c o n t a c t ︳ r eid -2019@l ist es.ir d .f r

in sc r ipt io n o bl ig at o ir e

pa r t ic ipat io n g r at u it e po u r l es ét u d ia n t s o u d o c t o r a n t s in sc r it s ava n t l e 12/04/19per ma n en t s/ po st -d o c t o r a n t s : 72€ ava n t / 90€ a pr ès l e 12/04/19c l ô t u r e d es in sc r ipt io n s : 06/ 05/ 19

Le comité d’organisat ion de REID+IMMUNINV-2019 : unités BGPI︳ CBGP︳ CEFE︳ DGIMI︳ IHPE︳ IPM E︳ ISEM︳ M IVEGEC

Université de Montpellier (Campus Triolet)

pr o g r amme & in f o s

20 - 23 mai2019R E I D - I M M U N I N V

Réseau Immunologie des InvertébrésRéseau Ecologie des Interactions Durables +

https:/ / reid-immuninv-2019.edu.umontpellier.fr/

réal

isat

ion ︳

com

mun

icat

ion

ISEM

Comité d’organisation

Sponsors : Université de Monpellier, INRA, Labex Cemeb, Agropolis Fondation, Région Occitanie, Memmert

Plan d’accès Localisation du Campus Triolet de l’Université de Montpellier : https://www.google.com/maps/place/B%C3%A2timent+5+FDS/@43.6326216,3.8615398,18z/data=!4m8!1m2!2m1!1suniversit%C3%A9+de+montpellier+campus+triolet+batiment+5!3m4!1s0x12b6aedeee23c881:0x646263ce2c15978b!8m2!3d43.6330504!4d3.8621501 Il est devenu impossible/interdit de rentrer ou se garer sur le campus Triolet en voiture et particulièrement difficile de se garer aux alentours. Il vaut mieux privilégier une arrivée par le tram (ligne 1, arrêt des Universités Sciences et Lettres). Il existe plusieurs parkings relais le long de cette ligne avec des solutions ‘TRAM+parkings’ très intéressantes (la journée de parking vient avec un billet de tram AR (voir http://www.tam-voyages.com/presentation/?rub_code=1&thm_id=8). Plan d’accès à pied au Campus Triolet, à partir de l’arrêt de tram « Universités Sciences et Lettres » :

Tram Ligne 1, direction MossonStop: Université desSciences et Lettres

Bât 5 : amphis 5.03 & 5.04 ; TD 5.17 (pause café)

Bât 4, salle A, Buffet

14:00 –15:45

Ecology and evolution:

Spatio-tem

poral dynamics

16:15–

17:45E

cology and evolution: W

ithin-host dynamics and

imm

une responses

9:15 –10:30

Imm

uno-ecology and evolution

11:00–

12:30A

pplications

14:15 –16:45

The microbiom

e perspective

18:30 –20:30

Buffet &

session poster

9:30 –14:40

Epidémiologie et

surveillance

REID

-IMM

UN

INV

(Am

phi5.03)

REID

-IMM

UN

INV

(Am

phi5.03)

9:15 –11:30

Spécial IM

MU

NIN

V11:30

–12:30

Spécial R

EID

14:40–

18:00E

cologie, Microbiote

&

Sym

biose, Discussion

générale

TMT

(Am

phi5.04)R

EID / IM

MU

NIN

V(A

mphi5.03)

CLO

NA

LITÉ (S

alle 4.A)

14:00–

17:00

TMT

(Am

phi5.04)

9:30 –12:00

Mécanism

eMoléculaire,

CompétenceVectorielleet

Lutte

14:00–

15:40Tiques&

Société

Lundi20/05/19

Mardi

21/05/19

Mercredi

22/05/19

Jeudi23/05/19

RE

ID-IM

MU

NIN

V 2019, U

niversité de Montpellier, C

ampus Triolet

Programme REID-IMMUNINV 2019, Université de Montpellier, Campus Triolet Lundi 20/05/19 REID-IMMUNINV: Ecology and evolution: Spatio-temporal dynamics (Amphi 5.03) 14:00 Elisabeth FOURNIER: Influence de la biodiversité cultivée sur l’évolution des populations d’agents

pathogènes : le cas de l’interaction riz / pyriculariose dans l’agrosystème traditionnel des terrasses du YuanYang

14:15 Antoine PERRIN: Perte versus Fragmentation de l’habitat, quelle réponse des parasites ? 14:30 Nathalie ZEBALLOS: Conséquences éco-évolutives de compromis de traits d'histoire de vie dans des

systèmes hotes- parasites spatialement structurés

14:45 Julie ISAIA: Les sources d’hétérogénéité d’infection chez les vecteurs de la malaria aviaire 15:00 Giacomo ZILIO: Spatial selection and experimental evolution of parasite dispersal strategies 15:15 Louise NOERGAARD: Infection in patchy populations : partitioning pathogen invasion success and

dispersal under different phases of host colonisation 15:30 Romain PIGEAULT: Dynamique de distribution spatiale et temporelle de Plasmodium au sein de l’hote

vertébré : impact sur la transmission 15:45 Pause café (salle TD 5.17)

Ecology and evolution: Within-host dynamics and immune responses (Amphi 5.03) 16:15 Samuel ALIZON: Within-host ecological dynamics of HPV in genital infections : the PAPCLEAR study 16:30 Cybèle PRIGOT-MAURICE: I will fight better once I meet you twice : on the trail of immune priming

against Salmonella in the common woodlouse 16:45 Benjamin GOURBAL: Innate immune memory, a new paradigm in vertebrate immunity: molecular bases

beyond phenotypes in the vector snail Biomphalaria glabrata 17:00 Delphine DESTOUMIEUX-GARZON: L’élimination des hémocytes détermine le succès parasitaire des

Vibrio pathogènes de l’huitre Crassostrea gigas 17:15 Elisabeth HUGUET: Intégration de bracovirus dans les génomes de lépidoptères hôte et non hôte 17:30 Alexandra CERQUEIRA DE ARAUJO: Etude de l'évolution de domestications virales récentes au sein de

guëpes parasitoides Campopleginae via des approches fonctionnelles et génomiques

Mardi 21/05/19 REID-IMMUNINV: Immuno-ecology and evolution (Amphi 5.03) 09:15 Guillaume MITTA: Cracking the code of the Pacific oyster mortality syndrome 09:30 Nicolas NEGRE: Réponse immunitaire de Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) à l'infection

par différents organismes entomopathogènes 09:45 Louise HUOT: Dissecting the immune response of a lepidopteran pest to

an entomopathogenic nematobacterial complex 10:00 Mariana GALAVAO FERRARINI: Development of a Dual-RNAseq strategy to unravel the molecular bases

of host-symbiont interactions 10:15 François LALLIER: Le role de l’immunité et de l’apoptose dans la régulation de la symbiose entre la

moule Bathymodiolus azoricus et ses endosymbiotes chimiosynthétiques 10:30 Pause café (salle TD 5.17)

Applications (Amphi 5.03) 11:00 Aurélie PERRIN: Les densovirus : le renouveau d’un agent de lutte biologique contre les Aedes urbains

vecteurs d’arboviroses 11:15 Louis GOUAGNA: Beyond mating competitiveness: Behavioural and physiological determinants of

sterile male fitness in support of SIT against Aedes albopictus 11:30 Jordan VACHERON: Invasion et mise à mort d’un insecte nuisible par Pseudomonas protegens CHA0 11:45 Edwige GUISSOU: Déterminants génétiques de la période d’incubation extrinsèque de Plasmodium

falciparum chez les anophèles vecteurs 12:00 Angélique BESSON-BARD: Analysis of the cross‐regulation between immunity, growth and iron

homeostasis in plants 12:15 Manon VILLA: Résistance aux antipaludiques et transmission 12:30 Buffet

The microbiome perspective (Amphi 5.03) 14:15 Florian BINETRUY: Co-diversification history of ticks and their microbiome 14:30 Camille HUOT: Microbiota structure and dynamics in planorbid snails, vector of the human parasites

Schistosoma spp 14:45 Bessem CHOUAIA: Developmental stages and gut microenvironments influence gut microbiota

dynamics in the invasive beetle Popillia japonica Newman (Coleoptera: Scarabaeidae) 15:00 Simon FELLOUS: Microbial warfare between competing Drosophila species hints for evolution-proof

crop protection 15:15 Natacha KREMER: Impact of polymicrobial interactions on Drosophila physiology 15:30 Pause café (salle TD 5.17)

16:00 Manon FALLET: Transgenerational response to early microbial exposure in the oyster Crassostrea gigas and positive impact on survival capacities to juvenile mortality syndrome

16:15 Alexis BENARD: Rapid evolution of symbiotic association in response to stress 16:30 Robin GUILHOT: How to disentangle symbiont effects on host resource acquisition and plasticity and

why it matters for their evolution 16:45 Photo Participants REID-IMMUNINV ; Discussion : Future REID, IMMUNINV 2020

18:30 Buffet & session poster Annia ALBA: Pseudosuccinea columella – Fasciola hepatica interaction: on the mechanistic and immunobiological bases of the snail host resistance/susceptibility to its parasitic trematode Sylvain Benhamou: Influence of bacterial symbionts on host niche and ecological diversification: a metabolic approach in whitefly model Lucas Bonometti: Local patterns of virulence and resistance in wild host-pathogen populations. Magali Eychenne: Production de mutants perte de fonction chez la noctuelle ravageur de culture, Spodoptera

frugiperda grâce à CRISPR/Cas9. Elisabeth Fournier: Le projet ANR GANDALF (2013-2017) : un projet fédérateur pour le groupe « Champignons » du REID

Benjamin Herran: Impact of the Wolbachia endosymbiont on the AGH pathway in Armadillidium vulgare

Damien Lassalle: Diversity of beta pore forming toxin family members in the interaction between the snail Biomphalaria glabrata and the trematode parasite Schistosoma mansoni Clementine Leroy: Snail-Trematodes interactions: how seasonal dynamics of parasite transmission are affected by water management in a complex wetland network? Lourdes Mateos-Hernández: Anti-α-Gal antibodies in dogs: Potential role in red meat allergy and protection against tick-borne pathogens Noureddine Mechouk: Summer Abundance of Ixodes ricinus infesting lizards in Ain Kerma (El Tarf), Northeast Algeria Noureddine Mechouk: Molecular evidence of bacteria in Melophagus ovinus sheep keds and Hippobosca equina forest flies collected from sheep and horses in northeastern Algeria. Daniel Oyanedel-Trigo: Multifaceted adaptations of vibrios to their molluscan host, the oyster Crassostreae gigas. Jordan Rossi: Analysis of the role of nitric oxide (NO) in the cross‐regulation between immunity, growth and iron homeostasis in plants Marion Varoqui: Conséquences de l’échelle de la compétition sur le maintien de diversité : Evolution expérimentale du parasite Tetranychus urticae sous hard versus soft selection Carole VINCENT-MONEGAT: 4IN: an Interactive database for Insect Innate Immunity

Mercredi 22/05/19 Sessions parallèles spécial IMMUNINV (Amphi 5.03) 09:30 Isabelle DARBOUX: Les longs ARNs non codant : de nouveaux régulateurs de l’immunité chez les

lépidoptères ? 09:45 Armel GALLET: The DH31/CGRP enteroendocrine peptide triggers intestinal contractions favoring the

elimination of opportunistic bacteria 10:00 Camille HOUDELET: The MALDI-BeeTyping, an innovative method to monitor the impact of a gut

pathogen on bee health 10:15 Maxime LEPRETRE: Proteomic characterization of the zebra mussel immune system by proteogenomics

and comparative proteomics in hemocytes and plasma 10:30 Pause café (salle TD 5.17)

11:00 Julien ORLANS: PGRP-LB, acteur majeur du maintien et du controle de l’endosymbiose chez le charançon des céréales

11:15 Christine PAILLARD: Transcriptomic analysis of clam Extra Pallial Fluids reveals immunity and cytoskeleton alterations in the first week of Brown Ring Disease development

spécial REID (Amphi 5.03) 11:30 Florian CHARRIAT: Analyse guidée par la structure de l'évolution des effecteurs dans les lignées de

Pyricularia oryzae infectant les céréales 11:45 Pilar ALDA: Distribution, history and phylogenetic relationships of Galba species, a group of cryptic and

world-wide freshwater snails 12:00 Antonio VASQUEZ: Who is responsible for fasciolosis transmission in the West Indies? A snail given

response 12:15 Elisabeth HERNIOU: Prevalence and diversity of ssRNA+ honey bee-infecting viruses in wild

hymenoptera 12:30 Buffet

Réunions groupes CLONALITÉ : hétérogénéité phénotypique (salle 4.A) 14:00 Alain GIVAUDAN: Présentation du groupe de réflexions : hétérogénéité clonale (variation phénotypique)

chez les procaryotes 14:15 François DELAVAT: Development of genetic tools to study the phenotypic heterogeneity within a Vibrio

harveyi strain pathogen of molluscs 14:45 Leyla SLAMTI: The stationnary phase regulator CpcR controls cell differenciation and cry gene expression

in Bacillus thuringiensis 15:15 Alice GUIDOT: Spontaneous mutations in a regulatory gene induce phenotypic heterogeneity and

adaptation of Ralstonia solanacearum to changing environments 15:40 Pause café (salle TD 5.17) 16:00 Amaury PAYELLEVILLE: Whole genome DNA methylation (Methylome), transcriptomic and phenotypic

analysis revealed involvement of Dam DNA methyltransferase in gene regulation in Photorhabdus

luminescens 16:30 Julien BRILLARD: DNA methylation and the Redox regulator OxyR: an epigenetic story in the

entomopathogenic bacterium Xenorhabdus?

16:45 Discussion générale / conclusion

17:00 Clôture de la journée

TIQUES et MALADIES des TIQUES (TMT) Epidémiologie & Surveillance (Amphi 5.04) 09:30 Olivier PLANTARD: Ixodes frontalis, une espèce de tique fréquente et facile à collecter au drap ou au

drapeau quand on sait où la chercher ! 09:50 Maggy JOUGLIN: Première détection et identification moléculaire de l'espèce zoonotique Anaplasma

capra sur Cervidés captifs en France 10:10 Laurence MALANDRIN: Collecte et identification des tiques dans une Réserve zoologique 10:30 Pause café (salle TD 5.17)

11:00 Valentin OLLIVIER: Le chevreuil sentinelle du risque de la contamination humaine par les maladies à tiques ?

11:20 Karine CHALVET-MONFRAY: Bilan de 5 ans de suivi mensuel d’un réseau d’observatoires d’Ixodes ricinus 11:40 Raphaël ROUSSEAU: Identification des pâtures à risque pour l’ehrlichiose bovine en Wallonie (Belgique) 12:00 Sébastien GRECH-ANGELINI: Première détection d’anticorps dirigés contre le virus de la fièvre

hémorragique de Crimée-Congo chez des ruminants corses

12:30 Buffet 14:00 Achille Sougrinoma OOUEDRAOGO: Cross border transhumance, a dissemination way of ticks and tick-

borne pathogens in West Africa

14:20 Albert AGOULON: Influence de la meteorologie sur la dynamique des populations des stades libres des tiques Ixodes ricinus et I. frontalis : Determination des fenetres temporelles optimales par l’approche des cross correlation maps

Ecologie, Microbiote et Symbiose (Amphi 5.04) 14:40 Karen MCCOY: Evaluating functional dispersal and its eco-epidemiological implications in a nest

ectoparasite

15:00 Thomas POLLET: The concept of scale in tick microbial community ecology 15:20 Emilie LEJAL: Microbiote de tique ou microbiote de kit ? 15:40 Pause café (salle TD 5.17)

16:10 Marie BUYSSE: Diversité, répartition, tropisme tissulaire et mode de transmission de Rickettsia lusitaniae chez les tiques molles Ornithodoros spp.

16:30 Olivier DURON: Quelle importance de la diversité microbienne chez les tiques? 16:50 Discussion générale TMT 18:00 clôture de la journée

20:00 Restaurant (au frais des participants)

Jeudi 23/05/19 Mécanisme Moléculaire, Compétence Vectorielle et Lutte (Amphi 5.04) 09:30 Rémi PEREIRA DE OLIVEIRA: Etude de la compétence vectorielle des tiques molles du genre

Ornithodoros pour le virus de la Peste Porcine Africaine en Europe 09:50 Lourdes MATEOS HERNANDEZ: Neuronal Basis of Tick-Pathogen Interactions 10:10 Claude RISPE: Deciphering the synganglion transcriptome of Ixodes ricinus 10:30 Manon LEMASSON: Etude des mécanismes moléculaires de la compétence vectorielle d’Ixodes ricinus

pour deux flavivirus 10:50 Pause café (salle TD 5.17)

11:20 Camille MIGNE: Variabilité Génétique des virus transmis par les tiques et identification de nouvelles cibles pour la lutte antivirale

11:40 Nathalie BOULANGER: Mesure de la compétence vectorielle des tiques par protéomique

12:00 Buffet Tiques & Société (Amphi 5.04) 14:00 Jonas DURAND: CiTIQUE, les sciences participatives au service de tous 14:20 Julie FIGONI: Surveillance de la Borréliose de Lyme en France entre 2005 et 2017 14:40 Costanza PUPPO: Prévention et prise en charge de la maladie de Lyme : de la complexité et de la

nécessité d’intégrer divers déterminants psychosociaux 15:00 Magalie RENE-MARTELLET: Intérêt des données de téléphonie mobile et des sciences participatives pour

l’estimation et la compréhension du risque de transmission de maladies liées à l’environnement : Application aux maladies transmises par les tiques

15:20 Laure MATTHEWS-MARTIN: Etude des risques associés aux tiques dans les parcs urbains et périurbains en région lyonnaise

15:40 Fin des TMT2019

1

Résumés pour REID-IMMUNINV, CLONALITÉ, TMT, POSTERS, par ordre alphabétique de

conférencier (souligné)

REID-IMMUNINV

Within-host ecological dynamics of HPV in genital infections : the PAPCLEAR study

Samuel Alizon & PAPCLEAR team

MIVEGEC, CNRS, IRD, Université de Montpellier

samuel.alizon@cnrs.fr Human papillomaviruses (HPVs) are among the most oncogenic microbes infecting humans. They are responsible for nearly

all cervical cancers and for a significant fraction of anal, head-and-neck, and other cacners. Most HPV genital infections are

‘acute’, that is non-persistent. Yet, for HPVs, as for many other oncoviruses, there is a striking gap between our detailed

understanding of chronic infections and our limited data on the early stages of infection. The clinical study PAPCLEAR has

started two year ago to follow the whole course of HPV infections in young women. The main data we collect are virus

loads (via qPCR), immune cell counts (via FACS) and cytokine densities (via MSD) in the cervix area, vaginal microbiota and

systemic antibodies. The goal is to combine this longitudinal data to within-host population dynamics models inspired from ecology in order to infer parameters and even compare models. A better understanding of HPV kinetics in acute infections,

especially the associated immune response, can have important implications in the context of mass vaccination. I will

present early results from the clinical study along with models for HPV ecological and evolutionary dynamics.

Distribution, history and phylogenetic relationships of Galba species, a group of cryptic and world-wide

freshwater snails

Pilar Alda, Manon Lounnas, Antonio Alejandro Vázquez, Patrice David, Philippe Jarne, Jean-Pierre Pointier,

Sylvie Hurtrez-Bousses MIVEGEC, University of Montpellier, CNRS, IRD, Montpellier, France

pilaralda@gmail.com Cryptic species are a major problem in systematics, biogeography and disease dynamics—especially if they are invasive or

transmit parasites or pathogens. We studied a group of cryptic freshwater snails that invade almost all continents and

transmit liver flukes to humans and livestock. We aim to clarify the distribution, history and phylogenetic relationships of

Galba species based on a sound approach that included morphology, molecular markers, the widest scale sampling to date

in the Americas and data retrieved from GenBank. Our results indicate that the genus Galba comprises five species. Galba cousini differs from other species on both shell morphology and internal anatomy (a derived trait), and is also probably the

only outcrossing Galba species and has the most restricted distribution within the group. The other four species—G. truncatula, G. viator, G. humilis and G. schirazensis—are morphologically similar (cryptic species), but each constitute a

unique phylogenetic clade. These species differ in amount of genetic diversity, geographic distribution and invasiveness.

Our analysis suggests that the genus Galba originated in North America around 5.6 Myr. We also discuss the possibility that

the Galba ancestor switched to more amphibious habitats favoring these species in avoiding competition with other

freshwater snails. Thereafter, selection might have stabilized a phenotype well adapted to these habitats, explaining why this group remains in a morphological stasis. We finally highlight that identifying Galba species requires molecular markers

and that sampling should be geographically extended, especially in North America, Eurasia and Africa, to clarify their

distribution and interactions.

Rapid evolution of symbiotic association in response to stress

ALEXIS BÉNARD, ANGELO JACQUET, FABRICE VAVRE, NATACHA KREMER

43 bd du 11 novembre 1918, Bât. Grégoire Mendel - 69622 VILLEURBANNE cedex alexis.benard@univ-lyon1.fr Animals live in symbiosis with tightly regulated bacterial communities that strongly impact their phenotype. While bacteria

were classically associated with pathogenesis, recent work on microbiota shows that they can also be beneficial. For

instance, the maternally-inherited bacterium Wolbachia is known to interfere with RNA-viruses replication, a property

currently used to reduce the spread of mosquito-vectored viruses. Wolbachia is beneficial in case of viral infection, but its

presence within host cells also induces direct costs. Because virulence and viral protection are density-dependent, a tight

regulation of the Wolbachia density is generally observed within host cells, selecting for an optimal bacterial density. When

a stress occurs, it can impact the host directly, but also indirectly through a modification of its symbiotic community. To

study the evolution of symbiotic associations in response to stress and to determine how they can adapt to new

environments, we performed experimental evolution of flies, infected or not by Wolbachia, under different stress

conditions. The aim of this project is to understand: 1) how stresses influence the physiology of both partners and how the

bacterial population is impacted? 2) what is influence of plasticity and selection in the return or not to the optimal density?

3) what are the mechanisms involved in the responses to stress? We will focus here on the direct impact of oxidative stress

and/or viral stress on various host and bacterial life-history traits. These results pave the way for understanding the

evolutionary and physiological mechanisms that occur in symbiotic interactions in response to stress.

2

Analysis of the cross‐regulation between immunity, growth and iron homeostasis in plants

Pauline Trapet, Jordan Rossi, Agnès Klinguer, Laure Avoscan, Sylvie Mazurier, Philippe Lemanceau, David

Wendehenne and Angélique Besson-Bard

UMR 1347 Agroécologie, AgroSup Dijon, CNRS, INRA, Univ. Bourgogne, Univ. Bourgogne Franche-Comté, F-

21000 Dijon, France

angelique.besson-bard@u-bourgogne.fr The existence of a tightly regulated balance between growth and immunity in plants has recently emerged. In this study,

we challenged this concept thanks to the biological model pyoverdine-Arabidopsis thaliana. Pyoverdine is a siderophore

produced by the plant growth promoting rhizobacteria Pseudomonas fluorescens C7R12. Under iron deficiency, P. fluorescens excretes the iron free form of pyoverdine (apo‐pyo) in the soil. Once chelated with iron (ferri‐pyo), the complex is internalized by the bacteria. We demonstrated that Arabidopsis thaliana plants treated by apo‐pyo in a medium containing or not iron internalize pyoverdine. Interestingly, apo‐pyo-treated plants did not show a typical growth reduction

induced by iron deficiency. Accordingly, the expression of genes related to growth, development and iron uptake/transport

was induced, these latter being involved in the growth improvement induced by apo‐pyo under iron deficiency. In contrast, a strong down-regulation of the expression of genes related to immunity was observed. Furthermore, the resistance to the

fungal pathogen Botrytis cinerea conferred by iron deficiency was partially impaired following apo‐pyo treatment. The overexpression of the HBI1 transcription factor, known to be involved in the growth‐immunity tradeoff, was linked to the above observations. These apo‐pyo effects were not observed after treatment of plants under iron sufficient conditions,

indicating that apo‐pyo effects are dependent on the plant iron status. To conclude, this work draws first elements of

pyoverdine effects on plant physiology. In a larger view, this work supports the recent concept of the existence of a cross‐regulation between growth, immunity and iron homeostasis in plants.

Co-diversification history of ticks and their microbiome

Florian Binetruy, Marie Buysse, Roxanne Barosi and Olivier Duron

Centre IRD, 911 avenue Agropolis, 34394 Montpellier

florian.binetruy@ird.fr Macroorganisms are typically colonized by an aggregate of microorganisms that resides within their body. In arthropods,

microorganisms use a large panel of lifestyle strategies to spread and persist within host populations: while some are

pathogens, moving from through infectious (horizontal) transmission, some others, at the opposite of the continuum,

behave as mutualists, undergoing exclusive maternal (vertical) transmission. This web of interactions can structure

complex within-host microbial communities but their composition remains nevertheless highly variable: host species, life

stage, feeding status and a wide array of environmental constraints are known key drivers of their structure. Another

possible driver, albeit rarely investigated, is the phylogenetic relatedness within a clade of host species: related host

species are likely to share similar physiology/ecology and may thus harbour similar microbial communities. Here we

examined this issue through the characterization of the core microbial communities hosted by tick species of genus

Amblyomma from South America and Africa. To this aim, the phylogeny of Amblyomma was first determined through a

nuclear DNA segment encompassing 18S-28S genes and the associated microbial communities were further characterized through 16S rRNA MiSeq barcoding. Analysis of these dataset will offer excellent opportunities to tackle questions about

the impact of host phylogenetic barriers on structuring microbial communities.

Etude de l’évolution de domestications virales récentes au sein de guêpes parasitoïdes Campopleginae via des approches fonctionnelles et génomiques

Cerqueira de Araujo, Alexandra ; Leobold, Matthieu ; Bézier, Annie ; Drezen, Jean-Michel ; Josse, Thibaut ;

Huguet, Elisabeth Institut de Recherche sur la Biologie de l'Insecte - UMR 7261, Université François-Rabelais Tours, UFR Sciences

et Techniques, Avenue Monge, Parc de Grandmont, 37200 Tours, France alexandra.cerqueiradearaujo@etu.univ-tours.fr Les Nudivirus sont connus pour s’être intégrés dans le génome de centaines d’especes de guêpes parasitoïdes. Chez les Braconidae ayant intégré un virus appartenant au genre Betanudivirus, les guêpes utilisent l’intégration virale pour accomplir leur cycle de vie parasite dans leur hôte lépidoptère en altérant le système immunitaire de celui-ci grâce à des

particules virales, injectées pendant l’oviposition, contenant des cercles d’ADN. Plus récemment, des genes nudiviraux appartenant au genre Alphanudivirus ont été endogénéisés dans le génome d’une guêpe ichneumonide, appartenant à la sous-famille des Campopleginae, nommée Venturia canescens. A la différence de ce qui est retrouvé chez les Braconidae,

Venturia canescens produit des Virus-Like-Particles (VLPs), des particules semblables aux particules virales, qui ne

contiennent pas de cercles d’ADN mais, à la place, contiennent des facteurs de virulence d’origine protéique. Tres récemment, des gènes nudiviraux impliqués dans la formation des VLPs ont été identifiés chez une autre espèce de guêpe Campopleginae : Campoplex capitator, phylogénétiquement proche de Venturia canescens, offrant ainsi la possibilité

d’utiliser des approches fonctionnelles et génomiques afin de mieux appréhender les mécanismes précoces impliqués dans

la domestication virale et de déterminer si les mêmes trajectoires évolutives ont été empruntées pour aboutir à la

production de VLPs. Il sera présenté ici les approches fonctionnelles (cinétique d’expression et interférence ARN),

3

génomiques (séquençage haut débit de longs fragments d’ADN) et moléculaires utilisées dans le but d’étudier l’évolution de symbioses virales récentes chez les guêpes parasitoïdes Campopleginae.

Analyse guidée par la structure de l'évolution des effecteurs dans les lignées de Pyricularia oryzae infectant

les céréales

Charriat F, Ravel S, Gracy J, Cros-Arteil S, Fournier E, Kroj T, Gladieux P

Campus International de Montferrier-Baillarguet

florian.charriat@inra.fr Les champignons pathogenes des plantes sécretent des petites protéines, appelée effecteurs, qui leur permettent de

modifier la physiologie et l’immunité de leur hote à leur propre avantage. La principale difficulté pour analyser l’évolution

et la fonction des répertoires d’effecteurs est leur extrême richesse et diversité nucléotidique, qui interdisent la définition

de famille multigéniques. Afin de contourner ce verrou méthodologique, nous nous sommes concentré sur une famille

d'effecteurs récemment identifiée, les effecteurs MAX, qui présentent une conservation de structure tridimensionnelle

plutot que de séquence. Les effecteurs MAX sont présents dans le champignon pathogene des céréales Pyricularia oryzae, qui représente une menace pour la sécurité alimentaire du fait de sa capacité à s’adapter à de nouveaux hotes. Notre

objectif était de comprendre comment les changements dans le répertoire et la séquence des effecteurs MAX participe à

l’adaptation de P. oryzae de nouveaux hotes. Plus de 200 génomes de P. oryzae représentatifs de ses dix principales lignées

hotes spécifiques ont été assemblés et annotés, et nous avons développé un nouveau pipeline utilisant des données

transcriptomiques et protéiques afin d’améliorer la prédiction des effecteurs MAX. Des analyses d’orthologie et les

annotations fonctionnelles révelent une variation importante de la composition du répertoire d’effecteurs MAX au sein et

entre les lignées, ainsi que de fréquentes insertions d’éléments transposables, relativement au reste de l’effectome ou du

génome. Nos résultats permettent aussi d’identifier des événements de perte ou de gain d’effecteurs potentiellement

impliqués dans les changements d’hotes, qui font l’objet d’une validation expérimentale.

Developmental stages and gut microenvironments influence gut microbiota dynamics in the invasive beetle

Popillia japonica Newman (Coleoptera: Scarabaeidae)

Bessem Chouaia, Giuseppe Mazza, Sumer Alali, Matteo Callegari, Elena Crotti, Daniele Daffonchio, Alberto

Alma, Francesco Paoli, Pio Federico Roversi, Leonardo Marianelli, Matteo Montagna

Department of Molecular Sciences and Nanosystems, Ca' Foscari University of Venice, Via Torino, 155. 30172,

Venice bessem.chouaia@unive.it Popillia japonica Newman (Coleoptera: Scarabaeidae) is a highly polyphagous invasive beetle originating from Japan. This

insect is highly resilient and able to rapidly adapt to new vegetation. Insect-associated microorganisms can play important

roles in insect physiology, helping their hosts to adapt to changing conditions and potentially contributing to an insect’s invasive potential. Such symbiotic bacteria can be part of a core microbiota that is stably transmitted throughout the host’s life cycle or selectively recruited from the environment at each developmental stage. The aim of this study was to

investigate the origin, stability and turnover of the bacterial communities associated with an invasive population of P. japonica from Italy. Our results demonstrate that soil microbes represent an important source of gut bacteria for P. japonica larvae, but as the insect develops, its gut microbiota richness and diversity decreased substantially, paralleled by

changes in community composition. Notably, only 16.75% of the soil bacteria present in larvae are maintained until the

adult stage. We further identified the micro-environments of different gut sections as an important factor shaping

microbiota composition in this species, likely due to differences in pH, oxygen availability and redox potential. In addition,

P. japonica also harbored a stable bacterial community across all developmental stages, consisting of taxa well-known for

the degradation of plant material, namely the families Ruminococcacae, Christensenellaceae and Lachnospiraceae.

Interestingly, the family Christensenallaceae had so far been observed exclusively in humans. However, the

Christensenellaceae OTUs found in P. japonica belong to different taxonomic clades within this family.

Les longs ARNs non codant : de nouveaux régulateurs de l’immunité chez les lépidoptères ?

Fabrice Legeai, Stéphanie Robin, Véronique Jouan, Cécile Clouet, Mylène Ogliastro et Isabelle Darboux UMR 1333 INRA - Université de Montpellier, Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes-Insectes

(DGIMI), 34095 Montpellier Cedex 5 - FRANCE

isabelle.darboux@inra.fr Les longs ARN non codants (lncRNAs) sont considérés comme une nouvelle catégorie de facteurs régulateurs de

l’expression génique, impliqués dans de nombreux processus biologiques cruciaux. Ces molécules sont définies comme des ARNs d’une taille supérieure à 200 nucléotides, dépourvus de la capacité à coder pour des protéines, et caractérisés par

une haute spécificité cellulaire d’expression. Ils sont en outre peu conservés entre especes. Si les lncRNAs de mammiferes font l’objet de recherches approfondies du fait de leur implication dans de nombreuses pathologies humaines, leur

importance potentielle dans les interactions insectes-pathogènes reste encore très peu abordée. Nous avons développé

une approche de séquençage à haut débit pour identifier le répertoire de lncRNAs différentiellement exprimés (DE) lors

d’une infection virale des chenilles de la légionnaire d’automne, Spodoptera frugiperda. Nous avons évalué l’influence de

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deux parametres sur le l’expression des lncRNAs : la spécificité tissulaire (hémocytes vs corps gras) et la spécificité de la

réponse à un type de virus (polydnavirus vs densovirus). Nous avons ainsi identifiés 4273 transcrits non codant,

correspondant à 3186 loci, exprimés dans les hémocytes et corps gras. Nous avons également montré que les 2

pathogenes viraux induisent la régulation de plusieurs lncRNAs dont certains sont spécifiques d’un seul virus et/ou d’un seul tissu. Ces résultats suggerent que les lncRNAs pourraient représenter des régulateurs essentiels de l’infection virale chez S. frugiperda.

L’élimination des hémocytes détermine le succès parasitaire des Vibrio pathogènes de l’huitre Crassostrea gigas.

Tristan Rubio, Daniel Oyanedel-Trigo, Yannick Labreuche, Eve Toulza, Xing Luo, Maxime Bruto, Cristian

Chaparro, Marta Torres Bejar, Julien de Lorgeril, Philippe Haffner, Jeremie Vidal-Dupiol, Arnaud Lagorce, Bruno

Petton, Guillaume Mitta, Annick Jacq, Frédérique Le Roux, Guillaume Charrière et Delphine Destoumieux-Garzón

IHPE UMR5244 Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia. Place Eugène

Bataillon cc80, 34090 Montpellier cedex 5

ddestoum@ifremer.fr Les espèces de Vibrio ont établi des relations allant du mutualisme au parasitisme avec les mollusques. A ce jour, les

facteurs hôtes et pathogènes qui déterminent l'issue des infections à Vibrio restent mal compris. Nous avons étudié ces

mécanismes chez l’huitre Crassostrea gigas en utilisant deux espèces de Vibrio pathogènes. Nous observons que les

hémocytes de l'huitre controlent efficacement l’infection par les souches non pathogenes dans l’hémolymphe. A l’inverse, toutes les souches pathogènes échappent à ce contrôle grâce à leurs propriétés cytotoxiques envers les hémocytes. En

analysant les réponses transcriptionnelles de l'hote et des bactéries lors d’infections expérimentales, nous avons identifié des mécanismes de lyse des hémocytes distincts chez Vibrio crassostreae et V. tasmaniensis. Dans les infections à V. crassostreae, la cytotoxicité dépend du contact direct avec les cellules immunitaires et nécessite un gène ancestral codant pour une protéine de fonction inconnue, R5-7. En revanche, chez V. tasmaniensis, qui a perdu ce gène ancestral, la

cytotoxicité est dépendante de la phagocytose et nécessite un système de sécrétion de type 6 (T6SS) et la sécrétion

intracellulaire d’effecteurs. Ces mécanismes de cytotoxicité sont nécessaires à la virulence. Ainsi, l'issue des infections

dépend de déterminants moléculaires propres à chaque espèce de Vibrio pathogène mais qui convergent pour éliminer les

hémocytes, permettant ainsi l'échappement aux défenses cellulaires de leur hôte.

Transgenerational response to early microbial exposure in the oyster Crassostrea gigas and positive impact

on survival capacities to juvenile mortality syndrome.

Manon Fallet1, Bruno Petton2, Julien de Lorgeril3, Sébastien Comarmond1, Cristian Chaparro1, Eve Toulza1, Jean-Michel Escoubas3, Yannick Gueguen3, Guillaume Mitta1, Jérémie Vidal-Dupiol3, Christoph Grunau1,

Caroline Montagnani3, Céline Cosseau1 1 IHPE, Univ. Montpellier, CNRS, Ifremer, Univ. Perpignan Via Domitia, Perpignan France 2 IFREMER, UBO CNRS IRD, LEMAR UMR 6539, Argenton, France 3 IHPE, Univ. Montpellier, CNRS, Ifremer, Univ. Perpignan Via Domitia, Montpellier France

manon.fallet@gmail.com Since 2008, Crassostrea gigas juvenile oysters are subjected to drastic episodes of mortalities due to the «Pacific Oyster

Mortality Syndrome» (POMS) a disease primary triggered by a viral infection (Ostreid herpes virus 1 µVar) which induces

immunosuppression in the host and leads to the colonization of the oyster tissues by consortium of opportunistic and/or

pathogenic bacteria. In order to generate oysters with improved survival capacities when faced to the disease, we

stimulated them during their larval development with an environmental microflora. For this purpose, we exposed larvae

during their first 10 days of life to an environmental seawater microflora. Three months later, we challenged the juvenile

oysters with an experimental model of pathogenesis (contact with naturally infected oysters during a period of disease)

and monitored their mortalities. We found that oysters previously exposed to non-infectious microflora have better

survival rates than controls. Moreover, offspring (F1) of exposed oysters (F0) also displays a better survival which is also

true for the next generation (F2). To decipher mechanisms beyond survival improvement we performed RNA-sequencing,

16S barcoding, genetic and epigenetic analyses. RNA-seq and barcoding analyses in offspring of exposed oysters (F1)

revealed the impact of the treatment on oyster microbiota on the immune response. These results echo recent advances

on host-microbiota relationships showing that early interactions with the host immune system can shape beneficial host-

microbiota relationships contributing to the host health status. Ongoing analyses of genetic and epigenetic data will allow

us to further explore their respective contribution to the observed heritable phenotype.

Microbial warfare between competing Drosophila species hints for evolution-proof crop protection

Antoine Rombaut, Anne Xuéreb, Robin Guilhot, Kenza Qitout, Romain Gallet, Patricia Gibert and Simon Fellous

CBGP - INRA Montpellier

simon.fellous@inra.fr

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Despite the importance of deciphering the mechanisms of niche separation between species, the influence of symbiotic

microbes in competition remains seldom studied. Microbe-mediated niche partitioning may be particularly important in

fruit-flies, such as the agricultural pest Drosophila suzukii, which larvae rely on exo-symbiotic microbes for fruit

consumption. We discovered that ovipositing D. suzukii females avoid fruits previously exposed to the ubiquitous species

D. melanogaster. Using axenic strains, we further unveilled that microbes carried by D. melanogaster are responsible for

this repellency that appears mediated by short-scale taste perception. Comparison among D. suzukii populations indicates

the behavior is present in populations from both the native and invasive ranges but depends on its microbiota. It further

points to core bacterial symbionts of D. melanogaster as causative agents of the repellency. We mimicked natural

oviposition by the two species in fresh berries: mortality of D. suzukii larvae increased in the simultaneous presence of both larvae and symbionts of D. melanogaster, which explains D. suzukii behavior in evolutionary terms. Our study

highlights how symbiotic microbes may determine interspecific interactions and niche partitioning through niche

construction and behavior. We believe repellents based on the avoidance of costly conditions frequently experienced by

target insects may be evolution-proof. Indeed, insects that would become resistant to the repellent would pay an

ecological cost in non-protected sites where they would dismiss repellency signals and be exposed to harmful conditions.

Influence de la biodiversité cultivée sur l’évolution des populations d’agents pathogènes : le cas de l’interaction riz / pyriculariose dans l’agrosystème traditionnel des terrasses du YuanYang

E. Fournier, S. Ali, H. Adreit, S. Cros-Arteil, P. Gladieux, B. Jin, I. Meusnier, J. Milazzo, S. Ravel, D. Tharreau, H. Huang, J-B. Morel

UMR BGPI Inra-CIRAD-Montpellier SupAgro, TA A 54/K, Campus International de Baillarguet, F34398

Montpellier cedex 5

elisabeth.fournier@inra.fr Dans les agrosystemes modernes, l’utilisation d’un petit nombre de variétés dans des paysages homogenes favorise l’émergence de génotypes d’agents pathogenes virulents contournant les résistances des plantes et causant des dégâts

importants. La diversification des paysages variétaux représente un levier pour contraindre l’évolution des agents pathogenes. Pour mieux comprendre l’influence de la biodiversité cultivée sur la structure et l’évolution des populations pathogènes, nous étudions un agrosystème rizicole traditionnel du Sud de la Chine : les terrasses du YuanYang. Dans ce

système où de très nombreuses variétés de riz (majoritairement de type indica, avec quelques variétés japonica) sont cultivées conjointement depuis des siecles, aucune crise sanitaire majeure n’a été rapportée. Nous avons d’abord confirmé la très forte diversité génétique des riz dans la zone, générant un paysage variétal très hétérogène pour les populations

pathogenes. En prenant l’exemple de l’interaction du riz avec le champignon Pyricularia oryzae (agent de la pyriculariose),

nous avons ensuite montré que la culture en sympatrie de riz indica et japonica, dont les systèmes immunitaires sont très

contrastés, entraîne une adaptation locale des populations de P. oryzae, conduisant à une protection réciproque de ces

deux types de riz. Nous avons aussi montré qu’au sein des riz indica, la tres forte diversité intra- et inter-variétale

sélectionne des génotypes de P. oryzae généralistes et possiblement maladaptés. Enfin, l’introduction récente dans la zone d’une variété moderne à base génétique réduite provoque localement des baisses importantes de diversité cultivée, dont nous avons mesuré les conséquences sur la structure des populations de P. oryzae.

The DH31/CGRP enteroendocrine peptide triggers intestinal contractions favoring the elimination of

opportunistic bacteria

Olivia Benguettat, Rouba Jneid, Julie Soltys, Rihab Loudhaief, Alexandra Brun-Barale, Dani Osman, Armel Gallet

Institut Sophia Agrobiotech, UMR CNRS 7254/INRA 1355/UNS; 400 route des Chappes, BP 167; 06903 Sophia

Antipolis Cedex - France

gallet@unice.fr The digestive tract is the first organ affected by the ingestion of foodborne bacteria. While commensal bacteria become

resident, opportunistic or virulent bacteria are eliminated from the gut by the local innate immune system. Here we

characterize a new mechanism of defense, independent of the immune system, in Drosophila melanogaster. We observed

strong contractions of longitudinal visceral muscle fibers for the first 2 hours following bacterial ingestion. We showed that

these visceral muscle contractions are induced by immune reactive oxygen species (ROS) that accumulate in the lumen and

depend on the ROS-sensing TRPA1 receptor. We then demonstrate that both ROS and TRPA1 are required in a subset of anterior enteroendocrine cells for the release of the DH31 neuropeptide, which activates its receptor in the neighboring

visceral muscles. The resulting contractions of the visceral muscles favors quick expulsion of the bacteria, limiting their

presence in the gut. Our results unveil a precocious mechanism of defense against ingested opportunistic bacteria,

whether they are Gram-positive like Bacillus thuringiensis or Gram-negative like Erwinia carotovora carotovora. Finally, we

found that the human homolog of DH31, CGRP, has a conserved function in Drosophila.

Development of a Dual-RNAseq strategy to unravel the molecular bases of host-symbiont interactions

Mariana Galvao Ferrarini, Nicolas Parisot, Agnès Vallier, Justin Maire, Benjamin Gillet, Sandrine Hughes, Carole

Vincent-Monégat, Anna Zaidman-Rémy et Abdelaziz Heddi BF2i, INSA-Lyon, 11 Av. Jean Capelle, Villeurbanne

mariana.galvao-ferrarini@insa-lyon.fr

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One peculiar attribute to insects, including insect pests and disease vectors, is their ability to establish long-term

relationships with heritable nutritional intracellular bacteria (endosymbionts) that supplement their diet with limiting

nutrients and thereby improve their adaptive and invasive powers. These symbiotic associations have been extensively

studied on a physiological, ecological and evolutionary levels; however, few studies have focused on the molecular

dialogue between the host and its associated endosymbionts to identify the genes and pathways directly involved in this

symbiosis. The first studies in this field are based on the separate analysis of the insect and the endosymbionts, making it

difficult to decipher the genetic mechanisms underlying their interaction. Indeed, obtaining high-throughput data

simultaneously on the different symbiotic partners is a major technological bottleneck, and to overcome this issue, we

have developed a host-symbiont metatranscriptomic approach, called Dual-RNAseq. We applied this innovative technique for the study of the metamorphosis and the life cycle of a symbiotic holometabolous insect pest, the cereal weevil

Sitophilus oryzae. In cereal weevils, endosymbiotic bacteria Sodalis pierantonius are secluded in specialized host cells,

called bacteriocytes that form the bacteriome organ. During the insect’s life cycle, this organ undergoes a drastic reorganization and the bacterial load changes continuously. Using Dual-RNAseq at twelve stages of the cereal weevil’s

development, we are unraveling the molecular bases of this symbiotic reorganization - which includes de-regulation of

genes invoved in cell motility and cell adhesion - as well as the network of interactions between the two symbiotic partners

in this process.

Beyond mating competitiveness: Behavioural and physiological determinants of sterile male fitness in

support of SIT against Aedes albopictus David Damiens, Clélia Oliva and Louis-Clément Gouagna.

Institut de Recherche pour le Développement (IRD)

louis-clement.gouagna@ird.fr Currently, control of diseases spread by Aedes mosquitoes, e.g. chikungunya, dengue, and Zika, relies on broad-spectrum

insecticide sprays. With the evolution of insecticide resistance in mosquitoes, and the environmental and health risks

associated with harmful pesticide use, new vector control technologies are being developed. Unlike many genetic

approaches being developed nowadays, the Sterile Insect Technique (SIT) has probably the highest safety and no

environmental footprint. In this technology, radiation-induced sterile male insects are released into natural populations to

mate with the wild females, reducing the mosquito population so that there are fewer mosquitoes to pass on the

pathogen. If female population is drastically suppressed, disease transmission reduction resulting from sterile male

releases could be significant. The fitness and behaviour of sterile males are often given a great deal of consideration in the

design of the SIT, as behaviorally inappropriate design can potentially lead to failures in SIT programs. Here, a number of

investigations carried out in La Reunion Island on measuring behavioral and physiological determinant of sterile males fitness will be used to illustrate the research supporting the design of sterile male release strategies against Ae. albopictus.

Innate immune memory, a new paradigm in invertebrate immunity: molecular bases beyond phenotypes in

the vector snail biomphalaria glabrata.

Silvain Pinaud, Richard Galinier, David Duval, Benjamin Gourbal

IHPE UMR 5244, CNRS, IFREMER, UM, UPVD 58 Avenue Paul Alduy, Bat R, Université de Perpignan, F-66860 PERPIGNAN CEDEX, FRANCE

benjamin.gourbal@univ-perp.fr Discoveries made over the past ten years have provided evidences that invertebrate antiparasitic response may be primed

in a sustainable manner, leading to the failure of a secondary encounter with the same pathogen. This phenomenon called

“immune priming” or "innate immune memory" was mainly phenomenological and the underlying molecular mechanisms remained to be investigated in invertebrate organisms. In order to achieve this ambitious goal, we focused our

investigations on the Lophotrochozoan snail, Biomphalaria glabrata, in which a specific genotype-dependent innate

immune memory was recently reported. We demonstrated that immune memory response in B. glabrata is associated

with a shift from a cellular to a humoral immune response, and we seek for the mechanisms supporting the genotype-

dependent specificity. We confirm the ability of Biomphalaria snails to distinguish different parasite genotypes but also

different parasite stages of the same genotype. We show for the first time the involvement of putative pathogen

recognition receptors (PRRs) that varies in quality and/or quantity following homologous and heterologous immune

challenges. We investigate the molecular and epigenetic support of this process in Biomphalaria/Schistosoma system and

try to reconcile mechanisms with phenomena, thereby exerting a yet unknown type of immunological memory upon re-

infection in invertebrates. This prompted us to revisit the artificial dichotomy between innate and memory immunity in

invertebrate systems and open the way to new questions on how the pathogen pattern is stored and recall in invertebrate immune system: Would memory of the pathogen exposure be written in the epigenome?

Spontaneous mutations in a regulatory gene induce phenotypic heterogeneity and adaptation of Ralstonia

solanacearum to changing environments

Anthony Perrier, Xavier Barlet, David Rengel, Philippe Prior, Stéphane Poussier, Stéphane Genin & Alice Guidot

Laboratoire des Interactions Plantes Micro-organismes (LIPM) - UMR CNRS-INRA 2594/441- Chemin de Borde-Rouge - Auzeville BP 52627 - 31326 Castanet Tolosan Cedex FRANCE

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alice.guidot@inra.fr An evolution experiment with the bacterial plant pathogen Ralstonia solanacearum revealed that several adaptive

mutations conferring enhanced fitness in plants arose in the efpR gene encoding a regulator of virulence and metabolic

functions. In this study, we found that an efpR mutant systematically displays colonies with two morphotypes: the type S

(‘smooth’, similar to the wild-type) and the type EV (‘efpR variant’). We demonstrated that the efpH gene, a homolog of

efpR, plays a key role in the control of phenotypic heterogeneity, the ΔefpR-ΔefpH double mutant being stably locked into

the EV type. Using mixed infection assays, we demonstrated that the type EV is metabolically more proficient than the type S and displays fitness gain in specific environments whereas the type S has a better fitness into the plant environment. We

provide evidence that this efpR-driven phenotypic heterogeneity is a general feature of strains of the R. solanacearum

species complex and could occur in natural conditions. This study highlights the importance of phenotypic heterogeneity in

this plant pathogen as an adaptive trait to changing environments.

How to disentangle symbiont effects on host resource acquisition and plasticity and why it matters for their

evolution

Robin Guilhot, Simon Fellous

CBGP – INRA Montpellier

robin.guilhot@inra.fr Microbial symbionts can either provide resources to their hosts or mediate host plasticity through physiological signaling.

Symbionts that improve resource availability would be beneficial in all environments, which favors the evolution of stable

mutualism. However, when symbiont affects plasticity, fitness consequences would depend on the environmental context,

with consequences on coevolution. In order to separate symbiont effects on host resources and plasticity, we propose a

new multivariate framework based on the analysis of trade-offs between fitness components. We applied the framework

to a series of experiments on the symbiosis between bacteria, yeasts and three fruit-fly species, Drosophila melanogaster,

D. simulans and D. suzukii. In particular, we focused on the trade-off between speed of larval development and adult size

that is largely documented in holometabolous insects. We found evidence for symbiont effects on both host resources

availability and developmental plasticity. Taking into account host sex, genotype and species revealed a major effect of

host species on whether yeast affects plasticity or not. Besides, evidence suggests Drosophila's bacterial symbionts may

influence plasticity more than yeast does. Further developments of the framework will enable the simultaneous analysis of

a greater number of fitness components and should encompass other types of variation (e.g. genetic). Until our

framework's evolutionary predictions are tested, its results can be used to improve the mass-production of insect (e.g. for the sterile insect technique) so as to fine-tune insect vigor and phenotype to contextual needs.

Déterminants génétiques de la période d’incubation extrinsèque de Plasmodium falciparum chez les anophèles vecteurs

Edwige Guissou, Bienvenue K. Yameogo, Dari F. A. Da, Domonbabele F.d.S. Hien, Rakiswende S. Yerbanga,

Kounbobr R. Dabiré, Anna Cohuet, Thierry Lefèvre

Unité MIVEGEC IRD-Montpellier 911 Av Agropolis BP 64501 34394 Montpellier cedex 5 IRSS, Direction Régionale, 399, Avenue de la Liberté 01 BP 545 Bobo-Dioulasso 01

edwigeguissou@yahoo.fr La période d'incubation extrinseque (PIE) du plasmodium est un facteur déterminant de l’intensité de la transmission du paludisme. De nombreuses études ont montré que la PIE est fortement dépendante de la température. Par contre, on ne

sait toujours pas dans quelle mesure la variation génétique du parasite et/ou du moustique peut influencer la PIE.

L'objectif de notre étude était d'utiliser le système anophèle/plasmodium pour étudier les déterminants génétiques du

temps de développement de Plasmodium falciparum (P.f) chez les anophèles. Trois espèces vectrices ont été

expérimentalement infectées par le sang de quatre isolats naturels de P.f. La PIE a été estimée en utilisant une approche

non destructive basée sur la détection de parasites dans des boules de coton imbibées d'une solution de glucose 10%. Nos

résultats indiquent que la PIE médiane globale de P.f à 27 °C était de 12 jours. Bien que cette période ait été similaire chez

les trois espèces de moustiques, elle a varié de façon significative entre les isolats de parasite. Il y’avait aussi une interaction espèces-isolats sur la PIE. Enfin nous avons constaté que les parasites qui se développaient les plus vite étaient

aussi ceux qui induisaient la plus forte mortalité chez les moustiques, suggérant ainsi l’existence d’un trade-off entre deux

traits clés de la transmission. Davantage de travaux seront nécessaires afin de confirmer que certains clones de parasites

se développent plus vite dans certaines especes de moustiques que d’autres. Les résultats de ces travaux fourniront des renseignements importants sur la lutte contre le paludisme.

Prevalence and diversity of ssRNA+ honey bee-infecting viruses in wild hymenoptera

Bigot D; Gayral, P. ; Lopez-Vaamonde C.; Herniou E.A.

IRBI, UMR 7261 CNRS-Université de Tours

elisabeth.herniou@univ-tours.fr Honey bee decline stems from multiple interacting environmental and biotic factors, such as pesticides and management practices, as well as parasites and microbial diseases. In this context, bees are becoming a prominent model in viral

ecology. Wild bees have been shown to carry a variety of honey bee viruses, in particular bumble bees that seem

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particularly sensitive to the diseases. Likewise, ants have been found positive for bee viruses, suggesting they could also be

reservoirs. Together this suggests that the host range of the viruses originally described in honey bees might be wider than

honey bees and that subsequently the epidemiology of these viruses might involve a broader suite of hosts. But so far

evidence of sustained honey bee virus infection in wild bees and ants is scarce. To test whether honey bee viruses are

specialists or generalists among ants and bees, we examined the prevalence and phylogenetic relationships of the 6 most

pathogenic honey bee viruses (SBV, ABPV, BQCV, CBPV, IAPV, DWV) as well as two sinaiviruses in individual insects,

including 349 ants, 110 wild bees, and 74 honey bees, sampled in Europe and America. Our results show extremely low

virus prevalence in wild Hymenoptera suggesting honey bee viruses are largely specialists.

The MALDI-BeeTyping, an innovative method to monitor the impact of a gut pathogen on bee health

Camille HOUDELET, Philippe BULET and Michel BOCQUET

Université Grenoble Alpes Institut pour l’Avancée des Biosciences, InsermU1209, CNRS UMR 5309, La Tronche

38700, France

camille.houdelet@univ-grenoble-alpes.fr The haemolymph of the Honey Bee Apis mellifera, like the Human blood reflects the health status. We applied MALDI-

BioTyping, an approach used in clinical microbiology, to monitor bee health. We demonstrated the ability to evaluate

impact of bacterial and viral infections on bee health using this approach (MALDI-BeeTyping). The honey bee can be also

parasitized by microsporidia such as Nosema species. Honeybees become infected when they ingest spores of Nosema.

The impact of this biotic stressors on the systemic immune response haemolymph remains an open question. Is MALDI-

BeeTyping able to diagnose a microsporidial infection with Nosema at the individual level? The following MALDI-BeeTyping

workflow was established: (1) infection protocols and infection monitoring at the gut level, (2) blood collection and MALDI

analyses, (3) generation of statistical models for monitoring infection by MALDI-BeeTyping, (4) proof of concept using field

samples. Two groups of bees were analysed, one infected in laboratory conditions and one control. We collected

haemolymph to monitor bee health and we quantified spores in each gut to evaluate infection. Using this workflow our

results shown that bees were successfully infected and could be classified according to the Nosema spore load. As

observed through MALDI-BeeTyping, statistical analyses allowed to discriminate three bee categories: uninfected, infected

but without spore’s multiplication and infected with various spore load. Interestingly, the systemic immune antimicrobial peptides are not the discriminating molecules in the model of classification. In conclusion, we demonstrated the potential

of the MALDI-MS method of BeeTyping for monitoring Nosema infection.

Intégration de bracovirus dans les génomes de lépidoptères hôte et non hôte

Germain Chevignon, Georges Periquet, Gabor Gyapay, Nathalie Vega-Czarny, Jérémy Gauthier, Hélène Boulain,

Karine Musset, Jean-Michel Drezen, Elisabeth Huguet

Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte, UMR CNRS 7261- Université de Tours

Faculté des Sciences et Techniques, Avenue Monge, Parc Grandmont

37200 TOURS (France) elisabeth.huguet@univ-tours.fr Les bracovirus sont des virus associés à plus de 17000 espèces de guêpes parasitoïdes Braconidae qui sont essentiels au

développement larvaire de ces guêpes à l’intérieur d’hotes lépidopteres. Les bracovirus sont présents dans le génome des guêpes sous forme d’ADN proviral intégré. Dans les ovaires des guêpes, cette forme virale intégrée sert de matrice pour la production du virus sous forme de multiples cercles d’ADN double brin qui seront injectés en même temps que les œufs dans l’hote lépidoptere. Ces cercles viraux portent les genes de virulence dont l’expression dans l’hote lépidoptere est indispensable à la réussite parasitaire de la guêpe. Les cercles viraux ne contiennent par contre pas les gènes impliqués

dans la réplication ou la production de particules virales, empêchant ainsi la réplication du virus dans l’hote lépidoptere. L’investigation du devenir des cercles viraux du bracovirus associé à la guêpe parasitoïde Cotesia congregata au cours du

parasitisme du sphinx du tabac, Manduca sexta, a révélé que certains cercles avaient la capacité de s’intégrer dans l’ADN génomique des hémocytes de l’hote et que cette intégration dépendait de séquences spécifiques présentes dans les

cercles. Ce processus d’intégration systématique des séquences virales dans l’ADN génomique de l’hote lépidoptere qui assure ainsi la persistance du virus pendant toute la durée du parasitisme, soulève la question du rôle de cette intégration

dans le succes parasitaire. De plus, ce processus d’intégration pourrait permettre d’expliquer certains phénomenes de transferts horizontaux dont les bracovirus sont les médiateurs au sein de génomes de lépidoptères non hôtes.

Microbiota structure and dynamics in planorbid snails, vector of the human parasites Schistosoma spp

Camille Huot, Anaïs Portet, David Duval, Richard Galinier, Benjamin Gourbal, Eve Toulza

Laboratoire IHPE, UMR5244, UPVD, 58 Avenue Paul Alduy, Bât. R, 66860 Perpignan Cedex 9

camille.huot@univ-perp.fr Since the advent of molecular methods to study uncultivable microbes, more and more studies have revealed the

importance of the microbiota in organism fitness and its influence on the relationship between parasites and their hosts

through its effect on the immune response. To decipher the interplay between microbiota, host and parasite, we have studied the interaction between the parasitic Platyhelminthes, Schistosoma spp., agents of the bilharzia, a neglected

tropical disease affecting more than 200 million people worldwide, and their intermediate freshwater planorbid snail

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hosts. Using 16S metabarcoding, we characterized the specificity of the bacterial microbiota for different mollusks’ genera / species / strains, as well as its dynamics in the course of infection by the parasite S. mansoni in an allopatric and

sympatric combination. The microbiota's structure in naive snails differed according to the host identity, and following

phylogeny, thus displaying a pattern of phylosymbiosis. Moreover, during a kinetic of infection by the parasite, a

microbiota dysbiosis was observed. This change in microbiota structure and diversity was linked to modifications of the

immune response and expression of antimicrobial peptides, especially biomphamacins, suggesting an interplay between

host immune response to parasite infection and microbiota. These results are of particular importance to go further in the

understanding of the relationship between microbiota and immune capabilities in invertebrates and support the

importance of considering the holobiont in a host/parasite interaction.

Dissecting the immune response of a lepidopteran pest to an entomopathogenic nematobacterial complex

Louise HUOT, Audrey BIGOURDAN, Pierre-Alain GIRARD, Sylvie PAGES, Nicolas NEGRE and Bernard DUVIC

DGIMI, INRA, Université de Montpellier, France

louise.huot@umontpellier.fr Entomopathogenic nematobacterial complexes (NBCs) are natural symbiotic associations between nematodes and bacteria

that cooperate to infect and kill insects. Due to the originality of these pathogens and to their potential for biological control of diverse crop pests, their interactions with insects have been extensively studied. Results from these studies have

shown that the parasitic success largely relies on complex interactions with the host’s immune system. However, the study of the dialogue that takes place between each NBC partner and the immune system suffers from a lack of knowledge of

the immune responses that insects oppose to NBC infestations. In order to improve this knowledge, we provide here the

first topologic transcriptional analysis of the immune response of an insect, the lepidopteran model Spodoptera frugiperda,

to an NBC, the Steinernema carpocapsae-Xenorhabdus nematophila association. Our results show that S. frugiperda

strongly responds to the infestation, with a mobilization of the three main immunocompetent tissues the NBC is

confronted to, which are the midgut, the fat body and the hemocytes. The responses are particularly intense in the fat

body and in the hemocytes, with a time-stable mobilization of diversified humoral and cellular immunity genes and

pathways. Further analysis revealed that these responses correspond to combinations of nematode- and bacterium-

induced ones, which paves the way for future studies of their interactions with the NBC. Finally, this analysis also allowed

the identification of new candidate immune genes whose functional characterization could reveal new types of anti-

nematode immune responses.

Les sources d’hétérogénéité d’infection chez les vecteurs de la malaria aviaire

Julie Isaïa1, Olivier Glaizot2, Ana Rivero3, Philippe Christe1 and Romain Pigeault1 1 Département d’Ecologie et d’Evolution, Université de Lausanne, CH-1015 Lausanne, Suisse 2 Musée de Zoologie, Palais de Rumine, CH-1014 Lausanne, Suisse 3 MIVEGEC (UMR CNRS 5290), Université de Montpellier, Montpellier, France

julie.isaia@unil.ch La distribution de parasites au sein de populations d’insectes vecteurs est en regle générale fortement sur-dispersée. Alors

que la majorité des vecteurs sont non infectés ou présentent de faibles charges parasitaires, quelques individus vont présenter des charges parasitaires tres importantes. L’identification des sources responsables de cette hétérogénéité d’infection est primordiale pour comprendre les dynamiques d’infection en population naturelle. Dans cette étude, nous avons voulu déterminer si la dynamique intra-hôte de Plasmodium, parasite responsable de la malaria, pouvait influencer sa transmission au moustique vecteur. Pour cela, nous avons testé expérimentalement l’hypothese selon laquelle la distribution intra-hôte du parasite pouvait être structurée temporellement, en exposant des hôtes infectés à des groupes

successifs de moustiques sur une courte période de temps (3h). Nos résultats ont montré une augmentation significative

de la transmission de Plasmodium en fonction de l’ordre de piqûre des moustiques. Suite à ce résultat, nous avons cherché

à déterminer si cette augmentation de transmission dans le temps pouvait être expliquée par une réponse plastique de

Plasmodium à la piqûre de son vecteur. Nos résultats ne nous ont pas permis de mettre en évidence une augmentation du

taux de réplication du parasite suite aux piqûres des moustiques. Cependant, d’autres mécanismes tels que la maturation des stades transmissible du parasite ou la vasodilatation des vaisseaux suite à la réponse inflammatoire de l’hote, pourrait être à l’origine de cette augmentation de transmission. L’identification des mécanismes sous-jacents qui régissent la

distribution intra-hôte du parasite apparait primordiale pour la compréhension des dynamiques de transmission aux

vecteurs.

Impact of polymicrobial interactions on Drosophila physiology

Vincent Raquin1,2,3, Edouard Saint-Michel1,2, Cédrine Milesi1,2, François Leulier1,2,* & Natacha Kremer1,3,* 1 Labex ECOFECT, Université de Lyon 2 Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon, Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS,

UMR 5242, Lyon, France. 3 Université de Lyon, Université Lyon 1, CNRS, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive UMR 5558 Villeurbanne, France.

natacha.kremer@univ-lyon1.fr

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Animal’s microbiota is composed of a large number of microorganisms (parasites, fungi, viruses, bacteria) that can influence development, metabolism and immunity of the host. Because microbes can interact within the host, multipartite

interactions could impact both the microbes and the host’s life history traits. For example, the intracellular bacterium Wolbachia, a major symbiont of arthropods, modulates the titer of RNA viruses and their potential pathogenic effect in

insects. But beyond inter-microbes interplay, the impact of multipartite interactions on host physiology remains poorly

studied. Here, we modelled the influence of such complex host-microbe interactions on host physiology using Drosophila.

We derived isogenic Wolbachia-infected or non-infected Drosophila melanogaster in a germ-free state, while keeping

Wolbachia infection status. These two lines were mono-associated to two major commensal bacteria naturally found in

Drosophila, Lactobacillus plantarum or Acetobacter pomorum or bi-associated to both bacteria. Germ-free, mono- or bi-associated flies were then exposed to Drosophila C virus (DCV), a natural pathogen of Drosophila, by oral route. We

monitored key host physiological traits including larval size, developmental timing, viability at larval, pupal and adult stage

as well as microbial load for all the conditions. We will present the results of the phenomenological assays as well as the

density of each microbial partner in larvae. Here, we considered host as a unit with all its associated microbes, and we

demonstrated that microbial communities trigger complex interactions that could influence host development and

physiology.

Le rôle de l’immunité et de l’apoptose dans la régulation de la symbiose entre la moule Bathymodiolus azoricus et ses endosymbiotes chimiosynthétiques.

Camille Détrée, Bérénice Piquet, Jean Mary, Ann C. Andersen, Sébastien Duperron et François H. Lallier

AD2M UMR7144, CNRS-Sorbonne Université, Station Biologique, 29680 Roscoff

lallier@sb-roscoff.fr Autour des sources hydrothermales profondes les espèces endémiques les plus abondantes ont toutes développé des

symbioses mutualistes avec des bactéries chimiosynthétiques pour assurer leur nutrition et leur croissance. Pour les

moules du genre Bathymodiolus, les gammaprotéobactéries, intracellulaires, sulfo-oxydantes ou méthanotrophes, sont

localisées exclusivement dans les bactériocytes qui composent l’essentiel de leurs filaments branchiaux. A partir

d’expériences in situ et au laboratoire induisant la perte des symbiotes nous essayons d’isoler les différents réseaux de gènes impliqués dans la relation hôte-symbiotes. Comment les bactéries sont-elles « admises » dans les branchies et pas

dans les autres tissus ? Les bactéries influencent-elles directement le systeme immunitaire de l’hote ? Des approches

globales de l’expression de genes (microarrays) ont révélé plus d’un millier de genes différentiellement exprimés1. Parmi

ceux-ci on note une tres nette surexpression des genes impliqués dans l’apoptose et dans l’immunité, comme les peptidoglycan recognition proteins (PGRP) ou les lysozymes, par exemple. Nous avons également observé et mesuré le

taux de cellules apoptotiques dans les branchies par marquages spécifiques (TUNEL, anti-caspase-3). Si ce taux est nettement supérieur à celui observé chez la moule côtière Mytilus edulis, il s’avere que les bactériocytes sont moins affectés que les simples cellules branchiales ciliées ou les coelomocytes. Dans ces conditions, comment l’apoptose pourrait-elle contribuer à la régulation des populations de bactéries symbiotiques ?

Proteomic characterization of the zebra mussel immune system by proteogenomics and comparative

proteomics in hemocytes and plasma.

Maxime Leprêtre1,3, Christine Almunia2, Jean Armengaud2, Arnaud Salvador3, Alain Geffard1, Mélissa Palos-

Ladeiro1 1Université de Reims Champagne-Ardenne UMR-I 02 INERIS-URCA-ULH SEBIO Unité Stress Environnementaux

et, BIOsurveillance des milieux aquatiques UFR Sciences Exactes et Naturelles, Campus du Moulin de la

Housse, BP 1039 51687 Reims CEDEX, France. 2CEA-Marcoule, DRF/IBITEC-S/SPI/Li2D, Laboratory “Innovative technologies for Detection and Diagnostics”, BP 17171, F-30200 Bagnols-sur-Cèze, France. 3Univ Lyon, CNRS, Université Claude Bernard Lyon 1, Institut des Sciences Analytiques, UMR 5280, 69100

Villeurbanne, France.

maxime.lepretre@univ-reims.fr Evaluation of immune system modulation in bivalves appears to be a relevant strategy in water quality assessment. While

cell-mediated responses are well defined in zebra mussels, Dreissena polymorpha, information on the molecular

mechanisms involved in D. polymorpha immunity are relatively scarce. The aim of this study is to acquire a better

knowledge of the molecular mechanisms involved in the immunity of D. polymorpha from both plasmatic and cellular

compartment. Firstly, proteogenomic analysis were performed on hemocytes and plasma to identify the relevant proteins

involved in the immunity of the zebra mussel. This strategy, which combines transcriptomic with mass spectrometry data,

led to the identification of 3,000 proteins in this non-model organism. Many proteins were potentially involved in the

recognition, internalization and destruction of microorganisms, reflecting the involvement of both compartments in the

management of biological contaminants. Secondly, a comparative proteomics approach was performed on hemolymph

exposed ex vivo during 4 hours, to RNA poly I:C (100 µg/mL) and a protozoa Cryptosporidium parvum (5:1

protozoa:hemocyte). Results showed distinct responses between the hemolymph challenged with RNA poly I:C and C. parvum. This step enabled to identify immune proteins modulated by biological stressful conditions, such as pro-

inflammatory cytokines, complement components or proteins involved in the endocytosis of C. parvum (ARP2/3 complex).

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Overall, this study brings a better understanding of the immune molecular mechanisms involved in the hemolymph of D. polymorpha and improve our knowledge on zebra mussel immunity by specifying the mechanisms associated with cell

mediated immune responses, such as apoptosis and phagocytosis.

Cracking the code of pacific oyster mortality syndrome

Julien de Lorgeril, Aude Lucasson, Bruno Petton, Eve Toulza, Caroline Montagnani, Camille Clerissi, Jeremie

Vidal-Dupiol, Cristian Chaparro, Richard Galinier, Jean-Michel Escoubas, Philippe Haffner, Lionel Degremont,

Guillaume M. Charrière, Maxime Lafont, Abigaïl Delort, Agnes Vergnes, Marlène Chiarello, Nicole Faury, Tristan

Rubio, Marc Leroy, Adeline Pérignon, Denis Régler, Benjamin Morga, Marianne Alunno-Bruscia, Pierre Boudry,

Frédérique Le Roux, Delphine Destoumieux-Garzόn, Yannick Gueguen, Guillaume Mitta

IHPE, 52 avenue Paul Alduy 66860 Perpignan mitta@univ-perp.fr For decades, methodological limitations have restricted the study of infectious diseases to simplified experimental

pathosystems in which the influences of host and pathogen diversity and the biotic and abiotic environments have been

minimized. Such reductionist approaches have made diseases with complex etiologies difficult to characterize. This is the

case for some diseases triggering recurrent mass mortalities in non-model species of ecological and/or economic interest

such as pollinators, corals and marine mollusks. The objective of the present work was to examine a disease of complex

etiology affecting one of the main invertebrate species exploited in the world, the Pacific oyster Crassostrea gigas.

Introduced to France in the 1970s, C. gigas suffers mass mortalities associated with complex interactions between host,

environment and pathogens. The severity of these mortality outbreaks has dramatically increased since 2008, decimating

up to 100 % of juvenile oysters in French farms. Over the past years, this mortality syndrome has become panzootic, being

observed in numerous other countries worldwide. By developing a holistic approach to tackle the complexity of

interactions, we deciphered the complex intra-host interactions underlying the Pacific oyster mortality syndrome. Using

ecologically realistic experimental infections combined with thorough molecular analyses on oyster families with

contrasted susceptibilities, we demonstrated that the disease is caused by a polymicrobial infection whose initial and

necessary step is the infection of oyster hemocytes by a herpesvirus. Viral replication leads to an immune-compromised

state of the host, evolving toward subsequent bacteremia by opportunistic bacteria.

Réponse immunitaire de Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) à l'infection par différents

organismes entomopathogènes

Isabelle Darboux, Bernard Duvic, Anne-Sophie Gosselin, Louise Huot, Nicolas Nègre

LABORATOIRE DGIMI CC 101 - Place Eugène Bataillon 34095 Montpellier

nicolas.negre@umontpellier.fr Spodoptera frugiperda est un lépidoptère ravageur de culture dont la chenille dévore principalement les grandes cultures

de maïs. Dans le cadre de la lutte biologique contre ces ravageurs, plusieurs microorganismes pathogènes peuvent être

utilisés comme alternative aux pesticides. Le laboratoire DGIMI étudie trois pathogènes capables de tuer les chenilles de Spodoptera. Le complexe némato-bactérien (CNB) Steinernema carpocapsae/Xenorhabdus nematophila est capable de

pénétrer dans l'hémolymphe des insectes qu'il contamine de ses bactéries symbiotiques, tuant l'insecte en quelques

heures. La guêpe parasitoïde Hyposoter didymator, pour se reproduire, pond un oeuf dans une chenille. Elle co-injecte à ce

moment-là un virus (HdIV) dont le génome est intégré au sien et qui est nécessaire au succès parasitaire de la guêpe,

notamment en abolissant la réponse immunitaire de la chenille. Finalement, le virus JcDV est un petit virus à ADN

spécifique d'insecte qui, lorsqu'il est ingéré par la chenille, traverse la barrière intestinale pour infecter ses tissus cibles et

provoquer la mort de l'insecte. Dans ces trois modèles d'infection, nous avons étudié par RNA-seq la réponse

transcriptionnelle tissu-spécifique de la chenille face à ses pathogènes, en regardant particulièrement les gènes de

l'immunité. Nous avons vu que la chenille est capable de déployer l'ensemble de son arsenal anti-microbien en réponse au

CNB ainsi qu'au HdIV, mais pas contre le virus JcDV qui semble passer inaperçu. Cette étude nous a permis de décrire les

spécificités du système immunitaire lépidoptère face à différents micro-organismes ainsi que de découvrir de nouveaux

peptides anti-microbiens acquis par transfert horizontal de gènes.

Infection in patchy populations : partitioning pathogen invasion success and dispersal under different

phases of host colonisation

Louise Solveig Nørgaard, Ben Phillips, Matthew D. Hall

Triolet Campus (Sciences et Lettres, Batiment 22)

Louise.noergaard@monash.edu At the front line of an invading population, ecological conditions are fundamentally different from the core and coincides

with low population density, low intraspecific competition and high resource availability. All of these factors may make

evolution proceed at different rates at the front versus the core of an expanding population. However, what about

evolution of a pathogen that invades a host population undergoing population expansion? In this study, we address how

population dynamics that mimic the core or front of an expanding population can selectively favour different pathogen genotypes. Using experimental populations of the waterflea, Daphnia magna, we manipulated population dynamics of

host populations (exponential, stationary, or in decline) and then experimentally invaded multiple genotypes of the

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bacterial pathogen, Pasteuria ramosa. Our results reveal that the probability of a pathogen establishing in a population and

the resulting intensity of infectious disease, changes as the host population approaches carrying capacity, but this occurs in

a pathogen genotype-specific manner. Specifically, not all pathogens showed decreases in the probability of infection,

invasion success, and transmission potential with increasing population density and growth rate. These findings suggest

that population dynamics of core versus front of a range expanding host population potentially enable the maintenance of

genetic variability in a pathogen species. Finally, we discuss how the dynamics of expanding host populations and the

capability of different pathogen genotypes to disperse into new host populations are both likely to affect the epidemiology

and evolution of infectious disease.

PGRP-LB, acteur majeur du maintien et du contrôle de l’endosymbiose chez le charançon des céréales

Julien Orlans1,2, Carole Vincent-Monegat1, Agnès Vallier1, Isabelle Rahioui1, Catherine Sivignon1, Anna

Zaidman1, Nicolas Parisot1, Séverine Balmand1, Justin Maire1, Agata Butryn2, Allen Orville2, Pierre Aller2, Pedro

Da Silva1, Abdelaziz Heddi1 1UMR0203, Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2i), Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA-Lyon), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Lyon (Univ Lyon), F-

69621 Villeurbanne, France. 2Diamond Light Source Ltd, Harwell Science and Innovation Campus, Didcot, Oxfordshire OX11 0DE, UK.

julien.orlans@insa-lyon.fr La symbiose intracellulaire à long terme (ou endosymbiose) est largement répandue parmi les invertébrés et est reconnue

comme un moteur majeur de l'évolution. Cependant, les processus moléculaires qui maintiennent l'homéostasie

immunitaire chez les organismes infectés de manière chronique par des bactéries mutualistes restent encore peu décrits.

Nous avons étudié les gènes codants des protéines de reconnaissance du peptidoglycane (PGRPs) dans l’association du charançon des céréales Sitophilus zeamais avec sa bactérie endosymbiotique Sodalis pierantonius pour mieux comprendre

ces mécanismes. Nous avons découvert que le gène pgrp-lb génère trois transcrits via un épissage alternatif et une régulation différentielle. L’isoforme sécrétée est exprimée dans les tissus subissant une infection pathogénique avec l'activation du récepteur PGRP-LC de la voie immunitaire IMD. Les isoformes cytosoliques et transmembranaires sont

exprimées de manière constitutive au sein de l'organe renfermant l'endosymbiote, le bactériome, de manière

indépendante de PGRP-LC. Ces deux isoformes clivent spécifiquement la cytotoxine trachéale (TCT), un monomère de

peptidoglycane libéré par les endosymbiotes. L’inactivation de pgrp-lb par ARN interférence entraîne la fuite de TCT du

bactériome vers d'autres tissus de l’insecte, où il active de maniere chronique l'immunité systémique de l'hote par le biais de PGRP-LC. Alors que pgrp-lb a été décrit initialement dans des interactions pathogenes, l’étude de ce gene chez un insecte endosymbiotique montre que les contraintes évolutives hôte-symbiote peuvent faciliter l’émergence, à travers des mutations et des introgressions géniques, de nouvelles fonctions immunitaires, permettant ainsi à l’insecte de maintenir une homéostasie immunitaire en présence bactérienne chronique.

Transcriptomic analysis of clam Extra Pallial Fluids reveals immunity and cytoskeleton alterations in the first

week of Brown Ring Disease development

Alexandra Rahmani1*, Erwan Corre2, Gaelle Richard1, Adeline Bidault1, Louisi Oliveira3, Cristiane

Thompson3, Fabiano Thompson3, Vianney Pichereau1*†, Christine Paillard1*†

1 Univ Brest, CNRS, IRD, Ifremer, LEMAR, F-29280 Plouzane, France

2Sorbonne Universites, Universite Pierre et Marie Curie-Paris 6, CNRS, FR2424, Station Biologique de Roscoff,

Roscoff, France 3Centro de Ciencias da Saude, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro,

Brazil

†These authors contributed equally

Corresponding authors: vianney.pichereau@univ-brest.fr ; alexandra.rahmani@univ-brest.fr ;

christine.paillard@univ-brest.fr The Brown Ring Disease is an infection caused by the bacterium Vibrio tapetis on the Manila clam Ruditapes philippinarum.

The process of infection, in the extrapallial fluids (EPF) of clams, involves alteration of immune functions, in particular on

hemocytes which are the cells responsible of phagocytosis. Disorganization of the actin-cytoskeleton in infected clams is a

part of what leads to this alteration. This study is the first transcriptomic approach based on collection of extrapallial fluids

on living animals experimentally infected by V. tapetis. We performed differential gene expression analysis of EPF in two experimental treatments (healthy- against infected- clams by V. tapetis). In infected clams, a downregulation of transcripts

implied in immune functions (lysosomal activity and complement- and lectin-dependent PRR pathways) was observed

during infection. We have also shown a deregulation of transcripts encoding proteins involved in actin cytoskeleton

regulation such as an overexpression of β12-Thymosin (which are actin sequestration proteins) or a downregulation of

proteins that closely interact with capping proteins such as Coactosin, that counteract action of capping proteins, or

Profilin. The response of the Manila clam to V. tapetis involves transcriptomic reprogramming which may lead hemocytes

to stay in a resting state to inhibit phagocytosis.

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Perte versus Fragmentation de l’habitat, quelle réponse des parasites ?

Perrin ; A. Khimoun ; B.Faivre ; A. Ollivier ; S.Garnier UMR CNRS 6282 Biogéosciences - Université Bourgogne - 6 Bd Gabriel - 21000 Dijon - France

antoine.perrin@u-bourgogne.fr La destruction des habitats est considérée comme l’une des causes majeures de la perte de biodiversité. Par ailleurs, il est aujourd'hui clairement établi que les modifications anthropiques du paysage peuvent augmenter les risques d'émergence

et de prolifération de certains pathogènes. La destruction des habitats est un processus complexe qui englobe deux

composantes, la perte d’habitat et la fragmentation de l'habitat (modification de la configuration spatiale de l'habitat pour

une quantité donnée d'habitat), dont les effets relatifs restent à ce jour très débattus. Nous avons étudié comment la

destruction de l'habitat forestier influence la prévalence des parasites sanguins (Haemosporidés) chez cinq espèces

d'oiseaux plus ou moins spécialistes du milieu forestier dans les Petites Antilles. Nous avons, pour cela, échantillonné 3250

individus dans 54 localités en Guadeloupe et en Martinique. En utilisant des analyses de régression PLS, nous avons

déterminé la part de la variabilité spatiale de la prévalence due à la perte et la fragmentation forestière, ainsi que les effets

de l’hétérogénéité du paysage et des conditions météorologiques. Nous avons montré que la fragmentation forestiere est le facteur prépondérant dans la majorité des combinaisons espèce hôte, espèce souche, bien que cet effet puisse être

positif ou négatif selon les combinaisons. Ce résultat pourrait être expliqué par les effets directs ou indirects de la

fragmentation des forêts sur les hôtes ou les vecteurs de ces parasites sanguins.

Les densovirus : le renouveau d’un agent de lutte biologique contre les Aedes urbains vecteurs d’arboviroses

Aurélie Perrin, Marie Rossignol, Carole Ginibre, Bethsabée Scheid, Fabrice Chandre, Thierry Baldet, Jeremy

Bouyer, Christophe Lagneau, Mylène Ogliastro

MIVEGEC (IRD224 -CNRS 5290- UM) 911 avenue Agropolis BP 64501 34 394 Montpellier cedex 5 France

perrin.aurelie-ext@ird.fr L’invasion récente du continent européen par Aedes albopictus, la recolonisation de certaines régions par Aedes aegypti, la recrudescence de la Dengue et l’émergence du Chikungunya et du Zika ont remis la lutte contre ces Aedes urbains comme

une priorité majeure de santé publique. Ces moustiques ne peuvent être combattus par les techniques habituelles utilisées

en routine par les services de démoustication. De nouvelles méthodes de lutte, plus spécifiques et plus sélectives, sont

aujourd’hui nécessaires pour gérer ce nouveau risque. Les Densovirus (DVs) sont des petits virus icosaédriques, non

enveloppés, appartenant à la famille des parvovirus. Ils ont été décrits dans les principaux groupes d’insectes d’importance agronomique, médicale ou vétérinaire. Leur stabilité dans l’environnement et leur mode d’action spécifique en font des biocides de grand intérêt pour les programmes de lutte intégrée contre les insectes vecteurs et les ravageurs. Leur

potentiel pour controler les moustiques a été étudié des les années 1990’ mais l’insuffisance des études menées et leur difficulté de production à grande échelle n’ont pas permis leur développement comme agent biocide.

Dans le cadre du projet ERC Revolinc, nous avons étudié les interactions entre le densovirus d’Aedes albopictus 2 (souche

AalDV2) et plusieurs populations de moustiques d’Ae. albopictus et Ae. aegypti. Nous avons ainsi montré que cette souche

possédait une puissante activité larvicide et que les mécanismes de transmission des densovirus au sein des populations

d’insectes pourraient favoriser leur efficacité. Ainsi la transmission horizontale due au cannibalisme entre larves de

moustique et les transmissions verticales (de la femelle à sa descendance) et par voie vénérienne (des mâles aux femelles)

pourraient augmenter la propagation du virus au sein des populations naturelles d’Aedes et permettre d’envisager différentes stratégies de lutte

Dynamique de distribution spatiale et temporelle de Plasmodium au sein de l’hôte vertébré : impact sur la transmission

Romain Pigeault, Julie Isaïa, Olivier Glaizot, Sylvain Gandon, Ana Rivero, Philippe Christe

Département d’écologie et d’évolution, Université de Lausanne romain.pigeault@unil.ch La transmission des parasites d’un hote vertébré à un hote invertébré vecteur est influencée par de nombreux paramètres

intrinsèques aux trois organismes. Les recherches se sont principalement centrées sur les sources d’hétérogénéités d’infection associées aux hotes vecteurs (p.ex. génotype). La dynamique d’infection des parasites au sein d’un hote vertébré peut cependant également avoir des effets importants sur la transmission. En utilisant la malaria aviaire comme

modele biologique, nous avons mis en évidence une forte hétérogénéité d’infection au sein d’un groupe de moustiques isogéniques, nourris sur un même hote infecté. Ce résultat suggere qu’il existe, au sein de l’hote vertébré, une distribution du parasite (Plasmodium) non homogene dans le temps et/ou l’espace, impactant sa transmission. En effet, nous avons mis en évidence une augmentation périodique de la charge en parasite au sein de l’hote vertébré, et a fortiori de la

transmission aux moustiques, en fin de journée. A une échelle de temps plus courte (3h), la transmission de Plasmodium

augmente également avec l’ordre de piqûre des moustiques, suggérant une réponse plastique du parasite. La distribution

spatiale de Plasmodium au sein de l’hote vertébré est également non homogene, ce qui se traduit par des taux de transmission différents en fonction des zones piquées par les vecteurs. La distribution de Plasmodium, à une courte échelle

de temps, est considérée comme homogene dans l’ensemble du compartiment de la circulation sanguine périphérique, nos études mettent cependant en évidence des fluctuations spatio-temporelles rapides de la charge en parasites au sein

de l’hote impactant la transmission.

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I will fight better once I meet you twice : on the trail of immune priming against Salmonella in the common

woodlouse

Cybèle Prigot-Maurice, Alexandra Cerqueira de Araujo, Sylvine Durand, Tiffany Laverré, Romain Pigeault, Julien

Verdon, Philippe Bulet, Sophie Beltran-Bech, Christine Braquart-Varnier

Université de Poitiers - Bat. B8-B35 - 5, rue Albert Turpin TSA 51106 - F- 86073 Poitiers Cedex 9

cybele.prigot@univ-poitiers.fr Pathogens represent an important selection force on host. An evolutionary arms race is well documented between hosts

and micro-organisms, with the main weapon of hosts: the immune system. Because invertebrates rely solely on the innate

immune system and are not known to possess a vertebrate-like adaptive immunity (Kurtz, 2005; Milutinovic and Kurtz,

2016), they have long been considered unable to establish an immune memory against pathogens (Hoffmann et al., 1999).

But since almost 20 years, several studies have shaken this paradigm by providing evidences that the invertebrate immune system could be “primed” during a first infection, leading to a better protection upon secondary exposure to pathogens: a phenomenon called “immune priming” (Milutinovic and Kurtz, 2016; Gourbal et al., 2018; Pradeu and Pasquier, 2018). Mechanisms, immune effectors and evolutionary costs of immune priming are still incompletely characterized and are

even more tricky to target as they seem different under the species and shaped by the risk of natural infection (Contreras-

garduno et al., 2016; Moret et al., 2018). In this brief context, we investigated the existence, setting-up and duration of

immune priming in Armadillidium vulgare, a terrestrial crustacean with suitable characteristics, against the pathogenic

bacterium Salmonella enterica. Besides a new invertebrate example, we highlight immune priming is temporally complex,

not exclusively explained by haemocyte (i.e immune cells) fluctuations and is even possible despite bacteria persist in

haemolymph between subsequent infections.

Invasion et mise à mort d’un insecte nuisible par Pseudomonas protegens CHA0.

Jordan Vacheron, Maria Péchy-Tarr, Silvia Brochet, Clara M. Heiman, Marina Stojilkkovic, Monika Maurhofer and Christoph Keel

UNIL, Université de Lausanne, Faculté de biologie et de médecine, Department of Fundamental Microbiology,

Bâtiment Biophore - Quartier Sorge, CH-1015 Lausanne, SWISS

jordan.vacheron@unil.ch Les bactéries du sous-groupe des Pseudomonas protegens sont bien connues pour leur activité de protection et d’induction des défenses de la plante. Certains de ces Pseudomonas possede une activité insecticide à l’encontre de lépidopteres et dipteres nuisibles pour l’agriculture. Apres ingestion de ces Pseudomonas par la larve, ces bactéries vont coloniser l’intestin de l’insecte dans le but de rejoindre l’hémolymphe et d’exercer leurs activités insecticides. Cette bactérie colonise efficacement différentes niches écologiques telles que les racines de plante et l’insecte qui sont densément peuplées par d’autres bactéries. La base moléculaire de la compétitivité de P. protegens reste encore largement méconnues. Dans cette étude, nous avons étudié le role de l’unique systeme de sécrétion de type VI (T6SS) que possede P. protegens durant le

processus d’infection de l’insecte. Ce systeme de sécrétion est une nanomachine trans-membranaire que possède de

nombreuses bactéries gram négative, consiste en un systeme d’injection de protéines effectrices toxiques directement à

l’intérieur de la bactérie voisine. Nous avons identifié à l’intérieur du génome de la souche modele P. protegens CHA0 un

cluster de gènes impliqué dans la construction du T6SS ainsi que deux autres clusters de gènes impliqués dans la

production des pointes VgrG, d’effecteurs et de protéines d’immunité envers ces effecteurs. Nous avons démontré l’importance de ces clusters lors de la colonisation l’intestin de l’insecte et l’invasion du microbiote intestinal de l’hote. Nos

résultats soulignent l’importance du T6SS lors de l’infection de l’insecte et plus largement pour l’établissement de la bactérie dans une niche écologique donnée.

Who is responsible for fasciolosis transmission in the West Indies? A snail given response

Antonio A. Vázquez, Annia Alba, Pilar Alda, Jorge Sánchez, Mercedes Vargas, Emeline Sabourin, Marion

Vittecoq, Jean-Pierre Pointier, Sylvie Hurtrez-Boussès

Mivegec (Maladies Infectieuses et Vecteurs: Ecologie, Génétique, Evolution, Contrôle) UMR CNRS (5290) - UM

– IRD Domaine La Valette - 900 rue Jean-François Breton 34090 Montpellier, France

applesnail@hotmail.fr Fasciolosis is a trematode infection affecting over two million people worldwide with economic losses related to cattle

production ascending to three billion dollars annually. Transmission in the Caribbean region is not well studied although

Fasciola hepatica is known to be circulating since long ago. We review the ancient and recent data on fasciolosis in the

West Indies, revealing for the first time the outcomes of sympatric and allopatric interactions of F. hepatica with its snail

hosts in the two main islands. We explored the susceptibility of four lymnaeid species after the exposure to F. hepatica isolates from Cuba, the Dominican Republic and France. Overall, our results points to the local Galba cubensis as the most

suitable species for transmission. Sympatric combinations (snail and parasite from the same country) were generally more

compatible (higher susceptibility, parasite intensity and survival post-exposure). However, certain allopatric combinations

in Pseudosuccinea columella showed important parasite intensities advising of potential risks of introductions. Overall, high

compatibility in most sympatric combinations and low-to-moderate compatibility in allopatric suggest the existence of

local adaptation due to a sustained long interaction. Interesting, attempts of infecting Galba schirazensis with sympatric

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and allopatric flukes failed and evidenced the lowest survival values with a reduced risk of transmission. We discuss the

existing gaps of the actual status of fasciolosis transmission from several islands in the West Indies and predict that

transmission can be strongly supported in areas where the local snail G. cubensis occur, increasing the probabilities if also

the invasive P. columella co-occur.

Résistance aux antipaludiques et transmission

Manon Villa, Arnaud Berthomieu & Ana Rivero

IRD 911 avenue Agropolis 34394 Montpellier

manon.villa@ird.fr La résistance aux médicaments est un probleme majeur en santé publique et en économie. Le devenir des mutations liées

à la résistance aux médicaments dépend de facteurs que nous controlons (tels que le choix des molécules curatives et de

leur posologie), mais aussi de facteurs sur lesquels nous n’avons aucun controle, dont le plus important est le coût que la

résistance impose sur la fitness du parasite. Dans les hotes traités, les coûts sont largement compensés par les bénéfices

conférés par la résistance. Mais, dans les hotes non traités l’importance des coûts va déterminer si les mutations vont

persister et se répandre dans la population. Les connaissances sur les coûts liés à la résistance aux médicaments dans le cas

du paludisme sont essentiellement basées sur des données dans l’hote vertébré. Pourtant, le moustique héberge une part tres importante du cycle parasitaire (reproduction sexuée, différentiation, prolifération et migration jusqu’aux glandes

salivaires). Les coûts liés à la résistance peuvent s’exprimer à n’importe laquelle de ces étapes et donc avoir un impact fort

sur la transmission de Plasmodium. L’objectif de ce projet est d’étudier l’impact que peut avoir l’utilisation des

médicaments sur la transmission des parasites responsables du paludisme. Dans ce but, nous étudions : 1) Les coûts de la

résistance aux antipaludiques à la fois chez le vecteur et chez l’hote vertébré sur le terrain (P. falciparum) et en laboratoire

(P. relictum); 2) L’effet des antipaludiques sur les traits d’histoire de vie des vecteurs

Un peptide antifongique constitutif protège Tenebrio molitor lors d'une infection par Beauveria bassiana

Savina Maistrou, Véronique Paris, Jens Rolff, Annette B. Jensen, Nicolai V. meyling, Caroline Zanchi

Université de Münster, Hüfferstraße 1, 48149 Münster caroline.zanchi@uni-muenster.de Les champignons entomopathogènes représentent une bonne opportunité d'étudier les intéractions hôte-pathogène de

par les millions d'années de coévolution qu'ils partagent avec leurs hôtes. Ils ont de plus la capacité d'infecter leurs hôtes

au travers de la cuticule sans nécessiter de manipulation invasive. C'est certainement la raison pour laquelle le rôle de la

cuticule des insectes a été le point focal de la majorité des études concernant leur résistance aux infections fongiques. Les

peptides antimicrobiens sont souvent étudiés dans le contexte d'infections bactériennes. L'existence de peptides

antifongiques exprimés constitutivement a également été reportée chez plusieurs espèces d'insectes. Leur expression

semble être limitée à des tissus « barrière ». Cependant, chez le ver de farine Tenebrio molitor, la Ténécine 3 semble être

exprimée constitutivement par le corps gras de l'adulte et sécrétée dans l'hémolymphe. Elle présente une activité

antimicrobienne contre des champignons pathogènes opportunistes in vitro. Ici, nous prenons avantage de la virulence du

champignon entomopathogène Beauveria bassiana envers T. molitor et de la sensibilité de ce dernier au knock-down

d'expression de gène par interférence d'ARN pour tester l'implication de la Ténécine 3 dans la résistance à une infection

naturelle par B. bassiana in vivo. En parallèle, nous mettons en relation la mortalité de l'hôte avec la progression du

pathogène dans sa cavité corporelle. Une meilleure compréhension de l'implication des peptides antimicrobiens

constitutifs des insectes dans la lutte contre les pathogènes peut aider à comprendre l'évolution de ce système de défense

en général, et des défenses constitutives en particulier.

Conséquences éco-évolutives de compromis de traits d'histoire de vie dans des systèmes hôtes- parasites

spatialement structurés

Nathalie ZEBALLOS

ISEM- EEC, Univerité de Montpellier

nathalie.zeballos@supagro.fr Les populations de parasites tendent à être inégalement réparties dans l’espace et le temps. Un des facteurs de cette

hétérogénéité de distribution est la connectivité des paysages, notamment à travers la variabilité de dispersion. Dans un

contexte épidémiologique, la dispersion est souvent perçue en tant que trait fixe, or que se passe-t-il lorsqu’on prend en

compte l’évolution de la dispersion dans un systeme hote-parasite? La partie modélisation de mon projet explore les

conséquences éco-évolutives de compromis entre traits d’histoire de vie de l’hote (taux de croissance, dispersion,

résistance) sur l’évolution de la dispersion et sur les dynamiques démographiques dans des populations hotes-parasites

spatialement structurées. La partie expérimentale étudie les variations et co-variations naturelles entre taux de croissance,

dispersion et résistance de l’hote en utilisant le modele biologique Paramecium caudatum et son parasite Holospora undulata.

Spatial selection and experimental evolution of parasite dispersal strategies

Zilio Giacomo, Noergaard Louise, Kaltz Oliver

Université de Montpellier, ISEM

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gcm.zilio@gmail.com In the light of global alteration of habitats and changing opportunities for dispersal, a spatial perspective of evolutionary

epidemiology can help us to better understand and predict the spread of pests and pathogens. According to classic theory,

parasite fitness is maximal for an optimal balance between virulence (= host exploitation) and transmission. However, in

fragmented landscapes, there may be an additional trade-off between local transmission and global dispersal. This can

cause shifts in optimal virulence, but also produce specific adaptations enhancing dispersal if parasites disperse with their

host. I will report on an ongoing study investigating spatial selection in interconnected experimental microcosms, where a bacterial parasite disperses with its protozoan freshwater host Paramecium caudatum. Using two-patch metapopulations, I

mimic a range expansion scenario, with directional selection for increased host dispersal at the front and relaxed selection

on dispersal in core populations. I predict that parasites from front populations evolve to interfere less with their host's

dispersal ability (or even up-regulate it); this may be associated with lower virulence and decreased investment in

horizontal transmission. Observed epidemiological dynamics are consistent with this prediction, and I will present the first

results from tests of evolutionary change.

CLONALITÉ : hétérogénéité phénotypique

DNA methylation and the Redox regulator OxyR: an epigenetic story in the entomopathogenic bacterium

Xenorhabdus?

Julien BRILLARD, Nadège GINIBRE, Carole ANAMALE, Amaury PAYELLEVILLE, Ludovic LEGRAND, Alain

GIVAUDAN UMR DGIMI, INRA-Université de Montpellier, place E. Bataillon, 34095 MONTPELLIER CEDEX 5 julien.brillard@umontpellier.fr Dam DNA methylation can modify the affinity of transcriptional regulators for their binding sites and can therefore lead to

the emergence of subpopulations, expressing or not some genes. Because these differential gene regulations can be

transmitted to daughter cells, this phenomenon is considered as an epigenetic mechanism. Xenorhabdus nematophila is an

enterobacterium symbiotically associated to a soil nematode and pathogenic for several insects. Its methylome analysis

revealed that >99% of Adenines in GATC motifs of the genome are methylated. One of the rare unmethylated motifs is

located in a putative OxyR-binding site in a promoter region. We constructed a Xenorhabdus oxyR mutant, and phenotypic

analysis confirmed the role of OxyR in adaptation to oxidative environments. We are now investigating if some genes are

transcriptionally regulated by OxyR in a DNA methylation-dependent manner.

Development of genetic tools to study the phenotypic heterogeneity within a Vibrio harveyi strain pathogen

of molluscs

François Delavat, Adeline Bidault, Vianney Pichereau, Christine Paillard

LEMAR-IUEM, rue Dumont d’Urville 29280 Plouzané francois.delavat@univ-brest.fr Marine organisms are facing a dual and cumulative threat, i.e. pathogenic microorganisms reinforced by global warming.

Bacteria belonging to the genus Vibrio are one of the most common pathogens in oceans and are responsible for massive

death of molluscs. However, despite these ecological and economical concerns, virtually nothing is known about the

behaviour of bacterial individuals during infection. Does every single cell of an isogenic pathogen behave the same, or is

the bacterial population composed of different sub-populations, behaving differently to divide the labour and conquer new

ecological niches. This strategy is the focus of a new field of research in microbiology, but remains essentially restricted to

mammalian pathogens. Here, the aim was to start unravelling the behaviour of Vibrio harveyi ORM4, a pathogen infecting

the abalone, working at the single cell level to account for the phenotypic heterogeneity. The major limiting step was to

genetically modify this strain, as the genetic tools available for model organisms are not necessarily valid for environmental and marine bacteria. An electroporation protocol was developed to introduce exogenous DNA in various Vibrio strains.

Moreover, we constructed bioreporters to follow the expression of genes at the single cell level, targeting relevant

virulence genes. Importantly, we could demonstrate that an isogenic population of V. harveyi is composed of 2 populations

with varying expression states of a flagellar promoter. This work is a fundamental step to understand the behaviour of

marine pathogens, and will deepen our understanding on the extent of microbial phenotypic heterogeneity during

microbial infections.

Présentation du groupe de réflexions : hétérogénéité clonale (variation phénotypique) chez les procaryotes

A. Givaudan, A. Guidot , A. Sarniguet et J. Brillard UMR 1333 DGIMI, INRA-Université de Montpellier UM, Site Triolet, place E. Bataillon, 34095 MONTPELLIER CEDEX 5 alain.givaudan@umontpellier.fr Un des paradigmes de la microbiologie qui soutenait que des cellules possédant le même génotype se comportent de

façon similaire lorsqu’elles évoluent dans un environnement strictement identique est désormais remis en cause. On parle

d’hétérogénéité phénotypique. Chez les bactéries, les phénotypes les plus affectés par ce phénomene aussi appelé «

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variation phénotypique » sont souvent liés au chimiotactisme, à la sporulation, à la formation de biofilm ou à la résistance

aux antibiotiques. Les exemples se sont multipliés ces dernieres années grace au développement des techniques dites «

single cell ». Les mécanismes moléculaires mis en jeu recouvrent principalement le phénomene de bistabilité qui consiste à

associer le bruit phénotypique d’un gene à un processus décisionnel conduisant à stabiliser un état ou un autre et la

méthylation de l’ADN qui chez les procaryotes est stable. Les mutations génerent également des variants génétiques qui

dans certaines conditions sont sélectionnés. Cette diversification phénotypique chez un pathogene ou un symbiote sont

par nature collective, et cette stratégie devient avantageuse (notion de bet-hedging) lorsque les changements

environnementaux sont relativement peu fréquents, et brutaux. Dans des exemples encore tres limités, les relations

sociales entre les variants (coopération, compétition, tricheurs) ont été étudiées chez des pathogenes humains mais pas encore dans les relations bactéries-plantes ou bactéries-invertébrés. Aussi, il était important de créer un groupe de

réflexions et d’animation collective au sein du réseau REID qui s’intéresse à l’hétérogénéité clonale (variation

phénotypique) chez les procaryotes et à son impact dans les interactions micro-organisme-hote.

Whole genome DNA methylation (Methylome), transcriptomic and phenotypic analysis revealed

involvement of Dam DNA methyltransferase in gene regulation in Photorhabdus luminescens.

Amaury PAYELLEVILLE, Anne LANOIS, Ludovic LEGRAND, Sylvie PAGES, Dana BLACKBURN, David CLARKE, Alain

GIVAUDAN, Julien BRILLARD CNRS, IMM, LISM, 31, Chemin Joseph Aiguier, CS 70071,13402 Marseille cedex 09. apayelleville@imm.cnrs.fr ; amaury.payelleville@umontpellier.fr Dam DNA methylation is an epigenetic mechanism as it can regulate genes expression by reducing the affinity of

transcriptional regulators for their binding site (Casadesus and Low, 2006). This Dam DNA methylation has been shown to be involved in pathogenicity and phenotypic heterogeneity of several bacteria (Casadesus and Low, 2013). Photorhabdus luminescens is an entomopathogenic bacteria switching from symbiosis, with a nematode, to pathogenicity, in the insect

(Boemare et al., 1993). This bacterium displays phenotypic heterogeneity. Because a Dam MTase has been identified in its

genome sequence, we investigated its role in the life-cycle of P. luminescens. Methylome analysis revealed that 99% of

GATC sites in the genome are methylated in all tested growth conditions. Overexpressing Dam methylates most of the

unmethylated sites and causes a decrease in motility and pathogenicity of the bacteria whereas it increases biofilms

formation. It does not impair the bacterial ability to perform a mutualistic association with the nematode. Transcriptomic

analysis revealed that the observed phenotypes are related to differences at the transcriptional level. Coupling phenotypic,

transcriptomic and methylomic analysis provides clues to identify genes transcriptionally regulated by DNA methylation

and to understand Dam DNA methylation involvement in P. luminescens life-cycle.

The stationnary phase regulator CpcR controls cell differenciation and cry gene expression in Bacillus thuringiensis Leyla Slamti, Ruibin Zhang, Emilie Verplaetse, Jie Zhang, Fuping Song, Didier Lereclus

INRA – Institut Micalis – Equipe GME, Domaine de Vilvert, 78350 Jouy-en-Josas leyla.slamti@inra.fr A challenge in bacterial developmental biology is to understand the mechanisms underlying cell fate. Phenotypic

heterogeneity within an isogenic population allows specialization of subpopulations and a division of labor which may

contribute to the survival of a group of bacteria under unfavorable conditions. Bacillus thuringiensis (Bt) is a spore-forming

bacterium closely related to Bacillus anthracis, the agent of anthrax, and to Bacillus cereus, a foodborne pathogen. The

feature that distinguishes Bt from its relatives is its ability to produce insecticidal toxin inclusions in sporulating cells. We

recently reported that strain Bt LM1212 presents two subpopulations during stationary phase: spore-formers and crystal-

producers. Here, we identified and characterized the transcriptional regulator CpcR responsible for this phenotype and for

the expression of the cry toxin genes. This transcription factor belongs to a family of two-component response regulators.

We showed that cpcR transcription is autoregulated. The alignment of LM1212 cry gene promoters revealed the presence

of a conserved DNA sequence upstream from the -35 box, which was also found in the promoter of cpcR. We also showed

that CpcR was able to direct the production of a crystal consisting of a heterologous insecticidal Cry protein in non-

sporulating cells of a typical Bt strain. Moreover, its expression induced a strong reduction in sporulation. The involvement

of CpcR in the sporulation regulatory networks may provide interesting data for a better understanding of the processes

occurring during the stationary phase of Bacillus species.

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TIQUES et MALADIES des TIQUES (TMT) Epidémiologie & Surveillance

Influence de la meteorologie sur la dynamique des populations des stades libres des tiques ixodes ricinus et i. Frontalis : determination des fenetres temporelles optimales par l’approche des cross correlation maps

Albert Agoulon1, Aurélien Madouasse1, Thierry Hoch1, Frédéric Huard2, Maude Jacquot3, Karine Chalvet-

Monfray3.

1 : BIOEPAR, INRA, Oniris, F-44307, Nantes, France. 2 : US AGROCLIM, INRA, F-84914, Avignon, France. 3 : EPIA,

INRA, VetAgro Sup, F-63122, Saint-Gènes-Champanelle, France albert.agoulon@oniris-nantes.fr Le projet « CC-EID », prolongé par « Climatick », vise à mesurer l’influence de la météorologie sur la dynamique temporelle des stades libres d’Ixodes ricinus, afin d’anticiper l’impact du changement climatique sur cette dynamique. Un modèle

statistique est en cours d’élaboration, pour expliquer les comptages mensuels de nymphes d’I. ricinus par des données

climatiques horaires (température de l’air ou du sol, hygrométrie, déficit de pression de vapeur saturante, vitesse du vent)

ou journalières (pluviométrie) moyennées dans différentes fenêtres temporelles. La durée du jour ou sa variation sont

également testées comme variables explicatives, pour évaluer l’influence de phénomenes saisonniers non météorologiques. Pour affiner ce modèle, selon la méthodologie des Cross Correlation Maps (Curriero et al. 2005), nous avons développé un

script R permettant d’explorer les fenêtres temporelles optimales à considérer pour chaque variable météorologique ou saisonnière. Cette approche aide également à formuler des hypothèses biologiques, aidant à construire un modèle global

pertinent.

Pour ce faire, nous avons reformulé intégralement un script originel (Brugger et al. 2018), afin :

-d’optimiser les temps de calcul, pour pouvoir intégrer les données au sein des fenêtres temporelles de différentes manières

(moyenne par défaut, min, max…, avec possible prise en compte de valeurs seuils) ou explorer des combinaisons de variables ;

-de proposer des AIC en complément des corrélations, pour construire le modèle global.

Les premiers résultats d’analyse seront présentés sur l’un des sites du projet (pres de Nantes) pour les nymphes d’I. ricinus, ainsi que pour les stades larvaires d’I. ricinus et d’I. frontalis.

Intérêt des données de téléphonie mobile et des sciences participatives pour l’estimation et la compréhension du risque de transmission de maladies liées à l’environnement : Application aux maladies transmises par les

tiques

Séverine Bord 1, Isabelle Lebert 1, Magalie René-Martellet 1, Sylvain Dernat 2, François Johany 2, ,3, Sandro Bimonte 4, Karine Chalvet-Monfray 1, Valérie Poux 1, Jean-François Cosson 5, Zbigniew Smoreda 6, Gwenaël

Vourc’h 1. 1 INRA, VetAgro Sup, UMR EPIA Epidémiologie des maladies animales et zoonotiques, 63122 Saint Genès

Champanelle, France. 2 INRA, UMR Territoires, 63122 Saint-Genès-Champanelle, France. 3 IRSTEA Clermont-

Ferrand, TSCF, 9 Avenue Blaise Pascal, 63178 Aubière France. 4 INRA, MIA, 75231 Paris, France. 5 UMR BIPAR,

ANSES, INRA, ENVA, 14 Rue Pierre et Marie Curie, 94701 Maisons-Alfort, France. 6 Orange Labs, SENSE, Paris, France

severine.bord@inra.fr L’objectif du projet TELETIQ est d’utiliser les données des Technologies de l’Information et de la Communication (TIC) pour

améliorer l’estimation et la compréhension du risque de transmission des maladies en lien avec l’environnement, en l’appliquant aux maladies à tiques. Le projet combine des approches d’échantillonnages, de modélisations et de sciences

humaines et sociales (SHS). Il a été mené dans la région Auvergne-Rhône-Alpes (AURA). L’abondance des tiques a été estimée à partir (i) des données de signalement de piqûres (projet CiTIQUE, données elle-même comparées aux densités d’utilisateurs

de téléphones mobiles (données Orange) et comparée à (ii) des collectes de terrain sur 15 sites de la région AURA et (iii) à

une modélisation utilisant les facteurs de favorabilité de présence des tiques. Le volet SHS avait pour objectif d’étudier la

représentation et la compréhension du risque tique par le grand public. Une étude exploratoire a été menée dans deux zones

du Puy-de-Dôme, urbaine et rurale (8 sites de recueil) auprès de 143 personnes via des entretiens mobilisant des approches

quantitatives et qualitatives. Pour mettre en relation les scientifiques et le grand public, un outil de géovisualisation

participative a été créé couplant un Wiki avec les systemes d’informations géographiques (WEB-SIG). Il permet de faire

participer la population pour d’acquérir leur avis et leurs connaissances sur des cartes et des données spatialisées concernant la répartition des tiques. Les résultats du projet TELETIQ concourront à améliorer la surveillance et la prévention des maladies.

Mesure de la compétence vectorielle des tiques par protéomique.

Pierre Boyer, Paola Cantero, Laurence Sabatier, Benoit Jaulhac, Nathalie Boulanger

Institut de Bactériologie, EA7290 : groupe Borrelia, 3 rue Koeberlé, 67 000 STRASBOURG

nboulanger@unistra.fr

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Les tiques peuvent héberger de nombreux microorganismes qui peuvent être de simples symbiontes ou des agents infectieux

susceptibles d’être transmis aux hotes vertébrés. La mesure du risque acarologique c’est-à-dire du risque de transmission

de ces agents à l’homme est essentielle pour développer des mesures de lutte et de prévention efficace. La biologie moléculaire est souvent utilisée pour détecter ces microorganismes, mais la détection d’ADN chez un arthropode, insecte ou tique, ne signe en rien sa compétence vectorielle. Il faut prouver sa viabilité, sa multiplication et sa maturation

chez le vecteur, puis sa transmission efficace à l’hote. Nous avons développé plusieurs techniques de protéomique, plus spécifiquement de spectrométrie de masse pour identifier

le vecteur, les agents infectieux et la transmission de ces agents à l’hote vertébré. Nous utiliserons l’exemple de la borréliose de Lyme pour démontrer l’intérêt de la protéomique dans l’identification du vecteur Ixodes, des agents infectieux associés puis la recherche dans la peau et les organes distants chez l’hote infecté et ainsi définir l’épidémiologie d’une maladie à tique.

Diversité, répartition, tropisme tissulaire et mode de transmission de Rickettsia lusitaniae chez les tiques

molles Ornithodoros spp.

Marie Buysse, Karen McKOY, Laurence Vial, Maxime Duhayon, Claudine Ménard, Olivier Duron 911 avenue Agropolis, 34394 Montpellier

marie.buysse@ird.fr Les bactéries du genre Rickettsia sont généralement connues comme des pathogènes humains ou animaux transmis par des

arthropodes hématophages. R. rickettsii, R. prowazekii et R. conorii sont, par exemple, respectivement les agents de la fièvre

pourprée des montagnes Rocheuses, du typhus et de la fièvre boutonneuse méditerranéenne. Néanmoins, certaines

Rickettsia entretiennent des interactions plus nuancées et durables avec leurs hôtes arthropodes et se comportent tels des

endosymbiotes à transmission maternelle. Des études préliminaires ont mis en évidence que plusieurs espèces de tiques du

genre Ornithodoros étaient infectées par une même espèce de Rickettsia, R. lusitaniae. Cette dernière a été décrite comme

phylogénétiquement proche de R. felis et potentiellement pathogène mais très peu de connaissances sont établies chez

cette espèce. Nous avons exploré plusieurs caractéristiques de R. lusitaniae. D’une part, nous avons étudié sa répartition et sa diversité au sein du genre Ornithodoros par typage génétique multilocus. D’autre part, nous nous sommes intéressés à

son tropisme tissulaire et son mode de transmission à travers plusieurs expérimentations (qPCR, Fluorescence In Situ

Hybridization (FISH)). Nos observations permettent d’établir une image plus précise de l’interaction entre R. lusitaniae et les

tiques du genre Ornithodoros. Identifiée chez au moins 11 especes de tiques, elle présente plusieurs caractéristiques d’un endosymbiote facultatif à transmission maternelle.

Bilan de 5 ans de suivi mensuel d’un réseau d’observatoires d’Ixodes ricinus

Chalvet-Monfray Karine et al. (Ceux de l’article en cours) UMR EPIA, INRA Centre Auvergne-Rhône-Alpes, site de Theix, 63122 Saint Genès Champanelle

karine.chalvet-monfray@inra.fr Le projet « CC-EID », prolongé par « Climatick », a permis de mettre en place un réseau d’observatoires d’activité de tiques, principalement Ixodes ricinus, basé sur des collectes régulières utilisant la même méthodologie. Les suivis mensuels réalisés sur 8 sites permettent de comparer différentes zones bioclimatiques en France et d’intégrer les observations des collectes avec les variables météorologiques.

Cinq cycles saisonniers ont ainsi été suivis, mettant en évidence i) la saisonnalité de l’activité des tiques, légere asynchronicité

des pics d’activité entre les sites d’échantillonnage et les importantes variations inter-annuelles pour chaque site. ii), ces

profils d’activité different sensiblement des descriptions classiquement rapportées (Korenberg, 2000). En effet, une chute d’activité estivale importante (voire tres importante) ainsi qu’une activité hivernale non négligeable dans les régions à hiver doux ont pu être décrites et viennent améliorer notre connaissance de la phénologie des tiques. Un modèle statistique

prenant en compte des variables météorologiques agrégées et l’évolutions de durée du jour permet de bien d’écrire l’activité des tiques. Ce modele donne des résultats tres similaires même apres resampling des observations à l’origine de l’estimation des paramètres du modèle. Ce modèle peut être utilisé pour mieux prédire des niveaux de risque d’activité de la tique Ixodes ricinus en fonction des conditions météorologiques.

Le réseau d’observatoire offre aussi la possibilité d’observer l’activité des tiques à des échelles de temps plus courtes (infra-

journalieres). On note ainsi de fortes variations d’activité qui dépendent des conditions immédiates de température et d’humidité. La prise en compte à l’avenir de ce phénomene journalier permettrait de mieux contextualiser les données observées et de mieux préciser les moments à risque concernant l’infestation des animaux et de l’Homme.

CiTIQUE, les sciences participatives au service de tous

Jonas Durand, Annick Brun-Jacob, Clémence Gallon, Irene Carravieri, Julien Marchand, Béatrice Palin, Cyril

Galley, Vincent Godard, Sara Moutailler, Jean-François Cosson, Pascale Frey-Klett

UMR 1136 - IAM, INRA Grand Est-Nancy, rue d’Amance, 54280 Champenoux

jonas.durand@inra.fr Lancé en 2017, CiTIQUE est un programme de recherche participative qui vise à mieux connaître les tiques et les maladies

qu’elles transmettent afin d’améliorer la prévention. Ce programme recouvre trois enjeux principaux : c’est à la fois un

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programme de recherche participatif, un observatoire du risque lié aux tiques et un facilitateur de projets.

CiTIQUE invite les citoyens à participer à différents niveaux. Via l’application « Signalement TIQUE », ils peuvent signaler

leurs piqûres ou celles de leurs animaux, mais aussi envoyer à l’INRA les tiques piqueuses qui seront stockées dans une tiquothèque publique. Depuis janvier 2019, ils peuvent également participer à des stages dans un laboratoire de recherche

ouvert au public, au cours desquels ils co-construisent les questions de recherche avec des chercheurs, identifient le stade

et l’espece des tiques de la tiquotheque, et analysent leur contenu en agents pathogenes. En tant qu’observatoire du risque, CiTIQUE a récolté plus de 15000 signalements qui ont permis de déterminer par exemple

que 29% des signalements correspondaient à des piqûres ayant eu lieu dans des parcs ou jardins. L’analyse par PCR microfluidique de 800 tiques piqueuses provenant de toute la France a montré que 33% d’entre elles étaient porteuses d’un agent pathogène (20% portaient Borrelia sp.).

CiTIQUE est aussi un facilitateur de projet. La tiquothèque et ses plus de 10000 tiques piqueuses est ouverte à tout chercheur

intéressé. Le programme jouit d’une reconnaissance nationale et d'une expertise qui permettent notamment de monter des

projets interdisciplinaires en incluant des acteurs privés.

Quelle importance de la diversité microbienne chez les tiques?

Olivier Duron

IRD, Montpellier olivier.duron@ird.fr Si les tiques comptent parmi les principaux vecteurs de microorganismes pathogènes, elles hébergent également une

impressionnante diversité de bactéries symbiotiques non pathogènes, comme les Coxiella, Francisella et Midichloria, qui leur

fournissent des apports vitaux en vitamines B. Pourtant, cette diversité ne s’arrête pas là : les nouvelles technologies de

séquençage, mais également l’examen d’une ‘vieille’ littérature trop souvent oubliée, nous offrent des opportunités inédites de (re)découvrir la diversité des microorganismes abrités par les tiques. Plusieurs exemples sont illustratifs de cette

situation : (i) la découverte de nouvelles espèces de Borrelia, divergentes des agents la maladie de Lyme et des fièvres

récurrentes, et formant un nouveau clade à la pathogénicité inconnue, (ii) le fait que la majorité des Rickettsia de tiques

pourraient ne pas être des pathogènes mais des bactéries exclusivement à transmission maternelle, ou encore (iii) la

(re)découverte des Aldérocystes que (presque) personne ne connait bien qu’ils soient omniprésents à la surface des spermatozoïdes de tique molle. Ces exemples ouvrent aujourd’hui de nouvelles voies pour explorer la biologie des tiques au-delà des approches conventionnelles.

Surveillance de la Borréliose de Lyme en France entre 2005 et 2017

Julie Figoni, Alexandra Septfons, Lucie Fournier, Thierry Blanchon, Benoît Jaulhac, Henriette de Valk

Santé publique France, 12 rue du Val d’Osne 94415 Saint-Maurice Cedex

julie.figoni@santepubliquefrance.fr La Borréliose de Lyme (BL) est la maladie vectorielle la plus fréquente en France. Nous décrivons ici les données de

surveillance permettant d’estimer l’incidence de la maladie, d’en détecter les tendances et d’identifier les groupes et les régions à risque en France.

Des médecins généralistes sentinelles rapportent régulièrement chaque cas diagnostiqué de BL, validé ensuite selon les

criteres de l’Eucalb. Les données hospitalieres sont analysées chaque année. Un cas de BL y est défini comme une personne hospitalisée avec un diagnostic de BL déterminé par un algorithme élaboré par un groupe multidisciplinaire.

Entre 2009 et 2017, l’estimation moyenne de l’incidence annuelle des cas de BL diagnostiqués en médecine générale était de 53/100 000 habitants (de 41/100 000 à 84/100 000). Une augmentation significative de l’incidence a été notée entre 2015 et 2016, non poursuivie en 2017. Entre 2005 et 2017, le taux d’incidence de cas de BL hospitalisés fluctuait entre 1,1 (2005)

et 1,5/100 000 habitants (2017), sans tendance significative au cours de la période. Plus de 95% des cas diagnostiqués en

médecine générale présentaient un érythème migrant et environ la moitié des cas hospitalisés étaient des neuroborrélioses.

Ces systemes de surveillance permettent d’avoir une image de l’incidence de la maladie. Pour optimiser la diffusion des messages préventifs, des études de séroprévalence sont également réalisées pour mieux documenter les facteurs de risque.

Les données de surveillance entomologique et l’amélioration des connaissances sur les interactions entre tiques, hôtes et

réservoirs des micro-organismes transmis sont indispensables pour orienter les politiques de prévention.

Première détection d’anticorps dirigés contre le virus de la fièvre hémorragique de Crimée-Congo chez des

ruminants corses

Sébastien Grech-Angelini, Renaud Lancelot, Armelle Peyraud, Aurélie Pédarrieu, Christophe Peyrefitte, Olivier

Ferraris, Raphaëlle Métras, Sara Moutailler, François Casabianca, Laurence Vial

GTV Corse, route de Ghisoni, 20 240 Ghisonaccia (laboratoire de rattachement : Vectotiq, UMR BIPAR,

Maisons-Alfort)

grech.angelini@gtvcorse.fr La Fièvre Hémorragique de Crimée-Congo (CCHF), maladie zoonotique contagieuse et transmissible par les tiques, est

émergente dans le bassin méditerranéen. La tique Hy. marginatum est considérée comme le principal vecteur du virus CCHF

dans cette région. Des prélèvements de tiques réalisés en Corse en 2014-2015 avaient ainsi montrer que Hy. marginatum

était largement répartie et abondante sur l’ile. Bien que la taille d’échantillon était relativement faible, aucune trace de

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génome viral CCHF n’avait par contre pu être détectée chez les tiques, aussi bien chez Hy. marginatum que chez d’autres espèces citées comme possiblement vectrices ou porteuses du virus.

Afin de mettre en évidence une circulation de virus CCHF en Corse, une enquête sérologique a parallèlement été réalisée sur

des sérums bovins, ovins et caprins collectés lors de la prophylaxie annuelle réalisée par les vétérinaires sanitaires (2014-

2015 pour la Corse-du-Sud et 2015-2016 pour la Haute-Corse). Près de 4 000 sérums issus de 269 élevages ont été testés en

ELISA (double antigen IDScreen, IDVET) en 2017. Dans plus d’un quart des cheptels échantillonnés, au moins un animal

séropositif a été détecté. Au niveau individuel, plus de 7% des animaux testés ont présenté des anticorps anti-CCHF. Les

animaux séropositifs se répartissent sur plus d’un tiers des 137 communes échantillonnées. Une confirmation de la spécificité

des anticorps détectés par ELISA a été réalisée sur une partie des échantillons, par séroneutralisation par le laboratoire national de référence OIE pour la CCHF (IRBA, Lyon).

Première détection et identification moléculaire de l'espèce zoonotique Anaplasma capra sur Cervidés captifs

en France

Maggy Jouglin, Barbara Blanc, Nathalie de la Cotte, Suzanne Bastian, Katia Ortiz, Laurence Malandrin

UMR INRA/Oniris BioEpAR, Site de la Chantrerie, 44307 Nantes cedex3 maggy.jouglin@oniris-nantes.fr Les Cervidés sont des réservoirs d'agents infectieux transmis par les tiques. Nous avons détecté et caractérisé les espèces

d'Anaplasma présentes chez le cerf élaphe (Cervus elaphus) et le cerf de Duvaucel (Rucervus duvaucelii), maintenus captifs

dans la Réserve Zoologique de la Haute Touche. Le sang de 59 cerfs élaphe et 7 cerfs de Duvaucel a été collecté entre 2015

et 2017. Les Anaplasma ont été détectées par PCR semi-nichée sur le gène de l'ARNr 23S. Anaplasma phagocytophilum a été

identifié chez 14/59 cerfs élaphe (23,7%) mais pas chez le cerf de Duvaucel. Trois séquences n'ont pas pu être assignées à

une espèce d'Anaplasma sur la base de l'ARNr 23S. Une caractérisation plus poussée sur les gènes de l'ARNr 16S, gltA et groEL a permis d'identifier pour la premiere fois Anaplasma capra en France, sur cerfs élaphes et cerfs de Duvaucel. Cette espece n'a été décrite que sur le continent asiatique (Chine et Japon), notamment sur cerf Sika, Saro du Japon, chèvre et

mouton. Son potentiel zoonotique a été démontré en Chine en 2015 sur une cohorte de patients. Cette bactérie a pu être

introduite dans le parc, qui accueille de nombreuses espèces de Cervidés asiatiques. Deux animaux infectés sont natifs du

parc, suggérant que la bactérie a établi son cycle épidémiologique localement et nous avons montré qu'elle persiste chez

l'animal pendant au moins 4 mois. En 2018, l'infection par A. capra est mise en évidence chez 4 autres cerfs de la réserve et

3 daims d'une autre réserve. Le vecteur n'est pas identifié.

Microbiote de tique ou microbiote de kit ?

Lejal E.1, Estrada-Peña A., Cosson JF.1, Rué O., Mariadassou M., Midoux C. ; Vayssier-Taussat M.1 et Pollet T.1

1UMR BIPAR, Laboratoire de santé animale, INRA, ANSES, Ecole Nationale Vétérinaire d’Alfort, Université Paris-

Est, Maisons-Alfort, France

emilie.lejal@vet-alfort.fr L’essor des technologies de séquençage à haut débit a considérablement facilité l’analyse de la diversité et de la composition

des communautés bactériennes, améliorant ainsi nos connaissances et notre compréhension de leur fonctionnement. Ces

techniques devenant toujours plus sensibles et moins coûteuses, leur utilisation est maintenant répandue dans l’analyse de nombreux écosystèmes microbiens. Ces approches sont utilisées pour étudier le microbiote des tiques, et à raison

connaissant l’importance que peuvent avoir certains endosymbiontes sur la biologie de la tique. De même, l’étude du microbiote des tiques via ces technologies a déjà permis de mettre en évidence des différences de composition en fonction

de plusieurs variables, dont la présence d’agents pathogenes. Toutefois, un nombre grandissant d’études alerte la communauté scientifique de l’importance de la contamination apportée par les étapes d’extraction/amplification de l’ADN. Chez les échantillons de faible biomasse, ces contaminants peuvent représenter plus de la moitié des séquences obtenues

et générer un biais considérable dans l’interprétation des résultats. La plupart des études portant sur le microbiote des tiques

ne mentionnent pas la réalisation de témoins lors des étapes d’extraction/amplification de l’ADN, ou assimilent l’absence de signal en électrophorèse à une absence de contamination. Nous avons analysé individuellement le microbiote de tiques

Ixodes ricinus, tout en effectuant différents témoins négatifs tout au long du processus suivi par les échantillons

(broyat/extraction/amplification). Les résultats montrent que plus de 40% des séquences correspondent à des contaminants.

La réalisation de nombreux contrôles est donc cruciale pour identifier la diversité et la composition des communautés

microbiennes de tiques.

Etude des mécanismes moléculaires de la compétence vectorielle d’Ixodes ricinus pour deux flavivirus

Manon Lemasson1, Grégory Caignard1, Yves Unterfinger1, Houssam Attoui1, Lesley Bell-Sakyi2, Sara Moutailler3,

Sarah Bonnet3, Damien Vitour1, Jennifer Richardson1, Sandrine A. Lacour1. 1UMR 1161 Virologie (INRA, ANSES, ENVA), Maisons-Alfort, France. 2Department of Infection Biology, Institute of Infection and Global Health, University of Liverpool, Liverpool, United Kingdom. 3UMR 956 BIPAR (INRA,

ANSES, ENVA), Maisons-Alfort, France.

manon.lemasson@vet-alfort.fr

22

En Europe, TBEV (virus de l’encéphalite à tique) et LIV (virus Louping ill) sont 2 flavivirus transmis par la tique Ixodes ricinus.

A ce jour, les mécanismes impliqués dans la réplication et la transmission des virus par la tique restent méconnus. Aussi,

nous avons choisi d’appréhender ces mécanismes par l’étude des interactions entre les protéines virales et les protéines de tique dans l’objectif d’identifier des facteurs moléculaires de la compétence vectorielle d’I. ricinus pour TBEV et LIV.

Notre stratégie a consisté à établir une cartographie d’interactions entre les protéines virales de TBEV et LIV et les protéines

cellulaires d’I. ricinus par crible double-hybride en levure. L’ADNc de chacune des protéines virales a été cloné puis criblé contre une banque d’ADNc de tique établie au laboratoire à partir de 3 lignées cellulaires d’I. ricinus. Après confirmation des

interactions, 22 protéines d’I. ricinus ont été identifiées pour interagir indifféremment avec les protéines de TBEV et LIV.

L’annotation des protéines a permis d’identifier leur role dans divers processus biologiques impliqués dans une infection virale tels que la réponse immunitaire ou la maturation de ribosomes.

Nous avons ainsi établi pour la premiere fois une cartographie d’interactions protéiques entre LIV, TBEV et I. ricinus à partir

d’un matériel biologique original. Ce travail sera poursuivi par la caractérisation in vitro du rôle de chaque interacteur sur le

cycle viral. De plus, l’extinction de l’expression des interacteurs chez la tique vivante permettra de déterminer leur role dans

la compétence vectorielle d’I. ricinus pour TBEV et LIV.

Collecte et identification des tiques dans une Réserve zoologique

Héloïse Duchêne, Albert Agoulon, Claire Bonsergent, Nathalie de la Cotte, Maggy Jouglin, Barbara Blanc, Alice

Brunet, Katia Ortiz, Suzanne Bastian, Laurence Malandrin

UMR INRA/Oniris BioEpAR, Site de la Chantrerie, 44307 Nantes cedex3

laurence.malandrin@oniris-nantes.fr La Réserve zoologique de la Haute Touche (Muséum National d'Histoire Naturelle), localisée dans l'Indre, au cœur d'un massif

forestier, rassemble plus de 1300 animaux des 5 continents, dont 50 espèces d'Ongulés différentes. Nous avons inventorié

les tiques présentes dans le parc, sur 101 points de collecte répartis autour et dans la Réserve. La collecte a été réalisée au

drapeau en conditions standardisées (cercle de 3 m de rayon, 5 minutes par point), à deux reprises en Mai. Les tiques

collectées dans l'alcool ont ensuite été comptées et identifiées au laboratoire. 5632 tiques ont été collectées et identifiées.

Les tiques sont présentes dans tout le parc : 97% des points présentent au moins un stade collecté. Le stade le plus représenté

est celui des nymphes (résultat biaisé par la limite imposée sur le nombre de larves collectées :10 à 40 maximum/point). La

densité moyenne des stades nymphes et adultes est de 18,5/point, soit 65/100 m2. Les données de densité sont

surdispersées : 75% des points présentent moins de 18 tiques, 3,5% en ont plus de 100 (jusqu'à 369). Sept espèces de tiques

ont été collectées au drapeau dans le parc au mois de Mai. Ixodes ricinus, Haemaphysalis concinna et H. inermis représentent

plus de 99% des tiques. Quelques I. frontalis, I. acuminatus, Dermacentor marginatus et D. reticulatus ont également été

collectées. L'analyse des agents pathogènes portés pas ces tiques est en cours.

Neuronal Basis of Tick-Pathogen Interactions

Mateos-Hernández Lourdes, Cabezas-Cruz Alejandro, Simo Ladislav

UMR-BIPAR, INRA, ANSES, ENVA, Université Paris-Est

lmateoshernandez@hotmail.com Anaplasma phagocytophilum is the most wide spread tick borne pathogen in animals in Europe and also severely affects the

human health. A. phagocytophilum infection induces transcriptional reprograming and proteome modulation in tick midguts

and salivary glands where it affects several cellular processes including cytoskeleton reorganization, cell immunity and

epigenetics, apoptosis, and metabolism. However, whether A. phagocytophilum, or any other tick-borne pathogen,

modulate the cellular processes in tick neural system (synganglion) is largely unknown. We hypothesize that A. phagocytophilum benefits from the modulation of the tick physiology manipulated via changes of the neuropeptide levels in

the synganglion. Our preliminary data using a peptidomics approach revealed the presence of several neuropeptides in the

tick cells ISE6, a model used to study tick-A. phagocytophilum interactions. Importantly, we found that A. phagocytophilum

infection modifies the mRNA levels of various tick neuropeptides in ISE6 cells. Our project will lay the foundation for

generating testable hypotheses on the neural basis of tick-pathogen interactions. Our innovative approach has a potential

to generate testable hypotheses that shed a completely new light on the neural basis of tick-pathogen interactions.

Etude des risques associés aux tiques dans les parcs urbains et périurbains en région lyonnaise

Mathews-Martin L.1, Sepulveda D 2., Barry S. 1, Poux V. 1, Lebert I. 1, Massaglia S. 1, Namèche M. 2, Bourdoiseau

G. 1, Chambon-Rouvier S. 3, Chalvet-Monfray K. 1 et René-Martellet M1. 1 INRA, VetAgro Sup, UMR EPIA Epidémiologie des maladies animales et zoonotiques, 63122 Saint Genès

Champanelle, France. 2 Direction de l’Ecologie urbaine, ville de Lyon, Lyon, France. 3 Métropole de Lyon, Lyon,

France.

laure.mathews-martin@ensv.vetagro-sup.fr Avec le lancement en 2016 du « Plan national de lutte contre la maladie de Lyme et les maladies transmises par les tiques »,

les collectivités locales sont confrontées à une demande croissante d’évaluation du risque d’exposition aux piqûres de tiques. Si le risque d’exposition aux tiques et bien connu en forêt et dans les zones rurales, il l’est moins dans les parcs urbains et

péri-urbains pourtant très fréquentés. Une étude de faisabilité réalisée en 2018 dans deux parcs de la région Lyonnaise a

confirmé la présence de tiques dans ces deux parcs et suggere l’existence de différences significatives probablement en lien

23

avec la localisation des parcs et leurs connections avec les forêts avoisinantes.

Une nouvelle étude a donc été initiée en 2019 en collaboration avec la métropole et la ville de Lyon. Des échantillonnages

(100 passages de draps par mois at par parc) sont programmés mensuellement d’avril à octobre. Un site témoin permet par ailleurs d’évaluer les variations d’activité saisonniere des tiques. Les jours de terrain sont déterminés en fonction des

conditions météorologiques controlées à l’aide d’une station implantée dans chacun des trois parcs. Les zones échantillonnées sont choisies aléatoirement dans différents types de végétations. Un volet sciences humaines et sociales est

conduit en parallèle pour les enjeux de communication associés au risque tiques. Cette communication a pour objectif de

présenter les enjeux et la méthode de cette étude et de partager au sein de la communauté TMT notre expérience de travail

avec une collectivité.

Evaluating functional dispersal and its eco-epidemiological implications in a nest ectoparasite

Amalia Rataud, Marlène Dupraz, Céline Toty, Thomas Blanchon, Marion Vittecoq, Rémi Choquet, Karen D.

McCoy

MiVEGEC, Centre IRD, 911 Avenue Agropolis, Montpellier

karen.mccoy@ird.fr Functional dispersal (between-site movement, with or without subsequent reproduction) is a key trait acting on the ecological and evolutionary trajectories of a species, with potential cascading effects on other members of the local

community. It is often difficult to quantify, and particularly so for small organisms such as parasites. Understanding this life

history trait can help us identify the drivers of population dynamics and, in the case of vectors, the circulation of associated

infectious agents. In the present study, functional dispersal of the soft tick Ornithodoros maritimus was studied at small

scale, within a colony of yellow-legged-gulls (Larus michahellis). Previous work showed a random distribution of infectious

agents in this tick at the within-colony scale, suggesting frequent tick movement among nests. This observation contrasts

with the presumed strong endophilic nature described for this tick group. By combining an experimental field study, where

both nest success and tick origin were manipulated, with Capture-Mark-Recapture modeling, dispersal rates between nests

were estimated taking into account both tick capture probability and survival, and considering an effect of tick sex. Our

results confirm the strong endophilic nature of this tick species, highlighting the importance of life cycle plasticity for

adjusting to changes in host availability. However, they also raise questions with respect to the previously described within-

colony distribution of infectious agents, suggesting that tick dispersal either occurs over longer temporal scales and/or that

transient host movements outside the breeding period result in vector exposure to a diverse range of infectious agents.

Variabilité Génétique des virus transmis par les tiques et identification de nouvelles cibles pour la lutte

antivirale

Camille Migné, Houssam Attoui, Sara Moutailler

ANSES, Laboratoire de santé animale, 14 rue Pierre et Marie Curie 94700 MAISONS ALFORT

camille.migne.ext@anses.fr Les tiques représentent un risque sanitaire majeur pour l’Homme et les animaux en transmettant une grande variété d’agents pathogenes (bactéries, virus, parasites). Parmi les 170 arbovirus transmis par les tiques, peu d’entre eux sont

étudiés. En raison de leur cycle de réplication rapide et de leur grande taille de population, les arbovirus existent sous forme

de populations de variants. Ce sont des virus quasi-especes avec une plasticité phénotypique importante pouvant s’adapter à de nouveaux environnements et hôtes. Néanmoins, une sélection efficace semble dominer l'évolution des arbovirus entrainant une relative stabilité génomique qui pourrait résulter de l’alternance d'hotes. En effet les arbovirus sont maintenus dans un cycle naturel à deux hôtes différents (vertébrés et invertébrés). Malgré tout, les arbovirus gardent la

capacité de générer des variants capables d’exploiter de nouveaux environnements et d’induire des émergences. Des virus connus, transmis par les tiques, ont également émergés dans de nouveaux territoires (Encéphalite à tique, Louping ill, la

Fièvre Hémorragique de Crimée-Congo, …). Afin de mieux comprendre ces phénomenes d’émergence, nous nous proposons d’évaluer la variabilité génétique et l’adaptation de deux virus transmis par les tiques : Colorado tick fever (Coltivirus) et

Kemerovo (Orbivirus). Nous souhaitons répondre aux questions suivantes : L’alternance d’hotes contraint-elle l’évolution des virus transmis par les tiques ? la variabilité génétique de ces virus est-elle différente en conditions in vitro versus in vivo ? A plus long terme, nous chercherons à identifier les gènes qui semblent plus contraints au niveau évolutif et qui pourraient

donc constituer de potentielles cibles antivirales. Je propose de vous présenter mon projet de these et l’avancée de mon travail commencé en octobre 2018.

Le chevreuil sentinelle du risque de la contamination humaine par les maladies à tiques ?

Valentin OLLIVIER, Matthieu BASTIEN, Benoit COMBES, Sara MOUTAILLER, Amandine GAMBLE, Hélène

VERHEYDEN & Thierry BOULINIER

UMR 5175, 1919 Route de Mende, 34293 Montpellier 5

valentin.ollivier@cefe.cnrs.fr Le risque de s’exposer aux agents infectieux responsables de la maladie de Lyme et d’autres maladies à tiques est susceptible

de varier fortement dans l’espace et dans le temps à différentes échelles, notamment en fonction de la densité des populations de tiques, de leur niveau d’infection par des agents infectieux et de la densité, la susceptibilité et les

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comportements des différents hôtes. Dans ce contexte, dans le but de complémenter les mesures mises en place par les

organisations de santé publique pour cartographier le risque d’exposition à la maladie de Lyme, nous nous proposons d’évaluer si la sérosurveillance chez le chevreuil pourrait être un outil pertinent. Ce travail s’articule autour de 3 axes : (1) La

validation du statut de séropositivité des chevreuils vis-à-vis de B. burgdorferi sl comme indicateur utile de leur histoire

d’exposition à cette bactérie. Ceci sera notamment fait en étudiant la dynamique du changement du statut sérologique

d’individus en utilisant des données de capture-marquage-recapture et des modeles d’analyse permettant d’estimer les probabilités de détection des individus, leur changement de statut sérologique et leur survie. (2) La construction de cartes

de la séroprévalence des chevreuils vis-à-vis de B. burgdorferi sl en relation avec l’évaluation du risque de contamination humaine par la bactérie B. burgdorferi sl à large échelle (territoire couvert par l’ELIZ). (3) L’exploration des perspectives de l’application de ce type d’approche au cas d’autres organismes pathogenes transmis par les tiques. Cross border transhumance, a dissemination way of ticks and tick-borne pathogens in West Africa

OUEDRAOGO A, ZANNOU O, FAROUGOU S, BELEM A, SAEGERMAN C , OOSTHUIZEN M, BIGUEZOTON A ,

LEMPEREUR L

Centre International de Recherche Développement sur l’Elevage en zone Subhumide (CIRDES), N° 559, rue 5-31 angle Avenue du Gouverneur Louveau, 01 B.P.: 454 Bobo-Dioulasso 01- Burkina Faso-

sougrinomaachille.ouedraogo@doct.uliege.be The extensive and low-input livestock system occurring in West Africa lay on a cross-border transhumance, which represents

an important animal production strategy. Meanwhile, cattle tick infestations constitute one of the main constraints to the

development of livestock production in this region. This study aims to evaluate the involvement of transhumance in the

spread of ticks and associated pathogens between the eastern Burkina Faso (BF) and northern Benin (BN), where the sanitary

conditions of cattle, considering ticks and tick-borne diseases, are less known. The first step has been a cross sectional survey,

which consisted in an investigation on ticks and tick-borne pathogens in cattle in the Eastern BF (490 cattle) and the Northern

BN (456 cattle). The second step was a longitudinal survey including 311 cattle from BF, monitored during one season of

transhumance. These two surveys were carried out with cattle ticks and peripheral blood collection from December 2016 to

March 2017. According to the cross sectional survey, the most abundant tick species recorded during this period were

Amblyomma variegatum, Hyalomma truncatum and Rhipicephalus (Boophilus) microplus. This latter species was evidenced

in some areas in Northern BN where it wasn’t reported yet, and only in a herd of BF coming from transhumance in BN. The

microscopic examination of blood smears revealed a high prevalence of Anaplasma sp up to 86,12% and 85,75% respectively

in BF and BN. The genus Theileria was solely diagnosed in BN within 8,11% of cattle.

Etude de la compétence vectorielle des tiques molles du genre Ornithodoros pour le virus de la Peste Porcine

Africaine en Europe

PEREIRA DE OLIVEIRA Rémi, HUTET Evelyne, PABOEUF Frédéric, DUHAYON Maxime, BOINAS Fernando, PEREZ

DE LEON Adalberto, VIAL Laurence, LE POTIER Marie-Frédérique

Anses, Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort Unité de Virologie Immunologie Porcines Zoopôle Les Croix, BP 53, F-22440 Ploufragan

remi.pereira_de_oliveira@cirad.fr La Peste Porcine Africaine (PPA), maladie virale, endémique en Afrique sub-saharienne, a été introduite en 2007 en Géorgie.

Depuis, elle s’est propagée en Europe et en Asie. Il n’existe ni vaccin ni traitement thérapeutique. Le virus de la PPA infecte

uniquement les suidés et les tiques molles du genre Ornithodoros. Une des voies connues de transmission au porc est la

piqûre de tique infectée. Cependant, le rôle des tiques dans la vectorisation et le maintien de la PPA en Europe reste encore

à déterminer. Trois espèces du genre Ornithodoros ont été sélectionnées : une africaine, O. moubata et deux européennes,

O. erraticus et O. verrucosus. Les quatre souches hautement pathogenes étudiées sont originaires d’Afrique, Liv13/33 ou d’Europe, OurT88/1, Georgia2007/1 et Ukr12/Zapo. Différentes associations tique-virus ont été testées : O. moubata-

Liv13/33, O. moubata-Georgia2007/1, O. erraticus-OurT88/1, O. erraticus-Georgia2007/1 et O. verrucosus-Zapo. Les tiques

sont infectées sur porc virémique par gorgement puis des essais de transmission sur porc ont été réalisés. Seule O. moubata

a réussi à transmettre le virus. Pour les autres couples, une injection de broyat de ces tiques a induit la PPA chez les porcs,

confirmant leur pouvoir infectieux. Pour comprendre ces différences de transmission, des titrages viraux à partir des tiques

ont été réalisés montrant que certaines souches virales sont plus aptes à se maintenir chez certaines espèces. Ces résultats montrent que la vectorisation du virus de la PPA dépend de plusieurs facteurs, ce qui renforce l’importance de l’étude des mécanismes sous-jacents de la compétence vectorielle des tiques molles.

Ixodes frontalis, une espèce de tique fréquente et facile à collecter au drap ou au drapeau quand on sait où

la chercher ! Olivier Plantard1*, Romain Daveu1, Thierry Hoch1, Claude Rispe1, Frédéric Stachurski2, Franck Bouée3, Valérie Poux4, Nicolas Cebe5, Hélène Verheyden5, Camille Mazé6, Magali René-Martellet7, Karine Chalvet-Monfray7,

Alessandra Cafiso8, Emanuela Olivieri9, Albert Agoulon1*.

* Ces auteurs ont contribué de façon équivalente à ce travail .

25

1 : BIOEPAR, INRA, Oniris, F-44307, Nantes, France. 2 : ASTRE, CIRAD, F-34398 Montpellier, France . 3 :

Laboratoire de la rage et de la faune sauvage de Nancy, ANSES, Malzéville, France . 4 : EPIA, INRA, VetAgro Sup, F-63122, Saint Genès Champanelle, France . 5 : CEFS, INRA, Université de Toulouse, F-31326 Castanet-Tolosan,

France . 6 : CEBC, CNRS, F-79360 Beauvoir-sur-Niort, France. 7 : EPIA, INRA, VetAgroSup, F-69280 Marcy L’Etoile, France. 8 : Department of Veterinary Medicine, University of Milan, Via Celoria 10, 20133 Milan, Italy. 9:

Department of Biology and Biotechnology, University of Pavia, via Ferrata 9, 27100 Pavia, Italy

olivier.plantard@inra.fr Parmi la quarantaine d’especes de tiques présente en France (une soixantaine dans l’ouest paléarctique), Ixodes frontalis est

l'une de celles dont la distribution demeure mal connue bien qu’elle semble largement répandue. L’immense majorité des données disponibles dans la littérature pour cette espèce est issue de collectes sur ses hôtes (oiseaux, notamment

passereaux). Dans le cadre de 2 programmes de recherche consécutifs visant à suivre la dynamique des populations d’I. ricinus par la méthode du drap, une forte abondance de larves d’I. frontalis collectées sur la litiere a été observée sur l’un des 8 sites du réseau (Agoulon et al. TTBD 2019). Comme cette espèce était fortement concentrée au niveau de quelques

transects entourés de bambous, nous avons cherché à savoir si cette situation était généralisable à d’autres localités. Une recherche systématique dans les parcs de la ville de Nantes où des bambous sont présents nous a permis de trouver l’espece dans 10 cas sur 10. Nous avons ensuite étendu cette recherche dans d’autres régions en France et en Italie où elle a été trouvée dans 9 cas sur 10. Cette espèce méconnue est donc finalement relativement facile à trouver par la méthode du drap

ou du drapeau si on la recherche sous des bambous. Nous faisons l’hypothese que les bosquets de cette poacée introduite constituent des sites privilégiés pour constituer des dortoirs nocturnes pour les passereaux. Cette tique étant connue comme

hébergeant des agents pathogenes zoonotiques, les conséquences de cette découverte pour l’épidémiologie des maladies à tiques seront discutées.

The concept of scale in tick microbial community ecology

Thomas Pollet, Emilie Lejal, Agustin Estrada-Peña, Jean François Cosson, Aleksandra Krawzcyk, Sara Moutailler, Muriel Vayssier-Taussat, Hein Sprong

UMR BIPAR, 14 rue Pierre et Marie Curie 94 700 Maisons-Alfort

thomas.pollet@vet-alfort.fr / thomas.pollet@inra.fr Ticks are among the most important vectors of pathogens affecting humans and animals worldwide. It is now well established

that tick-borne pathogens coexist with many other microorganisms in ticks constituting a tick microbial complex recently

named pathobiome. With the development of high throughput sequencing technologies, studies dealing with bacterial

composition in tick considerably increased in the past years and revealed an unexpected microbial diversity. These data on

diversity and composition of the tick microbiota are increasingly available, giving crucial details on microbial communities in

ticks and improving our knowledge on the tick microbial community. However, consensus is currently lacking as to which

scales (tick individual specimens or species, communities of ticks, populations adapted to specific/different environmental

conditions, spatial and temporal scales) best facilitate understanding the diverse relationships among bacteria. Temporal or

spatial scales have a clear influence on how we conduct ecological studies, interpret results, and understand interactions between organisms that build the microbiota. Patterns apparent at one scale can collapse into noise when viewed from

other scales, indicating that processes shaping tick microbiota vary in ways that are not yet captured. Based on empirical

results, we will demonstrate how much the concept of scale is crucial to consider in tick microbial community studies to

improve our knowledge on tick microbe ecology, get predictive models on pathogen/microbiota interactions and finally

develop successful control strategies of tick-borne diseases.

Prévention et prise en charge de la maladie de Lyme : de la complexité et de la nécessité d’intégrer divers

déterminants psychosociaux

Puppo, C. & Préau, M. Université Lumière Lyon 2

costanza.puppo@univ-lyon2.fr Cette présentation vise à proposer une analyse psychosociale de la littérature scientifique relative aux actions de prévention

et de prise en charge de la maladie de Lyme. Nous avons mené une revue de la littérature existante autour de la maladie de

Lyme, en particulier autour de sa prévention et prise en charge. Actuellement il existe tres peu d’études sur les aspects psychosociaux liés au vécu de la maladie de Lyme ainsi qu’aux autres MVT. Seules les dimensions physiques et mentales de la qualité de vie sont prises en compte.

Quant à la prévention, la littérature montre que la faible acceptabilité des mesures préventives doit être associée à la nature

comportementale, et non médicale, de ces interventions ainsi qu’à la complexité de la mise en œuvre d’une politique de

santé publique autour des MVT. Par ailleurs, la condition d’incertitude qui souvent caractérise la prise en charge de la maladie

de Lyme peut provoquer des conséquences importantes sur la qualité de vie du patient. C’est pourquoi la reconnaissance

du savoir profane est fortement revendiquée par les patients, en particulier par la recherche d’une condition d’engagement et participation active vis-à-vis des médecins. Dans ce contexte, la construction d’une relation solide entre soignant et patient

s’avere essentielle. En conclusion, notre revue de la littérature montre que l’invisibilité de nombreux symptomes, l’expérience subjective du patient ainsi que les représentations sociales autour de la maladie de Lyme nécessitent d’être appréhendés par une approche

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psychosociale, afin de mieux comprendre le vécu des patients atteints par cette maladie.

Deciphering the synganglion transcriptome of Ixodes ricinus.

Claude Rispe, Caroline Hervet, Jean-Marc Aury, Karine Labadie, Steeve Thany, Ladislav Simo, Claude Charvet,

Cédric Neveu and Olivier Plantard

INRA, Oniris, BIOEPAR, Nantes

claude.rispe@inra.fr Ticks are strict blood-feeding arthropods (Acari) and have the potential to transmit disease agents (bacteria, parasites,

viruses). Important gaps remain in our knowledge of the tick synganglion. Understanding of its activity in different conditions

could foster the developement of tick-specific acaricides targetting neuroreceptors, or of alternatives to chemical

treatments.

We dissected synganglions of Ixodes ricinus adult ticks in different biological conditions (questing females or males, blood-

feeding females). This material was used for high throughput RNAseq, with a sequencing on one lane of an Illumina 4000

machine. Reads were de novo assembled, mapped on a draft genome sequence, and we then focused on the transcripts with coding potential (i.e. on predicted coding sequences, n=38,909).

We obtained a tick synganglion transcriptome with a high level of gene completeness (as a result of high sequencing

coverage), which also showed a high level of specificity when compared to previously published transcriptomes for I. ricinus.

One puzzling result was the high frequency of tissue-specific transcripts corresponding to transposon related genes. We

performed annotation and phylogenetic analyses of neuropeptides, neuropeptide receptors and neurotransmitter

receptors. Notably, we achieved a near-exhaustive reconstruction of the Cys-loop Ligand-Gated Ion Channel genes (including

the nAchr receptors), a first for any tick species, to our knowldege. We combined phylogenetic studies for each type of

receptor with data on expression level in the different biological conditions, and on genomic localization. Populational

variation was also explored, revealing highly significant polymorphisms in potential acaricidal targets.

Identification des pâtures à risque pour l’ehrlichiose bovine en Wallonie (Belgique)

Raphaël Rousseau, Earth and Life Institute (ELI), Georges Lemaitre Center for Earth and Climate Research, Université catholique de Louvain (UCL), Louvain-la-Neuve, Belgique. Sophie O. Vanwambeke, Earth and Life

Institute (ELI), Georges Lemaitre Center for Earth and Climate Research, Université catholique de Louvain (UCL),

Louvain-la-Neuve, Belgique. Elise Dion, Département de l’environnement et de l’eau, Service public de Wallonie, Namur, Belgique (anciennement: Association Régionale de Santé et Identification Animales, Ciney, Belgique)

raphael.rousseau@uclouvain.be Les tiques constituent une menace pour la santé publique et animale car elles peuvent transmettre divers pathogènes.

Anaplasma phagocytophilum est une bactérie qui affecte les humains, mais aussi le bétail. Chez celui-ci, elle est responsable

de l’ehrlichiose bovine, qui est associée à des symptomes de fievre et des diminutions dans la production de lait. En Wallonie, le premier cas a été identifié en 2010, et la haute séroprévalence découverte chez le bétail suggere qu’elle y est endémique. L’objectif de cette étude est de déterminer les conditions environnementales associées à la présence d’animaux séropositifs. L’ARSIA (Association Régionale de Santé et d’Identification Animales) a analysé la présence d’anticorps IgG contre A. phagocytophilum chez un animal dans 1445 troupeaux répartis sur l’ensemble du territoire wallon, et géo-localisés selon les

patures utilisées par l’éleveur. Etant donné le faible nombre d’animaux testés dans chaque troupeau et la difficulté de savoir dans quelle pâture le bétail a été infecté, les données de séropositivité sont prétraitées afin de produire une surface continue

décrivant l’intensité locale de présence. A l’aide d’un cadre conceptuel basé sur les ressources nécessaires au cycle de transmission d’A. phagocytophilum, des variables décrivant l’environnement des patures pertinentes sont identifiées et mesurées à l’aide de bases de données standard au sein de zones entourant les patures. Les résultats permettent d’identifier les éléments paysagers caractéristiques des patures les plus à risque et sont comparés à d’autres études réalisées sur le même territoire. Les défis liés à l’analyse spatiale de données de surveillance sont également abordés.

Imaging approaches to study the tick endobacterium M.mitochondrii Uzum Z, Mallet A, Olivieri E, Floriano AM, Plantard O, Sassera D, Stavru F EBMC Unit / ERL6002, Institut Pasteur, 25 rue du Dr Roux, 75015 Paris fabrizia.stavru@pasteur.fr Midichloria mitochondrii is an alphaproteobacterium of the Rickettsiales family that is mainly found in the ovaries of the

European tick Ixodes ricinus, an important disease vector. M. mitochondrii has been shown to reside in the cytosol of tick

oocytes, but appears to have the peculiar ability of also colonising mitochondria. Our aim is to characterize the bacteria-

mitochondria interaction at the molecular and morphological level. To get insight into the M. mitochondrii – host

interaction at the molecular level, we employed a combination of comparative genomics and proteomics to select M. mitochondrii proteins that could interact with host proteins. These candidates are currently being studied in a

heterologous expression system. To obtain detailed 3D morphological insight into the M.mitochondrii-mitochondrial

interface we employed Focussed Ion Beam milling combined with Scanning Electron Microscopy (FIB-SEM). Segmentation

of the 3D-dataset enabled us to confirm the presence of intramitochondrial bacteria, to obtain quantitative information on

the bacteria-mitochondria interface and to quantify mitochondria-associated and free bacteria.

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POSTERS Pseudosuccinea columella – Fasciola hepatica interaction: on the mechanistic and immunobiological bases

of the snail host resistance/susceptibility to its parasitic trematode

Annia ALBA, Jorge SANCHEZ, Antonio VAZQUEZ, David DUVAL, Cristian CHAPARRO, Benjamin GOURBAL

IHPE, Université de Perpignan, France / Instituto « Pedro Kourí » de Medicina Tropical, Cuba annia.alba@gmail.com Pseudosuccinea columella is one of the main vectors of the medically-important trematode Fasciola hepatica. In Cuba, the

existence within P. columella species of field-occurring susceptible and resistant (parasite encapsulation by snail’s hemocytes) snail populations to F. hepatica infection offers a unique Mollusca-Trematoda model particularly interesting to

study. Here, we present, from naïve snails, the comparison of the whole snail transcriptome (by RNAseq) between resistant

and susceptible strains, to provide a molecular baseline of both P. columella phenotypes prior infection. In addition, we

investigated the hemocytes of P. columella resistant and susceptible following F. hepatica infection in regards of their

morphology, abundance, proliferation and in vitro encapsulation activity. On the one hand, the new “omic” data from naïve snails show an enrichment on biological process/functions associated with immune defense/stress response

associated with resistant P. columella, and a particular abundance of transcripts related with pathogen

recognition/interaction, pro-inflammatory responses and signaling/regulation of immune defenses. On the other hand, our

results on the hemocytaire response on exposed resistant snails show high spreading and aggregation of large adherent

cells, significant proliferation of circulating blast-like cells and higher encapsulation activity of the hemocytes, along with a

higher expression of the cytokine granulin compared to susceptible P. columella. Contrastingly, we found evidences of a

possible F. hepatica-driven immune modulation occurring only in susceptible snails.

Influence of bacterial symbionts on host niche and ecological diversification: a metabolic approach in

whitefly model.

Benhamou S., Rahioui I., Desouhant E., Heddi A., Vavre F., Calevro F., Mouton L.

UMR CNRS 5558 – Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1

(UCBL) – Bâtiment Gregor Mendel, 43 boulevard du 11 novembre 1918, 69622 VILLEURBANNE cedex sylvain.benhamou@univ-lyon1.fr Symbiosis has been associated with major transitions in evolution. For instance, the acquisition of nutritional obligate

symbionts allowed phytophagous insects to feed on plant sap. The whitefly Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae) is a

major economic pest species complex exhibiting a rich diversity of biotypes. In addition to their nutritional primary

symbiont (P-Symbiont) Portiera aleyrodidarum, most of B. tabaci individuals are infected by one or more secondary

symbionts (S-Symbionts). Importantly, symbiotic composition is specific to each biotype and may be associated to

biological and ecological features such as plant range. This raises the possibility that S-Symbionts play a role in the

adaptation of their host to the ecological niche, and in the B. tabaci complex species diversification. Genomic studies

suggest that S-Symbionts could have a profound effect on their host metabolism by providing essential nutrients, but could

also act as sinks for certain metabolites. To decipher whether S-Symbionts influence their host metabolism in a way

affecting their ability to exploit their niche, we conducted HPLC analysis of the amino acid content of two B. tabaci biotypes

harboring three different symbiotic communities as well as of the plants they are adapted to. First results reveal significant

variations in the metabolic profiles of both plants and insects. Experiments are now ongoing with the objective of linking

metabolic data of both insect and plants to patterns of insect preference and performance. Investigating the adaptive

value associated to specific symbiotic communities will help understanding the underlying mechanisms of diversification

and ecological speciation of pest insects.

Local patterns of virulence and resistance in wild host-pathogen populations.

L. Bonometti, L. Blondin and C. Neema

UMR BGPI Inra-CIRAD-Montpellier SupAgro

lucas.bonometti@supagro.fr The co-evolutionary process between a fungal plant pathogen, Colletotrichum lindemuthianum, and its host, the common

bean (Phaseolus vulgaris), was studied in wild populations. Fungal strains and their host plants were collected in three

countries (Mexico, Ecuador and Argentina) located in the three centers of diversity of the host (P. vulgaris). For both host and pathogen, genetic diversity was assessed using molecular markers. In parallel, cross-inoculation experiments were

realized at different spatial scales. The results showed local adaptation at the centers of diversity scale and at the regional

scale in Argentina and Mexico, with positive correlations between levels of host resistance and pathogen virulence. These

results have been correlated to disease prevalence and environmental conditions, such as local climatic and geographical

data, to study the environment effect on host and pathogen genetic diversity.

Production de mutants perte de fonction chez la noctuelle ravageur de culture, Spodoptera frugiperda grâce

à CRISPR/Cas9.

Eychenne M., Girard PA., Frayssinet M., d’Alençon E., Darboux I., Duvic B, Negre N. and Volkoff AN.

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Université de Montpellier, place Eugène Bataillon 34095 Montpellier, UMR DGIMI 1333, CC101

magali.eychenne@inra.fr Spodoptera frugiperda est un insecte ravageur de culture polyphage qui créé d’importants dégats sur le continent américain. Depuis quelques années, elle est devenue invasive en Afrique et en Asie et pourrait bientot atteindre l’Europe. Pour mieux controler ce ravageur, de nouveaux moyens de lutte doivent être proposés aux agriculteurs. L’UMR DGIMI étudie les mécanismes d’interactions entre cette noctuelle, son cortège de pathogènes/parasites et sa plante hôte. Nous

essayons notamment d’identifier des facteurs clefs impliqués dans les défenses immunitaires des insectes ou dans leur adaptation à la plante. Le RNAi n’étant pas fonctionnel chez les lépidopteres, nous ne disposions pas jusqu’alors d’outils de validation fonctionnelle de gènes in vivo chez Spodoptera frugiperda. Dans ce poster, nous vous présentons la mise en

place de l’outil d’édition de génome CRISPR/Cas9 chez Spodoptera frugiperda. Nous avons généré deux lignées d’insectes portant chacune une mutation perte-de-fonction dans l’un des deux genes pro-phénoloxidase (Sf-PPO1 et Sf-PPO2).

L’activité de l’enzyme active issue du clivage de PPO, la phénoloxidase, est fortement diminuée dans l’hémolymphe des

deux lignées mutantes comparée à celle observée dans l’hémolymphe de larves sauvages. L’outil « CRISPR/Cas9 » est donc

fonctionnel chez Spodoptera frugiperda et les deux lignées obtenues vont maintenant nous permettre de mieux

caractériser le rôle de chacune des PPO dans l’interaction de cet insecte avec les différents pathogenes étudiés au sein de l’unité DGIMI.

Le projet ANR GANDALF (2013-2017) : un projet fédérateur pour le groupe « Champignons » du REID

E. Fournier, F. Delmotte et le consortium GANDALF

UMR BGPI Inra-CIRAD-Montpellier SupAgro, TA A 54/K, Campus International de Baillarguet, F34398

Montpellier cedex 5

elisabeth.fournier@inra.fr Les parasites évoluent rapidement pour surmonter les mécanismes de défense de l'hôte, mais les bases moléculaires de

ces adaptations restent mal comprises. Identifier les polymorphismes sous sélection dans les populations de pathogènes

permet de mieux comprendre les processus évolutifs sous-jacents à l'adaptation à la plante hôte. Chez les champignons,

les genes impliqués dans le contournement des défenses de l’hote peuvent déterminer qualitativement si un génotype de plante peut être infecté ou non (infectivité : sauts d’hotes et contournement des résistances majeures), ou déterminer quantitativement l’aptitude du pathogene à surmonter les défenses basales de l’hote (agressivité : érosion des résistances partielles).

Le collectif GANDALF a utilisé des approches de génomique des populations (sans connaissance préalable des gènes

impliqués dans l’adaptation) pour aborder ces questions chez des champignons phytopathogènes dans différents

contextes écologiques ou agronomiques. Neuf modèles ont été étudiés, couvrant un large éventail de modes de vie

(biotrophie vs nécrotrophie, champignons vrais vs oomycetes …). Suivant les modeles, différentes approches ont été utilisées (génomique comparative, cartographie QTL, GWAs, scans génomiques de régions sous sélection), et ont permis

des avancées majeures dans la connaissance des genes responsables de l’adaptation. Des résultats sur d’autres traits de vie, notamment la reproduction, ont aussi été obtenus. Le poster illustre trois résultats du projet : le contournement d’une résistance complete chez la septoriose du blé, le contournement d’une résistance partielle chez la maladie des raies noires

du bananier, et la mise en évidence du locus du type sexuel chez le mildiou de la vigne.

Impact of the Wolbachia endosymbiont on the AGH pathway in Armadillidium vulgare Herran B., Houdelet C., Debenest C., Delaunay C., Raimond M., Bertaux J., Grève P.

UMR-CNRS 7267 – EBI, Université de Poitiers, Bâtiment B8/B35, Rue Albert Turpain, TSA 51106, F-86073

POITIERS Cedex 9

benjamin.herran@univ-poitiers.fr Male sex differentiation in malacostracan crustaceans is determined by the presence of the Androgenic Gland Hormone

(AGH), a peptidic hormone of the insulin superfamily. In isopods, this hormone is only expressed in genetic males. In

populations infected by feminizing Wolbachia strains, when male embryos inherit the bacteria, the AGH is not expressed

during development and genetic males develop into fully functional females, leading to female-biased sex-ratios. The AGH

signalling pathway is thus a putative target of the bacteria but to this date, the mechanisms underlying this endocrine

disruption remain unknown. Although the AGH has been studied for decades, its first molecular partners have been

discovered and described only recently, in decapod crustaceans: a carrier called Insulin-like Growth Factor Binding Protein

(IGFBP) and the membrane receptors called Insulin-like Receptors (IRs). We identified the homolog proteins in isopods and characterized them in our model species: the common woodlouse (Armadillidium vulgare). We investigated in particular

their structure, their expression during development and their spatial expression in adults, comparing both sexes in

naturally Wolbachia-infected and uninfected lineages. Wolbachia transinfection and RNAi experiments allowed further

investigation of the AGH receptor implication in the feminization process.

Diversity of beta pore forming toxin family members in the interaction between the snail Biomphalaria glabrata and the trematode parasite Schistosoma mansoni LASSALLE Damien, GALINIER Richard, GOURBAL Benjamin & DUVAL David 58 Avenue Paul Alduy, Bat R F-66860 PERPIGNAN CEDEX, FRANCE

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damien.lassalle@univ-perp.fr Schistosomiasis is the second world human parasitic disease caused by a flatworm named Schistosoma mansoni. During its

life cycle, the parasite must pass through a vertebrate host and an invertebrate host. The invertebrate host is a

planorbidae named Biomphalaria glabrata. No vaccine was available and solely one chemotherapeutic treatment is

currently efficient in humans but cases of resistance have been observed recently. Thus a particular attention has been

paid to the snail intermediate host to identify no strategies for parasite control based on vector mediation approaches.

New therapeutic targets were potentially identified for molecules that can be involved in the interaction or killing of the parasite by the snail immune system. In this context, the pore forming toxins are widespread cytolytic protein that had

been recently described in eukaryotes. The mollusc Biomphalaria glabrata makes no exception. Indeed, since 2013 we

described the involvement of aerolysin like molecule in the snail host immunity. This protein had the ability to bind to the

parasite tegument and form trans-membrane pores, leading to parasite elimination. Since then, the genome of

Biomphalaria has been sequenced and new potential toxins have been identify. These new class of toxins belong to

Biomphalysins and epsilon toxins. Herein, we described these toxins and their potential role in the Biomphalaria glabrata

and Schistosoma mansoni interaction.

Snail-Trematodes interactions: how seasonal dynamics of parasite transmission are affected by water

management in a complex wetland network?

Clémentine Leroy, Antonio Vazquez Perera, Sylvie Hurtrez-Bousses, Marion Vittecoq

Tour du Valat (Le Sambuc, Arles, France) et UMR Mivegec (UM-IRD-CNRS ; Maladies Infectieuses et Vecteurs :

Ecologie, Génétique, Evolution, Controle), 911 Avenue Agropolis, BP 64501, 34394 Montpellier Cedex 5 clementine.leroy@etu.umontpellier.fr Food- and water-borne diseases are currently reemerging worldwide, mainly due to the intensification of human

disturbances including agricultural encroachment, wetlands deterioration and land use changes. Camargue (Southern

France) appears as an ideal area to study the factors affecting water-borne diseases reemergence as it is a biodiversity

hotspot which experiences all the above cited changes. Thus, we focused on this area to study the species of freshwater

mollusks (belonging to the Lymnaeidae family) acting as intermediate hosts in the transmission of two re-emerging

parasites: Fasciola hepatica and Calicophorom daubneyi, species of major medical and veterinary importance. More

specifically our goal is to understand freshwater mollusks species diversity, population dynamics, interactions with trematodes and the influence of several abiotic factors on both parasite transmission and mollusk distribution. Monthly

mollusk sampling in eight sites of different habitat types will be carried out for one year. Infection status of sampled snails

will be obtained by dissection followed by PCR diagnosis. The habitat characterization will be based on hydrological and

chemical approaches measuring several ecological parameters. Preliminary results show that Physa acuta is the most

abundant species and lymnaeids are able to colonize permanent and temporary habitats. However, lymnaeids seem to

suffer the highest variations in snail abundances probably related to harsh winter conditions. These variations may affect

circulation and transmission probability of F. hepatica and C. daunbneyi simultaneously in both definitive and intermediate

hosts. Our final aim is to propose cattle and water management measures to limit the impact of these trematodiasis in

Camargue.

Anti-α-Gal antibodies in dogs: Potential role in red meat allergy and protection against tick-borne pathogens

Lourdes Mateos-Hernández, Adnan Hodžić, Michael Leschnik, Pilar Alberdi, Ryan O. M. Rego, Jose de la Fuente, Alejandro Cabezas-Cruz, Georg Gerhard Duscher

UMR-BIPAR, INRA, ANSES, ENVA, Université Paris-Est

lmateoshernandez@hotmail.com Galα1-3Galβ1-(3)4GlcNAc-R (α-Gal) is a post-translational modification of glycoproteins that occurs only in mammals,

excluding Old Word monkeys, apes and humans. All animals lacking α-Gal can potentially produce high antibody (Ab) levels

against this carbohydrate, which is also expressed in major animal and human pathogens, like Borrelia spp., Plasmodium

spp., Trypanosoma spp. and Leishmania spp. It has been proposed that anti-α-Gal IgM and IgG Abs can protect against these

pathogens. In contrast, anti-α-Gal IgE Abs induced by tick bites produce red meat allergy in humans. Here, we report that

dogs, which can synthesize α-Gal and therefore are not expected to produce naturally anti-α-Gal Abs, after being bitten by

ticks can produce anti-α-Gal IgM and IgE. Anti-α-Gal IgM Abs were associated with protection against the tick-borne

pathogen Anaplasma phagocytophilum in dogs. Results suggest that while anti-α-Gal IgM Abs may protect dogs against tick-

borne pathogens, anti-α-Gal IgE may be associated with red meat allergy in dogs. This study highlights the complex regulation of anti-α-Gal immune response across animals.

Summer Abundance of Ixodes ricinus infesting lizards in Ain Kerma (El Tarf), Northeast Algeria

Noureddine Mechouk and zihad Bouslama

Université Badji Mokhtar, Laboratoire EcoSATq, Annaba, Algeria, 23200

noureddinemechouk@gmail.com We investigated the infestation of Ixodes ricinus on three lizards’ species (Psammodromus algirus algirus, Podarcis hispanica vaucheri and Timon pater) during summer 2018 in Ain El Karma (El Tarf), northeastern Algeria. A total of 150 ticks were

recovered, Psammodromus algirus algirus was the most prevalent (66.67%) while Timon pater was least preferred host

30

(10%). These preliminary results of parasitism of I. ricinus on lizards shows that all of ticks were on immature stage (Larvae

73,33% and Nymphs 26,67%).

Molecular evidence of bacteria in Melophagus ovinus sheep keds and Hippobosca equina forest flies

collected from sheep and horses in northeastern Algeria.

Mehdi Boucheikhchoukh, Noureddine Mechouk, Ahmed Benakhla, Didier Raoult, Philippe Parola.

Université Badji Mokhtar, Laboratoire EcoSATq, Annaba, Algeria, 23200

noureddinemechouk@gmail.com The sheep ked, Melophagus ovinus, and the forest fly, Hippobosca equina, are parasitic dipteran insects of veterinary

importance. As hematophagous insects, they might be considered as potential vectors of diseases which are transmissible

to humans and animals. The purpose of this study was to present initial primary data about these two species in Algeria. To

do so, we conducted a molecular survey to detect the presence of bacterial DNA in flies collected in Algeria. A total of 683

Melophagus ovinus and 29 Hippobosca equina were collected from two regions in northeastern Algeria. Monitoring the

monthly kinetics of M. ovinus infestations showed something resembling annual activity, with a high prevalence in January (21.67%) and May (20.94%). Real-time quantitative PCR assays showed that for 311 tested flies, 126 were positive for the

Bartonella spp. rRNA intergenic spacer gene and 77 were positive for Anaplasmataceae. The tested flies were negative for

all spotted fever group Rickettsia species, Borrelia spp., and C. burnetii. A random selection of positive samples was

submitted for sequencing. The DNA of Bartonella chomelii and Bartonella melophagi were detected in, respectively, five

and four H. equina, while all M. ovinus positive samples were infected by Bartonella melophagi. Amplification and

sequencing of the Anaplasma spp. 23S rRNA gene revealed that both species were infected by Wolbachia sp. which had

previously been detected in Cimex lectularius bed bugs. This study highlights the importance of parasitic flies in sheep and

equine farms and suggests that Hippoboscidae flies could play an important role in the transmission of Bartonella spp.

Multifaceted adaptations of vibrios to their molluscan host, the oyster Crassostreae gigas. Daniel Oyanedel-Trigo, Etienne Robino, Frédérique Le Roux, Maxime Bruto, Laura Chapelet, Philippe Haffner, Martine Caroff, Yannick Gueguen, Jérémie Vidal-Dupiol, Agnès Delmas, Hervé Cottet, Guillaume M. Charrière*

and Delphine Destoumieux-Garzón*

Place Eugène Bataillon, CC 80,34095 Montpellier Cedex 5

Daniel.Oyanedel@partenaire-exterieur.ifremer.fr The process of host colonization depends on a multiplicity of factors which are involved in a continuum of interactions

from mutualistic to pathogenic. Some populations of environmental vibrios associated to the oyster posses the ability to

avoid been cleared by the immune system of the host. From there, they invade different tissues generating damage or are

kept under control by the host and establish persistent interactions. As the oyster innate defense relies largely on

antimicrobials effectors [1], we hypothesized here that the resistance to these antimicrobials constitutes a signature

characteristic of vibrio populations positively associated to the oyster tissues. We phenotyped here the resistance of six

ecological populations of vibrios [2] against the oyster antimicrobial effectors. We found that resistance to antimicrobials constitutes a population-specific trait insufficient to discriminate vibrio populations positively associated to oysters. Next,

we used comparative genomics and experimental infection along with gene functional invalidation, to explore alternative

mechanisms by which vibrio populations positively associated to oysters colonize their host. While virulent strains of Vibrio splendidus rely on host damage and bacterial competition for successful colonization, a mildly virulent strain from the

same ecological population as suffered the loss of these virulence and competition effectors and the shrinking of its LPS

polysaccharide molecules. We suggest these adaptations towards virulence attenuation and surface remodeling can drive

of the emergence of commensal phenotypes in vibrios associated to oysters.

Analysis of the role of nitric oxide (NO) in the cross‐regulation between immunity, growth and iron homeostasis

in plants

Jordan Rossi, Agnès Klinguer, Sylvie Mazurier, Philippe Lemanceau, David Wendehenne and Angélique Besson-

Bard

UMR 1347 Agroécologie, AgroSup Dijon, CNRS, INRA, Univ. Bourgogne, Univ. Bourgogne Franche-Comté, F-

21000 Dijon, France

jordan.rossi@inra.fr Studies performed in our Agroecology Department show that the immune response of plants is linked to their iron nutrition

and is modulated by pyoverdine, a siderophore produced by the plant beneficial rhizobacteria Pseudomonas fluorescens

C7R12. Accordingly, Arabidopsis thaliana plantlets exposed to iron deficiency and treated with pyoverdine in its iron non‐chelated structure (apo‐pyo) show an enhanced growth but a decreased immune response capacity. We hypothesize that nitric oxide (NO), a universal signaling molecule, is a key component of the regulation of the immune response in plants

exposed to apo‐pyo and to the C7R12 strain. We checked by fluorescence microscopy that NO is actually produced in response

to iron deficiency in presence or in absence of apo-pyo. To verify a role of NO in these processes, three tasks will be developed:

‐ identification of S‐nitrosylated proteins in response to apo‐pyo and P. fluorescens C7R12. S-nitrosylation is a major NO‐dependent posttranslational protein modification which targets cysteine residues (Cys).

‐ analysis of the impact of NO on the structure and function of the selected proteins. The influence of NO on the structure and

31

function of the proteins will be investigated in vitro and the Cys residues regulated by NO will be identified by directed

mutagenesis.

‐ study of the incidence of the S‐nitrosylation of the proteins of interest in planta. A. thaliana plants impaired in the expression

of the proteins of interest or expressing them in a non‐nitrosylable structure will be generated and their interaction with

pathogenic or beneficial micro‐organisms will be analyzed.

Conséquences de l’échelle de la compétition sur le maintien de diversité : Evolution expérimentale du parasite

Tetranychus urticae sous hard versus soft selection

Marion Varoqui, Elsa Noël, Sophie Lefèvre, Sara Magalhães and Alison B. Duncan

ISEM, Université de Montpellier, France

marion.varoqui@etu.umontpellier.fr Nous ne savons toujours pas exactement pourquoi la diversité génétique est maintenue dans les populations et plus

particulièrement dans le contexte des interactions hôtes-parasites quand il y a une forte sélection entrainant l'émergence

de résistances. Il est possible que cela soit en parti du au fait que les populations de parasites soient spatialement structurées (intra et inter hôte). La structure des populations peut modifier l'échelle de compétition entre les différents individus ce qui

impacte directement cette transmission et ainsi la diversité génétique des populations. Les modèles de hard et soft selection

présentent deux extrêmes de structuration de population qui peuvent être transposés à différents cycles parasitaires, et

notamment si la compétition se passe au niveau intra ou inter hôtes. Avec la soft selection, la régulation de la densité se

passe avant la dispersion et chaque hôte infecté contribue également à la génération de parasite suivante, la compétition

ayant lieu au sein de chaque hôte, la variabilité génétique est maintenue. A l’inverse, sous hard sélection, la régulation de la densité, et donc la compétition, se fait globalement entre les hôtes ce qui sélectionne le parasite ayant la meilleure valeur

sélective à chaque génération et diminue la variabilité génétique. La hard et la soft selection impactent également la

proportion des individus qui sont apparentés, cela signifie que les impacts de la hard/soft selection et de l'apparenté peuvent

être confondues. Nous avons donc fait évoluer expérimentalement des individus échantillonnés de l'espèces Tetranychus urticae, un parasite acarien généraliste de plante, sous hard et soft selection, apparentés ou non pendant 33 générations

(chaque régime de sélection ayant été répliqué x3). La population apparenté évoluée sous soft selection à été perdue au

bout de 14 générations. Pour les autres, 15 marqueurs microsatellites on été utilisée pour étudier la diversité génétique et

la comparer entre les différents traitements. Pour cela je vais utiliser le FST et les G-statistiques afin d'évaluer la

différenciation des populations à partir du polymorphisme génétique. J'étudierais également le lien entre la diversité

génétique de chaque population et leurs virulences, mesuré grâce à la taille de la zone de la plante endommagée .

4IN: an Interactive database for Insect Innate Immunity

Carole VINCENT-MONEGAT1,3, Nicolas PARISOT1,3, Carlos VARGAS CHAVEZ1,2, Louis BERANGER1, Aymeric

BONNAMOUR1, Waël ZAMOUM1, Justin MAIRE1, Patrice BAA-PUYOULET1, Anna ZAIDMAN-REMY1, Amparo

LATORRE2 and Abdelaziz HEDDI1

1 Univ Lyon, INSA-Lyon, INRA, BF2I, UMR0203, F-69621, Villeurbanne, France. 2 Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva, Universitat de València, Spain. 3 Authors contributed equally to this work. carole.monegat@insa-lyon.fr In insects, the innate immune system, which consists of cellular and humoral responses, is the second line of defense, after

the cuticle physical barrier, against bacterial and fungal infections. These defense responses are activated by Pattern

Recognition Receptors (PRRs) that detect and bind to conserved microbial surface structures called Microbial-Associated

Molecular Patterns (MAMPs) including bacterial lipopolysaccharide (LPS) and peptidoglycans (PG). The humoral immune

response includes the production of AntiMicrobial Peptides (AMPs) that protect against a broad array of infectious agents,

such as bacteria, fungi, viruses and even eukaryotic parasites. Holometabolous insects, including Drosophila melanogaster

(Diptera), Anopheles gambiae (Diptera), and Tribolium castaneum (Coleoptera), are traditional models for genomic and

functional investigations of insect innate immunity. As many other insect genomes are available, and many more will be in

the future in the context of the i5K initiative, we decided to provide a comprehensive database of innate immunity genes in a

diverse range of available insect genomes. The 4IN database allows i) searching for a specific gene across insect species using

its gene name or gene ID, ii) listing genes by a specific immune pathway or iii) finding all immunity genes within a particular species. We also offer the opportunity for researchers to perform BLAST searches to identify similar genes within the database

for any nucleotide or protein query. To date, the 4IN database provides the innate immune genes for different insect species

and we focused on major annotated immune pathways from the microbial recognition, to humoral response pathways and

the immune effectors.