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Mark F. Sanders John L. Bowman
G E N E T I C A N I N T E G R A T E D A P P R O A C H A N A LY S I S
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RNA Processing
Nucleótidos
DNA
Azúcar deoxiribosa
Grupo fosfato
Azúcar ribosa
Grupo fosfato
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Estructura del RNA
Los azúcares similares de RNA y ADN conducen a la formación de enlaces de azúcar-fosfato casi idéntico en las moléculas de RNA y DNA por la formación de enlaces fosfodiéster entre el terminal 5 fosfato de un nucleótido y el hidroxilo 3 del otro nucleotido.
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Sintesis RNA
RNA polimerasa
Cataliza la adicion de cada ribonucleotido al terminal 3 de la cadena en crecimiento y forma los enlaces fosfodiester entre los nucleotidos
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RNA’s
mRNA- Messenger RNA
es producida por los genes que codifican para proteínas y es un intermediario de vida corta entre el ADN y la proteína
Se traduce
No se traduce, tiene rol funcional
se codifican en docenas de formas y transportan aa para su inclusión durante la síntesis de la proteína.
rRNA- Ribosomal RNA
Se combina con numerosas proteinas para formar los ribosomas
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Otros RNAs
Small nuclear RNA (snRNA)
Son de varios tipos
se encuentra en el núcleo de los eucariotas y desempeña un papel en el procesamiento del mRNA
Micro RNA (miRNA)
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Cont RNAs
Small interfering RNA (siRNA)
protege las células de animales y plantas de la producción de virus y el movimiento de transposones
Ribozymes
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8.2 Transcripción bacteriana
La transcripción es la síntesis de una molécula de RNA por parte de la RNA polimerasa
Molde es DNA (template strand)
Sintesis de cadena de ribonucleotidos (RNA) a base de complementaridad y antiparalela
la hebra codificante de DNA es la cadena nontemplate, es complementaria a la hebra molde
cadena nontemplate/ / cadena molde (template)
cadena RNA/ / cadena molde (template)
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Estructura del Gen
El gen contiene varios segmentos con distintas funciones.
El promotor es una secuencia consenso en el DNA que esta inmediatamente upstream (5) hasta el lugar de inicio de la transcripción, conocida como el nucleótido 1
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Estructura del Gene, cont.
La región codificante del gen es la porción que contiene la información necesaria para sintetizar el producto de la proteína
La región de terminación del gene regula el cese de la transcripción.
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Pasos esenciales transcripción en E. coli
Reconocimiento del promotor
RNA Polimerasa
polimerasa del RNA bacteriano,
enzima pentamérica, core enzyme (2 subunidades, & ) que se une a una sexta subunidad (sigma (),
Core: transcribe RNA usando el templado de DNA, pero no se puede enlazar al promotor ni iniciar la sintesis de RNA sin la subunidad sigma (
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Promoter (Secuencia Consenso)
written in single-stranded shorthand form, 5 to 3 on the coding strand
At the 10 position is the Pribnow box, or 10 consensus sequence, 5-TATAAT-3
At 35 is a 6-bp region, the 35 consensus sequence, 5- TTGACA-3
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Iniciacion Transcripcion
Dos pasos
La holoenzima se asocia debilmente (“loose attachment”) a la secuencia del promotor para formar un complejo cerrado (closed promoter complex). La holoenzima desenrrolla aproximadamente 18 bp de DNA alrededor de la posición -10 para formar el promotor abierto (the open promoter complex).
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Alargamiento y Terminacion Transcripcion
La holoenzima inicia la síntesis de ARN en el sitio +1 y permanece intacta hasta que se han incorporado los primeros 8 a 10nucleótidos de RNA. La subunidad sigma se disocia de la enzima.
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Terminacion de la Transcripcion
Cuando termina la transcripción del gen la holoenzima se disocia del ADN y poco después se inicia una segunda ronda.
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Mecanismos TerminacionTranscripcion
Terminacion intrinseca
Comun en bacterias
mecanismo dependiente de la prescencia de una secuencia (repeat) que induce la formacion de una estructura secundaria que provoca la terminacion
El mRNA que se transcribe forma estructura en forma de pinche (stem-loop structure) que provoca la desestabilizacion de la holoenzima.
Terminacion dependiente de rho (rho-dependent)
requiere una secuencia de terminacion diferente y la presencia de una proteina, rho.
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