se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere...

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Progresa mediante la acumulación progresiva de diferentes combinaciones de alteraciones genéticas/epigenéticas en un contexto medio-ambiental apropiado. Se inicia cuando una célula experimenta una alteración genética o epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que normalmente restringen la invasión y colonización de territorios normalmente reservados para otras células.

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Page 1: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Progresa mediante la acumulación progresiva de diferentes combinaciones de

alteraciones genéticas/epigenéticas en un contexto medio-ambiental apropiado.

Se inicia cuando una célula experimenta una alteración genética o

epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse.

Se disemina subvirtiendo mecanismos que normalmente restringen la invasión

y colonización de territorios normalmente reservados para otras células.

Page 2: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

número de

células

división

celular

muerte

celular

diferenciación

celular

división

celularmuerte

celular

diferenciación

celular

tejido normal (homeostasis)

tumor (pérdida de la homeostasis)

metástasis

número de

células

Page 3: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

tumor o

neoplasma

Benigno. No invasivo. Ejemplos: Adenomas, angiomas, lipomas, etc

Maligno = cáncer. Invasivo. Ejemplos: Carcinomas, Sarcomas, etc

metástasis: Refiere a la generación de tumores secundarios, que se derivan y crecen

separados espacialmente del tumor primario.

Crecimiento y diseminación

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The body of an animal operates as a society or ecosystem. The individual members are cells that

reproduce by cell division and organize into collaborative assemblies called tissues. This society is

very peculiar, however, because self-limitation – as opposed to survival of the fittest- is the rule.

Ultimately, all of the somatic cell lineages in animals are committed to die: they leave no progeny and

instead dedicate their existence to support of the germ cells, which alone have a chance of continued

survival. There is no mystery in this, for the body is a clone derived from a fertilized egg, and the genome

of the somatic cells is the same as that of the germ cell lineage that gives rise to sperm or eggs. By their

self-limitation for the sake of the germ cells, the somatic cells help to propagate copies of their own genes.

Thus, unlike free-living cells such as bacteria, which compete to survive, the cells of a multicellular

organism are committed to cooperation. To coordinate their behavior, the cells send, receive, and

interpret an elaborate set of extracellular signals that serve as social controls, directing cells how to

act. As a result, each cell grow, migrate, divide, differentiate, or die as needed for the good of the

organism. Molecular disturbances that upset this harmony mean trouble for a multicellular society. In a

human body with more than 1014 cells, billions of cells experience mutations every day, potentially

disrupting the social controls. Most dangerously, a mutation may give one cell a selective advantage,

allowing it to grow and divide more vigorously than its neighbors and to become founder of a growing

mutant clone. A mutation that promotes such a selfish behavior by individual members of the cooperative

will jeopardize the future of the whole enterprise. Over time, repeated rounds of mutation, competition,

and natural selection operating within the population of somatic cells are the basic ingredients of

cancer: it is a disease in which a clone of mutant cells begins by prospering at the expense of their

neighbors, but in the end the descendants of this clone can destroy the whole cellular society and die. The

development of human cancer, as a microevolutionary process, occurs on a time scale of years or

decades, in a subpopulation of cells in the body. But the final result depends on the same principles of

mutation and natural selection that driven the evolution of all living organisms for billions of years.

Alberts et al MBC 2008

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Todos los tejidos adultos en mujeres constituyen mosaicos de células con el cromosoma X paterno (Xp) o el materno (Xm)

inactivado, proceso que ocurre al azar. El análisis de genes ligados a los cromosomas X en tumores de mujeres revela que

las células de un tumor (masa central) exhiben el mismo cromosoma X inactivo indicando el origen monoclonal del cáncer.

Los tumores tienen un origen monoclonal

Alberts et al MBC 2008

Page 6: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Otra evidencia en favor del origen monoclonal del cáncer proviene del análisis de alteraciones

cromosómicas en las células tumorales. Por ejemplo, todos los leucocitos de pacientes con

leucemia mielógena crónica (CML) exhiben el cromosoma Filadelfia (22) .

Page 7: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

El cáncer es producto de un proceso microevolutivo(“multi-hit model”)

Evan & Vousden, Nature 2001

El cáncer evoluciona a partir de sucesivas

rondas de mutaciones, amplificación y

selección en los tumores, acumulándose

mutaciones en oncogenes y en genes

supresores de tumores.

Page 8: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Consistente con un proceso microevolutivo, la incidenciadel cáncer incrementa marcadamente con la edad

Colon cáncer

Page 9: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

colon normal

“polyposis colon”

colon con pólipos

El cáncer de colon revela una secuencia de mutaciones relativamente predecibles que se correlacionan con la histopatología

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Estudios en ratones transgénicos revelan que la acción cooperativa de varias mutaciones aceleran el desarrollo de tumores

ratones que solo

sobreexpresan myc

ratones que solo

sobreexpresan ras

constitutivamente activo

ratones que

sobreexpresan

myc y ras activo

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Microfotografías de células de cuello uterino obtenidas por raspado (Papanicolaou). Las células normales (A) son

grandes, planas, con abundante citoplasma y núcleos áltamente condensados. Las células pre-cancerosas (B) y de

carcinoma invasivo (C) exhiben núcleos mas prominentes, escaso citoplasma y crecimiento irregular.

Las células cancerosas exhiben rasgos morfológicosque pueden distinguirse al microscopio

Page 12: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Clasificación morfológica del desarrollo de cáncer de cuello de útero

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Dos categorías de genes principalmente controlan el crecimiento tumoral:oncogenes y genes supresores de tumores

Proto-oncogen es un gen normal

que por mutación se convierte en un

oncogen. Los oncogenes codifican

para proteínas hiperactivas que

estimulan el crecimiento y la

proliferación celular.

Mutaciones dominantes

“gain of function”

Genes supresores de tumores.

Genes cuyas mutaciones inactivan la

función de proteínas que inhiben el

crecimiento y la proliferación celular.

Mutaciones recesivas

Page 14: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Circuitos afectados por mutaciones que promueven cáncer

Lodish MCB 2004

Page 15: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

La progresión de tumores no solo involucra alteraciones genéticas sino también cambios epigenéticos

Epigenética refiere a cambios heredables en la expresión de genes que no involucran modificaciones en la

secuencia del ADN. Las células tumorales presentan mutaciones en proteínas reguladoras del empaquetamiento

de la cromatina, en el patrón de metilación del ADN y de modificación de histonas. Mecanismos epigenéticos

pueden inactivar genes supresores de tumores y genes que promueven diferenciación.

Page 16: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Principales capacidades adquiridas por las células tumorales

Hanahan & Weinberg Cell 2011

Genome instability

metabolism

reprogramming

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Las células tumorales adquieren autosuficiencia para crecer y proliferar

Alberts et al, MBC 2015

(IR, ILGFR, etc)

Las células tumorales expresan transportadores de glucosa y enzimas

glicolíticas en mayor proporción que las células normales.

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El complejo mTOR constituye un nodo esencial en la señalización que promueve el metabolismo anabólico

Dibble et al Nature Rev NCB2013

El complejo mTORC está compuesto por 3 subunidades principales,

mTOR (Ser/Thr kinasa), mLST8 (activador) y Raptor (proteína “scaffold”)

(RTK, Ras, Raf, PI3K, Akt)

(PTEN, TSC1/2, p53)

La activación oncogénica de mTOR promueve diversos procesos que estimulan la progresión tumoral,

como por ej. el crecimiento, proliferación y sobrevivencia de las células.

Page 19: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Alberts et al, MBC 2015

Los tumores consumen altas cantidades de glucosa. Las células tumorales exhiben un metabolismo de la glucosa alterado

Las células tumorales

incrementan la glicólisis aeróbica

(effecto Warburg), produciendo y

secretando lactato al medio

extracelular.

La glicólisis aeróbica favorece el progreso tumoral en los siguientes aspectos:

1) prioriza la acumulación de biomasa en lugar de almacenamiento de energía

en forma de ATP,

2) reduce la apoptosis inducida por radicales libres producidos por la

fosforilación oxidativa en mitocondrias,

3) produce lactato el cual estimula la angiogénesis e invasión.

(↑biomasa)

LDH

Tomografía de emisión de positrones (PET)

revela la presencia de tumores (T). Inyección

de fluodeoxiglucosa F18

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Romero Garcia et al., Front Immunol 2016

El lactato acidifica el microambiente, estimula angiogénesisy suprime la respuesta inmune

Page 21: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

estimulación

autócrina

estimulación

paracrina

célula del

microambiente

tumoralcélula

tumoral

hiperactividad

de oncogenes

estimulación

paracrina

Las células tumorales desarrollan autosuficiencia para crecer y proliferar mediante diferentes mecanismos

inactivación de

supresores

de tumores

Cdks

La capacidad de señalización sostenida para la proliferación en las células tumorales puede resultar

de una estimulación autócrina, o indirectamente a través de la estimulación de células del estroma

asociadas, a secretar factores de crecimiento y mitogénicos.

Page 22: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Mutaciones activantes en

un solo alelo son

suficientes para que se

manifieste el fenotipo.

EGFR/PDGFR

Ras, Raf

Src, Abl

Crk

myc

etc...

oncogenes: genes mutados que

codifican proteínas capaces de

transformar células en cultivo o

inducir cáncer en animales

proto-oncogen: contraparte

normal del oncogen

Ras: GTPasa; mutaciones puntuales activadoras, ej. bloquean la hidrólisis del GTP

Raf: Ser/Thr kinasa; mutaciones puntuales activadoras de la catálisis

Abl: tirosina-quinasa; translocación cromosómica genera la proteína

de fusión bcr-Abl constitutivamente activa

Crk: proteína adaptadora que promueve motilidad; sobreexpresada en cáncer

Myc: factor de transcripción que promueve proliferación; translocaciones cromosómicas

causan la sobre-expresión de myc.

Page 23: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

oncogén célula normaltransfección

célula transformadaalteraciones

La expresión de oncogenes transforman células in vitro, induciendo alteraciones fenotípicas similares a las encontradas en tumores in vivo

- morfología fusiforme

- pérdida de la inhibición por contacto

- pérdida de la dependencia del anclaje al substrato

- menor dependencia a factores de crecimiento

- pérdida de adhesiones focales y fibras de estrés

Microscopía electrónica de barrido de fibroblastos normales (A) y transformados con el oncogen v-src (B)

Las células transformadas son fusiformes, con frecuente producción de microvellosidades.

El apilamiento de las células resulta de la pérdida de la inhibición por contacto.

A B

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la conversión de un proto-oncogen en un oncogen

involucra mutaciones de ganancia de función.

mecanismos mutaciones puntuales/deleciones

amplificación génica

translocaciones cromosómicas

Diferentes mecanismos moleculares pueden convertir un proto-oncogén en un oncogén

ej. bcr-abl,

Trk-tropomiosina

ej. c-myc en

linfoma

de Burkitt

Page 25: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Prior et al Cancer Res 2012

Las mutaciones oncogénicas más frecuentes de ras ocurren en los residuos G12, G13 y Q61 de la proteína.

Las mutaciones inhiben la capacidad intrínseca para hidrolizar el GTP unido y también la interacción con

GAPs, y por lo tanto generan una forma constitutivamente activa. La incidencia promedio de variantes

oncogénicas de ras en cáncer es de ~16%, pero puede superar el 60% en ciertos tumores (ej. páncreas).

El dominio que interacciona con el efector se

muestra en verde, la localización de los residuos

G12, G13 y Q61 se muestran en amarillo.

Mutaciones puntuales activadoras de la GTPasa RAS

Sitio activo de Ras en complejo con RasGAP. La cadena

lateral de arginina (“Arginine finger”, en amarillo) estabiliza

el estado de transición de la reacción de hidrólisis.

Q61

GAP en amarillo,

Ras en verde,

GDP en naranja,

AIF3, análogo del

fosfato

Page 26: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Wan et al, Cell 2004; Cell Signaling 2015

(inhibited)

En ausencia de estímulo la quinasa Braf se encuentra inhibida.

Más de 30 mutaciones puntuales asociadas con cáncer ocurren

en el dominio catalítico (“N y C lobe”), y facilitan la unión del

ATP y la fosfotransferencia al substrato. Las mutaciones alteran

la estructura y favorecen la conformación activa. Una de las más

comunes, es el reemplazo de V599 por E lo cual incrementa la

actividad de raf ~ 500 veces. Raf es mutado frecuentente en

melanoma y en otros tipos de cánceres humanos.

Mutaciones puntuales activadoras de la quinasa RAF

DFG loop

D593

K482

D575

G500

K574T598

Sitio activo de las quinasas

V599

P loop

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Varios oncogenes virales, ej. v-src, tienen su

contraparte celular no oncogénico (proto-oncogén), ej.

c-src. En las células no estimuladas la actividad c-Src

está normalmente reprimida por fosforilación de Tyr527.

Mutantes de v-Src codificadas por el virus RSV poseen

deleciones del terminal carboxilo que eliminan a la tirosina

Y527, o mutaciones puntuales que cambian Y527 por F.

Por lo tanto estas mutantes no pueden ser autoinhibidas

eficientemente y son constitutivamente activas.

En la configuración inactiva, la Y527 de c-Src es

constitutivamente fosforilada por otra quinasa. La

pY527 interacciona con el dominio SH2 de la misma

molécula, estabilizando la conformación inactiva del

dominio catalítico.

Dentro de las células infectadas los retrovirus utilizan su transcriptasa reversa para sintetizar ADN. El ADN viral se inserta

en el genoma huésped. Eventos de recombinación permiten la incorporación de genes del huésped en el genoma viral.

Ejemplos de virus que transducen oncogenes son: RSV v-src; Harvey sarcoma virus (HSV) H-ras, etc.

Proto-oncogenes celulares pueden mutar y convertirse en oncogenes dentro de virus

Page 28: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Secuencias reguladoras virales pueden convertir un proto-oncogén celular en un oncogén incrementando su expresión

Retrovirus que producen linfomas en aves usualmente se insertan en regiones adyacentes al gen c-myc

en dos posibles orientaciones. En ambos casos, secuencias promotoras o potenciadoras virales inducen

un incremento significativo en los niveles de transcripción de c-myc.

LTR: Long terminal repeats. Pueden funcionar como reguladores de la transcripción

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Ciertas proteínas virales son oncoproteínasque mimetizan factores de crecimiento celulares

SFFV (Spleen Focus Forming Virus) es un retrovirus que produce eritroleucemia en ratones. El SFFV

codifica la proteína gp55, que estimula al receptor de eritropoietina en eritroblastos e induce su proliferación.

la unión del ligando

natural eritropoietina (Epo)

dimeriza el receptor y activa

la quinasa JAK asociada

la unión de gp55 mimetiza

el ligando natural y también

dimeriza y activa las quinasas JAK

Otro ejemplo es el gen v-sis del virus SSV (Simian Sarcoma Virus) codifica para una proteína

homóloga a PDGFβ. SSV induce sarcomas en fibroblastos que expresan el receptor de PDGF.

Jak2 Jak2 Jak2 Jak2

ligando natural

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Deleciones y mutaciones puntuales generan variantes oncogénicas de receptores (ej. EGFR)

Ambas mutaciones promueven la activación

constitutiva del dominio tirosina-quinasa,

independiente de la presencia del ligando.

Otras mutaciones ocurren en el dominio

citosólico, p. ej. deleciones que eliminan

señales de endocitosis contribuyen a

activaciones sostenidas del receptor.

Miembros de la familia del EGFR se encuentran sobre-

expresados o están mutados en varios tipos de cáncer.

Ej. La mutación puntual de Val Gln en la región de

transmembrana favorece la dimerización y convierte el

receptor Her2 en su forma oncogénica (Neu).

Deleciones del dominio extracelular del EGFR también

producen variantes oncogénicas (hiperactivas).

Lodish, MCB 2004EGFR/HER/ErbB son denominaciones del mismo gen

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Translocaciones cromosómicas generan quimeras oncogénicas (ej. TPM-Trk)

El mecanismo más común de activación oncogénica del receptor tirosina quinasa Trk es consecuencia de translocaciones

cromosómicas que generan proteínas quiméricas. Por ejemplo, una translocación cromosómica reemplaza la región

extracelular de Trk por el dominio “coiled coil” de la tropomiosina (TPM) involucrado en dimerización. La dimerización

constitutiva de la quimera TPM-Trk provoca una hiperactividad del dominio quinasa independiente de ligando.

La fosforilación y

activación de los

dímeros ocurre sin

necesidad de unir

al ligando natural.

dominio extracelular

oncoproteína quimera TPM-Trk

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Translocación cromosómica en leucemia mieloide crónica (chronic myelogenous leukemia o CML). La translocación puede

detectarse por bandeo cromosómico (A) o por FISH (B). La translocación produce una oncoproteína quimera, Bcr-Abl, que exhibe

una actividad desregulada de la tirosina quinasa Abl, inducida por la dimerización que produce la región “coiled-coil” de Bcr.

c-Abl

Bcr-Abl

activación

de Abl

FISH: Fluorescence in situ hibridizationA B

BCR: Breakpoint Cluster Region

FISH: Fluorescence In Situ Hybridization

Translocaciones cromosómicas generan quimeras oncogénicas (ej. Bcr-Abl)

InTechOpen

substrate substrate

Page 33: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Translocación cromosómica en linfomas de Burkitt que

posiciona al gen de c-myc en la región adyacente a

activadores o “enhancers” de genes de inmunoglobulinas.

Sobreexpresión

de c-myc!!

Amplificación de c-myc (FISH)

Otras translocaciones posicionan los activadores o “enhancers”

de los genes de inmunoglobulinas adyacentes al gen que

codifica para ciclinas D o al gen anti-apoptótico Bcl-2.

Translocaciones cromosómicas alteran la expresión de factores de transcripción (ej. c-myc)

Page 34: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Myc regula la expresión de genes que promueven la transición G1 S

Expresión diferencial de genes blanco. Aprox

1200 de 6633 genes cambian su expresión

después de 4 h de activación de myc

niveles de expresión

respecto del control

<2 0 >2

mRNAs colectados de células beta del

páncreas y de queratinocitos, fueron

marcados con biotina e hibridizados a un

microarreglo de DNA (GeneChip, Affymetrix)

Robson et al, Genomics, 2011

Page 35: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Ambos alelos de los genes supresores de

tumores deben inactivarse para abolir la

función supresora del crecimiento tumoral.

CKIs

pRb

p53

TGFb

APC

PTEN

ATM/ATR

etc…

categorías de genes supresores de tumores:- proteínas de checkpoint, ej. p53, Bub, Mad

- proteínas inhibidoras de la proliferación, ej. CKIs, Rb, APC, TGFβ

- proteínas pro-apoptóticas, ej. PTEN

- proteínas reparadoras del DNA, ej. ATM/ATR, Chk1/2

Page 36: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

TGFb inhibe el crecimiento tumoral a través de la regulación de la expresión de numerosos genes

TGFb

↑ PAI-1(plasminogen

activator

inhibitor-1)

plasminogen

activator

plasminogen

plasmin

degradación

de la ECM

TGFb

↑ p15 CKI

↑ p21 CKI

Rb

E2F

síntesis

de DNA

Cdk4/cicl D

Mutaciones inactivantes de Smads en la vía de TGF-b R son comunes en cáncer de colon y páncreas.

proliferación invasión

c-myc

efe

cto

cit

ostá

tico

efe

cto

cit

ostá

tico

Page 37: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

APC y Axina restringen la función transcripcional de b-catenina

Mutaciones de APC, Axina y b-catenina se observan en varios tipos de cáncer incluído el colorectal. Beta

catenina se acumula y se transloca al núcleo donde forma complejos con los factores de transcripción

Tcf/Lcf y activa la transcripción de genes que promueven proliferación (ej. myc, ciclina D, E2F, etc).

Page 38: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

PI-3k

Akt

caspasa 8/9

Bad

p53

citoc C/APAF

cascada de

activación de

caspasas

PTEN

deleciónPTEN es una fosfatasa

que defosforila PIP3 y

contraresta la función

de PI-3K.

deleción /

inactivación

en rojo se señalan alteraciones

observadas en cáncer

que confieren resistencia

a la apoptosis.

RPTKs receptores que transducen

señales anti-apoptóticas

familia de proteínas Bcl-2:

proapoptóticas (Bax, Bak),

BH-only (Bad, Noxa, Puma)

antiapoptóticas (Bcl-2, Bcl-XL)

integrinas

Bcl-2

Bax

sobre-expresión

PTEN contraresta señales de supervivencia y crecimiento

pérdida de

función

NOXA,

PUMA

mTOR

Ras

MdM2

Page 39: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

• amplificación génica de ciclinas D

• deleciones de inhibidores de Cdk4/6, p16

• mutaciones inactivantes de Rb

Rb e inhibidores de Cdks como p16 son supresores de tumores; las ciclinas D y Cdk4 son proto-

oncogenes. Mutaciones de estos genes son comunes en cáncer. La ganancia de función de un solo proto-

oncogen de esta vía, o la inactivación bi-alélica de los supresores de tumores promueven la proliferación.

Retinoblastoma inhibe la transición G1/S

tipos de mutaciones descriptas en cáncer

p16

Rb

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Virus de DNA, como el papiloma humano (HPV) y Simian Virus 40 (SV40) producen proteínas que

se unen e inactivan a las proteínas p53 y Rb. El HPV es causante del cáncer de cuello de útero.

Rb y p53 pueden inactivarse por oncoproteínas virales

E2F

Rb

E2F

HPVE7: inactiva Rb

E6: inactiva p53

E5: activa el PDGFR

Rb

E2F

verruga causada por HPV

Page 41: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

La pérdida de heterocigosis de genes supresores de tumores puede ocurrir por diferentes mecanismos

La pérdida de función de Rb es causante de retinoblastoma y de otros tipos de cáncer.

Page 42: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Ratones knockout para p53 desarrollan tumores tempranamente

Page 43: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

P53 contraresta diversas alteraciones asociadas al progreso tumoral

ANGIOGENESIS

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La hiperactividad de oncogenes incrementa la expresión de p19ARFy la activación de p53

↑ ras La transcripción de p19ARF (ARF).

ARF inhibe Mdm2, lo cual estabiliza

p53 y promueve su actividad

transcripcional.

En condiciones normales

la E3 ubiquitina ligasa

Mdm2 ubiquitina a p53 y

promueve su degradación

en proteosomas.

↑ b-catenina

ARF: Alternative Reading Frame, es un producto de “splicing alternativo” del locus INK4a que codifica para P15INK4a, p16INK4a.

(No confundir con la GTPasa ARF que recluta proteinas de cubierta COPI!)

↑ proteínas pro-apoptóticas:

Bax, Puma, noxa,

receptores de Fas, etc

↑ myc

Page 45: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Oncogenes y supresores de tumores integran redes de señalización, su efecto depende del tipo celular y el contexto funcional

Lowe et al Nature 2004Senescencia: estado no replicativo permanente e irreversible

p19

telomer shortening

Myc activa p53 y promueve

apoptosis mientras inhibe

senescencia.

Ras activa p53 y promueve

senescencia mientras inhibe

apoptosis.

La inactivación de p19ARF

promueve la proliferación e

inhibe la senecencia y apoptosis.

Page 46: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Orígenes de las mutaciones y cáncer

Tomasetti et al, Science 2017

Básicamente 3 factores explican la

acumulación de mutaciones en las

células de los organismos

pluricelulares: factores hereditarios,

factores relacionados con la

replicación del ADN y factores

ambientales.

Estudios recientes sugieren una

importante correlación entre la

división celular de células madre y la

incidencia de cáncer.

Page 47: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

inestabilidad genómica

fallas en reguladores

de "checkpoint“ mitóticos

fallas en mecanismos de

detección y reparación

del ADN

fallas en el mantenimiento

de los telómeros

Inestabilidad genómica

arresto del

ciclo celular

apoptosis

Las células normales exhiben mecanismos

que restringen la inestabilidad genómica y

eventualmente inducen arresto del ciclo

celular, senescencia o apoptosis.

senescencia

Actividad oncogénica,

estrés de la replicación

La inestabilidad genómica es una característica del cáncer. Implica un proceso de acumulación de

alteraciones en la secuencia de ADN y/o en los cromosomas que disminuyen la fidelidad en la

transmisión de copias exactas del genoma de una generación a otra. Las causas son varias.

fallas en citoquinesis,

duplicación de centrosomas

Page 48: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Un nivel de inestabilidad

genómica óptimo facilita

el desarrollo del cáncer

(B) Se presume que un nivel de

inestabilidad genómica óptimo en los

tumores genera la suficiente

diversidad fenotípica para evolucionar

y superar las barreras selectivas

impuestas por el organismo.

apoptosis

(A) Las células normales

restringen la inestabilidad

genómica lo cual impide la

generación de variantes que

superen las barreras selectivas

impuestas durante la vida del

organismo.

(C) Existe un umbral de

inestabilidad genómica

compatible con la vida celular,

que cuando es superado activa

la apoptosis o senescencia.

La inestabilidad genómica es un mecanismo que genera diversidad genética

Page 49: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Diversos sistemas reparan daños en el ADN y restringen la inestabilidad genómica

Alberts et al, MBC 2008

dímero de timinadeaminación

de 5-metil

citosina

Page 50: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

En cada ronda de duplicación de la molécula de ADN un fragmento del extremo 3´ no puede ser copiado

telómero

Un complejo de proteínas unidas a los telómeros

normales inhiben el mecanismo sensor de daño

del DNA mediado por ATM/ATR.

loss of RNA

primer in

lagging

strand

loss of RNA

primer in

lagging

strand

La telomerasa extiende el extremo 3´

Page 51: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

El acortamiento o mal funcionamiento de los telómeros contribuyen a la inestabilidad genómica

O´Sullivan & Karlseder,

Nature Rev MCB 2010

Las proteínas RAP1, TRF2 y POT1 son

componentes de un complejo que se une y

protege a los telómeros del ataque de

nucleasas y de la activación de sistemas de

detección de daños al ADN (MRN, ATM).

Cuando esta protección falla, se activan los

sistemas de detección de doble corte del

ADN y de reparación (ej. NHEJ).

NHEJ: Non Homologous End Joining

NHEJ

detección de

doble corte

Page 52: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

La disfunción de los telómeros y/o la ruptura de cromosomas conducen a ciclos de ruptura y fusión que aumentan la inestabilidad genómica

inactivaciones de checkpoints,

ej. mutación de ATM/ATR

Los ciclos de ruptura y fusión de cromosomas inducen alteraciones masivas en la estructura de los

cromosomas (translocaciones, deleciones, cromosomas acéntricos y dicéntricos, etc) que se denominan

genéricamente Inestabilidad cromosómica estructural. y que en células normales inducen la apoptosis.

Page 53: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

La re-expresión de la telomerasa limita la inestabilidad genómica y contribuye a la inmortalización de las células tumorales

a) La senescencia replicativa de una célula normal es inducida por la pérdida de los telómeros.

b) La re-expresión de la telomerasa en las células cancerosas le permiten escapar a la senescencia replicativa.

Los extremos de los cromosomas de vertebrados poseen numerosas copias de la secuencia TTAGGG (5-20 Kb),

agregadas por la enzima telomerasa. La telomerasa deja de expresarse en la mayoria de las células somáticas.

Aproximadamente el 80-90% de los cánceres muestran una reactivación de la expresión de la telomerasa.

telomerase telomerase

acortamiento de

los telómeros

telomerasa

3’5’

Odago & Gerson, 2003

telomerase

inhibitiontelomerase

re-expression

Page 54: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Senescencia replicativa

Los fibroblastos humanos dejan de proliferar después de ~50-60 divisiones (símbolos verdes) debido a la

erosión de los telómeros. Este estado se conoce como “senescencia replicativa”. La expresión forzada

de la enzima telomerasa extiende significativamente el potencial replicativo (símbolos rojos).

Fibroblastos transfectados con telomerasa

Fibroblastos controles no transfectados

Dos barreras distintas limitan la proliferación de la mayoría de las células normales: la senescencia

replicativa y un estado de crisis que desencadena la apoptosis. Ambas dependen de p53. Mutaciones

de p53 en las células cancerosas eliminan estos sistemas de resguardo a la proliferación ilimitada.

Page 55: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

p53 es un sensor de la inestabilidad cromosómica estructural

BFB = "Breakage-Fusion-Breakage" (ciclos de ruptura y fusión)

La inestabilidad de los telómeros y la exposición de extremos de la doble hebra del DNA inducen la

apoptosis por medio de la activación de proteínas de checkpoint (ATM, ATR, Chk1/2 y p53). Las células

cancerosas evitan la apoptosis mediante la mutación de p53 y la re-expresión de la telomerasa.

La inactivación de p53 favorece la inestabilidad genómica

estructural y los ciclos de ruptura y fusión de cromosomas.

(p21, Bax, Puma)

p53

p53

Zivotovsky & Kroemer, Nature Rev Mol Cel Biol 2004

Page 56: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

La poliploidía y aneuploidía es común en cáncer. Puede resultar por defectos en la mitosis, fusión celular y

endomitosis. Estas alteraciones activan apoptosis mediada por p53. En células cancerosas la apoptosis

puede ser inhibida por inactivación de p53 y/o la sobre-expresión de miembros de la familia de Bcl-2.

p53 también es un sensor de lainestabilidad cromosómica numérica

Zivotovsky & Kroemer, Nature Rev Mol Cel Biol 2004

(multiplicación

del número

haploide >2n)

(multiplicación

incompleta del

número haploide)

Page 57: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

estabilización

y localización

nuclear

p21CIP Cdk2

degradación en

el proteosoma

proteínas pro-apoptóticas (Bax,BID,

PUMA, noxa, receptores de Fas)

G1/S

Cdc25 G2/MCdk1

Cdk4/6 Rb E2F

Resumen de funciones de p53

ATM/ATR

Chk1/2

p53

inactivación de proteínas anti-apoptóticas (Bcl2, Bcl-xl)

activación de proteínas pro-apoptóticas (BAX y BAK)

efectos

independientes

de transcripción

transcripción estrés oncogénico

ras, myc, E2Fp19

ARF

inestabilidad

genómica

Daño al DNA

Page 58: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

El contexto y el genotipo celular influyen sobre

las vías activadas por p53

contexto celular (señalización)

- factores de crecimiento, citoquinas, etc

- integrinas

- caderinas adhesión

↑ p53

arresto temporario

apoptosis

genotipo (alteraciones en genes reguladores del ciclo celular y la apoptosis)

hiperactividad

oncogénica

inestabilidad

cromosómica

daño del DNA,

acortamiento de

telómeros

senescencia

Page 59: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

a. Los tumores secretan VEGF, un potente factor

que induce la angiogénesis a partir de capilares

pre-existentes.

b. Un evento temprano de la angiogénesis es la

disociación de los pericitos y la dilatación de

los capilares.

c. Las células endoteliales degradan la membrana

basal e invaden el estroma.

d. Inducidas por factores del estroma, las células

endoteliales migran y proliferan.

e. Las células endoteliales se adhieren entre sí,

generan una membrana basal y reclutan pericitos

que se asocian a la pared del nuevo capilar

formado.

Berger & Benjamin, Nature Cancer Rev 2003

La capacidad de inducir angiogénesis es esencial para elcrecimiento y propagación de los tumores sólidos

pericito

Angiogénesis es el proceso de formación de vasos a partir de capilares pre-existentes.

Page 60: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Los tumores sólidos benignos crecen como nódulos avasculares. En la mayoría de los casos se estabilizan en un estado

de latencia ("dormancy") en el cual el tumor no crece en tamaño (a). Eventualmente, dependiendo del tipo de tumor y del

micro ambiente, la masa celular puede incrementar drásticamente si adquiere la capacidad de inducir la angiogénesis

("switch" angiogénico). Los vasos nuevos inducidos por los tumores son frágiles, irregulares y tortuosos produciendo

hemorragias e inflamación.

Berger & Benjamin, Nature Cancer Rev 2003

Page 61: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

El "switch" angiogénico depende de un balance entre numerosos factores pro-angiogénicos y anti-angiogénicos

Berger & Benjamin, Nature Cancer Rev 2003

TGF-b

Thrombospondin-1 MMP9 VEGF VEGFRendothelial cell proliferation

and migration

RPTP

ECM

TGF-b

ECM

degradation

products

plasminogen

fragment

Page 62: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Que dispara

el "switch"

angiogénico?

hipoxia

p53

acumulación del factor

de transcripción HIF-1

(hypoxia-inducible factor-1)

↑ factores pro-angiogénicos (VEGF)

↑ genes pro-invasivos (receptor met)

↓ factores pro-angiogénicos, HIF-1

↑ factores anti-angiogénicos

normoxia

↑HIF-1

HIF-1 proteosoma

OHVHL

En condiciones de oxígeno normal el factor de transcripción HIF-1 es hidroxilado en prolinas y ubiquitinado por

la proteína supresora de tumores VHL (von Hippel-Lindau), siendo continuamente degradado en proteosomas.

En condiciones de hipoxia y/o inactivación de VHL, HIF-1 se acumula y activa transcripción de factores pro-

angiogénicos. La proteína supresora de tumores p53 reprime la expresión de VEGF y promueve la expresión

de Trombospondin-1 y HIF-1, por lo tanto mutaciones que inactivan a p53 también facilitan que se dispare la

angiogénesis.

HGF/SF

met (RTK)

↑ migración

Page 63: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Metástasis refiere a la capacidad de las células

tumorales de colonizar tejidos distantes al tumor

primario y generar tumores secundarios.

El proceso progresa por

diferentes fases:

1) invasión local del estroma

2) intravasación

3) circulación

4) arresto y extravasación

5) colonización

tumor

estroma

invasión, intravasación

nodos

linfáticos

Steeg, Nature Med 2006

La colonización depende de

interacciones recíprocas entre

las células tumorales y diversas

células en el microambiente de

tejido distante.

extravasación, colonización

Page 64: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

El comportamiento invasivo (maligno) de las células involucra:

cambios en la adhesión (caderinas, integrinas)

proteólisis local (proteasas de la matriz)

migración (señalización, reguladores del citoesqueleto, etc)

Page 65: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Ensayos in vitro para evaluar la invasión

Page 66: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

células de carcinoma

de colon humano

implante

ortotópico

(intestino)

implante

heterotópico

(músculo)

metástasis

Estudios in vivo

El implante heterotópico inhibe la metástasis en el órgano huésped.

En contrast, el implante ortotópico facilita el proceso de metástasis

Page 67: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Transiciones epitelio-mesénquima marcan el inicio de la invasión de carcinomas

El proceso de EMT de las células epiteliales

involucra la pérdida de los contactos

intercelulares, la pérdida de la polaridad y la

adquisición de un fenotipo migratorio e invasivo.

EMT ocurre normalmente durante el desarrollo, por ej. durante gastrulación, delaminación de las células de la cresta neural,

etc. También ocurre EMT fisiológicamente como resultado a injuria de epitelios (cicatrización o “wound healing”).

Rowe & Weiss ARCDB 2009

Page 68: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Savagner, Bioessays 2001

Experimentos in vitro muestran que diversas señalesextracelulares inducen EMT

colágeno,

TGFb

Células de carcinoma exhiben EMT cuando se las estimula con distintos factores de

crecimiento extracelulares (TGFb, EGF, HGF, etc) y con componentes de la matriz extracelular.

Page 69: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Las señales externas inducen EMT mediante la activación de factores de transcripción específicos

Kang & Masagué, Cell 2004

cytokines

Los factores de transcripción Twist,

Snail y SIP1 reprimen la transcripción

de la caderina-E y activan la

transcripción de proteínas pro-invasivas

como la caderina-N, fibronectina, etc.

Page 70: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Friedl & Wolf, Nature Rev Can 2003

migración en 3-D. Adhesión, proteólisis, contracción dependiente de actina-miosina

Page 71: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Las células invasivas manifiestan cambios en la expresión de moléculas de adhesión

integrinas: Las células tumorales expresan integrinas promiscuas, que

reconocen diversas moléculas de la matriz extracelular, por ej. a3b1, avb3

reconocen el motivo RGD en fibronectina, vitronectina y otras.

caderinas: Un rasgo característico de carcinomas es la supresión de la

expresión de las caderinas-E. Esto facilita la migración de las células tumorales.

La re-expresión de caderina-E inhibe la invasividad en algunos tumores.

la proteólisis pericelular controlada de la matriz exponen sitios

crípticos RGD reconocidos por las integrinas a3b1 y avb3.

a3b1 interacciona con laminina, fibronectina y colágeno.

avb3 interacciona con fibronectina, vitronectina, colágeno, trombospondina.

Page 72: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

La invasión requiere de la degradación localizada de la matriz

Las células del microambiente tumoral secretan proteasas que degradan la matriz

y favorecen la invasividad. Las proteasas extracelulares se agrupan en dos familias:

(1) Metaloproteinasas

de la matriz (MMP)

colagenasas instersticiales degradan colágenos fibrilares

estromelisinas degradan fibronectina, proteoglicanos, col IV

gelatinasas (colagenasas tipo IV) degradan col IV, fibronectina, elastina

su actividad depende de iones zinc

o calcio

Las tres clases de metaloproteinasas poseen inhibidores endógenos (tissue inhibitors of metalloproteinasas = TIMPs)

(2) Serine

proteases Activadores del plasminógeno (PAs). Hay 2 tipos:

- laminina

- fibronectina

- colágeno IV

- vitronectina

uPA: urokinase-plasminogen activator asociada a receptores de superficie (uPAR)

tPA: tissue-type plasminogen activator secretada

las serpinas son inhibidores de las serine proteases

uPA o tPA plasminógeno plasmina activa la plasmina degrada

Page 73: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

La invasión involucra un intercambio de señales secretadas

por las células del microambiente del tumor

Liotta & Kohn, Nature 2001

El carcinoma invasivo es considerado una

patología de poblaciones celulares diversas

que habitan el microambiente del tumor.

La transición a un carcinoma invasivo es

precedida por la activación de fibroblastos,

células endoteliales y del sistema inmune

que liberan enzimas, citoquinas y factores

de crecimiento en una zona localizada

denominada "frente de invasión".

Page 74: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

1) Los fibroblastos secretan HGF/SF que

estimulan la motilidad de las celulas tumorales

a través de los receptores c-Met.

2) Las células tumorales secretan VEGF y

bFGF, los cuales se unen a receptores en las

células endoteliales e inducen angiogénesis.

3) Los fibroblastos y las células endoteliales

producen enzimas latentes como MMPs y uPA,

que son activadas en contacto con el

invadopodio de la célula tumoral, y degradan

la ECM y los ectodominios de las caderinas,

promoviendo la invasión.

4) La degradación de la ECM libera factores

como el TGFb y el EGF los cuales promueven

angiogénesis y la proliferación de la célula

tumoral.

5) La degradación de la ECM expone sitios

RGD reconocidos por integrinas involucradas

en la motilidad.

6) Las vias activadas en la célula tumoral

generan señales de proliferacion, motilidad y

anti-apoptóticas. Por ejemplo, la activación

de los receptores Met, EGFR e integrinas

activan FAK, PI-3K, MLCK, GTPasas rho, etc.

Interacciones moleculares en el microambiente de invasión

Liotta & Kohn, Nature 2001

3

3

2

1

4

3

5

6

Page 75: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Dado que el cáncer es en gran parte una enfermedad

genética debería ser posible su clasificación en base al

perfil de expresión específico del transcriptoma.

Los chips de DNA permiten analizar niveles de mRNA a

escala global (transcriptoma)

La tipificación del cáncer es importante para decidir la terapia a aplicar.

Actualmente dicha clasificación se basa en la historia clínica del paciente,

la histología del tumor y la expresión de marcadores bioquímicos.

Page 76: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

La hibridización comparativa de mRNAs se emplea para detectarcambios en expresión de genes

El chip o microarreglo de DNA consiste en una matriz de

cDNAs u oligonucleótidos pertenecientes a una colección de

genes, cuya posición en el arreglo es conocida. Los chips se

hibridizan con una mezcla de cDNAs de muestras de

referencia y experimentales marcadas con fluorescentes

diferentes. Los datos obtenidos se emplean para construir

perfiles de expresión en relación a una determinada

condición o tratamiento.

cDNA de muestra de referencia (ej. individuo sano)

cDNA de muestra experimental (ej. individuo enfermo)

++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++gen1 gen2 gen3 gen4 gen5

fijación de

oligonucleótidos

o cDNA

gen1 gen2 gen3 gen4 gen5

hibridización con

cDNA marcado

++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++

resultado

Page 77: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

MBC Alberts et al 4th ed, p378

Patrones de expresión génica en distintos tipos de cáncer

En este chip se analizan los niveles de expresión

de 1800 genes (ordenados en hileras horizontales)

en 142 tumores obtenidos de pacientes diferentes

y agrupados de acuerdo al órgano que afectan

(columnas verticales).

conclusión 1: el nivel de expresión de cada

gen varía en los distintos tumores (hilera de

barras ordenadas de izquierda a derecha).

conclusión 2: cada tipo de tumor expresa

un perfil de expresión génica característico.

Cada rectángulo (ver inserto) indica el nivel de

expresión de un gen particular en un tumor

determinado, el rojo indica que la expresión es

mayor que el promedio; el verde que es

inferior al promedio y el negro indica un

valor de expresión promedio.

Esta información puede ser empleada para

tipificar células cancerosas de origen

desconocido comparando sus transcriptomas

con el de tumores conocidos.

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De un chip de 6817 genes humanos

se identificó un grupo de 50 genes

que se expresan diferencialmente en

leucemia mieloide aguda (AML) y

leucemia linfoblástica aguda (ALL).

Golub TR et al, Science 286,1999

Este estudio demuestra que el perfil

genético basado en microarrays

puede ser aplicado para tipificar

distintos tumores.

genes:Perfiles transcripcionalesde dos tipos de leucemia (AML y ALL)

Page 79: Se inicia cuando una célula experimenta una alteración ... · epigenética que le confiere ventajas selectivas para crecer y multiplicarse. Se disemina subvirtiendo mecanismos que

Alizadeh et al, Nature 2000

Los linfomas DLBCL son agresivos y clínicamente

heterogéneos. El análisis de microarreglos de DNA

revela la expresión coordinada de genes en distintas

muestras de DLBCL. Por ej. genes que se expresan

en centros germinales de células B tienen un patrón

de expresión diferencial en dos tipos de linfomas, FL y

CLL. Cada columna vertical representa una muestra

de RNAm y cada hilera horizontal representa un gen.

Niveles de expresión inferiores o superiores a la media

se representan en verde y rojo, respectivamente

Perfiles transcripcionales de linfomas difusos de células B grandes (DLBCL)96 muestras de diferentes linfomas

~19

.000 g

enes

FL: Follicular lymphoma

CCL: Chronic Lymphocytic lymphoma

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De un chip de ~25.000 genes humanos se identificaron ~5000 genes que se expresan diferencialmente en 98 tumores primarios

de mama. De estos se seleccionaron 70 genes cuya expresión (rojo indica sobreexpresión, verde indica subexpresión) se

emplea como un “patrón marcador” para pronosticar metástasis en biopsias de 78 tumores de mama (hileras horizontales). Los

genes fueron ordenados de acuerdo a sus coeficientes de correlación en dos grupos: buen pronóstico o mal pronóstico.

van 't Veer et al Nature 2002

Perfiles transcripcionales asociados a metástasisCáncer de mama

genes (70)

buen pronóstico,

no metástasis

en >5 años

Mal pronóstico,

metástasis

en <5 añostu

mo

res (

78)

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from Jake Youngberg

Expectativa para un futuro cercano…