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JUAN CARLOS RODRIGUEZ DIAZ
S. MICROBIOLOGIA
HOSPITAL GENERAL UNIVERSITARIO DE ELCHE
CASOS PRACTICOS EN MICROBIOLOGIA CLINICA
CASO CLINICO 1: Paciente joven con sospecha de tuberculosis
Datos clínicos• Hombre• 27 años• Fumador• Tos de 20 días de evolución• Febrícula vespertina• Pérdida de peso de 8 kg• Lesión radiológica en pulmón
CASO CLINICO 1: Paciente joven con sospecha de tuberculosis
Muestras a procesar• Tres muestras de esputo de días diferentes• Aspirado bronquial• Lavado bronquial • Cepillado bronquial• Biopsia pulmonar
Patogenia de la tuberculosis
Respuesta del sistema inmuneDiseminación hematógena
Infección tuberculosa o Tuberculosis latente
Enfermedad tuberculosa
Entrada del microorganismo
Métodos clásicos de diagnóstico de la infección tuberculosa
Prueba del Mantoux o de la tuberculina
� Basada en:� Inoculación de una mezcla de antígenos obtenidos de un cultivo inactivado
� Lectura de la induración a las 48-72hPRINCIPALES VENTAJAS� Existen consensos internacionales para su interpretación
� Amplia experiencia clínicaINCONVENIENTES� Reacción cruzada con:
� BCG�Micobacterias no tuberculosas� Falta de sensibilidad (anergia)
Nuevos métodos de diagnóstico de la infección tuberculosa
IGRAs (interferon gamma release assay)
� Basada en:� Detección de la producción de interferon en
leucocitos estimulados in vitro con antígenos específicos de M. tuberculosis (ES AT-6 y CFP-10)
� PRINCIPALES VENTAJAS� Evita las reacciones cruzadas con la vacuna y
con muchas de las micobacterias no tuberculosas
� Útil en vacunados e inmunodeprimidosINCONVENIENTES� Coste� No está evaluado en profundidad su
verdadero significado en algunos casos
Métodos de diagnóstico de la enfermedad tuberculosa
Tinciones• Ziehl Neelsen• Auramina
PRINCIPALES VENTAJAS� Rapidez� Bajo costeINCONVENIENTES� Falta de sensibilidad� No diferencia entre M. tuberculosis y micobacterias no tuberculosas
Métodos de diagnóstico de la enfermedad tuberculosa
Cultivos• Sólidos: Lowenstein, Coletsos• Líquidos automatizados: MGIT
PRINCIPALES VENTAJAS� Sensibilidad� Aislamiento de la cepa para estudios posteriores: sensibilidad, etc� Permite diferenciar entre M. tuberculosis y micobacterias no
tuberculosasINCONVENIENTES� Lentitud: 2-4 semanas
Métodos de diagnóstico de la enfermedad tuberculosa
Sistemas de biología molecular
• PCR a tiempo real
• Amplificación e hibridación con sondas específicas
PRINCIPALES VENTAJAS� Sensibilidad, aunque menor que el cultivo� Permite diferenciar entre M. tuberculosis y micobacterias no
tuberculosas� Rapidez� Permite conocer la resistencia antibióticaINCONVENIENTES� Coste� No permite obtener la cepa� No sustituye a los métodos clásicos sino que los complementa
Métodos moleculares de diagnóstico de la enfermedad tuberculosa
Métodos moleculares de detección de resistencias en Mycobacterium tuberculosis
Caso clínico 2: Mujer joven con infección urinaria
Cistitis (infección de vías bajas)• Micción dolorosa: Disuria• Micción frecuente: Polaquiuria• Sensación continua de necesidad de orinar: Tenesmo• Escasa sintomatología
Pielonefritis
(infección de uréteres y riñones)• Fiebre• Dolor lumbar• Afectación general• Síntomas de cistitis
Caso clínico 2: Mujer joven con infección urinaria
Muestras a tomar
Cistitis�Muestra de orina para cultivo cuantitativo
� Pielonefritis�Muestra de orina para cultivo cuantitativo�Hemocultivos para bacterias aerobias y anaerobias
Caso clínico 2: Mujer joven con infección urinaria
Cultivo cuantitativo
� Para diferenciar infección y colonización uretral: 100.000 colonias/ml de orina
� Principales patógenos:�Escherichia coli�Proteus mirabilis�Enterococcus faecalis
� Se realiza en varios medios: �CLED�Agar sangre�Agar mac Conkey
Caso clínico 3: Viajero que regresa de Méjico con diarrea
Causas
� Bacterianas�Salmonella�Campylobacter�Shigella�Vibrio
� Virus�Rotavirus�Adenovirus�Norovirus
Parásitos: clasificación
• Protozoos:– Amebas
– Ciliados
– Flagelados
– Apicomplexa
– Microspora
• Helmintos– Platelmintos
• P. cestodos
• P. trematodos
– Nemátodos
Protozoos: Amebas
Protozoos ciliados
Protozoos: flagelados
Trichomona vaginalis
Protozoos: flagelados II
Leishmania spp Tripanosoma spp
Protozoos: Apicomplexa
Pasmodium Toxoplasma gondii
Protozoos: Apicomplexa II
Cryptosporidium spp
Isospora belli
Cyclospora cayetanenesis
Protozoos: Microspora
Enterocytozoon spp
Platelmintos: cestodos
Tenia spp. Ecchinococcus ssp.
Platelmintos: tremátodos
Fasciola hepatica Schistosoma mansoni
Nemátodos I
Trichuris trichiura Trichinella spiralis
Nemátodos II
Enterobius vermicularis Ascaris lumbricoides
Nematodos III
Toxocara canis Strongyloides stercoralis
Nemátodos III
Necator americanus Anylostoma duodenale
Nemátodos IV
Filarias sp
Identificación de los microorganismos
Se utilizan pruebas bioquímicas, sensibilidad a algunos compuestos, secuenciación y espectrometría de masas
� Pruebas bioquímicas:�Fermentación de azúcares: glucosa, lactosa, etc�Hidrólisis de la urea
� Sensibilidad a:�Optoquina�Bacitracina
Identificación de los microorganismos
Secuenciación de algunos genes
� Bacterias: Gen 16S rRNA� Hongos: Genes ITS 1 y ITS4
Espectrometría de masas (Malditof)
Estudio de la sensibilidad antibiótica
Concentración mínima inhibitoria (CMI): Mínima concentración del antibiótico que inhibe el crecimiento bacteriano in vitro
Métodos
� Sistema disco placa: Utiliza discos impregnados que se ponen en un medio sólido
� Sistema microdilución: Utiliza concentraciones seriadas de antibióticos en cultivos líquidos
� E-test: Tiras con un gradiente de antibióticos que se ponen sobre un cultivo sólido
� Detección molecular de genes de resistencia
Estudio de la sensibilidad antibiótica
Caso clínico 4: Paciente con sospecha clínica de HIV
Datos clínicos
• Varón• 25 años• Antecedentes de uso de drogas por vía
parenteral hace 5 años• Asintomático
Caso clínico 4: Paciente con sospecha clínica de HIV
Detección de anticuerpos
• Cribado mediante enzimoinmunoensayo (ELISA)
• Su negatividad descarta la infección salvo en primoinfección (infección muy reciente)
• Si es positivo siempre hay que confirmar por western Blot y PCR
Interpretación de resultados serológicos
Exposición al microorganismo
• Presencia de anticuerpos en el suero del paciente
Diagnóstico de infección aguda:
• Detección de IgM
• Seroconversión
• Al cuantificar dos sueros del paciente separados 3-4 semanas se observa un incremento importante de la cantidad total de anticuerpos
• El suero en fase aguda puede ser negativo
Interpretación resultados serológicos