presentación de powerpoint · biltong = carne disecada de animales domésticos y salvajes de...

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Universidad Nacional de La Plata, Facultad de Ciencias Veterinarias, Instituto de Genética Veterinaria IGEVET

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  • Universidad Nacional de La Plata, Facultad de Ciencias Veterinarias, Instituto de Gentica Veterinaria

    IGEVET

  • Universidad Nacional de La Plata, Facultad de Ciencias Veterinarias, Instituto de Gentica Veterinaria

    IGEVET

    Si voy a ser bilogo Para qu quiero los

    marcadores genticos?

  • Marcador gentico

  • Muestra biolgica Extraccin de ADN Amplificacin

    por PCR

    Diferentes mtodos de anlisis

    http://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/Caron_lab/MO/images/rflp.jpg&imgrefurl=http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/Caron_lab/MO/prot_rflp.html&h=350&w=400&sz=16&hl=es&start=18&sig2=oBoIEB_OAck7wGbML9P8Qw&tbnid=ux1uHdcBAxsCGMhttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.amnh.org/learn/pd/genetics/case_study/images/gel_caviar.jpg&imgrefurl=http://www.amnh.org/learn/pd/genetics/case_study/alter.html&h=381&w=400&sz=25&hl=es&start=157&sig2=8yvYQ2Ps3RxDM6xOvZo7gw&tbnid=alf0kBYrthttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.elchrom.com/images_uploaded/RAPD.jpg&imgrefurl=http://www.elchrom.com/public/index.php%3Farticle%3D113&h=162&w=150&sz=38&hl=es&start=11&sig2=WKxP_M9h3qDPQF2fXKfG4Q&tbnid=wHht9lv7EjrnTM:&tbnh=98&tbnw=91&ei=Wk
  • Muestra biolgica Extraccin de ADN Amplificacin

    por PCR

    Diferentes mtodos de anlisis

    http://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/Caron_lab/MO/images/rflp.jpg&imgrefurl=http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/Caron_lab/MO/prot_rflp.html&h=350&w=400&sz=16&hl=es&start=18&sig2=oBoIEB_OAck7wGbML9P8Qw&tbnid=ux1uHdcBAxsCGMhttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.amnh.org/learn/pd/genetics/case_study/images/gel_caviar.jpg&imgrefurl=http://www.amnh.org/learn/pd/genetics/case_study/alter.html&h=381&w=400&sz=25&hl=es&start=157&sig2=8yvYQ2Ps3RxDM6xOvZo7gw&tbnid=alf0kBYrthttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.elchrom.com/images_uploaded/RAPD.jpg&imgrefurl=http://www.elchrom.com/public/index.php%3Farticle%3D113&h=162&w=150&sz=38&hl=es&start=11&sig2=WKxP_M9h3qDPQF2fXKfG4Q&tbnid=wHht9lv7EjrnTM:&tbnh=98&tbnw=91&ei=Wk
  • Qu tipo de muestras puedo utilizar para

    obtener DNA

  • El ADN se puede extraer de diferentes tipos de muestras:

    Orina Otros tejidos (Ej. corazn, rin, etc.).

    Pelo con bulbo.

    Carne (msculo)

    Hueso y diente.

    Sangre con anticoagulante.

    Hojas, frutos, semillas, tubrculos aceite vegetal, madera

    En vegetales

    Hongos, bacterias, protistas

  • Muestra biolgica Extraccin de ADN Amplificacin

    por PCR

    Diferentes mtodos de anlisis

    http://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/Caron_lab/MO/images/rflp.jpg&imgrefurl=http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/Caron_lab/MO/prot_rflp.html&h=350&w=400&sz=16&hl=es&start=18&sig2=oBoIEB_OAck7wGbML9P8Qw&tbnid=ux1uHdcBAxsCGMhttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.amnh.org/learn/pd/genetics/case_study/images/gel_caviar.jpg&imgrefurl=http://www.amnh.org/learn/pd/genetics/case_study/alter.html&h=381&w=400&sz=25&hl=es&start=157&sig2=8yvYQ2Ps3RxDM6xOvZo7gw&tbnid=alf0kBYrthttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.elchrom.com/images_uploaded/RAPD.jpg&imgrefurl=http://www.elchrom.com/public/index.php%3Farticle%3D113&h=162&w=150&sz=38&hl=es&start=11&sig2=WKxP_M9h3qDPQF2fXKfG4Q&tbnid=wHht9lv7EjrnTM:&tbnh=98&tbnw=91&ei=Wk
  • Muestra biolgica Extraccin de ADN Amplificacin

    por PCR

    Diferentes mtodos de anlisis

    http://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/Caron_lab/MO/images/rflp.jpg&imgrefurl=http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/Caron_lab/MO/prot_rflp.html&h=350&w=400&sz=16&hl=es&start=18&sig2=oBoIEB_OAck7wGbML9P8Qw&tbnid=ux1uHdcBAxsCGMhttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.amnh.org/learn/pd/genetics/case_study/images/gel_caviar.jpg&imgrefurl=http://www.amnh.org/learn/pd/genetics/case_study/alter.html&h=381&w=400&sz=25&hl=es&start=157&sig2=8yvYQ2Ps3RxDM6xOvZo7gw&tbnid=alf0kBYrthttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.elchrom.com/images_uploaded/RAPD.jpg&imgrefurl=http://www.elchrom.com/public/index.php%3Farticle%3D113&h=162&w=150&sz=38&hl=es&start=11&sig2=WKxP_M9h3qDPQF2fXKfG4Q&tbnid=wHht9lv7EjrnTM:&tbnh=98&tbnw=91&ei=Wk
  • PCR

  • PCR

  • Amplificacin por PCR

  • Muestra biolgica Extraccin de ADN Amplificacin

    por PCR

    Diferentes mtodos de anlisis

    http://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/Caron_lab/MO/images/rflp.jpg&imgrefurl=http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/Caron_lab/MO/prot_rflp.html&h=350&w=400&sz=16&hl=es&start=18&sig2=oBoIEB_OAck7wGbML9P8Qw&tbnid=ux1uHdcBAxsCGMhttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.amnh.org/learn/pd/genetics/case_study/images/gel_caviar.jpg&imgrefurl=http://www.amnh.org/learn/pd/genetics/case_study/alter.html&h=381&w=400&sz=25&hl=es&start=157&sig2=8yvYQ2Ps3RxDM6xOvZo7gw&tbnid=alf0kBYrthttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.elchrom.com/images_uploaded/RAPD.jpg&imgrefurl=http://www.elchrom.com/public/index.php%3Farticle%3D113&h=162&w=150&sz=38&hl=es&start=11&sig2=WKxP_M9h3qDPQF2fXKfG4Q&tbnid=wHht9lv7EjrnTM:&tbnh=98&tbnw=91&ei=Wk
  • Secuenciacin

    de DNA

  • 3

    5

    3

    5

  • 5 TACCGTGTGAGGTTCCTCCAAGGTTTGAAATCTACCTGAGTCAGGAAGCTAAG 3 ATGGCACACTCCAAGGAGGTTCCAAACTTTAGATGGACTCAGTCCTTCGATTC

    5 TACCGTGTGAGGTTCCTCCAAGGTTTGAAATCTACCTGAGTCAGGAAGCTAAG

    T C T G A G A 5 * TACCGTGTGAGG G G G C A G A T G C G 5 * TACCGTGTGAGG

    5 * TACCGTGTGAGG 3 ATGGCACACTCCAAGGAGGTTCCAAACTTTAGATGGACTCAGTCCTTCGATTC

    Desnaturalizacin

    Annealing y Extensin

  • T C T G A G A G G G C A G A T G C G

    5 * TACCGTGTGAGG 3 3 ATGGCACACTCCAAGGAGGTTCCAAACTTTAGATGGACTCAGTCCTTCGATTC

    5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAA G 3 ATGGCACACTCCAAGGAGGTTCCAAACTTTAGATGGACTCAGTCCTTCGATTC

    5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAAG G 3 ATGGCACACTCCAAGGAGGTTCCAAACTTTAGATGGACTCAGTCCTTCGATTC

    5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAAGGTTT G 3 ATGGCACACTCCAAGGAGGTTCCAAACTTTAGATGGACTCAGTCCTTCGATTC

    5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAAGGTTTGAAATCTACCT G 3 3 ATGGCACACTCCAAGGAGGTTCCAAACTTTAGATGGACTCAGTCCTTCGATTC

    5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAAGGTTTGAAATCTACCTGA G 3 3 ATGGCACACTCCAAGGAGGTTCCAAACTTTAGATGGACTCAGTCCTTCGATTC

    5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAAGGTTTGAAATCTACCTGAGTCA G 3 ATGGCACACTCCAAGGAGGTTCCAAACTTTAGATGGACTCAGTCCTTCGATTC

    5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAAGGTTTGAAATCTACCTGAGTCAGGAA G 3 ATGGCACACTCCAAGGAGGTTCCAAACTTTAGATGGACTCAGTCCTTCGATTC

  • 5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAA G 5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAAG G 5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAAGGTTT G 5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAAGGTTTGAAATCTACCT G 3 5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAAGGTTTGAAATCTACCTGA G 3 5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAAGGTTTGAAATCTACCTGAGTCA G 5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAAGGTTTGAAATCTACCTGAGTCAGGAA G 5 * TACCGTGTGAGG TTCCTCCAAGGTTTGAAATCTACCTGAGTCAGGAAGCTAA G 3 ATGGCACACTCCAAGGAGGTTCCAAACTTTAGATGGACTCAGTCCTTCGATTCAGT

  • Phred score Probabilidad de quela base asignada seaincorrecta

    Precisin en ladeterminacin de lasbases

    10 1 in 10 90%20 1 in 100 99%30 1 in 1,000 99.9%40 1 in 10,000 99.99%50 1 in 100,000 99.999%

    A mayores valores de Phred Score , mayor es la calidad de la secuencia.

    En general, un Phred Score de 20 significa que la secuencia es confiable.

    Phred score

    Probabilidad de que la base asignada sea incorrecta

    Precisin en la determinacin de las bases

    10

    1 in 10

    90%

    20

    1 in 100

    99%

    30

    1 in 1,000

    99.9%

    40

    1 in 10,000

    99.99%

    50

    1 in 100,000

    99.999%

  • Y todo esto

  • Y todo esto

    Para qu sirve?

  • Y AHORA?

    Y AHORA?

  • La identificacin especie especfica es la identificacin de la especie a la que pertenece

    una determinada muestra biolgica

    Identificacin especie especfica

  • Qu es una especie?

  • Cules son las posibles aplicaciones de la identificacin especie especfica?

  • Factores econmicos De salud Religiosos Casos forenses De conservacin

    http://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.fda.gov/fdac/graphics/2006graphics/fish_inspector_fda.jpg&imgrefurl=http://www.fda.gov/fdac/features/2006/106_ora.html&h=527&w=400&sz=118&hl=es&start=7&tbnid=y6c7DfDaCegJGM:&tbnh=132&tbnw=100&prev=/images%3Fhttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.lomejordelagastronomia.com/firmas/21f.jpg&imgrefurl=http://www.lomejordelagastronomia.com/firmaselec.asp%3Fkey%3D21&h=403&w=403&sz=28&hl=es&start=216&tbnid=YXg9KWapzuL0mM:&tbnh=124&tbnw=124&prev=/images%3Fq%25
  • Factores econmicos De salud Religiosos Casos forenses De conservacin

    http://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.carlebloomington.com/images/Flu.jpg&imgrefurl=http://www.carlebloomington.com/allergy_immunology.html&h=838&w=524&sz=298&hl=es&start=166&sig2=Qu_bObEgpo2CeqKx0eoiJg&tbnid=3TB9izX10yxFYM:&tbnh=144&tbnw=90&ei=http://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.lakewoodvets.com/images/SamandFredawithBoxer.JPG&imgrefurl=http://www.lakewoodvets.com/modern_medicine.htm&h=1200&w=1600&sz=419&hl=es&start=312&sig2=dHIaLVDAQz_fMz4nX2ZWWw&tbnid=CcZl347UPbrcdM:&tbnh=113&tbnwhttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.monasterio.org.ar/imagenes/quesos/quesos-lostoldos-1.jpg&imgrefurl=http://www.monasterio.org.ar/moduloquesos-monasterio.htm&h=347&w=520&sz=94&hl=es&start=8&sig2=NfvUQIOYKfLhr8WE97hg6A&tbnid=lmfTBUKX8VP1pM:&t
  • Factores econmicos De salud Religiosos Casos forenses De conservacin

    http://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.avenuevine.com/archives/Kosher-w.jpg&imgrefurl=http://www.avenuevine.com/archives/002584.html&h=289&w=385&sz=35&hl=es&start=22&sig2=soMozwZFgS13GAbDB_25VQ&tbnid=1UaucbYzN1n5XM:&tbnh=92&tbnw=123&ei=JRvxRp_UIZ
  • Factores econmicos De salud Religiosos Casos forenses De conservacin

    http://images.google.com/imgres?imgurl=http://www.hobotraveler.com/122_07baghdad/0094.JPG&imgrefurl=http://www.hobotraveler.com/122_07baghdad04.shtml&h=480&w=640&sz=58&hl=en&start=36&tbnid=9cb5yPmIekCOxM:&tbnh=103&tbnw=137&prev=/images%3Fq%3Dblood%2Bclothes%26
  • Factores econmicos De salud Religiosos Casos forenses De conservacin

    http://images.google.com/imgres?imgurl=http://62.15.226.148/fot/c32/1915472.jpg&imgrefurl=http://www.todocoleccion.com/gra/cartera-piel-vibora%7Ex5504636&h=337&w=450&sz=65&hl=en&start=1&tbnid=6m0b2r3KmMvXtM:&tbnh=95&tbnw=127&prev=/images%3Fq%3Dv%25C3%25ADbora%2Bhttp://images.google.com/imgres?imgurl=http://www.sabanalia.com/images/leopardo.jpg&imgrefurl=http://www.sabanalia.com/index.php%3FcPath%3D24&h=536&w=700&sz=135&hl=en&start=9&tbnid=NLwE1lDWyC2rkM:&tbnh=107&tbnw=140&prev=/images%3Fq%3Dleopardo%2Bpiel%26gbv%3D2%25
  • Factores econmicos De salud Religiosos Casos forenses De conservacin

    http://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.mth.msu.edu/%7Epeller/Africa_large/rhinoceros.jpg&imgrefurl=http://green-bubble.org/%3Fm%3D20070710&h=647&w=1000&sz=405&hl=es&start=55&tbnid=pN4zHY8RXh1GTM:&tbnh=96&tbnw=149&prev=/images%3Fq%3DRinoceronte%26st
  • Mtodos de identificacin especie especfica

  • Muestra biolgica Extraccin de ADN Amplificacin

    por PCR

    Diferentes mtodos de anlisis

    http://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/Caron_lab/MO/images/rflp.jpg&imgrefurl=http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/Caron_lab/MO/prot_rflp.html&h=350&w=400&sz=16&hl=es&start=18&sig2=oBoIEB_OAck7wGbML9P8Qw&tbnid=ux1uHdcBAxsCGMhttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.amnh.org/learn/pd/genetics/case_study/images/gel_caviar.jpg&imgrefurl=http://www.amnh.org/learn/pd/genetics/case_study/alter.html&h=381&w=400&sz=25&hl=es&start=157&sig2=8yvYQ2Ps3RxDM6xOvZo7gw&tbnid=alf0kBYrthttp://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.elchrom.com/images_uploaded/RAPD.jpg&imgrefurl=http://www.elchrom.com/public/index.php%3Farticle%3D113&h=162&w=150&sz=38&hl=es&start=11&sig2=WKxP_M9h3qDPQF2fXKfG4Q&tbnid=wHht9lv7EjrnTM:&tbnh=98&tbnw=91&ei=Wk
  • Amplificacin por PCR

  • Genes comnmente utilizados en la identificacin especie especfica

    Gen Ubicacin Porcentajes

    Citocromo b mitocondrial 44% ARNr 12 S y 16 S mitocondrial 11% y 16% D-loop mitocondrial 8 % Citocromo oxidasa I (COI) mitocondrial ARNtLys mitocondrial ARNr 28S nuclear actina, nuclear 21 % TP53 (codifica para p53) nuclear Secuencia entre ATPasa8 y ATPasa6 mitocondrial

    ARNtVal mitocondrial ATPasa subunidad 6 y 8 mitocondrial ARNr 5S nuclear

  • Comparacin de las secuencias en las bases de datos

  • Algoritmo BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)

  • Secuenciacin y comparacin con las bases de datos -Los resultados de la secuenciacin del fragmento amplificado de 323 pb (electroferograma) y la comparacin con las bases de datos pblicas de secuencias nucleotdicas (utilizando el algoritmo BLAST) muestran que el fragmento corresponde a un segmento del gen mitocondrial CytB de oveja.

  • Cdigo de barra

    de la vida

  • The International Barcode of Life project (iBOL) La ms grande de las iniciativas de diversidad genmica 500.000 especies depositaria de un fragmento de 648 pares de bases (pb) del gen mitocondrial citocromo C oxidasa 1 (COI). En plantas se utilizan los genes cloroplsticos rcbl y matK La informacin enviada debe estar acompaada de informacin sobre el espcimen de origen, institucin de origen e informacin biolgica adicional.

  • Mi caballo fue descalificado Cmo s si no me cambiaron

    la muestra?

  • 8786.2

    8988.2

    9190.2

    9392.2

    9594.1

    9796.2

    9998.2

    G01 060224_CTD_DogRun01 CTD7

    0

    100

    200

    300

    400

    50087

    86.289

    88.291

    90.293

    92.295

    94.197

    96.299

    98.2

    G01 060224_CTD_DogRun01 CTD7

    0

    100

    200

    300

    400

    500

    227232.0

    229233.8

    231235.6

    233237.6

    235239.4

    237241.2

    239243.2

    241245.2

    243247.2

    245249.0

    B02 060309_CT_DOG CT2

    0

    100

    200

    300

    400

    500

    600

    235245

    192191.4

    194193.1

    196195.1

    198197.1

    200199.2

    202201.2

    204203.3

    206205.2

    208207.1

    210209.3

    212211.6

    D01 060309_CT_DOG CT15

    0

    1000

    2000

    3000

    4000

    5000

    6000

    199

    201

    220223.5

    222225.4

    224227.5

    226229.5

    228231.6

    230233.7

    232235.9

    234237.9

    236239.9

    238241.8

    E02 060228_TC_EqDogRun01 CTD18

    0

    1000

    2000

    3000

    229 239

    220223.5

    222225.4

    224227.5

    226229.5

    228231.6

    230233.7

    232235.9

    234237.9

    236239.9

    238241.8

    B01 060309_CT_DOG CT13

    0

    1000

    2000

    3000

    4000

    5000

    6000

    7000

    24124

    192191.4

    194193.1

    196195.1

    198197.1

    200199.2

    202201.2

    204203.3

    206205.2

    208207.1

    210209.3

    212211.6

    B02 060309_CT_DOG CT2

    0

    1000

    2000

    3000

    4000

    199205

    227232.0

    229233.8

    231235.6

    233237.6

    235239.4

    237241.2

    239243.2

    241245.2

    243247.2

    245249.0

    A02 060224_CTD_DogRun01 CTD9

    0

    50

    100239

    Identificacin Gentica de un Individuo/Muestra

    Muestra 1 = Muestra Muestra 2 = Referencia

  • Identificacin Gentica de un Individuo/Muestra

    Muestra 1 = Muestra Muestra 2 = Referencia

    8786.2

    8988.2

    9190.2

    9392.2

    9594.1

    9796.2

    9998.2

    G01 060224_CTD_DogRun01 CTD7

    0

    100

    200

    300

    400

    50087

    86.289

    88.291

    90.293

    92.295

    94.197

    96.299

    98.2

    G01 060224_CTD_DogRun01 CTD7

    0

    100

    200

    300

    400

    500

    227232.0

    229233.8

    231235.6

    233237.6

    235239.4

    237241.2

    239243.2

    241245.2

    243247.2

    245249.0

    B02 060309_CT_DOG CT2

    0

    100

    200

    300

    400

    500

    600

    235245

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    B02 060309_CT_DOG CT2

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    200

    300

    400

    500

    600

    235245

    192191.4

    194193.1

    196195.1

    198197.1

    200199.2

    202201.2

    204203.3

    206205.2

    208207.1

    210209.3

    212211.6

    D01 060309_CT_DOG CT15

    0

    1000

    2000

    3000

    4000

    5000

    6000

    199

    201

    192191.4

    194193.1

    196195.1

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    200199.2

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    208207.1

    210209.3

    212211.6

    D01 060309_CT_DOG CT15

    0

    1000

    2000

    3000

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    199

    201

    220223.5

    222225.4

    224227.5

    226229.5

    228231.6

    230233.7

    232235.9

    234237.9

    236239.9

    238241.8

    E02 060228_TC_EqDogRun01 CTD18

    0

    1000

    2000

    3000

    229 239

    220223.5

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    0

    1000

    2000

    3000

    229 239

  • PCR-RFLP (PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism)

  • PCR-RFLP cyt b

    M hum

    ano

    caba

    llo

    M M sang

    re

    sang

    re

    pelo

    pelo

    orin

    a

    orin

    a hu

    man

    o

    caba

    llo

    Frag

    PC

    R Hinf I Hae III

  • 1 50 Pelo/Sangre ATCTGCTTAATTCTACAAATCTTAACAGGCCTATTCCTAGCTATATACTA Caballo .................................................. AY819737 .................................................. AY819736 .................................................. DQ236094 .....T............................................ 51 100 Pelo/Sangre CACATCAGACACAACAACCGCCTTCTCATCTGTTATACACATCTGCCGAG Caballo ..................................-............... AY819737 .................................................. AY819736 .................................................. DQ236094 .................................................. 101 150 Pelo/Sangre ATGTGAACTACGGATGAATTATCCACCATCTCCATGCTAACGGAGCGTCC Caballo ...........R...................................... AY819737 .................................................. AY819736 ...........A...................................... DQ236094 .....................................C............ 151 200 Pelo/Sangre ATATTCTTCATCTGCCTCTTTATTCACGTAGGACAAGGCCTTTACTACAG Caballo .................................................. AY819737 .................................................. AY819736 .................................................. DQ236094 ....................C.............G............... 201 250 Pelo/Sangre CTCCTACACCTTCCTAGAAACATGAAATATTGGGATTCTCCTGTTTCTTC Caballo .................................................. AY819737 .................................................. AY819736 .................................................. DQ236094 ..........................................A....... 251 278 Pelo/Sangre CAGTAATAGCTACAGCATTCATGGGTTATGTCCTACCA Caballo ...................................... AY819737 ...................................... AY819736 ...................................... DQ236094 ......................................

  • 1 50 Orina CTGATCCTCCAAATCACCACAGGACTATTCCTAGCCATGCACTACTCACC Humano .................................................. AY509658 .................................................. EF495216 .................................................. EF495220 ..................................................

    51 100 Orina AGACGCCTCAACCGCCTTTTCATCAATCGCCCACATCACTCGAGACGTAA Humano .................................................. AY509658 .................................................. EF495216 .................................................. EF495220 ..................................................

    101 150 Orina ATTATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTC Humano .................................................. AY509658 .................................................. EF495216 .................................................. EF495220 ..................................................

    151 200 Orina TTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATTACGGATCATT Humano .................................................. AY509658 .................................................. EF495216 .................................................. EF495220 ..................................................

    201 250 Orina TCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTA Humano .................................................. AY509658 .................................................. EF495216 .................................................. EF495220 ..................................................

    251 278 Orina TAGCAACAGCCTTCATAGGCTATGTCCT Humano ............................ AY509658 ............................ EF495216 ............................ EF495220 ............................

  • Trfico de camlidos

    sudamericanos llama o...

    alpaca?

    http://images.google.com.ar/imgres?imgurl=http://www.agpix.com/catalog/AGPix_BlHaII19/large/AGPix_BlHaII19_0916_Lg.jpg&imgrefurl=http://ag-edit.lightlink.com/view_caption.php%3Fimage_id%3D136959%26keyword%3Dvalley&h=235&w=350&sz=119&hl=es&start=238&sig2=yklqHO
  • S1a.

    .bactrian .dromedary .guanaco .vicuna .llama .alpaca .c.s.

  • .bactrian .dromedary .guanaco .vicuna .llama .alpaca .c.s.

  • Fig. 1. Allele frequencies distribution LAB13 (b,c) loci in South American camelid species and casework samples

  • Fig. 1. Allele frequencies distribution GLM5 (d,e) loci in South American camelid species and casework samples

  • Biltong = Carne disecada de animales domsticos y salvajes de Sudfrica

  • Chorizos adulterados?

  • PCR-RFLP cyt b

    + + + - diez muestras problema

    S B E

  • Cuantificacin con Real Time PCR

    Numero de ciclos de PCR

    Uni

    dade

    s de

    fluo

    resc

    enci

    a

  • Seal de primers universales

    Seales de primers especficos de bovinos

    N de ciclos

    Fluo

    resc

    enci

    a

  • Caza ilegal de rinocerontes en frica

    1 kg de cuerno = USD 30.000 en el mercado ilegal. La poblacin de rinocerontes blancos fue reducida a unos 40 individuos a principios del siglo XX y actualmente los aproximadamente 20.000

  • ModeradorNotas de la presentacinHembra de rinoceronte blanco con su cuerno cortadocomo medida preventiva de caza ilegal en el Parque NacionalKruger. Foto cortesa Carla DAmato.
  • Rhodis, Rhino DNA Index System Base de datos de perfiles de en todas las reservas nacionales, provinciales y privadas; Permite la trazabilidad de cuernos confiscados de manos de traficantes y se los puede adjudicar a individuos (cadveres) especficos. El sistema consiste de 22 loci de microsatlites y un sistema de sexado y permite distinguir las dos especies. Actualmente cuenta con unos 3.500 perfiles

  • Direccin de reas Naturales Protegidas de la Provincia de Buenos Aires Identificacin de restos animales encontrados dentro de la reserva El destino, Magdalena.

  • Marcadores genticos asociados a enfermedades genticas

  • PKD (Polycystic Kidney Disease)

    Enfermedad Poliqustica Renal

    ModeradorNotas de la presentacinhttp://vetandpet.blogspot.com.ar/2011/08/el-pkd-o-enfermedad-poliquistica-renal.htmlEL PKD o Enfermedad poliquistica renal es una patologia renal comn en gatos, principalmente de raza persa, nuestra compaera Elena Lezcano nos describe que podemos hacer para descartarla previa a la crianza y en que consiste y que debemos hacer en un gato con PKD. Como siempre tambien puedes bajarte el PDF para tenerlo siempre a mano (pulsa aqu) ENFERMEDAD POLIQUISTICA RENAL (PKD) EN GATOS PERSA Cuando un cliente viene por primera vez a nuestra consulta con una cra de gato (en el caso que nos ocupa) de raza Persa o sus cruces, debemos hablarle de esta importante enfermedad congnita que tanta gente desconoce e intentar diagnosticarla lo antes posible. Las enfermedades congnitas son las que estn presentes en el momento del nacimiento, y algunas de ellas estn determinadas genticamente, como es el caso de la Enfermedad Poliqustica Renal (PKD) en los gatos de raza Persa. Esta enfermedad hereditaria se caracteriza por un progresivo crecimiento y desarrollo de quistes renales que destruyen el parnquima funcional, teniendo como principal (y ms grave) complicacin el desarrollo de una insuficiencia renal debido a la destruccin gradual de dicho parnquima al irse acumulando orina en los quistes. De ah la importancia que tiene el diagnosticarla lo antes posible. Esta enfermedad cursa de manera similar a una de las causas ms comunes de muerte en cualquier gato, la insuficiencia renal... sta es una de las causas por las que el PKD ha pasado desapercibida durante aos, y se ha diseminado por la poblacin de gatos Persas.Su herencia es autosmica dominante, es decir, que la presencia de una sola copia del gen mutado es suficiente para que la enfermedad se manifieste (si la madre esta libre de dicha enfermedad, pero el padre la tiene, las cras la heredarn). Es una herencia no ligada al sexo del gato, por lo que no importa si es macho o hembra, ambos pueden padecerla. De ah la importancia de chequear a todo gato de raza persa (tanto machos como hembras), y no procrear con ellos en caso de que la tengan. Al ser una enfermedad hereditaria, los quistes estn presentes desde el nacimiento del gato aunque su tamao es, al principio, de menos de 1 milmetro. A medida que el animal se desarrolla y va cumpliendo aos, los quistes empiezan a crecer hasta alcanzar varios centmetros. Puede afectar a uno o a ambos riones, llegando a encontrar entre 20 y 200 quistes. Los problemas aparecen cuando la parte sana del rin no es suficiente como para que este rgano realice sus funciones, en ese momento aparece la insuficiencia renal. As mismo el Hgado tambin puede estar daado, presentando quistes iguales a los que encontramos en rin.Los gatitos ms afectados pueden morir por insuficiencia renal a las 8 semanas de vida, aunque no es lo comn, siendo ms normal que la enfermedad pase desapercibida hasta que el animal tiene varios aos (una media de 7 aos) y comience a mostrar sntomas de insuficiencia renal (ver ms adelante) debido al crecimiento de los quistes.Por tanto, lo ideal al vernos frente a un gato persa, sea de la edad que sea, est sano o no, es chequear sus riones para descartar que no tenga Enfermedad Poliquistica Renal. Mtodos para diagnosticar la PKD: - La Ecografa es el mtodo no invasivo ms especfico para diagnosticar una PKD. Puede realizarse en gatitos a partir de las 6-8 semanas de edad, pero la ausencia de quistes en esta etapa precoz no evita que se puedan desarrollar a una edad ms avanzada. En gatitos de 2-3-4 meses es una prueba muy especfica (si vemos los quistes, podemos afirmar que tiene la enfermedad), pero poco sensible (si no los vemos, no podemos descartarla). A partir de los 9-10 meses de vida ya es ms fiable, y si nos sale negativo a quistes renales, lo ms probable es que est libre de la enfermedad. La ecografa no es fiable al 100% hasta el ao de edad, momento en el cual, si sta nos sale normal, nos descarta que en futuro vayamos a tener problemas con la formacin de quistes renales. Por ello, si se le hace la ecografa a una cria de gato Persa, se recomienda repetirla ya pasado el ao de vida para asegurarnos de que es negativo. Recordar siempre chequear el Hgado por si tambin presenta quistes. - La Palpacin abdominal nos puede revelar renomegalia (aumento del tamao de los riones) as como dolor a la palpacin de los mismos y notar sus bordes irregulares. Aunque son signos compatibles con otros problemas renales, pero ya puede servirnos de orientacin al diagnstico hasta hacer la ecografa.- Test gentico para determinar PKD el diagnstico molecular ofrece la ventaja de la deteccin precoz de individuos asintomticos portadores del defecto gentico. Es un mtodo eficiente, temprano y seguro para seleccionar a los gatos que se van a utilizar como reproductores. Hay varios laboratorios en nuestro pas que tienen este servicio.Se puede hacer entre las 5-10 semanas de edad. Como muestras se pueden enviar: - Sanger fresca en EDTA- Un hisopo bucal Sntomas de Insuficiencia Renal: El animal nace con los quistes, que van aumentando de tamao a medida que este crece. Los signos clnicos se presentan entre los 3 y 10 aos. Debido a que la enfermedad se manifiesta despus de la edad reproductiva, muchas veces se utiliza como reproductores gatos con la mutacin, cosa que debemos evitar. Los signos clnicos que el propietario notar en casa son: - Poliuria: Excesivo consumo de agua.- Polidipsia: Aumento de la eliminacin urinaria.- Letargia.- Anorexia.- Vmitos.- Prdida de peso.- Deshidratacin. Ante un gato que muestre algunos o todos estos sntomas, se recomienda acudir al veterinario para realizarle una analtica sangunea y en funcin de sus resultados, chequear rin. Resumiendo, la PKD es una enfermedad que se hereda de padres a hijos, no importa el sexo. Debemos realizar una ecografa renal antes de criar con 2 persas, no usndolos como reproductores en caso de que la tengan. Si el animal es menor de 1 ao la ecografa no excluye la enfermedad al 100%, y la forma ms fiable sera testar genticamente una muestra de sangre o un hisopo bucal. Si no corre prisa porque no son gatos de criadero, se puede esperar al ao y realizar una ecografa. Si nota que su gato (ya sea una cra, o adulto) bebe mas agua de lo normal, y orina mas de lo normal, no dude en visitar a un profesionalson signos de que el rin puede estar fallando, y entre antes se diagnostique y se trate, mejor.El propietario de un gato positivo a PKD debe saber que con el paso de los aos podr sufrir una insuficiencia renal crnica, por lo que a partir de una determinada edad tendr que ser sometido a frecuentes controles veterinarios, as como estar sometido a dietas y medicaciones que limiten en lo posible el desarrollo rpido de la enfermedad una vez que sta se ha desarrollado.
  • SNP (Single nucleotide polymorphism = snips) Es una variacin en la secuencia de ADN que afecta a una sola base de una secuencia del genoma. Estos cambios pueden ser responsables de causar una enfermedad o afectar la respuesta de los individuos a bacterias, virus, productos qumicos, frmacos, etc.

  • Gen MDR1 (gen de resistencia a

    multidrogas)

    Sensibilidad a Ivermectina en Collies

    ModeradorNotas de la presentacinUn buen ejemplo de una prueba directa de ADN es la diseada para el gen MDR1 (Multidrug Resstanse) en perros deraza Collie. Este gen codifica para un glico-protena P que se expresa constitutivamente en varias clulas epiteliales yprotege a algunos rganos (testculo, sistema nervioso central) de su exposicin a ciertas drogas, minimizando el riesgode impactos txicos. La ivermectina es un antiparasitario ampliamente utilizado y un sustrato de la glico-protena P queprotege a las neuronas sensitivas GABA frente a la presencia de este frmaco. En los animales sensibles a la ivermectinapuede observarse un delecin de 4 pares de bases en la regin codificante del gen MDR1 que origina un codon de stopprematuro en la posicin 91 de la glico-protena P (Figura 1).
  • Sano GGAAACATGACAGATAGCTTTGCAAATGCAGGA GGAAACATGACAGATAGCTTTGCAAATGCAGGA Heterocigota GGAAACATGACAGATAGCTTTGCAAATGCAGGA GGAAACATGACAGCTTTGCAAATGCAGGAATTT Sensible GGAAACATGACAGCTTTGCAAATGCAGGAATTT GGAAACATGACAGCTTTGCAAATGCAGGAATTT

  • Sindactilia (pie de mula)

  • Universidad Nacional de La Plata, Facultad de Ciencias Veterinarias,

    IGEVET

  • Universidad Nacional de La Plata, Facultad de Ciencias Veterinarias,

    IGEVET

    Nmero de diapositiva 2Nmero de diapositiva 3Nmero de diapositiva 4Nmero de diapositiva 6Nmero de diapositiva 7Nmero de diapositiva 8Nmero de diapositiva 9Nmero de diapositiva 10Nmero de diapositiva 11Nmero de diapositiva 12Nmero de diapositiva 13Nmero de diapositiva 14Nmero de diapositiva 15Nmero de diapositiva 16Nmero de diapositiva 17Nmero de diapositiva 18Nmero de diapositiva 19Nmero de diapositiva 20Nmero de diapositiva 21Nmero de diapositiva 22Nmero de diapositiva 23Nmero de diapositiva 24Nmero de diapositiva 25Nmero de diapositiva 26Nmero de diapositiva 28Nmero de diapositiva 34Nmero de diapositiva 36Nmero de diapositiva 37Nmero de diapositiva 39Nmero de diapositiva 40Nmero de diapositiva 41Nmero de diapositiva 42Nmero de diapositiva 43Nmero de diapositiva 44Nmero de diapositiva 45Nmero de diapositiva 46Nmero de diapositiva 47Nmero de diapositiva 52Nmero de diapositiva 53Nmero de diapositiva 54Nmero de diapositiva 55Nmero de diapositiva 56Nmero de diapositiva 57Nmero de diapositiva 58Nmero de diapositiva 59Nmero de diapositiva 60Nmero de diapositiva 61Nmero de diapositiva 62Nmero de diapositiva 63Nmero de diapositiva 64Nmero de diapositiva 65Nmero de diapositiva 67Nmero de diapositiva 68Nmero de diapositiva 69Nmero de diapositiva 70Nmero de diapositiva 71Nmero de diapositiva 73Nmero de diapositiva 74Nmero de diapositiva 75Nmero de diapositiva 76Nmero de diapositiva 77Nmero de diapositiva 78Nmero de diapositiva 79Nmero de diapositiva 80Nmero de diapositiva 81Nmero de diapositiva 82Nmero de diapositiva 83Nmero de diapositiva 84Nmero de diapositiva 85Nmero de diapositiva 86Nmero de diapositiva 87Nmero de diapositiva 88Nmero de diapositiva 89Nmero de diapositiva 90Nmero de diapositiva 92Nmero de diapositiva 93Nmero de diapositiva 94Nmero de diapositiva 103Nmero de diapositiva 104Nmero de diapositiva 105Nmero de diapositiva 106Nmero de diapositiva 107Nmero de diapositiva 108Nmero de diapositiva 109Nmero de diapositiva 110Nmero de diapositiva 111Nmero de diapositiva 112Nmero de diapositiva 113Nmero de diapositiva 114Nmero de diapositiva 115Nmero de diapositiva 116Nmero de diapositiva 117Nmero de diapositiva 118Nmero de diapositiva 119Nmero de diapositiva 120Nmero de diapositiva 121PKD(Polycystic Kidney Disease)Enfermedad Poliqustica RenalNmero de diapositiva 123Nmero de diapositiva 124Nmero de diapositiva 125Nmero de diapositiva 126Nmero de diapositiva 127Nmero de diapositiva 128Nmero de diapositiva 129Nmero de diapositiva 130Nmero de diapositiva 131Nmero de diapositiva 141Nmero de diapositiva 142Nmero de diapositiva 143Nmero de diapositiva 144