Son moléculas que tienen dos anillos bencénicos (ó aromáticos, para los químicos orgánicos) unidos a través de una cadena de tres átomos de carbono, puesto que cada anillo bencénico tiene 6 átomos de carbono, los autores los denominan simplemente como compuestos C6C3C6.

Para su estudio sistemático los más de 4000 flavonoides naturales se han clasificado en varias clases de acuerdo con las variantes estructurales que presenta la cadena central C3.

Los flavonoides pueden ser dividos en 4 grupos mayores: Las flavonas, los flavonoles, las antocianinas y las catecinas.

- Las flavonas son caracterizadas por una estructura plana a causa del doble enlace presente en el centro del anillo aromático. Uno de los flavonoides mejor descritos, la quercetina, es miembro de este grupo. La quercetina se encuentra de manera abundante en cebollas, manzana, brócoli y cerezas. - Los flavonoles son mayormente encontrados en las frutas cítricas.- Las catecinas son encontradas principalmente en el té verde, el té negro y el vino rojo.- Las antiocianinas se pueden hallar en fresas, cerezas, uvas, vino y té.