3- automatizacion en microbiologia

Automatización en Microbiología

DR CESAR CABRERA CARRILLO

MEDICO ASISTENTE DEL SERVICIO MICROBIOLOGIA

DEPARTAMENTO PATOLOGIA CLINICA-HNERM

Automatización

en identificación

y pruebas de

sensibilidad

Ventajas de los sistemas automatizados de

estudios de susceptibilidad bacteriana

Desventajas de los sistemas automatizados de

estudios de susceptibilidad bacteriana

Ssitemas automatizados para identificación y

estudio de susceptibilidad bacteriana

• MicroScan Walkaway (Dade)

• Sistema Vitek (BioMerieux)

• Sistema Phoenix (Becton Dickinson)

Sistema Semiautomatizados y Automatizados

en el Peru

MicroScan 1. Equipos

2. Paneles

3. Software de trabajo

4. Sistema experto

MicroScan 1. Equipos

Equipos de Microscan

MicroScan WalkAway 96 plus

MicroScan WalkAway 40 plus

Microscan AutoScan - 4

•Sistema de Lectura

automatizada de paneles

convencionales en solo 5

segundos simplificando

las prueba ID/AST y la

estandarización de

resultados

Microscan AutoScan – 4

Semiautomatizado

Incubar

MicroScan WalkAway 96 plus

Completamente automatizado

MicroScan 2. Paneles

1. Paneles Convencionales

2. Paneles Rápidos

3. Paneles Plus ESBL

4. Paneles Plus Sinergias

• VRE , MRSA

5. Paneles Plus MicroStrep

• MIC para Streptococcus

6. Paneles ID Especiales

• ID de levaduras, BGN

fastidosos, anaerobios

Paneles de MicroScan

MicroScan – Paneles Convencionales

MicroScan – Pos Combo Panel Type 33 (PC 33) (Gram positivos)

- CV (Crystal Violet)-

- MS (Micrococcus Screen)

- NIT (Nitrate)

GLYCOSIDASES

- PGR (PNP Glucoronoside)

- PGT (PNP Galactopyranoside)

- NOV (Novobiocin)

- IDX (Indoxyl Phosphatase)

- VP (Voges-Proskauer)

- OPT (Optochin)

- PHO (Phosphatase)

- BE (Bilis Esculin 40%)

- PYR (Pyrrolidomyl naphthylamide)

- ARG (Arginine)

- URE (Urea)

- MAN (Mannitol)

CARBOHIDRATOS

- LAC (Lactose)

- TRE (Trehalose)

- MNS (Mannose)

- SOR (Sorbitol)

- ARA (Arabinose)

- RBS (Ribose)

- INU (Inulin)

- RAF (Raffinose)

- NACL (Solucion Chloride 6.5%)

- BAC (Bacitracin)

- PRV (Pyruvate)

Microscan - PC 33 (Gram positivos)

MicroScan – PC 33 Antibioticos y diluciones

MicroScan – Neg Combo Panel Type 50 (NC 50) (Bacilos gram negativos)

CARBOHIDRATOS

- GLU (Glucose)

- SUC (Sucrose)

- SOR (Sorbitol)

- RAF (Raffinose)

- RHA (Rhamnose)

- ARA (Arabinose)

- INO (Inositol)

- ADO (Adonitol)

- MEL (Melbiose)

- URE (Urea)

- H2S (Hydrogen Sulfide)

- IDN (Indole)

- LYS (Lysine)

- ARG (Arginine)

- ORN (Ornithine)

-TDA (Trytophan Deaminase)

- ESC (Esculin Hydrolisis)

- VP (Voges – Proskauer)

- CIT (Citrate)-

- MAL (Malonate)

- ACE (Acetamide)

- TAR (Tartrate)

- ONPG (O NitroPhenyl Galactopyranoside)

- CET (Cetrimide)

- OF/G (Oxidation-Fermentation/Glucosa)

- OF/B (Oxidation-Fermentation/Base)

- DCB (Decarboxylation Control Base)

NC 50 – Bacilos gram negativos

MicroScan – Neg Combo Panel Type 50 Antibioticos y diluciones

MicroScan – Neg Urine Combo Panel Type 55 (NUC 55) (Uropatogenos)

MicroScan – NUC 55 Antibioticos y diluciones

MicroScan 3. Software : LABPRO

4. Sistema Experto : ALERTEX

LABPRO con ALERTEX

1 2 4 8 MIC

8

4

2

1

8

Phoenix 1. Equipos

2. Paneles

3. Software de trabajo

4. Sistema Experto

Phoenix 1. Equipos

• Sistema automatizado de identificación y sensibilidad para bacterias de importancia clínica

• Comunicación intuitiva con el aparato a través de iconos

• Capacidad de incubación de 100 paneles

• Nuevo sistema de inoculación

• Control y calibración interna

Equipo PHOENIX

Phoenix 2. Paneles

• Paneles para ID/AST Combo

o solo AST para :

• Gram negativos

• Gram positivos

• Streptococcus

• Panel de formato único

• Almacenamiento a

temperatura ambiente

• Hermetíco

• Resultados rapidos

• 80% de los resultados de

AST completado en < de

10h.

• Lectura continua cada 20

minutos

PHOENIX - Paneles

• Identificación :

• 45 substratos

•convencionales, fluorogénicos y cromogénicos, carbohidratos, fuentes de carbono, esculina

• Sin adición de reactivos

• Sin tests complementarios • 5 base de datos • Resultados a las 2, 3, 4, 6 y 12

horas

• Información de valores de

confianza, y reacciones de los

substratos

• B-Lact en la parte ID para los

paneles G+

PHOENIX - Paneles

• Sensibilidad : • 20 a 22 antibioticos por

panel • > de 3 dil por Ab • Doble diluciones

• ESBL incluido en cada

panel G- con 2 metodos

de detección

PHOENIX - Paneles

Phoenix

3. Software: EPICENTER

4. Sistema Experto: BDXpert

Vitek 2 1. Equipos

2. Tarjetas

3. Software de trabajo

4. Sistema Experto

Vitek 2 1. Equipos

Equipo Vitek 2 Compact

Vitek 2 compact 40

Vitek 2 compact 60

Vitek 2 2. Tarjetas

Vitek 2 - Tarjetas

Vitek 2 3. Software

4. Sistema Experto

As presented at the 105th General Meeting of the

American Society for Microbiology, 2005.

As presented at the 105th General Meeting of the

American Society for Microbiology, 2005.

Automatización

en hemocultivos

AUTOMATIZACION EN

HEMOCULTIVOS

•En el Perú en 1998

COSTO - BENEFICIO

•Primero en el HNERM

IMPACTO DE LA AUTOMATIZACIÓN

• El impacto de la automatización de los hemocultivos versus la

metodología convencional puede ser evaluado desde 4 puntos de vista:

clínico, microbiológico, epidemiológico y económico.

IMPACTO CLÍNICO: La implementación de sistemas

automatizados de hemocultivos con monitoreo sensibles y continuos y

con agitación constante han llevado a un aumento de la velocidad de

detección, con una disminución del tiempo de respuesta y a un

aumento de la sensibilidad de los hemocultivos. Esto permite mejorar

la capacidad diagnóstica en bacteriemias y un uso más racional de la

terapia antimicrobiana.

IMPACTO MICROBIOLÓGICO: Ha sido principalmente una

disminución de la carga de trabajo con posibilidades de procesar

grandes volúmenes de muestras, una disminución de la contaminación

cruzada por técnicas de detección no invasivas y un aumento del

espectro de microorganismos que se detectan por estos sistemas.

IMPACTO EPIDEMIOLÓGICO: El soporte computacional que

poseen estos sistemas permiten obtener listados de positividad por

pacientes, por muestra, por microorganismo, conocer el rendimiento

(% de positividad) y la contaminación de los hemocultivos. Estos datos

se pueden evaluar por servicio, por tipo de muestra, diarios, semanales,

mensuales y/o anuales, lo que constituyen gran aporte en el control de

las bacteriemias intrahospitalarias.

• IMPACTO ECONÓMICO

A nivel del laboratorio: aumento del costo por botella (2 a 4 veces el costo de la convencional), disminución de las horas/hombre, disminución de los costos del material de resiembra, disminución del riesgo de cortopunzantes en el operador. Esto conduce a una disminución del costo global de los hemocultivos negativos siempre y cuando no se considere el costo del equipo.

A nivel del hospital: podría conducir a una disminución de los días de uso de antibióticos de amplio espectro (más caros y con mayor toxicidad) y podría significar también una disminución de los días/cama; sin embargo casi no existen publicaciones que avalen estos impactos.

Tres de tales sistemas: El BacT/Alert; el BACTEC

9240/9120 y el TREK tienen un uso muy extendido. El

sistema de cultivo de sangre BioMeriux Vital no esta

autorizado por la FDA (en USA) sin embargo tiene

ensayos exitosos.

Sistema Bact/alert

SISTEMA BacT/Alert (OrganonTeknika)

MECANISMO DE DETECCIÓN BacT/Alert

Sistema Bactec

Analizador

Sensor Señal fluorescente

Detector

BACTEC 9000 SYSTEMS

BACTEC 9000 SYSTEMS

• Permite una detección

más temprana y rápida

• Viales con resinas para

neutralización de

antibióticos

Lectura cada 10 minutos

Precocidad en el

diagnóstico del paciente

Aumenta rendimiento

BACTEC 9000 SYSTEMS Resinas

• Dos tipos de Resinas :

– Resinas de intercambio catiónico: Se unen

iónicamente a los antimicrobianos cargados

positivamente como los aminoglucósidos.

– Resinas absorbentes poliméricas (Hidrofóbicas):

Se unen a las porciones hidrofóbicas de

prácticamente cualquier antimicrobiano.

resinas

Sistema Trek

SISTEMA TREK

Antes Sistema ESP(Extra sensing Power)

• Este difiere de los 2 anteriores debido a :

1) La producción de CO2 es monitoreada por manometria.

2) Tanto la producción como el consumo de gas son monitoreados.

3) Cambios en la [ ] de H2 y O2 son detectados además del de

CO2 (Principal ventaja porque las lecturas se hacen 1 a 8

horas antes que aquellos sistemas que solo detectan CO2 –

Ayuda en organismos asacaroliticos que no produzcan suficiente

CO2)

• La unidad también actúa como auto contenido, agitador y detector.

• Presenta capacidad para 128 o 384 frascos.

Tinción de gram con resinas (BACTEC)

Tinción de gram con carbon (BACT/ALERT)

Diferencias BACTEC vs BACT/ALERT

Botellas de BACTEC

Botellas de VERSATREK

La botella tiene

una sola

etiqueta de

código de barra

Diferencias BACTEC vs VERSATREK

Comparison of the VersaTrek blood culture system against the Bactec 9240 system in

patients with suspected bloodstream infections.

Annal of clinical Microbiology and Antimicrobial 2011, 10;4

Diferencias BACTEC vs VERSATREK

Comparison of the VersaTrek blood culture system against the Bactec 9240 system in patients with

suspected bloodstream infections.

Annal of clinical Microbiology and Antimicrobial 2011, 10;4

Brucella?

Haemophilus?

Diferencias BACTEC vs VERSATREK

Automatización

en tuberculosis

Bactec MGIT 960

fluorometrico

MGIT Bactec 460

radiometrico

COMPARACION

Bactec MGIT 960

fluorometrico

Tiempo hasta que el cultivo de positivo

-

0

50

100

0 10 20 30 40 50 60

Dias

% P

os

itiv

o

MODS

MBBacT

LJ

7 13 26 7 13 26

Moore DAJ et al, NEJM 2006; 355 (15): 1539 - 50

-

MODS - características diagnósticas

MODS MBBacT LJ

Sensibilidad - cultivo 98% 89% 84%

Especifidad - cultivo 99.6% 99.9% 100%

Características - PS (sens, espec, VPP & VPN)

Equivalente

Costo Diagnostico + PS (USD)

2 50 9

GRACIAS