programas de cribado neonatal encuentros 2006 fundación sira carrasco dra. teresa casals
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PROGRAMAS DE CRIBADO NEONATAL PROGRAMAS DE CRIBADO NEONATAL
Encuentros 2006Fundación Sira Carrasco
Dra. Teresa Casals
MarcadoresMarcadores
TIR1 cut-off buena sensibilidad
reducir detección de portadores
DNA aumenta sensibilidad ≥ 80%
TIR2 aumenta especificidad
ESCRIBA CON LAPIZ
NOMBRE Y APELLIDOS
PAP reduce tiempo vs DNA
neonatos para estudio genético ~ 0,5%
Estrategias en los PCNEstrategias en los PCN
TIR1 / F508del / TIR2
TIR1 / DNA / T. sudor
TIR1 / DNA (3 mutac.) / T. sudor (Suecia)
TIR1 / DNA (20 mutac.) / TIR2 / T. sudor
(Francia)
TIR1
TIR1 / TIR2 / T. de sudor
TIR1 / TIR2 / DNA / T. de sudor
Castilla y LeónCastilla y LeónTIR / DNA / UTIR / DNA / U 1/ 1/
4.0834.083
CataluñaCataluña TIR1 / TIR2 / DNA / UTIR1 / TIR2 / DNA / U 1/ 1/
5.4575.457
BalearesBaleares TIR1 / DNA / UTIR1 / DNA / U 1/ 1/
4.4334.433
GaliciaGalicia TIR1 / TIR2 / DNATIR1 / TIR2 / DNA / U / U 1/ 1/
10.23210.232
ExtremaduraExtremadura TIR1 / TIR2 / DNA / UTIR1 / TIR2 / DNA / U
AragónAragón TIR1 / DNA / TIR2, UTIR1 / DNA / TIR2, U
MadridMadrid TIR / DNA TIR / DNA vsvs TIR / PAP TIR / PAP
MurciaMurcia TIR1 / TIR2 / DNA / UTIR1 / TIR2 / DNA / U
RESUMENRESUMEN
PROGRAMA DE CRIBADO PROGRAMA DE CRIBADO NEONATAL EN CASTILLA Y NEONATAL EN CASTILLA Y
LEÓNLEÓN
Juan José Tellería [email protected]
Muestra de sangre en papel de filtro
Nivel de T.I.R.
negativo< 70 ng/ml
positivopositivo>70ng/ml
Estudio secuencial de mutaciones CFTR (> 80% de alelos)
Estudio secuencial de mutaciones CFTR (> 80% de alelos)
0,9%
Estudio % acumuladoF508del 61,10MultiA (11,14b,17b) 73,58Exón 7 78,44Exón 12 81,09Exón 13 83,74
Estudio secuencial de mutaciones CFTR (> 80% de alelos)
Estudio secuencial de mutaciones CFTR (> 80% de alelos)
Capacidad de detección de mutaciones en enfermos FQ
Ambos alelos 70,12%Un alelo 27,24%Ningún alelo 2,64%
Estudio secuencial de mutaciones CFTR (> 80% de alelos)
2 mutacs. 1 mutac. No mutac.
negativo
Test del sudor
positivo
confirmación
positivo negativo
diagnóstico
-Consejo genético yestudio de los padres.-Seguimiento???
2,6% de positivosa TIR
Test del sudor
92,1% de positivosa TIR
1999 - 2005
Muestras estudiadas : 126.578
IRT>70 ng/mL 1.207 (0,95%)
Enfermos FQ 31 (1/4.083)
Portadores 64 (1/18,9%)*
* De las muestras IRT>70 ng/ml
Enfermos Mutaciones
10 F508del HOMOCIGOTOS (33%)
16* F508del + OTRAS (50%)
5 NO F508del EN NINGÚN ALELO (17%)
Frecuencia alélica de F508del* 58,3%
* 2 de ellos fueron gemelos monocigotos. Para calcular las frecuencias alélicas se consideraron como un solo caso
PROGRAMA DE PROGRAMA DE CRIBADO NEONATAL EN CRIBADO NEONATAL EN CATALUÑACATALUÑA
Antoni Maya [email protected]
MARCADORES MÁS UTILIZADOS EN LA DETECCIÓN NEONATAL DE F.Q.
Estudio de la TIR (bioquímico) TIR
Estudio del DNA (mutacional) DNA
Estudio combinado (TIR+DNA) +TIR DNA
Programa de Cataluña TIR ± TIR ± DNA
DETECCIÓN (-)DETECCIÓN (-)
TIR-1TIR-1
TIR-1 > 120 NG/MLTIR-1 > 120 NG/MLTIR-1 < 120 NG/MLTIR-1 < 120 NG/ML
PETICIÓN 2ª MUESTRAPETICIÓN 2ª MUESTRA
CRIBADO NEONATAL F.Q.CRIBADO NEONATAL F.Q.
TIR-2TIR-2
TIR-2 > 60 NG/MLTIR-2 > 60 NG/MLTIR-2 < 60 NG/MLTIR-2 < 60 NG/ML
DETECCIÓN (+)DETECCIÓN (+)
31 MUTACIONES CFTR 31 MUTACIONES CFTR
NO MUTACIÓNNO MUTACIÓN 2 MUTACIONES2 MUTACIONES
ESTUDIO DEL GEN CFTRESTUDIO DEL GEN CFTR
1 MUTACIÓN1 MUTACIÓN
DETECCIÓN (-)DETECCIÓN (-)
(2-5 días)
SIN TIR-1SIN TIR-1
(25-40 días)
SIN TIR-2SIN TIR-2
PROTOCOLOPROTOCOLO
SIN 1-2 TIRSIN 1-2 TIR
TEST DEL SUDORTEST DEL SUDOR
Cl < 60 meq/LCl < 60 meq/L Cl > 60 meq/LCl > 60 meq/LNO MUTACIÓNNO MUTACIÓN
NO PROTOCOLONO PROTOCOLO
2 MUTACIONES2 MUTACIONES
FENOTIPO FQFENOTIPO FQ
1 MUTACIÓN1 MUTACIÓN
PROTOCOLO DE CRIBADO NEONATAL DE LA FIBROSIS QUÍSTICA EN CATALUÑA
U. Cribado1U. Genética 1
U. Clínicas3Centros maternales 71
CASOS FUERA DE PROTOCOLO
Muestra < 48 horas 31
Muestra insuficiente 25
Pretérmino 13
Transfusión 13
Íleo meconial 8
Sin muestra 8
Sin TIR1 Sin TIR2
Muestra > 40 días
272
Sin muestra
9
Antecedentes
familiares 5
Ingreso hospitalario
3
Íleo meconial
1
n = 290
CAUSAS QUE INVALIDAN LA DETERMINACIÓN DE TIR
n = 98
Recién nacidos analizadosPositivos TIR-1Estudios genéticos realizados • Por protocolo TIR-1 y 2 (+) • Por fuera de protocoloNº recién nacidos con mutación
CF confirmadas
Frecuencia
1/2.236
1/5.457
Númerocasos
371.134 5.402 1.718 1.468
250 166
68
% sobre la muestra
100,00 1,45 0,46 0,39 0,06 0,044
0,018
RESULTADOS DEL CRIBADO NEONATAL DE FIBROSIS QUÍSTICA EN CATALUÑA
Período evaluado : 09/1999 a 12/2004
Recién nacidos analizados hasta 31/12/2005 = 452.430
ESTUDIO GENÉTICO
Muestras CF / CF
1.718 33
A) PCR / OLA 31 mutaciones
FQ Portador
29 CF / CF3 CF / -
70
CF/variante
31
CF / -
133
B) Análisis completo gen CFTR
ESTUDIO CLÍNICO EN LOS CASOS DIAGNOSTICADOS DE FQ. (n=68) Septiembre 1999-Diciembre 2004
TEST DEL SUDOR MANIFESTACIONES CLÍNICAS
Íleo meconial 10 15
Insuf. pancreática 39 60
Cultivo + (Ps. y St.) 33 51
Asintomáticos 2 3
Íleo meconial 10 15
Insuf. pancreática 39 60
Cultivo + (Ps. y St.) 33 51
Asintomáticos 2 3
%Casos
GenotipoT. sudor +T. sudor -
CF/CF -
CF/- 32 101
33
DIAGNÓSTICO TARDÍO
“ABANDONO DEL PROGRAMA”
1 Población magrebí [L227R] + [L227R]
1 Prematuro gemelar [F508del] + [F508del]
“FALSO NEGATIVO”
1 neonato TIR1 96ng/ml [F508del] +
[F508del]
COSTES DEL CRIBADO NEONATAL DE LA FIBROSIS QUÍSTICA
Estimación sobre 80.000 recién nacidos/año y protocolo TIR±TIR±DNA
Cribado bioquímico:
Detección individual de FQ 6 €
Detección conjunta PKU+HC+FQ 3 €
Cribado genético (coste por muestra analizada):
A) PCR / OLA 31 mutaciones 67 €
B) Análisis completo gen CFTR 901 €
GENOTIPOS CF/CF EN 65 AFECTADOS
F508del / F508del 17 F508del / 1078delT 1
F508del / G542X 5 F508del / 296+3insT 1
F508del / N1303K 4 F508del / F587I 1
F508del / L206W 3 F508del / A561E 1
F508del / Q890X 2 F508del / 3849+1G>A 1
F508del / E92K 2 F508del / W1089X 1
F508del / R1066C 2 G542X / R553X 1
F508del / 2183AA>G 2 N1303K / R334W 1
F508del / 1811+1,6kbA>G 1 N1303K / L206W 1
F508del / 2789+5G>A 1 N1303K / 3272-26A>G 1
F508del / R347H 1 1811+1,6kbA>G / 2711delT 1
F508del / R347P 1 711+1G>T / L206W 1
F508del / 2752-26A>G 1 R347P / 2183AA>G 1
F508del / 1812-1G>A 1 I507del / 1677delTA 1
F508del / A1006E, 5T 1 I507del / Q890X 1
F508del / 3272-26A>G 1 L227R / L227R 1
F508del / ? 3 F508del / CFTRdel20 1
F508del / - 43 1609delCA / - 1
R117H / - 7 S549R / - 1
G542X / - 4 G85E / - 1
711+1G>T / - 3 I507del / - 1
R334W / - 2 W1282X / - 1
2183AA>G / - 2 R347H / - 1
R1162X / - 1 1078delT / - 1
2789+5G>A / - 1
GENOTIPOS EN PORTADORES
15 Genotipos / 70 portadores
F508del / 5T 9 F508del / Y1014C 1
R117H / 5T 1 R117H / R1162L 1
2789+5G>A / 5T 1 R117H / R170H 1
F508del / 1716G>A 4 R117H / Q1352H 1
F508del / R75Q 2 G542X / A120V 1
E725K / R75Q 1 S549R / S1235R 1
F508del / L997F 2 R334W / L967S 1
R117H / L997F 1 N1303K / F1052V 1
G85E / L997F 1 W1282X / R74Q 1
GENOTIPOS CF / VARIANTE
18 Genotipos / 31 neonatos
PROGRAMA DE PROGRAMA DE CRIBADO NEONATAL EN CRIBADO NEONATAL EN BALEARESBALEARES
Jordi Rosell [email protected]
MallorcaMallorca
Centros saludCentros salud
MaternidadesMaternidades
PadresPadres
Laborat.Carmen
Laborat.Carmen
Conselleria de Salut i Consum
Registro
Conselleria de Salut i Consum
Registro
HUSDLaborat. Neonatal
Análisis TIR
HUSDLaborat. Neonatal
Análisis TIR
MenorcaCentro Insular Conselleria
I biza-FormenteraCentro Insular Conselleria
ResultadosPositivos
Resultadosnegativos
Pediatria HUSDLaboratorioInforme final
TIR < 60 ng/mL
TIR > 60 ng/mL
(Repetida por duplicado)
Genética
Estudio mutaciones
Gabinete pediatria
Aviso padres
Test de sudor
Mutaciones y test de sudor normal
Presencia de mutaciones y/o test de sudor patológico
2001 2002 2003 2004 2005
Recién nacidos
9858 10420 10655 10792 > 11000
Analizados 917893%
973693%
1042697%
1056098%
11000 ?
?
Estudio molecular
37 36 32 52 60 / 15
Portador 3 2 2 2 4
Afecto 3 4 1 1 1
2001-04
41725
39900
95 %
157
9
9
1 / 4.636
COSTE
TIR 2,50 €
ESTUDIO MOLECULAR 62 €
TEST SUDOR 25 €
TIR 27500 € MOLECULAR 6820 €TEST SUDOR 2750 €TOTAL 37070 €Sobre 11000 / 1 % (+)
PROGRAMA DE PROGRAMA DE CRIBADO NEONATAL EN CRIBADO NEONATAL EN GALICIAGALICIA
Estudio Piloto Detección Precoz Fibrosis Quística
• InicioAño 2003 como Programa Piloto. Aprobado por el Comité de Investigación Clínica
de Galicia.
• Área de CoberturaGalicia
• Tasa de Cobertura98,7% de los recién nacidos vivos
• Método de cribadoDeterminación de tripsinógeno en sangre por Inmunofluorescencia (AutoDelfia)
• Método confirmación Cloro en sudorPotenciometría con dilución (3100 SWEAT-CHEK)
• Métodos confirmación genética– INNO-LIPA– Secuenciación completa gen CFTR
Resultados y Prevalencia en Cribado Neonatal
2003 2004 2005 Total Frec.
Niños analizados
19.91120.42
421.05
761.39
298,7%
Tripsinógeno elevado 1ªmuestra
139 154 164 457 0,74%
Tripsinógeno elevado 2ªmuestra
-- 28 56 84 0,20%
Estudio genético
105 24 49 178
Portadores 5 4 s/d 9 1:4.482
Fibrosis Quística
2 2 2 61:10.23
2
Comparación una muestra con doble muestra
Una única muestra
(2003)
Doble muestra
(desde 2004)
Precisión 99,27% 99,81%
Sensibilidad* 100% 100%
Especificidad 99,27% 99,81%
Valor predictivo positivo 0,013 0,048
Valor predictivo negativo* 1 1
Ratio probabilidad positiva 136,11 518,46
* No valorable, hasta ahora ningún caso falso negativo
Determinación de tripsinógeno
en sangre
NORMAL
Solicitud de2ª muestra
Mutaciones CFTR
Cloro en sudor
F. QUÍSTICAposible
F. QUÍSTICAConfirmada
<70 ng/mL>69 ng/mL
>39 ng/mL
<40 ng/mL
>60 mEq/L
<40 mEq/L
positivo
negativo
>39 mEq/L
Protocolo de Cribado Inicial
Resultados y Prevalencia en Cribado Neonatal
2003 2004 2005 Total
Niños analizados
19.91120.42
421.05
761.39
298,7%
Tripsinógeno elevado 1ªmuestra
139 154 164 457 0,74%
Tripsinógeno elevado 2ªmuestra
-- 28 56 84 0,20%
Estudio genético
105 24 49 178
Portadores 5 4 s/d 9 1:4.482
Fibrosis Quística
2 2 2 61:10.23
2
Casos positivos Cribado
AñoTIR
ng/mL
Cl
mEq/LAlelo 1 Alelo 2
2003 76 elevado ? ?
2003 177 elevado DF508 ?
2004 96 76 DF508 R334W
2004 105 81 DF508 R1162X
2005 223 >100 DF508 2176insC
2005 76 60 711+1G->A V232D
Resultados en CribadoMutación 2003 2004 2005 TotaldeltaF508 2 3 1 6L997F 1 2 3R334W 1 1 2R668C 2 22176InsC 1 1711+1G->A 1 1D1270N 1 1F1052V 1 1G576A 1 1I148T 1 1I807M 1 1L206W 1 1L967 1 1L967S 1 1M952I 1 1R1162X 1 1R74W 1 1R75Q 1 1S42F 1 1V232D 1 1Y1014C 1 1TOTAL 18 8 4 30
Determinación de Tripsinógeno
en sangre
NORMAL
Mutaciones CFTR Cloro en sudor
F. QUÍSTICAPosible
Secuenc. Seguim,...
F. QUÍSTICAConfirmada
<70 ng/mL>69 ng/mL
>39 mEq/L
Un alelo
Protocolo de Cribado Actual
Negativo
Positivo
Dos alelos
<40 mEq/L
Panel de mutaciones Cribado Neonatal Galicia
711+3A-T 3849+10KbC-T E585X L206W R347P1078delT 3849+4G E60X L558S R352Q1154insTC 3860ins31 E692X L571S R553X1609delCA 3876delA E92K L967S R560T1717-1A 3905insT F1052V L997F R668C1717-8G-A 394delTT F1074L M1101K R709X1811+1.6kbA-G 4005+1G-A F316L M952I R74W1812-1G-A 405+1A F508C N1303K R75Q1898+1A 405+3C G1244E P205S R851X1898+3A-G 621+1G-T G178R P5L S1045Y1949del84 711+1G-T G314E POLI-Tn S1235R2143delT 711+5G-A G330X Q1100P S1251N2176insC 712-1G-T G480C Q1281X S42F2183AA-G 875+1G-A G542A Q1313X S549N2184delA 936delTA G542X Q30X S549R2184insA A1006E G551D Q493X T351S2603delT A120T G576A Q552X T582R2789+5G-A A455E G673X Q890X V232D2869insG A559T G85E R1066C V520F3120+1A A561E G85V R1158X W1089X3199del6 D1152H H199Y R1162X W1282X3272-26A-G D1270N I148T R117C Y1014C3601-111G-C del2,3_21kb I807M R117H Y1092X3659delC DELTAF508 K710X R334W Y122X3667del4 DELTAI507 L1065R R347H Y1381X
Valoración final
• Detección precoz fiable con alta especificidad y sensibilidad, aunque parece admitir mejora con la determinación simultánea de PAP y tripsinógeno
• Económico. Mismo precio que la determinación de TSH.
• Rápido. Resultados en el día en el caso de tripsinógeno y al mes en el cribado genético.
• Beneficio del diagnóstico precoz, previo a la aparición de sintomatología: Prevención de malnutrición, infecciones, etc.
Mutaciones localizadas en 82 casos FQ seguidos en Galicia
• 21 casos sin identificar ninguna mutación
• 21 casos homocigotos DeltaF508
• 7 casos ausencia DeltaF508
Mutación Cantidad %DeltaF508 74 45%G542X 5 3%R1162X 3 2%2176insC 2 1%621+1G>T 2 1%G85E 2 1%R1066C 2 1%V232D 2 1%Y1381X 2 1%5T-12TG-V470 1 1%685E 1 1%711+1G>A 1 1%711+1G>T 1 1%7Tn9Tn 1 1%9T-10TG-M470 1 1%D1270N 1 1%G85V 1 1%IVS8CA 1 1%R334W 1 1%R74W 1 1%Y1092X 1 1%Desconocido 58 35%
Total 164 100%
PROGRAMA DE CRIBADO PROGRAMA DE CRIBADO NEONATAL EN NEONATAL EN EXTREMADURAEXTREMADURA
Jesús María Remón Alvarez-Arenas [email protected]
TOMA DE MUESTRA DE SANGRE DE TALÓN
ENVÍO A LA COORDINACIÓN PARA REGISTRO
LABORATORIO - VALORACIÓN DE LA IRT (¿?)
< 70 ngr./ml. > 70 ngr./ml.
Sale del Programa Nueva muestra
< 70 ngr./ml. > 70 ngr./ml.
Test de sudor Estudio de mutaciones(33 mut. y polimorfismos)
POBLACIÓN Y RESULTADOS
2003 2004 2005
1ª IRT normal
8.576 9.087 8.795
1ª IRT NO normal
51 50 47
2ª IRT normal
47 37 35
Confirmar estudio
4 13 12
PROGRAMA DE CRIBADO PROGRAMA DE CRIBADO NEONATAL EN ARAGÓNNEONATAL EN ARAGÓN
Mª Teresa Calvo [email protected]
TIR a partir de las 48 h.
Mutaciones CFTR
No mutación
TIR día 21
< 40 ng/l > 40 ng/l
Unidad FQ
Test sudor elevadoTest sudor normal
Fibrosis Quística
Protocolo
repetir
INFORME
< 60 ng/l> 60 ng/l
< 60 ng/l
> 60 ng/l INFORME
INFORMEINFORME
2 mutaciones1 mutación
Muestras estudiadas: 408
30 (7%)
300 (74%)
78 (19%)
No mutación
una mutación
dos mutaciones
Mutaciones CFTR
MutaciónMutación Número (%)Número (%)
p.F508del 75 (58,14)
p.G542X 12 (9,30)
p.L206W 8 (6,20)
p.N1303K 7 (5,43)
p.I507del 7 (5,43)
c.1609delCA 5 (3,88)
p.S549R 2 (1,55)
p.Q890X; c.712G>T; c.2789+5G>A; c.1811+1,6kbA>G; c.71+1G>A; c.2184insA; c.1716G>A; p.Y1092X; p.I148T; p.R347P; c.1717 1G>A; c.3272- 26A>G; p.R117H
1 (0,78)
Mutaciones CFTR
Prevalencia estimada: 1/5.109
R.N. con FQ: 2-3/año
Portadores: 374 RN
Costo de la prueba: 3 €
PROGRAMA DE PROGRAMA DE CRIBADO NEONATAL EN CRIBADO NEONATAL EN
MADRIDMADRID
Elena Dulín [email protected]
Cribado Neonatal FQ en la CM
ACTUALMENTE: No se realiza
PREVISIÓN FUTURA: Realizar estudio piloto durante al menos seis meses (35.000 RN)
OBJETIVO: Prevalencia y Oportunidad de Incorporación
TIR >55 g/dL sangre
Normal TIR >65 g/dL sangre
Confirmar (2x) en la misma muestra
M/M M/X
TEST DEL SUDOR
Anormal (> 60 mEq/L) Normal
SEGUIMIENTO ENFERMEDAD
CONSEJO GENÉTICO M/X
X/X
TIR< 55 g/dL sangre
Muestra >48 horas W#903
Control 21 días (S&S)
TIR< 40 g/dL sangre
TIR> 40 g/dL sangre
Estudio del gen CFTR
LAB. DETECCIÓN
LAB. BIOLOGÍA MOLECULAR
Unidad SEGUIMIENTO
(40-59 mEq/L)
SEGUIMIENTO 3, 6 Y 12 MESES
l'AFDPHE
TIR >55 g/dL sangre
Normal TIR >65 g/dL sangre
Confirmar (2x) en la misma muestra
M/M M/X
TEST DEL SUDOR
Anormal (> 60 mEq/L) Normal
SEGUIMIENTO ENFERMEDAD
CONSEJO GENÉTICO M/X
X/X
TIR< 55 g/dL sangre
Muestra >48 horas W#903
Control 21 días (W#903)
TIR< 40 g/dL sangre
TIR> 40 g/dL sangre
Estudio del gen CFTR
LAB. DETECCIÓN
LAB. BIOLOGÍA MOLECULAR
Unidad SEGUIMIENTO
(40-59 mEq/L)
SEGUIMIENTO 3, 6 Y 12 MESES
204.749 RN
1177 (0.58%)
45 (4%) 116 (10%) 1028 (86%)
43 (89.5%)
48 = 1: 4266
TIR >50 g/dL y PAP >1.0 ng/mL
Normal
TEST DEL SUDOR
Anormal (> 60 mEq/L) Normal
SEGUIMIENTO ENFERMEDAD
Muestra >48 horas S & S LAB. DETECCIÓN
Unidad SEGUIMIENTO
(40-59 mEq/L)
SEGUIMIENTO 3, 6 Y 12 MESES
TIR <50 g/dL y PAP <1.0 ng/mL
0.72%
TIR >50 g/dL y PAP >1.8 ng/mL TIR >100 g/dL y PAP >1.0 ng/mL
0.24%
Resumen
204.748 TIR (65) / ADN TIR(50) / PAP
TIR 1177 (0.58%) 3890 (1.89%)
CFTR
2 Mutaciones
1
0
TIR 21 días
45 (3.8%)
116 (9.8%)
1028 (87.3%)
111 (10.8%) TIR (1x) TIR(2x)
Test sudor 224 (0.11%) 501 (0.25%) 329 (0.16%)
FQ 48 48
1.- A Munck el al. Archives de Pediatrie 12 (2005):646-6492.- J Sarles el al. J Pediatr 2005;147:302-5
Coste Estimado
100.000 Precio Unitario (€) TIR / ADN TIR / PAP
TIR 2.5 (100%) 250000 250000
CFTR 120 (0.58%) 69600 2600
PAP 4.5 (1.89%)) - 18000
Test sudor 46 (0.11%- 0.25%) 5000 11500
TIR 21 días 23 (0.5%) 11500
Seguimiento 400 (0.4%) 16800
Total (€) 352900 282100
1.- A.Munck el al. Archives de Pediatrie 12 (2005):646-6492.- J Sarles el al. J Pediatr 2005;147:302-5
Estudio Piloto......
ESTUDIO ANÓNIMO NO RELACIONABLE: 35000 RN
CENTRO CRIBADO NEONATAL DE LA CM: HGUGM• Medición de TIR y PAP
BIOLOGÍA MOLECULAR: HGUGM• kit: CFTR19 y CFTR17+Tn
COMPARAR ESTRATEGIAS: TIR/ADN versus TIR/PAP
CONSENTIMIENTO INFORMADO ADN
PROGRAMA DE PROGRAMA DE CRIBADO NEONATAL EN CRIBADO NEONATAL EN MURCIAMURCIA
Asuncion Fernandez Sanchez [email protected]
Protocolo Propuesto
Muestra sangre papel filtro (3-6 días), nivel IRT
Positivo Negativo
FQ (Unidad)
Est. Mut. en CFRT, kit 31 mut +A1006E + K710X
Positivo
Solicitar 2ª muestra, <20 – 30dias
> cut-off
< cut-off
> cut-off
Otras: D-HPLC, secuen, MLPA,
1 mut2 mut Sin mut
Negativo
< cut-off
normal
Test sudor
Heterocigoto/ AsesorGenético
mut
+
-
MUTACIONES Nº cromosomas % Nº pacientes %
F508del * 50 34.2 40 54.8
G542X * 18 12.3 17 23.3
L206W 8 5.5 7 9.6
K710X 6 4.1 5 6.8
A1006E + 5T 5 3.4 5 6.8
N1303K * 4 2.7 4 5.5
2869insG 4 2.7 4 5.5
G85E * 4 2.7 2 2.7
3849 + 10kbC>T * 4 2.7 4 5.5
1811+1.6bkA>G 3 2.05 3 4.1
R334W * 3 2.05 3 4.1
2789 + 5G>A * 2 1.4 2 2.7
21833AA>G * 2 1.4 2 2.7
Q890X 2 1.4 2 2.7
711+1G>T * 2 1.4 2 2.7
No encontrado 9 6.2 7 9.6
No hecho 6 4.1 3 4.1
• Incluidas en el KitPCR-OLA V3 de Abbott
RESULTADOS
El Kit PCR-OLA V3 (Abbott) incluye únicamente el 42.1% (16/38) de las mutaciones halladas en la población murciana y permitiría diagnosticar (por encontrar las 2 mutaciones) el 57.5% de los pacientes.
Mutaciones de FQ relativamente frecuentes en Murcia no incluidas en el kit PCR-OLA V3 (Abbott)
• L206W: 7 pacientes (1 homozigoto)• A1006E: 5 pacientes• K710X: 5 pacientes (1 homozigoto)• 2869insG: 4 pacientes• 1811+1.6kbA>G: 3 pacientes
Análisis económico: presupuesto
Número Coste total euros (ptas)
1ª IRT 19.000 recién nacidos 40.000
(6.655.440)
2 ª IRT 800* (400pacientes)
(análisis por duplicado)
1.600
(266.218)
ADN
- extracción-Kit (30 mut)-D-HPLC/secuenciación
100
100
15
100 (16.700)
1.000 (167.000)
1.500 (250.000)
TOTAL 44.200
(7.355.358)
Se precisa la incorporación de 2 TEL (48.898 euros) y un auxiliar administrativo al Centro de Bioquímica y Genética Clínica (21. 429 euros)
Total coste programa 114. 527 eurosTotal coste por paciente FQ (¿frecuencia?)