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Unidad 1 Introduccion Biotecnología Ingeniería Bioquímica Ingeniería de Bioprocesos Ingeniería Genética Reactores Bioquímicos Fermentaciones Reacciones enzimáticas Ingeniería Ambiental Alimentos Producción microbiana Productos microbianos 1.1.- CONCEPTOS Sustrato Microorganismos Enzimas Productos + Ing. Procesos (células, productos celulares)

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Page 1: Ingeniería Genética - dungun.ufro.cldungun.ufro.cl/~CyT/Reactores/descargables/Bioreactores1.pdf · Así entran iones como el Na+, K+, Ca2+, Cl-. Las proteínas de canal son proteínas

Unidad 1 Introduccion

Biotecnología

Ingeniería Bioquímica

Ingeniería de Bioprocesos

Ingeniería Genética

Reactores BioquímicosFermentaciones

Reacciones enzimáticas

Ingeniería Ambiental

Alimentos

Producción microbiana

Productos microbianos

1.1.- CONCEPTOS

SustratoMicroorganismos

Enzimas Productos+ Ing. Procesos

(células, productos celulares)

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1.2.- ALGO DE HISTORIA.....

VINOCERVEZAVINAGREQUESO

PANPEPINILLOS

CECINAS

PENICILINAFERMENTACIONLODOS ACTIVOS

DIGESTION AEROBIADIGESTION ANAEROBIA

ANTIBIOTICOSVACUNAS

ENZIMAS INDUSTRIALESAMINOACIDOS

QUIMIOTERAPIAVERTEDEROS

BIOGAS

MUTACIONCLONACION

DNA recombinanteORGANISMOS TRANSGENICOS

ENZIMAS INMOVILIZADASCELULAS INMOVILIZADASCULTIVO CELULAR ANIMAL

ANTICUERPOS MONOCLONALESFUSION CELULAR

¿ Biotecnología en Chile.....???

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Procesos de transformación

biológica

VS

ProcesosQuímicos

Tradicionales

Conversiones de hasta un 100%, con un mínimo de reacciones colaterales

Reacciones de alta especificidad

Procesos de varias etapas, con productos intermedios, concentraciones mayores y reacciones rápidas

Una sola etapa, sin productos intermedios.Reacciones lentas en baja concentración

Los biocatalizadores trabajan a bajas temperaturas (20-60 °C) y a presión ambiental

Muchos procesos químicos se realizan en solventes orgánicos de alto costo y toxicidad

Todas las reacciones biológicas se realizan en presencia de agua

Petróleo o sus derivadosUso de recursos no renovables

Azúcares, almidón, residuos de industrias agroalimentarias. Materias poco convencionales

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BIOPROCESO

PRODUCTOS•Alcoholes•Metano•Ácidos grasos•Enzimas•Biopolímeros•Anticuerpos

monoclonales

MATERIAS PRIMAS• Celulósicas• Almidón• Azúcares• Aceites• Biomasa agrícola• Biomasa forestal• pulpas

DISEÑO DE BIOREACTORES•Transporte de materia•Transmisión de calor•Agitación y mezcla•Tanques agitados•Suministro de aire•Lechos rellenos•Biocinética•Bioinmovilización

INSTRUMENTACION•Controladores para PC•Biosensores•Adquisición de datos•Modelación•Ensayos de productos•Análisis económico

AGENTES DE BIOCONVERSION

•Células microbianas•Células vegetales•Células animales•Células DNA rec•MO psicrófilos•MO termófilos•MO halófilos•Enzimas

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MICROORGANISMOSMICROORGANISMOS

• Existen en casi todo ambiente en que exista H2O líquida• Desde -20 a 110 °C• Psicrófilos, mesófilos y termófilos• Aerobios, anaerobios, facultativos• Eucariontes, procariontes

Según su Fuente de Energía

Según su Estructura

Según su Fuente de Carbono

Autótrofos: carbono inorgánico.

Heterótrofos: carbono orgánico.

Quimiótrofos: energía química.

Fotótrofos: energía solar (luz).

Procariontes: no poseen núcleo ni organelos.

Eucariontes: poseen núcleo y organelos.

ClasificacionClasificacion de Microorganismosde Microorganismos

1.3.- CONCEPTOS DE MICROBIOLOGÍA Y BIOQUÍMICA

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Según la fuente de carbono que utilizan, los seres vivos se dividen en autótrofos, cuya principal fuente de carbono es el CO2 , y heterótrofoscuando su fuente de carbono es materia orgánica.

Por otra parte según la fuente de energía, los seres vivos pueden serfototrofos, cuya principal fuente de energía es la luz, y los organismosquimiotrofos, cuya fuente de energía es un compuesto químico que se oxida.

Atendiendo a las anteriores categorías, entre las bacterias podemos encontrar las siguientes formas, como puede apreciarse en el esquema:

• Los organismos quimioheterótrofas, utilizan un compuesto químico como fuente de carbono , y a su vez, este mismo compuesto es la fuente de energía. La mayor parte de las bacterias cultivadas en laboratorios y las bacterias patógenas son de este grupo.

• Los organismos quimioautótrofas, utilizan compuestos inorgánicos reducidos como fuente de energía y el CO2 como fuente de carbono. Como por ejemplo, Nitrobacter, Thiobacillus.

• Los organismos fotoautótrofas, utilizan la luz como fuente de energía y el CO2 como fuente de carbono. Bacterias purpureas.

• Los organismos fotoheterótrofas, utilizan la luz como fuente de energía y biomoléculas como fuente de carbono. Ejemplos como Rodospirillum yCloroflexus.

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Células EucariontesCélulas Eucariontes

Hongos, protozoos, algas, células animales y vegetales

Poseen núcleo y organelos citoplasmáticos

Organelos: Estructuras celulares de presencia constante y función definida

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La célula está rodeada por una membrana, denominada "membrana plasmática"., que delimita el territorio y controla el contenido químico de la célula.

En la composición química de la membrana entran a formar parte lípidos, proteínas yglúcidos en proporciones aproximadas de 40%, 50% y 10%, respectivamente. Los lípidos forman una doble capa y las proteínas se disponen de una forma irregular y asimétrica entre ellos. Estos componentes presentan movilidad, lo que confiere a la membrana un elevado grado de fluidez.

Por el aspecto y comportamiento el modelo de membrana se denomina "modelo de mosaico fluido"Las funciones de la membrana podrían resumirse en :

1.TRANSPORTEEl intercambio de materia entre el interior de la célula y su ambiente externo.

2.RECONOCIMIENTO Y COMUNICACIÓNGracias a moléculas situadas en la parte externa de la membrana, que

actúan como receptoras de sustancias.

MEMBRANA PLASMATICA

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Transporte a través de membranaLa bicapa lipídica de la membrana actúa como una barrera que separa dos medios acuosos, el medio donde vive la célula y el medio interno celular. Las células requieren nutrientes del exterior y deben eliminar sustancias de desecho procedentes del metabolismo y mantener su medio interno estable. La membrana presenta una permeabilidad selectiva, ya que permite el paso de pequeñas moléculas, siempre que sean lipófilas, pero regula el paso de moléculas no lipófilas.

El paso a través de la membrana posee dos modalidades:- pasiva, sin gasto de energía- activa , con consumo de energía

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1. El transporte pasivo. Es un proceso de difusión de sustancias a través de la membrana. Se produce siempre a favor del gradiente, es decir, de donde hay más hacia el medio donde hay menos. Este transporte puede darse por:

Difusión simple . Es el paso de pequeñas moléculas a favor del gradiente; puede realizarse a través de la bicapa lipídica o a través de canales proteicos.

1.1 Difusión simple a través de la bicapa . Así entran moléculas lipídicas como las hormonas esteroideas, anestésicos como el éter y fármacos liposolubles. Y sustancias apolares como el oxígeno y el nitrógeno atmosférico. Algunas moléculas polares de muy pequeño tamaño, como el agua, el CO2, el etanol y la glicerina, también atraviesan la membrana por difusión simple. La difusión del agua recibe el nombre de ósmosis

1.2 Difusión simple a través de canales .Se realiza mediante las denominadas proteínas de canal. Así entran iones como el Na+, K+, Ca2+, Cl-. Las proteínas de canal son proteínas con un orificio o canal interno, cuya apertura está regulada, por ejemplo por ligando, como ocurre con neurotransmisores u hormonas, que se unen a una determinada región, el receptor de la proteína de canal, que sufre una transformación estructural que induce la apertura del canal.

Difusión facilitada . Permite el transporte de pequeñas moléculas polares, como los aminoácidos, monosacáridos, etc, que al no poder, que al no poder atravesar la bicapa lipídica, requieren que proteínastrasmembranosas faciliten su paso. Estas proteínass reciben el nombre de proteínas transportadoras opermeasas que, al unirse a la molécula a transportar sufren un cambio en su estructura que arrastra a dicha molécula hacia el interior de la célula.

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2. El transporte activo . En este proceso también actúan proteínas de membrana, pero éstas requieren energía, en forma de ATP, para transportar las moléculas al otro lado de la membrana. Se produce cuando el transporte se realiza en contra del gradiente electroquímico. Son ejemplos de transporte activo la bomba de Na/K, y la bomba de Ca.

• La bomba de Na+/K+ Requiere una proteína transmembranosa que bombea Na+ hacia el exterior de la membrana y K+ hacia el interior. Esta proteína actúa contra el gradiente gracias a su actividad como ATP-asa, ya que rompe el ATP para obtener la energía necesaria para el transporte.

Por este mecanismo, se bombea 3 Na+ hacia el exterior y 2 K+ hacia el interior, con la hidrólisis acoplada de ATP. El transporte activo de Na+ y K+ tiene una gran importancia fisiológica. De hecho todas las células animales gastan más del 30% del ATP que producen ( y las células nerviosas más del 70%) para bombear estos iones.

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El Núcleo celularEl núcleo es un orgánulo característico de las células eucariotas. El material genéticode la célula se encuentra dentro del núcleo en forma de cromatina.

El nucleo dirige las actividades de la célula y en él tienen lugar procesos tan importantes como la autoduplicación del ADN o replicación, antes de comenzar la división celular, y la transcripción o producción de los distintos tipos de ARN, que servirán para la síntesis de proteínas. El núcleo cambia de aspecto durante el ciclo celular y llega a desaparecer como tal. Por ello se describe el núcleo en interfasedurante el cual se puede apreciar las siguientes partes en su estructura: •envoltura nuclear: formada por dos membranas concéntricas perforadas por poros nucleares. A través de éstos se produce el transporte de moléculas entre el núcleo y el citoplasma. •el nucleoplasma, que es el medio interno del núcleo donde se encuentran el resto de los componentes nucleares. •nucléolo, o nucléolos que son masas densas y esféricas, formados por dos zonas: una fibrilar y otra granular. La fibrilar es interna y contiene ADN, la granular rodea a la anterior y contiene ARN y proteínas. •la cromatina, constituida por ADN y proteinas, aparece durante la interfase; pero cuando la célula entra en división la cromatina se organiza en estructuras individuales que son los cromosomas.

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Retículo Endoplasmático

Está formado por una red de membranas que forman cisternas,sáculos y tubos aplanados. Delimita un espacio interno llamado lúmen del retículo y se halla en continuidad estructural con la membrana externa de la envoltura nuclear.

Se pueden distinguir dos tipos de retículo:

1. El Retículo endoplasmático rugoso (R.E.R.), presenta ribosomas unidos a su membrana. En el se realiza la síntesis proteíca. Las proteinas sintetizadas por los ribosomas, pasan al lúmen del retículo y aquí maduran hasta ser exportadas a su destino definitivo.

2. El retículo endoplásmico liso (R.E.L.), carece de ribosomas y esta formado portúbulos ramificados y pequeñas vesículas esféricas. En este retículo se realiza la síntesis de lípidos. En el retículo de las células del hígado tiene lugar la detoxificación, que consiste en modificar a una droga o metabolito insoluble en agua,en soluble en agua, para asm eliminar dichas sustancias por la orina.

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Las mitocondrias son los orgánulos celulares encargados de suministrar la mayor parte de la energía necesaria para la actividad celular, actúan por tanto,como centrales energéticas de la célula y sintetizan ATP a expensas de los carburantes metabólicos (glucosa, ácidos grasos y aminoácidos). La ultraestructura mitocondrialestá en relación con las funciones que desempeña: en la matriz se localizan los enzimas responsables de la oxidación de los ácidos grasos, los aminoácidos, el ácido pirúvico y el ciclo de krebs. En la membrana interna están los sistemas dedicados al transporte de los electronesque se desprenden en las oxidaciones anteriores y un conjunto de proteínas encargadas de acoplar la energía liberada del transporte electrónico con la síntesis de ATP,estas proteínas le dan un aspecto granuloso a la cara interna de la membranamitocondrial. También se encuentran dispersas por la matriz una molécula de ADN circular y unos pequeños ribosomas implicados en la síntesis de un pequeño número de proteínasmitocondriales

Mitocondria

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Aparato de Golgi

Descubierto por C. Golgi en 1898, consiste en un conjunto de estructuras de membrana que forma parte del elaborado sistema de membranas interno de las células. Se encuentra más desarrollado cuanto mayor es la actividad celular. La unidad básica del orgánulo es el sáculo, que consiste en una vesícula o cisterna aplanada. Cuando una serie de sáculos se apilan, forman un dictiosoma. Además, pueden observarse toda una serie de vesículas más o menos esféricas a ambos lados y entre los sáculos. El conjunto de todos los dictiosomas y vesículas constituye el aparato de Golgi.

El dictiosoma se encuentra en íntima relación con el retículo endoplásmico, lo que permite diferenciar dos caras: la cara cis, más próxima al retículo, y la cara trans, más alejada. En la cara cis se encuentran las vesículas de transición , mientras que en la cara trans, se localizan las vesículas de secreción. El sistema de membranas comentado al principio, constituye la respuesta de las células eucariotas a la necesidad de regular sus comunicaciones con el ambiente en el trasiego de macromoléculas. Para ello, se han desarrollado dos mecanismos en los que el aparato de Golgi está involucrado. La adquisición de sustancias se lleva a cabo por endocitosis, mecanismo que consiste en englobar sustancias con la membrana plasmática para su posteriorinternalización. La expulsión de sustancias se realiza por exocitosis , mecanismo que, en último término, consiste en la fusión con la membrana celular de las vesículas que contienen la sustancia a exportar. Estos mecanismos dan sentido funcional al aparato de Golgi:

•Maduración de las glucoproteínas provenientes del retículo. •Intervenir en los procesos de secreción, almacenamiento , transporte y transferencia de glucoproteínas. •Formación de membranas: plasmática, del retículo, nuclear.. •Formación de la pared celular vegetal. •Intervienen también en la formación de los lisosomas.

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Los principales representantes de este reino Procariota son las bacterias. De organización muy sencilla, la célula bacteriana consta:

! citoplasma. Presenta un aspecto viscoso, y en su zona central aparece unnucleoide que contiene la mayor parte del ADN bacteriano, y en algunas bacterias aparecen fragmentos circulares de ADN con información genética , dispersos por el citoplasma: son los plásmidos. La membrana plasmática presenta invaginaciones, que son los mesosomas, donde se encuentran enzimas que intervienen en la síntesis de ATP, y los pigmentos fotosintéticos en el caso de bacterias fotosintéticas.

! En el citoplasma se encuentran inclusiones de diversa naturaleza química. ! Muchas bacterias pueden presentar flagelos generalmente rígidos, implantados

en la membrana mediante un corpúsculo basal . Pueden poseer también, fimbrias o pili muy numerosos y cortos, que pueden servir como pelos sexuales para el paso de ADN de una célula a otra

! Poseen ARN y ribosomas característicos, para la síntesis de proteínas. ! pared celular es rígida y con moléculas exclusivas de bacterias. ! El éxito evolutivo de las bacterias se debe en parte a su versatilidad metabólica.

Todos los mecanismos posibles de obtención de materia y energía podemos encontrarlos en las bacterias.

Células ProcariontesFlagelos: otorgan movilidad

Mesosomas: pliegues internos de la membrana plasmática

Ribosomas: síntesis de proteínasDNA procarionte: molécula única, circular, no asociada a proteínas. Generalmente ligado a un mesosoma.

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Generalmente las bacterias se reproducen por bipartición, como se ve en el siguiente esquema:

Tras la duplicación del ADN, que esta dirigida por la ADN-polimerasa que se encuentra en los mesosomas, la pared bacteriana crece hasta formar un tabique transversal separador de las dos nuevas bacterias. Pero además de este tipo de reproducción asexual, las bacterias poseen unos mecanismos de reproducción sexual o parasexual, mediante los cuales se intercambian fragmentos de ADN .

Puede realizarse por :

TransformaciónConjugaciónTransducción

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CONJUGACIÓN: En este proceso, una bacteria donadora F+ transmite a través de un puente o pili, un fragmento de ADN, a otra bacteria receptora F-. La bacteria que se llama F+ posee un plásmido, además del cromosoma bacteriano.

TRANSFORMACION: Consiste en el intercambio genético producido cuando una bacteria es capaz de captar fragmentos de ADN, de otra bacteria que se encuentran dispersos en el medio donde vive.

TRANSDUCCIÓN: En este caso la transferencia de ADN de una bacteria a otra , se realiza a través de un virus bacteriófago, que se comporta como un vector intermediario entre las dos bacterias.

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Procariontes

Eucariontes

Eubacterias

Arcaebacterias

La gran mayoría de las bacterias

METANOGENICAS

HALOFILAS

TERMOACIDOFILAS

Células vegetales

Células animales

Protistas

Algas

Protozoos

Fungi

Virus

Levaduras

Hongos filamentosos

Clasificación de organismos celulares

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Control de los fermentadores

Un fermentador puede disponer de una unidad de control remoto para la visualización y el registro del comportamiento de la microbiota durante todoel proceso de fermentación que permite la simultaneidad de trabajo de los distintos equipos.

Sistema fermentador: El biorreactor dispone de sensores específicos que permiten la medida y el control "in situ" de las variables de una forma precisa y reproducible.

Variables implicadas: Los microorganismos crecerán a una velocidad característica que depende tanto de la composición del medio de cultivo como de la temperatura, pH, oxígeno suministrado y condiciones de la mezcla. Por este motivo, durante el proceso de producción se controlan mediante los oportunos sensores las siguientes variables:! pH !temperatura !presión parcial de oxígeno !producción de espumas !nivel

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BioFlo® 110 Autoclavable Fermentor &Bioreactor (1.3 - 14 L Total Volume)

Fermentation & Cell Culture Systems

NEW BRUNSWICK SCIENTIFIC CO., INC.www.nbsc.com

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BioFlo 6000, 130 Liter capacity fermentor. Shown with open skidequipped with optional automatic

sterilization feature.

ASME-Coded Vessels: The stainless steel jacketed vessel is constructed

in our own certified vessel fabrication facility in accordance with the coderegulations of the ASME (American Society of Mechanical Engineers)

BioFlo 4500®

Sterilizable-In-Place Fermentor-Bioreactor(20 and 30 Liters)

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BioFlo 3000® Autoclavable Fermentor(1¼ - 10 Liters)

CelliGen Plus®

The Universal Stirred-TankBioreactor System

Spinner Basket® with Fibra-Cel® Support

Immobilizes cells on Fibra-Cel disks while secreted proteins are easily

harvested with the medium

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Fermentador de laboratorio (2 L)

Fermentador de laboratorio (2-5 L)

Fermentador de laboratorio c/unidad de control (5 L)

Fermentador piloto c/monitor de control (25 L)

Fermentador piloto (50 L)

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