herramientas bibliográficas para la investigación en ciencias. curso 2009-2010. 6: bases de datos...

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Herramientas bibliográficas para la

investigación en Ciencias

Biblioteca de la Facultad de Ciencias de la Universidad de Zaragoza


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(5)BASES DE DATOS

ESPECIALIZADAS EN CIENCIAS

Roberto Soriano


3Biblioteca de la Facultad de Ciencias de la Universidad de Zaragoza

a) Temáticas

a) Interdisciplinares o generales

b) Especializadasa) Químicab) Físicac) Matemáticasd) Geologíae) Otras materias relacionadas

b) Por el tipo de documento

a) Tesis

b) Patentesa) Qué es, característicasb) Buscar patentes

BASES DE DATOSESPECIALIZADAS EN CIENCIAS


Bases de datos especializadas en

Ciencias


Tipos de bases de datos

Las bases de datos pueden clasificarse de varias maneras, de acuerdo al criterio elegido para su clasificación.

Por ejemplo, dentro del ámbito temático, pueden ser:

◦ Generales o interdisciplinares

◦ Especializadas


Bases de datos interdisciplinares

Por su exclusividad (investigación de calidad):◦ Bases de datos del ISI (Web of Knowledge) ◦ Elsevier (Scopus)

Por su ámbito geográfico, las bases de datos del CSIC:◦ ICYT Ciencia y Tecnología◦ ISOC Ciencias Sociales y Humanidades◦ IME Biomedicina


ICYT: Ciencia y Tecnología Recoge la literatura científica contenida en

publicaciones españolas de ciencia y tecnología desde los años 70

Sus fuentes son fundamentalmente artículos de revistas científicas y de forma selectiva actas de congresos, series, compilaciones, informes y monografías

Recurso de pago suscrito por la BUZ:◦ http://biblioteca.unizar.es

También permite su consulta de forma gratuita (pero limitada)


ICYT: Ciencia y Tecnología


WorldWideScience.orgThe Global Science Gateway

Es un portal que permite búsquedas federadas de información bibliográfica en bases de datos científicas y en otras pasarelas producidas o distribuidas por organismos públicos de varios países

Además de Science.gov, el gran portal de documentación científica del gobierno estadounidense, incluye Article@INIST de Francia, SciELO de Latinoamérica, UK PubMed Central, el CISTI de Canadá, DEFF de Dinamarca y fuentes de información de Japón, Alemania, Holanda y Australia. A través de pasarelas como DEFF, se localizan referencias de CiteSeer, ArXiv, CogPrints, etc.

Consulta gratuita


WorldWideScience.orgThe Global Science Gateway

11Biblioteca de la Facultad de Ciencias de la Uiversidad de Zaragoza

getCITED

GetCITED es una base de datos colaborativa abierta por y para toda la comunidad científica

La consulta es gratuita, pero es imprescindible darse de alta para poder introducir y editar contenidos

Recopila artículos, capítulos de libros, ponencias, informes, documentos de trabajo, etc.


getCITED


Bases de datos especializadas

La mayoría de bases de datos especializadas en

materias concretas son exhaustivas

Estas características: Exhaustividad Especialización

son a la vez, su peor y mejor valor como herramienta de recuperación



Química:◦ SciFinder◦ Web of Knowledge◦ ICYT◦ Entrez (PubChem, PubMed…)◦ PubChem◦ ChEBI◦ DrugBank

Y en menor medida:◦ PubMed◦ NTIS◦ Energy Citation Database



Física◦ ArXiv.org◦ Web of Knowledge◦ IOPScience◦ ICYT

Y en menor medida:◦ NTIS◦ Energy Citation Database


Bases de datos temáticas

Matemáticas:◦ Mathscinet◦ ArXiv.org◦ Web of Knowledge◦ IOPScience◦ ICYT

Y en menor medida:◦ NTIS◦ Energy Citation Database


Bases de datos temáticas Geología:

◦ Georef◦ Bigpi◦ MinAbs Online◦ Bibliosaurus◦ Pangaea◦ Web of Knowledge◦ ICYT

Y en menor medida:◦ SciFinder Scholar◦ Energy Citation Database


Bases de datos en Ciencias

La primera aproximación, hasta que nos familiaricemos con las que cubren nuestras necesidades, es a través de la Biblioteca:

http://biblioteca.unizar.es

Y seguir con:◦ Enlaces rápidos / bases de datos / Buscar por

materia: CIENCIA


Química: Scifinder Scholar

Producida por Chemical Abstracts Service (CAS), división de American Chemical Society, es una base de datos formada por más de 16 millones de registros de actualización diaria.

Contiene referencias bibliográficas, abstracts y, en algunos casos, acceso al documento completo, de artículos de publicaciones periódicas, informes técnicos, tesis doctorales, patentes, ponencias de congresos, etc.



Materias: ◦ Química ◦ Ingeniería química◦ Ciencia de los materiales◦ Aspectos relacionados con sustancias de otras áreas de

conocimiento como: Farmacia Medicina Biología Física Geología Ciencias del medio ambiente

Acceso por suscripción (4 usuarios) a través de la biblioteca:◦ http://biblioteca.unizar.es



Primero registrars

e

Después acceder


Química: Entrez Entrez, The Life Sciences Search Engine es el portal de acceso a todas las

bases de datos del National Center for Biotechnology Information (NCBI), (que forma parte de la National Library of Medicine de Estados Unidos, quien a su vez está integrado en los National Institutes of Health (NIH)).

El NCBI almacena y actualiza constantemente información referente a biomedicina, biotecnología, bioquímica, genética y genómica además de otros datos biotecnológicos de relevancia en diversas bases de datos, accesibles todas a través de Entrez:◦ Moleculas (PubChem)◦ Secuencias genómicas (GenBank)◦ Artículos científicos de investigación biomédica de MEDLINE (PubMed)◦ Análisis de secuencias de ADN, ARN y proteínas (BLAST y otras)◦ Catálogo de todas las enfermedades conocidas con un componente

genético (OMIM: Online Mendelian Inheritance in Man)◦ Etc, etc, etc…

Acceso gratuito


Química: Entrez


Química: PubChem PubChem es una base de datos de moleculas creada en 2004 y concebida

como una herramienta de investigación que debía ser ampliada, corregida y mejorada por los mismos científicos que la usaban.

PubChem es de acceso gratuito, está desarrollada por el National Center for Biotecnology Information (NCBI), y financiada por los National Institutes of Health (NIH), la principal agencia federal norteamericana destinada a la investigación biosanitaria.

American Chemical Society (ACS), propietaria de SciFinder Scholar, se opone a que este sea un recurso de acceso libre y gratuito, acusando al NIH de competencia desleal porque, dicen, se está pagando con dineros públicos un servicio (duplicado) que ya ofrecían ellos.

PubChem dicen que sus contenidos sólo coinciden en un 3% con los de SciFinder

Fundamentalmente de interés para bioquímicos y médicos


Química: PubChem


Química: ChEBI

Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) - entidades químicas de interés biológico

Base de datos de entidades moleculares centrada en pequeños componentes químicos, de acceso gratuito

Moléculas directamente relacionadas con el genoma, tales como ácidos nucleicos, proteínas y péptidos, no están incluidos


Química: ChEBI


Química: DrugBank Base de datos gratuita de la Universidad de Alberta

Permite averiguar casi todo lo que necesiten saber sobre un medicamento o sus aplicaciones. Proporciona más de 80 datos para cada uno, incluyendo los distintos nombres comerciales con que los fabricantes lo producen, las estructuras químicas, las secuencias de las proteínas y del ADN, enlaces a páginas relevantes en Internet, información sobre las prescripciones y datos detallados para los pacientes.

A los biólogos y químicos les ayuda en una amplia gama de búsquedas y preguntas sofisticadas. Combinadas con el software de visualización del DrugBank, estas herramientas permiten a los científicos buscar con facilidad los nuevos medicamentos y sus aplicaciones, comparar sus estructuras, estudiar sus mecanismos y obtener mucha otra información.


Química: DrugBank


Física: ArXiv.org

Es un “archivo” en acceso abierto para borradores (preprints) de artículos científicos en el campo de:◦ Física◦ Matemáticas◦ Informática◦ Biología cuantitativa◦ Estadística

En muchos campos de las matemáticas y la física, casi todos los artículos científicos se colocan en arXiv.


Física: ArXiv.org El arXiv fue desarrollado originalmente por Paul Ginsparg y

comenzó en 1991 como un archivo para borradores de física y más tarde se amplió para incluir astronomía, matemáticas, informática, ciencia no lineal, biología cuantitativa y más recientemente estadística.

Pronto se hizo obvio que se había generado una demanda para que se mantuvieran durante mucho tiempo los borradores.

El término e-print se adoptó para describir estos artículos. Actualmente hay más de 527.000 e-prints


Física: ArXiv.org

Aunque arXiv no esta revisado por pares, se introdujo un sistema de "aprobación" en enero de 2004 como parte de un esfuerzo para asegurar el contenido que es relevante y de interés para la investigación actual en las disciplinas especificadas. El nuevo sistema ha recabado críticas por denuncias de restricciones injustificadas. Bajo este sistema, un autor debe recibir primero su aprobación, que viene o bien de otro autor de arXiv que es un "evaluador" o es automática, dependiendo de varios criterios que no están públicamente expuestos.


Física: ArXiv.org

No se pide que los evaluadores revisen los errores del artículo, sino si éste es apropiado para el área al que pertenecen.

Aunque la falta de revisión por pares suscita alguna preocupación, no se considera un obstáculo para los usuarios de arXiv. Muchos autores son cuidadosos con sus contribuciones. La mayoría de los e-prints también se envían a revistas científicas para que sean publicadas, pero algunos trabajos, incluidos algunos artículos influyentes, se quedan solo como e-prints y jamás son publicados en una revista científica.


Física: ArXiv.org Aunque arXiv contiene algunos e-prints dudosos, éstos

son "sorprendentemente raros”. ArXiv generalmente reclasifica estos trabajos.

Acceso a través de la biblioteca:◦ http://biblioteca.unizar.es

Acceso directo (libre):◦ http://arxiv.org/


Física (y matemáticas, etc.)

ArXiv.org


Física (y matemáticas, etc.)

ArXiv.orgeprintweb.org, interfaz beta para buscar en Arxiv desarrollada por el IOP. Permite una mayor personalización, recibir alertas y guardar artículos de interés.


Física: IOPScience Portal de acceso a las publicaciones del Institute of Physics de

Londres (IOP) Base de datos de todas las publicaciones del IOP, contiene más de

300.000 artículos desde 1874 hasta el presente. Da acceso a información de contenido científico y técnico (física,

astronomía y matemáticas) Da enlaces a artículos relacionados, referencias y citas recibidas Ofrece listas de artículos más populares y más recientes Búsqueda por códigos de clasificación PACS (Physics and

Astronomy Classification Scheme) y AMS (American Mathematical Society)

Acceso al texto completo por suscripción a través de la biblioteca


Física: IOPScience


Matemáticas: Mathscinet

Recoge todo lo publicado sobre matemáticas a nivel mundial desde 1940 (artículos de revista, capítulos de libros, actas de congresos, etc.)

Vacía 1900 títulos de revista

Contiene más de 1 millón de artículos



MathScinet incluye dos repertorios bibliográficos publicados por la American Mathematical Society (AMS):

◦ Mathematical Reviews (MR): repertorio de revisiones de literatura matemática que incluye las reseñas bibliográficas y extensos resúmenes o revisiones. Actualización mensual



◦ Current Mathematical Publication (CMP): índice estructurado por materias de la literatura publicada recientemente, funcionando por tanto como un repertorio de alerta. Incluye las reseñas bibliográficas completas pero no los resúmenes. Se actualiza diariamente.

Acceso por suscripción a través de la biblioteca:◦ http://biblioteca.unizar.es


Geología: GeoRef

Producto del American Geological Institute desde 1966, da acceso a literatura mundial sobre ciencias geológicas.

Cubre la geología de América del Norte desde 1693 y la geología del resto del mundo desde 1933 hasta el presente.


Geología: GeoRef

Contiene más de 3 millones de referencias de artículos de revistas, libros, mapas, actas de congresos, informes y tesis en todos los idiomas.

Los títulos de las referencias no publicadas en inglés se traducen al inglés.

Incorpora anualmente más de 100.000 referencias

Acceso por suscripción a través de la biblioteca:◦ http://biblioteca.unizar.es


Geología: GeoRef

1.Seleccionar las casillas de GeoRef y GeoRef in Process

2. Pinchar en Continuar la búsqueda


Geología: GeoRef


Geología: BIGPIBibliografía de Geología de la

Península Ibérica

Mantenida por la Biblioteca Jaume Almera de la UB/CSIC, es una base de datos sobre geología de la Península Ibérica.

De actualización semanal, incluye más de 83.000 referencias de artículos de revista, libros y capítulos de libro, tesis, ponencias de congresos, entre otros.


Acceso directo (libre):◦ http://www.bib.ub.edu/fileadmin/bigpi/bigpi.htm


Geología: BIGPIBibliografía de Geología de la Península

Ibérica


Geología: MinAbs Online

The Online Mineralogical Abstracts Journal

Publicada por The Mineralogical Society of Great Britain and Ireland Temática:

◦ Mineralogía◦ Cristalografía◦ Geoquímica◦ Petrología◦ Mineralogía medioambiental◦ Otras materias relacionadas



Geología: MinAbs OnlineThe Online Mineralogical Abstracts

Journal


Geología: BibliosaurusBase de datos de dinosaurios


Geología: Pangaea

Pangaea es un archivo abierto de datos científicos, es decir, datos en bruto, numéricos o no, obtenidos de la observación e investigación de proyectos relacionados las geociencias marinas (geología, geografía, medio ambiente)

Son datos de observación o de experimentos completos y en bruto que se recogen en la realización de las investigaciones y que, aunque son la base de los artículos, no se publican


Geología: Pangaea


PubMed (Medline)

PubMed es un motor de búsqueda de libre acceso a la base de datos MEDLINE

MEDLINE es la base de datos de bibliografía biomédica más amplia que existe.

Está producida por la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos.

Recoge más de 16.000.000 referencias bibliográficas de los artículos publicados en más de 5.000 revistas médicas desde 1966


Acceso libre:◦ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez


PubMed (Medline)


NTIS: National Technical Information Service

Bases de datos del National Technical Information Service de Estados Unidos, con datos de referencia standard producto de la investigación propia o de la revisión de la literatura publicada, evaluados y avalados por el NIST, como base para otros desarrollos o aplicaciones técnicas.

La mayor parte de la información es de tipo factual: numérica, gráfica o icónica. Pero también hay citas bibliográficas y resúmenes de informes de trabajos de investigación y estudios de carácter científico, tecnológico e industrial (química, física, computación, etc.)

Servicio de pago suscrito por la biblioteca a través de la plataforma Engineering Village:◦ http://biblioteca.unizar.es


NTIS: National Technical Information Service


Energy Citations Database

Base de datos de referencias bibliográficas del Departamento de Energía americano (DOE).

Contiene más de 2 millones de citas (desde 1943) de informes científicos y técnicos sobre energía, relacionados con disciplinas de interés como química, física, ciencias de los materiales, ciencias ambientales, geología, ingeniería, matemáticas, climatología, oceanografía, informática, etc.

Incluye citas bibliográficas de informes, conferencias, artículos de revistas, libros, tesis, y patentes.

Acceso gratuito Acceso a través de la biblioteca:

◦ http://biblioteca.unizar.es


Energy Citations Database


Bases de datos por el tipo de documento

Tesis doctoral◦ Es una disertación escrita que presenta a la universidad el

aspirante al título de doctor en una facultad.

Patente◦ Documento en que oficialmente se le reconoce a alguien una

invención y los derechos que de ella se derivan.


Tesis doctorales

◦ Cómo buscar Tesis: http://biblioteca.unizar.es

◦ Referencias: Teseo TesisUZ (desde 1991-1992) Proquest Dissertations & Theses

◦ Texto completo Zaguan (Universidad de Zaragoza) TDR Tesis Complutenses Digitales Cybertesis.Net


Patentes (1)¿Qué es una Patente?

Una Patente es un título que reconoce el derecho de explotar en exclusiva una invención, impidiendo a otros su fabricación, venta o utilización sin consentimiento del titular.

La duración de una Patente varía en cada país; en España es de veinte años a contar desde la fecha de presentación de la solicitud. Para mantenerla en vigor es preciso pagar tasas anuales a partir de su concesión.


Patentes (2)

¿Dónde se registran las patentes?

En España: Oficina Española de Patentes y Marcas (http://www.oepm.es)

Allí trabajan los examinadores quienes determinan la patentabilidad de una invención


Patentes (3)

Los documentos de patente

A cambio del privilegio del monopolio, el propietario de la invención acuerda divulgar los detalles completos de la misma.

Esta divulgación se realiza mediante los documentos de patente resultantes de la tramitación en una Oficina Nacional o Internacional de patentes.


Patentes (4)

Los documentos de patente

Son una importante fuente de información tecnológica ya que describen una invención de una manera clara y completa, puesto que la protección que otorga la patente se basa en lo que está descrito en la misma.

En su mayoría están accesibles a texto completo en Internet.


Patentes (5)

Patentes

◦ Se publican cerca de un millón de solicitudes de patente (incl. modelo de utilidad) "distintas" al año. Muchas solicitudes se abandonan antes de publicarse.

◦ Aprox. el 40% de las solicitudes publicadas se conceden, convirtiéndose en patentes (en 3-4 países como media).

◦ Sólo el 5-10% de las patentes se explotan o usan para algo

◦ El 70-85% de la información publicada en solicitudes de patente no se republica en ninguna otra fuente de información


Patentes (6)Los documentos de patente

Se identifican mediante un número de publicación. Ejemplos:◦ ES2246177-A1 (PATENTE ESPAÑOLA)◦ EP1623719-A1 (PATENTE EUROPEA)◦ WO2004098631-A1 (PATENTE MUNDIAL)

ES2246177-A1 Código del país u oficina Serie numérica

Tipo de documento


Patentes (y 7)

Principales oficinas de patentes

Oficina Española de Patentes y Marcas: http://www.oepm.es OMPI (Organización Mundial de la Propiedad Intelectual):

http://www.wipo.int/portal/index.html.es European Patent Office: http://www.european-patent-office.org


Buscar Patentes (1)

Directorio de bases de datos de patentes por países:

http://www.wipo.int/ipdl/en/resources/links.html

ESP@ACENEThttp://es.espacenet.com/Textos completos de patentes publicadas en los dos

últimos años en cualquier estado miembro de la Organización Europea de Patentes, así como las de la Oficina Europea de Patentes y los de la Organización Mundial de la Propiedad Intelectual.


Buscar Patentes (2)

UNITED ESTATES PATENT AND TRADEMARK OFFICEhttp://www.uspto.gov/patft/index.html Textos completos de patentes americanas desde 1790

INVENEShttp://invenes.oepm.es Base de datos de la Oficina Española de Patentes y Marcas que contiene

los datos bibliográficos de Patentes y Modelos de Utilidad españoles o designados en España y datos bibliográficos de Patentes y Modelos de dieciocho países iberoamericanos. Sólo algunas a texto completo.


Buscar Patentes (3)

PATENTSCOPEhttp://www.wipo.int/pctdb/es

Solicitudes internacionales de patentes

DERWENT INNOVATION INDEX (WOK)http://roble.unizar.es:9090/login?url=http://www.accesowok.fecyt.es/diidw


Buscar Patentes (4) BUSCADORES

◦ FreePatentsOnlinehttp://www.freepatentsonline.com/ Patentes estadounidenses, europeas y japonesasSobre FreePatensOnline

◦ PatentSearchhttp://es.patents.com/ Patentes estadounidenses y europeas

◦ Google Patentshttp://www.google.com/patents Patentes estadounidensesSobre Google Patents


Buscar Patentes (y 5)

BIBLIOGRAFÍA SOBRE PATENTES

◦ González-Albo, B.; Zulueta, M.A. 2007. Estudio comparativo de bases de datos de patentes en internet. Anales de documentación, 10:145-162

◦ Santos Medina, M.E.; Muñoz Palma, L.; Becerra Arellano, R. 2007. El estado de la técnica y los recursos de información en el proceso de patentamiento. Serie Bibliotecología y Gestión de Información, 21:1-76.


Y ahora… ¿qué?

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