Profesor: José Luis Medina Franco

Diseño de Fármacos Asistido por ComputadoraDepartamento de Farmacia, Facultad de QuímicaDIFACQUIM, UNAMEdificio F, cubículo 309medinajl@unam.mxFacebook (DIFACQUIM, UNAM)

5 de agosto - 22 noviembre, 2019

Lunes y miércoles, 11:30 - 13:00 AM

Salón 402

DIFACQUIM: www.difacquim.com

Proyectos principales

❑ Identificación de compuestos bioactivos

❑ Diseño de fármacos

Publicaciones representativas:Lista competa de publicaciones disponible en: http://publicationslist.org/j.l.medina-franco

❑ Desarrollo de material didáctico para la

enseñanza de la Quimioinformática

❑ Minería de datos - HTS

❑ Análisis quimioinformático de bases de

datos

DIFACQUIMDiseño de Fármacos Asistido por Computadora en la Facultad de Química

Semestre 2020-1

DIFACQUIMInvestigación

www.difacquim.com

Naveja J et al. Molecular Diversity 2018 22:247

Semestre 2020-1

Diseño de Fármacos Asistido por Computadora en la Facultad de Química (DIFACQUIM)

Semestre 2020-1

Ph.D.

Jesús Naveja

Fernando Prieto

Norberto Sánchez

Bárbara Díaz

M.Sc.

Fernanda Saldívar

Alejandro Gomez

Edgar López

B.Sc.

Angélica Pilón

Eurídice Juárez

Marisa Santibáñez

Roberto Hernández

Noemí Durán

www.difacquim.com

Semestre 2020-1

DIFACQUIM

@difacquim

Edificio F, Facultad de Química

Semestre 2020-1

1. ¿Cuál consideras que es el tema central del curso de Química Farmacéutica?

( ) Síntesis orgánica avanzada

( ) Diseño de fármacos

( ) Estrategias para la optimización de moléculas bioactivas

( ) No estoy seguro(a)

( ) Otro(s):

2. Motivación: ¿por qué te inscribiste a esta asignatura optativa?

( ) Me llama la atención el temario

( ) Me ayudará a conseguir un empleo en la industria

( ) Me ayudará a continuar con estudios de posgrado

( ) Recomendación de un compañero(s) y/o profesor

( ) Me interesó el tema por la asistencia a un evento de Química Farmacéutica

( ) Por horario

( ) Porque tiene los créditos que necesito

( ) Otra razón(es):

Presentación del Curso

➢ Temario

➢ Bibliografía

➢ Programa de actividades

➢ Evaluación

➢ Cronograma

Semestre 2020-1

Semestre 2020-1

UNIDADES

1. Consideraciones básicas

2. Desarrollo de fármacos

3. Dianas biológicas - receptores

4. Diseño de compuestos activos basado en el receptor

5. Diseño de compuestos activos basado en el ligando

6. Diseño retrometabólico

7. Fármacos que actúan a través de dianas biológicas

8. Conceptos actuales en diseño y desarrollo de fármacos

Semestre 2020-1

UNIDAD 1: Consideraciones Básicas

• Química farmacéutica

• ¿Qué es un fármaco?

• Clasificación y nomenclatura y de fármacos

• Las tres etapas en la acción de un principio activo

• Fases del desarrollo de fármacos: De un principio activo

hasta un medicamento

Semestre 2020-1

UNIDAD 2: Desarrollo de Fármacos: Descubrimiento de Principios Activos

• Origen de principios activos

o Métodos tradicionales y fuentes naturales

o Ensayos de alto rendimiento (high-throughput screening)

o Química combinatoria

o Métodos computacionales: cribado virtual

o Combinación de estrategias

• Compuestos hit y compuestos líderes

• Modificaciones moleculares a prototipos

• Descubrimiento de principios activos en la Facultad de Química, UNAM

Semestre 2020-1

UNIDAD 3: Dianas Biológicas

• Naturaleza de las dianas biológicas moleculares

• Interacciones moleculares ligando-receptor

• Visualización y modelos moleculares

• Dianas moleculares como sitios de acción de fármacos

Semestre 2020-1

UNIDAD 4: Diseño de CompuestosActivos Basado en el Receptor

• Acoplamiento molecular automatizado: Molecular

docking

• Diseño de novo

• Diseño en base a fragmentos

• Cribado virtual basado en el receptor

• Casos de estudio (presentaciones de alumnos)

Semestre 2020-1

UNIDAD 5: Diseño de CompuestosActivos Basado en el Ligando

• Relaciones (cuantitativas) estructura-actividad: (Quantitative) Structure-Activity Relationships, (Q)SAR

• Relaciones estructura múltiple-actividad (SmAR)

• Panoramas de actividad (activity landscape) y acantiladosde actividad (activity cliffs)

• Similitud molecular

• Búsqueda por famacóforo

• Cribado virtual basado en el ligando

• Casos de estudio (presentaciones de alumnos)

Semestre 2020-1

UNIDAD 6: Diseño Retrometabólico

• Metabolismo de fármacos

• Profármacos

Semestre 2020-1

Semestre 2020-1

Libros de Texto Principales

Semestre 2020-1

Avendaño C. Introducción a la Química Farmacéutica. McGraw-

Hill Interamericana. Madrid, España, 1997

Graham L.P., An Introduction to Medicinal Chemistry, University Press, Oxford, 5th edition, 2013

Wermuth C., The Practice of Medicinal Chemistry, Academic Press Elsevier

Ltd., Third edition, 2008

Libros Complementarios

Semestre 2020-1

Revistas Científicas

• Journal of Medicinal Chemistry

• Bioorganic and Medicinal Chemistry

• European Journal of Medicinal Chemistry

• ChemMedChem

• Medicinal Chemistry Communications

• Future Medicinal Chemistry

• Drug Discovery Today

• Nature Reviews Drug Discovery

• Current Medicinal Chemistry

Semestre 2020-1

Enfoque: revisiones, análsis y comentarios(review articles)

En general, artículosde investigación(original papers)

Semestre 2020-1

Artículos de Divulgación en EspañolPDF de acceso libre*

*www.difacquim.com/español/difusión/

Diseño de Fármacos Asistido por Computadora: Cuando la Informática,

la Química y el Arte se Encuentran

Actividades

• Exámenes escritos de las unidades 1-7

• Participaciones en clase

– Resumen de clase anterior, tareas

• Presentaciones orales

• Desarrollo de guías de estudio para las unidades 1-5

Semestre 2020-1

Guías de Estudio de Referencia

Semestre 2020-1

https://quizlet.com/indishking__/folders/quimica-farmaceuticaMario Omar GarcíaSemestre 2016-1

Héctor Hernández Parra Semestre 2016-1

David HernándezSemestre 2016-1

https://www.goconqr.com/es/p/2694031Betsabé GómezSemestre 2015-2

Criterios de Evaluación (Teoría)*

Semestre 2020-1

Actividad Criterio de evaluación % Calificación final de teoría

Exámen parcial (EP) 1: Unidades 1 y 2 Porcentaje de aciertos 25%

EP 2: Unidades 3 y 4 Porcentaje de aciertos 25%

EP 3: Unidades 5 - 7 Porcentaje de aciertos 25%

Presentación oral de casos de estudio • Contenido y calidad de la presentación oral• Claridad para transmitir los conocimientos• Conocimentos para contestar preguntas

15%

Guías de estudio • Contenido• Calidad de la presentación final

5%

Participaciones en clase Porcentaje de participaciones correctas 5%

Total (teoría)** 100%

**60 % de la calificación final del curso

Criterios de Evaluación

➢ Calificación mínima para aprobar teoría: 6.0

➢ No se presentan exámenes ordinarios (A, B) si se cumple:

– La calificación de teoría es ≥ 6.0

Y

– Se aprueban con mínimo 6.0 los tres exámenes parciales

Semestre 2020-1

Criterios de Evaluación

• Calificación final de Química Farmacéutica

– Teoría: 60%

– Laboratorio: 40%

• Para escribir la calificación en actas:

Semestre 2020-1

Intervalo Calificación

oficial

de 0 a 5.99 puntos 5

de 6.0 a 6.59 puntos 6

de 6.60 a 7.59 puntos 7

de 7.60 a 8.39 puntos 8

de 8.40 a 9.39 puntos 9

de 9.40 a 10 puntos 10

Semestre 2020-1

16 semanas30 sesiones (45 horas)

2 días de clase inhábiles:16 septiembre y 18 noviembre (Lun)

Semestre 2020-1

Unidad Fecha (2016) No. clases Actividad de alumnos(as)

1 5 - 7 ago 2 Introducción al curso y Unidad 1

2 12 - 26 ago 5

28 ago (Mie) 1 *Examen parcial 1 (Unidades 1 y 2)

3 2 - 18 sep 5 Incluye 1 sesión de presentaciones

4 23 sep - 7 oct 5 Incluye 1 sesión de presentaciones

9 oct (Mie) 1 *Examen parcial 2 (Unidades 3 y 4)

5 14 - 23 oct 4 Incluye 1 sesión de presentaciones

6 28 oct 1

30 oct (Mie) 1 *Examen parcial 3 (Unidades 5-7)

7, 8 4 oct – 13 nov 5 Presentaciones

20 noviembre -- Entrega de calificaciones

*Las guías de estudio se entregan el día del examen parcial

Fechas tentativas de cada unidad