MARCADORES GENÉTICOS

MARCADORES GENÉTICOS

La diferencia entre individuos se denotaba señalando diferencias en su aspecto externo (fenotipo)

Carácter Informativo Variación

POLIMORFISMO

Marcadores Morfológicos

Marcadores Morfológicos

Genes asociados a caracteres fenotípicos, fáciles de identificar

visualmente.

Número limitado

Poco informativos

Herencia compleja (herencia dominante/recesiva,

multigénicos,etc.)

Ambiguos y subjetivos

Grupos sanguíneos

Inmunoglobulinas

Isoenzimas (enzimas con la misma función pero con distinto tamaño, carga o

conformación)

Marcadores Bioquímicos

Los marcadores bioquímicos se basan en la observación del polimorfismo en la

secuencia de aminoácidos de una proteína.

EL NIVEL DE OBSERVACIÓN ES EL FENOTÍPICO (TIPIFICAN

PROTEÍNAS).

ANALIZAN SÓLO LAS SECUENCIAS CODIFICANTES DE LOCI

ESTRUCTURALES, QUE CORRESPONDEN APROXIMADAMENTE AL

5% DEL GENOMA.

LA FUNCIONALIDAD DE LAS PROTEÍNAS LIMITA EL GRADO DE

POLIMORFISMO.

LAS MUESTRAS TIENEN QUE SER FRESCAS YA QUE LAS

PROTEÍNAS SE DETERIORAN CON FACILIDAD.

Marcadores Bioquímicos

DESVENTAJAS:

NO SE EXPRESAN EN TODOS LOS TEJIDOS.

NO SE EXPRESAN EN TODAS LA EDADES.

INFLUENCIADOS POR EL AMBIENTE.

POCO POLIMÓRFICOS.

BAJA REPRESENTACIÓN EN EL GENOMA

Marcadores Bioquímicos

Métodos de detección de polimorfismos directamente a nivel de ADN

Marcadores Genéticos

MARCADOR MOLECULAR ES UN SEGMENTO DE ADN

CON UNA UBICACIÓN FÍSICA IDENTIFICABLE Y CUYA HERENCIA

GENÉTICA SE PUEDE RASTREAR

Un marcador puede ser un gen o puede ser alguna sección del ADN sin

función conocida.

Características de los Marcadores Genéticos

Estar presentes en el individuo en el momento del nacimiento

Poseer herencia mendeliana sencilla. Codominante

Estar distribuidos por todo en genoma

Ser informativos o sea POLIMORFICOS

La metodología empleada debe ser repetible, automatizable y estandarizable

Marcadores Genéticos

MARCADORES BIOQUÍMICOS MARCADORES GENÉTICOS

Solo muestras frescas Muestras frescas, congeladas o conservadas en alcohol, parafina, etc.

Solo muestras de sangre Cualquier clase de tejidos: pelo, músculo, hueso, semen dientes, etc.

Número limitado de marcadores Número Ilimitado de marcadores

Moderado grado de información Alto grado de información

Según la región de ADN de la que formen parte pueden tener distintos modos de

Herencia

Marcadores Genéticos

Tipos de Marcadores Genéticos

SNP (o Single nucleotide polymorphism)

RFLP (o Polimorfismo en la longitud de fragmentos de restricción)

Microsatélites o STR

RAPD (o Random amplification of polymorphic DNA)

VNTR (o Número variable de repeticiones en tándem)

Muestra biológica Extracción de ADN

Amplificación por

PCR Diferentes métodos de análisis

A

216.1

B

218.0

C

220.2

D

222.2

224

224.1

F

226.1

G

228.2

H

230.1

232

232.1

234

233.9

K

236.0

L

238.0

M

240.1

N

242.1

244

243.9

P

246.3

Q

248.3

H01 081118_M176_STRB_STRO_BTA5Run01 HeM 92002

0

1000

2000

3000

4000

DIK5108

Métodos de estudio de Marcadores Genéticos

¿Cómo determino el Genotipo de una muestra?

PCR-RFLP

PCR-Alelo especifica

PCR-Secuenciación

PCR-Microsatélites o Minisatelites

PCR-RAPD s

Amplificación por PCR

Análisis por distintos métodos

Determinación del genotipo

Variantes de PCR

Polimorfismos de Nucleótido Simple

SNPs

Es una variación en la

secuencia de ADN que afecta

a una sola base (adenina (A),

timina (T), citosina (C) o

guanina (G)) de una secuencia

del genoma.

GTCCGATCC GTCCAATCC

Estas variaciones deben darse al menos en un 1% de la población para ser

consideradas como un SNP.

Polimorfismos de Nucleótido Simple

SNPs

Homocigota GG Homocigota AA Heterocigota GA

Genotipificación de SNPs

Grupo en estudio

PCR-RFLP

(Polimorfismos de longitud de los fragmentos de restricción)

Digestión con enzima de restricción BSTN I 5’…CCWGG…3’

3’…GGWCC…5’

Primer reverse

Primer forward

5’

3’

3’

5’

PCR

Homocigota AA

Heterocigota AG Homocigota GG

Microsatélite o STR (short tándem repeat)

A

216.1

B

218.0

C

220.2

D

222.2

224

224.1

F

226.1

G

228.2

H

230.1

232

232.1

234

233.9

K

236.0

L

238.0

M

240.1

N

242.1

244

243.9

P

246.3

Q

248.3

H01 081118_M176_STRB_STRO_BTA5Run01 HeM 92002

0

1000

2000

3000

4000

DIK5108

Fragmentos obtenidos por amplificación (PCR) al azar del ADN

genómico

No se conoce la ubicación genómica de las bandas

Utilidad en organismos de genoma desconocido: sondeo de variabilidad

RAPDs (Random Amplified Polymorphic DNA)

Utilidades de los Marcadores genéticos

Identificación individual

Identificación de patógenos

Caracterización de

especies

Análisis de filogenias

Genética forense

(paternidad, identidad)

Conservación de biodiversidad

genética

detección de

enfermedades genéticas

Sexado

embrionario

Adulteración de alimentos

Marcadores

Genéticos

A

216.1

B

218.0

C

220.2

D

222.2

224

224.1

F

226.1

G

228.2

H

230.1

232

232.1

234

233.9

K

236.0

L

238.0

M

240.1

N

242.1

244

243.9

P

246.3

Q

248.3

H01 081118_M176_STRB_STRO_BTA5Run01 HeM 92002

0

1000

2000

3000

4000

DIK5108A

216.1

B

218.0

C

220.2

D

222.2

224

224.1

F

226.1

G

228.2

H

230.1

232

232.1

234

233.9

K

236.0

L

238.0

M

240.1

N

242.1

244

243.9

P

246.3

Q

248.3

D01 081127_M179_STRO_BTA5Run01 HeM X71

0

1000

2000

3000

DIK5108