mutaciones en el promotor de tert en melanoma: …...2017/02/01 · • las mutaciones en el...
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Mutaciones en el promotor de TERT en melanoma:
valor clínicoEduardo Nagore
Instituto Valenciano de OncologíaValencia
Promotor de TERT
• El gen TERT está localizado en 5p15.33 y está formado por 16 exones y 15 intrones.
• La región del promotor de TERT se considera el elemento regulador más importante de la expresión de TERT y de la actividad de la telomerasa.– Core:
• 260 pares de bases.• Varias áreas de unión para factores reguladores
de la transcripción del gen.– Ets (pueden ser estimulados por oncogenes: EGF,
Her2/Neu, Ras y Raf).
803
804
802 801
767
766
772
778
763
782
764
779
765
755
756 757
758
759 760 761
762
773
769 768
770
776
777
774775
780
753812
852
781
754
Index
Age onsetAge death
DNA sample
3031
****
*
L
LL
L L
L L
L
L
LL L L
L
L##2050
42
3232
3940
36unk
3031
4242
28
4649
3049
1819
2020
2731
unk
772
TERT mutation -57bp T>G
*
Linkage analysis
L
High throughput sequencing
No se encontró en 34 familias CDKN2A negativas
Familia sin mutaciones en CDKN2A, CDK4 ni alteraciones
en MC1R
5´ GAGTTTCAGGCAGC 3´ 3´ CTCAAAGTCCGTCG 5´
TERTTERT Promoter
- 57bp A>C (T>G) mutation
Ets/TCF Binding
Aumento de la transcripción
Science. 2013 Feb 22:339(6122):959-61
5´ GAGTTTCCGGCAGC 3´
TERTTERT Promoter
3´ CTCAAAGGCCGTCG 5´
Promotor de TERT: efecto de la mutación
Pacientes y métodos
• Se seleccionaron 287 pacientes de los cuales había ADN en el Biobanco del IVO. – 213 pacientes con melanoma en Estadio I y
II– 74 con melanoma en Estadio III– 4 en Estadio IV
• Obtención de ADN: a partir de muestras con >70% de tumor.
• Datos clínicos, epidemiológicos y patológicos obtenidos de la base de datos del IVO.
• Detección de mutaciones por secuenciación directa (Sanger): BRAF, NRAS, promotor de TERT.
Resultados• Mutaciones en promotor de TERT:
37.9%Posicióna
Númerob
% Efectoc
-146C>T 51d
46.8 Ets/TCF
-124C>T 34e
31.2 Ets/TCF
-124C>A 1
0.92 Ets/TCF
-124_125CC>TT 4f
3.7 Ets/TCF
-138_139CC>TT 7
6.4 Ets/TCF
-57A>C 3
2.8 Ets/TCF
Otrasg 8
7.3
-46C>T BRCA1
-58C>T ELK1 or APh
-144C>T PLAG1
-154C>T -
-156C>T Ets/TCF
-176C>T E2F1
-187C>T BRCA1
-242C>T SP1
Mutaciones en el promotor de TERT
BRAF (n = 287)
OR 2.5; 95% CI 1.53 - 4.14; P = 0.0003
NRAS (n = 274)
OR 2.6; 95% CI 1.03 - 6.62; P = 0.04
CDKN2A (n = 60)
OR 3.65; 95% CI 0.96 - 13.90; P = 0.06
Melanocito MetástasisNevus común
Nevus displásico
MM fase radial MM fase vertical MM metastásic
o
37.9%
36.2%
7.3%
Característica
N(n=287)
TERT wildtype
TERT mutation
Odds ratio
95% CI
P
Edad al diagnóstico
< 45 70 48 22 1.00 Ref.
46 - 65 119 80 39
1.06
0.56 -
2.00 0.85
> 66 98 50 48 2.10
1.10 -
3.98 0.02
Lentigos solares en el área del melanoma
no 159
109 50
1.00 Ref.
sí 118 64 54
1.84
1.12 -
3.01 0.02
Patrón de exposición solar del área del melanoma
Raramente expuesto 52 42 10
1.00 Ref.
Habitualmente expuesto
195
118 77
2.74
1.30 -
5.78 0.008
Infrecuentemente expuesto 35 17 18
4.44
1.70 -
11.5 0.002
Tipo histológico
MES158
103 55
1.00 Ref.
MN 76 34 422.31
1.3 - 4.0
0.03
MLA 24 23 1LMM 13 10 3
Fase de crecimiento
radial 39 33 6 1.00 Ref.
vertical 186
108 78
3.97
1.60 -
9.94 0.003
Breslow [mm]
</= 1.00102 77 25
1.00 Ref.
1 .01 – 2.00 58 35 23
2.0
1.0 - 4.0
0.05
2.01 – 4.00 51 26 25
2.9
1.5 - 6.0
0.003
> 4.00 60 29 313.3
1.7 - 6.5
0.0006
Ulceración
no 194
133 61
1.00 Ref.
sí 86 43 43 2.18
1.30 -
3.67 0.003
Estadio
in situ 12 11 1 1.00
Ref. Localizado
191
124 67
Enfermedad locorregional 74 38 36
1.90
1.17 -
3.38
0.012
Metástasis a distancia 4 1 3
Análisis multivariadoOR 95%
CIP
Edad
< 651.00 Ref.
> 651.97
1.03 - 3.79
0.04
Exposición solar del area del MM
Rara/ausente1.00 Ref.
Intermitente
3.01
1.07 - 8.46
0.05
Crónica4.94
1.34 - 18.2
Tipo histológico
MES1.00 Ref.
LMM0.38
0.08 - 1.86
0.04MN
0.86
0.38 - 1.96
MLA0.04
0.004 - 0.42
Breslow, mm
< 2.001.00 Ref.
> 2.002.83
1.24 - 6.43
0.01
Presencia de ulceración
No1.00 Ref.
Sí2.34
1.04 - 5.26
0.04
BRAF mutado
No1.00 Ref.
Sí2.35
1.27 - 4.33
0.006
• Las mutaciones en el promotor de TERT son eventos tardíos
Nevus común
Nevus displásico
melanoma(different stages)
melanocito normal
92 nevi
Secuenciación de 520 muestras de melanoma
Estudio de mutaciones en nevus melanocíticos
Conclusiones
1. Las mutaciones en el promotor de TERT son tan frecuentes como las mutaciones en BRAF en melanomas cutáneos.
2. Se encuentran significativamente asociadas a otras mutaciones, sobre todo a las encontradas en BRAF y alteraciones en CDKN2A
3. Parecen ser un evento tardío y estar relacionadas con el daño directo producido por la radiación ultravioleta.
Velocidad de crecimiento
Espesor tumoral/índice de crecimiento tumoral (meses).
• Índice de crecimiento temporal: D2 (fecha de exéresis) – D1. Donde D1 es:– Fecha en la que los pacientes perciben un
aumento de la elevación del tumor (crecimiento vertical o volumétrico) o, si no hay tal crecimiento:
– Fecha en la que los pacientes percibieron algún cambio en una lesión previamente estable o una lesión nueva en crecimiento desde el inicio.
• GR: mm/mes
Welch and Black, J Natl Cancer Inst 2010
Grob et al, Int J Cancer 2002
Melanomas de rápido crecimiento(>0.5 mm/mes)
+/-20%
• Since January 2000: 1141 incident melanomas.
• Since January 2003: 418 of 543 stage I/II primary melanoma patients with available data for GR calculation.
• Median follow-up: 38 months.
Variables that were included in multivariate analyses: age, sex, Breslow thickness (continuous or AJCC categories), site and mitotic rate.
Multivariate analyses
Estudio de la relación entre la velocidad de crecimiento y las mutaciones en el promotor
de TERT
• 339 casos.• Criterios de selección:
– Melanoma cutáneo– Estudiados para la presencia de
mutaciones en el promotor de TERT, BRAF, NRAS, y del polimorfismo rs2853669 en el promotor de TERT.
– Con información adecuada para el cálculo de la velocidad de crecimiento.
GR≥0.5 mm/mes(n=126)
GR<0.5 mm/mes(n=213)
Características
N % N (%) P
Edad (años) ≤50 51-65 >65
363555
28.627.843.7
856563
39.930.529.6
0.023
Sexo Mujer Hombre
5571
43.756.3
109104
51.248.8
0.180
Localización del MM Axial Extremidades
7749
61.138.9
97116
45.554.5
0.006
Tipo histológico LMM MES MN MLA Otros/sin especifcar
5337585
4.026.259.56.34.0
914232219
4.266.715.09.94.2
<0.001
Breslow ≤2 mm >2 mm
19107
15.184.9
16746
78.421.6
<0.001
Ulceración (v.p.=1) No Sí
4878
38.161.9
17240
81.118.9
<0.001
Índice mitósico (v.p.=13) ≤2 mit/mm2
>2 mit/mm2
2594
21.079.0
14760
71.029.0
<0.001
BRAF status (v.p.=13) WT Mutado
6655
54.545.5
12976
62.937.1
0.136
NRAS status (v.p.=13) WT Mutado
10415
87.412.6
19116
92.37.7
0.149
TERT promoter status WT Mutado
4977
38.961.1
14469
67.632.4
<0.001
rs2853669 (TERT promoter) No portador (TT) Portador (TC+CC)
8144
64.835.2
12487
58.841.2
0.273
GR: tasa de crecimiento. WT: wild type. v.p.: valores perdidos.
GR≥0.5 mm/mes(n=126)
GR<0.5 mm/mes(n=213)
Características
N % N (%) P
Edad (años) ≤50 51-65 >65
363555
28.627.843.7
856563
39.930.529.6
0.023
Sexo Mujer Hombre
5571
43.756.3
109104
51.248.8
0.180
Localización del MM Axial Extremidades
7749
61.138.9
97116
45.554.5
0.006
Tipo histológico LMM MES MN MLA Otros/sin especifcar
5337585
4.026.259.56.34.0
914232219
4.266.715.09.94.2
<0.001
Breslow ≤2 mm >2 mm
19107
15.184.9
16746
78.421.6
<0.001
Ulceración (v.p.=1) No Sí
4878
38.161.9
17240
81.118.9
<0.001
Índice mitósico (v.p.=13) ≤2 mit/mm2
>2 mit/mm2
2594
21.079.0
14760
71.029.0
<0.001
BRAF status (v.p.=13) WT Mutado
6655
54.545.5
12976
62.937.1
0.136
NRAS status (v.p.=13) WT Mutado
10415
87.412.6
19116
92.37.7
0.149
TERT promoter status WT Mutado
4977
38.961.1
14469
67.632.4
<0.001
rs2853669 (TERT promoter) No portador (TT) Portador (TC+CC)
8144
64.835.2
12487
58.841.2
0.273
GR: tasa de crecimiento. WT: wild type. v.p.: valores perdidos.
Factores relacionados con melanomas de rápido crecimiento
Univariado
Multivariado
OR
OR 95%
CI
OR
OR 95%
CI
Edad (años)
≤50 51-65 >65
Ref.
1.27
2.06
Ref.
0.72-2.24
1.21-3.51
- -
Localización del melanoma axial
1.88
1.20-2.94
- -
Tipo histológico nodular
8.32
4.96-13.96
3.00
1.57-5.71
Espesor tumoral (>2 mm vs. ≤2 mm)
20.45
11.37-36.77
12.34
6.44-23.63
Ulceración (presence vs. ausencia)
6.99
4.25-11.49
- -
Índice mitósico (>2 mit/mm2 vs. ≤2 mit/mm2
)
9.21
5.40-15.71
- -
Mutación en el promotor de TERT
3.28
2.07-5.19
3.09
1.69-5.67
Relación entre las mutaciones en el promotor de TERT y los melanomas de crecimiento rápido (>0.5
mm/mes) en 339 casos
Factores relacionados con melanomas de rápido crecimiento
Univariado
Multivariado
OR
OR 95%
CI
OR
OR 95%
CI
Edad (años)
≤50 51-65 >65
Ref.
1.27
2.06
Ref.
0.72-2.24
1.21-3.51
- -
Localización del melanoma axial
1.88
1.20-2.94
- -
Tipo histológico nodular
8.32
4.96-13.96
3.00
1.57-5.71
Espesor tumoral (>2 mm vs. ≤2 mm)
20.45
11.37-36.77
12.34
6.44-23.63
Ulceración (presence vs. ausencia)
6.99
4.25-11.49
- -
Índice mitósico (>2 mit/mm2 vs. ≤2 mit/mm2
)
9.21
5.40-15.71
- -
Mutación en el promotor de TERT
3.28
2.07-5.19
3.09
1.69-5.67
Modificación de la relación entre las mutaciones en el promotor de TERT por el polimorfismo rs2853669
en el propio promotor
rs2853669
TERT
promoter status
Total
GR
<0.5
mm/mes
GR
>/=0.5
mm/mes
OR (95%
CI)
No portador (TT)
wt
N (%)
118
88 (74.6)
30 (25.4)
Ref.
mut
N (%)
87
36 (41.4)
51 (58.6)
4.16 (2.29-7.53)
Portador (TC+CC)
wt
N (%)
73
54 (74.0)
19 (26.0)
Ref.
mut
N (%)
58
33 (56.9)
25 (43.1)
2.15 (1.03-4.50)
Total
wt
N (%)
191
142 (74.3)
49 (25.7)
Ref.
mut
N (%)
145
69 (47.6)
76 (52.4)
3.28 (2.07-5.19)
Mut: mutado. Wt: wild type (consenso).
Conclusiones
• Las mutaciones en el promotor de TERT confieren una mayor agresividad al melanoma expresado en una tasa de crecimiento más elevada.
• Su efecto se ve significativamente modificado por la presencia de un polimorfismo frecuente en el mismo promotor.
Impacto en la supervivencia libre de enfermedad en 300 pacientes con MM localizado (estadios I/II).
Combinación con mutaciones en BRAF/NRAS
Impacto en la supervivencia específica por melanoma en 300 pacientes con MM localizado
(estadios I/II)
Impacto en la supervivencia específica por melanoma en 300 pacientes con MM localizado (estadios I/II). Combinación con mutaciones en
BRAF/NRAS
Conclusiones
• Las mutaciones en el promotor de TERT confieren un peor pronóstico, especialmente si además coexisten con mutaciones en BRAF/NRAS.
• Su efecto se ve modificado por la presencia de un polimorfismo frecuente en la población con una repercusión funcional demostrada.
Conclusiones finales
• De confirmarse nuestros resultados en más series, las mutaciones en el promotor de TERT deberían considerarse de forma rutinaria para la selección de pacientes de alto riesgo susceptibles de tratamientos adyuvante.
• Los nuevos fármacos en desarrollo que actúan disminuyendo la actividad de TERT deberían considerarse tanto en adyuvancia como en enfermedad avanzada en los pacientes con melanoma.