informe final de proyecto - nasdap.ejgv.euskadi.eus · informe técnico final papacid 2 desarrollo...

Informe técnico final PAPACID 1

Informe final de proyecto

Desarrollo de variedades de patata a partir de material nativo

Centro: NEIKER

Participantes:

Jose Ignacio Ruiz de Galarreta ([email protected])

Enrique Ritter, Javier Pascualena

Entidades participantes:

Centro Internacional de la Papa (CIP)

Cabildo de Tenerife

Año 2006


Desarrollo de variedades de patata a partir de material nativo

1.- Introducción El objetivo principal del presente proyecto se ha centrado en inicio de un proceso de caracterización y conocimiento de la agrobiodiversidad existente en variedades de papas nativas. Además del principal centro de biodiversidad de estos cultivares en la región andina, concretamente en España, también existen algunos microcentros con diversidad de papas nativas, como son las Islas Canarias, donde los agricultores han mantenido, y posiblemente diversificado, el material genético originalmente introducido. Las variedades de papas nativas poseen cualidades extraordinarias, entre otras, valores nutritivos superiores, altos contenidos de materia seca y de antioxidantes y una gran variabilidad de contenido de azúcares reductores. A pesar de esto, la gran parte de los consumidores, a excepción de los locales y muy cercanos a las zonas de producción alto-andinas e Islas Canarias, desconocen la existencia de la enorme variabilidad existente en dichas papas, su alto valor añadido alimenticio, su calidad y su gran potencial para el desarrollo de la agro-industria de estos países. Siguiendo estas premisas, se planteó desde el CIP (Centro Internacional de la Papa) el presente proyecto para la potenciación del uso de las papas nativas y ampliar los conocimientos existentes en estos cultivares. Dentro de los objetivos planteados en el presente proyecto, las acciones llevadas a cabo por NEIKER y los Cabildos Insulares de Tenerife y La Palma durante el trienio 2004-2006 han sido las que se detallan a continuación. 1.- Cooperación e intercambio entre los organismos que poseían papas nativas como el CIP de Perú, Cabildo de Tenerife y NEIKER 2.- Prospección y recuperación de variedades de papas nativas de Canarias 3.- Incorporación de variedades de papas nativas del CIP 4.- Evaluación de cruzamientos de papas nativas con genitores CIP 5- Caracterización morfológica de papas nativas de Canarias 6.- Caracterización molecular de papas nativas canarias 7.- Variantes alélicas asociadas a genes de resistencia en papas nativas del CIP 2.- Cooperación entre el CIP, Cabildo de Tenerife y NEIKER En el año 2004 se realizó un viaje al Centro Internacional de la Papa (CIP) en Lima con el objeto de establecer los contactos con el grupo de investigación del CIP y conocer de forma inherente la situación de las papas nativas andinas. Para ello se realizaron una serie de conferencias en la Estación central del CIP en Lima con el fin de intercambiar las actividades que se desarrollaban en ambos Centros en relación con las papas nativas. También se expusieron los programas de mejora genética y obtención de variedades levadas a cabo en ambos Institutos. En dicho viaje se realizó una visita a la Estación del CIP en Huancayo, asistiendo a una conferencia sobre la ‘Conservación de la diversidad de papas en la comunidad agrícola’ (Stefan de Haan).


Seguidamente se realizó el viaje a Huancavelica para ver ‘in situ’ el manejo de variedades de papa nativas por parte de agricultores colaboradores. En 2006 se realizó otro viaje al CIP de Lima para realizar la segunda reunión de coordinación del proyecto. El encuentro se inició con una serie de ponencias en la Estación central del CIP en Lima a cargo de los participantes del proyecto describiendo las actividades realizadas. A continuación se procedió a la visita a los laboratorios de Sistema de Información Geográfica (GIS), marcadores moleculares, calidad y nutrición y Banco de Germoplasma. Además se concertaron los siguientes encuentros con el Dr. Charles Crissman, Director General de Investigación del CIP y Mr. Carlos Alonso, Director de Finanzas y administración del CIP. Seguidamente se realizó el viaje a Ayacucho (500 km de Lima). El objetivo era visitar los campos de ensayo de las poblaciones obtenidas y seleccionadas tras cruzamientos sucesivos con variedades nativas de patata, los cuales estaban. situados en torno a los 4000 m de altitud. Asimismo, nos trasladamos hasta un campo de multiplicación de 200 variedades locales de Ayacucho, las cuales eran identificadas con un Ingeniero perteneciente al INIA del Perú. Tras dos días de estancia, a la mañana siguiente se regresó a Lima, iniciando la última reunión con el fin de realizar un ‘feed back’ y tratar de futuras colaboraciones. 3.- Prospección y recuperación de variedades de papas nativas de Canarias En 2004 y 2005 se incorporaron a la colección de variedades locales de NEIKER, un total de 47 y 19 entradas pertenecientes a Tenerife, y La Palma, respectivamente, las cuales aparecen con su código en la Tabla 1. Durante 2006 se añadieron 24 nuevas entradas procedentes de Tenerife (Tabla 2) con lo que se completó la prospección por parte de Canarias de las principales variedades locales de patata de dichas islas. Actualmente, se dispone de un total de 71 y 19 entradas pertenecientes a Tenerife y La Palma, respectivamente. A partir de los resultados obtenidos tras la evaluación de enfermedades, principalmente virosis detectadas en el conjunto de las entradas, se continúa con el tratamiento de termoterapia y posterior cultivo de meristemos para concluir el saneamiento de todo el conjunto de las variedades, su micropropagación y posterior mantenimiento mediante cultivo in vitro. A la conclusión de este proceso se enviará una copia de la colección a los Cabildos Insulares para mantener un duplicado de las mismas


Tabla 1.- Variedades de papas nativas de Canarias incorporadas al Banco de Germoplasma de NEIKER en 2004 y 2005.

Entradas Tenerife

Código

Tipo varietal

Lugar de recolección

Entradas La Palma

Tipo varietal

Lugar de

recolección

c.v.1 BbO Bonita Blanca La Orotava PS-LP1 Marciala La Piedra, Garafia c.v.2 BnO Bonita Negra La Orotava PS-LP2 Marciala La Piedra, Garafia

c.v.3 BcO Bonita Colorada La Orotava PS-LP3 Corralera Buena Vista, Breña

Alta c.v.4 BpO Bonita Ojo de Perdiz La Orotava PS-LP4 Moruna La Piedra, Garafia c.v.5 CoO Colorada de baga La Orotava PS-LP5 Marciala La Piedra, Garafia

c.v.7 AnT Azucena Negra Tacoronte PS-LP6 Corralera Buena Vista, Breña

Alta c.v.8 AbT Azucena Blanca Tacoronte PS-LP7 Cecilia La Piedra, Garafia c.v.9 NbT Blanca Negra Tacoronte PS-LP8 Cecilia La Piedra, Garafia

c.v.10 CoE Colorada de baga El Rosario PS-LP9 Conejera Buena Vista, Breña

Alta

c.v.11 T-E Terrenta El Rosario PS-LP10 Marciala Buena Vista, Breña

Alta c.v.15 AnB Azucena Negra Buenavista PS-LP11 Malgara La Piedra, Garafia

c.v.18 MIB Melonera Buenavista PS-LP12 Conejera Buena Vista, Breña

Alta

c.v.19 LbB Peluca Blanca Buenavista PS-LP13 Corralera Buena Vista, Breña

Alta c.v.20 LnB Peluca Negra Buenavista PS-LP14 Negra La Piedra, Garafia c.v.21 BnR Bonita Negra Los Realejos PS-LP15 Corralera La Piedra, Garafia c.v.24 MbR Marrueca Blanca Los Realejos PS-LP16 Marciala La Piedra, Garafia c.v.25 LrM Peluca Rosada La Matanza PS-LP17 Marciala La Piedra, Garafia

c.v.27 BnG Bonita Negra La Guancha PS-LP18 Colorada Buena Vista, Breña

Alta

c.v.30 BIG Bonita Llagada La Guancha PS-LP19 De año Buena Vista, Breña

Alta c.v.31(pl1) BpG Bonita Ojo de Perdiz La Guancha c.v.31(pl2) BpG Bonita Ojo de Perdiz La Guancha c.v.31(pl3) BpG Bonita Ojo de Perdiz La Guancha c.v.32 MaG Marrueca La Guancha c.v.33 BoL Borralla La Laguna c.v.35 PcS Palmera Colorada Santa Cruz c.v.36 PIS Palmera Lagarteada Santa Cruz c.v.37 G-S Brasileña o Grasileña Santa Cruz c.v.39 N-F Negra Fasnia c.v.41 VnF Venezolana Negra Fasnia c.v.44 BcR Bonita Colorada Los Realejos c.v.50 CoR De Baga Los Realejos c.v.51 AnG Azucena Negra La Guancha c.v.52 AbG Azucena Blanca La Guancha c.v.53 CoG Colorada de Baga La Guancha c.v.56 MoL Moras La Laguna


c.v.57 PnF Palmera Negra Fasnia c.v.58 PcF Palmera Colorada Fasnia c.v.59 PbF Palmera Blanca Fasnia c.v.60 (b) LrO Peluca Rosada La Orotava c.v.60 (pl 4) LrO Peluca Rosada

La Orotava

c.v.60 LrO Peluca Rosada La Orotava c.v.61 T-T Terrenta Tacoronte c.v.62 LbO Peluca Blanca La Orotava c.v.62 (pl 5) LbO Peluca Blanca

La Orotava

c.v.62 (pl 6) LbO Peluca Blanca

La Orotava

c.v.63 N-T Negra Yema de Huevo

Tacoronte

c.v.64 NoT Negra Oro Tacoronte

Tabla 2.- Variedades de papas nativas recolectadas en Tenerife en 2006.

Entradas Tenerife 2006 Tipo varietal Lugar de recolección c.v.69 Colorada Blanca El Rosario c.v.71 Moruna La Matanza c.v.73 Venezolana Blanca El Rosario c.v.78 Borralla Colorada La Laguna c.v.79 De María La Matanza c.v.81 Liria Santa Cruz c.v.83 Morada Santa Cruz c.v.84 Colombiana Tacoronte c.v.85 Matancera Tacoronte

c.v.86 Bonita Ojo de Perdiz Pl. 1 La Guancha

c.v.87 Bonita Ojo de Perdiz Pl. 2 La Guancha

c.v.94 Del Riñon Los Realejos c.v.95 Borrega Los Realejos c.v.96 Londrera San Juan de la Rambla c.v.104 Rafaela Los Realejos c.v.106 Rafaela Los Realejos c.v.107 Palmera Negra Fasnia c.v.109 Negra Mora Fasnia c.v.112 Del Riñon San Juan de la Rambla c.v.113 Del Clavo Los Realejos c.v.114 Siete Cueros Los Realejos c.v.115 De María Los Realejos c.v.116 Rafaela Los Realejos c.v.117 De María Tacoronte


4.- Incorporación de variedades de papas nativas del CIP Durante el presente año y tras el envío en 2005 por parte del Centro Internacional de la Papa (CIP) en Lima de un conjunto de papas nativas andinas para conocer su adaptación a nuestras condiciones, se ha realizado la segunda multiplicación mediante micropropagación y trasplante posterior a maceta con el fin de disponer mayor cantidad de tubérculos para poder realizar su caracterización posterior e inicio de un programa de cruzamientos. Con ello se persigue el establecimiento de poblaciones base de referencia para la mejora de la calidad y adaptación de las papas nativas. Actualmente se dispone de suficiente cantidad de tubérculos del material que se detalla en la Tabla 3 para evaluaciones posteriores agronómicas, frente a patógenos y de calidad.


Tabla 3.- Variedades de papas nativas de Perú multiplicadas en NEIKER en 2005 y 2006.

COD. NEIKER COD. CIP VARIEDAD ESPECIE PAIS

NKD-164 CIP 704481 AMARILLA S. stenotonum Perú

NKD-127 CIP 701165 CALHUA ROSADA S. stenotonum Perú

NKD-159 CIP 703461 CAMUSA S. andigena Venezuela NKD-148 CIP 703287 CCECCORANI S.stenotonum Perú NKD-132 CIP 701570 CHAUCHA S. phureja Perú

NKD-151 CIP 703305 CHIAR SURIMANA O PHIÑU S. chaucha Bolivia

NKD-160 CIP 703477 CHIMBINA S.andigena Perú NKD-133 CIP 702305 CHIMI LUCKI S. juzepczukii Bolivia NKD-163 CIP 704327 COLOR UNCKUNA S. chaucha Perú NKD-156 CIP 703365 HOLANDESA S.andigena Colombia NKD-128 CIP 701241 HUAGALINA S.andigena Perú NKD-139 CIP 702802 JANCKO AJAWIRI S. ajawiri Bolivia

NKD-155 CIP 703352 KASHPADANA AMARILLA S. goniocalix Perú

NKD-138 CIP 702683 LARAM AJAWIRI S. ajawiri Bolivia NKD-144 CIP 703258 LARAM CANCHALI S. juzepczukii Perú

NKD-152 CIP 703312 MORADA TURUNA S. stenotonum Perú

NKD-140 CIP 702815 MORAR NAYRA MARI S. stenotonum Perú

NKD-130 CIP 701273 MURO SHOCCO S.andigena Perú NKD-136 CIP 702464 NATIN SUITO SxG* Colombia NKD-161 CIP 703671 NEGRITA S.andigena Perú NKD-126 CIP 701127 OJO DE BUEY S.andigena Perú

NKD-158 CIP 703421 POLUYA S. stenotonum Perú

NKD-131 CIP 701524 PUCA HUAYRO S. chaucha Perú NKD-145 CIP 703264 PUCA QUITISH S.andigena Perú NKD-134 CIP 702316 PULU S.andigena Bolivia NKD-150 CIP 703291 ROSCA S. phureja Colombia

NKD-129 CIP 701243 SEÑORA WARNI S. stenotonum Perú

NKD-137 CIP 702535 SIPANCACHI S.andigena Bolivia NKD-135 CIP 702363 SOCCO HUACCOTO S. andigena Perú NKD-154 CIP 703316 UCHO CHAQUITAY SxG* Colombia NKD-141 CIP 702867 UNKNOWN S.andigena Perú NKD-147 CIP 703280 UNKNOWN S. goniocalix Perú NKD-153 CIP 703315 UNKNOWN S. goniocalix Perú NKD-157 CIP 703370 UNKNOWN S. andigena Colombia NKD-143 CIP 703248 WILA HUAKA LAJRA S.andigena Bolivia

NKD-149 CIP 703288 YANA PPOCCOYA S. stenotonum Perú


NKD-142 CIP 703197 YANA SUCRE S. stenotonum Perú

NKD-162 CIP 704218 YEMA DE HUEVO S. phureja Colombia NKD-146 CIP 703265 YURAC SOLE S.andigena Perú

5.- Evaluación de cruzamientos de papas nativas con genitores CIP A partir de los cruzamientos realizados por el CIP y el envío de las semillas a NEIKER de dos poblaciones en 2005, éstas fueron sembradas para obtener tubérculos con los que realizar la evaluación de las progenies. La Tabla 4 muestra clones de 1º año seleccionados durante el presente año.

Tabla 4. Clones seleccionados en 2006, provenientes de cruzamientos con papas nativas enviadas por el CIP.

Cod. NEIKER

Cod. CIP Genitor hembra Genitor macho

Semillas sembradas

Clones 1ºaño seleccionados

05/103 302279

88.108 Adg purple flesh bulk (*) 50 -

05/104 302280

ATLANTIC Adg purple flesh bulk (*) 50 10

05/105 302281

C91.612 Adg purple flesh bulk (*) 50 2

05/106 302282

C92.140 Adg purple flesh bulk (*) 50 -

05/107 302284

LR93.160 Adg purple flesh bulk (*) 50 -

05/108 302285

LT-8 Adg purple flesh bulk (*) 50 -

05/109 302286

MONALISA Adg purple flesh bulk (*) 50 4

05/110 302287

OREB Adg purple flesh bulk (*) 50 4

05/111 302288

PW-6065 Adg purple flesh bulk (*) 50 2

05/112 302289

PW-6187 Adg purple flesh bulk (*) 50 3

05/113 302290

SPUNTA Adg purple flesh bulk (*) 50 5

05/114 302295

88.108 Adg red flesh bulk (**) 50 3

05/115 302296

ATLANTIC Adg red flesh bulk (**) 50 18

05/116 302297

C91.612 Adg red flesh bulk (**) 50 12


05/117 302298

C92.140 Adg red flesh bulk (**) 50 5

05/118 302299

DELCORA Adg red flesh bulk (**) 50 13

05/119 302300

LR93.160 Adg red flesh bulk (**) 50 5

05/120 302301

LT-8 Adg red flesh bulk (**) 50 -

05/121 302302

MONALISA Adg red flesh bulk (**) 50 1

05/122 302303

OREB Adg red flesh bulk (**) 50 5

05/123 302304

PW-6065 Adg red flesh bulk (**) 50 2

05/124 302305

PW-6187 Adg red flesh bulk (**) 50 -

TOTAL 94

Se seleccionaron por formas, ciclo y adaptación un total de 94 clones procedentes de 16 familias, 9 de ellas cuyo genitor masculino estaba compuesto por una mezcla polen de variedades nativas selectas con tubérculo de color de pulpa roja y perteneciente a S. andigena, y 7 de la misma subespecie de color de pulpa morada. El genitor femenino está compuesto de variedades de S. tuberosum y progenitores CIP. Se seguirá el proceso de evaluación durante la próxima campaña para identificar genotipos selectos con características especiales agronómicas y de calidad. 6.- Caracterización morfológica de las papas nativas Canarias

Del conjunto de papas nativas de Tenerife y de La Palma, prospectadas antes del 2006, se realizó la caracterización morfológica de las primeras cuyo resultado se tradujo en la Tesis Doctoral del Dr. Domingo Rios ‘Caracterización morfológica y ecofisiológica de un grupo de cultivares locales de papas de Tenerife’, realizada en la Universidad de Santiago de Compostela. Los datos de las nuevas entradas caracterizadas en el año 2006 constituyen un Trabajo Fin de Carrera que actualmente se está realizando en la Universidad de La Laguna (Tenerife9 y cuya fecha de finalización se prevé para Febrero de 2007, al igual que las 19 variedades de papas nativas de la isla de La Palma. Asimismo se realizó en 2005 una evaluación de las principales virosis y bacteriosis del material prospectado (Tablas 5 y 6).

Tabla 5. Virus detectado mediante test ELISA en las variedades procedentes de Tenerife.

Entrada Tipo varietal Virus detectado c.v.1 Bonita Blanca PVS,PVA,PVV c.v.2 Bonita Negra PVY,PVS,PVM,PVA c.v.3 Bonita Colorada PVS,PVM,PVA,PVV c.v.4 Bonita Ojo de Perdiz PVS,PVM,PVA,PVV c.v.5 Colorada de baga - c.v.7 Azucena Negra PVY,PVM c.v.8 Azucena Blanca PVY,PVS,PVM


c.v.9 Blanca Negra PVY c.v.10 Colorada de baga - c.v.11 Terrenta PLRV,PVS c.v.15 Azucena Negra PVY,PVM c.v.18 Melonera PLRV,PVA,PVV c.v.19 Peluca Blanca PLRV,PVA c.v.20 Peluca Negra PVS c.v.21 Bonita Negra PVY,PVM c.v.24 Marrueca Blanca PVS,PVM,PVV c.v.25 Peluca Rosada PVY,PVS,PVM c.v.27 Bonita Negra - c.v.30 Bonita Llagada PVY,PVS,PVA c.v.31(pl1) Bonita Ojo de Perdiz - c.v.31(pl2) Bonita Ojo de Perdiz PVS,PVM,PVV c.v.31(pl3) Bonita Ojo de Perdiz PVA,V,PVS c.v.32 Marrueca PVX,PVS,PVA,PVV c.v.33 Borralla PVA,PVV c.v.35 Palmera Colorada PVX,PVS,PVA c.v.36 Palmera Lagarteada PVX,PVS,PVA,PVV c.v.37 Brasileña o Grasileña PVX,PLRV,PVS,PVA c.v.39 Negra PVY c.v.41 Venezolana Negra PVY c.v.44 Bonita Colorada PVX, PLRV,PVS,PVA,PVV c.v.50 De Baga PVY,PLRV,PVS,PVA c.v.51 Azucena Negra PVY,PVS,PVM c.v.52 Azucena Blanca PVY,PVS c.v.53 Colorada de Baga PVS,PVA,PVV c.v.56 Moras PVX,PLRV,PVS c.v.57 Palmera Negra PLRV,PVX, PVS c.v.58 Palmera Colorada PVY,PVX,PLRV,PVS c.v.59 Palmera Blanca PVY, PLRV, PVX, PVS c.v.60 (b) Peluca Rosada PLRV,PVS,PVV c.v.60 (pl 4) Peluca Rosada - c.v.60 Peluca Rosada PVX,PLRV,PVS,PVA,PVV c.v.61 Terrenta PVY,PVS c.v.62 Peluca Blanca PVS,PVM c.v.62 (pl 5) Peluca Blanca PVY,E,PVS,PVM c.v.62 (pl 6) Peluca Blanca PVS,PVM c.v.63 Negra Yema de Huevo PVY c.v.64 Negra Oro PVA

*Todos los cultivares resultaron negativos a las bacteriosis Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus y Ralstonia solanacearum


Tabla 6. Análisis sanitario mediante test ELISA de las variedades procedentes de La Palma.

Entrada Tipo varietal Virus detectado PS-LP1 Marciala PLRV, PVV, PVS PS-LP2 Marciala PVS,PVA PS-LP3 Corralera - PS-LP4 Moruna PLRV PS-LP5 Marciala - PS-LP6 Corralera - PS-LP7 Cecilia PVX PS-LP8 Cecilia PVX PS-LP9 Conejera PLRV, PVS PS-LP10 Marciala PVX,PVA PS-LP11 Malgara - PS-LP12 Conejera PVY,PLRV,PVS,PVA,PVM PS-LP13 Corralera PVX PS-LP14 Negra PVX PS-LP15 Corralera PVX PS-LP16 Marciala PVX,PVS,PVA PS-LP17 Marciala PVA PS-LP18 Colorada PVA, PVV, PVS PS-LP19 De año -

*Todos los cultivares resultaron negativos a las bacteriosis Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus y Ralstonia solanacearum 7.- Caracterización molecular de las papas nativas Canarias En 2005 se ha realizó la caracterización molecular mediante microsatélites de las 71 entradas de Tenerife y 19 de La Palma. En 2006 se incorporaron 24 nuevas entradas procedentes de Tenerife. Se han utilizado 19 marcadores SSR (Ghislain et al., 2004). El ADN fue extraído utilizando el kit DNAeasy Plant Mini kit de Quiagen (Valencia, USA). Los productos de amplificación se separaron en gel desnaturalizante al 6% (p/v). Los fragmentos se detectaron en un secuenciador LI-COR 4200-S1, siendo marcados los cebadores con fluorescencia IRD800 (LI-COR, Lincoln, Nebraska, USA). Los análisis estadísticos se realizaron utilizando el programa NTSYS v 2.0.

La Figura 1 muestra el dendrograma obtenido a partir de los 19 SSR utilizados y el

total de 90 entradas que reúnen todas las procedentes de Canarias. junto con el cv. Kenebec como referencia.


1 Ghislain, M., D.M. Spooner, F. Rodríguez, F. Villamón, J. Núñez, C. Vásquez, R. Waugh & M. Bonierbale. 2004. Selection of highly informative and user-friendly microsatellites (SSRs) for genotyping of cultivated potato. Theor. Appl. Genet. 108: 881-890

Se observa como se han incorporado las nuevas entradas a los grupos ya establecidos con el resto de variedades de Tenerife y La Palma, presentados en el informe correspondiente a 2005. De esta forma el grupo I ahora comprende un conjunto de entradas de Tenerife como son CV83 o Morada, CV116, CV104, CV106 (las tres Rafaelas), CV81 o Liria, CV79 (de María) y CV85 o Matanzera, éste último separado más claramente del resto de variedades. El siguiente grupo II estaría formado por el CV112 (Del riñón) de Tenerife al igual que el grupo III compuesto de la entrada CV95 o Borrega, caracterizada este año. El siguiente grupo IV engloba 3 entradas de Tenerife caracterizadas en 2006, CV113 o Del Clavo , CV84 (Colombiana) y CV115 o De María. El grupo V incluye un solo cultivar CV109 o Negra Mora. El grupo VI engloba dos cultivares de la Isla de la Palma, PS-LP14 (Morada) y PS-PL7 (Cecilia), aunque ambos se unen a un coeficiente de similitud inferior a 0,80. Las entradas PS-LP11 (Malgara) y PS-LP8 (Siciliana) se encuadran en el grupo VII junto con la variedad Kennebec, utilizada como control de S. tuberosum subsp. tuberosum. El grupo IX corresponde a las variedades de Tenerife Moras de la Laguna (Mol) y la Brasileña o Grasileña (G-S). Tres nuevos cultivares caracterizados este año CV117 (De Maria, Tacoronte), CV114 o Siete Cueros y CV94 (Del Riñón, Realejos) constituyen el grupo X. Un gran grupo, el XI engloba a un número amplio de cultivares y es el más heterogéneo, en el que se pueden apreciar tres subgrupos. El XI.I formado por dos cvs. de La Palma, PS-PL3 y PSPL6, ambas Corraleras (Colorada y Tijarafera, respectivamente). El XI.II compuesto por la entrada PS-LP9 o Conejera Blanca. El subgrupo XI.III, amplio y que encuadra una entrada PS-LP-13 (Corralera Legítima) que se separa del resto, junto con un grupo de las Terrentas de Tenerife, junto con el cv. de La Palma, PS-LP19 o De año. También aparecen las Azucenas (AbT, AnB, AnG, AbG, AnT), todas ellas similares y la Corralera Blanca de La Palma (PS-PL15). Para cerrar el grupo aparecen los cvs. Bonitas de Tenerife, siendo similares las entradas BpO, BiG, BnO, BnG, MbR, BnR, BbO y BcO junto con la Marrueca (MaG). Todas tienen en común pertenecer a la subsp. andigena. El siguiente grupo XII está formado por 3 subgrupos. El primero XII.I lo componen, por una parte los CV96 o Londrera y el CV69 (Colorada Blanca) caracterizados este año. Por otra parte se incluye un conjunto de cultivares Coloradas de Baga de Tenerife (CoG, CoO y CoE) junto con la Bonita Colorada (BcR), Bonita Ojo Perdiz (BpG) y los cvs. CV73 (Venezolana Blanca) y CV86 o de 2006 que aparecen todas como el mismo cultivar. También se incluye el cv. De Baga (CoR). Todas ellas pertenecientes a la subsp. andigena. El segundo subgrupo XII.II lo formaría el cv. Venezolana Negra (VnF) y el XII.III los cvs. Melonera (MIB) y Borralla (BoL), las cuales son aparentemente similares. El grupo XIII lo constituyen los cvs. denominados Negra Yema de Huevo (N-T), Blanca Negra (NbT) y Negra (N-E), los tres similares, junto con el cv. de la Palma PS-LP12 y la Negra Oro (NoT) que se separa algo más, todas ellas incluidas en la especie S. chaucha. El grupo XIV está formado el cv. denominado Palmera Lagarteada (PIS), y dos Palmeras Coloradas (PcS, PcF), los tres similares, además de el cv. Palmera Blanca (Pb) y Palmera Negra (PnF). A él se le unen los cinco cultivares de La Palma, PS-LP2, PS-LP5, PS-LP16, PS-LP10 y PS-LP17, todos ellos dentro de las denominadas Marcialas. El último grupo engloba a los cvs. tipo Peluca de Tenerife, LbO, LbB, LnB y LrM, muy similares, junto con el cv. LrO y los de La Palma PS-LP18 o Colorada, PS-LP1 (Jaragana) y PS-LP4 (Moruna), éste último más separado. El CV78 o Borralla Colorada se integra en el grupo pero claramente distanciado del mismo. Con estos análisis se da por concluida la


fase de caracterización molecular de la colección de papas de las Islas Canarias, centrada en Tenerife y la Palma.


Coefficient0.64 0.73 0.82 0.91 1.00

KENNEBEC

LbO LbB LnB LbO LbO LrM LrO LrO LrO PS-LP18 PS-LP1 PS-LP4 CV78 PIS PcS PcF PS-LP5 PS-LP17 PbF PS-LP16 PS-LP2 PnF PS-LP10 CV107 N-E NbT N-T PS-LP12 NoT MIB BoL VnF CoE BcR CoO CV73 BpG CoG CV86 BpG BpG CV87 CoR CV69 CV96 BcO


Coefficient0.64 0.73 0.82 0.91 1.00

KENNEBEC

BbO BnR MbR BnG BnO BIG BpO MaG AnT AnG AnB AbG AbT PS-LP15 T-E T-T PS-LP19 PS-LP13 PS-LP9 PS-LP3 PS-LP6 CV117 CV114 CV94 MoL G-S CV71 KENNEBEC PS-LP8 PS-LP11 PS-LP7 PS-LP14 CV109 CV115 CV84 CV113 CV95 CV112 CV83 CV116 CV104 CV106 CV81 CV79 CV85

Figura 1. Dendrograma conjunto de las variedades locales de patata de Tenerife y La Palma a partir de 19 marcadores SSR.


Las Tabla 7 y 8 muestran los alelos específicos encontrados en variedades de papas nativas o grupo de cultivares de la isla de Tenerife y La Palma, respectivamente.

Tabla 7. Variedad y grupo de alelos específicos detectados en papas nativas de Tenerife.

SSR Alelo específico [bp] Especificidad por variedad o grupo de cultivares

STM1053 172 Venezolana STM1031 278 Colorada de Baga

STM0037 72 Azucenas, Terrentas STM0030 157 Terrentas

STM0037 91 Moras/Grasileña

STPoAc 243 Moras/Grasileña STM1064 186 Moras/Grasileña STM0019 196 Moras/Grasileña STM1064 188 Todas las entradas excepto Moras/Grasileña

STM1017 137 Moras/Grasileña, Pelucas STM3012 198 Moras/Grasileña, Pelucas

STM2022 233 Moras/Grasileña, Borralla/Melonera STGBSS 133 Moras/Grasileña, Negras, Palmeras

Tabla 8. Variedad y grupo de alelos específicos detectados en papas nativas de La Palma

SSR Alelo específico

[bp] Especificidad por variedad o grupo de cultivares

STM2030 207 PS-LP1 y PS-LP18

STM2013 142 Todas las entradas excepto Corraleras (PS-LP3, PS-LP6 y PS-LP15)

STM1052 213 Todas las entradas excepto Cecilia (PS-LP7)

STM2022 185 Corralera tijarafera (PS-LP6) STM0037 75 Todas las entradas excepto PS-LP7 y PS-LP14 STM0037 84 Marcialas y PS-LP14 STM0037 91 Moruna

STM1104 164 Todas las entradas excepto PS-LP1 y PS-LP18 STM1106 156 Cecilia (PS-LP7)

STM0019 180 Marciala PS-LP10

STM0019 205 Todas las entradas excepto Corraleras (PS-LP3 y PS-LP6)

La Figura 2 muestra algunos polimorfismos encontrados en las variedades de Tenerife.


8.- Variantes alélicas asociadas a genes de resistencia en papas nativas del CIP Se realizaron unos estudios preliminares para identificar diferentes cDNAs que tenían altas homologías con genes involucrados en la resistencia a G. pallida. Estos estudios estaban basados (1) cDNA-AFLP diferencial incluyendo el análisis de grupos segregantes o BSA (Bulked Segregant Analysis) y (2) el análisis de microarrays (TIGR,10K chip) partiendo de poblaciones de mRNAs de control no infectado y después de la infección con G. pallida. El análisis de las variaciones alélicas se llevó a cabo con el fin de poder asociar la expresión de un carácter específico con un alelo en particular. Para ello se diseñaron 8 pares de primers basados en las secuencias de 7 genes expresados diferencialmente bajo la infección con G. pallida . Se obtuvieron productos de amplificacion en la mayoría de los casos (Tabla 9-11). Dos pares de cebadores para cDNA Lipoxygenase y una Pyruvate kinase, respectivamente, produjeron ambos dos bandas monomórficas. Los otros pares de cebadores generaron entre 2 y 4 alelos polimórficos. Sin embargo, la variación observada de estos genes no parece depender de la especie en particular.


Tabla 7. Variantes allelicas de genes implicados en la resistencia a G pallida.

cDNA: Lipoxygenase (S. tuberosum)

Resistance gene cluster

(potato)

Primers: BSCER1 BSCER5.1

Cod. CIP Variedad Especie NoB bp NoB bp

CIP 703291 ROSCA S. phureja 2 165, 167 1 357

CIP 701570 CHAUCHA S. phureja 2 165, 167 1 357

CIP 704218 YEMA DE HUEVO S. phureja 2 165, 167 2 357, 359

CIP 703264 PUCA QUITISH S.andigena 2 165, 167 2 355, 359

CIP 703265 YURAC SOLE S.andigena 2 165, 167 2 357, 359

CIP 701273 MURO SHOCCO S.andigena 2 165, 167 1 357

CIP 702867 UNKNOWN S.andigena 2 165, 167 2 355, 359

CIP 703248 WILA HUAKA LAJRA S.andigena 2 165, 167 2 357, 359

CIP 702316 PULU S.andigena 2 165, 167 2 357, 359

CIP 702363 SOCCO HUACCOTO S. andigena 2 165, 167 1 357

CIP 702535 SIPANCACHI S.andigena 2 165, 167 1 357

CIP 703365 HOLANDESA S.andigena 2 165, 167 1 359

CIP 703370 UNKNOWN S. andigena 2 165, 167 2 357, 359

CIP 703461 CAMUSA S. andigena 2 165, 167 1 357

CIP 703477 CHIMBINA S.andigena 2 165, 167 2 357, 359

CIP 703671 NEGRITA S.andigena 2 165, 167 2 357, 359

CIP 701127 OJO DE BUEY S.andigena 2 165, 167 1 355

CIP 701241 HUAGALINA S.andigena 2 165, 167 1 355

CIP 703305 CHIAR SURIMANA O PHIÑU S. chaucha 2 165, 167 2 357, 359

CIP 701524 PUCA HUAYRO S. chaucha 2 165, 167 1 357

CIP 704327 COLOR UNCKUNA S. chaucha 2 165, 167 2 357, 359

CIP 703312 MORADA TURUNA S. stenotonum 2 165, 167 1 357

CIP 703287 CCECCORANI S.stenotonum 2 165, 167 2 357, 359

CIP 703288 YANA PPOCCOYA S. stenotonum 2 165, 167 2 357, 359

CIP 701243 SEÑORA WARNI S. stenotonum 2 165, 167

CIP 702815 MORAR NAYRA MARI S. stenotonum 2 165, 167 2 355, 357

CIP 703197 YANA SUCRE S. stenotonum 2 165, 167 2 357, 359

CIP 703421 POLUYA S. stenotonum 2 165, 167 2 357, 359

CIP 704481 AMARILLA S. stenotonum 2 165, 167

CIP 701165 CALHUA ROSADA S. stenotonum 2 165, 167 1 355

CIP 703315 UNKNOWN S. goniocalix 2 165, 167 1 357

CIP 703352 KASHPADANA AMARILLA S. goniocalix 2 165, 167 3 355, 357,

359 CIP 703280 UNKNOWN S. goniocalix 2 165, 167

CIP 702802 JANCKO AJAWIRI S. ajawiri 2 165, 167 1 357

CIP 702683 LARAM AJAWIRI S. ajawiri 2 165, 167

CIP 702305 CHIMI LUCKI S. juzepczukii 2 165, 167 2 357, 359

CIP 703258 LARAM CANCHALI S. juzepczukii 2 165, 167

CIP 702464 NATIN SUITO SxG*(Crotalaria nitidula)

2 165, 167

CIP 703316 UCHO CHAQUITAY SxG*(Crotalaria nitidula)

2 165, 167 3 355, 357, 359

No of dif. Bands

2 165, 167 3 355, 357, 359


Tabla 8. Variantes allelicas de genes implicados en la resistencia a G pallida.

Pyruvate kinase

cytosolic (potato)

Sulfate adenylyltransferase met3-2

(potato)

cDNA: 36kDA porin II (potato)

Primers:

TC45105 TC49101 TC53855

Cod. CIP

Variedad Especie NoB bp NoB bp NoB bp

CIP 703291 ROSCA S. phureja

2 315, 320

1 240 2 366, 379

CIP 701570 CHAUCHA S. phureja

2 315, 320

3 236, 240, 242

2 366, 368

CIP 704218 YEMA DE HUEVO S. phureja

2 315, 320

2 366, 368

CIP 703264 PUCA QUITISH S.andigena

2 315, 320

3 236, 238, 242

3 366, 368, 379

CIP 703265 YURAC SOLE S.andigena

2 315, 320

2 236, 242 3 366, 368, 379

CIP 701273 MURO SHOCCO S.andigena

2 315, 320

1 240 1 366

CIP 702867 UNKNOWN S.andigena

2 315, 320

2 240, 242 2 366, 379

CIP 703248 WILA HUAKA LAJRA S.andigena

2 315, 320

2 238, 240 3 366, 368, 379

CIP 702316 PULU S.andigena

2 315, 320

3 366, 368, 379

CIP 702363 SOCCO HUACCOTO S. andigena

2 315, 320

1 379

CIP 702535 SIPANCACHI S.andigena

2 315, 320

1 366

CIP 703365 HOLANDESA S.andigena

2 315, 320

2 238, 242 3 366, 368, 379

CIP 703370 UNKNOWN S. andigena

2 315, 320

2 238, 242 2 386, 379

CIP 703461 CAMUSA S. andigena

2 315, 320

2 238, 242 2 366, 379

CIP 703477 CHIMBINA S.andigena

2 315, 320

1 240 2 366, 379

CIP 703671 NEGRITA S.andigena

2 315, 320

2 240, 242

CIP 701127 OJO DE BUEY S.andigena

2 315, 320

CIP 701241 HUAGALINA S.andigena

2 315, 320

2 238, 242

CIP 703305 CHIAR SURIMANA S. chaucha

2 315, 320

1 240 2 366, 368

CIP 701524 PUCA HUAYRO S. chaucha

2 315, 320

1

CIP 704327 COLOR UNCKUNA S. chaucha

2 315, 320

2 366, 368

CIP 703312 MORADA TURUNA S. stenotonum

2 315, 320

1 242

CIP 703287 CCECCORANI S.stenotonum

2 315, 320

1 242 2 366, 368

CIP 703288 YANA PPOCCOYA S. stenotonum

2 315, 320

2 238, 240 2 366, 368


CIP 701243 SEÑORA WARNI S. stenotonum

2 315, 320

2 366, 368

CIP 702815 MORAR NAYRA MARI S. stenotonum

2 315, 320

1 240

CIP 703197 YANA SUCRE S. stenotonum

2 315, 320

2 238, 240

CIP 703421 POLUYA S. stenotonum

2 315, 320

CIP 704481 AMARILLA S. stenotonum

2 315, 320

CIP 701165 CALHUA ROSADA S. stenotonum

2 315, 320

2 238, 242

CIP 703315 UNKNOWN S. goniocalix

2 315, 320

1 242

CIP 703352

KASHPADANA AMARILLA S. goniocalix

2 315, 320

1 242

CIP 703280 UNKNOWN S. goniocalix

2 315, 320

1 240

CIP 702802 JANCKO AJAWIRI S. ajawiri

2 315, 320

1 240

CIP 702683 LARAM AJAWIRI S. ajawiri

2 315, 320

1 240

CIP 702305 CHIMI LUCKI S. juzepczukii

2 315, 320

2 240, 242

CIP 703258 LARAM CANCHALI S. juzepczukii

2 315, 320

1 240

CIP 702464 NATIN SUITO SxG*

2 315, 320

CIP 703316 UCHO CHAQUITAY SxG)

2 315, 320

2 236, 242

No of dif. Bands

2 315, 320

4 236, 238, 240, 242

3 366, 368, 379

Tabla 9. Variantes allelicas de genes implicados en la resistencia a G pallida

cDNA: Lipoxygenase (S. tuberosum)

Leucine-rich-repeat protein LRP (tomato)

Primers: LRPTOM TC53855 Cod. CIP Variedad Especie NoB bp NoB bp

CIP 703291 ROSCA S. phureja 2 224,226 2 366, 379

CIP 701570 CHAUCHA S. phureja 1 226

CIP 704218 YEMA DE HUEVO S. phureja 1 226

CIP 703264 PUCA QUITISH S.andigena 2 224,226 2 366, 368

CIP 703265 YURAC SOLE S.andigena 2 224,226 3 366, 368,

379 CIP 701273 MURO SHOCCO S.andigena 2 224,226 2 366, 379

CIP 702867 UNKNOWN S.andigena 1 226

CIP 703248 WILA HUAKA LAJRA S.andigena 1 226

CIP 702316 PULU S.andigena 1 226 2 366, 368

CIP 702363 SOCCO HUACCOTO S. andigena 2 224,226 2 366, 368

CIP 702535 SIPANCACHI S.andigena 2 224,226


CIP 703365 HOLANDESA S.andigena 1 226

CIP 703370 UNKNOWN S. andigena 2 224,226

CIP 703461 CAMUSA S. andigena 1 226

CIP 703477 CHIMBINA S.andigena 1 226

CIP 703671 NEGRITA S.andigena 1 226

CIP 701127 OJO DE BUEY S.andigena 2 224,226

CIP 701241 HUAGALINA S.andigena 1 226

CIP 703305 CHIAR SURIMANA O PHIÑU S. chaucha

2 224,226 2 366, 368

CIP 701524 PUCA HUAYRO S. chaucha 1 226 2 366, 368

CIP 704327 COLOR UNCKUNA S. chaucha 2 224,226

CIP 703312 MORADA TURUNA S. stenotonum 2 224,226 3 366, 368,

379 CIP 703287 CCECCORANI S.stenotonum 2 224,226 1 366

CIP 703288 YANA PPOCCOYA S. stenotonum 2 224,226 3 366, 368,

379 CIP 701243 SEÑORA WARNI S. stenotonum 2 224,226 2 386, 379

CIP 702815 MORAR NAYRA MARI S. stenotonum 1 226

CIP 703197 YANA SUCRE S. stenotonum 1 226 2 366, 368

CIP 703421 POLUYA S. stenotonum 2 224,226

CIP 704481 AMARILLA S. stenotonum 2 224,226

CIP 701165 CALHUA ROSADA S. stenotonum 2 224,226

CIP 703315 UNKNOWN S. goniocalix 1 226 1 366

CIP 703352 KASHPADANA AMARILLA S. goniocalix

2 224,226 3 366, 368, 379

CIP 703280 UNKNOWN S. goniocalix 2 224,226 1 379

CIP 702802 JANCKO AJAWIRI S. ajawiri 2 224,226 2 366, 379

CIP 702683 LARAM AJAWIRI S. ajawiri 1 226

CIP 702305 CHIMI LUCKI S. juzepczukii 1 226 2 366, 368

CIP 703258 LARAM CANCHALI S. juzepczukii 1 226 3 366, 368,

379 CIP 702464 NATIN SUITO SxG 2 224,226

CIP 703316 UCHO CHAQUITAY SxG 2 224,226 2 366, 379 No of dif. Bands

2 224,226 3 366, 368, 379

9.- Información científica generada � Publicaciones Científicas Internacionales Ritter, E., Lucca F., Sánchez I., Ruiz de Galarreta J.I., Aragonés A., Castañón S., Bryan G., Waugj R., Lefebre V., Rousselle-Bourgoise F., Gebhardt C., van Eck H., van Os H., Tacco J., Bakker J. 2004. Recursos genómicos en la papa y posibilidades de su explotación. 2004. Revista Latinoamericana de la Papa.. Suppl. especial pp. 2-4. Ritter, E., Lucca F., Sánchez I., Ruiz de Galarreta J.I., Aragonés A., Castañón S., Bryan G., Waugj R., Lefebre V., Rousselle-Bourgoise F., Gebhardt C., van Eck H., van Os H., Tacco J., Bakker J. Genomic resources in potato and posibilities for exploitation. 2005. In Haverkort A.J. & Struik P.C. (eds.). Potato in progress. Wageningen Academic Publishers. ISBN: 9076998841. 55-65 pp.


Ruiz de Galarreta J.I., Ezpeleta B., Pascualena J., Ritter E.. 2006. Combining ability and correlations in early generations of potato. Plant Breeding 125: 183-186. Ruiz de Galarreta J.I., Pascualena J., Legorburu F.J., Barandalla L., Ritter E. 2006. The history of potato in Spain. Potato Research 41: 19-25. Barandalla L., Ruiz de Galarreta J.I., Rios D., Ritter E. 2006. Molecular analysis of local potato cultivars from Tenerife Island using microsatellite markers. Euphytica 152: 283-291. Ríos D., Rodríguez F., Spooner D., Ghislain m. 2006. What is the origin f the European potato?. Evidence from Canary Island landraces. Crop Science (en prensa). Barandalla L., Ruiz de Galarreta J.I., Ritter E. 2006. Oryzalin treatment of potato diploids yields tetraploid and chimaeric plants from which euploids could be derived by callus induction. Potato Research (en prensa). Barandalla L., Ruiz de Galarreta, Lorenzo R., González J., Rios D., Ritter E. 2006. Genetic variation in local potato cultivars from La Palma Island using microsatellite markers. Spanish Journal of Agricultural Research (en revision).

� Publicaciones Científicas Nacionales Ruiz de Galarreta J.I., Barandalla L., Ritter E. 2004. Duplicación cromosómica de dihaploides de patata mediante oryzalina y colchicina. Actas de Horticultura 41: 161-162. Ruiz de Galarreta J.I., Barandalla L., Lorenzo R., González J., Gil J., Ríos D., E. Ritter. 2006. Caracterización de variedades locales de patata de la isla de La Palma mediante marcadores microsatélites. Actas de Horticultura 45: 97-98.

informe final de proyecto - nasdap.ejgv.euskadi.eus · informe técnico final papacid 2 desarrollo...

Documents