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Listado de análisis y condiciones para recepción de muestrasInciensa-R40

Versión 1 Consecutivo: 2018-001

“Documento propiedad del INCIENSA, cualquier impresión se considera una Copia No Controlada, verificar en el SFD la vigencia antes de hacer uso de esta versión”

Centro Nacional de ReferenciaVirología

CENTRO NACIONAL DE REFERENCIA: VIROLOGÍA

Agente o analito Método de ensayo

Tiempo máximo de respuesta

Días de evolución Tipo de muestra

Condiciones de envío

Contacto

Otras condiciones:

Anticoagulante, medio de

transporte, preservantes específicos u

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

transcurrido entre toma de muestra y recepción

(horas)

Tipo de envase

Determinación anticuerpos IgM Dengue

ELISA IgM (6 a 10) días Suero

1 mL Refrigeración (4 a 8) °C 48 h

Marta Víquez Villalobos mviquez@inciensa.sa.cr

Mauricio González E mgonzalez@inciensa.sa.cr

Detección virus Dengue

Reacción en cadena de la polimerasa (PCR Tiempo Real)

<5 días Suero 1 mL Refrigeración (4 a 8) °C 48 h Mauricio González E

mgonzalez@inciensa.sa.cr

Determinación anticuerpos IgM Chikungunya

ELISA IgM (6 a 10) días Suero

1 mL Refrigeración (4 a 8) °C

Marta Víquez Villalobos mviquez@inciensa.sa.cr

Mauricio González E mgonzalez@inciensa.sa.cr

Detección virus Chikungunya

≤ 7 días Suero 1 mL Refrigeración

(4 a 8) °C 48 h Mauricio González E mgonzalez@inciensa.sa.cr

Detección virus Zika

≤5 días Suero 1 mL

Refrigeración (4 a 8) °C 48 h Mauricio González E

mgonzalez@inciensa.sa.cr

(6 a 10) días Orina 2 mL

Tubo vacutainer sin anticoagulante en Triple embalaje

Primeras 48 horas del nacimiento

Suero, orina, sangre de cordón umbilical, líquido amniótico

Determinación anticuerpos IgM virus del Nilo del Oeste

ELISA IgM (6 a 10) días

1 mL Refrigeración (4 a 8) °C 48 h Ana Isela Ruiz González

aruiz@inciensa.sa.crLCR

Detección virus del Nilo del Oeste

Reacción en cadena de la polimerasa (PCR Punto Final)

≤ 3 díasSuero

1 mL Refrigeración (4 a 8) °C 48 h Ana Isela Ruiz

aruiz@inciensa.sa.cr LCR

Detección virus Inmunofluorescencia 2 días ≤5 días Aspirado Medio de 2 mL Refrigeración 72 h Recipientes Jenny Lara Araya“Documento propiedad del INCIENSA, cualquier impresión se considera una Copia No Controlada, verificar en el SFD la vigencia antes de hacer uso de esta versión”

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

respiratorios: AdenovirusInfluenza A y BParainfluenza 1, 2 y 3Virus respiratorio sincicial

directa

nasofaríngeo

transporte viral (o suero fisiológico estéril o solución salina estéril)

(4 a 8) °C

con tapa de rosca en Triple embalaje

jlara@inciensa.sa.cr

Hebleen Brenes Porras hbrenes@inciensa.sa.cr

Hisopado faríngeo Medio de

transporte viralHisopado traqueal

Detección virus Influenza A, virus Influenza B

Reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (PCR Tiempo Real)

5 días ≤5 días

Aspirado nasofaríngeo Medio de

transporte viral 2 mL Refrigeración (4 a 8) °C 72 h

Recipientes con tapa de rosca en Triple embalaje

Jenny Lara Arayajlara@inciensa.sa.cr

Hebleen Brenes Porras hbrenes@inciensa.sa.cr

Hisopado faríngeo

Determinación anticuerpos IgM virus Sarampión y Rubéola

ELISA IgM4 días (5 a 30)

días Suero 2 mL Refrigeración (4 a 8) °C 48 h Ana Isela Ruiz

aruiz@inciensa.sa.cr ELISA IgG

Detección virus Sarampión y Rubéola

28 días ≤ 3 días

Hisopado faríngeo

Medio de transporte viral 2 mL

Refrigeración (4 a 8) °C 48 h Ana Isela Ruiz

aruiz@inciensa.sa.cr Aspirado faríngeo

Detección Poliovirus y otros enterovirus

Inmunofluorescencia directa 28 días ≤ 14 días Heces 8 g

Refrigeración (4 a 8) °C 48 h Ana Isela Ruiz

aruiz@inciensa.sa.cr Reacción en cadena de la polimerasa (PCR)

14 días ≤ 3 días Suero 2 mLLCR

Encefalitis/meningitis viral

Reacción en cadena de la polimerasa (PCR )

≤ 3 días LCR 1 mL Refrigeración (4 a 8) °C 48 h Ana Isela Ruiz

aruiz@inciensa.sa.cr

Centro Nacional de ReferenciaParasitología

CENTRO NACIONAL DE REFERENCIA: PARASITOLOGÍA

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Determinación anticuerpos Angiostrongylus costaricensis

Test de Morera 3 días Suero 0,500 mLRefrigeración (con refrigerante)

5 díasRecipiente plástico con tapa

Nidia Calvo Fonsecancalvo@inciensa.sa.cr

Identificación del vector de Chagas

Determinación estereoscópica 2 días Insecto Temperatura

ambiente 10 díasRecipiente plástico con tapa de rosca

Nidia Calvo Fonseca ncalvo@inciensa.sa.cr

Diagnóstico de infección del vector de Chagas con T. cruzi

Frotis 2 días Insecto Temperatura ambiente 10 días

Recipiente plástico con tapa de rosca

Identificación de coccidios

Frotis de heces teñido con Ziehl Neelsen 3 días Heces

Temperatura ambiente 5 días

Frotis de heces teñido con Koster

Identificación de microsporidios

Frotis de heces teñido con Giemsa

3 días Heces Temperatura ambiente 5 días

Nidia Calvo Fonseca ncalvo@inciensa.sa.cr Frotis de heces

teñido Weber

Identificación de protozoarios y helmintos

Frotis solución salina3 días Heces Temperatura

ambiente1 día (preferible)

Nidia Calvo Fonseca ncalvo@inciensa.sa.crFrotis lugol

Identificación de helmintos Kato Katz 3 días Heces

20 g (una cucharadita aproximadamente)

Identificación de protozoarios y helmintos

Método de Sedimentación Espontánea

3 días Heces

Temperatura ambiente

1 día (preferible)

Método de Flotación de FaustMétodo de Sedimentación de Ritchie

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Identificación de características macroscópicas de heces

Observación directa 3 días Heces

Recipientes con tapa de rosca y plástico

Determinación de Plasmodium sp

Gota gruesa2 días Sangre total EDTA 1 tubo

Refrigeración (con refrigerante)

72 hRecipientes con tapa y plástico

Nidia Calvo Fonseca ncalvo@inciensa.sa.crFrotis

Confirmación de Plasmodium sp

Gota gruesa y

2 días

Sangre total

1 tuboRefrigeración (con refrigerante)

72 hRecipiente plástico con tapa Nidia Calvo Fonseca

ncalvo@inciensa.sa.crFrotis Montaje en

lámina lámina Temperatura ambiente 72 h

Caja de cartón o plástica

Determinación de Plasmodium sp

3 días Sangre total EDTA 3 mLRefrigeración (con refrigerante)

4 díasRecipientes con tapa y plástico

Determinación de Leishmania sp

5 días Raspado de lesión o biopsia

Solución salina estéril

100 uL (raspado – 1 ml biopsia)

Refrigeración (con refrigerante)

Diagnostico parasitológico de Leishmania spp

Cultivo 45 días Biopsia y aspirado

Solución salina estéril

100 uL (aspirado – 1 ml biopsia)

Refrigeración (con refrigerante) 2 días

Recipiente plástico con tapa

Determinación anticuerpos anti Trypanosoma cruzi

ELISA lisado

3 días Suero o plasma

Para el plasma el anticoagulante puede ser heparina, citrato o EDTA

0,750 mLRefrigeración (con refrigerante)

Nidia Calvo Fonseca ncalvo@inciensa.sa.crELISA recombinante

Determinación anticuerpos anti Trypanosoma cruzi

Inmunofluorescencia indirecta 3 días Suero o plasma 0,750 mL

Refrigeración (con refrigerante) 5 días

Recipiente plástico con tapa

Diagnóstico parasitológico

Strout 1 día Sangre total 1 mL Temperatura ambiente

1 hora Recipiente plástico con

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

de Chagas tapa

Confirmación diagnóstica tamizaje enfermedad de Chagas

ELISA lisado

3 días

Suero o plasma

Para el plasma el anticoagulante puede ser heparina, citrato o EDTA

0,750 mLRefrigeración (con refrigerante)

Nidia Calvo Fonseca ncalvo@inciensa.sa.crELISA recombinante

Inmunofluorescencia indirecta

Centro Nacional de ReferenciaMicobacteriología

CENTRO NACIONAL DE REFERENCIA: MICOBACTERIOLOGÍA

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Detección y aislamiento de micobacterias

(muestras clínicas)

Reacción en cadena de la polimerasa

(PCR en tiempo real)

Cultivo sólido y líquido

PCR: 5 días

Cultivo: 3 meses

Más de 15 días

Muestras respiratorias

(Esputo, lavado bronquial ,

lavado broncoalveolar,

aspirado bronquial, etc.)

Cumplimiento con la norma nacional

(https://www.ministeriodesalud.go.cr/index.p

hp/vigilancia-de-la-salud/normas-

protocolos-y-guias/3185-norma-de-

laboratorio-tuberculosis/file)

3 mL 4 -8 °C 5 días

Boca ancha, mínimo 50

mm de diámetro, capacidad

total (30-50) mL, cierre hermético, con tapa de

rosca, plástico

transparente resistente a

roturas, estéril

Carlos Trabado Alpízar ctrabado@inciensa.sa.cr

Biopsia

Conservantes: 1-2 mL de solución

fisiológica o agua destilada estéril.

No agregar formol, fenol o

formaldehido

50 mg 4 -8 °C 5 días Carlos Trabado Alpízar ctrabado@inciensa.sa.cr

Líquidos biológicos

estériles (pleural ascítico,

pericárdico, peritoneal,

cefalorraquídeo, articular)

Tubos con anticoagulante citrato al 3,8% (tubos de tapa

celeste)

3 mL, preferible 5

mL4 -8 °C 12 horas

Tubos con anticoagulante citrato al 3,8% (tubos de tapa

celeste)

Aislamiento de micobacterias

Cultivo sólido y líquido 3 meses Más de 15

días Lavado gástrico

Al menos 3 muestras. Si no es posible el

procesamiento inmediato debe neutralizarse el

material con 1 mg de bicarbonato de sodio o de fosfato trisódico anhidro por cada mL

de contenido gástrico. Se debe recolectar por la mañana al

despertar, en ayunas

3 mL 4 -8 °C

4 horas sin neutralizació

24 horas neutralizado

Boca ancha, mínimo 50

mm de diámetro, capacidad

total (30-50) mL, cierre hermético, con tapa de

rosca, plástico

transparente resistente a

roturas,

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

estéril

días Orina

Al menos 3 muestras, máximo 6. Enviar el sedimento de toda la

orina centrifugada durante 15 minutos a 3.000 g, neutralizado

con 1 mg de bicarbonato de sodio

o fosfato trisódico anhidro

50 mL 4 -8 °C

Inmediato sin neutralizació

12 horas neutralizado

Capacidad de (300 a 500) mL, limpio, de

boca ancha, cierre

hermético, resistente a

roturas, estéril

días Sangre total 2 muestras en días consecutivos 10 mL

Temperatura ambiente o

Inmediato o transferir a frasco con medio de cultivo e incubar a

37°C hasta envío

Transferir a un tubo

plástico seco estéril con

tapa de rosca de cierre hermético

Identificación de micobacterias

(PCR Punto Final) / Hibridación reversa

de ADN

10 días

Cultivo sólido

Cultivo positivo por BAAR en medio

sólido Löwenstein-Jensen

Crecimiento visible

15 días de incubación

desde que se detectó

crecimiento

Tubo vidrio con medio

Löwenstein-Jensen

Cultivo líquidoCultivo positivo por

BAAR en medio líquido (ej: MGIT)

5 mL Temperatura ambiente

crecimiento

Tubos de medio líquido

(ej: MGIT)

Detección de mutaciones de resistencia de

complejo Mycobacterium

tuberculosis

tiempo real/Curvas de fusión

10 días Cultivo sólido o líquido

sólido Löwenstein-Jensen o en medio líquido (ej: MGIT)

Medio sólido con

crecimiento visible o 5

mL de medio líquido

crecimiento

Löwenstein-Jensen o tubos de

medio líquido

Detección de mutaciones de resistencia de

M. aviumM. intracellulare

M. chelonae

(PCR Punto Final) / Hibridación reversa

de ADN

10 días Cultivo sólido o líquido

Medio sólido con

crecimiento

medio líquido

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

M. abscessus

Prueba de sensibilidad a antibióticos de M. tuberculosis

Ensayo en medio líquido MGIT 60 días Cultivo sólido o

líquido

Medio sólido con

crecimiento

medio líquido

Detección de enfermedad de

HansenBaciloscopía 48 horas Frotis de linfa

cutáneaReferencia por

especialista

4 frotis de 4 sitios

anatómicos (CD, CI, LD, LI)

Centro Nacional de ReferenciaBromatología

CENTRO NACIONAL DE REFERENCIA: BROMATOLOGÍA

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Determinación de flúor

Electrodo de ion específico 5 días

Sal 500 g Temperatura ambiente 5 días Paquete Thelma Alfaro Calvo

talfaro@inciensa.sa.cr

Orina 200 mL Refrigeración (4 a 8) °C 8 h

Recipientes con tapa de rosca

Thelma Alfaro Calvo talfaro@inciensa.sa.cr

Determinación de yodo

Método volumétrico para yodato

5 días

Sal 500 g Temperatura ambiente 5 días Paquete Thelma Alfaro Calvo

talfaro@inciensa.sa.cr Electrodo de ion específico Sal 500 g Temperatura

ambiente 5 días Paquete Thelma Alfaro Calvo talfaro@inciensa.sa.cr

Espectrofotometría UV-visible Orina 200 mL Refrigeración

(4 a 8) °C 8 h Recipientes con tapa de rosca

Determinación de hierro

Espectrofotometría UV-visible 5 días

Harina de trigo 1000 g Temperatura

ambiente

5 días Paquete

Harina de maíz 5 días Thelma Alfaro Calvo talfaro@inciensa.sa.cr

Leche 1000 mL 5 días Caja Thelma Alfaro Calvo talfaro@inciensa.sa.cr

Determinación de vitamina A

Espectrofotometría UV-visible 2 días Azúcar 2000 g Temperatura

ambiente

5 días Paquete Thelma Alfaro Calvo talfaro@inciensa.sa.cr

Cromatografía liquido líquido de alta presión (HPLC)

5 días Leche 1000 mL 5 días Caja Thelma Alfaro Calvo talfaro@inciensa.sa.cr

5 días

Plasma

8 h Recipientes con tapa de rosca

Suero 8 h Recipientes con tapa de rosca

Determinación de compuestos polares

Gravimétrico 5 días Grasas de frituras 250 mL Temperatura

ambiente 8 h Recipientes con tapa de rosca

Determinación de Bromato de potasio

Cualitativo 3 días Harina de trigo 1000 g Temperatura ambiente 2 días Paquete Thelma Alfaro Calvo

Centro Nacional de ReferenciaBromatología

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Determinación de ácido fólico

Cromatografía liquido líquido de alta presión (HPLC)

3 días Arroz 1800 g Temperatura ambiente 3 días Paquete Thelma Alfaro Calvo

Determinación de Vitamina B12

Cromatografía liquido líquido de alta presión (HPLC) 5 días Arroz 1800 g Temperatura

Determinación de Vitamina E

Determinación de Niacina

Determinación de Tiamina

Determinación de Aflatoxinas totales

Columnas de inmunoafinidad-Fluorométrico método AOAC 991.31

5 días Maní 500 g Temperatura ambiente 5 días Paquete Thelma Alfaro Calvo

Columnas de inmunoafinidad-Fluorométrico método AOAC 991.31

5 días Maíz 500 g Temperatura ambiente 5 días Paquete Thelma Alfaro Calvo

Determinación de Cinc

Espectrofotometría de absorción atómica

5 días Arroz 1800 g Temperatura

Determinación de Selenio

Determinación de arsénico

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Columnas de inmunoafinidad 5 días Arroz 1800 g Temperatura

Aflatoxina M1 en leche

Columnas de inmunoafinidad 5 días Leche 1000 mL

Temperatura ambiente siempre que el empaque sea de alta duración, caso contrario en refrigeración (4 a 8) °C

5 días Paquete Thelma Alfaro Calvo talfaro@inciensa.sa.cr

Metanol en ron y vodka

Cromatografía de gases 5 días Rones y vodkas 1 envase

cerrado Temperatura ambiente 5 días Paquete Thelma Alfaro Calvo

talfaro@inciensa.sa.cr Nitritos en embutidos

Espectrofotometría UV-visible 5 días Embutidos 500 g Refrigeración

(4 a 8) °C 6 horas Paquete Thelma Alfaro Calvo talfaro@inciensa.sa.cr

Colorantes Cromatografía liquido líquido de alta presión (HPLC)

5 días Bolis y gelatinas 5 unidades Refrigeración (4 a 8) °C 1 día Paquete Thelma Alfaro Calvo

Determinación de nicotina en condensados de humo de cigarro

Cromatografía de gases (GC-FID) método ISO 10315:2013

5 días Cigarros 200 unidades

Temperatura ambiente 5 días Paquete Thelma Alfaro Calvo

Determinación de contenido de agua en condensados de humo de cigarro

Cromatografía de

gases (GC-TCD) método ISO 10362-1:1999 (E).

5 días Cigarros 200 unidades

Temperatura ambiente 5 días Paquete Thelma Alfaro Calvo

Material particulado seco libre de nicotina (Alquitrán)

Gravimétrico método ISO 4387:2000 (E) 5 días Cigarros 200

unidadesTemperatura ambiente 5 días Paquete Thelma Alfaro Calvo

Determinación del contenido de Monóxido de carbono en la fase de vapor de humo de cigarro

NDIR método ISO 8454:2007 5 días Cigarros 200

unidadesTemperatura ambiente 5 días Paquete Thelma Alfaro Calvo

Determinación AOAC 2012.01 (Elisa 8 días Alimentos 1 envase Temperatura 8 días Paquete Thelma Alfaro Calvo “Documento propiedad del INCIENSA, cualquier impresión se considera una Copia No Controlada, verificar en el SFD la vigencia antes de hacer uso de esta versión”

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

de gluten en alimentos por la técnica ELISA

declarados como libres de gluten, o que por su naturaleza no lo contienen, excepto cerveza y masa fermentada

cerrado ambiente talfaro@inciensa.sa.cr

Centro Nacional de ReferenciaBacteriología

CENTRO NACIONAL DE REFERENCIA: BACTERIOLOGÍA

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Salmonella (serovares)Shigella (especies y serotipos)Aeromonas (especies)Plesiomonas shigelloidesVibrio cholerae, otros vibrios (especies)Yersinia enterocolitica Campylobacter (especies)

Coprocultivo convencional e identificación de enteropatógenos bacterianos por bioquímica convencional, API 20 E o Vitek 2 Compact, y métodos moleculares

8 días (1 a 3) días

Heces o contenido intestinal

La muestra se debe recolectar previo al inicio de antibiótico-terapia y enviar en triple embalaje, acompañada de la boleta Solicitud de Diagnóstico (USTL-R01)

Recipientes herméticos con tapa de rosca Emplear triple embalaje para su transporte. Hilda Ma. Bolaños Acuña

hbolanos@inciensa.sa.cr

Hisopo fecal o hisopado rectal en Cary Blair

1 hisopado Temperatura ambiente

Medio de transporte Cary Blair Emplear triple embalaje para su transporte.

Vibrio cholerae O1

Prueba rápida de Cholera SMART (inmunocromatografía)

< 6 horas (en pacientes con diarrea, sin antibióticos) y < 24 horas (en asintomáticos

(1 a 3) días

Hilda Ma. Bolaños Acuña hbolanos@inciensa.sa.crHisopo fecal o

hisopado rectal en Cary Blair

1 hisopado Temperatura ambiente

Medio de transporte Cary Blair Emplear triple embalaje.

Detección de virotipos de Escherichia coli patógena:enterotoxigénicaenteropatógenaenteroagregativa enterohemorrágica, incluyendo O157:H7

48 hrs

Hilda Ma. Bolaños Acuña hbolanos@inciensa.sa.cr

Hisopo fecal o hisopado rectal en Cary Blair 1 hisopado Temperatura

ambiente

Medio de transporte Cary Blair Emplear triple embalaje

Centro Nacional de ReferenciaBacteriología

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Detección de Clostridium perfringens enterotoxigénico

5 días (1 a 3) días Heces

Detección de virus causantes de diarrea:RotavirusNorovirusAstrovirusAdenovirus entérico

Contenido intestinal

Serovariedades de Salmonella

Esquema Kauffmann-White (bioquímica convencional, aglutinación en lámina, micro aglutinación, reacción en cadena de la polimerasa)

12 días (para las Serovariedades más comunes)

Cultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h

La realización de este análisis requiere de justificación e información clínico-epidemiológica. Emplear triple embalaje y enviar acompañado de la boleta de Solicitud de Confirmación Diagnóstica para Aislamientos Bacteriológicos USTL-R02

Subcultivo en medio no selectivo o en Medio de Transporte Cary Blair

(4 a 25) °C

Tubo hermético con tapa de rosca o placa de Petri

Pulsotipos de Salmonella

Electroforesis de campo pulsado (PFGE)

15 días Subcultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h

La realización de este análisis requiere de justificación e

1 Subcultivo

(4 a 25) °C Tubo hermético con tapa de rosca o placa

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

preferiblemente, en medio de cultivo (idealmente no selectivo) o en Medio de Transporte Cary Blair

información clínico-epidemiológica. Emplear triple embalaje y enviar acompañado de la boleta de Solicitud de Confirmación Diagnóstica para Aislamientos Bacteriológicos USTL-R02

de Petri

Especies y serotipos de Shigella sp.

Bioquímica convencional

7 días

Subcultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h preferiblemente, en medio de cultivo (idealmente no selectivo) o en Medio de Transporte Cary Blair

Emplear triple embalaje y enviar acompañado de la boleta de Solicitud de Confirmación Diagnóstica para Aislamientos Bacteriológicos USTL-R02

1 Subcultivo (4 a 25) °C

Vitek 2 Compact

Aglutinación en lámina

Serotipos inusuales de Shigella flexneri

15 días

La realización de este análisis requiere de justificación e información clínico-epidemiológica. Emplear triple embalaje y enviar acompañado de la boleta de Solicitud de Confirmación Diagnóstica para Aislamientos Bacteriológicos USTL-R02

1 Subcultivo (4 a 25) °C

Pulsotipos de Shigella sonnei

Electroforesis de campo pulsado

15 días Subcultivo bacteriano puro y

La realización de este análisis

Subcultivo en medio

(4 a 25) °C Tubo hermético

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

(PFGE)

fresco (18 a 24) h preferiblemente, en medio de cultivo (idealmente no selectivo) o en Medio de Transporte Cary Blair

requiere de justificación e información clínico-epidemiológica. Emplear triple embalaje y enviar acompañado de la boleta de Solicitud de Confirmación Diagnóstica para Aislamientos Bacteriológicos USTL-R02

no selectivo o en Medio de Transporte Cary Blair

con tapa de rosca o placa de Petri

Especies de Aeromonas

12 días

(4 a 25) °C

API-20E

Vitek 2 Compact

Plesiomonas shigelloides

5 días

(4 a 25) °C

API-20E

Vitek 2 Compact

Especies de Yersinia

Bioquímica convencional 5 días Subcultivo

bacteriano puro y Emplear triple embalaje y enviar

Subcultivo en medio (4 a 25) °C Tubo

hermético Hilda Ma. Bolaños Acuña hbolanos@inciensa.sa.cr

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

enterocolitica

acompañado de la boleta de Solicitud de Confirmación Diagnóstica para Aislamientos Bacteriológicos USTL-R02

API-20E

Vitek 2 Compact

Especies de Campylobacter sp.

12 días

Subcultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h, idealmente en Medio de Transporte Cary Blair

Subcultivo en Medio de Transporte Cary Blair

Medio de transporte Cary Blair

API-20E

Listeria monocytogenes

4 días

Subcultivo en Medio de Transporte Cary Blair

(4 a 25) °C

Grettel Chanto Chacón gchanto@inciensa.sa.cr

Vibrio cholerae O1 y O139

3 días Subcultivo bacteriano puro y

Emplear triple embalaje y enviar

Subcultivo en medio

(4 a 25) °C Tubo hermético

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

acompañado de la boleta de Solicitud de Confirmación Diagnóstica para Aislamientos Bacteriológicos USTL-R02

API-20E Aglutinación en lámina

Otras especies de Vibrio sp.

5 días

(4 a 25) °C

API-20E

Caracterización molecular y determinación de factores de virulencia de Vibrio cholerae (incluye gen de la toxina colérica, identificación de Vibrio cholerae a nivel de especie serogrupo y de biotipo El Tor)

5 días

(4 a 25) °C

Pulsotipos de Vibrio cholerae O1

Electroforesis de campo pulsado (PFGE)

15 días

Subcultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h preferiblemente,

Emplear triple embalaje y enviar acompañado de la boleta de Solicitud de

Subcultivo en medio no selectivo o en Medio

(4 a 25) °C

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

en medio de cultivo (idealmente no selectivo) o en Medio de Transporte Cary Blair

Confirmación Diagnóstica para Aislamientos Bacteriológicos USTL-R02

de Transporte Cary Blair

Escherichia coli O157:H7

2 días

Placa de aislamiento primario agar sangre o Mc Conkey Lactosa y/o Mc Conkey Sorbitol, o diez colonias sugestivas del coprocultivo

(4 a 25) °C

Detección de virotipos de E. colienterotoxigénicaenteropatógenaentero invasivaenterohemorrágicaenteroagregativa

5 días

Subcultivo bacteriano puro y fresco (18 - 24 h) preferiblemente, en medio de cultivo (idealmente no selectivo) o en Medio de Transporte Cary Blair

(4 a 25) °C

Diagnóstico de tos ferina

Aspirado nasofaríngeo

Hisopo de dacrón o alginato de calcio. La muestra se debe recolectar previo al inicio de antibiótico-terapia y enviar en triple embalaje, acompañada de la boleta Solicitud de Diagnóstico (USTL-R01)

1 ml Refrigeración (4 a 8) °C

Recipientes hermético con tapa de rosca

Hisopado nasofaríngeo

Cultivo 15 días (1 a 7) días

Aspirado traqueal

24 hBiopsia de pulmón

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Detección directa de: Chlamydophila pneumonia, Mycoplasma pneumoniae, Bordetella pertussis, Haemophilus influenzaeStreptococcus pneumoniae,Legionella pneumophila

Aspirado nasofaríngeo

Hisopo de dacrón o alginato de calcio. La muestra se debe recolectar previo al inicio de antibiótico-terapia y enviar en triple embalaje, acompañada de la boleta Solicitud de Diagnóstico (USTL-R01)

Recipientes hermético con tapa de rosca

Hisopado nasofaríngeo

Aspirado traqueal

Biopsia de pulmón

Diagnóstico serológico de la brucelosis

Aglutinación en lámina Rosa de Bengala (RBT)

5 días 15 días Suero

Suero agudo y convaleciente. Enviar en triple embalaje, acompañada de la boleta Solicitud de Diagnóstico (USTL-R01)

2 mL Refrigeración (4 a 8) °C 5 días Tubo

herméticoGrettel Chanto Chacón gchanto@inciensa.sa.cr

Microaglutinación en placa (SAT)

Determinación de anticuerpos séricos contra Vibrio cholerae O1

Prueba vibriocida 3 días

Suero agudo y

convalesciente (15

días después de

iniciados los

síntomas)

Suero agudo y convaleciente. Enviar en triple embalaje, acompañada de la boleta Solicitud de Diagnóstico (USTL-R01)

herméticoHilda Ma. Bolaños Acuña hbolanos@inciensa.sa.cr

Aislamiento de Leptospira sp

Cultivo 6 meses (1 a 6) días Sangre total o tubo de medio EMJH o Fletcher inoculado con sangre total

Sangre total anticuagulada o inocular ±0.5 ml de sangre en medio de cultivo EMJH o Fletcher (solicitar al Lab. INCIENSA).

La muestra se debe recolectar

0,5 mL Sangre total refrigerada o medio inoculado a temperatura. ambiente

≤2 días después de tomada la muestra

Tubo tapa de rosca a T. ambiente

Diana Chinchilla Montero dchinchilla@inciensa.sa.cr

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

previo al inicio de antibióticoterapia. Boleta Solicitud de Diagnóstico (USTL-R01) con información completa Indispensable días de evolución (o fecha de inicio de síntomas y de toma de la muestra)

Detección Leptospira sp.

Reacción en cadena de la polimerasa (PCR Tiempo Real )

3 días (1 a 6) díasSuero, líquido cefalorraquídeo, plasma o sangre

Boleta Solicitud de Diagnóstico (USTL-R01) con información completa Indispensable fecha de inicio de síntomas y toma de muestra o días de evolución

herméticoDiana Chinchilla Montero dchinchilla@inciensa.sa.cr

Determinación de anticuerpos IgM contra Leptospira

ELISA IgM 2 días (6 a 15) días Suero

Boleta Solicitud de Diagnóstico (USTL-R01) con información completa Indispensable fecha de inicio de síntomas y toma de muestra o días de evolución

Determinación de anticuerpos aglutinantes totales contra Leptospira

Prueba de Aglutinación microscópica (MAT)

2 días ≥ 6 días

Requiere un Suero agudo y otro convaleciente ≥15 días después del suero agudo

Boleta Solicitud de Diagnóstico (USTL-R01) con información completa Indispensable fecha de inicio de síntomas y toma de muestra o días

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

de evolución

Especies y serotipos de Streptococcus pneumoniae

5 días NA

Subcultivo en medio no selectivo

Temperatura ambiente NA Placa de

Petri.Grettel Chanto Chacón gchanto@inciensa.sa.cr

API-StrepVitek 2 Compact

Reacción de Quellung

Serotipos de Haemophilus influenzae

5 días

Placa de Petri.

API-NH

Vitek 2 Compact

Serogrupos de Neisseria meningitidis

2 días

Placa de Petri.

Grettel Chanto Chacón gchanto@inciensa.sa.cr r

API-NH

Confirmación de Neisseria gonorroheae

5 días Cultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h

Emplear triple embalaje y enviar acompañado de la boleta de Solicitud de Confirmación Diagnóstica para Aislamientos Bacteriológicos

Placa de Petri.

API-NH

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

USTL-R02

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Prueba de sensibilidad a los antibióticos (PSA) de enterobacterias aisladas de heces

Kirby-Bauer

4 díasCultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h

Un subcultivo en medio no selectivo o en Medio de Transporte Cary Blair

(4 a 25) °C

Anamariela Tijerino Ayala atijerino@inciensa.sa.cr

Vitek 2 Compact

Prueba de sensibilidad a los antibióticos (PSA) de Vibrio

Kirby-Bauer 4 díasCultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h

(4 a 25) °C

β-lactamasas (Amp-C plasmídica, β-lactamasa de espectro extendido y carbapenemasas) enterobacterias aisladas de heces

Perfil de sensibilidad, prueba de Hodge, inhibición de la enzima en presencia de EDTA o ácido dipicolínico, cloxacilina, ácido borónico y ácido clavulánico

Emplear triple embalaje y enviar acompañado de la boleta de Solicitud de Confirmación Diagnóstica para Aislamientos Bacteriológicos USTL-R02.

Adjuntar copia del reporte de la PSA del equipo automatizado.

(4 a 25) °C

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Carbapenemasas tipo KPC y Metalo-β-lactamasa (IMP, VIM y NDM) en enterobacterias aisladas de heces

(4 a 25) °C

Sensibilidad disminuida o resistencia a fluoroquinolonas (detección de genes qnrA, qnrB, qnrD, qnrS, aac(6')Ib) en: enterobacterias aisladas de heces y en Vibrio cholerae

Kirby-Bauer

Un subcultivo. (4 a 25) °C

Tubo hermético con tapa de rosca o placa de Petri Emplear triple embalaje

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Prueba de sensibilidad a los antibióticos (PSA) de Campylobacter sp

E-Test 3 días

Cultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h, idealmente en medio de transporte Cary Blair

(4 a 25) °CMedio de transporte Cary Blair

Prueba de sensibilidad a los antibióticos (PSA) de Listeria monocytogenes

E-Test 5 díasCultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h

(4 a 25) °C

Prueba de sensibilidad a los antibióticos (PSA) de Streptococcus pneumoniae

E-Test

Un subcultivo en medio no selectivo

Concentración Inhibitoria Mínima por microdilución (CIM)

Kirby-Bauer

Vitek 2 Compact

Detección de mecanismos de resistencia de Streptococcus pneumoniae: MLSb

D-Test Cultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h

Emplear triple embalaje y enviar acompañado de la boleta de Solicitud de Confirmación Diagnóstica para Aislamientos Bacteriológicos

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

USTL-R02. Adjuntar copia del reporte de la PSA del equipo automatizado.

Prueba de sensibilidad a los antibióticos de Haemophilus influenzae

E-Test

Kirby-Bauer

Determinación de β-lactamasa en Haemophilus influenzae

Método cromogénico 3 díasCultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h

Prueba de sensibilidad a los antibióticos (PSA) de Neisseria meningitidis, incluyendo determinación de β-lactamasa

E-Test

Método cromogénico

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Determinación de β-lactamasa en Neisseria gonorroheae

Cefinasa 1 díaCultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h

Prueba de sensibilidad a los antibióticos (PSA) de Staphylococcus aureus (meticilino y vancomicino resistencia, MLSb)

Kirby-Bauer

(4 a 25) °C

Antonieta Jiménez Pearson

ajimenez@inciensa.sa.cr

E-Test

D-Test

Detección de resistencia a glicopéptidos en Staphylococcus aureus y S. epidermidis

Kit Rosco para hGISA, GISA, VRE y sensibilidad a daptomicina

(4 a 25) °C

ajimenez@inciensa.sa.crE-Test GRD (para hGISA, GISA)

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Detección de genes mecA y PVL en Staphylococcus aureus

(4 a 25) °C

Detección de proteína PBP´2a en Staphylococcus aureus

Aglutinación (Slidex MRSA) 3 días

(4 a 25) °C

Confirmación de Streptococcus α y β-hemolíticos

Vitek 2 Compact

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Prueba de sensibilidad a los antibióticos (PSA) de Streptococcus β-hemolíticos (incluyendo S. pyoenes, S. agalactiae )

Prueba de sensibilidad a los antibióticos de Enterococcus spp.

(4 a 25) °C

Detección de resistencia a glicopéptidos en Enterococcus spp.y Staphylococcus spp.

E-Test

(4 a 25) °C

ajimenez@inciensa.sa.crReacción en cadena de la polimerasa (PCR Punto Final)

Prueba de sensibilidad a los antibióticos (PSA) de Enterobacterias

Kirby-Bauer

5 días Cultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24) h

Emplear triple embalaje y enviar acompañado de la boleta de Solicitud de

(4 a 25) °C Tubo hermético con tapa de rosca o placa de Petri

Vitek 2 Compact

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

aisladas de muestras diferentes a heces,

Confirmación Diagnóstica para Aislamientos Bacteriológicos

Detección y confirmación β-lactamasas (BLEE, AmpC y carbapenemasas de Enterobacterias aisladas de muestras diferentes a heces,Pseudomonas, Acinetobacter y Burkholderia

Perfil de sensibilidad, prueba de Hodge, inhibición de la enzima en presencia de EDTA o ácido dipicolínico, o ácido clavulánico y ácido borónico

2 díasCultivo bacteriano puro y fresco (18 a 24 h)

(4 a 25) °C

Detección de resistencia a colistina mediada por plásmidos en Enterobacterias aisladas de muestras diferentes a heces, Pseudomonas, Acinetobacter

(4 a 25) °C

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Confirmación de carbapenemasas tipo KPC y MBL (IMP, VIM y NDM) de Enterobacterias aisladas de muestras diferentes a hecesPseudomonas, Acinetobacter y Burkholderia

(4 a 25) °C

Centro Nacional de ReferenciaInocuidad Microbiológica de

Alimentos

CENTRO NACIONAL DE REFERENCIA: INOCUIDAD MICROBIOLÓGICA DE ALIMENTOS

Días de evolución

Tipo de muestra

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Escherichia coli O157:H7

Detección utilizando Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) punto final - "melting curve".Método BAX System (AFNOR)

5 días

Alimentos frescos, productos cárnicos crudos (carne molida y picada y tortas para hamburguesas), carnes congeladas, otros alimentos y bebidas.

La muestra se debe recolectar y transportar en doble bolsa estéril para evitar su contaminación. Se deben mantener las condiciones de temperatura durante el transporte al laboratorio.

100 g o 100ml

Depende de la naturaleza de la muestra: puede ser a temperatura ambiente, en refrigeración o en congelación.

Depende de la naturaleza del alimento, en el caso de alimentos perecederos deben enviarse lo antes posible para evitar el deterioro.

Paquetes o envases cerrados estériles o el alimento en su empaque original

María Teresa Acuña macuna@inciensa.sa.cr

Francisco Duarte fduarte@inciensa.sa.cr

Ericka Umaña eumana@inciensa.sa.cr

Aislamiento convencional Método oficial USDA

10 días

Caracterización molecular de cepas utilizando reacción en cadena de la polimerasa (PCR) - punto final (rfbO157, stx1, stx2, eae, h7, hlyA, aggR).

5 días

Cultivo bacteriano puro y fresco (18 h a 24 h)

La muestra debe ser transportada en un embalaje triple

Temperatura ambiente o refrigeración.

Tubo cerrado con tapa de rosca o placa de petri cerrada

Francisco Duarte Martínez fduarte@inciensa.sa.cr

María Teresa Acuña

macuna@inciensa.sa.cr

Listeria monocytogenes

Detección utilizando Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) punto final - "melting curve" Método BAX System (AOAC)

5 días Alimentos frescos , alimentos procesados y congelados

100 g o 100 mL o un envase cerrado

María Teresa Acuña

macuna@inciensa.sa.cr

Aislamiento convencional utilizando métodos convencionales oficiales

10 días

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Salmonella spp.

Detección utilizando Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) punto final - "melting curve" Método BAX System (AFNOR)

5 días Alimentos frescos, alimentos procesados y congelados

Depende de la naturaleza del alimento, en el caso de alimentos perecederos deben enviarse lo antes posible para evitar el deterioro

Aislamiento convencional utilizando método oficial ISO

10 días

Pulsotipos de Salmonella (cepas asociadas brotes) utilizando Electroforesis de campo pulsado (PFGE)Método Pulsenet internacional

15 días

Temperatura ambiente o refrigeración

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Vibrio cholerae O1

Detección por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) Tiempo RealMétodo BAX System (AOAC)

3 días

Alimentos frescos, alimentos procesados y congelado. Se incluye pescado, derivados y productos marinos frescos y congelados.

Aislamiento convencional utilizando método oficial FDA-BAM

10 días

Caracterización molecular de cepas. Identificación de especie, identificación de serogrupo, de biotipo El Tor (TcpA) y determinación de factores de virulencia gen de la sub unidad A de la toxina colérica (ctxA), utilizando Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) punto final

5 días

Cultivo bacteriano puro y fresco (18 h a 24 h).

Un subcultivo en medio no selectivo o en Medio de transporte

Tubo cerrado con tapa de rosca o placa de petri

Pulsotipos de Vibrio cholerae O1 especialmente (cepas asociadas brotes) utilizando Electroforesis de campo pulsado (PFGE)Método Pulsenet internacional

15 días

Un subcultivo en medio no selectivo o en medio de transporte

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Vibrio parahaemolyticus

Detección por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) Tiempo Real Método BAX System (AOAC)

3 días

Alimentos frescos, alimentos procesados y congelado. Se incluye pescado, derivados y productos marinos frescos y congelados.

Recuento y aislamiento convencional utilizando métodos oficiales FDA-BAM,

10 días

Cronobacter sp

Detección utilizando Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) punto final - "melting curve" Método BAX System

3 días

Productos lácteos y otros alimentos.

Aislamiento convencional utilizando método oficial FDA-BAM,

10 días

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

(horas)

Tipo de envase

Recuento de Escherichia coli

Recuento convencional utilizando métodos oficiales Petrifilm (AOAC) NMP FDA BAM

8 días

Agua, hielo, alimentos frescos, procesados y congelados.

Agua máximo 24 horas y en alimentos depende de la naturaleza del alimento, en el caso de alimentos perecederos deben enviarse lo antes posible para evitar el deterioro

Recuento de Staphylococcus aureus

Recuento utilizando métodos oficiales Petrifilm (AOAC)

8 días

Alimentos frescos, procesados y congelados.

Depende de la naturaleza del alimento, en el caso de alimentos perecederos deben enviarse lo antes posible. Para evitar el deterioro.

Detección de enterotoxinas de

S. aureus utilizando Reacción en cadena de la polimerasa (PCR Punto Final)

5 días

Un subcultivo en medio no selectivo o en Medio de Transporte

Contacto

Otras condiciones:

otras (indique)

Cantidad mínima

Temperatura de

transporte (°C)

Tiempo máximo

transcurrido entre toma

de muestra y recepción

(horas)

Tipo de envase

Recuento de Clostridium perfringens

Recuento convencional utilizando método oficial FDA-BAM

10 días

Alimentos frescos, procesados y congelados

Depende de la naturaleza del alimento, en el caso de alimentos perecederos deben enviarse lo antes posible. Para evitar el deterioro.

Detección de enterotoxinas de C. perfringens utilizando Reacción en cadena de la polimerasa (PCR Punto Final)

5 días

Francisco Duarte Martínez

fduarte@inciensa.sa.cr

Shigella sonnei

Pulsotipos de Shigella sonnei (especialmente cepas asociadas a brotes, se requiere información clínico epidemiológica) utilizando Electroforesis de campo pulsado (PFGE)Método Pulsenet internacional

15 días

Francisco Duarte Martínez

fduarte@inciensa.sa.cr

Fin de documento

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