metabolismo secundario

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Tema Nº 6 Metabolismo secundario Universidad Central de Venezuela Facultad de Farmacia Farmacognosia y Medicamentos Herbarios Profª Nery Margarita Pérez Ibáñez Año 2013-2014

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Rutas de Biosíntesis

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  • Tema N 6Metabolismo secundario

    Universidad Central de VenezuelaFacultad de Farmacia

    Farmacognosia y Medicamentos Herbarios

    Prof Nery Margarita Prez IbezAo 2013-2014

  • METABOLISMO

    Reacciones qumicas

    Sntesis(Anabolismo)

    Degradacin(Catabolismo)

    Enzimas, cofactores

    METABOLITOS METABOLITOS

  • METABOLISMO

    METABOLISMO PRIMARIO

    METABOLISMO SECUNDARIO

    Procesos metablicos esenciales que poseen la mayora de los seres vivos: Fotosntesis Gluclisis Ciclo de las pentosas Ciclo de Krebs, etc.

    Procesos metablicos especiales que poseen ciertos organismos vivos:

    Ruta del cido siqumico Ruta del acetato polimalonato Ruta DOXP MEP Condensacin de aminocidos alifticos

    Utilizan y sintetizan sustancias esenciales para la vida, llamadas metabolitos primarios o productos bioqumicos: Carbohidratos (polisacridos) Aminocidos (protenas) cidos grasos comunes (lpidos)

    Utilizan y sintetizan sustancias especiales para ciertos organismos, llamadas metabolitos secundarios o productos naturales: Fenoles (flavonoides, cumarinas,

    lignanos, quinonas, taninos, etc.) Alcaloides Terpenos

  • + Agua + CO2

    Ciclo de las pentosas

    Gluclisis

    FotosntesisGlucosa

    Eritrosa-4-fosfato Fosfoenolpiruvato

    AcetilCoAAminocidos

    alifticos

    Rutacido siqumico

    Ruta Acetato polimalonato

    Ruta cido mevalnico

    Aminocidos aromticos ALCALOIDES

    COMPUESTOS FENLICOS

    TERPENOS

    METABOLISMO SECUNDARIO

    METABOLISMO PRIMARIO

    Ciclo de Krebs

    Gliceraldehido-3-fosfatoPiruvato

    Ruta DOXP/MEP

  • Metabolitos secundarios

    Se originan de productos del metabolismo primario (precursores biosintticos).

    Se les atribuyen una variedad de funciones en el organismo que los contienen.

    Muchos poseen propiedades farmacolgicas muy especficas.

  • Metabolismo secundario

    Ruta del cido siqumico Ruta del acetato polimalonato Ruta 1-desoxi-D-xilulosa-5-fosfato (DOXP)

    2-C-metil-D-eritritol-4-fosfato (MEP) Condensacin de aminocidos alifticos

  • Ruta del cido siqumico

    Condensacin aldlica

    OxidacinEliminacinReduccin

    TANINOS

    Condensacin aldlica intramolecuar

    FEP

    DAHP (3-deoxi-D-arabino-heptulosonato-7-fosfato)

    cido 3-deshidroqunicocido 3-deshidrosiqumicoCIDO SIQUMICO

  • Ruta del cido siqumico

    1,4 trans-eliminacin

    HOOC

    OH

    COOH

    O

    CIDO PREFNICO

    Reordenamiento de Claisen

    TRIPTFANO

    Corismatomutasa

    NAFTOQUINONASNH

    OHO

    NH2ALCALOIDES INDLICOS

    CIDO SIQUMICO cido siqumico-3-fosfato

    FEP

    cido 5-enol-piruvilsiqumico-3-fosfatocido corsmicoCIDO PREFNICO

  • Fenilalanina amonio liasa (FAL)

    HOOC

    OH

    COOH

    O

    CIDO PREFNICO

    HOOC

    OH

    COOH

    NH2

    CIDO AROGNICO

    OHTIROSINA

    NH2

    COOH

    FENILALANINA

    NH2

    COOH

    CIDO CINMICO

    COOH

    OH

    COOH

    CIDO P-CUMRICO

    FENILPROPANOSLIGNANOS

    CUMARINASFLAVONOIDES

    XANTONAS

    Tirosina amonio liasa(TAL)

    - CO2- H2O

    - CO2- H+

    Prefenato aminotransferasa

    Glutamato

    Arogenatodeshidratasa

    Arogenato deshidrogenasa

    Ruta del cido siqumico

    CIDO PREFNICO cido arognico

    FENILALANINA TIROSINA

  • OO

    HO

    OH

    OH

    OH

    COMPUESTOS FENLICOS DERIVADOS DE LA RUTA DEL CIDO SIQUMICO

    FENILPROPANOSCUMARINAS

    LIGNANOS

    FLAVONOIDES

    HO

    OH

    OH

    O

    O

    HO

    HO O

    OH

    HO

    H3CO

    OH

    OCH3

    OH

    HO

    OH

    O

    O

    OH

    OH

    XANTONAS

  • ALCALOIDES INDLICOS derivados del aminocido aromtico triptfano

    NH

    OHO

    NH2

    L-Triptfano

    INDOL SIMPLES

    -CARBOLINAS

    ERGOLINAS PIRROLINDLICOS

    INDOL MONOTERPNICOS

    Ruta del cido siqumico

  • NH2HO

    OH

    O

    NH2

    OH

    O

    L-Lisina L-Tirosina

    ALCALOIDES derivados de aminocidos aromticos

    TETRAHIDRO-ISOQUINOLINAS

    BENCILTETRAISOQUINOLINAS

    MORFINANOS APORFINAS PROTOBERBERINAS

    Ruta del cido siqumico

  • SCoA

    O

    HOOC

    MALONIL-SCoA

    Ruta del acetato polimalonato

    SCoA

    O

    HOOC

    MALONIL-SCoA

    SCoA

    O

    H3C

    COOH

    OACETILMALONIL-SCoA

    H3C SCoA

    OACETIL-SCoA

    H3C SCoA

    OACETIL-SCoA

    SCoA

    O

    H3C

    OACETOACETIL-SCoA

    SCoA

    COOH

    OOO

    H3C

    SCoA

    OOO

    H3C SCoA

    O

    HOOC

    MALONIL-SCoA

    POLI--CETOCIDO (Polictido)

    Acetilmalonil-CoA-decarboxilasa

    HSCoA

    CO2HSCoA

    HSCoA

    CO2

    CO2

    HIDRLISIS

    +

    +

    +

    CO2-BIOTINA

    SCoA

    OOOO

    H3COH

    OOOO

    H3C

    Acetil-CoA-carboxilasa

    Acetilmalonil-CoA-sintetasa

    Condensacin de Claisen

    Condensacin de Claisen

    Condensacin de Claisen

    Condensacin de Claisen

    Decarboxilacin

    Decarboxilacin

    Decarboxilacin

  • COMPUESTOS FENLICOS DERIVADOS DE LA RUTA ACETATO-POLIMALONATO

    FENOLES SIMPLES

    ISOCUMARINAS CROMONAS

    OH

    OHHO

    OH3C

    O

    OH O

    OHO

    OH

    CH3

    OOH

    O

    O

    NAFTOQUINONAS

    O

    O

    OH OH

    HO CH3

    ANTRAQUINONAS

    HO

    OH

    O

    O

    OH

    OH

    FLAVONOIDES XANTONAS

    O

    O

    HO

    OH

    OH

  • Poli--cetoster

    Condensacin aldlica

    Deshidratacin favorecida por

    formacin de un sistema conjugado

    EnolizacinHidrlisis

    Enolizacin favorecida por

    formacin de un anillo aromtico

    Adicin aldlica sobre el carbonilo

    Condensacin de Claisen

    Enolizacin

    Reformacin de carbonilo posible por expulsin de grupo saliente

    Reacciones intramoleculares de los polictidos

  • OHO

    SCoA

    O

    Reacciones intramoleculares de los polictidos

    O

    O

    CoAS OO

    O

    O

    OH

    HO

    OLactonizacin

    SCoA

    OOOOO

    Cromonas

    Condensacin aldlica

    -Pironas

    SCoA

    OOO

    OO

    SCoA

    O

    O O

    OH

    Lactonizacin

    OH

    OH

    HO

    O

    O

  • Condensacin Aldlica y Condensacin de Claisen

    Anin enolato estabilizado por

    resonancia

    Prdida de un buen grupo

    salienteAdicin nucleoflica

    sobre el carbonilo

    Si no hay un adecuado grupo saliente ocurre la

    protonacin

    Producto de la condensacin aldlica

    Producto de la condensacin de Claisen

    R = X = H, acetaldehdoR = H, X = OEt, acetato de etilo

    R = X = H, aldol

    R = H, X = OEt, aceto acetato de etilo

    Reacciones caractersticas de los polictidos

  • C-Metilaciones usando SAM

    Posiciones orto y para son

    activadas por OH

    grupos carbonilos incrementan la

    acides y formacin del anin enolato

    (S-adenosilmetionina)

    O S

    R2

    H3C R1H OH CH3

    OCH3

    O-Metilaciones usando SAM

    H

    (S-adenosilmetionina)

    Reacciones secundarias de los polictidos

    O

    H

    O H

    HO H

    H H

    Reducciones

    (del NADPH)

  • Reacciones de oxidacin y reduccin

    Deshidrogenasas: NAD+ y NADP+

    Deshidrogenasas: FAD y FMN

    Reacciones secundarias de los polictidos

  • Oxidasas

    Mono-oxigenasas

    Reacciones secundarias de los polictidos

  • O O

    OH

    HO

    OH

    OH

    OH

    H3C

    HO CH3

    CH3

    Sugiera una ruta biosinttica razonable para los compuestos 1-4.

    1 2 3

    + 3 malonil-SCoA

    4

  • Ruta del cido mevalnico

    H3C SCoA

    O O

    SCoACOOH

    OH

    O

    ACETOACETIL-CoA

    HMG-CoA(3-hidroxi-3-metilglutaril-CoA)

    COOH

    OH

    HO(3R) CIDO MEVALNICO

    H3C SCoA

    O+

    H3C SCoA

    OACETIL-CoA

    2x

    Acetoacetil-CoA-tiolasa

    Condensacin de Claisen

    HMG-CoA-sintetasa

    Condensacin aldlica Hidrlisis

    2 NADPH

    HMG-CoA-reductasa

    COOH

    OH

    PP-O

    Mevalonato-quinasa

    2ATP2ADP

    Fosfomevalonato-quinasa

    O-P

    PP-O OO

    H

    ADP

    ATPcido mevalnico-5-difosfato

    PP-O

    IPPPP-O

    DMAPP

    HO-PCO2

    Mevalonato-pirofosfato-descarboxilasa

    Isopentenilpirofosfato--isomerasa

  • Ruta 1-desoxi-D-xilulosa-5-fosfato (DOXP) / 2-C-metil-D-eritritol-4-fosfato (MEP)

    Acidopirvico

    Gliceraldehdo-3-fosfato

    1-desoxi-D-xilulosa-5-fosfato sintasa

    1-desoxi-D-xilulosa-5-fosfato-reducto-

    isomerasa2-C-metil-D-eritritol-

    4-fosfato

    2-C-metil-D-eritritol 4-fosfato citidililtransferasa

    4-difosfocitidil-2-C-metil-D-eritritol quinasa

    2-C-metil-D-eritritol 2,4-ciclodifosfato sintasa

    4-hidroxi-3-metilbut-2-en-1-il difosfato

    sintasa

    4-hidroxi-3-metilbut-2-enil difosfato reductasa

    DMAPF

    IPPF

    1-desoxi-D-xilulosa-5-fosfato

  • AC. MEVALNICO DOXP/MEP

    DMAPF (C5) IPPF (C5)

    C10

    C25

    C20

    C15

    C30

    X 2IPPF

    IPPF

    Hemiterpenos (C5)

    Monoterpenos (C10)Iridoides

    Sesquiterpenos (C15)

    Diterpenos (C20)

    Sesteterpenos (C25)

    Triterpenos (C30)

    Esteroides (C18-C30)

    Tetraterpenos (C40)Carotenoides

    IPPFX 2

    C40

    Geranilpirofosfato (GPF)

    Farnesilpirofosfato (FPF)

    Geranilgeranilpirofosfato (GGPF)

    Ecualeno

    Fitoeno

    Geranilfarnesilpirofosfato (GFPF)

    Politerpenos (> C45)

    Biosntesis de terpenos

  • MONOTERPENOS DITERPENOSSESQUITERPENOS

    TRITERPENOS ESTEROIDES

    CAROTENOIDES

    Terpenos derivados de la ruta del cido mevalnico y ruta DOXP/MEP

    Ciclopentanoperhidrofenantreno

  • Biosntesis de terpenosRUTA DOXP/MEP(Monoterpenos,

    diterpenos, carotenoides) CLULA VEGETAL

    CLOROPLASTO

    CITOPLASMARUTA MEV

    (Triterpenos, politerpenos)

  • IPPF

    Geranilpirofosfato (GPF)

    DMAPF

    Catin allico estabilizado por resonancia

    1. Adicin electroflca2. Formacin del catin terciario

    Prdida estereoespecfica de un protn

    CABEZACOLA

    MonoterpenosSesquiterpenos

    DiterpenosSesteterpenosPoliterpenos

    Biosntesis de terpenos

  • Catin allico estabilizado por resonancia

    1. Adicin electroflica2. Formacin del catin terciario

    Geranilpirofosfato (GPF)

    Prdida estereoespecfica de un protn

    Farnesilpirofosfato (FPF)

    Biosntesis de terpenos

  • Biosntesis de terpenos

    Catin allico estabilizado por resonancia

    1. Adicin electroflica2. Formacin del catin terciario

    Farnesilpirofosfato (FPF)

    Prdida estereoespecfica de un protn

    Geranilgeranilpirofosfato (GGPF)

  • Catin allicoAdicin electroflicaFormacin del catin terciario

    Prdida de protn con formacin de un anillo ciclopropano

    Prdida del difosfato origina el catin primario

    Desplazamiento 1-3 de alquilo genera un nuevo anillo

    ciclopropano y favorece la formacin del catin terciario

    Ruptura del enlace origina un alqueno y favorece el catin allico

    Biosntesis de terpenos

    Triterpenos

    Catin inactivado por ataque de hidruro

    ESCUALENO

    COLA

    COLA

    W-MDesplazamiento

    1,3 de alquilo

    FPF

    FPF

  • Catin allicoAdicin electroflicaFormacin del catin terciario

    GGPF

    GGPF

    Prdida de protn con formacin de un anillo ciclopropano

    Ruptura del enlace origina un alqueno y favorece el catin allico

    W-MDesplazamiento

    1,3 de alquilo

    Prdida de protn genera un alqueno

    Prdida del difosfato origina el catin primario

    Z-FITOENO

    COLA

    COLA

    Biosntesis de terpenos

    Tetraterpenos

  • Generacin de carbocatin

    Prdida de un grupo saliente Protonacin de alquenos

    Protonacin y apertura del anillo del epxido

    Metilacin de alqueno va SAM

    Adiciones inter- e intramolecular

    Intramolecular adicin: ciclacin

    IPPF GPFAdicin electroflica del

    catin sobre el doble enlace

    Reacciones caractersticas en la biosntesis de terpenos

  • Reordenamiento de Wagner- Meerwein

    Carbocatin secundarios

    Carbocatin secundario

    Carbocatin terciario

    Carbocatin secundario

    Carbocatin terciario

    desplazamiento 1,2- de hidruro

    desplazamiento 1,2- de metilo

    desplazamiento 1,2- de alquilo

    desplazamiento 1,2- de hidruro

    Carbocatin terciario

    Catin allico estabilizado por resonancia

    Carbocatin terciario, pero anillo de cuatro

    miembro tenso

    Carbocatin terciario, pero anillo tenso de

    cuatro miembro

    Carbocatin secundario, pero la tensin del anillo reducida en el anillo de

    cinco miembro

    una serie de desplazamientos concertados 1,2 de hidruro y metilo

    Reacciones caractersticas en la biosntesis de terpenos

  • Descarga del carbocatin

    Prdida de protn Ciclacin / Prdida de protn

    O- Alquilacin

    Carbocatin estabilizado por

    resonancia

    DMAPFdifosfato es un

    buen grupo saliente o

    Adicin de agua, formacin de alcoholes

    Reacciones caractersticas en la biosntesis de terpenos

  • OW-MDesplazamiento

    1,2 de alquilo

    H2O

    W-MDesplazamiento 1,3 de hidruro

  • Biosntesis de AlcaloidesAminocidos precursores

    L-Triptfano L-Tirosina L-Lisina cido antranlico L-Histidina (Aminocido bsico) L-Ornitina L-Lisina cido nicotnico

    Aminocidos aromticos

    Aminocidos alifticos bsicos

  • L-Triptfano cido antranlicoL-Fenilalanina L-Tirosina

    L-Ornitina L-Lisina

    HN

    N COOH

    H2N

    Histidinacido nicotnico

    Aminocidos precursores de los alcaloides

  • Lisina

    Ornitina

    Histidina

    Antranilato

    Triptfano Tirosina Fenilalanina

    cido nicotnico

    Condensacin de aminocidos alifticos

  • CH3

    NH3C

    Alcaloides derivados de la L-Ornitina

    PIRROLIZIDINA

    ORNITINA

    PIRROLIDINATROPANO

    NN

    NCLEOS BSICOS

  • Alcaloides derivados de la L-Lisina

    PIPERIDINAQUINOLIZIDINA INDOLIZIDINA

    LISINA

    NH

    N N

    NCLEOS BSICOS

  • NN

    N

    N

    NH

    N

    N

    Alcaloides derivados del cido Nicotnico-L-Ornitina/-L-Lisina

    PIRIDINA

    PIRIDINA-PIRROLIDINA PIRIDINA-PIPERIDINA

  • Reacciones caractersticas de la biosntesis de alcaloides

    Formacin de Base de Shiff Condensacin de Mannich Condensacin aldlica entre grupos

    iminos

  • Formacin de Base de Schiff

    Condensacin de Mannich

    Reacciones caractersticas de la biosntesis de alcaloides

    Ataque nucleoflico sobre el carbonilo

    Amina primaria

    Amina secundaria

    Equilibrio entre especies, protn pede estar sobre el

    N sobre el O Eliminacin de agua

    Imina o Base de Shiff

    Base de Shiff cuaternaria

    Ion iminium

    Adicin nucleoflica sobre el ion iminium

    Nuclefilo tipo carbanin (ion enolato)

  • Condensacin aldlica entre grupos iminos

    Reacciones caractersticas de la biosntesis de alcaloides

    Imina

    Enamina

    Enamina

    Imina protonada

    Producto de la adicin tipo aldol

    Tautamerismo imina-enamina

    Reaccin tipo aldol entre dos sistemas de iminas

  • NCH3

    O

    Alcaloides derivados de la L-ornitina

    H2NCOOH

    NH2

    H2N

    NH2NH

    CH3

    NH2NH

    CH3

    o

    N

    CH3

    H2C SCoA

    O

    N

    CH3

    SCoA

    O

    N

    CH3

    O

    SCoA

    O

    L-Ornitina

    -CO2PLP

    Putrescina

    N-metilacin

    SAM

    Desaminacin oxidativa

    N-metil-putrescina

    Base de Shiff

    N-metil-1-catin pirrolinio

    Condensacin de Mannich intermolecular

    HIGRINA

    Hidrlisis-CO2

    Acetil-SCoA

    Condensacin de Claisen

    H2C SCoA

    O

    N

    O

    COSCoA

    H3C

    N

    O

    COSCoA

    H3CN

    OH

    COOCH3

    H3C

    O

    N

    COOCH3

    H3C O

    CoAS

    O

    Oxidacin para generar el catin pirrolinio; formacin del anin enolato en la cadena

    O

    Condensacin de Mannich intramolecular

    +

    +

    Acetil-SCoA

    L-fenilalanina

    Formacin del metilester y reduccin estereoespecfica del carbonil para dar 3-alcohol

    SAMNADPH

    Formacin del ster

    COCANA

    Metilecgonina

    Bencil-CoA

  • NH2

    NH2

    H2N

    NH2

    N

    NH2NH2

    HN

    NH2NH2

    HN

    CHO

    NH2

    N

    NH2

    N

    CHOH

    N

    OHHHO

    Putrescina Putrescina

    NAD+ NADH

    Homoespermidina

    Base de Shiff

    Condensacin de Mannich

    intramolecular

    Desaminacin oxidativa

    RETRONECINA

    Desaminacin oxidativa

    Homoespermidina sintetasaL-Ornitina

    Oxid. y Reduc.

    N

    CHO

    N

    CHO

    Alcaloides derivados de la L-ornitina

  • NH2 NH2

    COOH

    NH2 NH2 NH2 O N

    NH

    COSCoA

    O

    COSCoA

    ONH

    O

    COSCoA

    NH

    O

    N

    O

    CH3

    NH

    O

    NH

    NH

    N

    O

    H3C

    -CO2PLP

    Desaminacin oxidativa

    Base de Shiff

    Condensacin de Mannich

    intermolecularHidrlisis

    -CO2

    Condensacin de Mannich

    intramolecular

    Condensacin de Mannich

    intermolecular

    L-Lisina Cadaverina 1-piperideina

    H+

    Acetoacetil-CoA

    2 x Acetil-CoA

    SAM

    PELLETIERINA

    N-METILPELLETIERINAANAFERINA

    PSEUDOPELLETIERINA

    +

    1-catinpiperidinio

    Alcaloides derivados de la L-lisina

    1-catinpiperidinio

  • Alcaloides derivados del cido nicotnico-L-ornitina/L-lisinaOP

    O

    HO COOH

    H2N COOH N

    HO COOH

    COOH N

    COOH

    COOH N

    COOH

    H

    H

    NH

    HH

    C

    H

    O

    O H

    NH

    H

    H

    H

    NCH3

    NH

    H

    NCH3

    H

    H

    N

    NCH3H

    Deshidratacin y Deshidrogenacin

    cido quinolnico CIDO NICOTNICO

    -CO2

    1,4-Reduccin de piridina

    a dihidropiridina

    cido dihidronicotnico1,2-dihidropiridina

    -CO2

    N-metil-1-catin pirrolinio

    Aldolizacin entre la enamina y el ion

    iminio

    Oxidacin de dihidropiriridina

    NADP+

    NICOTINA

    L-ORNITINA

    Gliceraldehido-3-fosfato

    L-cido asprtico

    Putrescina

    NH

    H

    NH

    L-LISINA

    Cadaverina

    N

    HNH

    ANABASINA

    1-catin piperidinio1,2-dihidropiridina

  • Sugiera una ruta biosinttica razonable para los compuestos 1-3 a partir de sus precursores inmediatos.

    1

    2

    3

    3 MalonilCoA +

    +

    +

    Tema N 6Metabolismo secundarioNmero de diapositiva 2Nmero de diapositiva 3Nmero de diapositiva 4Metabolitos secundariosMetabolismo secundarioNmero de diapositiva 7Nmero de diapositiva 8Nmero de diapositiva 9COMPUESTOS FENLICOS DERIVADOS DE LA RUTA DEL CIDO SIQUMICOALCALOIDES INDLICOS derivados del aminocido aromtico triptfanoNmero de diapositiva 12Ruta del acetato polimalonatoCOMPUESTOS FENLICOS DERIVADOS DE LA RUTA ACETATO-POLIMALONATONmero de diapositiva 15Reacciones intramoleculares de los polictidosCondensacin Aldlica y Condensacin de ClaisenNmero de diapositiva 18Nmero de diapositiva 20Nmero de diapositiva 21Nmero de diapositiva 22Ruta del cido mevalnicoRuta 1-desoxi-D-xilulosa-5-fosfato (DOXP) / 2-C-metil-D-eritritol-4-fosfato (MEP) Nmero de diapositiva 25Nmero de diapositiva 26Biosntesis de terpenosNmero de diapositiva 28Nmero de diapositiva 29Nmero de diapositiva 30Nmero de diapositiva 31Nmero de diapositiva 32Nmero de diapositiva 33Nmero de diapositiva 34Reacciones caractersticas en la biosntesis de terpenosNmero de diapositiva 36Biosntesis de AlcaloidesAminocidos precursoresNmero de diapositiva 38Nmero de diapositiva 39Alcaloides derivados de la L-OrnitinaAlcaloides derivados de la L-LisinaAlcaloides derivados del cido Nicotnico-L-Ornitina/-L-LisinaReacciones caractersticas de la biosntesis de alcaloidesFormacin de Base de SchiffCondensacin aldlica entre grupos iminosAlcaloides derivados de la L-ornitinaNmero de diapositiva 47Nmero de diapositiva 48Alcaloides derivados del cido nicotnico-L-ornitina/L-lisinaNmero de diapositiva 50