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Novedades del último año en Mi bi l í Clí i Microbiología Clínica Bacteriología nosocomial II Bacteriología nosocomial II Teresa Alarcón Servicio de Microbiología Hospital Universitario de la Princesa Hospital Universitario de la Princesa

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Novedades del último año en Mi bi l í Clí iMicrobiología Clínica

Bacteriología nosocomial IIBacteriología nosocomial II

Teresa Alarcón

Servicio de Microbiología

Hospital Universitario de la PrincesaHospital Universitario de la Princesa

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Bacteriología nosocomial IIBacteriología nosocomial II

TEMAS:

• SARM

• Enterobacterias productoras BLEE

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Bacteriología nosocomial IIBacteriología nosocomial II

SSARM • Mensa J y cols. Guía de tratamiento de la infección producida por Staphylococcus aureusresistente a meticilina. Rev Esp Quimioter 2008; 21: 234‐258. 

• Malhotra‐Kumar S y cols. Current Trends in Rapid Diagnostics for Methicillin‐Resistant Staphylococcus aureus and Glycopeptide‐Resistant Enterococcus Species. J Clin Microbiol2008; 46: 1577–1587.

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Cambios en las infecciones por SARM en los últimos años:

i ió d d SARM d i id l• aparición de cepas de SARM adquiridas en la comunidad

t d l f i d SARM l h it l• aumento de la frecuencia de SARM en los hospitales • desarrollo de técnicas moleculares que permiten identificación rápida de SARM en muestras clínicasidentificación rápida de SARM en muestras clínicas

• introducción de nuevos antibióticos activos frente a SARM: linezolid daptomicina tigeciclina ySARM: linezolid, daptomicina, tigeciclina y 

• la mejor comprensión de los parámetros farmacocinéticos/ farmacodinamicos junto con lafarmacocinéticos/ farmacodinamicos junto con la evidencia de la pérdida de eficacia de vancomicinafrente a SARM cuando la CMI es > 1mg/ml.g/

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Guía de tratamiento de la infección por SARM elaborada por:

Representantes de Sociedades Españolas de:

• Quimioterapia 

• Medicina InternaMedicina Interna

• Medicina Intensiva, Crítica y Unidades C iCoronarias

• Asociación Española de Cirujanos y p j y

• Hematología y Hemoterapia

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EPINE del año 2007EPINE del año 2007

• E. coli (15,4%)

• S. aureus (10,6%)S. aureus (10,6%) 

• P. aeruginosa (10,3%)

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Infecciones leves por SARM sin repercusión sistémica

• Tratamiento empírico por vía oral como alternativa a los betalactámicos – Clindamicina

Cotrimoxazol– Cotrimoxazol

– Doxiciclina  

– Linezolid  

• Dependiendo de las tasas locales deDependiendo de las tasas locales de resistencia a estos antimicrobianos

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Infecciones de gravedad moderada o alta por SARM

Opciones

• GlucopéptidosGlucopéptidos

• Linezolid

• Daptomicina  

• TigeciclinaTigeciclina 

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VancomicinaVancomicina 

• es menos eficaz que las penicilinas isoxazólicas en SASM 

• su eficacia, aun siendo la cepa sensible, varía en función del valor de la CMIen función del valor de la CMI

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Tratamiento empírico de elección en una probable infección por SARM 

i i li lid l i i• Daptomicina o linezolid en las siguientes circunstancias: – infección que cursa con criterios de sepsis grave – neumonía – infección del SNC– riesgo de que la cepa tenga CMI de VAN > 1,5 mg/l:

• datos locales > 10% o • tratamiento con VAN durante el mes previo 

filtrado glomer lar inferior a 50 ml/min (edad > 65– filtrado glomerular inferior a 50 ml/min (edad > 65 años con creatinina >1,4 mg/l) o tratamiento con fármacos nefrotóxicosfármacos nefrotóxicos

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Elección entre daptomicina, linezolid o tigeciclina 

• Debe basarse en:– la experiencia clínica obtenida en estudios pcomparativos

– la localización del foco primario y las posiblesla localización del foco primario y las posibles metástasis y 

la valoración de determinadas ventajas de los– la valoración de determinadas ventajas de los diferentes antimicrobianos

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Elección entre daptomicina, linezolid o tigeciclina 

• Linezolid es el antimicrobiano de elección en caso de neumonía endooftalmitis o infeccióncaso de neumonía, endooftalmitis o infección del SNCD t i i l ti i bi d l ió• Daptomicina es el antimicrobiano de elección en caso de bacteriemia primaria o relacionada 

é d di i i f icon un catéter y en endocarditis infecciosa• En la infección polimicrobiana intra‐abdominal o de piel y partes blandas puede considerarse el empleo de tigeciclinap g

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Recomendaciones de TTO por SARM según foco

Localización VAN < 1mgLVAN > 1,5mgL  o FG<50ml/min

Bacteriemia primaria o asociada a catéter

VAN o TEI IV, completarcon LZD VO

DAP IV, completarcon LZD VO

VAN IV, DAP IV o LZD IV

Bacter. persistente o recidivante

VAN IV, DAP IV o LZD IV o VO

DAP o LZD VO o VI

Si grave o no DAP + GEN y/o RIF o 

LZD + RIF oDAP + GEN y/o RIF o LZD + RIF o DAP +

respuestaLZD + RIF o

DAP + LZD (ult recurso)LZD + RIF o DAP + LZD (ult recurso)

EI drcha VAN o DAP IV DAP IV

Endocarditis EI izq + GEN  + GEN 

Val. Protésica  DAP + RIF DAP + RIF

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Recomendaciones de TTO por SARM según foco

Localización VAN < 1mgLVAN > 1,5mgL  o FG<50ml/min

Inf piel/partesblandas

Inf leve CLINDA, COTRI, DOX

Inf moderada o LZD o VAN +/‐ DA

Si polimicroob añadir LZD o DAP +/‐ DA

Si polimicroob añadir grave

pTIGE

pTIGE

Inf. osteoarticularInf. Aguda VAN IV DAP o LZD

f óInf crónica LZD + RIF o RIF +COT, DA, AC. FU

Neumonia LZD IV o VO o VAN IV LZD VO o IV

Inf SNC LZD VO o IV o VAN IV LZD VO o IVInf. SNC LZD VO o IV o VAN IV LZD VO o IV

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Cultivos de vigilancia activaCultivos de vigilancia activa 

i li did d i l i d• Permiten aplicar medidas de aislamiento de contacto de forma precoz para prevenir la di i ió l h it ldiseminación en el hospital

• Los cultivos tradicionales requieren 2 a 3 días, lo que no facilita una actuación rápida. 

• Recientemente se están desarrollando pruebas de diagnóstico rápido que permitirán disminuir el tiempo de detección, reduciendo el riesgo de transmisión nosocomial, especialmente en pacientes de alto‐riesgo.

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Métodos de detección “rápida” de SARM basados en cultivo

• Medios cromogénicos para detección de SARM• Medios cromogénicos para detección de SARM: “permiten identificación del microorganismo, sin subcultivos ni pruebas bioquímicas desubcultivos ni pruebas bioquímicas de confirmación“

• Comparación de los diferentes mediosComparación de los diferentes medios cromogénicos comercializados en cuanto a: – ATM incluidos como agentes selectivos– cambios de sensibilidad y especificidad al prolongar el tiempo de incubación y al realizar un enriquecimiento l f t d l t tili d– el efecto de la muestra utilizada 

– el tiempo de detección y el coste eficacia– el coste eficacia

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Métodos de detección “rápida” de SARM basados en cultivo

b d l i• Nuevo ensayo basado en cultivo • Detección de SARM resistentes a CIP mediante la detección por bioluminiscencia de la actividad adenilato kinasa. 

• El tiempo requerido para obtener resultados es de 5 horases de 5 horas 

• El precio es menor que el de las técnicas l l á lt l d lmoleculares aunque más alto que el del 

cultivo

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Métodos moleculares comercializados para SARM

l l b d C di ibl• Test moleculares basados en PCR disponiblesactualmente:– LightCycler Staphylococcus y MRSA detection kit (LC assay; Roche Diagnostics, Mannheim, Germany)H l St h l R i t PCR (BAG Li h G )– Hyplex StaphyloResist PCR (BAG, Lich, Germany)

– GenoType MRSA direct assay (Hain Lifescience, Nehren Germany)Nehren, Germany)

– IDI‐MRSA assay (GenOhm, San Diego, CA; BD Diagnostics)Diagnostics),

– GeneXpert MRSA assay (Cepheid, Sunnyvale, CA)

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Métodos moleculares comercializados para ERG

• métodos comercializados para detección de l d f ó lERG implicados en infección nosocomial:

– LC vanA/vanB  (LC; Roche Diagnostics, Basel, gSwitzerland)

– GeneOhm VanR (BD Diagnostics‐ GeneOhm, SanGeneOhm VanR  (BD Diagnostics GeneOhm, San Diego, CA).

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ConclusiónConclusión 

• PCR produce resultados clínicamente importantes en poco tiempo.p p p

• Los kits comerciales tienen coste muy alto lo que impide el uso rutinarioque impide el uso rutinario.

• Se necesitan métodos diagnósticos más rápidos y más baratos que sean útiles en la detección y control de las infecciones pordetección y control de las infecciones por SARM

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Bacteriología nosocomial IIBacteriología nosocomial II

E t b t i d t d BLEEEnterobacterias productoras de BLEE• Cano ME y cols. Cultivos de vigilancia epidemiológica de bacterias resistentes a losepidemiológica de bacterias resistentes a los antimicrobianos de interés nosocomial. EnfermInfecc Microbiol Clin 2008; 26: 220‐9Infecc Microbiol Clin 2008; 26: 220 9. 

• Tumbarello M y cols. Bloodstream Infections Caused by Extended‐Spectrum‐B‐Lactamase‐Caused by Extended Spectrum B LactamaseProducing Escherichia coli: Risk Factors for Inadequate Initial Antimicrobial Therapy. 

b h hAntimicrob Agents Chemother 2008; 52: 3244–3252.

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Bacteria multirresistenteBacteria multirresistente 

• Aquella que es resistente a dos o más grupos de los antimicrobianos empleados phabitualmente en el tratamiento de las infecciones por esa bacteriainfecciones por esa bacteria. 

• Aquella que de forma natural presenta úl l b hresistencia a múltiples antimicrobianos y ha 

sido capaz de adquirir resistencia a alguno de los grupos con posible utilidad clínica.

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Principales bacterias con interés en infección nosocomial

• Agentes etiológicos de mayor interés en infección nosocomial, por su frecuencia o por p plas dificultades terapéuticas que suponen: – SARM– SARM

– Enterococcus spp. resistentes a glucopéptidos

– Enterobacterias productoras de BLEE 

– A. baumanniimultirresistente y 

– P. aeruginosa productoras de MBL 

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Muestras para investigación de bacterias multi‐R

/Heces/rectal

perineal faríngeo nasal Otras

SARM + a +++ +++ b ++++ ++ bSARM + a +++ +++ b ++++ ++ b

ERG ++++ ++++ (+) ‐ ++

Enterobact BLEE+ ++++ ++++ + ++Enterobact BLEE+ ++++ ++++ + ‐ ++

A. baumannii ++++ ++ ++++ c ‐ +++ d,e

P aeruginosaMBL+ + +++ ++++ c +++ dP. aeruginosaMBL+ + +++ ++++ c ‐ +++ d

a) No parece de interés para estudio sistemáticob) Aspirado traqual si ventilación mecánica (++), ulceras crónicas (+++) orina en pac. con sonda (++)c) Mas habitual esputo y ex. Traqueotomía) p y qd) En especial ex. Herida (+++)e) Muestra perineal (++++)

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SARMSARM

• ocasiona brotes epidémicos en los hospitales 

• en muchos casos se comporta como unen muchos casos se comporta como un microorganismo endémico. 

E l úl i ñ á d d• En los últimos años se están documentando, infecciones extrahospitalarias causadas por SARM en pacientes ingresados en centros de crónicos, asilos, etc (que se considerancrónicos, asilos, etc (que se consideran “asociadas al sistema sanitario”). 

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SARMSARM

L i d S i i l l• Los reservorios de S. aureus son principalmente los pacientes colonizados, pero también el personal sanitariosanitario.

• Las muestras adecuadas para realizar la vigilancia epidemiológica de SARM van encaminadas a detectarepidemiológica de SARM van encaminadas a detectar pacientes o personal sanitario colonizados. 

• Se recomienda:Se recomienda: – exudado nasal, faríngeo, exudado de piel de la zona perineal‐perirrectal y 

– muestras respiratorias, exudados de úlceras o heridas, y urocultivo en pacientes con alguna de estas infecciones. 

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ERG:ERG: 

i d i i l é id (• Fenotipos de resistencia a glucopéptidos (VanA, VanB, VanC, VanD, VanE y VanG)

• Principal reservorio en el ambiente hospitalario: tracto gastrointestinal de los pacientes ingresados

• Muestras más habituales para cultivo de vigilancia: frotis rectal o perianal y las heces 

• Poseen la capacidad de sobrevivir largos períodos de tiempo en condiciones desfavorables. Pueden precuperarse del suelo, alimentos, agua o equipamiento médicoq p

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Enterobacterias productoras de BLEE:Enterobacterias productoras de BLEE: 

i i l i d i ió l• Principal mecanismo de transmisión: las manos del personal sanitario, que se coloniza cuando entra en contacto con pacientes colonizados 

• Principal reservorio: el aparato digestivo • Muestras de elección: frotis rectal o hecesMuestras de elección: frotis rectal o heces • Otros mecanismos de transmisión descritos: l bj t d l i tlos objetos que rodean a los pacientes o a productos utilizados en su higiene

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Acinetobacter baumanniimultirresistente

A h d it b t id d• Aunque se han descrito brotes en unidades médicas y quirúrgicas, la mayoría han tenido lugar en unidades de cuidados intensivoslugar en unidades de cuidados intensivos. 

• Muestras para estudios de vigilancia: esputo y exudado de traqueotomía heridas axila/ingle yexudado de traqueotomía, heridas, axila/ingle y frotis rectal.

• También se han descrito muestras ambientalesTambién se han descrito muestras ambientales contaminadas como equipos de respiración asistida, líquidos diversos, medicaciones 

l d d d dmultidosis, ropa de cama, transductores de presión no desechables, etc.

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P aeruginosa productora de MBL:P. aeruginosa productora de MBL:

N l f d l fl l d• No suele formar parte de la flora normal pero puede colonizar el tracto gastrointestinal y otras zonas, como faringe axila y perinéfaringe, axila y periné. 

• Puede producirse contaminación de productos y equipos hospitalarios en particular de aquellos queequipos hospitalarios, en particular de aquellos que poseen componentes en contacto con la humedad. 

• A pesar de la amplia distribución que puede tener P.A pesar de la amplia distribución que puede tener P. aeruginosa en el medio ambiente, varios estudios sugieren que el principal reservorio en los brotes hospitalarios son los pacientes colonizados.

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E coli BLEE +E. coli BLEE +

• Estudio retrospectivo de 7 años para identificar los factores de riesgo asociados a una terapia antimicrobiana inicial inadecuadauna terapia antimicrobiana inicial inadecuada (por ejemplo tratamiento basado en antimicrobianos para los que la bacteria eraantimicrobianos para los que la bacteria era resistente) en pacientes hospitalizados con bacteriemia por E. coli productor de BLEE.

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E coli BLEE +E. coli BLEE +

• El estudio se realizó en el Hospital ól d lUniversitario Católico de Roma, Italia. 

• Se revisaron las historias clínicas de los Se e sa o as sto as c cas de ospacientes con bacteriemia por E. coliproductor de BLEE de enero de 1999 aproductor de BLEE de enero de 1999 a diciembre de 2005. 

• Se incluyó el primer episodio por paciente, en caso de que sufrieran más de uno episodio. q p

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E coli BLEE +E. coli BLEE +

• El número de casos por año aumentó de 8 en 1999 a 25 en 2005. 

• 109 (84,5%) fueron nosocomiales, 

18 (13 9%) f di i d l• 18 (13,9%) fueron diagnosticadas en el ingreso, y cumplían criterio de bacteriemia asociada a cuidado sanitario y 

• 2 (1 6%) parecían de adquisición comunitaria• 2 (1,6%) parecían de adquisición comunitaria.

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E coli BLEE +E. coli BLEE +

• Se detectaron un total de 167 genes de BLEE dif t l 129diferentes en los 129 cepas: 

• 61 (36.5%) fueron genes blaCTX‐M, 

• 58 (34.7%) genes blaSHV, y 

48 (28 7%) bl TEM• 48 (28.7%) genes blaTEM. 

• Además, 36 de los 129 aislamientos (27.9%) , ( )tenían múltiples genes BLEE.

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E coli BLEE +E. coli BLEE +

L i t ibi t t i t í i l• Los pacientes recibieron tratamiento empírico al recoger el hemocultivo. 

• De los 129 pacientes incluidos 56 (43 4%)• De los 129 pacientes incluidos, 56 (43.4%) recibieron terapia antimicrobiana inicial inadecuada durante 48 a 120 h (media 72 h):inadecuada durante 48 a 120 h (media 72 h):– cefalosporinas de 3ª o 4ª generación (n=28), – fluorquinolonas (n=17), q ( ),– combinación de betalactámico con inhibidor de beta‐lactamasas (n=5), 

– aminoglicósidos (n=5) y – trimetoprim‐sulfametoxazol (n=1). 

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E coli BLEE +E. coli BLEE +

L i i i d d• Los pacientes con tratamiento inadecuado:– fueron mayores y 

t b í di d bilid d d Ch l– presentaban un ímayor ndice de comorbilidad de Charlson

• Presentaban:b bilid d d t f d d h t ló i– menor probabilidad de tener enfermedad hematológica y 

– mayor probabilidad de tener diabetes mellitus, enfermedad hepática crónica y/o una historia reciente deenfermedad hepática crónica y/o una historia reciente de procedimientos diagnósticos o terapéuticos invasivos. 

• El grupo de tratamiento inadecuado presentó un g p pmayor porcentaje de hospitalización previa y/o tratamiento previo. 

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E coli BLEE +E. coli BLEE +

áli i l i i i ió i d di• Análisis multivariante: asociación independiente con tratamiento inadecuado para los siguientes f tfactores: – bacteriemia de origen desconocido (OR, 4.86; IC 95%  1.98 a 11.91; P=0.001), 

– infección por una cepa R a >=3 antimicrobianos (OR, 3.73; IC 95%, 1.58 a 8.83; P=0.003), 

– hospitalización durante 12 ms antes de la bacteriemia (OR, 3.33; IC 95%, 1.42 a 7.79; P=0.005), y

– TTO ATM durante 3 ms antes de la bacteriemia (OR, 2 65 95% IC 1 11 6 29 P 0 02)2.65; 95% IC, 1.11 a 6.29; P=0.02). 

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E coli BLEE +E. coli BLEE +

M t lid d l 21 dí 38 d l 129• Mortalidad a los 21 días: 38 de los 129 • Mortalidad a las 72 horas:  13 de los 129• Mayor mortalidad en el grupo con terapia inicial no• Mayor mortalidad en el grupo con terapia inicial no adecuada: • 16,1% (9 de 56) vs 5,4% (4 de 73) a las 72h y , ( ) , ( ) y• 51,8% (29 de 56) vs 12,3% (9 de 73) en el día 21.

• TTO ATM inicial inadecuado fue el factor de riesgo l l d d l dí ó dprincipal para mortalidad a los 21 días y aumentó de 

forma significativa el tiempo de hospitalización posterior a la bacteriemia en los pacientes queposterior a la bacteriemia en los pacientes que sobrevivieron (• media 21,6 +/‐ 8,9 días vs 16,7+/‐7,8 días, p=0,001 

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E coli BLEE +E. coli BLEE +

l d d b j i di l• Los resultados de este trabajo indican la importancia de realizar un adecuado manejo de 

i t i f i E lipacientes con infecciones graves por E. coliproductor de BLEE. 

• Para ello es necesario:– conocer la epidemiología de las infecciones locales, – un análisis detallado de la historia del paciente con especial atención a contacto previo con hospitales y

– hacer todo lo posible por encontrar el foco de infección que da lugar a la bacteriemia.

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ConclusiónConclusiónInfección por bacterias multi‐RInfección por bacterias multi R

• Clínico– Sospechar posible infección por estas bacterias

– Aplicar un tratamiento adecuado p

• MicrobiólogoD l i f i b i l i R d– Detectar las infecciones por bacterias multi‐R de forma rápida

– Evitar diseminación de cepas