitaciones Ademaacutes la mayor

parte de los servicios geneacuteticos ofertados dirigidos

hacia la identificacioacuten de variantes somaacuteticas esto

es no heredadas de los padres y desarrolladas a lo

largo de la vida del individuo incluiacutean pruebas no

estaacutendar o no validadas (definidas por los autores

como pruebas basadas en sugerencias inferidas o sin

evidencias de que la salud mejoraraacute al utilizar datos

de alteraciones genoacutemicas) En este sentido en la

actualidad la estandarizacioacuten de pruebas molecula‐

res y geneacuteticas en el contexto del caacutencer constituye

un problema a resolver ya que el tratamiento perso‐

nalizado contra el caacutencer evoluciona maacutes raacutepido de lo

que las organizaciones profesionales pueden asimilar

para elaborar protocolos de estandarizacioacuten

A raiacutez de los resultados obtenidos del anaacutelisis de los

sitios de Internet los autores indican que hasta que

los anaacutelisis genoacutemicos esteacuten maacutes regulados en medi‐

cina en general y en medicina personalizada en par‐

ticular los profesionales meacutedicos seraacuten los responsa‐

bles de guiar a los pacientes a lo largo del proceso y

ayudarles a entender conceptos como el de validez

cliacutenica utilidad cliacutenica o la generalizacioacuten de resulta‐

dos de investigacioacuten Esto advierten no seraacute posible

si dichos profesionales no estaacuten versados en genoacutemi‐

ca Sin la educacioacuten y formacioacuten adecuada de estos

profesionales tanto la integracioacuten de las pruebas

geneacuteticas y genoacutemicas en la praacutectica cliacutenica como su

oacuteptima utilizacioacuten se veraacuten limitadas significativa‐

mente

Asiacute a pesar de su gran potencial la venta de produc‐

tos geneacuteticos relacionados con la medicina personali‐

zada por Internet podriacutea resultar perjudicial si aporta

productos de beneficio no probado o si los resultados

que se puedan obtener son indiferentes para la situa‐

cioacuten del paciente En estos momentos dada la am‐

plia variedad de servicios disponibles en algunos paiacute‐

ses la informacioacuten y capacidad criacutetica de los profe‐

sionales de la salud es crucial para identificar aquellos

basados en evidencias robustas contrastadas y vali‐

dadas

Referencias

Gray SW et al Marketing of personalized cancer care

on the web an analysis of internet websites J Natl

Cancer Inst 2015 Mar 5107(5) pii djv030 doi

101093jncidjv030

Garber K Oncologists push beyond new lung cancer

genomic testing guidelines J Natl Cancer Inst 2015

Feb 12107(2) pii djv023 doi 101093jncidjv023

Fuente httpwwwdana‐farberorgNewsroom

Geneacutetica Meacutedica News

10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Poleacutemica y preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos

Las nuevas teacutecnicas de edicioacuten del genoma han

abierto la posibilidad de modificar de forma precisa

el ADN humano La tecnologiacutea seguacuten un gran nuacuteme‐

ro de especialistas ya estaacute puesta a punto Las con‐

secuencias de su aplicacioacuten sin embargo todaviacutea se

desconocen

Un antildeo despueacutes de que se obtuvieran con eacutexito los

primeros primates adultos con mutaciones especiacutefi‐

cas introducidas mediante teacutecnicas de edicioacuten del

genoma los intensos rumores de que ya se ha modi‐

ficado el genoma en embriones humanos han levan‐

tado la voz de alarma en la comunidad cientiacutefica Di‐

chos rumores parecen tener fundamento ya que el

equipo de Nature News ha comunicado que varios

investigadores que no desean hacer puacuteblicos sus

nombres han informado de la existencia de diversos

trabajos en los que se ha modificado el genoma en

embriones humanos que estaacuten siendo considerados

para su publicacioacuten Ante esta posibilidad la respues‐

ta no se ha hecho esperar y cinco expertos en teacutecni‐

cas de edicioacuten del genoma han publicado un comen‐

tario en el que solicitan una moratoria por parte de la

comunidad cientiacutefica al completo para retrasar la

utilizacioacuten de esta tecnologiacutea en humanos y en el que

urgen a iniciar el diaacutelogo sobre si deberiacutean de llevarse

a cabo investigaciones futuras que conlleven la modi‐

ficacioacuten geneacutetica de ceacutelulas germinales en la especie

humana y en queacute circunstancias deberiacutean permitirse

Editando directamente el genoma de un embrioacuten en

el estadiacuteo de una ceacutelula se puede llegar a obtener un

individuo con todas sus ceacutelulas modificadas No obs‐

tante la tasa con la que esto se consigue es baja y

existe la posibilidad de que se genere un mosaico

esto es que el organismo obtenido no tenga la mis‐

Imagen National Human Genome Research Institute wwwgenomeorg

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 11

revistageneticamedicacom

ma composicioacuten geneacutetica en todas sus ceacutelulas Debi‐

do a esta razoacuten la aproximacioacuten requiere la genera‐

cioacuten de un gran nuacutemero de embriones para obtener

uno completamente modificado Otro planteamien‐

to es la obtencioacuten de ceacutelulas germinales (oacutevulos y

espermatozoides) modificadas con los que poste‐

riormente llevar a cabo la fecundacioacuten Mediante

este meacutetodo se pueden generar multitud de ceacutelulas o

embriones modificados entre los que se podriacutean se‐

leccionar aquellos que incluyen el cambio Una vez

desarrollados en adultos los individuos modificados

podriacutean transmitir parte de su genoma editado a su

descendencia

Las aplicaciones meacutedicas de una modificacioacuten preci‐

sa y dirigida del genoma humano en embriones son

inmediatas ya que su utilizacioacuten evitariacutea la transmi‐

sioacuten de enfermedades causadas por mutaciones pa‐

togeacutenicas a la descendencia Sin embargo no se sa‐

be si esta modificacioacuten del genoma podriacutea generar

problemas despueacutes del nacimiento o a largo plazo ni

las consecuencias que podriacutea haber a nivel de la es‐

pecie humana en su conjunto en las sucesivas gene‐

raciones Sin olvidar que aunque la intencioacuten inicial

fuera exclusivamente terapeacuteutica la tecnologiacutea pue‐

de potencialmente introducir cambios relacionados

con otras caracteriacutesticas leacutease color de ojos de pe‐

lohellipy la facilidad con la que se puede utilizar podriacutea

derivar en el temido disentildeo de ldquonintildeos a la cartardquo En

cualquier caso en su comentario titulado ldquoNo editad

la liacutenea germinal humanardquo los investigadores sentildea‐

lan que sean o no filosoacutefica o eacuteticamente justifica‐

bles estas aplicaciones son irrelevantes hasta que

sea posible demostrar que su utilizacioacuten es segura y

se obtengan datos reproducibles a traveacutes de muacutelti‐

ples generaciones

Ademaacutes de la preocupacioacuten por las implicaciones

eacuteticas y de seguridad que conlleva la utilizacioacuten de

teacutecnicas de edicioacuten del genoma en la liacutenea germinal

humana los cientiacuteficos temen que el impacto negati‐

vo generado por la poleacutemica pueda afectar a la utili‐

zacioacuten de las teacutecnicas de edicioacuten en ceacutelulas de la liacutenea

somaacutetica (ceacutelulas que no se transmiten a la descen‐

dencia) la cual estaacute generando resultados muy pro‐

metedores para el tratamiento de diversas enferme‐

dades humanas

En cuanto a las consideraciones legales aunque mu‐

chos paiacuteses no tienen una legislacioacuten que permita o

prohiacuteba la ingenieriacutea geneacutetica en humanos por con‐

siderar esta aacuterea como algo experimental en los paiacute‐

ses donde siacute existen leyes relativas a la modificacioacuten

geneacutetica esta praacutectica estaacute prohibida en humanos al

igual que en muchos casos lo estaacute la modificacioacuten de

la liacutenea germinal No obstante conviene tener en

cuenta que la mayor parte de las normativas fueron

instauradas antes de que la avanzada teacutecnica de

CRISPR estuviera disponible por lo que podriacutean ser

modificadas para aceptar la intervencioacuten terapeacuteutica

En cualquier caso la poleacutemica estaacute servida Algunos

investigadores como David Sinclair de la Universi‐

dad de Harvard indican que la pregunta no es si la

obtencioacuten de embriones humanos modificados ten‐

draacute lugar o no sino maacutes bien cuaacutendo seraacute llevada a

cabo

Referencias

Lanphier E et al Donrsquot edit the human germ line Na‐

ture 2015 March 12 Doi 101038519410a

Regalado A Engineering the Perfect Baby MIT Tech

Rev 2015 httpwwwtechnologyreviewcom

featuredstory535661engineering‐the‐perfect‐baby

Cyranoski D Scientists sound alarm over DNA editing

of human embryos Nature News 2015 Doi 101038

nature201517110

Geneacutetica Meacutedica News

12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en laboratorios cliacutenicos

El Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas (ACMG

en sus siglas en ingleacutes) y la Asociacioacuten de Patologiacutea

Molecular de EEUU acaban de publicar una serie de

estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten

de variantes geneacuteticas en los laboratorios cliacutenicos

El objetivo del trabajo seguacuten sus autores es crear un

recurso educativo para los profesionales de la geneacuteti‐

ca que trabajan en laboratorios cliacutenicos y con ello

aumentar la calidad de los servicios proporcionados

que cada vez incluyen maacutes pruebas genoacutemicas ge‐

notipacioacuten anaacutelisis de genes individuales paneles

geacutenicos exomas genomas transcriptomashellip

La primera parte del trabajo estaacute centrada en consi‐

deraciones de tipo general como la necesidad de

definir los conceptos utilizados en los laboratorios de

geneacutetica cliacutenica de forma homogeacutenea y utilizar una

nomenclatura uniforme que no pueda llevar a equi‐

vocaciones Ante la posible confusioacuten entre los teacutermi‐

nos mutacioacuten (cambio permanente en la secuencia

de nucleoacutetidos) y polimorfismo (variante con una fre‐

cuencia superior al 1) o la asuncioacuten erroacutenea de ca‐

racteriacutesticas negativas para mutacioacuten y positivas para

polimorfismo los autores recomiendan utilizar siem‐

pre el teacutermino variante acompantildeado de modificado‐

res que especifiquen su grado de patogenicidad

(patogeacutenico probablemente patogeacutenico significado

incierto probablemente benigna benigna) Respec‐

to a la nomenclatura los autores recomiendan la que

mantiene la Sociedad de Variacioacuten del Genoma Hu‐

mano (httpwwwhgvsorg) y en cualquier caso

aconsejan que los laboratorios indiquen queacute nomen‐

clatura y versioacuten utilizan en sus informes

En el trabajo se incluyen tambieacuten dos importantes

recursos para los laboratorios cliacutenicos En primer lu‐

gar un listado de bases de datos poblacionales (con

informacioacuten de las frecuencias de las variantes en

diferentes poblaciones) y de enfermedades

(variantes encontradas en pacientes y evaluacioacuten de

patogenicidad) Aunque la utilidad de estas bases de

datos es indudable los autores recuerdan que los

laboratorios cliacutenicos deberaacuten tener en cuenta la fre‐

cuencia con que se actualiza la informacioacuten en los

repositorios los meacutetodos de validacioacuten nomenclatu‐

rahellip En segundo lugar los autores incluyen tambieacuten

Diagnoacutestico y consejo geneacutetico Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 13

revistageneticamedicacom

un listado de diferentes programas de prediccioacuten

computacional in silico de mutaciones que afectan a

la pauta de lectura de los genes o a los sitios de pro‐

cesado del ARN mensajero asiacute como del grado de

conservacioacuten de las posiciones nucleotiacutedicas

El segundo bloque del artiacuteculo se centra en los crite‐

rios para interpretar las variantes geneacuteticas identifi‐

cadas y evaluar su grado de patogenicidad en rela‐

cioacuten con enfermedades mendelianas diferenciando

en dos bloques variantes patogeacutenicas o probable‐

mente patogeacutenicas y variantes benignas o probable‐

mente patogeacutenicas

A continuacioacuten los autores hablan sobre la forma de

presentar los resultados sobre variantes geneacuteticas

en definitiva el producto final de los laboratorios cliacute‐

nicos Asiacute los informes deberiacutean incluir los resultados

presentados de forma estructurada la interpretacioacuten

de los mismos junto con las evidencias en las que

estaacute basada referencias metodologiacutea y descargo de

responsabilidades cuando sea necesario Ademaacutes de

las situaciones generales en el trabajo se incorporan

consideraciones especiales como las variantes de

significado incierto el anaacutelisis de individuos sanos

los hallazgos inesperados variantes mitocondriales

variantes implicadas en el metabolismo de faacutermacos

o enfermedades complejas

Por uacuteltimo los autores incluyen una seccioacuten sobre

coacutemo deberiacutean utilizar las recomendaciones los pro‐

fesionales de la salud Teniendo en cuenta que el ob‐

jetivo principal de las pruebas geneacuteticas llevadas a

cabo en un laboratorio cliacutenico es dirigir o apoyar la

toma de decisiones meacutedicas a traveacutes de la identifica‐

cioacuten de las causas de la enfermedad o de factores

que afecten a la respuesta a determinados faacutermacos

los autores reconocen la interaccioacuten y el trabajo cola‐

borativo entre los profesionales meacutedicos que tratan a

los pacientes y los del laboratorio encargado de reali‐

zar las pruebas como algo crucial Los resultados de

cada paciente deben ser evaluados por el laboratorio

y el meacutedico responsable dentro del contexto de la

historia meacutedica y familiar del paciente y la identifica‐

cioacuten de una nueva variante geneacutetica no debe ser asu‐

mida como relevante simplemente porque sea rara

nueva o de novo (no heredada) Ademaacutes en la medi‐

da de lo posible la toma de decisiones a partir de los

resultados geneacuteticos deberiacutea complementarse con

informacioacuten cliacutenica adicional

El creciente nuacutemero de pruebas geneacuteticas disponi‐

bles en la actualidad requiere el desarrollo de estaacuten‐

dares para los diferentes laboratorios cliacutenicos encar‐

gados de realizarlas maacutes allaacute de las normas de cali‐

dad asiacute como de recomendaciones para interpretar

las variantes geneacuteticas que puedan ser identificadas

en el anaacutelisis Iniciativas como la llevada a cabo por el

ACMG y la Asociacioacuten de Patologiacutea Molecular favore‐

cen la estandarizacioacuten de conceptos y facilitan la to‐

ma de decisiones basadas en resultados geneacuteticos al

tiempo que contribuyen a mejorar la calidad de los

servicios de los laboratorios

Referencia Richards S et al Standards and guideli‐

nes for the interpretation of sequence variants a joint

consensus recommendation of the American College of

Medical Genetics and Genomics and the Association

for Molecular Pathology Genet Med 2015 Mar 5 doi

101038gim201530

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 10: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

10 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Poleacutemica y preocupacioacuten ante la edicioacuten del genoma en embriones humanos

Las nuevas teacutecnicas de edicioacuten del genoma han

abierto la posibilidad de modificar de forma precisa

el ADN humano La tecnologiacutea seguacuten un gran nuacuteme‐

ro de especialistas ya estaacute puesta a punto Las con‐

secuencias de su aplicacioacuten sin embargo todaviacutea se

desconocen

Un antildeo despueacutes de que se obtuvieran con eacutexito los

primeros primates adultos con mutaciones especiacutefi‐

cas introducidas mediante teacutecnicas de edicioacuten del

genoma los intensos rumores de que ya se ha modi‐

ficado el genoma en embriones humanos han levan‐

tado la voz de alarma en la comunidad cientiacutefica Di‐

chos rumores parecen tener fundamento ya que el

equipo de Nature News ha comunicado que varios

investigadores que no desean hacer puacuteblicos sus

nombres han informado de la existencia de diversos

trabajos en los que se ha modificado el genoma en

embriones humanos que estaacuten siendo considerados

para su publicacioacuten Ante esta posibilidad la respues‐

ta no se ha hecho esperar y cinco expertos en teacutecni‐

cas de edicioacuten del genoma han publicado un comen‐

tario en el que solicitan una moratoria por parte de la

comunidad cientiacutefica al completo para retrasar la

utilizacioacuten de esta tecnologiacutea en humanos y en el que

urgen a iniciar el diaacutelogo sobre si deberiacutean de llevarse

a cabo investigaciones futuras que conlleven la modi‐

ficacioacuten geneacutetica de ceacutelulas germinales en la especie

humana y en queacute circunstancias deberiacutean permitirse

Editando directamente el genoma de un embrioacuten en

el estadiacuteo de una ceacutelula se puede llegar a obtener un

individuo con todas sus ceacutelulas modificadas No obs‐

tante la tasa con la que esto se consigue es baja y

existe la posibilidad de que se genere un mosaico

esto es que el organismo obtenido no tenga la mis‐

Imagen National Human Genome Research Institute wwwgenomeorg

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 11

revistageneticamedicacom

ma composicioacuten geneacutetica en todas sus ceacutelulas Debi‐

do a esta razoacuten la aproximacioacuten requiere la genera‐

cioacuten de un gran nuacutemero de embriones para obtener

uno completamente modificado Otro planteamien‐

to es la obtencioacuten de ceacutelulas germinales (oacutevulos y

espermatozoides) modificadas con los que poste‐

riormente llevar a cabo la fecundacioacuten Mediante

este meacutetodo se pueden generar multitud de ceacutelulas o

embriones modificados entre los que se podriacutean se‐

leccionar aquellos que incluyen el cambio Una vez

desarrollados en adultos los individuos modificados

podriacutean transmitir parte de su genoma editado a su

descendencia

Las aplicaciones meacutedicas de una modificacioacuten preci‐

sa y dirigida del genoma humano en embriones son

inmediatas ya que su utilizacioacuten evitariacutea la transmi‐

sioacuten de enfermedades causadas por mutaciones pa‐

togeacutenicas a la descendencia Sin embargo no se sa‐

be si esta modificacioacuten del genoma podriacutea generar

problemas despueacutes del nacimiento o a largo plazo ni

las consecuencias que podriacutea haber a nivel de la es‐

pecie humana en su conjunto en las sucesivas gene‐

raciones Sin olvidar que aunque la intencioacuten inicial

fuera exclusivamente terapeacuteutica la tecnologiacutea pue‐

de potencialmente introducir cambios relacionados

con otras caracteriacutesticas leacutease color de ojos de pe‐

lohellipy la facilidad con la que se puede utilizar podriacutea

derivar en el temido disentildeo de ldquonintildeos a la cartardquo En

cualquier caso en su comentario titulado ldquoNo editad

la liacutenea germinal humanardquo los investigadores sentildea‐

lan que sean o no filosoacutefica o eacuteticamente justifica‐

bles estas aplicaciones son irrelevantes hasta que

sea posible demostrar que su utilizacioacuten es segura y

se obtengan datos reproducibles a traveacutes de muacutelti‐

ples generaciones

Ademaacutes de la preocupacioacuten por las implicaciones

eacuteticas y de seguridad que conlleva la utilizacioacuten de

teacutecnicas de edicioacuten del genoma en la liacutenea germinal

humana los cientiacuteficos temen que el impacto negati‐

vo generado por la poleacutemica pueda afectar a la utili‐

zacioacuten de las teacutecnicas de edicioacuten en ceacutelulas de la liacutenea

somaacutetica (ceacutelulas que no se transmiten a la descen‐

dencia) la cual estaacute generando resultados muy pro‐

metedores para el tratamiento de diversas enferme‐

dades humanas

En cuanto a las consideraciones legales aunque mu‐

chos paiacuteses no tienen una legislacioacuten que permita o

prohiacuteba la ingenieriacutea geneacutetica en humanos por con‐

siderar esta aacuterea como algo experimental en los paiacute‐

ses donde siacute existen leyes relativas a la modificacioacuten

geneacutetica esta praacutectica estaacute prohibida en humanos al

igual que en muchos casos lo estaacute la modificacioacuten de

la liacutenea germinal No obstante conviene tener en

cuenta que la mayor parte de las normativas fueron

instauradas antes de que la avanzada teacutecnica de

CRISPR estuviera disponible por lo que podriacutean ser

modificadas para aceptar la intervencioacuten terapeacuteutica

En cualquier caso la poleacutemica estaacute servida Algunos

investigadores como David Sinclair de la Universi‐

dad de Harvard indican que la pregunta no es si la

obtencioacuten de embriones humanos modificados ten‐

draacute lugar o no sino maacutes bien cuaacutendo seraacute llevada a

cabo

Referencias

Lanphier E et al Donrsquot edit the human germ line Na‐

ture 2015 March 12 Doi 101038519410a

Regalado A Engineering the Perfect Baby MIT Tech

Rev 2015 httpwwwtechnologyreviewcom

featuredstory535661engineering‐the‐perfect‐baby

Cyranoski D Scientists sound alarm over DNA editing

of human embryos Nature News 2015 Doi 101038

nature201517110

Geneacutetica Meacutedica News

12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en laboratorios cliacutenicos

El Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas (ACMG

en sus siglas en ingleacutes) y la Asociacioacuten de Patologiacutea

Molecular de EEUU acaban de publicar una serie de

estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten

de variantes geneacuteticas en los laboratorios cliacutenicos

El objetivo del trabajo seguacuten sus autores es crear un

recurso educativo para los profesionales de la geneacuteti‐

ca que trabajan en laboratorios cliacutenicos y con ello

aumentar la calidad de los servicios proporcionados

que cada vez incluyen maacutes pruebas genoacutemicas ge‐

notipacioacuten anaacutelisis de genes individuales paneles

geacutenicos exomas genomas transcriptomashellip

La primera parte del trabajo estaacute centrada en consi‐

deraciones de tipo general como la necesidad de

definir los conceptos utilizados en los laboratorios de

geneacutetica cliacutenica de forma homogeacutenea y utilizar una

nomenclatura uniforme que no pueda llevar a equi‐

vocaciones Ante la posible confusioacuten entre los teacutermi‐

nos mutacioacuten (cambio permanente en la secuencia

de nucleoacutetidos) y polimorfismo (variante con una fre‐

cuencia superior al 1) o la asuncioacuten erroacutenea de ca‐

racteriacutesticas negativas para mutacioacuten y positivas para

polimorfismo los autores recomiendan utilizar siem‐

pre el teacutermino variante acompantildeado de modificado‐

res que especifiquen su grado de patogenicidad

(patogeacutenico probablemente patogeacutenico significado

incierto probablemente benigna benigna) Respec‐

to a la nomenclatura los autores recomiendan la que

mantiene la Sociedad de Variacioacuten del Genoma Hu‐

mano (httpwwwhgvsorg) y en cualquier caso

aconsejan que los laboratorios indiquen queacute nomen‐

clatura y versioacuten utilizan en sus informes

En el trabajo se incluyen tambieacuten dos importantes

recursos para los laboratorios cliacutenicos En primer lu‐

gar un listado de bases de datos poblacionales (con

informacioacuten de las frecuencias de las variantes en

diferentes poblaciones) y de enfermedades

(variantes encontradas en pacientes y evaluacioacuten de

patogenicidad) Aunque la utilidad de estas bases de

datos es indudable los autores recuerdan que los

laboratorios cliacutenicos deberaacuten tener en cuenta la fre‐

cuencia con que se actualiza la informacioacuten en los

repositorios los meacutetodos de validacioacuten nomenclatu‐

rahellip En segundo lugar los autores incluyen tambieacuten

Diagnoacutestico y consejo geneacutetico Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 13

revistageneticamedicacom

un listado de diferentes programas de prediccioacuten

computacional in silico de mutaciones que afectan a

la pauta de lectura de los genes o a los sitios de pro‐

cesado del ARN mensajero asiacute como del grado de

conservacioacuten de las posiciones nucleotiacutedicas

El segundo bloque del artiacuteculo se centra en los crite‐

rios para interpretar las variantes geneacuteticas identifi‐

cadas y evaluar su grado de patogenicidad en rela‐

cioacuten con enfermedades mendelianas diferenciando

en dos bloques variantes patogeacutenicas o probable‐

mente patogeacutenicas y variantes benignas o probable‐

mente patogeacutenicas

A continuacioacuten los autores hablan sobre la forma de

presentar los resultados sobre variantes geneacuteticas

en definitiva el producto final de los laboratorios cliacute‐

nicos Asiacute los informes deberiacutean incluir los resultados

presentados de forma estructurada la interpretacioacuten

de los mismos junto con las evidencias en las que

estaacute basada referencias metodologiacutea y descargo de

responsabilidades cuando sea necesario Ademaacutes de

las situaciones generales en el trabajo se incorporan

consideraciones especiales como las variantes de

significado incierto el anaacutelisis de individuos sanos

los hallazgos inesperados variantes mitocondriales

variantes implicadas en el metabolismo de faacutermacos

o enfermedades complejas

Por uacuteltimo los autores incluyen una seccioacuten sobre

coacutemo deberiacutean utilizar las recomendaciones los pro‐

fesionales de la salud Teniendo en cuenta que el ob‐

jetivo principal de las pruebas geneacuteticas llevadas a

cabo en un laboratorio cliacutenico es dirigir o apoyar la

toma de decisiones meacutedicas a traveacutes de la identifica‐

cioacuten de las causas de la enfermedad o de factores

que afecten a la respuesta a determinados faacutermacos

los autores reconocen la interaccioacuten y el trabajo cola‐

borativo entre los profesionales meacutedicos que tratan a

los pacientes y los del laboratorio encargado de reali‐

zar las pruebas como algo crucial Los resultados de

cada paciente deben ser evaluados por el laboratorio

y el meacutedico responsable dentro del contexto de la

historia meacutedica y familiar del paciente y la identifica‐

cioacuten de una nueva variante geneacutetica no debe ser asu‐

mida como relevante simplemente porque sea rara

nueva o de novo (no heredada) Ademaacutes en la medi‐

da de lo posible la toma de decisiones a partir de los

resultados geneacuteticos deberiacutea complementarse con

informacioacuten cliacutenica adicional

El creciente nuacutemero de pruebas geneacuteticas disponi‐

bles en la actualidad requiere el desarrollo de estaacuten‐

dares para los diferentes laboratorios cliacutenicos encar‐

gados de realizarlas maacutes allaacute de las normas de cali‐

dad asiacute como de recomendaciones para interpretar

las variantes geneacuteticas que puedan ser identificadas

en el anaacutelisis Iniciativas como la llevada a cabo por el

ACMG y la Asociacioacuten de Patologiacutea Molecular favore‐

cen la estandarizacioacuten de conceptos y facilitan la to‐

ma de decisiones basadas en resultados geneacuteticos al

tiempo que contribuyen a mejorar la calidad de los

servicios de los laboratorios

Referencia Richards S et al Standards and guideli‐

nes for the interpretation of sequence variants a joint

consensus recommendation of the American College of

Medical Genetics and Genomics and the Association

for Molecular Pathology Genet Med 2015 Mar 5 doi

101038gim201530

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 11: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 11

revistageneticamedicacom

ma composicioacuten geneacutetica en todas sus ceacutelulas Debi‐

do a esta razoacuten la aproximacioacuten requiere la genera‐

cioacuten de un gran nuacutemero de embriones para obtener

uno completamente modificado Otro planteamien‐

to es la obtencioacuten de ceacutelulas germinales (oacutevulos y

espermatozoides) modificadas con los que poste‐

riormente llevar a cabo la fecundacioacuten Mediante

este meacutetodo se pueden generar multitud de ceacutelulas o

embriones modificados entre los que se podriacutean se‐

leccionar aquellos que incluyen el cambio Una vez

desarrollados en adultos los individuos modificados

podriacutean transmitir parte de su genoma editado a su

descendencia

Las aplicaciones meacutedicas de una modificacioacuten preci‐

sa y dirigida del genoma humano en embriones son

inmediatas ya que su utilizacioacuten evitariacutea la transmi‐

sioacuten de enfermedades causadas por mutaciones pa‐

togeacutenicas a la descendencia Sin embargo no se sa‐

be si esta modificacioacuten del genoma podriacutea generar

problemas despueacutes del nacimiento o a largo plazo ni

las consecuencias que podriacutea haber a nivel de la es‐

pecie humana en su conjunto en las sucesivas gene‐

raciones Sin olvidar que aunque la intencioacuten inicial

fuera exclusivamente terapeacuteutica la tecnologiacutea pue‐

de potencialmente introducir cambios relacionados

con otras caracteriacutesticas leacutease color de ojos de pe‐

lohellipy la facilidad con la que se puede utilizar podriacutea

derivar en el temido disentildeo de ldquonintildeos a la cartardquo En

cualquier caso en su comentario titulado ldquoNo editad

la liacutenea germinal humanardquo los investigadores sentildea‐

lan que sean o no filosoacutefica o eacuteticamente justifica‐

bles estas aplicaciones son irrelevantes hasta que

sea posible demostrar que su utilizacioacuten es segura y

se obtengan datos reproducibles a traveacutes de muacutelti‐

ples generaciones

Ademaacutes de la preocupacioacuten por las implicaciones

eacuteticas y de seguridad que conlleva la utilizacioacuten de

teacutecnicas de edicioacuten del genoma en la liacutenea germinal

humana los cientiacuteficos temen que el impacto negati‐

vo generado por la poleacutemica pueda afectar a la utili‐

zacioacuten de las teacutecnicas de edicioacuten en ceacutelulas de la liacutenea

somaacutetica (ceacutelulas que no se transmiten a la descen‐

dencia) la cual estaacute generando resultados muy pro‐

metedores para el tratamiento de diversas enferme‐

dades humanas

En cuanto a las consideraciones legales aunque mu‐

chos paiacuteses no tienen una legislacioacuten que permita o

prohiacuteba la ingenieriacutea geneacutetica en humanos por con‐

siderar esta aacuterea como algo experimental en los paiacute‐

ses donde siacute existen leyes relativas a la modificacioacuten

geneacutetica esta praacutectica estaacute prohibida en humanos al

igual que en muchos casos lo estaacute la modificacioacuten de

la liacutenea germinal No obstante conviene tener en

cuenta que la mayor parte de las normativas fueron

instauradas antes de que la avanzada teacutecnica de

CRISPR estuviera disponible por lo que podriacutean ser

modificadas para aceptar la intervencioacuten terapeacuteutica

En cualquier caso la poleacutemica estaacute servida Algunos

investigadores como David Sinclair de la Universi‐

dad de Harvard indican que la pregunta no es si la

obtencioacuten de embriones humanos modificados ten‐

draacute lugar o no sino maacutes bien cuaacutendo seraacute llevada a

cabo

Referencias

Lanphier E et al Donrsquot edit the human germ line Na‐

ture 2015 March 12 Doi 101038519410a

Regalado A Engineering the Perfect Baby MIT Tech

Rev 2015 httpwwwtechnologyreviewcom

featuredstory535661engineering‐the‐perfect‐baby

Cyranoski D Scientists sound alarm over DNA editing

of human embryos Nature News 2015 Doi 101038

nature201517110

Geneacutetica Meacutedica News

12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en laboratorios cliacutenicos

El Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas (ACMG

en sus siglas en ingleacutes) y la Asociacioacuten de Patologiacutea

Molecular de EEUU acaban de publicar una serie de

estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten

de variantes geneacuteticas en los laboratorios cliacutenicos

El objetivo del trabajo seguacuten sus autores es crear un

recurso educativo para los profesionales de la geneacuteti‐

ca que trabajan en laboratorios cliacutenicos y con ello

aumentar la calidad de los servicios proporcionados

que cada vez incluyen maacutes pruebas genoacutemicas ge‐

notipacioacuten anaacutelisis de genes individuales paneles

geacutenicos exomas genomas transcriptomashellip

La primera parte del trabajo estaacute centrada en consi‐

deraciones de tipo general como la necesidad de

definir los conceptos utilizados en los laboratorios de

geneacutetica cliacutenica de forma homogeacutenea y utilizar una

nomenclatura uniforme que no pueda llevar a equi‐

vocaciones Ante la posible confusioacuten entre los teacutermi‐

nos mutacioacuten (cambio permanente en la secuencia

de nucleoacutetidos) y polimorfismo (variante con una fre‐

cuencia superior al 1) o la asuncioacuten erroacutenea de ca‐

racteriacutesticas negativas para mutacioacuten y positivas para

polimorfismo los autores recomiendan utilizar siem‐

pre el teacutermino variante acompantildeado de modificado‐

res que especifiquen su grado de patogenicidad

(patogeacutenico probablemente patogeacutenico significado

incierto probablemente benigna benigna) Respec‐

to a la nomenclatura los autores recomiendan la que

mantiene la Sociedad de Variacioacuten del Genoma Hu‐

mano (httpwwwhgvsorg) y en cualquier caso

aconsejan que los laboratorios indiquen queacute nomen‐

clatura y versioacuten utilizan en sus informes

En el trabajo se incluyen tambieacuten dos importantes

recursos para los laboratorios cliacutenicos En primer lu‐

gar un listado de bases de datos poblacionales (con

informacioacuten de las frecuencias de las variantes en

diferentes poblaciones) y de enfermedades

(variantes encontradas en pacientes y evaluacioacuten de

patogenicidad) Aunque la utilidad de estas bases de

datos es indudable los autores recuerdan que los

laboratorios cliacutenicos deberaacuten tener en cuenta la fre‐

cuencia con que se actualiza la informacioacuten en los

repositorios los meacutetodos de validacioacuten nomenclatu‐

rahellip En segundo lugar los autores incluyen tambieacuten

Diagnoacutestico y consejo geneacutetico Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 13

revistageneticamedicacom

un listado de diferentes programas de prediccioacuten

computacional in silico de mutaciones que afectan a

la pauta de lectura de los genes o a los sitios de pro‐

cesado del ARN mensajero asiacute como del grado de

conservacioacuten de las posiciones nucleotiacutedicas

El segundo bloque del artiacuteculo se centra en los crite‐

rios para interpretar las variantes geneacuteticas identifi‐

cadas y evaluar su grado de patogenicidad en rela‐

cioacuten con enfermedades mendelianas diferenciando

en dos bloques variantes patogeacutenicas o probable‐

mente patogeacutenicas y variantes benignas o probable‐

mente patogeacutenicas

A continuacioacuten los autores hablan sobre la forma de

presentar los resultados sobre variantes geneacuteticas

en definitiva el producto final de los laboratorios cliacute‐

nicos Asiacute los informes deberiacutean incluir los resultados

presentados de forma estructurada la interpretacioacuten

de los mismos junto con las evidencias en las que

estaacute basada referencias metodologiacutea y descargo de

responsabilidades cuando sea necesario Ademaacutes de

las situaciones generales en el trabajo se incorporan

consideraciones especiales como las variantes de

significado incierto el anaacutelisis de individuos sanos

los hallazgos inesperados variantes mitocondriales

variantes implicadas en el metabolismo de faacutermacos

o enfermedades complejas

Por uacuteltimo los autores incluyen una seccioacuten sobre

coacutemo deberiacutean utilizar las recomendaciones los pro‐

fesionales de la salud Teniendo en cuenta que el ob‐

jetivo principal de las pruebas geneacuteticas llevadas a

cabo en un laboratorio cliacutenico es dirigir o apoyar la

toma de decisiones meacutedicas a traveacutes de la identifica‐

cioacuten de las causas de la enfermedad o de factores

que afecten a la respuesta a determinados faacutermacos

los autores reconocen la interaccioacuten y el trabajo cola‐

borativo entre los profesionales meacutedicos que tratan a

los pacientes y los del laboratorio encargado de reali‐

zar las pruebas como algo crucial Los resultados de

cada paciente deben ser evaluados por el laboratorio

y el meacutedico responsable dentro del contexto de la

historia meacutedica y familiar del paciente y la identifica‐

cioacuten de una nueva variante geneacutetica no debe ser asu‐

mida como relevante simplemente porque sea rara

nueva o de novo (no heredada) Ademaacutes en la medi‐

da de lo posible la toma de decisiones a partir de los

resultados geneacuteticos deberiacutea complementarse con

informacioacuten cliacutenica adicional

El creciente nuacutemero de pruebas geneacuteticas disponi‐

bles en la actualidad requiere el desarrollo de estaacuten‐

dares para los diferentes laboratorios cliacutenicos encar‐

gados de realizarlas maacutes allaacute de las normas de cali‐

dad asiacute como de recomendaciones para interpretar

las variantes geneacuteticas que puedan ser identificadas

en el anaacutelisis Iniciativas como la llevada a cabo por el

ACMG y la Asociacioacuten de Patologiacutea Molecular favore‐

cen la estandarizacioacuten de conceptos y facilitan la to‐

ma de decisiones basadas en resultados geneacuteticos al

tiempo que contribuyen a mejorar la calidad de los

servicios de los laboratorios

Referencia Richards S et al Standards and guideli‐

nes for the interpretation of sequence variants a joint

consensus recommendation of the American College of

Medical Genetics and Genomics and the Association

for Molecular Pathology Genet Med 2015 Mar 5 doi

101038gim201530

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 12: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

12 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten de variantes geneacuteticas en laboratorios cliacutenicos

El Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas (ACMG

en sus siglas en ingleacutes) y la Asociacioacuten de Patologiacutea

Molecular de EEUU acaban de publicar una serie de

estaacutendares y recomendaciones para la interpretacioacuten

de variantes geneacuteticas en los laboratorios cliacutenicos

El objetivo del trabajo seguacuten sus autores es crear un

recurso educativo para los profesionales de la geneacuteti‐

ca que trabajan en laboratorios cliacutenicos y con ello

aumentar la calidad de los servicios proporcionados

que cada vez incluyen maacutes pruebas genoacutemicas ge‐

notipacioacuten anaacutelisis de genes individuales paneles

geacutenicos exomas genomas transcriptomashellip

La primera parte del trabajo estaacute centrada en consi‐

deraciones de tipo general como la necesidad de

definir los conceptos utilizados en los laboratorios de

geneacutetica cliacutenica de forma homogeacutenea y utilizar una

nomenclatura uniforme que no pueda llevar a equi‐

vocaciones Ante la posible confusioacuten entre los teacutermi‐

nos mutacioacuten (cambio permanente en la secuencia

de nucleoacutetidos) y polimorfismo (variante con una fre‐

cuencia superior al 1) o la asuncioacuten erroacutenea de ca‐

racteriacutesticas negativas para mutacioacuten y positivas para

polimorfismo los autores recomiendan utilizar siem‐

pre el teacutermino variante acompantildeado de modificado‐

res que especifiquen su grado de patogenicidad

(patogeacutenico probablemente patogeacutenico significado

incierto probablemente benigna benigna) Respec‐

to a la nomenclatura los autores recomiendan la que

mantiene la Sociedad de Variacioacuten del Genoma Hu‐

mano (httpwwwhgvsorg) y en cualquier caso

aconsejan que los laboratorios indiquen queacute nomen‐

clatura y versioacuten utilizan en sus informes

En el trabajo se incluyen tambieacuten dos importantes

recursos para los laboratorios cliacutenicos En primer lu‐

gar un listado de bases de datos poblacionales (con

informacioacuten de las frecuencias de las variantes en

diferentes poblaciones) y de enfermedades

(variantes encontradas en pacientes y evaluacioacuten de

patogenicidad) Aunque la utilidad de estas bases de

datos es indudable los autores recuerdan que los

laboratorios cliacutenicos deberaacuten tener en cuenta la fre‐

cuencia con que se actualiza la informacioacuten en los

repositorios los meacutetodos de validacioacuten nomenclatu‐

rahellip En segundo lugar los autores incluyen tambieacuten

Diagnoacutestico y consejo geneacutetico Imagen cortesiacutea de Marta Yerca

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 13

revistageneticamedicacom

un listado de diferentes programas de prediccioacuten

computacional in silico de mutaciones que afectan a

la pauta de lectura de los genes o a los sitios de pro‐

cesado del ARN mensajero asiacute como del grado de

conservacioacuten de las posiciones nucleotiacutedicas

El segundo bloque del artiacuteculo se centra en los crite‐

rios para interpretar las variantes geneacuteticas identifi‐

cadas y evaluar su grado de patogenicidad en rela‐

cioacuten con enfermedades mendelianas diferenciando

en dos bloques variantes patogeacutenicas o probable‐

mente patogeacutenicas y variantes benignas o probable‐

mente patogeacutenicas

A continuacioacuten los autores hablan sobre la forma de

presentar los resultados sobre variantes geneacuteticas

en definitiva el producto final de los laboratorios cliacute‐

nicos Asiacute los informes deberiacutean incluir los resultados

presentados de forma estructurada la interpretacioacuten

de los mismos junto con las evidencias en las que

estaacute basada referencias metodologiacutea y descargo de

responsabilidades cuando sea necesario Ademaacutes de

las situaciones generales en el trabajo se incorporan

consideraciones especiales como las variantes de

significado incierto el anaacutelisis de individuos sanos

los hallazgos inesperados variantes mitocondriales

variantes implicadas en el metabolismo de faacutermacos

o enfermedades complejas

Por uacuteltimo los autores incluyen una seccioacuten sobre

coacutemo deberiacutean utilizar las recomendaciones los pro‐

fesionales de la salud Teniendo en cuenta que el ob‐

jetivo principal de las pruebas geneacuteticas llevadas a

cabo en un laboratorio cliacutenico es dirigir o apoyar la

toma de decisiones meacutedicas a traveacutes de la identifica‐

cioacuten de las causas de la enfermedad o de factores

que afecten a la respuesta a determinados faacutermacos

los autores reconocen la interaccioacuten y el trabajo cola‐

borativo entre los profesionales meacutedicos que tratan a

los pacientes y los del laboratorio encargado de reali‐

zar las pruebas como algo crucial Los resultados de

cada paciente deben ser evaluados por el laboratorio

y el meacutedico responsable dentro del contexto de la

historia meacutedica y familiar del paciente y la identifica‐

cioacuten de una nueva variante geneacutetica no debe ser asu‐

mida como relevante simplemente porque sea rara

nueva o de novo (no heredada) Ademaacutes en la medi‐

da de lo posible la toma de decisiones a partir de los

resultados geneacuteticos deberiacutea complementarse con

informacioacuten cliacutenica adicional

El creciente nuacutemero de pruebas geneacuteticas disponi‐

bles en la actualidad requiere el desarrollo de estaacuten‐

dares para los diferentes laboratorios cliacutenicos encar‐

gados de realizarlas maacutes allaacute de las normas de cali‐

dad asiacute como de recomendaciones para interpretar

las variantes geneacuteticas que puedan ser identificadas

en el anaacutelisis Iniciativas como la llevada a cabo por el

ACMG y la Asociacioacuten de Patologiacutea Molecular favore‐

cen la estandarizacioacuten de conceptos y facilitan la to‐

ma de decisiones basadas en resultados geneacuteticos al

tiempo que contribuyen a mejorar la calidad de los

servicios de los laboratorios

Referencia Richards S et al Standards and guideli‐

nes for the interpretation of sequence variants a joint

consensus recommendation of the American College of

Medical Genetics and Genomics and the Association

for Molecular Pathology Genet Med 2015 Mar 5 doi

101038gim201530

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 13: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 13

revistageneticamedicacom

un listado de diferentes programas de prediccioacuten

computacional in silico de mutaciones que afectan a

la pauta de lectura de los genes o a los sitios de pro‐

cesado del ARN mensajero asiacute como del grado de

conservacioacuten de las posiciones nucleotiacutedicas

El segundo bloque del artiacuteculo se centra en los crite‐

rios para interpretar las variantes geneacuteticas identifi‐

cadas y evaluar su grado de patogenicidad en rela‐

cioacuten con enfermedades mendelianas diferenciando

en dos bloques variantes patogeacutenicas o probable‐

mente patogeacutenicas y variantes benignas o probable‐

mente patogeacutenicas

A continuacioacuten los autores hablan sobre la forma de

presentar los resultados sobre variantes geneacuteticas

en definitiva el producto final de los laboratorios cliacute‐

nicos Asiacute los informes deberiacutean incluir los resultados

presentados de forma estructurada la interpretacioacuten

de los mismos junto con las evidencias en las que

estaacute basada referencias metodologiacutea y descargo de

responsabilidades cuando sea necesario Ademaacutes de

las situaciones generales en el trabajo se incorporan

consideraciones especiales como las variantes de

significado incierto el anaacutelisis de individuos sanos

los hallazgos inesperados variantes mitocondriales

variantes implicadas en el metabolismo de faacutermacos

o enfermedades complejas

Por uacuteltimo los autores incluyen una seccioacuten sobre

coacutemo deberiacutean utilizar las recomendaciones los pro‐

fesionales de la salud Teniendo en cuenta que el ob‐

jetivo principal de las pruebas geneacuteticas llevadas a

cabo en un laboratorio cliacutenico es dirigir o apoyar la

toma de decisiones meacutedicas a traveacutes de la identifica‐

cioacuten de las causas de la enfermedad o de factores

que afecten a la respuesta a determinados faacutermacos

los autores reconocen la interaccioacuten y el trabajo cola‐

borativo entre los profesionales meacutedicos que tratan a

los pacientes y los del laboratorio encargado de reali‐

zar las pruebas como algo crucial Los resultados de

cada paciente deben ser evaluados por el laboratorio

y el meacutedico responsable dentro del contexto de la

historia meacutedica y familiar del paciente y la identifica‐

cioacuten de una nueva variante geneacutetica no debe ser asu‐

mida como relevante simplemente porque sea rara

nueva o de novo (no heredada) Ademaacutes en la medi‐

da de lo posible la toma de decisiones a partir de los

resultados geneacuteticos deberiacutea complementarse con

informacioacuten cliacutenica adicional

El creciente nuacutemero de pruebas geneacuteticas disponi‐

bles en la actualidad requiere el desarrollo de estaacuten‐

dares para los diferentes laboratorios cliacutenicos encar‐

gados de realizarlas maacutes allaacute de las normas de cali‐

dad asiacute como de recomendaciones para interpretar

las variantes geneacuteticas que puedan ser identificadas

en el anaacutelisis Iniciativas como la llevada a cabo por el

ACMG y la Asociacioacuten de Patologiacutea Molecular favore‐

cen la estandarizacioacuten de conceptos y facilitan la to‐

ma de decisiones basadas en resultados geneacuteticos al

tiempo que contribuyen a mejorar la calidad de los

servicios de los laboratorios

Referencia Richards S et al Standards and guideli‐

nes for the interpretation of sequence variants a joint

consensus recommendation of the American College of

Medical Genetics and Genomics and the Association

for Molecular Pathology Genet Med 2015 Mar 5 doi

101038gim201530

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 14: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

14 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Rastreo in vivo de todos los genes del genoma en un modelo animal de caacutencer Investigadores del Instituto Broad y el Instituto de

Tecnologiacutea de Massachusetts en EEUU han utiliza‐

do el sistema de edicioacuten del genoma CRISPR‐Cas9

para inactivar in vivo y de forma sistemaacutetica todos los

genes del genoma en un modelo animal de caacutencer

El sistema CRISPR‐Cas9 (Clustered Regularly Inters‐

paced Short Palindromic Repeat‐Cas9) combina una

enzima Cas9 que corta el ADN con un ARN guiacutea

que le indica la posicioacuten exacta donde actuar El pun‐

to de rotura en la doble cadena de ADN es posterior‐

mente reparado por la ceacutelula mediante la unioacuten de

los extremos no homoacutelogos Esta reparacioacuten resulta

en la aparicioacuten de mutaciones de insercioacuten o dele‐

cioacuten que si estaacuten localizadas en la regioacuten codificante

de un gen dan lugar a la peacuterdida de la capacidad de

producir la proteiacutena correspondiente

Los investigadores utilizaron una libreriacutea de maacutes de

65000 ARNs guiacutea para inducir la creacioacuten de muta‐

ciones en todos los genes codificantes de proteiacutenas

en una liacutenea de ceacutelulas de caacutencer de pulmoacuten siguien‐

do una aproximacioacuten que aseguraba que en cada ceacute‐

lula uacutenicamente un uacutenico gen seriacutea inhabilitado A

continuacioacuten introdujeron las ceacutelulas en ratones

Varias semanas despueacutes los ratones habiacutean desarro‐

llado tumores metastaacutesicos como consecuencia de

las ceacutelulas mutagenizadas Entonces los investiga‐

dores secuenciaron los tumores primarios y metastaacute‐

sicos con el objetivo de evaluar la peacuterdida de queacute

genes era responsable del fenotipo proliferativo y del

metastaacutesico

ldquoLa evolucioacuten de un tumor es un conjunto extrema‐

damente complejo de procesos o marcas distintivas

Tecnologiacutea CRISPR Imagen Ernesto del Aguiila National Human Genome Research Institute (wwwgenomegov)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 15: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 15

revistageneticamedicacom

controladas por redes de genesrdquo indica Phillip Sharp

uno de los directores del trabajo ldquoLa aplicacioacuten de la

edicioacuten del genoma in vivo es una plataforma pode‐

rosa para la genoacutemica funcional ofreciendo un nue‐

vo modo de investigar cada paso de la evolucioacuten del

tumor e identificar los genes que regulan estas mar‐

casrdquo

Los resultados indican que la poblacioacuten de ceacutelulas

inoculadas se modificoacute dramaacuteticamente durante el

desarrollo de los tumores y la metaacutestasis reflejando

un proceso de evolucioacuten celular En los tumores pri‐

marios las ceacutelulas mutantes proliferan y compiten lo

que favorece la seleccioacuten de las ceacutelulas con mutacio‐

nes en genes que evitan la muerte celular Cada paso

hacia la metaacutestasis supone un cuello de botella en el

que la poblacioacuten sufre presioacuten selectiva hacia carac‐

teriacutesticas que favorecen la dispersioacuten de las ceacutelulas

tumorales Los investigadores identificaron genes

supresores ya conocidos implicados en el caacutencer en

humanos asiacute como nuevos genes cuya funcioacuten como

supresores de tumores no habiacutea sido desvelada toda‐

viacutea

El estudio constituye el primer caso en el que la tec‐

nologiacutea CRISPR‐Cas9 es utilizada en un organismo

completo para evaluar el efecto de la falta de funcioacuten

de cada gen del genoma sobre un fenotipo concreto

Los investigadores indican que el sistema de rastreo

utilizado podriacutea ser utilizado en otros tipos de caacutencer

ademaacutes de combinarse con inmunoterapia o trata‐

miento farmacoloacutegico para identificar genes implica‐

dos en la aparicioacuten de resistencias

ldquoLas libreriacuteas de ARNs guiacutea son un sistema de rastreo

muy potente a nivel genoacutemico y estamos excitados

por empezar a aplicarlo al estudio de la funcioacuten geacuteni‐

ca en animales modelordquo ha manifestado Feng

Zhang tambieacuten director del trabajo ldquoEste estudio

representa un primer paso hacia la utilizacioacuten de

Cas9 para identificar in vivo genes importantes en el

caacutencer y otras enfermedades complejasrdquo

Referencia Chen S et al Genome‐wide CRISPR

Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metas‐

tasis Cell 2015 Doi 101016jcell201502038

Fuente httpwwwbroadinstituteorgnews6607

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 16: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

16 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Alteracioacuten de los genes ldquomaacutes grandesrdquo del genoma en el siacutendrome de Rett

El siacutendrome de Rett desoacuterden neuroloacutegico de heren‐

cia dominante ligada al X caracterizado por la peacuterdi‐

da parcial o completa de las habilidades linguumliacutesticas y

manuales adquiridas durante los primeros 6‐18 me‐

ses de vida estaacute causado por mutaciones en el gen

MECP2 (methil CpG binding protein 2) MECP2 codifi‐

ca para una proteiacutena implicada en la metilacioacuten del

ADN MeCP2 la cual se ha propuesto que interviene

en la regulacioacuten de la expresioacuten geacutenica como repre‐

sor transcripcional Sin embargo a pesar de los nu‐

merosos estudios que abordan la funcioacuten de esta

proteiacutena no existe un modelo claro de su funciona‐

miento o de coacutemo su alteracioacuten desemboca en la en‐

fermedad

Un reciente estudio de la Universidad de Harvard

acaba de revelar informacioacuten clave para el estudio

del siacutendrome de Rett y la funcioacuten de MeCP2 los ge‐

nes de mayor tamantildeo del genoma son los maacutes afec‐

tados por la ausencia de MECP2 siendo sus niveles

de expresioacuten los maacutes alterados

Los investigadores analizaron los datos de la expre‐

sioacuten geacutenica en el cerebro de ratones mutantes para el

gen Mecp2 ya publicados en diferentes estudios y

encontraron que en todos ellos se produciacutea un au‐

mento en la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

(genes con maacutes de 100 kilobases de longitud que

representan aproximadamente un 10 del total de

genes del genoma) en comparacioacuten con los de menor

tamantildeo cuyos niveles de expresioacuten no variaban o

disminuiacutean

Para confirmar los resultados el equipo dirigido por

Michael Greenberg profesor del departamento de

Neurobiologiacutea de Harvard analizoacute un modelo de ra‐

toacuten opuesto al del siacutendrome de Rett el siacutendrome de

duplicacioacuten de MECP2 En este caso en lugar de te‐

ner lugar una alteracioacuten de la funcioacuten de la proteiacutena

MeCP2 los individuos afectados presentan dos co‐

pias funcionales del gen que la produce Los investi‐

gadores observaron que en el siacutendrome de duplica‐

cioacuten de MECP2 los genes de mayor longitud teniacutean

Estructura de la proteiacutena MeCP2

Imagen Jawahar Swaminathan y

miembros del Instituto Europeo de

Bioinformaacutetica (EBI)

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 17: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 17

revistageneticamedicacom

niveles de expresioacuten disminuidos confirmando la

relacioacuten entre la presencia o ausencia de MeCP2 y los

niveles de expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo

A continuacioacuten el equipo analizoacute la modificacioacuten de

la expresioacuten de los genes de mayor tamantildeo en au‐

sencia de MECP2 a lo largo del desarrollo de los rato‐

nes y encontroacute que antes de desarrollar los siacutentomas

caracteriacutesticos de la enfermedad ya se produce un

aumento de la expresioacuten de estos genes aunque tras

la aparicioacuten de los siacutentomas el aumento es mucho

maacutes pronunciado Ademaacutes los niveles de expresioacuten

de los genes de mayor tamantildeo correlacionaban con

la severidad de la enfermedad Esta misma relacioacuten

de dependencia entre la sobreexpresioacuten y la longitud

de los genes fue encontrada en neuronas humanas

derivadas de ceacutelulas madre embrionarias que care‐

ciacutean del gen MECP2 y en muestras de cerebro post‐

mortem de pacientes con siacutendrome de Rett

El equipo observoacute que muchos de los genes reprimi‐

dos por MeCP2 codifican para proteiacutenas implicadas

en procesos nerviosos e hipotetizoacute que los elevados

niveles de proteiacutena MeCP2 en las neuronas podriacutean

ser fruto de una evolucioacuten dirigida hacia la regulacioacuten

de los genes de mayor tamantildeo en el cerebro Esta

informacioacuten se ve apoyada por el elevado nuacutemero de

funciones nerviosas referidas a los genes de mayor

longitud del genoma asiacute como por el descubrimiento

de que estos genes se expresan de forma preferen‐

cial en cerebro tanto en ratoacuten como en humanos

respecto a otros tejidos ldquoEncontramos que mientras

que todos los tipos celulares del cuerpo utilizan ge‐

nes de longitud media y corta existe mayor expre‐

sioacuten de los genes de mayor longitud en el cerebro

que en cualquier otra parte del cuerpo Esto podriacutea

ayudar a explicar por queacute el siacutendrome de Rett es una

enfermedad neuroloacutegicardquo indica Benyam Kinde uno

de los autores del trabajo

Aprovechando los resultados de un reciente trabajo

en el que se habiacutea demostrado que la inhibicioacuten far‐

macoloacutegica de las enzimas topoisomerasas lleva a la

reduccioacuten de la expresioacuten de los genes de mayor ta‐

mantildeo en neuronas los investigadores analizaron el

efecto de uno de estos inhibidores denominado to‐

potecan en ceacutelulas carentes de MECP2 (y que por

tanto presentaban sobreexpresioacuten de genes de ma‐

yor tamantildeo) Los resultados indican que el trata‐

miento con topotecan revierte el efecto de la ausen‐

cia de MeCP2 en neuronas apuntando hacia un po‐

tencial complemento terapeacuteutico para el tratamiento

de desoacuterdenes del neurodesarrollo en los que la ex‐

presioacuten de los genes de mayor tamantildeo estaacute alterada

De momento no obstante y antes de plantear su

utilizacioacuten en humanos los investigadores evaluacutean su

efecto en modelos en ratoacuten del siacutendrome de Rett

ldquoMECP2 es uno de los problemas maacutes complejos en

los que he trabajado durante mi carrerardquo reconoce

Michael Greenberg ldquoPerseveramos porque creo fir‐

memente que entender coacutemo funciona esta proteiacutena

nos ayudaraacute a tratar este desorden devastador Es

gratificante imaginar que nosotros un laboratorio de

ciencia baacutesica hayamos podido abrir la puerta hacia

una nueva forma de abordar el tratamiento del siacuten‐

drome de Rett y los desoacuterdenes asociados a MECP2rdquo

Referencia Gabel HW et al Disruption of DNA‐

methylation‐dependent long gene repression in Rett

syndrome Nature 2015 Mar 11 doi 101038

nature14319

Fuentes

httpwwwrsrtorgabout‐rsrtpress‐releaseslength

‐matters‐rett‐syndrome‐may‐result‐from‐

overexpression‐of‐long‐genes

httpmedicalxpresscomnews2015‐03‐rett‐

syndrome‐result‐overexpression‐geneshtml

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 18: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

18 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

iquestA quieacuten beneficia el diagnoacutestico geneacutetico de una enfermedad

A grandes rasgos el teacutermino ldquoutilidad cliacutenicardquo se refie‐

re a la probabilidad de que una intervencioacuten lleve a

una mejora en el estado de salud de los pacientes o a

la capacidad de una determinada prueba para pro‐

porcionar informacioacuten uacutetil sobre el diagnoacutestico tra‐

tamiento manejo o prevencioacuten de la enfermedad

Ante las recientes poliacuteticas de los programas de salud

o aseguradoras en EEUU que asumen que el benefi‐

cio cliacutenico de una prueba diagnoacutestica geneacutetica o ge‐

noacutemica se limita al paciente que recibe los servicios

el Colegio de Geneacutetica y Genoacutemica Meacutedicas de

EEUU (ACMG en sus siglas en ingleacutes) en represen‐

tacioacuten de la comunidad profesional de Geneacutetica Meacute‐

dica del paiacutes acaba de publicar una nota en la que

explican bajo queacute situaciones la utilidad cliacutenica se

puede extender a la familia de los probandos o inclu‐

so a la sociedad

Los autores indican que en el caso de pacientes indi‐

viduales la utilidad cliacutenica y los beneficios del diag‐

noacutestico geneacutetico de enfermedades sobre las que se

puede actuar cliacutenicamente estaacute ampliamente reco‐

nocida por los diferentes programas de salud El

diagnoacutestico preciso de una enfermedad puede llevar

a cambios en el manejo del paciente como la pre‐

vencioacuten de pruebas adicionales o la toma de decisio‐

nes terapeacuteuticas Ademaacutes conforme aumentan las

enfermedades que pueden ser diagnosticadas me‐

diante pruebas geneacuteticas aumentan las posibilida‐

des de intervenir cliacutenicamente sobre ellas

Respecto a la utilidad de las pruebas geneacuteticas en

otros miembros de la familia el diagnoacutestico geneacutetico

definitivo de un paciente permite determinar si otros

familiares en riesgo son portadores de mutaciones

causales llevar a cabo planificacioacuten familiar informa‐

da y finalizar la denominada ldquoodisea del diagnoacutesti‐

cordquo que acarrea una importante carga tanto psicoloacute‐

gica como econoacutemica para las familias

La utilidad cliacutenica del diagnoacutestico geneacutetico y genoacutemi‐

co puede ser transferida a la sociedad por medio de

los ensayos cliacutenicos De forma frecuente un diagnoacutes‐

tico preciso es necesario para ser seleccionado como

participante en ensayos cliacutenicos a traveacutes de los que

se pueden establecer conclusiones sobre tratamien‐

tos o aproximaciones de utilidad para otros pacientes

con la enfermedad Los autores indican que en el sis‐

tema actual la efectividad en teacuterminos econoacutemicos

se valora por el retorno de lo invertido en periodos de

tiempo demasiados cortos a pesar de que los benefi‐

cios para la sociedad pueden producirse a largo pla‐

zo

Con estos argumentos el ACMG declara su firme

creencia en que conocer la naturaleza de las enfer‐

medades geneacuteticas hereditarias que pueden presen‐

tar segregacioacuten en las familias de los miembros afec‐

tados proporciona utilidad significativa no soacutelo para

los pacientes sino tambieacuten para las familias y la so‐

ciedad

Clinical utility of genetic and genomic services a posi‐

tion statement of the American College of Medical Ge‐

netics and Genomics Genet Med 2015 Mar 12 doi

101038gim201541

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 19: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 19

revistageneticamedicacom

Un anaacutelisis de sangre podriacutea sustituir la biopsia en la deteccioacuten de las mutaciones del gen EGFR en los caacutenceres de pulmoacuten

Rafael Rosell Director del Programa de Biologiacutea y

Medicina Personalizada del Caacutencer Instituto Catalaacuten

de Oncologiacutea (ICO) Hospital Germans Trias i Pujol

Badalona Barcelona

El tratamiento del caacutencer de pulmoacuten de ceacutelula no pe‐

quentildea (CPCNP) ha cambiado draacutesticamente desde

que se descubrieron en el antildeo 2004 las mutaciones

del gen receptor de factor de crecimiento epideacutermico

EGFR como causantes del caacutencer de pulmoacuten en algu‐

nos pacientes (sobre todo aquellos con adenocarci‐

nomas de pulmoacuten mujeres y los no fumadores o ex‐

fumadores) Estudios de cribado para detectar las

mutaciones en el EGFR pueden ahora determinar queacute

pacientes tienen maacutes probabilidades de beneficiarse

de las terapias dirigidas tales como Tarcevareg los pa‐

cientes tratados con este faacutermaco responden signifi‐

cativamente mejor en comparacioacuten con aquellos que

reciben quimioterapia Dadas las dificultades ante‐

riormente comentadas en obtener tejido tumoral

mediante la biopsia tradicional esta nueva teacutecnica

de deteccioacuten en sangre es un meacutetodo prometedor

para el cribado

En nuestro trabajo recientemente publicado en la

revista JAMA Oncology ldquoAssociation of EGFR L858R

mutation in circulating free DNA with survival in the

EURTAC trialrdquo demostramos la viabilidad de utilizar

ADN circulante libre (cfDNA) a partir de muestras de

sangre recogidas de pacientes con caacutencer de pulmoacuten

avanzado de ceacutelula no pequentildea (CPCNP) como un

sustituto para biopsias de tejido a traveacutes de un test

de deteccioacuten de mutaciones geneacuteticas en sangre de

pacientes con caacutencer de pulmoacuten

El ensayo EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol

de Caacutencer de Pulmoacuten (GECP) fue el primero en de‐

mostrar la superioridad de Tarcevareg sobre la quimio‐

terapia en pacientes occidentales con EGFR mutado

El GECP es un grupo cooperativo multidisciplinar for‐

mado por maacutes de 132 hospitales y 260 meacutedicos espa‐

ntildeoles especializados en oncologiacutea meacutedica cirugiacutea

toraacutecica e investigadores baacutesicos fundado en el antildeo

1991 con un claro objetivo avanzar en el tratamiento

de caacutencer de pulmoacuten mediante la investigacioacuten y la

prevencioacuten

El artiacuteculo destaca los importantes niveles de sensibi‐

lidad (78) y especificidad (100) posicionaacutendolo

como el mejor test en sangre en la actualidad asiacute

como la importancia de la biopsia liquida en la moni‐

torizacioacuten de los pacientes

El anaacutelisis en tejido tumoral sigue siendo el meacutetodo

recomendado para la deteccioacuten de la presencia de

mutaciones de EGFR oncogeacutenicas Sin embargo la

cantidad de tejido tumoral obtenido por biopsia es a

Estructura del Receptor del Factor de Crecimiento Epideacutermico Imagen RCSB

Protein Data Base

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 20: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

20 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

menudo insuficiente especialmente en CPCNP avan‐

zado planteando la cuestioacuten de si cfDNA puede ser

utilizado como una biopsia liacutequida sustituta para la

deteccioacuten no invasiva de las mutaciones de EGFR

Mediante esta novedosa teacutecnica hemos buscado

detectar mutaciones en el gen EGFR que impulsan el

crecimiento del tumor y correlacionan su presencia

con los tiempos de supervivencia para estos pacien‐

tes La mutacioacuten L858R en EGFR emerge por primera

vez como un factor pronoacutestico y predictivo de la su‐

pervivencia en determinados pacientes

Este anaacutelisis era un objetivo secundario del estudio

EURTAC promovido por el Grupo Espantildeol de Caacutencer

de Pulmoacuten (GECP) y que llevoacute a la aprobacioacuten por

parte de la FDA del inhibidor de Roche Tarcevareg en

2013 para pacientes con la mutacioacuten EGFR en prime‐

ra liacutenea Para llevar a cabo el presente anaacutelisis exa‐

minamos mutaciones de EGFR en cfDNA aislado de

97 muestras de sangre En 76 muestras de 97 (78 por

ciento) de los pacientes se detectaron mutaciones

de EGFR en cfDNA

El tiempo medio de supervivencia global fue menor

en los pacientes con la mutacioacuten L858R en cfDNA

que en aquellos con delecioacuten en el exoacuten 19 (137 vs 30

meses) Para los pacientes con la mutacioacuten L858R en

el tejido el tiempo medio de supervivencia global fue

de 137 meses para los pacientes con la mutacioacuten

L858R en cfDNA y 277 meses para aquellos en los

que no se detectoacute la mutacioacuten en cfDNA Para los 76

pacientes con mutaciones de EGFR en cfDNA soacutelo el

tratamiento con erlotinib fue un predictor indepen‐

diente de la enfermedad para la supervivencia libre

de progresioacuten Por lo tanto la presencia de la muta‐

cioacuten de EGFR L858R y su deteccioacuten en sangre ahora

se puede considerar como un factor pronoacutestico y pre‐

dictivo con aplicacioacuten a la praacutectica cliacutenica El ensayo

es el primero en comparar la supervivencia en

CPCNP avanzado seguacuten la deteccioacuten de mutaciones

en cfDNA vs tejido

Referencia Karachaliou N et al Association of EGFR

L858R Mutation in Circulating Free DNA With Survival

in the EURTAC Trial JAMA Oncol Published online

February 26 2015 doi101001jamaoncol2014257

Adenocarcinoma de pulmoacuten Imagen Ed Uthman (CC BY 20)

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 21: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News Nuevas claves sobre la susceptibilidad geneacutetica a la tuberculosis

Alrededor de 2000 millones de personas estaacuten infec‐

tadas con Mycobacterium tuberculosis bacteria res‐

ponsable de causar la tuberculosis Sin embargo uacuteni‐

camente el 10 de ellas desarrollan de forma activa

la enfermedad el resto son portadores de la infec‐

cioacuten pero no muestran siacutentomas Con el objetivo de

determinar queacute factores geneacuteticos predisponen a la

tuberculosis y contribuyen a que unas personas desa‐

rrollen la forma cliacutenica de la enfermedad y otras no

investigadores de la Universidad de Cambridge han

llevado a cabo el mayor estudio de asociacioacuten del

genoma completo hasta la fecha en el que se han

identificado variantes geneacuteticas en el gen ASAP1

asociadas a la susceptibilidad a desarrollar tubercu‐

losis

Los investigadores analizaron maacutes de 7 millones y

medio de SNPs (polimorfismos de un solo nucleoacuteti‐

do) en un total de maacutes de 15000 personas incluyen‐

do pacientes con tuberculosis pulmonar activa y con‐

troles sanos todos ellos de poblacioacuten rusa Los resul‐

tados revelaron la asociacioacuten entre la tuberculosis y

diversas variantes geneacuteticas localizadas en el gen

ASAP1 el cual codifica para una proteiacutena implicada

en la remodelacioacuten de la membrana con funciones

importantes para la adhesioacuten y migracioacuten celular Los

mecanismos de accioacuten de ASAP1 y su papel en la for‐

macioacuten de estructuras que conectan la matriz extra‐

celular con el citoesqueleto de actina del interior de

la ceacutelula apuntan a una importante participacioacuten en

el proceso de patogeacutenesis de la tuberculosis espe‐

cialmente a traveacutes de dos tipos celulares macroacutefagos

y ceacutelulas dendriacuteticas Estudios previos indican que M

tuberculosis inhibe la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacute‐

ticas infectadas hacia los noacutedulos linfaacuteticos donde

activan los linfocitos T implicados en inmunidad

adaptativa sin embargo el papel del gen ASAP1 en

este tipo celular no habiacutea sido estudiado

El equipo de investigadores dirigido por Sergey Ne‐

jentsev determinoacute que la expresioacuten de ASAP1 en las

ceacutelulas dendriacuteticas de los pacientes infectados con

tuberculosis es menor que en las ceacutelulas dendriacuteticas

de controles sanos Ademaacutes en ceacutelulas dendriacuteticas

obtenidas de la diferenciacioacuten de monocitos de per‐

sonas sanas la reduccioacuten de ASAP1 mediante ARN

de interferencia daba lugar a una alteracioacuten en la

migracioacuten celular

Asiacute el trabajo concluye indicando que la alteracioacuten

de la migracioacuten de las ceacutelulas dendriacuteticas infectadas

con M tuberculosis como consecuencia de la dismi‐

nucioacuten de la expresioacuten de ASAP1 contribuye a la pa‐

togeacutenesis de la tuberculosis De este modo variantes

geneacuteticas como las identificadas que reducen la ex‐

presioacuten de ASAP1 podriacutean conferir mayor susceptibi‐

lidad a desarrollar la forma activa de la enfermedad

En la actualidad la tuberculosis es la segunda enfer‐

medad infecciosa que maacutes muertes provoca La Or‐

ganizacioacuten Mundial de la Salud ha advertido de que

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 21

revistageneticamedicacom

Mycobacterium tuberculosis Imagen Centro de Control y Prevencioacuten de

Enfermedades Instituto Nacional de Salud EEUU

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 22: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News soacutelo en Europa aproximadamente 1000 personas

son infectadas por tuberculosis cada diacutea y que aun‐

que el nuacutemero de casos ha disminuido la frecuencia

de casos de tuberculosis multirresistente sigue sien‐

do alta especialmente en un grupo de 18 paiacuteses en

los que en conjunto se produce el 85 de los nuevos

casos en Europa Zsuzsanna Jakab directora regional

de la OMS en Europa advierte que uacutenicamente la

mitad de los pacientes con tuberculosis multirresis‐

tente son identificados y de eacutestos soacutelo la mitad son

curados Ante esta situacioacuten ademaacutes de las poliacuteticas

de prevencioacuten y diagnoacutestico urge identificar nuevos

mecanismos de accioacuten contra la enfermedad asiacute co‐

mo determinar queacute parte de la poblacioacuten presenta un

mayor riesgo a desarrollar la enfermedad

ldquoNuestro estudio proporciona nueva perspectiva

dentro de los mecanismos bioloacutegicos de la tubercu‐

losisrdquo indica Sergey Nejentsev ldquoLa tuberculosis es

un problema de salud global y la amenaza de resis‐

tencia a los faacutermacos significa que necesitamos desa‐

rrollar urgentemente nuevas formas de luchar contra

ella En el futuro quizaacutes sea posible utilizar como dia‐

na rutas inmunes que impliquen a ASAP1 para dise‐

ntildear de forma eficiente vacunas para la prevencioacuten de

la tuberculosisrdquo

Referencia Curtis J et al Susceptibility to tubercu‐

losis is associated with variants in the ASAP1 gene en‐

coding a regulator of dendritic cell migration Nat Ge‐

net 2015 Mar 16 doi 101038ng3248

Fuentes

httpswwwcamacukresearchnewsgene‐

discovery‐provides‐clues‐to‐how‐tb‐may‐evade‐the‐

immune‐system

httpwwweurowhointenmedia‐centresections

press‐releases2015each‐day‐1000‐people‐fall‐sick‐

with‐tuberculosis‐in‐the‐european‐region

22 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 23: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 18 | 2015

revistageneticamedicacom

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 24: Genética Médica News Número 20

Un nuevo siacutendrome que combina anomaliacutea de Klip‐

pel‐Feil y miopatiacutea asociado a una mutacioacuten en el

gen MYO18B

Alazami AM et al A novel syndrome of Klippel‐Feil

anomaly myopathy and characteristic facies is linked

to a null mutation in MYO18B J Med Genet 2015 Mar

6 doi 101136jmedgenet‐2014‐102964

Un comentario sobre la legislacioacuten en la era genoacute‐

mica y la realizacioacuten de pruebas geneacuteticas para la

evaluacioacuten del riesgo en caacutencer

Walcott FL Dunn BK Legislation in the genomic era

the Affordable Care Act and genetic testing for cancer

risk assessment Genet Med 2015 Mar 5 doi 101038

gim201518

La identificacioacuten en pacientes con nistagmo

(movimiento involuntario del ojo que resulta en

visioacuten limitada) autosoacutemico dominante de muta‐

ciones en el gen que codifica para la beta manosi‐

dasa enzima implicada en el almacenamiento li‐

sosoacutemico apunta a una nueva entidad cliacutenica y

arroja nueva informacioacuten sobre el papel de los ge‐

nes asociados a la funcioacuten lisosoacutemica en la patogeacute‐

nesis de la condicioacuten

Yu P et al Lysosomal storage disease in the brain

mutations of the β‐mannosidase gene identified in au‐

tosomal dominant nystagmus Genet Med 2015 Mar

5 doi 101038gim201510

Un estudio de la Universidad de Florida evaluacutea re‐

giones genoacutemicas de susceptibilidad a la diabetes

de tipo I y revela variantes causales en regiones

intensificadoras de la expresioacuten de genes relacio‐

nados con funciones linfoides

Onengut‐Gumuscu S et al Fine mapping of type 1

diabetes susceptibility loci and evidence for colocaliza‐

tion of causal variants with lymphoid gene enhancers

Nat Genet 2015 Mar 9 doi 101038ng3245

Identificadas 15 nuevas regiones croacutemosomicas de

riesgo para el caacutencer de mama

Michailidou K et al Genome‐wide association

analysis of more than 120000 individuals identifies 15

new susceptibility loci for breast cancer Nat Genet

2015 Mar 9 doi 101038ng3242

Mutaciones de novo en el gen KCNA2 que codifica

para un canal de potasio responsables de causar

encefalopatiacuteas epileacutepticas

Syrbe S et al De novo loss‐ or gain‐of‐function muta‐

tions in KCNA2 cause epileptic encephalopathy Nat

Genet 2015 Mar 9 Doi 101038ng3239

Investigadores de la Universidad de California San

Diego desarrollan un meacutetodo geneacutetico para el

diagnoacutestico del autismo a partir de sangre que po‐

driacutea ser la base para futuras pruebas cliacutenicas

Pramparo T et al Prediction of Autism by Translation

and ImmuneInflammation Coexpressed Genes in

Toddlers From Pediatric Community Practices JAMA

Psychiatry 2015 Mar 4 doi 101001

jamapsychiatry20143008

Un estudio del St Jude Childrenrsquos Research Hospi‐

tal analiza la estructura genoacutemica de los tumores

adrenocorticales pediaacutetricos

Pinto EM et al Genomic landscape of paediatric

adrenocortical tumours Nat Commun 2015 Mar

666302 doi 101038ncomms7302

Maacutes de la mitad de los padres deseariacutea conocer el

Geneacutetica Meacutedica News Noticias cortas

24 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 25: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

riesgo a desarrollar enfermedades geneacuteticas pro‐

pio y de su descendencia seguacuten un estudio de la

Universidad de Michigan

Dodson DS et al Parent and Public Interest in Whole‐

Genome Sequencing Public Health Genomics 2015

Mar 6

Nuevo meacutetodo de secuenciacioacuten de ARN para de‐

tectar y cuantificar ARNs no codificantes de larga

cadena

Clark MB et al Quantitative gene profiling of long

noncoding RNAs with targeted RNA sequencing Nat

Methods 2015 Mar 9 doi 101038nmeth3321

El estudio de los supervivientes a la infeccioacuten por el

virus del Eacutebola revela una intensa activacioacuten inmu‐

ne y apunta a posibles proteiacutenas virales implicadas

en la respuesta inmune humana que podriacutean dirigir

hacia el desarrollo de tratamientos

McElroy AK et al Human Ebola virus infection results

in substantial immune activation Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 9 pii 201502619

Un estudio de asociacioacuten del genoma completo

revela nuevas variantes geneacuteticas implicadas en la

funcioacuten tiroidea

Taylor PN et al Whole‐genome sequence‐based

analysis of thyroid function Nat Commun 2015 Mar

665681 doi 101038ncomms6681

Un meacutetodo para mapear a alta resolucioacuten los sitios

de unioacuten al genoma de factores de transcripcioacuten

He Q et al ChIP‐nexus enables improved detection of

in vivo transcription factor binding footprints Nat Bio‐

technol 2015 Mar 9 doi101038nbt3121

A pesar de la gran expectacioacuten y promesas de los

programas de terapia geacutenica no existe consenso

sobre el precio y coacutemo se podraacute hacer frente a los

gastos

Morrison C $1‐million price tag set for Glybera gene

therapy Nat Biotechnol 2015 Mar 633(3)217‐8 doi

101038nbt0315‐217

Un estudio identifica marcadores geneacuteticos asocia‐

dos al desorden por estreacutes post‐traumaacutetico relacio‐

nados con redes geacutenicas que regulan la funcioacuten

inmune innata y la sentildealizacioacuten mediada por inter‐

feroacuten

Breen MS et al Gene networks specific for innate im‐

munity define post‐traumatic stress disorder Mol

Psychiatry 2015 Mar 10 doi 101038mp20159

El primer estudio de asociacioacuten del genoma com‐

pleto en la enfermedad croacutenica de la piel denomi‐

nada rosaacutecea identifica dos variantes de riesgo en

los genes HLA‐DRA y BTNL2

Chang AL et al Assessment of the Genetic Basis of

Rosacea by Genome‐Wide Association Study J Invest

Dermatol 2015 Feb 19 doi 101038jid201553

Los pacientes con sensibilidad geneacutetica al anticoa‐

gulante warfarina tienen una mayor tasa de san‐

grado durante los primeros meses de tratamiento

y se benefician del tratamiento con otros faacutermacos

anticoagulantes

Mega JL et al Genetics and the clinical response to

warfarin and edoxaban findings from the randomi‐

seddouble‐blind ENGAGE AF‐TIMI 48 trial Lancet

2015 Mar 10 piiS0140‐6736(14)61994‐2 doi

101016S0140‐6736(14)61994‐2

La proteiacutena inhibidora de la apoptosis BRUCE y la

deubiquitinasa USP8 promueven la reparacioacuten de

dantildeos en el ADN y previenen la inestabilidad geneacute‐

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 25

revistageneticamedicacom

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 26: Genética Médica News Número 20

tica

Ge C et al BRUCE regulates DNA double‐strand break

response by promoting USP8 deubiquitination of

BRIT1 Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 2 pii

201418335

La proteiacutena Sall4 que contribuye a que las ceacutelulas

madre embrionarias mantengan su identidad pro‐

mueve tambieacuten la reparacioacuten de dantildeos en el ADN

seguacuten un estudio de la Universidad de California

San Diego

Xiong J et al Stemness factor Sall4 is required for

DNA damage response in embryonic stem cells J Cell

Biol 2015 Mar 2208(5)513‐20 doi 101083

jcb201408106

Un estudio sugiere que la cepa de gripe porcina

responsable del brote que ha matado a maacutes de

1200 personas en India desde diciembre ha adqui‐

rido mutaciones que la convierten en maacutes peligro‐

sa que cepas anteriores del virus

Tharakaraman K Sasisekharan R Influenza Sur‐

veillance 2014‐2015 H1N1 Swine‐Derived Influenza

Viruses from India Cell Host Microbe 2015 Mar 1117

(3)279‐82 doi 101016jchom201502019

Investigadores de la Universidad John Hopkins uti‐

lizan teacutecnicas de edicioacuten del genoma para corregir

un error geneacutetico en ceacutelulas madre de pacientes

con anemia falciforme y obtienen eritrocitos ma‐

duros y sanos de las ceacutelulas modificadas

Huang X et al Production of gene‐corrected adult be‐

ta globin protein in human erythrocytes differentiated

from patient iPSCs after genome editing of the sickle

point mutation Stem Cells 2015 Feb 20 doi 101002

stem1969

Investigadores del Salk Institute for Biological Re‐

search convierten ceacutelulas de pacientes con inmu‐

nodeficiencia severa combinada en ceacutelulas madre

reparan la mutacioacuten responsable de la enfermedad

y dirigen las ceacutelulas hacia su diferenciacioacuten en ceacutelu‐

las NK paso clave en el desarrollo de terapias celu‐

lares para la enfermedad

Menon T et al Lymphoid Regeneration from Gene‐

Corrected SCID‐X1 Subject‐Derived iPSCs Cell Stem

Cell 2015 Mar 11 pii S1934‐5909(15)00061‐2 doi

101016jstem201502005

Investigadores del Walter and Eliza Hall Institute

Australia utilizan una teacutecnica de edicioacuten del geno‐

ma para eliminar un gen necesario para la supervi‐

vencia de las ceacutelulas de linfoma permitiendo la eli‐

minacioacuten de ceacutelulas cancerosas de forma especiacutefica

en un modelo celular de caacutencer de sangre

Aubrey BJ et al An inducible lentiviral guide RNA

platform enables the identification of tumor‐essential

genes and tumor‐promoting mutations in vivo Cell

Rep 2015 Mar 310(8)1422‐32 doi 101016

jcelrep201502002

Un estudio de asociacioacuten del genoma complete

identifica al gen ISL1 como relacionado con una

malformacioacuten congeacutenita del tracto urinario

Draaken M et al Genome‐wide Association Study

and Meta‐Analysis Identify ISL1 as Genome‐wide Sig‐

nificant Susceptibility Gene for Bladder Exstrophy

PLoS Genet 2015 Mar 1211(3)e1005024 doi

101371journalpgen1005024

Nueva aplicacioacuten para encontrar y mapear regio‐

nes cromosoacutemicas utilizando versiones del sistema

de edicioacuten CRISPRCas9

Ma H et al Multicolor CRISPR labeling of chromoso‐

mal loci in human cells Proc Natl Acad Sci U S A 2015

Mar 10112(10)3002‐7 doi 101073pnas1420024112

Geneacutetica Meacutedica News

26 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 27: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

La identidad de los codones utilizados determina

la estabilidad del ARNm influyendo en la produc‐

cioacuten de proteiacutenas

Presnyak V et al Codon optimality is a major determi‐

nant of mRNA stability Cell 2015 Mar 12160(6)1111‐

24 doi 101016jcell201502029

Arquitectura geneacutetica del sistema inmune hu‐

mano Un estudio con gemelos evaluacutea la relacioacuten

de maacutes de 75000 rasgos inmunes con polimorfis‐

mos distribuidos a lo largo del genoma

Roederer M et al The Genetic Architecture of the Hu‐

man Immune System A Bioresource for Autoimmunity

and Disease Pathogenesis Cell 2015 Mar 11 pii

S0092‐8674(15)00247‐0 doi 101016

jcell201502046

Un estudio del CRG y el ICFO de Barcelona revela

que el ADN no estaacute empaquetado regularmente en

los nucleosomas y que las ceacutelulas madre pluripo‐

tentes presentan una estructura de la cromatina

diferente a las ceacutelulas diferenciadas

Ricci MA et al Chromatin fibers are formed by hetero‐

geneous groups of nucleosomes in vivo Cell 2015 Mar

12160(6)1145‐58 doi 101016jcell201501054

Muchos animales incluyendo los humanos adqui‐

rieron genes de los microorganismos del ambiente

mediante transferencia horizontal resultado que

rebate la asuncioacuten tradicional de que la evolucioacuten

animal se ha producido a traveacutes de la transferencia

de genes a traveacutes de los linajes

Crisp A et al Expression of multiple horizontally ac‐

quired genes is a hallmark of both vertebrate and in‐

vertebrate genomes Genome Biol 2015 Mar 1316

(1)50

Investigadores de la Universidad de Stanford des‐

cubren coacutemo se pueden transformar algunas ceacutelu‐

las leuceacutemicas en ceacutelulas inmunes que contribuyan

a luchar contra el caacutencer

McClellan JS et al Reprogramming of primary human

Philadelphia chromosome‐positive B cell acute

lymphoblastic leukemia cells into nonleukemic macrop‐

hages Proc Natl Acad Sci U S A 2015 Mar 16 pii

201413383

La secuenciacioacuten de exomas completes revela nue‐

vas variantes geneacuteticas de novo implicadas en la

esclerosis lateral amiotroacutefica

Steinberg KM et al Exome sequencing of case‐

unaffected‐parents trios reveals recessive and de novo

genetic variants in sporadic ALS Sci Rep 2015 Mar

1659124 doi 101038srep09124

Ausencia de evidencias de diferencias geneacuteticas

entre poblaciones eacutetnicas que expliquen las dispa‐

ridades asociadas a las enfermedades cardiovascu‐

lares

Kaufman JS et al The Contribution of Genomic Re‐

search to Explaining Racial Disparities in Cardiovascu‐

lar Disease A Systematic Review Am J Epidemiol

2015 Mar 1 pii kwu319

Un estudio identifica nuevas dianas para el desa‐

rrollo de terapias contra el raro y agresivo desor‐

den geneacutetico denominado IBMPFD (Miopatiacutea de

cuerpos de inclusioacuten con enfermedad oacutesea de Pa‐

get y demencia frontotemporal)

Zhang X et al Altered cofactor regulation with disea‐

se‐associated p97VCP mutations Proc Natl Acad Sci

U S A 2015 Mar 16 pii 201418820 Doi 101073

pnas1418820112

Un estudio de la Universidad de Pensilvania revela

el papel de la proteiacutena de unioacuten al ARN MSI2 en el

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 27

revistageneticamedicacom

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 28: Genética Médica News Número 20

caacutencer de colon

Wang S et al Transformation of the intestinal epithe‐

lium by the MSI2 RNA‐binding protein Nat Commun

2015 Mar 1666517 doi 101038ncomms7517

Investigadores de la Universidad de Pensilvania

analizan coacutemo una ARN helicasa MOV10L1 a tra‐

veacutes de una red en la que intervienen maacutes de 20 ge‐

nes protege la integridad de la liacutenea germinal fa‐

voreciendo la produccioacuten de un tipo de ARNs pe‐

quentildeos esenciales para el desarrollo de esperma

Vourekas A et al The RNA helicase MOV10L1 binds

piRNA precursors to initiate piRNA processing Genes

Dev 2015 Mar 11

La obtencioacuten de la estructura tridimensional de la

ADN polimerasa theta cuya expresioacuten aumenta

en algunos caacutenceres como el de mama y ovario

apunta a una posible nueva diana terapeacuteutica con‐

tra el caacutencer

Zahn KE et al Human DNA polymerase θ grasps the

primer terminus to mediate DNA repair Nat Struct

Mol Biol 2015 Mar 16 doi 101038nsmb2993

La kinasa TOPKPBK es identificada como un regu‐

lador maestro de la divisioacuten celular en caacutencer lo

que la convierte en una potencial diana terapeacuteutica

en la lucha contra el caacutencer

Rizkallah R et al Identification of the oncogenic kina‐

se TOPKPBK as a master mitotic regulator of C2H2

zinc finger proteins Oncotarget 2015 Jan 306

(3)1446‐61

Un rastreo geneacutetico en ceacutelulas madre embrionarias

de ratoacuten identifica 63 genes implicados en la sensi‐

bilidad o resistencia a la infeccioacuten con el virus de la

rabia

Wallis D et al High throughput differentiation and

screening of a library of mutant stem cell clones defi‐

nes new host‐based genes involved in rabies virus in‐

fection Stem Cells 2015 Mar 5 doi 101002

stem1983

Geneacutetica Meacutedica News

28 | Geneacutetica Meacutedica News | Vol 2 | Nuacutem 20 | 2015

revistageneticamedicacom

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom

Page 29: Genética Médica News Número 20

Geneacutetica Meacutedica News

I Congreso Internacional de Geneacutetica Cliacutenica y

Consejo Geneacutetico en Enfermedades Raras

Entidad organizadora Genetic insidER

Localizacioacuten Sevilla

Duracioacuten y fechas 16‐17 Abril 2015

Informacioacuten httpwwwgenetic‐insidercomes

indexphp

VII Congreso de la Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Entidad organizadora Sociedad Espantildeola de

Farmacogeneacutetica y Farmacogenoacutemica

Localizacioacuten Madrid Centro Nacional de Investiga‐

ciones Oncoloacutegicas

Duracioacuten y fechas 20‐21 Abril 2015

Informacioacuten httpcongreso2015seffes

XXVIII Congreso Nacional de Geneacutetica Humanamdash

AEGH y XXIII Reunioacuten Anual de la Sociedad Espa‐

ntildeola de Geneacutetica Cliacutenica y Dismorfologiacutea

Entidad organizadora Asociacioacuten Espantildeola de Ge‐

neacutetica Humana

Localizacioacuten Palma de Mallorca

Duracioacuten y fechas 13‐15 Mayo 2015

Informacioacuten httpwwwgeysecoesaegh2015

Congresos

2015 | Nuacutem 20 | Vol 2 | Geneacutetica Meacutedica News | 29

revistageneticamedicacom