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Catálogo de Servicios ValGenetics 201 2017 Especialistas en Vida Vegetal

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Catálogo de Servicios ValGenetics

201 2017

Especialistas en Vida Vegetal

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2 Catálogo de Servicios ValGenetics 2017

ValGenetics, laboratorio autorizado por la Conselleria de Agricultura, Medio

Ambiente, Cambio Climático y Desarrollo Rural (Generalitat Valenciana)

para el análisis de patógenos presentes, emergentes y de cuarentena,

apostando por la calidad ofrece:

Servicios y análisis genéticos exclusivos y únicos amoldados al

mercado agrícola y biotecnológico de plantas.

Equipo de técnicos e investigadores con gran experiencia científica.

Desarrollos propios en I+D+i.

Servicio de peritaje y asesoramiento técnico.

Tratamiento eficaz y eficiente de las muestras.

Trato personalizado y confidencial.

Presupuesto adaptado.

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Catálogo de Servicios ValGenetics 2017 3

Ciencia al servicio de la Agricultura

ValGenetics está desarrollando tecnología de aplicación agraria

constantemente. En nuestras instalaciones, situadas en el Parc

Científic de la Universitat de València, realizamos:

Análisis fitopatológicos mediante técnicas moleculares e inmunológicas.

Identificación de microorganismos mediante taxonomía molecular.

Análisis por secuenciación masiva de la microbiota en suelo, planta o agua.

Ensayos de poder patógeno.

Estudios de evaluación in vitro de fungicidas y bactericidas.

Secuenciación masiva y estudios bioinformáticos.

Análisis genéticos dirigidos a la diferenciación e identificación varietal.

Mejora de cultivos con la obtención de nuevas variedades.

Cultivo in vitro de plantas. Rejuvenecimiento y micropropagación.

Saneamiento de plantas madre siguiendo los esquemas de certificación

normalizados.

Pruebas de germinación de semillas.

Estudios de ploidía. Obtención de plantas triploides.

Ensayos de enraizamiento de plantas.

Transformación genética.

Desarrollo de productos, tecnología y proyectos I+D+i a la carta.

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4 Catálogo de Servicios ValGenetics 2017

ÁREA FITOPATOLOGÍA

1.1. Servicio de diagnóstico fitopatológico

ValGenetics dispone de una amplia gama de plataformas diagnósticas. Aplicando los

protocolos de la normativa española o comunitaria (OEPP/EPPO), basados en métodos

moleculares (PCR, PCR a tiempo real, Bio-PCR, Multiplex-PCR) o inmunológicos (ELISA,

inmunoimpresión-ELISA, inmunofluorescencia) y siguiendo las normativas de calidad ISO

9001 y 17025, se pueden detectar e identificar los siguientes virus, viroides, bacterias,

fitoplasmas, hongos y oomycetes:

Cultivo afectado

Alc

ach

ofa

s

Aliá

ceas

Ap

iáce

as

Bra

ssic

as

Cer

eale

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Cít

rico

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curb

itác

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Esp

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Fru

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rojo

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Fru

tos

seco

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Hig

os

Ho

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ola

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oja

Kiw

i

Legu

min

osa

s

Man

go

Oliv

o

Orn

amen

tale

s

Sola

nác

eas

Vid

Virus y viroides

Alfalfa mosaic virus Apple chlorotic leaf spot virus

Apple mosaic virus

Arabis mosaic virus

Cherry leaf roll virus Chrysanthemum stunt viroid

Citrus bark cracking viroid

Citrus bent leaf viroid

Citrus dwarfing viroid

Citrus exocortis viroid

Citrus leaf blotch virus

Citrus psoriasis virus

Citrus tristeza virus

Citrus variegation virus Citrus vein enation woody-gall virus Cucumber green mottle mosaic virus

Cucumber leaf spot virus

Cucumber mosaic virus Cucumber vein yellowing virus Cucurbit yellow stunting disorder virus

Aliáceas (ajo, cebolla, chalote, puerro); Apiáceas (apio, eneldo, hinojo, perejil, zanahoria); Brassicas (col, col de bruselas, coliflor,

repollo); Cereales (cebada, centeno, maíz, trigo); Cucurbitáceas (calabaza, melón, pepino, sandía); Frutales de hueso (aguacate,

albaricoque, cereza, ciruelo, melocotón); Frutales de pepita (manzana, membrillo, pera); Frutos rojos (arándano, frambueso,

grosella); Hortícolas de hoja (acelgas, espinacas, lechuga, albahaca); Leguminosas (guisante, judía, lenteja); Solanáceas

(berenjena, patata, pimiento, tomate).

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Catálogo de Servicios ValGenetics 2017 5

Cultivo afectado

Alc

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Aliá

ceas

Ap

iáce

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Bra

ssic

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Cer

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Cít

rico

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Vid

Virus y viroides

Grapevine fanleaf virus

Grapevine fleck virus Grapevine leafroll associated virus I Grapevine leafroll associated virus III

Grapevine virus A

Grapevine virus B

Hop stunt viroid

Iris yellow spot virus

Leek yellow stripe virus

Lettuce mosaic virus Lettuce yellow mosaic virus

Melon necrotic spot virus Moroccan watermelon mosaic virus

Onion yellow dwarf virus

Papaya ringspot virus

Peach latent viroid

Pepino mosaic virus

Pepper mild mottle virus

Pepper vein yellow virus

Plum pox virus Potato spindle tuber viroid

Potato Y virus

Prune dwarf virus Prunus necrotic ringspot virus Raspberry bushy dwarf virus

Raspberry ringspot virus

Shallot latent virus

Squash mosaic virus Strawberry latent ringspot virus Strawberry mild yellow edge virus

Tobacco mosaic virus

Aliáceas (ajo, cebolla, chalote, puerro); Apiáceas (apio, eneldo, hinojo, perejil, zanahoria); Brassicas (col, col de bruselas, coliflor,

repollo); Cereales (cebada, centeno, maíz, trigo); Cucurbitáceas (calabaza, melón, pepino, sandía); Frutales de hueso (aguacate,

albaricoque, cereza, ciruelo, melocotón); Frutales de pepita (manzana, membrillo, pera); Frutos rojos (arándano, frambueso,

grosella); Hortícolas de hoja (acelgas, espinacas, lechuga, albahaca); Leguminosas (guisante, judía, lenteja); Solanáceas

(berenjena, patata, pimiento, tomate).

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6 Catálogo de Servicios ValGenetics 2017

Cultivo afectado

Alc

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Ap

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Cer

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Cít

rico

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min

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Man

go

Oliv

o

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Sola

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Vid

Virus y viroides

Tobacco rattle virus

Tobacco ringspot virus

Tomato apex necrosis virus

Tomato black ring virus

Tomato bunchy top virus

Tomato chlorosis virus

Tomato leaf curl New Delhi virus

Tomato mosaic virus

Tomato ringspot virus

Tomato spotted wilt virus

Tomato torrado spp

Tomato yellow leaf curl virus

Watermelon mosaic virus

Zucchini yellow mosaic virus

Bacterias y fitoplasmas

Acidovorax citrulli

Agrobacterium rubi

Agrobacterium tumefaciens

Agrobacterium vitis

Aster yellows MLO

Candidatus liberibacter spp. Candidatus liberibacter solanacearum Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis

Erwinia amylovora

Fitoplasma spp.

Pseudomonas spp. Pseudomonas savastanoi pv. nerii Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi Pseudomonas syringae pv. actinidiae Pseudomonas syringae pv. aesculi

Ralstonia solanacearum

Rhodococcus fascians

Aliáceas (ajo, cebolla, chalote, puerro); Apiáceas (apio, eneldo, hinojo, perejil, zanahoria); Brassicas (col, col de bruselas, coliflor,

repollo); Cereales (cebada, centeno, maíz, trigo); Cucurbitáceas (calabaza, melón, pepino, sandía); Frutales de hueso (aguacate,

albaricoque, cereza, ciruelo, melocotón); Frutales de pepita (manzana, membrillo, pera); Frutos rojos (arándano, frambueso,

grosella); Hortícolas de hoja (acelgas, espinacas, lechuga, albahaca); Leguminosas (guisante, judía, lenteja); Solanáceas

(berenjena, patata, pimiento, tomate).

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Catálogo de Servicios ValGenetics 2017 7

Cultivo afectado

Alc

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Aliá

ceas

Ap

iáce

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Bra

ssic

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Cer

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s

Cít

rico

s

Cu

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osa

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Man

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Vid

Bacterias y fitoplasmas

Spiroplasma citri (Stubborn)

Xanthomonas spp.

Xanthomonas arboricola pv. pruni

Xanthomonas campestris pv. campestris

Xanthomonas campestris pv. vesicatoria

Xanthomonas citri subsp.citri

Xylella fastidiosa

Xylophilus ampelinus

Hongos y oomycetes

Alternaria spp.

Colletotrichum spp.

Didymella bryoniae

Eutypa lata

Fusarium graminearum

Fusarium oxysporum

Hongos de madera en vid Hongos productores de micotoxinas

Macrophomina phaseolina

Monilinia fructigena

Phytophthora spp.

Verticillium dahliae

Rhizoctonia solani

Rosellinia necatrix

Stemphylium vesicarium

Aliáceas (ajo, cebolla, chalote, puerro); Apiáceas (apio, eneldo, hinojo, perejil, zanahoria); Brassicas (col, col de bruselas, coliflor,

repollo); Cereales (cebada, centeno, maíz, trigo); Cucurbitáceas (calabaza, melón, pepino, sandía); Frutales de hueso (aguacate,

albaricoque, cereza, ciruelo, melocotón); Frutales de pepita (manzana, membrillo, pera); Frutos rojos (arándano, frambueso,

grosella); Hortícolas de hoja (acelgas, espinacas, lechuga, albahaca); Leguminosas (guisante, judía, lenteja); Solanáceas

(berenjena, patata, pimiento, tomate).

Las tarifas varían dependiendo del número de muestras, patógeno analizado y la técnica de

diagnóstico. Para consultar nuestros precios, tipos de análisis y bioensayos o la detección de

patógenos no detallados en este catálogo, contáctenos en los teléfonos +34 663855771 o +34

960059146 o vía email a [email protected]

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8 Catálogo de Servicios ValGenetics 2017

1.2. Desarrollo de metodologías de detección de patógenos vegetales

Ofrecemos puesta a punto de metodologías de detección de patógenos (PCR, PCR a tiempo

real, BIO-PCR, Multiplex PCR, High Resolution Melting (HRM), inmunoimpresión-ELISA…)

ajustadas a las necesidades de las empresas agroalimentarias o biotecnológicas.

1.3. Servicio de evaluación in vitro de fungicidas y bactericidas

Realizamos la determinación in vitro del potencial de substancias químicas, extractos

vegetales o microorganismos antagonistas para el control de hongos y bacterias.

1.4. Ensayos de patogenicidad y test de resistencia a patógenos

Desarrollamos estudios de patogenicidad o de resistencia a hongos, bacterias y virus en

planta en condiciones controladas. Las plantas o semillas inoculadas se cultivan en sustratos

estériles para posteriormente analizar la aparición de síntomas y el contenido de patógenos

mediante técnicas moleculares.

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Catálogo de Servicios ValGenetics 2017 9

1.5. Detección de células viables de microorganismos

Disponemos de tecnologías que permiten la detección de células viables de microorganismos

patógenos y no patógenos mediante técnicas de ADN, lo que aúna la especificidad y

sensibilidad de las técnicas basadas en la detección de ADN con la funcionalidad de detectar

solamente ADN que procede de células vivas.

1.6. Diagnóstico absoluto mediante taxonomía molecular

Aplicamos la taxonomía molecular (análisis bioinformático de la secuencia del gen del ARNr

16S para bacterias o del gen ARNr 18S (ITS) para hongos) mediante la secuenciación masiva

de todos los microorganismos componentes de una muestra. Estos estudios se aplican a la

certificación de la ausencia de patógenos en plantas madre, estudios de la composición de la

microbiota o análisis de la variación de la microbiota cuando se aplican biocidas o

fertilizantes.

1.7. Diagnóstico específico de variantes de una especie viral o microbiana

Realizamos el genotipado de cepas, razas o variantes genéticos de una misma especie viral o

microbiana, diagnosticando diferencialmente la variante patogénica mediante análisis

genéticos altamente específicos.

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10 Catálogo de Servicios ValGenetics 2017

ÁREA GENÉTICA Genética Vegetal

2.1. Identificación y diferenciación varietal

Obtenemos marcadores moleculares específicos para especies y variedades de plantas y los

empleamos para detectar polimorfismos a nivel de ADN, permitiendo la identificación

varietal de forma precisa y la determinación de pureza varietal en semillas.

2.2. Asistencia en proyectos de mejora vegetal

Ofrecemos asesoramiento y desarrollo de marcadores moleculares proporcionando un

servicio completo de genotipado de las nuevas variedades de plantas. La huella digital de

ADN permite la protección de los derechos del obtentor.

2.3. Obtención de nuevas variedades mediante irradiación de tejidos vegetales

El uso de radiaciones ionizantes aumenta la variabilidad, lo que puede estimular rasgos

agronómicos de interés en programas de mejora genética para la obtención de nuevas

variedades vegetales. Implementamos el proyecto de mejora vegetal completo.

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Catálogo de Servicios ValGenetics 2017 11

Genética Microbiana

3.1. Identificación de hongos, bacterias y virus por taxonomía molecular

La identificación del patógeno se lleva a cabo mediante la secuenciación tipo Sanger o tipo

metagenómica de un fragmento de ADN o ARN. Igualmente, se realizan análisis genómicos

de microorganismos empleando la secuenciación masiva (Plataforma MiSeq® o NextSeq ® de

Illumina).

3.2. Caracterización de comunidades microbianas de muestras complejas

Todos los microorganismos presentes en muestras de suelo, agua o cultivos vegetales

enfermos se pueden identificar de forma conjunta en un único análisis mediante la

secuenciación masiva de todo el ADN presente en la muestra y posterior análisis

bioinformático. De este modo se pueden determinar las especies de microorganismos

patológicos y beneficiosos, así como la concentración de los mismos en la muestra.

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12 Catálogo de Servicios ValGenetics 2017

ÁREA BIOTECNOLOGÍA VEGETAL

4.1. Saneamiento y propagación

El saneamiento in vitro de plantas madre de variedades vegetales seleccionadas permite la

recuperación y posterior propagación de plantas sanas, libres de patógenos (virus, bacterias,

hongos), los cuales causan una reducción del vigor y de la producción del cultivo.

Cultivo Servicio1

Plazo de entrega Saneamiento Propagación

Adelfa (Nerium oleander)

√ √

De 6 meses a 1 año (consultar en cada caso

concreto)

Chufa (Cyperus esculentus

√ √

Cítricos (Citrus)

√ √

Dracaena (Dracaena, Cordyline)

√ √

Fresa (Fragaria sp.)

√ √

Frambuesa (Rubus idaeus)

√ √

Granado (Punica granatum)

√ √

Kiwi (Actinidia deliciosa)

√ √

Planta crasa (Crassulaceae, Portulacaceae…)

√ √

Vid (Vitis vinifera)

√ √

Zarzamora (Rubus sp.)

√ √

1 Se enumeran los cultivos ya ensayados en nuestro laboratorio pero ofrecemos la posibilidad de realizar el servicio en cualquier cultivo.

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Catálogo de Servicios ValGenetics 2017 13

4.2. Ensayos de viabilidad in vitro

En ciertos casos, es conveniente plantear ensayos iniciales in vitro para establecer la

viabilidad de proyectos más amplios con determinadas especies vegetales. Esto permite

acotar las condiciones de cultivo y alcanzar con mayor facilidad el objetivo planteado por el

cliente.

4.3. Pruebas de germinación

Analizamos la calidad de los lotes de semillas mediante pruebas de germinación ex vitro o in

vitro, para determinar el vigor, la pureza y la calidad de la semilla de cada lote, según

normativa ISTA.

4.4. Rescate de embriones

En el caso de semillas con bajas posibilidades de germinación ex vitro o para la recuperación

de todos los embriones de semillas poliembriónicas, realizamos el rescate y germinación de

embriones individualizados in vitro.

4.5. Ensayos de microinjerto

Mediante ensayos in vitro de microinjerto podemos comprobar la compatibilidad en el

injerto patrón-variedad y además acelerar o incluso abaratar la obtención de planta.

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14 Catálogo de Servicios ValGenetics 2017

4.6. Ensayos de enraizamiento

En determinados genotipos puede resultar necesario realizar una propagación de planta por

enraizamiento in vitro, por ser inviable la propagación vegetativa o la propagación por

semilla.

4.7. Análisis de la viabilidad del polen

Podemos evaluar el porcentaje de viabilidad del polen mediantes distintas técnicas. Además,

esta metodología se puede aplicar en programas de mejora genética dirigida a obtención de

frutas sin semilla, ya que la generación de semillas se puede valorar analizando el polen

antes de que la variedad fructifique, acelerando el proceso de análisis en invernadero.

4.8. Análisis de ploidía

La determinación precoz de la ploidía mediante citometría de flujo permite identificar, en

programas de mejora de plantas, los individuos con diferente grado de ploidía.

4.9. Transformación genética

La transformación genética de plantas consiste en la transferencia de genes foráneos al

genoma de una especie vegetal determinada. Esta técnica es útil para el estudio funcional de

genes específicos o para la producción estable de metabolitos o proteínas en planta.

ValGenetics dispone de la autorización oficial para el uso confinado de OMG, que le permite

implementar la mejora genética de plantas.

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Catálogo de Servicios ValGenetics 2017 15

ÁREA PROYECTOS I+D+i

5. Servicios I+D+i a la carta

Acometemos proyectos de investigación y desarrollo empleando o combinando las

técnicas disponibles en nuestros servicios de diagnóstico fitopatológico, taxonomía

molecular, genética, biotecnología y cultivo de tejidos de plantas. Implementamos

proyectos aplicados a la carta, exclusivos y adaptados a las necesidades de los clientes,

con resultados rápidos y fiables a precios competitivos.

El equipo científico de ValGenetics cuenta con más de 25 años de experiencia científica en

el campo de la biotecnología de plantas, genética y el diagnóstico y control de los

patógenos vegetales. Además, disponemos de un grupo interdisciplinar de asesores

científicos internacionales.

Nuestros laboratorios disponen de medios técnicos para el manejo de metodologías de

investigación científica, desde las clásicas de análisis del material genético y cultivo de

tejidos de plantas hasta las más punteras de genómica (secuenciación masiva),

transcriptómica y proteómica, además de la expresión de sustancias de interés en plantas o

edición de genomas.

Así ofrecemos:

Implementar proyectos adaptados a la problemática agraria planteada y

adaptados a las necesidades del cliente.

Posibilidad de cubrir todos los aspectos del control de patógenos y plagas desde el

diagnóstico del patógeno a la obtención de plantas madres sanas o la protección

del obtentor de nuevas variedades de planta.

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16 Catálogo de Servicios ValGenetics 2017

VALGENETICS S.L.

Agustín Escardino, 9, Parc Científic UV, Edificio 3 CUE

46980 Paterna (Valencia). Tel: +34 663855771 /+34 960059146

[email protected]

www.valgenetics.com

Laboratorio autorizado por el Servicio de Sanidad Vegetal de la Conselleria de

Agricultura, Medio Ambiente, Cambio Climático y Desarrollo Rural (Generalitat

Valenciana) para las actividades amparadas por el RD 58/2005.

ValGenetics dispone de la autorización oficial de la Conselleria de Agricultura Medio

Ambiente, Cambio Climático y Desarrollo Rural para el uso confinado de OMG

expedida por el Comité Valenciano de Control de OMG.

Especialistas en Vida Vegetal