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BIOQUÍMICA II 11/10/2011 Ing. Karla Dávila

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Objetivos

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Contenidos

• Niveles estructurales de una proteína

• Relación entre estructura y función

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Estructura primaria

• La estructura primaria, se refiere al orden de los

aminoácidos en la cadena polipeptídica. La fuerza

estabilizadora de esta estructura es el enlace covalente

(peptídico). En esta estructura se incluye, además de la

• secuencia de aminoácidos, la localización de los

puentes disulfuro (cistina).

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• La importancia de la estructura primaria es tal que una

variación en un solo aminoácido de una cadena

polipeptídica puede determinar una falta letal en la

proteína completa. El ejemplo clásico es el de la

hemoglobina S (HbS) que tiene la sexta posición de la

cadena P ocupada por valina en lugar de glutámico como

la hemoglobina normal (HbAí). Los individuos que tienen

este defecto padecen anemia de células falciformes, con

una elevada hemolisis y obstrucción de capilares por los

eritrocitos anormales.

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Estructura secundaria

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Estructura Terciaria

Existen razones sobradas para pensar que gran parte de

las proteínas tienden a adoptar forma esférica, globular.

Esto sólo puede ocurrir si suponemos que, además del

plegamiento secundario, existe un superplegamiento de la

proteína que da lugar a una estructura compacta. Es la que

se conoce como estructura terciaria de las proteínas. Se

trata de un arreglo tridimensional que forma diversos

repliegues específicos.

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Los tipos de enlaces que estabilizan la estructura terciaria

son:

a) atracción electrostática de tipo salino entre un grupo

carboxilato (-COO-) y un grupo amino (-NH3+) de residuos

glutamato o aspartato con Usina oarginina;

b) puentes de hidrógeno, entre grupos carboxilato,

oxhidrilo (-OH) o los propiosgrupos carbonilo (-C=0) de las

uniones peptídicas;

c) interacción de cadenas polares, como los grupos

aromáticos de la fenilalanina o los no aromáticos de

alanina e isoleucina, etc;

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• d) fuerzas de Van der Waals, cuando los residuos son

idénticos como dos metilos de la alanina, hidroximetilos de

la serina, etc;

• e) puentes disulfuro, que se establecen entre los grupos

sulfhidrilo (-SH) de la cisteína para dar el enlace covalente

disulfuro (-S-S-) entre cadenas vecinas

Las estructuras terciarias de las proteínas permiten

agruparlas en familias y subfamilias; por ejemplo, proteínas

fibrosas de forma alargada y proteínas globulares de

formaesferoidal

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Estructura Cuaternaria

Cuando una proteína se compone de más de una cadena

polipeptídica, se dice que posee estructura cuaternaria. Las

proteínas que poseen este grado de organización estructural se

denominan oligoméricas y las cadenas polipeptídicas

individuales que la integran se denominan monómeros,

protómeros o subunidades. Cuando una proteína oligomérica

contiene dos o cuatro monómeros o subunidades se denomina

dímero o tetrámero, respectivamente. El mejor ejemplo

estudiado es la hemoglobina que es una proteína tetramérica

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Los enlaces que mantienen la estructura cuaternaria son

del mismo tipo que los que mantienen la estructura

terciaria, excepto enlaces covalentes. Por ejemplo, la ot-

quimotripsina contiene tres cadenas polipeptídicas unidas

por enlaces disulfuro y no se considera estructura

cuaternaria. La mioglobina está compuesta por una sola

cadena polipeptídica y no posee estructura cuaternaria.

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Sin embargo, la hemoglobina contiene 4 subunidades

unidas no covalentemente y, por tanto, tiene estructura

cuaternaria. La enzima aspartato transcarbamilasa tiene

una estructura cuaternaria formada por 12 subunidades.

Otros ejemplos incluyen la sintetasa de ácidos grasos, la

piruvato deshidrogenasa,a las cuales se les conoce como

complejos multier>zimáticos o estructuras

supramoleculares

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La estructura cuaternaria está íntimamente ligada a las

propiedades reguladoras de las proteínas, particularmente

en los sistemas llamados alostéricos. En estos sistemas, la

respuesta puede estar afectada por la presencia de

efectores (inhibidores o activadores) que modulan la

acción primaria de la proteína.

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Las estructuras secundaria y terciaria de una proteína

están determinadas por la estructura primaria. Por lo tanto,

no es necesario postular un control genético independiente

para los niveles de estructuración superiores al nivel

primario, puesto que la estructura primaria determina la

secundaria, terciaria y (cuando está presente) la

cuaternaria.

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RELACIÓN ENTRE

ESTRUCTURA Y FUNCIÓN

La actividad biológica de una proteína depende del

ordenamiento tridimensional apropiado de sus grupos

funcionales. De este modo, las proteínas sólo funcionan

cuando están plegadas en su estructura original o

conformación nativa.

Debido a que las conformaciones nativas de la mayor parte

de las proteínas están estabilizadas sólo por enlaces no

covalentes, el plegamiento puede ser alterado por

condiciones como alta temperatura, pH extremo o

presencia de solventes orgánicos que debilitan las

interacciones no covalentes

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Desnaturalización

La alteración de una proteína que modifique su

conformación nativa se denomina desnaturalización; este

cambio provoca la consiguiente alteración o desaparición

de sus funciones. En una proteína se produce la

desnaturalización al perder su estructura secundaria,

terciaria y cuaternaria, conservándose la primaria

(covalente).

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En el estado desnaturalizado los niveles de

estructuración superior de la conformación nativa se

encuentran al azar, es decir la proteína altamente

ordenada queda reducida a un polimero estadístico

formado por una cadena de aminoácidos (Siguiente

figura). La existencia de enlaces disulfuro en una

proteína aumenta su resistencia a la

desnaturalización.

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Agentes desnaturalizantes

Todos aquellos agentes capaces de romper o alterar los

enlaces que mantienen las estructuras de orden superior

de una proteína pueden desnaturalizarla.

Agentes:

- Calor

- Agentes físicos: radiaciones, tensoactividad, altas

presiones)

- Agentes químicos: ácidos, álcalis, urea,detergentes

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Consecuencias de la desnaturalización:

Pérdida drástica de solubilidad

disminución de la viscosidad, velocidad de difusión y facilidad con que cristalizan.

se altera su actividad fisiológica. Por ejemplo, las globulinas plasmáticas desnaturalizadas pierden sus funciones de anticuerpos

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Asignaciones individuales

Proteínas de importancia biomédica

- Hemoglobina y mioglobina: Blanca e itza

- Estructura y función de los anticuerpos: Mariela y Wilmer

- En que consiste la hemostasia:Axel y Milzon

- Glicoproteínas y proteoglicanos: Edwin y Engell

- Colágeno y proteínas contráctiles. todos

Estructura y Función de aminoácidos y proteínas. Todos.

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Seminario sobre estructuras de las proteínas el próximo encuentro 151011.

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