Investigación Básica

Dr. Francisco J. Blanco García

Medicina Molecular

Manhattan plot del MetaGWAS: Los genes del MHC de clase II y de componentes de matriz extracelular son los mas numerosos.

4M004 Genetics & Epigenetics ofScleroderm

• Epigenética: Metilación o Acetilación de Histonas y Micro RNAs

Angiolilli NRR, 2018

“Encendido y apagado de Genes”

Genética y Epigenética en la Patogénesis de la Esclerodermia

Fibroblastos expuestos al efecto de el TGFbeta,el cual induce cambios epigenticos en la viade SIRT3, SMAD3, PARP1 y KLF5 cuyo resultadofinal es la produción de colágeno tipo I y fibrosis

Angiolilli NRR, 2018

• Análisis de células simple revela heterogenicidad de fibroblastos y miofibroblastos en la Esclerosis sistémica asociada en enfermedad pulmonar intersticial

Análisis de secuenciación de ARN unicelular de 5 controles sanos humanos y 8 muestras de tejido pulmonar SSc-ILD.

(A) Visualización de agrupamiento de las 13 muestras combinadas de control saludable y SSc-ILD, identificadas por tipo de célula.

(B) Recubrimiento de los grupos originales (grupos 5, 6 y 10 en la figura 1A) que contienen múltiples tipos de células epiteliales bronquiales y alveolares que demuestran la separación en tipos de células epiteliales individuales.

(C) Gráfico t-SNE de células coloreadas según el estado de la enfermedad; Todos los grupos contenían células tanto de SSC como de muestras de control.

(D) Mapa de calor de los datos de expresión de cada gene para los 5 principales genes expresados diferencialmente que identifican cada grupo, con los genes seleccionados.

(E) Todos los grupos contienen células de todas las muestras. SSc-ILD, enfermedad pulmonar intersticial asociada a la esclerosis sistémica, SSC, esclerosis sistémica.

Valenzi, ARD 2018

Session: 5T060 Epigenetics & Transcriptomics of Vasculitis: Insights on Pathogenesis

• Gene-Specific DNA Methylation Changes Predict Remission in Patients with ANCA-Associated Vasculitis. Dominic J. Ciavatta*‡ ‡Department of Genetics, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, North Carolina• Objetivo: Establecer la relación entre la metilación del DNA ya la

expresión genica de autoantigenos y el estado clínico de los pacientes con vasculitis asociada con ANCA.

• Métodos: Se mide la metilación de MPO y PRTN3 en 82 pacientes con vasculitis asociado con ANCA y 32 controles sanos.

Resultados: Metilación del DNA y actividad de la enfermedad

• Pacientes con con enfermedad activa mostraban hipometilación de MPO y PRTN3 y aumento la expresión de los autoantigenos.

• Pacientes en remisión, la metilación del DNA en general esta aumentada.

• Los pacientes se pueden dividir en dos grupos en base a si la metilación disminuida o aumentada

Resultados: Metilación del DNA y probabilidad de brote de actividad

• Graficas de Kaplan mayor muestran que pacientes con hipermetilación del gen PRTN3 tiene un significativo periodo de tiempo mas largo sin brotes independientemente del tipo de ANCA.

Pacientes con hipometilacion the PRTN3 tienen mas riesgo de brote (mas de 4 veces)

• La conclusión es la metilación del gen PRTN3 puede predecir el riesgo de permanecer estable.

2738 Differential Methylation of Peripheral Blood AdaptiveImmune Cells in Individuals at High Risk for RA and withEarly RA Compared with Controls Identifies PathwaysImportant in Transition to Arthritis

• Se Identifica firmas de metilación reproducibles de CCP-, CCP + y ERA en Linfocitos B de sangre periférica, células T de memoria y células T vírgenes en cohortes iniciales y confirmatorias.

• El metiloma de ERA también demostró un patrón distintivo de CCP +, lo que indica que la progresión a RA está acompañada de remodelación epigenética, especialmente en la señalización de células T y las respuestas de interferón.

• Estas firmas identifican vías críticas en la positividad del CCP y la AR clasificable y podrían proporcionar la base de nuevas intervenciones para prevenir.

Rizi Ai1, David Boyle 2, Deepa Hammaker 3, Kevin Deane 4, V. Michael Holers 5, Andre Matti 6, William Robinson 7, Jane

Buckner 8, Navin Rao 9, Frédéric Baribaud 10, George Vratsanos 11, Sunil Nagpal 9, Wei Wang 2 and Gary

Firestein 3, 1University of California San Diego, San Diego,

Figure 1. PCA muestra separación de shows

the separation of pacientes CCP+, CCP- y

ERA en las células T de memoria