automatizacion en microbiologia

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AUTOMATIZACION EN MICROBIOLOGIA

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Page 1: Automatizacion en microbiologia

AUTOMATIZACION EN MICROBIOLOGIA

AUTOMATIZACION EN MICROBIOLOGIA

Page 2: Automatizacion en microbiologia

Marco Terencio V116-27 a.C.Insectos

Vectores deenfermedades

Avicena981-1037Describe

síntomas y tratamiento de gusanos

Hipócrates 460 -377 a.C.Enfermedad no es mágicaEnfermedadalt. Fluido

Vital y miasma

Girolano Fracastoro 1478-1553

Transmisibilidadde las enfermedadesPoema sobre la sífilis

HISTORIA : MICROBIOLOGIA

ZACARIAS JANSSEN1590-1608

Construyo Sistema de Lentes compuestos

GALILEO GALILEI1564-1609

Construyo primerMicroscopio simple

ANTONY VAN LEEUWENHOEK

1632 – 1723 1676,observa yDibuja bacterias

de la saliva

Carta 39, 17 Sept. 1683

Page 3: Automatizacion en microbiologia

EDWARD JENNER 1749 – 1823

Padre de la Imunología

1798: Preparó la vacuna contra la viruela humana.Realizó inoculaciones a humanos utilizando pústulas de viruela vacuna y comprobó que esta práctica protegía frente a la viruela humana.26 de Octubre 1979 la O.M.S. da por erradicada esta enfermedad del mundo

LOUIS PASTEUR 1822 – 1895 Padre de la

Bacteriología

1856: Fermentación por levaduras1857: Fermentación láctica1861: Culmino con la teoría de Generación espontánea 1866: Pasteurización1880: Identificó agente del Cólera en la gallina. 1881: Inmuniza ovejas contra el Carbunco1885: Vacuna contra la Rabia

ROBERTO KOCH 1843 – 1910 Nóbel Fis. y Med. (1905)

Las enf. infecciosas son provocadas por microorganismos y elaboro técnicas para identificar y aislar bacterias 1876: Demuestra la etiología del Carbunco o Ántrax, Bacillus anthracis1882: “Myco. Tuberculosis”1881: Estudio esporas y diferencias de los bacilos 1881: técnicas de laboratorio: medios de cultivo sólidos 1883: descubre el Vibrión colérico en Egipto

Page 4: Automatizacion en microbiologia

JOSEPH LISTER (1827 – 1912)

1867: Las bases de la desinfección y antisepsia en cirugía, utilizando fenol y bicloruro de mercurio en en el lavado del instrumental quirúrgico, manos y heridas de pacientes

Frederich Loeffler (1852-1915)-Klebs:descubre bacilo diftéricoKarl Joseph Ebert (1835-1926): el agente causal de la fiebre tifoideaArmauer Hansen (1841-1912), LepraAlbert Neisser (1855-1916), aísla el GonococoArthur Nicolaier ,descubre el bacilo tetanicoKitasato y Yersin ,descubren el bacilo de la peste

Page 5: Automatizacion en microbiologia

Descubrimiento de la Penicilina (1929)Descubrimiento de la Penicilina (1929)

Fleming, Sir Alexander.Fleming, Sir Alexander. Observó que un moho que contaminaba una de sus placas de cultivo, había destruido la bacteria cultivada en ella,

llamado Penicillium notatun.

Descubrimiento de la Estreptomicina (1944)Schatz y Waksman: Descubren la estreptomicina. Producida por hongo Streptomyces griseus

Page 6: Automatizacion en microbiologia

HANS C. J. GRAM (1853 – 1938)

1884, Coloración GRAM

HANS C. J. GRAM (1853 – 1938)

1884, Coloración GRAM

Tyndall Tyndall (1820-1893) ,1877 Evidencia la presencia de (1820-1893) ,1877 Evidencia la presencia de formas microbianas resistentes al calor (esporas formas microbianas resistentes al calor (esporas bacterianas).bacterianas).

Schaudinn y Hoffmann 1906 ; Descubren que Treponema pallidum , causa la Sífilis

Paul Ehrlich ( 1854-1919 ) ,1910 desarrolla quimioterapéutico (Salvarsán) frente a la Sífilis

Page 7: Automatizacion en microbiologia

ROBERTO GALLO ( U.S.A. )JEAN LUC MONTANIER ( FRANCIA )

1984: Descubren el VIH

1915-1917 , Descubren los virus bacterianos “Bacteriófagos”

D’Herrelle y Twort

Schönlein (1839) : Schönlein (1839) : Describe asociación de HONGOS Describe asociación de HONGOS con con

la Tiña (infección en piel)la Tiña (infección en piel)

Page 8: Automatizacion en microbiologia

1910: Comienza la era de la Biología Molecular1979: Se sintetiza la insulina por técnicas de ADN.1982: Se desarrolla la vacuna contra la Hepatitis B.

Watson y Crick :1953 , Proponen la estructura de la doble hélice para el ADN.

1933 el primer Microscopio Electrónico de Transmisión.1980 el primer Microscopio Electrónico de Barrido

Page 9: Automatizacion en microbiologia

El dinámico desarrollo de la microbiología en el siglo XX-XXI

Descubrim

iento de A

gentes infecciosos

Era de la

Antibioticoterapia

Prevenciónvacunas

Epidem

ias

B- lactam

icos

Am

ino

glu

cosid

os

Macro

lido

sQ

uin

olo

nas

Genética

Microbiología

Bioquím

ica

Revolución del Laboratorio

Biología BásicaAc. nucleicosCódigo genéticoMecanismo de síntesis proteica

Automatización Microbiología

En ProcedimientosUso ordenadores de

gestión MicrobiologíaEn diagnostico

HibridomasAc. monoclonales

específicos

PCR

Page 10: Automatizacion en microbiologia
Page 11: Automatizacion en microbiologia

¿PORQUE LLEGAR A LA AUTOMATIZACION?

Page 12: Automatizacion en microbiologia
Page 13: Automatizacion en microbiologia

Primer Método utilizado (1966), Estandarizado 0.5 Escala Mc Farland (Turbidez-inoculo)

Page 14: Automatizacion en microbiologia

Criterios de Interpretación (R, I, y S)Los escatogramas o scatterplots

Para la interpretación de CIM y disco difusión . •Los aislamientos son analizados con los métodos estándar de difusión por disco y CIM del NCCLS. La CIM y su correspondiente diámetro de zona son delineados para cada aislamiento.

Page 15: Automatizacion en microbiologia

Panel de microdilucion en Caldo - CIM

La prueba de microdilucion en caldo - CIM se realiza en placas de poliestireno (0.1 ml) .

Una placa contiene de 7 a 8 diluciones de 12 diferentes antibióticosUna celdilla es control (+) (caldo+inoculo)Control (-) (solo caldo)

Placas para Gram negativos y Gram (+)Caldo Muller Hinton recomendableHay paneles específicos

Caldo contiene Cationes Ca ++ y Mg ++

Cada lote examinado PH después de preparado (7.2 a 7.4) y Tº 25ºc

Para neumococo suplementar 2-5% sangre caballo lisado

Colocar standares de control de calidad

Page 16: Automatizacion en microbiologia

Grupo N acilo

Anillo Tiazolidinico

Posición aminoacídica 39 42 104 164 237 238 240 265 TEM-1 Ala Glu Arg Ala Gly Glu Thr

TEM-2

TEM-3 Lys Ser

TEM-4 Lys Ser Met

TEM-5 Ser Thr Lys

TEM-6 Lys His

TEM-7 Lys Ser

TEM-8 Lys Lys Ser Ser

TEM-9 Lys Ser Met

TEM-10 Ser Lys

TEM-11 Lys His

TEM-12 Ser

TEM-13 Lys Met

TEM-14 Lys Lys Ser Met

TEM-15 Lys Ser

Posición aminoacídica69 165 244 275 276

TEM-1 Met Trp Arg Arg Asn

TEM-31 (IRT-1) Cys

TEM-30 (IRT-2) Ser

TEM-32 (IRT-3) Ile

TEM-35 (IRT-4) Leu Asp

TEM-33 (IRT-5) Leu

TEM-34 (IRT-6) Val

TEM-36 (IRT-7) Val Asp

TEM-37 (IRT-8) Ile Asp

TEM-38 (IRT-9) Val Leu

TEM-39 (IRT-10) Leu Arg Asp

TEM-40 (IRT-I67) Ile

TEM-41 Thr

TEM-45 (IRT-14) Leu Gln

Posición aminoacídica

35 179 205 238 240 SHV-1 Leu Asp Arg Gly Glu

SHV-2 Ser

SHV-2a Gly Ser

SHV-3 Leu Ser

SHV-4 Leu Ser Lys

SHV-5 Ser Lys

SHV-7 Ser Lys

SHV-8 Asn

SHV-11 Gln

SHV-12 Gln Ser

Page 17: Automatizacion en microbiologia

BLEE B- Lactamasa relacionada

País de origen En especies detectadas

TEM TEM1 Y TEM2 FRANCIA Enterobacterias

SHV SHV 1 / LEN ALEMANIA P. Aeruginosa / BGNNF

CTX-M cefotaxaminasas

KLUA Kluyvera Alemania/Argentin E. coli, Salmonella

OXA OXA 10 Turquía/Francia P- aeruginosa

PER FRANCIA P.- aeruginosa

VEB PER Vietnam/Tailandia E. Coli

TLA CME-1 MEXICO E. Coli

GES/IBC Guayana/ Sudafr. K. Pneumoniae y Pseudomona

BES Y. Enterocolitica Brasil S. marcescens

SFO AmpA S. fonticola Japon E. cloacae

Page 18: Automatizacion en microbiologia

1 Antibiótico en sangre2 Bacterias sensibles a los

antibióticos3 Bacteria no sensible a los

antibióticos4 Bacterias muertas por

antibióticos5 Bacteria sobreviviente

6 Bacteria con resistencia creciente a  antibióticos

7 Bacterias muertas por antibióticos

8 Población bacteriana con resistencia creciente al antibiótico

Page 19: Automatizacion en microbiologia

GENES DE RESISTENCIA BACTERIANA:GENES DE RESISTENCIA BACTERIANA:

1 Plásmido2 Antibiótico expulsado3 Genes de resistencia antibiótica4 Enzima que degrada al antibiotico5 Antibiótico que ingresa6 Antibiótico que ingresa7 Enzima que altera el antibiótico8 Antibiótico que ingresa9 Cromosoma

Page 20: Automatizacion en microbiologia
Page 21: Automatizacion en microbiologia

MRSA O SARM O SUPERBUGSTAFILOCOCO AUREUS RESISTENTE A LA METICILINA

MRSA O SARM O SUPERBUGSTAFILOCOCO AUREUS RESISTENTE A LA METICILINA

•E.U. 300,000 contraen infecciones en hospitalizacion /año •CDC ,número de muertes 12,000 por año•UCI ,aislamiento llega a 50% (R) a Meticilina, Penicilina, Tetraciclina y Eritromicina

•Factores de riesgo: prolongada hospitalización, uso múltiple de antibióticos previos,etc.•En la comunidad niños ,ancianos y portadores enf. crónicas•Endémico en Hospitales ,Neumonía ,Infecc. qx, bacteriemias.

En el Perú : UCI ,Unidad de Quemados, Oncologia y Cirugía, Resistencia del 58% (500 cepas aisladas-1995)En la actualidad brotes epidémico relacionado a la colonizaciónDel personal de salud (MINSA)

Page 22: Automatizacion en microbiologia

VISA – Resistencia Intermedia a la Vancomicina (GISA)VISA – Resistencia Intermedia a la Vancomicina (GISA)

Susceptibilidad intermedia a la Vancomicina, CIM 8-16 ug /ml y completamente Resistentes a CIM >= 32 ug /ml

VISA debido al engrosamiento de la pared celular que contiene precursores capaces de ligar Vancomicina extracelularmente.La mayoría contiene mecA ,las MIC de 4 ug /ml reportadas se consideraran VISA potenciales y se recomienda repetir pruebasDescrito 1996 en JapónEn EU. en pacientes con MRSA, que reciben Vancomicina por tiempo prolongado, en diálisis.

VRSA : STAPHYLOCOCCUS AUREUS RESISTENTE A VANCOMICINA , 2002 EN EE.UU.

Page 23: Automatizacion en microbiologia

HOSPITAL BASE VALDIVIA 2007

RESISTENCIA DEL ESTAFILOCOCO AUREUS

Page 24: Automatizacion en microbiologia

RESISTENCIA INDUCIBLE A CLINDAMICINARESISTENCIA INDUCIBLE A CLINDAMICINA

bacterias poseen gen de B- Lactamasa y se exponen un agente B-Lactàmico.Esta acción antimicrobiana en la pared celular activa mecanismo genético en cascada que inicia la producción deB-Lactamasa.

la producción cesa en ausencia de antimicrobianos en la pared

Page 25: Automatizacion en microbiologia
Page 26: Automatizacion en microbiologia
Page 27: Automatizacion en microbiologia

B-Lactamasa AmpCB-Lactamasa AmpC

Page 28: Automatizacion en microbiologia

Panorama actual Panorama actual La aparición cada vez más frecuente y diversa de los

mecanismos de resistencia microbiana, sobre todo en bacterias patógenas facultativas y oportunistas, ha traído consecuencias importantes en términos de morbilidad y mortalidad y millonarias pérdidas humanas y económicas

Resistencia incrementada en caso de staphilococcus, streptococcus y enterococcus y bacilos Gram negativos (enterobacterias y no fermentadores)

Dificultad para predecir los patrones de resistencia en pacientes críticos

El uso de la Terapia de amplio espectro de alto costo y numerosos efectos secundarios o adversos que se presentan

Page 29: Automatizacion en microbiologia

Panorama actual Panorama actual La necesidad de

entrega de resultados oportunos ,evita que la terapia inicial se prolonga innecesariamente

Mortalidad : Resultado > 72 hrs. da

como consecuencia el aumento de mortalidad

en pacientes críticos y sobrevida disminuye 30% por cada día de retardo a entrega de resultados

Page 30: Automatizacion en microbiologia
Page 31: Automatizacion en microbiologia

VIGILANCIA DE LA RESISTENCIA A LOS ANTIMICROBIANOS Perú 2007 -INS

VIGILANCIA DE LA RESISTENCIA A LOS ANTIMICROBIANOS Perú 2007 -INS

HOSPITAL Aislados E. Pediátricas ( R )

Aislados H. Unanue

(R)

ANTIBIOT.

Cefazolina

Clindamicina 28 53.6 % 46 87

Eritromicina 29 69 46 91.3

Gentamicina 27 59.3 38 81.6

Oxacilina 29 58.6 43 90.7

Vancomicina 29 0 36 0

STAPHYLOCOCCUS AUREUS

Page 32: Automatizacion en microbiologia

VIGILANCIA DE LA RESISTENCIA A LOS ANTIMICROBIANOS Perú 2007 -INS

VIGILANCIA DE LA RESISTENCIA A LOS ANTIMICROBIANOS Perú 2007 -INS

Escherichia coli-Resistencia

Hospital aislado H. Unanue aislado I.M.P aislado E. Pediátricas

AntibiotAmicacina 84 2.4 % 106 8.5 % 82 4.9 %Amox.Cl 227 63.9 83 18.1 79 55.7Cefotaxima 69 31.9 66 27.3 78 32.1Ceftriaxona 180 30.5 115 34.8 82 32.9Cefuroxima 71 23.9Ciprofloxac 74 65.4 116 30.4 45 33.3ESBL 53 98.1 31 71 82 32.9Nitrofurant 190 7.9 102 8.4 69 1.4Trimet- Sulf 220 65.9 95 80 80

TEM-1 de E. coli 1.8 A de resolución

Page 33: Automatizacion en microbiologia

ANTIMICROBIANOS Perú 2007 – INS

Pseudomonas aeruginosa

ANTIMICROBIANOS Perú 2007 – INS

Pseudomonas aeruginosa

Hospital aislado 2 de Mayo aislado H. Unanue

Antibiótico

Amicacina 72 37.5% 73 47.9%

Aztreonam 75 33.3 71 80.3%

Ciprofloxacina 73 46.6% 80 65

Gentamicina 76 46.1 72 65.3%

Imipenem 64 43.8

Meropenem 52 50%

Page 34: Automatizacion en microbiologia

ANTIMICROBIANOS Perú 2007 – INS Klebsiella pneumoniae

ANTIMICROBIANOS Perú 2007 – INS Klebsiella pneumoniae

Hospital aislado IMP aislado H. Unanue aislado S. Bernales

AntibióticoAmicacina 56 60.7% 42 11.9 31 19.4

Amp. Clav 48 22.9 75 77.3 31(A-S) 41.9 (A-S)

Aztreonam 36 80.6

B-lactamasa 42 95.2

Cefalotina 75 76

Cefazolina 31 93.5 31 58.1

Cefotaxima 36 77.8 31 45.2

Ceftriaxona 63 81.1 31 45.2

Cefuroxima 31 51.6

Ciprofloxacin 52 21.2 66 45.5 31 25.8

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Page 43: Automatizacion en microbiologia

Factores de riesgo de adquirir infecciones por cepas productoras de BLEE

DesnutriciónBajo peso al nacer

Gravedad de la infección Duración de la estadía en el hospital y en UCIProcedimientos invasivos

Receptores oncológicos

Page 44: Automatizacion en microbiologia

Reservorios y vectores

Termómetros Cánulas de oxígenoMascaras y tubos de ventiladores mecánicosJabón líquidoInsectosGel para ecografíasTrabajadores de la salud

Page 45: Automatizacion en microbiologia
Page 46: Automatizacion en microbiologia

Papel de la AutomatizaciónPapel de la Automatización Los sistemas automatizados acortan los

tiempos porque mejoran la sensibilidad analítica de los métodos

Capaces de detectar el desarrollo bacteriano en una suspensión con y sin antimicrobianos antes que el laboratorista detecte turbidez (fundamento de los sistemas automatizados)

Metodología: colorimetría – turbidimetria -fluorometria etc.

Page 47: Automatizacion en microbiologia

ventajas EspecificaciónImpacto clínico Rapidez en el resultado

de 3 a 10 horas.

Inicio o cambio precoz del antimicrobiano

costos hospitalización y análisis de laboratorio ,de usos de antibióticos

Estandarización y control de calidad

de la reproductibilidad intra e ínter laboratorio

Disminución de la carga de trabajo

Requieren manos personal en métodos del MIC

CONDICIONES SOBRE SU UTILIZACION

Page 48: Automatizacion en microbiologia

ventajas Especificación

Disminución de errores post analíticos

Evita la transcripción errónea de resultados por el uso de programas

Utilización de sistemas de expertos

Permite actualizar anualmente las guias de NCCLS que permite el informe selectivo de los antimicrobianos. Monitorizar resultados inconsistentes

Page 49: Automatizacion en microbiologia

ventajas Especificación

Patrones fenotipitos de resistencia

Permite sospechar la presencia de B lactamasas de espectro extendido y cefalosporinas

Facilita las estadísticas Almacenar y procesar información para una análisis de tendencias anuales de susceptibilidad

Facilita el control en el uso de antimicrobianos

Informe de resultados en línea con el comité farmacológico

Page 50: Automatizacion en microbiologia

desventajas EspecificacionesAlto costo (3 veces mayor

Que los manuales)

El equipamiento y los insumos (paneles o tarjetas) - “tarifas diferenciadas o “uso para hospitalización y críticos”

Requieren método de respaldo

Frente a cualquier falla se necesita un back up o metodología manual de respaldo

No existen normas NCCLS para sistemas automatizados, no aplicables a todas las bacterias

Sin embargo se deben considerar los métodos empleados (puntos de corte o MIC)

Page 51: Automatizacion en microbiologia

desventajas Especificaciones

Poca flexibilidad en los antimicrobianos ensayados

Paneles o tarjetas están determinadas por el fabricante.

Existen tarjetas especiales pero requiere consumo mínimo

Page 52: Automatizacion en microbiologia

desventajas Especificaciones

Discrepancia con métodos convencionales de referencia

Problemas:

Haemophilus Influenza Neumococos, Gram (-) no fermentadores, y Anaerobios .

Cefepime y Pseudomonas

Vancomicina (I) en el caso de Enterococcus

Imipenem ,falsa (R) o (S) con Pseudomona y Acinetobacter baumanii .

Page 53: Automatizacion en microbiologia

desventajas Especificaciones

Discrepancia con métodos convencionales de referencia

Problemas:

B lactamasa en algunos Gram negativos requieren prolongada incubación para expresar ( R )

FDA recomienda para errores mayores (sistema informe R siendo (S) ,la tasa no > 1.5% ,la concordancia sea 90% , fallas de crecimiento =< 10%

Page 54: Automatizacion en microbiologia

SISTEMAS AUTOMATIZADOSSISTEMAS AUTOMATIZADOS

Diferentes grados de automatización Métodos Calorimétricos,

Turbidimetricos , Fluorescencia Lectura a tiempos determinados Lectores muy sensibles al crecimiento

aumentan la velocidad de entrega de los resultados

Page 55: Automatizacion en microbiologia

Componentes TecnológicosComponentes Tecnológicos

Panel o tarjeta de Trabajo Software

MicrobiológicoControl de Calidad Cepas ATCCMotor de Base de DatosEstadístico y EpidemiológicoNormas de la CLSI (antes NCCLS)Comunicación (Interfaz)

Page 56: Automatizacion en microbiologia

BiomeriuxVitek

SiemensMicroScan

Becton DickinsonBD Phoenix

Page 57: Automatizacion en microbiologia

Panel o Tarjeta de Trabajo

Biomeriux

Vitek SiemensMicroScan

Becton DickinsonBD Phoenix

Page 58: Automatizacion en microbiologia

Caracteristicas de PanelesMICRO Scan

Caracteristicas de PanelesMICRO Scan

Identificación solamente

Sensibilidad solamente

(BP o MIC)

Combo (ID+ATB)

Page 59: Automatizacion en microbiologia

Tecnología del PanelTecnología del Panel Paneles Convencionales – Colorimetrica y Turbidez

– Gram Negativo / Gram Positivo Paneles Cromogénicos – Colorimetrica Enzimatica Identificación en 4 hrs

– ID de Levaduras– HNID (Haemophilus, Neisseria, Moraxella y Gardnerella)– ID de Anaerobios

Paneles Rápidos Fluorescentes - Fluorescencia– Gram Negativo– Gram Positivo

Synergies Plus Panels – Fluorescencia y Turbidez– Gram Negativo– Gram Positivo

Paneles Especializados – Turbidez– MicroStrep Plus– ESBL confirmatorio

Page 60: Automatizacion en microbiologia

Colorimetrica y Turbidez

Colorimetrica y Turbidez

Colorimetrica Enzimatica

Fluorescente Fluorescente y Turbidez

Page 61: Automatizacion en microbiologia

MIC (Concentración Mínima Inhibitoria)

Concentración del antibiótico in vitro por método cuantitativo.

4 – 5 diluciones por antibiótico

17 – 27 ATB /panel

BP (Breakpoint) Susceptibilidad in

vitro cualitativa (S, I, ó R)

Concentración de antibiótico equivalente a las reglas CLSI - breakpoints

1-2 diluciones por droga - 29-33 ATB por panel

ANTIBIOGRAMA

Page 62: Automatizacion en microbiologia

PANEL ESβL plusPANEL ESβL plus Confirmar la producción de Beta Lactamasas de Espectro

Extendido en E. coli, Klebsiella oxytoca y Klebsiella pneumoniae.

La inoculación con la técnica de turbidimetría o de prompt. Incubar 20-24 hrs. A 35 ± 1°C sin CO2 en incubadora externa.

Determinación cualitativa con lectura manual de crecimiento en pocillos como turbidez o nebulosidad en todo el pocillo.

Interpretación del resultado (disminución 3 diluciones en Caz y Caz/CA ó Cft y Cft/CA):

ESBL positivo ESBL negativo

Se ingresa al software manualmente el resultado en el apartado de ESBL para confirmar el resultado si es positivo o negativo.

ESBL panel (B1027-101)

Page 63: Automatizacion en microbiologia

PANEL MICro STREP plusPANEL MICro STREP plus Determinar la sensibilidad de antimicrobianos para estreptococos aerobios no enterococos (incluidos St.

pneumoniae). Inoculación del panel (turbidimetría con tubo 0.5 de Mc Farland).

TSA con 5% de sangre de carnero

25 ml de LHB (B1015-25)

0.5 McFarland =

0.08 ± 0.02 turbidímetro

Incubar 20-24 hrs. a 35 ± 1 °C

en una incubadora

externa.

Se ingresa al software manualmente el resultado donde el crecimiento se presenta como turbidez. Cualquier cambio de color en el medio no se considera crecimiento.

Salina (B1015-12)

4-5 colonias

100 mcl

Inoculador

2 veces

MICro STREP panel (B1027-201)

Page 64: Automatizacion en microbiologia

PANELES Synergies PlusPANELES Synergies Plus

Organismos Gram NegativosGram Positivos

Tipos de Panel Combo, MIC sólamente, ID Medio de cultivo Agar Sangre para Gram Negativos Identificación 138 Gram negativos Antibióticos 31 para Gram negativos

Tiempo de Lectura 2.5 hrs ID con base en la fluorescencia

MIC 4.5-16 hrs, Read-When-Ready 80% MIC en 6.5 hrs Método de Lectura Sistema WalkAway®

Almacenamiento Temperatura Ambiente Vida de Anaquel Un año Reactivos Ninguno

Page 65: Automatizacion en microbiologia

ANTIBIÓTICOS EN PANELES SYNERGIES PLUS

ANTIBIÓTICOS EN PANELES SYNERGIES PLUS

Antibióticos que se liberarán en cuanto estén listos

Amikacina Ampicillina Ampicillina/Sulbactam* Ceftazidima Ceftriaxona Cefuroxima Ciprofloxacina Gatifloxacina Gentamicina Imipenem Levofloxacina Meropenem Moxifloxacina Nitrofurantoina* Norfloxacina Piperacillina/Tazobactam* Piperacillina* Tobramicina Trimetoprim/Sulfametoxazol

Antibióticos de incubación convencional

Amoxicillina/Clavulanato

Aztreonam

Cefazolina

Cefepime

Cefotaxime

Cefotetan

Cefoxitin

Cefalotina

Cloramfenicol

Tetraciclina

Ticarcillina

Ticarcillina/Clavulanato

* Antibióticos de incubación convencional en algunos paneles.

Page 66: Automatizacion en microbiologia

INOCULACIÓN DE PANELESINOCULACIÓN DE PANELES

1-Desembolsar el Panel

2- Imprimir y pegar el código de barras al panel

3- Tomar la colonia 4- Un prompt para ID y sensibilidad.

5- Vaciar suspensión bacteriana al inoculador

6- Preparar una placa de pureza

7- Usar el Renok para inocular panel

8- Cargar el panel en el WA

Page 67: Automatizacion en microbiologia

Colorimetría, mide color de soluciones.Fluorometría, mide fluorescencia y luz dispersa y reemitida en varias direcciones.

Turbidimetría, mide luz no dispersa a través de una solución turbia.

Dual combinacion de dos tecnologias a la vez

Lectura

Visual sin equipo

Equipo AS-4

Equipo WA 40/96 SI

SiemensMicroScan

Page 68: Automatizacion en microbiologia
Page 69: Automatizacion en microbiologia
Page 70: Automatizacion en microbiologia

Centro de Comando LabPro

Muestra lista de códigos de barra de

nuevas ordenes del LIS

Page 71: Automatizacion en microbiologia

Paneles completados

Paneles recién cargados

Cargar Paneles

Probabilidad del organismo

Page 72: Automatizacion en microbiologia

Interpretaciones CLSIResultados suprimidos

del reporte

Texto de Alerta

ordenado por prioridadInformaciones necesárias para tomar decisiones

aparecen en la misma pantalla

Page 73: Automatizacion en microbiologia

Click + para exibir texto de instrucciones

de alertas

Page 74: Automatizacion en microbiologia

Código de colores para resultados “Fuera de Control”

Sumário y Edición de Resultados QCSumário y Edición de Resultados QC

Entrada & información acción correctiva & manutención de archivos w/QC; apoya guias del CAP

Page 75: Automatizacion en microbiologia

LabPro: EpidemiologiaLabPro: Epidemiologia

Excluir drogas no-formulário

Reporte ordenado

por organismo

Critério de aislados duplicados definidos por el usuário

Reportes de

Incidencia Bacteriana

Page 76: Automatizacion en microbiologia

Sistema – Elaborado por el usuario– Automatizado programado día y hora

Interfaz– Unidireccional y/o bidireccional– Labpro – Labpro– Labpro – Sistema del Hospital– Labpro - Whonet

Control de Calidad MicroScan Nacional : MINSA – INS

Internacional m: NCCLS - USA

Page 77: Automatizacion en microbiologia

Streptococcus pneumoniae Resistente a Penicilina: Evaluación CuantitativoStreptococcus pneumoniae Resistente a Penicilina: Evaluación Cuantitativo

2,0 g/ml

RR

<0,12 g/ml

SS II

0,12 - 1,0 g/ml

Hansman & Bullen, 1967, en Australia.

Appelbaum et al., 1977; Jacobs et al., 1978; Koornhof et al., 1978, en África del Sur. CIM2,0 mg/ml de penicilina

Resistencia se incrementa a nivel mundial, España, Africa del Sur, Sudeste Asiático y Estados Unidos

Page 78: Automatizacion en microbiologia

VRE – Enterococo Resistente a VancomicinaVRE – Enterococo Resistente a Vancomicina

Resistencia intrínsecaResistencia a las Cefalosporinas

“National Nosocomial Infections Surveillance System” (1999)– 2º en bactiremias– 2º en infecciones urinarias

Page 79: Automatizacion en microbiologia

EQUIPOS DE APOYOEQUIPOS DE APOYO

El Eddy Jet para realizar las siembras en espiral.El uso de una micro-jeringa desechable de gran precisión, evita la contaminación cruzada.

Instrumento óptico que utilizado con un ordenador  WXp o Vista se convierte en un potente contador de colonias.Con un software opcional se puede  utilizar para un número ilimitado de nuevas aplicaciones.

Page 80: Automatizacion en microbiologia

EQUIPOS DE APOYOEQUIPOS DE APOYO

El Spin Air es el instrumento para el muestreo microbiológico del aire.El diseño especial de los orificios combinado con la lenta rotación de la cápsula permite el uso del 100% de la superficie comparado con el 5% de la misma que emplean los aparatos fijos.

Para realizar diluciones volumétricas 1 a 10ml para muestras microbiológicas.También pueden realizar diluciones gravimétricas utilizando una balanza externa. reducen la mano de obra, ahorran tiempo y aseguran esterilidad y precisión.

Page 81: Automatizacion en microbiologia

Coloración GRAMColoración GRAM

Poly Stainer : automático para la tinción de Gram.totalmente programableAlmacena diez programas diferentes, para definir el baño, el tiempo de inmersión y la agitación.

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Page 84: Automatizacion en microbiologia

PhoenixPhoenix Sistema automatizado de identificación y sensibilidad Comunicación con el equipo por iconos. Capacidad de incubación de 100 paneles Sistema de fácil inoculación Control y calibración interna, no requiere mantenimiento. Lectura : convencional, fluoro génico y cromogénico. Medidas cinéticas de las reacciones: cada 20 min. Funcionamiento autónomo, incluyendo el sistema experto

BDXper. Conexión al sistema Epicenter Conexión al Sistema de Gestión de Laboratorio

Page 85: Automatizacion en microbiologia

Phoenix: PantallaPhoenix: Pantalla

Page 86: Automatizacion en microbiologia

Phoenix: InsumosPhoenix: Insumos

Panel y sellador: bandeja de poliestireno, moldeada sellada y autoinoculante. 136 pozos: 51 ID y 85 en AST.

Caldo Phoenix ID y AST Indicador Azul de Alamar Estación de Inoculación Recipiente para paneles Nefelómetro Crystal Spec o BD

Phoenix Spec. Pipeta 25 ul con micropuntas.

Page 87: Automatizacion en microbiologia

Phoenix: InsumosPhoenix: Insumos Identificación: 45 substratos:

convencionales, fluorogénicos y cromogénicos, Carbohidratos, fuentes de carbón o Esculina.

Sin adición de reactivos 5 bases de datos Resultados a 2,3,4, 6 y 12 hrs. Información de valores de

confianza y reacciones de los substratos.

B-Lact en la parte ID para los paneles G+

Page 88: Automatizacion en microbiologia

Phoenix: InsumosPhoenix: Insumos Paneles para ID/AST Combo

o solo AST para 1x25:• Gram negativos: NMIC/ID• Gram positivos PMIC/ID• Streptococcus SMIC/ID• Panel de formato único:

NID,PID,PMIC,NMIC,SMIC. Temp. almacenamiento de

reactivos: ambiente. Bioseguridad: Cierre hermético Resultados rápidos: 80% de

los resultados de AST completo en < de 10h.

Page 89: Automatizacion en microbiologia

Phoenix: InsumosPhoenix: Insumos

Sensibilidad: Caldo AST/AST-S 8 ml, Azul de

Alamar. 20 a 22 antibióticos por panel. > de 3 diluciones por Antibiótico Doble diluciones ESBL incluido en cada panel G-

con 2 métodos de detección NMIC/ID, NMIC, PMIC/ID,

PMIC, SMIC/ID, SMIC.

Page 90: Automatizacion en microbiologia

Phoenix: Medios de Obtención de InoculoPhoenix: Medios de Obtención de Inoculo

Page 91: Automatizacion en microbiologia

Phoenix: InoculaciónPhoenix: Inoculación

Colonias puras, 18-24 hr de incubación.

Hacer escala de McFarland 0.5 o 0.25.

Añadir una gota del indicador azul de Alamar.

Page 92: Automatizacion en microbiologia

Phoenix: InoculaciónPhoenix: Inoculación

Transferir 25 ul o 50 ul de inoculo ID al caldo AST.

Servir ambas soluciones en el panel según corresponde ID o AST.

Cierre el panel: hermético.

Page 93: Automatizacion en microbiologia

Phoenix: IncubaciónPhoenix: Incubación1. Escanear el

código de barras.

2. Teclear o escanear el

numero de muestra.

3. Introducir el panel en el Phoenix.

Page 94: Automatizacion en microbiologia

Phoenix: Control de CalidadPhoenix: Control de Calidad

Lectura de lotes automática

Cepas ATCC variadas

Page 95: Automatizacion en microbiologia

Phoenix: Método de IdentificaciónPhoenix: Método de Identificación

Substratos: convencionales. Cromogenicos, fluoro génicos, Esculina H.C.

Base de datos después de 2,3,4,6, y 12 hrs. de incubación.

Page 96: Automatizacion en microbiologia

Phoenix: Método de análisisPhoenix: Método de análisis Sensibilidad: Diluciones seriadas con MIC real

doble dilución: mínimo 3 dil por antibiótico. Lectura basada en:

– Indicador de actividad metabólica: redox– Cambios de turbidez

Medición cinética cada 20 min. 6 – 16 hr. .

Page 97: Automatizacion en microbiologia

Phoenix: Marcador de ResistenciaPhoenix: Marcador de Resistencia

Marcadores de Resistencia: tests específicos (ESBL) o Características fenotípicas

No se requiere de Test de confirmación adicional BDXpert utiliza estos marcadores para tomar acción apropiada

o hacer recomendaciones. Los marcadores son:

– ß-Lactamasa de Staphylococcus (Nitrocefinasa)– MRSA (basado en Interpretacion de Oxacilina y Cefoxitin.)– VRE (basado en MIC Vancomicina).– Sinergia con aminoglicosidos en Enterococcus

(Gentamicin500mcg/ml y Streptomycin1000mcg/ml)– ESBL

Page 98: Automatizacion en microbiologia
Page 99: Automatizacion en microbiologia

Epi CenterEpi Center

Inter-conexión de Microbiología

Page 100: Automatizacion en microbiologia

EpiCenter: Informe ClínicoEpiCenter: Informe Clínico

Page 101: Automatizacion en microbiologia

EpiCenter: Estadística y EpidemiologíaEpiCenter: Estadística y Epidemiología

Page 102: Automatizacion en microbiologia

EpiCenter: GraficosEpiCenter: Graficos

Page 103: Automatizacion en microbiologia

EpiCenter: Cubo Dinamico.EpiCenter: Cubo Dinamico.

Page 104: Automatizacion en microbiologia

DESARROLLADO PARA LA INVESTIGACIÓN ESPACIALTARJEDAS PEQUEÑAS-SE INCOCULA CON UN SISTEMA DE VACÍO- ENTRE 4 Y 10 HORAS (JORNADA LABORAL)LECTURA CADA 60 MINUTOS

DESARROLLADO PARA LA INVESTIGACIÓN ESPACIALTARJEDAS PEQUEÑAS-SE INCOCULA CON UN SISTEMA DE VACÍO- ENTRE 4 Y 10 HORAS (JORNADA LABORAL)LECTURA CADA 60 MINUTOS

Page 105: Automatizacion en microbiologia

Tecnología – Tarjeta

TrazabilidadUnión electrónica Por código de Barras

Seguridad Unidades Selladas

Rendimiento64 pocillos

SimplicidadInóculo único

Page 106: Automatizacion en microbiologia

1 Preparación de la Muestra

2 Entrada código barras

3 Carga del sistema

Page 107: Automatizacion en microbiologia

123 especies 159 especies 52 especies

Aumento de la productividad Completo menú ID

98% de la rutina ID realizable en una plataforma

Page 108: Automatizacion en microbiologia

Menú de antibióticos FLEXIBLE

~ 20 antibióticos por tarjeta +Rango MIC EXPANDIDO + Antibióticos deducidos

Page 109: Automatizacion en microbiologia

Manejo de ICONOS - Árbol de navegación

Page 110: Automatizacion en microbiologia

1 Entrada cassette

2 tarjetas 3 Muestra

Resultados para el médico

Page 111: Automatizacion en microbiologia

los resultados e Identificaciones precisas

API referenciaAPI referencia

Page 112: Automatizacion en microbiologia

Equipado Sistema de Expertos™ Reporte correcto de Interpretación

Alerta de mecanismos de resistencia

Page 113: Automatizacion en microbiologia

Tiempo respuesta - 80% aislamientos

95% de la rutina bacteriana en 6 horas Soporte a las decisiones terapéuticas

Resultados rápidos - ID

E. coli 5K. pneumoniae 5P. aeruginosa 6P. mirabilis 4

E. faecalis 4S. aureus 5S. pneumoniae 5S. epidermidis 6

Page 114: Automatizacion en microbiologia

Método tradicional

6 hrs Enterobacteriaceae

18-24hrs Todos los Microorganismos

9 hrs No-fermentadores

< 5 hrs Staph Oxa R

3 Resultados en el dia - Sensibilidad

Detección rápida de la resistencia Bacteriana Rápido ajuste y rotación del tratamiento Rápido aislamiento del paciente

Page 115: Automatizacion en microbiologia

La automatización en el aislamiento primario :Hemocultivos

Desinfección adecuada de la zona , tiempo de espera de acción desinfectante,punción tradicional desinfección final del septum de la botella.

Espera 2 min.

Desinfectar septum

Page 116: Automatizacion en microbiologia

BACTERIEMIA Y FUNGEMIABACTERIEMIA Y FUNGEMIA

“Presencia de Bacterias y/o levaduras y/o hongos en sangre indicando la falla del sistema inmune del huésped para localizar la infección en su foco primario o la falla del médico remover, drenar y/o esterilizar aquel foco.”

“... La tasa de mortalidad está entre 20% al 50% ”

Page 117: Automatizacion en microbiologia

HEMOCULTIVOSHEMOCULTIVOS

Síntomas de sospecha de bacteremia :

Fiebre de origen desconocido (> 38°C) o hipotermia (<36°C)

shock, escalofríos Infecciones severas (meningitis,

endocarditis, neumonia, pielonefritis, Absceso abdominal…).

Frecuencia cardíaca acelerada Alta o baja presión sanguínea Aumento de la frecuencia

respiratoria

Page 118: Automatizacion en microbiologia

Hemocultivos: importancia del volumenHemocultivos: importancia del volumen

WEINSTEIN,M.REV INF DIS,1983

Nº DE EPISODIOS= 282

3 MUESTRAS DE 15 ml CADA UNA

1º= 91% POSITIV 2º= >99% POSITIV

WASHINGTON, J.MAYO CLIN PROC. 1975

Nº DE EPISODIOS= 80

3 MUESTRAS DE 20 ml CADA UNA

1º= 80% POSITIV. 2º= 88% POSITIV 3º= 99% POSITIV

Page 119: Automatizacion en microbiologia

Criterios de interpretaciónCriterios de interpretación

MICROORGANISMOS QUE SIEMPRE REPRESENTAN BACTERIEMA

S.pneumoniae, H.influenzae, N.meningitidis, S.agalactiae, Brucella spp, M.tuberculosis, Bacteroides spp, Fusobacterium spp, H.capsulatum, C.neoformans, Leptospira.

MICROORGANISMOS QUE GENERALMENTE REPRESENTAN BACTERIEMIA

S.aureus, enterobacterias, P.aeruginosa, S.pyogenes, C.albicans

Page 120: Automatizacion en microbiologia

Criterios de interpretaciónCriterios de interpretación

MICROORGANISMOS QUE PUEDEN SER CONTAMINANTES O REPRESENTAR BACTERIEMIAS VERDADERAS:Estreptococos grupo viridans, Clostridium spp, C.tropicalis.

MICROORGANISMOS QUE GENERALMENTE REPRESENTAN CONTAMINACION:SCN, Bacillus spp, Corynebacterium spp, P.acnes, bacilos gram negativos no fermentadores (excluyendo a P.aeruginosa)

Page 121: Automatizacion en microbiologia

DDiaia 1 1 al 15 al 15Paso 2 Paso 2

24 – 48 hrs24 – 48 hrs

Paso 3 Paso 3

24 – 72 hrs24 – 72 hrs..

Método tradicional

Se requiere un máximo de 15 díaspara descartar un negativo

Subcultivo Identificación yantibiograma

Page 122: Automatizacion en microbiologia

Tecnología Colorimétrica

• Utilización de un sensor liquido tipo plasma.

• Membrana de silicona impregnada al plasma de sensibilidad

• Cambio sensitivo de CO2 diluido

• Generación de color permanente.

Page 123: Automatizacion en microbiologia

Unidades de reflectancia

2

Uso para hemocultivos, fluídos corporales y micobacterias.

La curva de crecimiento es automáticamente

GRABADA

ANALIZADA

GUARDADA

0 1 2 3 4 5 6 7

6000

5000

4000

3000

2000

1000

0

Days tested

Reflectance Units

1 Sustained acceleration2 Rate3 Initial threshold

1

3

2

• Algoritmos– Independientes al

tipo de medio monitoreado.

– Immediata notificación de positivos.

– Algoritmo de alto valor inicial. (ventaja en la entrada de botellas demoradas).

Tecnología Colorimétrica

Page 124: Automatizacion en microbiologia

Bourbeau PP et al. Routine incubation of BacT/ALERT FA and FN blood culture bottles for more than 3 days may not be necessary. J Clin Microbiol. 2005;43:2506-2509

Importancia de la automatizacionTiempo de recuperación

74% en Día 1 20% en Día 2 4% en Día 3 2% en Día 4 1% en Día 5

Estos resultados demuestran que el 98% de los aislamientos clínicamente significativos fueron recuperados en los 3 primeros días de incubación y el 94% dentro de los 2 días de incubación.

Page 125: Automatizacion en microbiologia

1.Cockerill FR III, Wilson J.W., Vetter E.A., et al. Optimal testing parameters for blood cultures. Clin Infect Dis. 2004 ;38 :1724-1730

Importancia de la automatizacionTiempo de recuperación

Estos datos sugieren que períodos de incubación extendidos previamente recomendados para la detección de microorganismos fastidiosos que a veces causan endocarditis, incluyendo Brucella, Capnocytophaga y Campylobacter spp., y el grupo HACEK (Haemophilus, Actinobacillus, Cardiobacterium, Eikenella y Kingella spp.) no son necesarios CUANDO SE UTILIZA SISTEMAS DE HEMOCULTIVOS AUTOMATIZADOS DE MONITORIZACIÓN CONTINUA

99.5% de la infecciones de sistema circulatorio (no endocarditis) y 100% de los episodios de endocarditis fueron detectados con 5 días de incubación.

Page 126: Automatizacion en microbiologia

Impacto de la contaminaciónImpacto de la contaminación

Un hemocultivos falso positivo puede conducir a un tratamiento antibiótico innecesario, mayor tiempo de hospitalización y mayores costos.

Se ha estimado que cada hemocultivo contaminado puede llevar a un aumento en:

estadía del paciente - en 6 días en promedio, el tiempo de terapia antibiótica – en 3 días, el costo de la administración de antibióticos puede ser

de hasta US$ 4400

Barenfanger et al. Clinical and Financial Benefits of Rapid Bacterial Identification and Antimicrobial Susceptibility Testing J. Clin. Micr, May 1999 p1415-1418

Page 127: Automatizacion en microbiologia

BACTEC 9050BACTEC 9050BACTEC 9050BACTEC 9050

Tecnología de monitoreo contínuo de la serie BACTEC ® 9000Sistema no invasivoCapacidad de 50 vialesInterfase gráfica de fácil uso:

Pantalla de cristal líquidoTeclado sencillo

Lector de código de barras fijoajuste de la intensidad de la alarmaformato de fecha/hora

Page 128: Automatizacion en microbiologia

El material del sensor es una sustancia sensible a la concentración de CO2

El sensor genera una señal fluorescente, la cual es detectada por el analizador.

La fluorescencia aumenta a medida que aumenta la concentración de CO2

El material del sensor es una sustancia sensible a la concentración de CO2

El sensor genera una señal fluorescente, la cual es detectada por el analizador.

La fluorescencia aumenta a medida que aumenta la concentración de CO2

Filtro de Detección

SENSOR

Filtro de Excitación

LEDPhotodiode

LED

CO2

Fotodiodo

Page 129: Automatizacion en microbiologia

FELIZ NAVIDAD Y PROSPEROAÑO NUEVO

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COSTOS DE UCI-HSRCOSTOS DE UCI-HSR HOSPITALIZACION 106.00 / día OXIGENO 53.00 / día DESCARTABLE 20.00 (sondas , mascaras) MEDICAMENTOS 100.00 (Imipenem – asociados) Materiales de asepsia 40.00 total 319.00 gasto por día Promedio de estancia 5 días Total = 1595.00 Sin considerar análisis de control y Rx (15.00)si amerita Gases arteriales : 25.00 + hemograma 12.00 +

coagulación 25.00 + bioquímica 18.00 (glucosa,urea,creatinina) +hemocultivo 45.00 + otros 17 =142.00

Page 131: Automatizacion en microbiologia

Importancia de la automatización Conclusiones

Importancia de la automatización Conclusiones

Tratamiento inicial acertadoTratamiento inicial acertado– Beneficios clínicosBeneficios clínicos

– Menor morbi-mortalidadMenor morbi-mortalidad– Menor tiempo de internaciónMenor tiempo de internación– Menor toxicidadMenor toxicidad– Reducción de costosReducción de costos

– Beneficios epidemiológicosBeneficios epidemiológicos Disminuir presión de selección de cepas RDisminuir presión de selección de cepas R

Page 132: Automatizacion en microbiologia
Page 133: Automatizacion en microbiologia

Estudio de resistencia los antibacterianos en el Centro Medico Naval -2000Estudio de resistencia los antibacterianos en el Centro Medico Naval -2000

Escherichia coli ( R) 60% Penicilinas ,B lactamicos, , Cefalosporinas

Recomendamos estudiar con detalles la resistencia de Estafilococo aureus y tomar las medidas necesarias para evitar su desiminacion : (R) Penicilinas y Céfalosporinas: 70%

Necesario que el Dep. de Microbiologia realice una vigilancia permanente de la resistencia a los antimicrobianos y la aparición de cepas multiresistentes

Farmacia debe realizar estudios de utilización de antibióticos El personal de enfermería alerta ante el problema de

resistencia y establezca medidas para evitar la diseminación Comité de Infecciones y la vigilancia Epidemiológica Uso racional de antibióticos

Page 134: Automatizacion en microbiologia

Programa de Evaluación Externa del Desempeño (PEED)

Vigilancia de la Resistencia Antimicrobiana de bacterias patógenas asociadas a Enfermedades Diarreicas Agudas, Infecciones

Respiratorias Agudas e Infecciones Intrahospitalarias

INS - CNSP LRN Enteropatógenos LRN IRAs E IIH

Page 135: Automatizacion en microbiologia
Page 136: Automatizacion en microbiologia
Page 137: Automatizacion en microbiologia

GRACIAS

POR NO DORMIR