PLATAFORMA DIAGNOSTICA 1DENTIFY: Red diagnóstica para la determinación de las mutaciones del Receptor del Factor de Crecimiento Epidérmico (EGFR) en pacientes con cáncer de pulmón no microcítico avanzado (CPNMa)

García Foncillas, J1; Ponce, S2; Cobo, M3; Camps, C4; Vicente, D5; Abdulkader, I6; Rojo, F1; Gomez Román, J7; Molina, MA8; Palacios, J9

1Fundación Jimenez Díaz (Madrid); 2Hospital Doce de Octubre (Madrid); 3Hospital Regional Universitario Carlos Haya (Málaga); 4Hospital General Universitario de Valencia; 5Hospital Universitario Virgen Macarena (Sevilla); 6Complejo Hospitalario Universitario de Santiago; 7Hospital Universitario Marqués de Valdecilla (Santander); 8Pangaea Biotech (Barcelona); 9Hospital Universitario Ramón y Cajal

• La presencia de mutaciones del EGFR en pacientes con CPNMa se considera el mejor predictor de respuesta a inhibidores especificos de la actividad tirosina kinasa (TKIs) del EGFR y su determinación ha pasado a ser parte de la práctica clínica habitual en estos pacientes.

• En el año 2010 se puso en marcha la plataforma diagnóstica 1DENTIFY (http://www.identify-egfr.es) para facilitar la determinación de las mutaciones del EGFR en España de una forma estandarizada y homogénea. Más de 30, todos laboratorios adheridos al programa internacional de calidad EMQN, han dado servicio a unos 200 hospitales.

Material y métodos

• Las determinaciones de mutaciones del EGFR se realizaban esencialmente dentro de entornos de investigación

• Los tiempos de respuesta del resultado excedían los requeridos para una decisión de tratamiento adecuada (> 15 días)

• Había una creciente necesidad de incorporar la determinación de mutaciones como parte de la práctica clínica

Infraestructura inadecuada

o insuficiente

Escasez de recursos

Grados dispares de conocimiento

A menos que se generara un cambio significativo en el mapa de diagnóstico, éste no sería capaz de satisfacer las crecientes demandas

de la práctica clínica

Hasta 2010 en España, menos del 18% de los pacientes eran analizados para

conocer su estado mutacional

Plataforma diagnóstica: Contexto

Petición Recepción de la petición

Determinación de la muestra

Reporte de resultados

Muestra

Resultado

Oncólogo Patólogo CRO Laboratorio

Compromiso Tiempo de procesamiento: 7 días laborables Media Tiempo de procesamiento: 4.69 días laborables

Oncólogo/ Patólogo

Centro de Servicio

Flujo de muestras

CENTROS IN-HOUSE

CENTROS DE SERVICIO

Red de centros de la plataforma

Nacionales

Regionales

Desde abril de 2010 hasta octubre de 2014 se han enviado 26114 muestras

250 hospitales activos en la plataforma

Tiempo en obtener el resultado: - - - 4,69 días de media

- El 55.12% en 4 o menos días.

26114 muestras enviadas desde Marzo de 2010

Resultados generales de la plataforma 1DENTIFY

72%

28% 30% 35%

16% 19%

69%

1% 7%

14% 8%

0% 0%

10%

20%

30%

40%

50%

60%

70%

80%

España n= 25627

Características clinicopatológicas de los pacientes y de las muestras enviadas

Población parcialmente seleccionada sobre todo por criterios

histológicos.

Técnicas utilizadas

Técnica utilizada N=25627 (%)

Therascreen 14283 (55,73%)

Cobas 4385 (17,11%)

Analisis de fragmentos y 5' nuclease PCR assay 2558 (9,98%)

Secuenciación directa 843 (3.29%)

No especificado 3558 (13,87%)

Tipo de muestra N= 25627 %

Biopsia 12755 72,42*

Citología 4858 27,58*

Dato no disponible 8009

Tipos de muestras histológicas

*Porcentajes calculados frente a las 17613 muestras con dato

Resultados de la determinación del EGFR

TOTAL

% SOBRE EL

TEST

REALIZADO

% SOBRE

MUESTRAS

VALORABLES

Test realizado 25569

Muestras Valorables 24352 96.08 %

Muestras no

valorables 993 3.92 %

Sin dato 224

Mutación positiva 3082 12,66

Menos de un 4% de las muestras a las que se les ha realizado el test son NO VALORABLES.

La tasa de mutaciones en España dentro de 1DENTIFY es del 12,66%

Mutación positiva 12,66%

Mutación negativa 87,34%

n = 24352

Exones Resultado del

estudio

M+ n = 3032

%M+ vs Valorables n =

24352

Exón 18 178 0,74

G719A 21 0,09

G719C 2 0,01

G719S 5 0,02

G719X 150 0,61

Exón 19 1570 6,45

747-753 3 0,01

747_750P 6 0,02

748-751 1 0,01

A750-759 2 0,01

DELECIÓN EXON 19 1424 5,84

E746_A750>AP 4 0.02

E746-S752insV 7 0,03

E746-T751 12 0,05

E746-T751insA 2 0,01

E746-T751insI 3 0,01

E746_T751insVP 1 0,01

L747-A750insP 6 0,02

L747-E749 4 0,02

L747-P753insS 6 0,02

L747-S752 4 0,02

L747-T751insP 2 0,01

Exones Resultado del

estudio

M+ n = 3032

%M+ vs Valorables n = 24352

L747_T751 2 0,01

L747_T751lnsA 2 0,01

L757-A750insP 2 0,01

Mutacion puntual 1744M 1 0,01

p.E746_A750del 73 0,3

p.L747_A751>P 1 0,01

S752_1759 1 0,01

Exón 20 276 1,13

INSERCIÓN EXON 20 139 0,57

K806N 1 0,01

S768I 69 0,28

S768Q 1 0,01

T790M 65 0,26

V769_D770insASV 1 0.01

Exón 21 1008 4,13

G861Q 1 0,01

L833F 2 0,01

L858Q 6 0,02

L858R 906 3,72

L861Q 93 0,38

L861R 1 0.01

Total general 3082 12,66

• La distribución de las

mutaciones es la habitual,

encontrándose la mayor parte

de las mutaciones en los

exones 19 y 21.

• El 29,88% de ellas

corresponden a la mutación

puntual L858R.

Resultados de la determinación

n = 3082

Exón 18 5,77%

Exón19 50,94%

Exón 20 8,95%

Exón 21 32,71%

No Data 1,62%

Mutaciones Dobles Mutaciones dobles n = 93

G719X + Ins20 3 L858R + T790M 23

G719X + Ins20 18 L858R + Del 19 3

G719X + Ins20 1 L858R + S768I 6

G719X + Ins20 2 Ins 20 + T790M 2

G719X + Ins20 1 S768I + T790M 1

G719X + Ins20 1

Del 19 + T790M 26

Del 19 + Ins 20 3

Del 19 + S768I 3

Las características clínicas

que se correlacionan con

mayor tasa de mutaciones son:

• No fumador (34,53%)

• Mujer (26.02%)

• Adenocarcinoma (14,60%).

Alrededor del 4,5% de

tumores escamosos

presentan mutaciones en el

EGFR.

Porcentaje de mutación en función de las

características clínicas

6,50%

26,02%

5,31% 7,98%

34,53%

10,59%

14,60%

10,43% 8,31%

4,42% 7,91%

3,64%

0%

5%

10%

15%

20%

25%

30%

35%

40%

NACIONAL Muestras valorables

M+

% M+

Hombre / No fumador / Carcinoma escamoso 137 13 9,49

Hombre / No fumador / Adenocarcinoma 802 206 25,69

Hombre / No fumador / Carcinoma de células grandes 69 16 23,19

Hombre / Exfumador / Carcinoma escamoso 1380 53 3,84

Hombre / Exfumador / Adenocarcinoma 4572 379 8,29

Hombre / Exfumador / Carcinoma de células grandes 508 24 4,72

Hombre / Fumador / Carcinoma escamoso 1026 30 2,97

Hombre / Fumador / Adenocarcinoma 3758 183 4,87

Hombre / Fumador / Carcinoma de células grandes 403 18 4,47

Hombre / Desconocido / Carcinoma escamoso 536 17 3,17

Hombre / Desconocido / Adenocarcinoma 1989 138 6,94

Hombre / Desconocido / Carcinoma de células grandes 277 7 2,53

Mujer / No fumador / Carcinoma escamoso 149 28 18,79

Mujer / No fumador / Adenocarcinoma 2308 1039 45,02

Mujer / No fumador / Carcinoma de células grandes 126 51 40,48

Mujer / Exfumador / Carcinoma escamoso 91 6 6,59

Mujer / Exfumador / Adenocarcinoma 920 179 19,46

Mujer / Exfumador / Carcinoma de células grandes 88 14 15,91

Mujer / Fumador / Carcinoma escamoso 131 3 2,29

Mujer / Fumador / Adenocarcinoma 1153 135 11,71

Mujer / Fumador / Carcinoma de células grandes 119 6 5,04

Mujer / Desconocido / Carcinoma escamoso 85 10 11,76

Mujer / Desconocido / Adenocarcinoma 911 264 28,98

Mujer / Desconocido / Carcinoma de células grandes 77 9 11,69

Incluso pacientes con

características “desfavorables”

como ser hombres, fumadores y

con carcinoma escamoso tendrían

mutaciones en el 2.97%.

Combinando varias

características clínicas “favorables”

se pueden alcanzar tasas de

mutaciones del 45%.

Porcentaje de mutación en función de las características clínicas

2010-2011 2012 2013 2014

Muestras enviadas 9259 6444 5562 4205

Muestras valorables 8888 6176 5271 3918

Mutación positiva 1288 712 592 476

Tasa de mutación 14,49 11,53 11,23 12,15

Tasa de EGFR M+ a lo largo del tiempo

14,49

11,53 11,23 12,15

0

2

4

6

8

10

12

14

16

2010-2011 2012 2013 2014

Tasa de mutacion

Tasa de mutación en función de la técnica utilizada Técnica utilizada

Tipo de muestra Estatus del EGFR N=25627

(%) Tasa de mutación Therascreen 14283

(55,73%) No valorables 452 Valorables 13829

EGFR M+ 1542 11,15% EGFRM- 12287

Sin dato 2 Cobas 4385

(25,63%) No valorables 160 Valorables 4225

EGFR M+ 436 10,32% EGFRM- 3789

Analisis de fragmentos y 5' nuclease PCR assay

2558 (9,98%)

No valorables 238 Valorables 2278

EGFR M+ 315 13,83% EGFRM- 1963

Sin dato 42 Secuenciación directa 843

(3.29%) No valorables 25 Valorables 818

EGFR M+ 154 18,83% EGFRM- 664

No especificado 3558 (13,87%)

Muestras en Sangre

Tasa de EGFR M+: 12.17%

401 muestras enviadas

Pendientes de resultado 6

Sin dato 8

No valorables 9

Mutación positiva 46

Mutación negativa 332

Alrededor del 2,5% de muestras no valorables

Mutación positiva 12,17%

Mutación negativa 87,83%

n = 378

Características de las muestras de sangre enviadas

Población más seleccionada que en las muestras de tejido

59%

41%

19%

46%

33%

2%

74%

1% 5% 4%

11% 4%

0%

10%

20%

30%

40%

50%

60%

70%

80%

España n= 401

Conclusiones

• La plataforma 1DENTIFY ha facilitado la posibilidad de realizar las mutaciones de EGFR a pacientes con CPNM diagnosticados a lo largo de todo el territorio español.

• Las muestras enviadas están parcialmente seleccionadas sobre todo por criterios histológicos

• Más de un 70% de las muestras fueron de biopsia.

• La mayoría de las determinaciones se realizó con técnicas basadas en PCR en tiempo real

• La rapidez en la comunicación de los resultados permite la toma de decisiones terapéuticas en un tiempo adecuado

• La tasa de mutación y la distribución de las mutaciones es consistente con otras series publicadas recientemente en otros países.

• La realización de la mutación del EGFR en sangre permite saber el estatus del EGFR en aquellos pacientes que no tienen muestra de tejido disponible.