bioquÍmica bÁsica

82
PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA BIOQUÍMICA BÁSICA Dagmar Stojanovic de Malpica Ph D Escuela de Biología, Facultad de Ciencias, U.C.V. 2012

Upload: others

Post on 17-Nov-2021

5 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: BIOQUÍMICA BÁSICA

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA

BIOQUÍMICA BÁSICA

Dagmar Stojanovic de Malpica Ph D Escuela de Biología, Facultad de Ciencias, U.C.V.

2012

Page 2: BIOQUÍMICA BÁSICA

UNIDAD V. PANORÁMICA DEL METABOLISMO CENTRAL

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 3: BIOQUÍMICA BÁSICA

CONCEPTOS BÁSICOS

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 4: BIOQUÍMICA BÁSICA

Metabolismo

§  Los seres vivos son máquinas químicas §  Obtienen sus componentes y energía mediante

reacciones químicas §  Al conjunto de reacciones químicas en un ser

vivo se denomina metabolismo §  La inmensa mayoría de las reacciones químicas

se producen en el interior de la célula §  Por ello es imprescindible conocer el

metabolismo celular para comprender el metabolismo general de un individuo

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 5: BIOQUÍMICA BÁSICA

Mapa metabólico en una célula

La célula tiene un intricado mapa de reacciones químicas, no obstante existen rutas comunes con un mismo destino e interconectadas con otros destinos

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 6: BIOQUÍMICA BÁSICA

Catabolismo

§  Reacciones químicas conducentes a la degradac ión de nutr ientes orgán icos (carbohidratos, aminoácidos y grasas, ricos en energía libre) en productos sencillos (CO2, H20 y NH3)

§  Son exergónicas §  Parte de la energía liberada se utiliza para: Sintetizar ATP, NADH + H+, NADPH + H+ , y

FADH2

Mantener la direccionalidad de las reacciones

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 7: BIOQUÍMICA BÁSICA

Anabolismo §  Reacciones químicas conducentes a la síntesis

de macromoléculas (polisacáridos, proteínas, ácidos nucleicos) a partir de moléculas precursoras sencil las (monosacáridos, aminoácidos, nucleótidos )

§  Son endergónicas §  Requieren del suministro de energía como

ATP y NADPH + H+

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 8: BIOQUÍMICA BÁSICA

Nutrientes que contienen energía libre: Carbohidratos

Grasas Proteínas

Catabolismo

Productos finales carentes de

Energía: CO2 H2O NH3

Energía química

Proteínas Polisacáridos Ácidos Nucleicos Lípidos

Moléculas Precursoras:

Aminoácidos Azúcares

Bases Nitrogenadas

Anabolismo

El ATP vincula el catabolismo con el anabolismo

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 9: BIOQUÍMICA BÁSICA

Enzima 1 Enzima 2 Enzima 3 Enzima 4 Enzima 5

Rutas metabólicas y metabolitos

§  Serie de reacciones químicas consecutivas que transforman unas moléculas en otras conducentes a un producto final

§  Cada reacción consecutiva es catalizada por una enzima diferente

§  El producto de la acción de una enzima es el sustrato para la acción de la siguiente enzima

§  Las rutas metabólicas pueden ser catabólicas o anabólicas §  Intermediarios metabólicos (metabolitos): los productos B, C, D

y E son metabolitos

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 10: BIOQUÍMICA BÁSICA

Catabolismo convergente:

Anabolismo divergente:

Ruta cíclica

Las rutas catabólicas son convergentes Las rutas anabólicas son divergentes

Intermediario común

Ciclo del ácido cítrico (ciclo de Krebs)

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 11: BIOQUÍMICA BÁSICA

Metabolito anfibólico §  Pueden ser utilizados tanto para la síntesis

(anabolismo) como para la degradación (catabolismo) §  Por ejemplo, el acetato es consumido en la ruta cíclica

del ácido cítrico, y sirve como precursor en la síntesis de lípidos

§  Varios de los intermediarios del ciclo del ácido cítrico (Ciclo de Krebs) también cumplen una función dual, participan tanto en reacciones catabólicas como en reacciones anabólicas

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 12: BIOQUÍMICA BÁSICA

Homeostasis y la regulación del metabolismo

§  Los organismos vivos no se encuentran en equilibrio con el ambiente

§  No obstante, se encuentran en estado estacionario, dinámico porque mantienen una concentración constante de sus componentes, a expensas del intercambio de nutrientes y energía con el ambiente, y eliminación de productos de desecho

§  Cuando el estado estacionario se perturba por algún cambio circunstancial interno o en el ambiente, el flujo de metabolitos a través de las rutas metabólicas se altera (cambio de velocidad) y dispara mecanismos regulatorios, intrínsecos a cada ruta, con el efecto neto de regresar el organismo a su estado estacionario (homeostasis)

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 13: BIOQUÍMICA BÁSICA

Reacción limitada por la actividad de la enzima

Reacción limitada por el sustrato

La regulación del flujo de una ruta metabólica se establece en los pasos en el cuales las reacciones están limitadas por la actividad de la enzima (enzimas regulatorias o alostéricas P.e. la reacciones B →C; E →F, H →I, la concentración del sustrato no está en equilibrio con el producto porque la reacción es demasiado lenta (limitada por la actividad de la enzima), por lo que el sustrato se acumula (B, E, H); son mayoritariamente exergónicas e irreversibles; la única manera de aumentar la velocidad de flujo es aumentando la actividad de la enzima (regulación alostérica) que puede ser intrínseca a la ruta o estar bajo el control por hormonas

Las reacciones restantes (A→B, C→D y D→E, F→G→H) están limitadas por el sustrato; son catalizadas por enzimas no regulatorias muy activas (flechas azules) tan pronto reciben el sustrato lo conv ierten en producto; la concentración del sustrato y del producto son próximas a las que existen en el equilibrio (reversibles)

Toda ruta metabólica posee por lo menos una reacción limitante de flujo que determina el flujo de la vía y que, de a cuerdo a él, se adecúan las velocidades de las otras reacciones de la ruta

Regulación del flujo de una ruta metabólica

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 14: BIOQUÍMICA BÁSICA

CATABOLISMO

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 15: BIOQUÍMICA BÁSICA

RESPIRACIÓN CELULAR

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 16: BIOQUÍMICA BÁSICA

La respiración celular §  Se refiere a los procesos catabólicos que

ocurren dentro de la célula, que convierten la energía química de los nutrientes orgánicos en otra forma de energía química, conocida como ATP

§  El ATP es la moneda energética requerida por la célula para realizar trabajo celular

§  Puede ocurrir en presencia de oxígeno (respirac ión aeróbica) o en ausencia (respiración anaeróbica)

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 17: BIOQUÍMICA BÁSICA

Respiración aeróbica

§  La mayoría de las células procariotas, y eucariotas realizan la respiración aeróbica

§  Es una forma de respiración celular que requiere oxigeno molecular (O2)

§  Es un proceso redox exergónico en el que los nutrientes orgánicos se oxidan en presencia de O2, a CO2 y H20 y la energía liberada se utiliza para la síntesis de ATP

§  La mayoría de las células emplea la respiración celular aeróbica para obtener energía a partir de la glucosa

§  La glucosa entra a la célu la a través de transportadores específicos localizados en la membrana plasmática

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 18: BIOQUÍMICA BÁSICA

Glucosa (C6H1206) + 6 O2 →6 CO2 +6H20 +Energía (38 ATP)

ΔG´o = -2840 kJ/mol = el 40% de la energía es

aprovechada por las células para sintetizar 38 ATP

§ El CO2 se produce por la eliminación de átomos de hidrógeno de la glucosa § El agua se forma cuando el oxigeno acepta los átomos de hidrógeno § Dado que la transferencia de átomos de hidrógeno es equivalente a la transferencia de electrones, se trata de una reacción redox donde la glucosa se oxida y el oxígeno se reduce

Oxidación

Reducción

Reacción global de la respiración aeróbica PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 19: BIOQUÍMICA BÁSICA

En las células la oxidación de la glucosa no es una combustión simple

§  Esta reacción en la células no ocurre en un solo paso porque de ser así la energía se liberaría solo como calor, el cual no puede ser aprovechado por la célula

§  La respiración aeróbica se efectúa a través de una serie de reacciones redox consecutivas en las cuales los átomos de hidrógeno de la glucosa son transferidos al oxígeno (vía coenzimas reducidas, NADH + H+ y FADH2 ) en una serie de pasos

§  Durante estos pasos la energía se libera en pequeñas

fracciones que es utilizada para la síntesis de ATP a partir de ADP + Pi; este proceso está bajo el control de enzimas específicas

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 20: BIOQUÍMICA BÁSICA

Cadena respiratoria

El catabolismo de la glucosa

Fosforilación oxidativa

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 21: BIOQUÍMICA BÁSICA

¿En cuál (es) lugar (es) de la célula ocurre la respiración aeróbica

§  Procariotas: en el citoplasma y la membrana plasmática

§  Eucariotas: en el citoplasma y la mitocondria

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 22: BIOQUÍMICA BÁSICA

Distintos estructuras de la mitocondria participan en la respiración aeróbica

Cresta ADN

Matriz mitocondrial Ribosomas

Membrana externa

Membrana interna mitocondrial

Espacio intermembrana

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 23: BIOQUÍMICA BÁSICA

Fosforilación oxidativa Cadena respiratoria

El catabolismo de la glucosa PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 24: BIOQUÍMICA BÁSICA

Las cuatro fases consecutivas de la respiración aeróbica

Fase Ubicación Condición I. Glucosa → Piruvato (Glicolisis)

Citoplasma

Anaeróbica

II. Piruvato→ AcetilCoA

Matriz

Mitocondrial

Anaeróbica

III. Oxidación del AcetilCoA por las enzimas del Ciclo del ácido cítrico

Matriz

Mitocondrial

Anaeróbica

IV. Transporte de electrones (NADH + H+

y FADH2) al oxígeno por la cadena respiratoria acoplado a la síntesis de ATP, a partir de ADP + Pi por la ATP sintasa (fosforilación oxidativa)

Membrana interna

mitocondrial

Aeróbica

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 25: BIOQUÍMICA BÁSICA

FASE 1: LA GLICOLÍSIS

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 26: BIOQUÍMICA BÁSICA

La glicólisis es una ruta catabólica que consiste de diez reacciones consecutivas

Estas reacciones se pueden dividir en dos fases: § Fase I: preparatoria o de inversión de energía (las reacciones desde la 1 al 5)

§ Fase II: ganancia de energía (las reacciones desde la 6 a la 10)

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 27: BIOQUÍMICA BÁSICA

Fase 1: inversión de ATP para la escisión de la glucosa en dos aldotriosa-fosfato

Glucosa (6C)

2 ATP (3C)

(3C)

2 Gliceraldehído 3-P (G3P) + 2 ADP

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 28: BIOQUÍMICA BÁSICA

1: Fosforilación

2: Isomerización

3: Fosforilación

4: Clivaje aldol

5: Isomerización

Reacciones de la Fase I de la glicólisis: inversión de ATP y clivaje de la glucosa

6C

3C 3C

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 29: BIOQUÍMICA BÁSICA

Fase II. Ganancia de energía Conversión del G3P en piruvato

2 G3P 2 Piruvato 4 ATP 2 NADH + 2H+

4 ADP +4Pi

2 NAD+

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 30: BIOQUÍMICA BÁSICA

Reacciones de la Fase II de la glicólisis

2 X

6

7

8

9

10

Reacción 6: oxidación- deshidrogenación del G3P Reacción 7: fosforilación a nivel de l sustrato Reacción 8: isomerización Reacción 9:deshidratación

Reacción 10: fosforilación a nivel del sustrato

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 31: BIOQUÍMICA BÁSICA

Reacción 6: oxidación-deshidrogenación del G3P

El grupo aldehído es deshidrogenado a un grupo carboxilo que contiene en enlace anhidrido a un grupo fosfato (acil-fosfato)

El 1,3 bifosfoglicerato, es un compuesto fosfato de alta energía (∆G´o hidrólisis del grupo acil fosfato = - 49 kJoules/mol)

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 32: BIOQUÍMICA BÁSICA

Fosforilación a nivel sustrato (reacción 7)

§  La formación de ATP por transferencia de un grupo fosforil al ADP a partir de un sustrato, el 1,3 bifosfoglicerato se conoce como fosforilación a nivel del sustrato

§  Fosforilación es sinónimo de síntesis de ATP a partir de ADP +Pi; es endergónica ( ∆G´o = +30 kJoules/mol)

§  Las fosforilaciones a nivel del sustrato requieren de enzimas solubles y de intermediarios químicos (metabolitos) (En este caso el 1,3BPG)

(1,3 BPG)

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 33: BIOQUÍMICA BÁSICA

Fosforilación a nivel sustrato (reacción 10)

§  En este paso ocurre la segunda reacción de fosforilación a nivel del sustrato

§  La energía para sintetizar el ATP proviene de la hidrólisis del grupo fosfato unido al C2 del fosfoenolpiruvato (∆G´o = - 62 kJoules/mol), un compuesto fosfato de alta energía

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 34: BIOQUÍMICA BÁSICA

Sumatoria de las reacciones de la glicólisis Paso de la reacción ΔG´o

kJ/mol Fase I: 1. Glucosa + ATP → Glucosa-6-fosfato +ADP -16.7 2. Glucosa-6-fosfato ↔ Fructosa-6-fosfato 1,7 3. Fructosa-6-fosfato + ATP → Fructosa-1,6- bifosfato + ADP -14,2 4. Fructosa-1,6- bifosfato ↔ dihidroxiacetona-fosfato + gliceraldehído-3- fosfato

23,8

5. Dihidroxiacetona-fosfato ↔ gliceraldehído-3-fosfato 7,5

  (I)   Glc + 2 ATP → 2 gliceraldehído-fosfato + 2 ADP + 2,1  Fase II:   6. (2) Gliceraldehído-3-fosfato + (2) NAD++ (2) Pi ↔ (2 ) 1,3-bifosfoglicerato + ( 2) NADH + (2) H+

12,6

7. (2) 1,3-bifosfoglicerato + (2) ADP ↔ (2) 3-bifosfoglicerato + (2)ATP -37,6 8. (2) 3-bifosfoglicerato ↔ (2) 2-fosfoglicerato 8,8 9. ( 2) 2-fosfoglicerato ↔ (2) fosfoenolpiruvato + (2) H20 15 10. (2) Fosfoenolpiruvato + (2) ADP → (2) piruvato + (2)ATP -62,8

  ( II) 2 gliceraldehído-fosfato + 4 ADP + 2Pi + 2 NAD+ → 2 piruvato + 4 ATP + 2NADH + 2H+

  -64

Reacción global (III): (I )+ (II) ∑ΔG´o = -62 Glc + 2 NAD++ 2 ADP + 2Pi → 2 piruvato + 2 ATP + 2 NADH + 2 H+ + 2 H20

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 35: BIOQUÍMICA BÁSICA

La reacción global de la glicólisis Fase I. Inversión de energía o fase preparatoria

C6H1206 + 2 ATP → 2 G3P + 2 ADP Fase II. Rendimiento energético: 2 G3P + 4 ADP + 2 Pi + 2NAD+ → 2 Piruvato + 4 ATP + + 2 NADH + 2H+ + 2H20

Reacción global ( I + II): C6H1206 + 2 ADP + 2 Pi + 2 NAD+ → 2 Piruvato + 2 ATP + + 2 NADH + 2 H+ + 2 H20

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 36: BIOQUÍMICA BÁSICA

El piruvato (C3H3O3)

§  En la glicolisis se producen dos moléculas de piruvato:

Glucosa (C6H12O6) 2 piruvato (C6H6O6) §  La conversión de glucosa a piruvato libera ~5% de la

energía química potencial de la molécula de glucosa; parte de la energía de la oxidación se conserva como 2ATP y 2 NADH+2H+; el resto de la energía original está presente en los 2 piruvatos

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 37: BIOQUÍMICA BÁSICA

DESTINO DEL PIRUVATO

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 38: BIOQUÍMICA BÁSICA

DEPENDE DE LA RUTA UTILIZADA PARA REOXIDAR EL

NADH

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 39: BIOQUÍMICA BÁSICA

¿Por qué se debe reoxidar el NADH a NAD+? §  Para que la glicolisis se pueda repetir es necesario reoxidar el

NADH citosólico a NAD+

§  El citoplasma tienen cantidades limitadas de NAD+

§  Existen dos formas de reoxidar el NADH citosólico: Respiración anaeróbica Respiración aeróbica §  La respiración aeróbica requiere de una membrana plasmatica

(bacterias) o de una mitocondria (eucariotas) y de la presencia de oxígeno

§  La membrana interna mitocondrial es impermeable al NADH citosólico, por lo que es reoxidado a nivel de la membrana interna mitocondrial (sistema de lanzaderas)

§  La matriz mitocondrial también tiene una cantidad limitada de NAD+

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 40: BIOQUÍMICA BÁSICA

Glucosa

2 Piruvato + 2 NADH + H+

2 Acetil-CoA

6C02 +6H20 + 36 o 38 ATP

2 NAD+ + 2 Etanol + CO2 2 Lactato + 2 NAD+

Glicólisis

Respiración anaeróbica Respiración anaeróbica

6 O2

Respiración aeróbica

Fermentación láctica Contracción muscular vigorosa; glóbulos rojos; otras células; algunos microorganismos

Fermentación alcohólica Levadura

En muchas bacterias, plantas y animales

NAD+

NAD+ ←NADH FAD ←FADH2

Reutilización del NAD+ Reutilización del NAD+

2 ATP

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 41: BIOQUÍMICA BÁSICA

FASE II. OXIDACIÓN DEL PRIUVATO A ACETIL-COA

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 42: BIOQUÍMICA BÁSICA

OXIDACIÓN DEL PIRUVATO

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 43: BIOQUÍMICA BÁSICA

El piruvato es transportado hacia la mitocondria, y liberado dentro de la matriz mitocondrial

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 44: BIOQUÍMICA BÁSICA

Oxidación del piruvato

Reacción global: 2 Piruvato + 2NAD++2CoASH →2Acetil-CoA + 2NADH + 2 H+ + 2 CO2 2 Piruvato (C6H6O6) 2 Acetil-CoA (C2H3O x 2 = C4H6O2)

Descarboxilación oxidativa 3C 2C

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 45: BIOQUÍMICA BÁSICA

FASE III. OXIDACIÓN DEL ACETIL-COA POR LAS ENZIMAS EL CICLO

DEL ÁCIDO CÍTRICO

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 46: BIOQUÍMICA BÁSICA

§  Se efectúa la oxidación de los dos acetil-CoA §  En cada vuelta del ciclo se oxida un acetil-CoA y se

liberan 2 CO2

§  En dos vueltas se oxidan los dos Acetil-CoA, por lo se liberan 4 C02, en este punto se ha oxidado totalmente la glucosa

§  La energía de la oxidación se conserva como: Por Acetil-CoA: 2 Acetil-CoA: 3 NADH+ 3H+ x 2 = 6 NADH + 6 H+

1 FADH2 x 2 = 2 FADH2 1 ATP x 2 = 2ATP §  Se regenera el oxalacetato, el iniciador del ciclo

Resumen del ciclo de Krebs PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 47: BIOQUÍMICA BÁSICA

Resumen del ciclo del ácido cítrico

Oxalacetato

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 48: BIOQUÍMICA BÁSICA

El ciclo del ácido cítrico

§  También se conoce como ciclo de Krebs o ciclo de los

ácidos tricarboxílicos (TCA) §  Ocurre en ausencia de oxígeno §  Consta de ocho reacciones consecutivas §  Cada reacción es catalizada por una enzima

específica §  Todas las enzimas -excepto una- se encuentran en

la matriz mitocondrial: La succinato deshidrogenasa es una proteína

parcialmente embebida en la membrana interna mitocondrial, su sitio activo (lado catalítico) se encuentra expuesto hacia la matriz mitocondrial

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 49: BIOQUÍMICA BÁSICA

Reacciones del ciclo del ácido cítrico PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 50: BIOQUÍMICA BÁSICA

La primera reacción del ciclo del ácido cítrico

2C 4C 6C

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 51: BIOQUÍMICA BÁSICA

Fases de la respiración aeróbica

Productos

I. Glicólisis 2 Piruvato 2 NADH + 2 H+ 2 ATP citosol

II. Oxidación del piruvato (dos por glucosa)

2 Acetil-CoA 2 NADH + 2H+

2 CO2 matriz mitocondrial

III. Oxidación del Acetil-CoA en el ciclo del ácido cítrico (dos por glucosa)

4CO2 6 NADH + 6 H+ 2 FADH2 2 ATP matriz mitocondrial

Conservación de la energía en la respiración aeróbica

Las coenzimas (10 NADH + H+ y 2 FADH2) contienen la mayor parte de la energía libre que tenía la molécula de

glucosa

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 52: BIOQUÍMICA BÁSICA

¿CUÁL ES EL DESTINO DE LAS COENZIMAS NADH Y FADH2 ?

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 53: BIOQUÍMICA BÁSICA

Los NADH Y FADH2, deben ser oxidados de nuevo

Para ello, tienen que ceder sus electrones a otras moléculas

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 54: BIOQUÍMICA BÁSICA

Fosforilación oxidativa Cadena respiratoria

El catabolismo de la glucosa PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 55: BIOQUÍMICA BÁSICA

§  Las coenzimas reducidas donan sus electrones a la cadena respiratoria en la membrana interna mitocondrial, la cual transporta los electrones hasta el oxígeno que se reduce a agua

§  La transferencia de electrones esta acoplada a la síntesis de ATP (fosforilación oxidativa)

Fase IV. Transporte de electrones y fosforilación oxidativa

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 56: BIOQUÍMICA BÁSICA

La cadena respiratoria §  También se conoce como cadena transportadora de electrones

(CTE)

§  Consiste de un conjunto transportadores de electrones situados en la membrana interna de la mitocondria en células eucariotas; en bacterias aeróbicas se localiza en la membrana plasmática

§  Una unidad de respiración mitocondrial consiste de una CTE y una ATP sintasa, la enzima responsable de la síntesis del ATP

§  La función de la unidad de respiración es sintetizar ATP a expensas de la transferencia de energía aportada por las coenzimas reducidas

§  La CTE está formada por cuatro complejos enzimáticos (I, II, III y IV), el citocromo c y la ubiquinona o coenzima Q

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 57: BIOQUÍMICA BÁSICA

Complejos enzimáticas I, II, III y IV §  Las proteínas de los complejos I, III, y IV son proteínas

integrales de la MIM §  Las proteínas del complejo II están parcialmente embebidas

del lado interno de la membrana MIM §  Subunidades proteínicas específicas de los complejos

enzimáticos contienen los grupos prostéticos (uno o más) responsables de las reacciones redox en los complejos enzimáticos, tales como: FAD, centros de Fe-S, el FMN, el ión cobre

§  En caso de varios grupos prostéticos en un mismo complejo enzimático la transferencia de electrones se efectúa secuencialmente; posteriormente son transferidos al próximo componente de la cadena respiratoria

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 58: BIOQUÍMICA BÁSICA

NADH+H+ NAD+

Espacio intermembrana

Matriz mitocondrial

FADH2+H+ FAD 2H+ + 2e-

+1/2O2 →H20

La cadena transportadora de electrones o cadena respiratoria en la membrana interna mitocondrial

Q y Cit c son los componentes móviles de la cadena respiratoria

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 59: BIOQUÍMICA BÁSICA

NADH+H+ NAD+

Espacio intermembrana

Matriz mitocondrial

FADH2+H+ FAD 2H+ + 2e-

+1/2O2 →H20

Q y Cit c son los componentes móviles de la cadena respiratoria

FMN → Fe-S Fe-S

Cit b→ FeS → cit c1 aa

aa3

Cu2A

Cu2+B

Transferencia de electrones mediante reacciones redox en los grupos prostéticos de los componentes de la cadena

respiratoria

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 60: BIOQUÍMICA BÁSICA

Reacciones redox en el complejo I PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 61: BIOQUÍMICA BÁSICA

La ubiquinona o coenzima Q

§  Es una benzoquinona

§  Es un lípido soluble con una larga cadena isoprenoide

§  Cataliza reacciones redox

del tipo: AH2 + Q → A + QH2 §  Es una molécula pequeña que

se mueve con relativa facilidad en la MIM de un componente a otro

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 62: BIOQUÍMICA BÁSICA

Secuencia de la transferencia de electrones en la cadena respiratoria

Complejo I

Complejo II

Complejo III

Complejo IV

NADH deshidrogenasa: acepta un par de protones y dos electrones del NADH + H+ y los transfiere a la coenzima Q

Succinato deshidrogenasa (ciclo del ácido cítrico): acepta un par de protones y dos electrones del FADH2 y los transfiere a la Coenzima Q

Oxidoreductasa (citocromo b-C1): cataliza el paso secuencial de electrones procedentes de QH2 (ubiquinol) al citocromo b, citocromo c1 y luego al citrocromo C

Citocromo oxidasa: formado por los citocromos a y a3; recogen un par de electrones del citocromo C y los ceden a un átomo de oxígeno que junto con dos H+

de la Matriz forma agua

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 63: BIOQUÍMICA BÁSICA

NADH+H+ NAD+

Espacio intermembrana

Matriz mitocondrial

FADH2+H+ FAD 2H+ + 2e-

+1/2O2 →H20

FMN → Fe-S Fe-S

Cit b→ FeS → cit c1 aa

aa3

Cu2A

Cu2+B

Transporte de electrones en la CTE

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 64: BIOQUÍMICA BÁSICA

Los citocromos §  La mayoría son proteínas integrales de la membrana interna

mitocondrial §  Contienen un grupo hemo que consiste de un anillo de

porfirina que contiene un átomo de Fe2+ central coordinado a cuatro átomos de nitrógeno

§  El átomo de hierro participa en reacciones de oxido reducción del tipo F2+ → Fe3+

§  Existen varios tipos de citocromos según la clase de grupo hemo que presenten (b, c, c1, , a , a3)

§  Los grupos hemos varían en estructura y tipo de grupos químicos unidos al anillo de porfirina, están unidos fuertemente a la proteína (grupos prostéticos)

§  El citocromo c es una proteína globular que se encuentra en el lado externo de la membrana interna mitocondrial; contiene el grupo hemo c unido covalentemente a la proteína; es la única proteína móvil de la cadena respiratoria

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 65: BIOQUÍMICA BÁSICA

Estructura del grupo hemo de los citocromos

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 66: BIOQUÍMICA BÁSICA

Flujo de electrones en la cadena respiratoria

§  La transferencia de electrones en la cadena respiratoria requiere que todos componentes de la cadena transportadora de electrones se encuentren en estado oxidado

§  Las coenzimas transportadoras de electrones NAD+ y FAD deben estar en estado reducido, como: NADH + H+ y FADH2, respectivamente

§  El orden de transferencia de electrones esta determinado por el potencial de oxido de reducción

(Eo) de todos los componentes de la cadena respiratoria que participan en la reacción redox

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 67: BIOQUÍMICA BÁSICA

Flujo de electrones en la CTE

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 68: BIOQUÍMICA BÁSICA

¿Porqué el NADH y el FADH2, no ceden "directamente" sus electrones al oxígeno y utilizan tantos "intermediarios" ? § Porque la reducción directa del oxígeno a agua puede ser explosiva § La CTE permite que la energía aportada por el NADH se libere gradualmente, de forma controlada, que se aprovecha para sintetizar ATP

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 69: BIOQUÍMICA BÁSICA

Inhibidores de la cadena respiratoria

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 70: BIOQUÍMICA BÁSICA

La FOSFORILACIÓN OXIDATIVA

(QUIMIÓSMOSIS)

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 71: BIOQUÍMICA BÁSICA

La Fosforilación oxidativa (FO) se

refiere a la síntesis de ATP acoplada al transporte de electrones en la CTE

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 72: BIOQUÍMICA BÁSICA

La hipotésis quimiosmótica de Mitchell §  Peter Denis Mitchell (1920-1992), Bioquímico Inglés fue

galardonado con el Premio Nobel de Química en el año 1978

§  Peter Mitchell propuso la "hipótesis quimiosmótica" en 1961

§  La teoría sugiere que la mayor parte de la energía necesaria para sintetizar ATP en la respiración celular, proviene de un gradiente electroquímico existente entre la membrana interna y el espacio intermembrana de la mitocondria

§  El gradiente electroquímico se forma por la transferencia de los electrones desde el NADH y el (FADH2) al oxígeno molecular en la cadena respiratoria

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 73: BIOQUÍMICA BÁSICA

Modelo quimiosmótico de Mitchel: mecanismo de la FO

ATPsintasa

4 H+ 4 H+ 2H+

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 74: BIOQUÍMICA BÁSICA

La ATP sintasa: Matriz Mitocondrial

Membrana interna mitocondrial

Espacio intermembrana

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 75: BIOQUÍMICA BÁSICA

Número de moléculas de ATP sintetizadas a partir del NADH + H+ y el FADH2 por la ATP

sintasa El retorno de cuatro (4) H+ desde el espacio intermembrana hacia la matriz mitocondrial, a través de Fo de la ATP sintasa permite la síntesis de un ATP:

4H+ + ADP + Pi → ATP

NADH + H+ = 3 ATP (10 H+ bombeados por la CTE) FADH 2 = 2 ATP (6 H+ bombeados por la CTE)

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 76: BIOQUÍMICA BÁSICA

Etapa respiración celular

Productos

Cantidad total de ATP

producidos

Glicólisis 2 NADH + H+ 2 ATP citosol

4 ó 6* 2

Oxidación del piruvato (dos por glucosa)

2 NADH + 2H+

matriz mitocondrial 6

Ciclo del ácido cítrico (dos Acetil-CoA por glucosa)

6 NADH + 6 H+ 2 FADH2 2 ATP matriz mitocondrial

18 4 2

Rendimiento total por molécula de glucosa oxidada 36-38 ATP

Rendimiento energético de la respiración celular

*Depende del tipo de lanzadera del NADH citosólico a la MIM Eficiencia: el 40% de la energía libre de la oxidación de la glucosa se conserva en los 36-38 ATP sintetizados

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 77: BIOQUÍMICA BÁSICA

Resumen de la respiración aeróbica PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 78: BIOQUÍMICA BÁSICA

La cadena respiratoria

Animación: http://dl.dropbox.com/u/46910322/METABOLISMO/CADENA_transp.swf

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 79: BIOQUÍMICA BÁSICA

METABOLISMO CENTRAL

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 80: BIOQUÍMICA BÁSICA

Proteínas Polisacáridos Lípidos Catabolismo de Combustibles orgánicos

Aminoácidos Glucosa Glicerol Ácidos Grasos

Digestión

Piruvato

Acetil CoA

Ciclo de

Krebs

Productos comunes de degradación

NH3 H2O CO2

Productos finales del catabolismo

Síntesis de ATP ATP

O2

Moneda Energética

∑NADH +2H+

∑FADH2

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 81: BIOQUÍMICA BÁSICA

Rendimiento de la oxidación de combustibles orgánicos ricos en energía libre

Tipo de nutriente orgánico ∆G´o

ATP

Glucosa + 6 O2 → 6CO2 + 6 H20

-2840

36-38

Palmítico + 23 O2 → 16CO2 + 16 H20

-9770

110

(Alanina): Piruvato + 3 O2 → 3 CO2 + 3H20 -1400? 15

PROPEDÉUTICO DE ODONTOLOGÍA, UCV

D. Stojanovic de Malpica, Ph D

Page 82: BIOQUÍMICA BÁSICA