Mejoramiento Genético Animal

16 abril 2014

Valor de los reproductores:

Proceso de selección de machos para reemplazos en el rodeo Hereford de R7

Rodeo AngusObjetivo: Facilidad de parto. Fertilidad. Mayor tamaño.

Rodeo HerefordObjetivo: Facilidad de parto. Fertilidad. Desarrollo muscular

Rodeo Criollo Objetivo:Mantenimiento de la variabilidad genética. Desarrollo muscular

Esquema de trabajo

• Valoración genética rodeo Hereford• Clasificación y elección de los machos

destetados 2014. Planillas• Miércoles 23: Reserva 7:• Selección de los terneros que quedarán

enteros (Angus; Hereford y Criollo)• Mediciones posdestete de los toritos (A, H y C)

seleccionados por el grupo de la cursada 2013.

Programa de selección en rodeo Hereford a partir de 2004

• Objetivo: Incrementar el crecimiento hasta el destete de la progenie, sin alterar la facilidad de parto del rodeo y mejorar las características carniceras y reproductivas de los reproductores.

• Criterios de selección:– EBVpnd– EBVpdd– Circunferencia escrotal 18 meses– Espesor de grasa dorsal y lumbar a los 18 meses– Area del ojo del bife a los 18 meses de edad

Estrategia de selección

• Niveles independientes de selección

• Incorporación de genes favorables para el desarrollo muscular a través de la incorporación de semen de reproductores mejoradores.

Yarará

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Dominante

Palenque

Resumen padres Hereford 2013

Toro Nombre HBA fechanac Rodeos hijos FPD PN PD PA PF CE AOB GD

Palenque Palenquero Dominante 117 X 409347 16-08-05 3 17 1.5 27.9 41.4 44.4 0.90 2.77 0.43

Dominante Palenquero Felton 59 X 387201 04-08-98 13 431 0.6 16.4 26.4 27.7 0.80 0.06 0.71

Nico La Elisa X249 Cerro Cavalier X 392384 24-08-99 17 156 1.3 1.0 15.5 19.9 21.6 0.10 1.36 -0.66

identip nombre n_padre 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 total9914094   720 9                 9

10114779   740 8                 810114930   741 9                 9

100750 Emilio (Scioli) 750 4                 410215080   756 10 13               2310215134   757 9 6 17             3210315409   766   7 6 14           2710315477   767   10 11             2110215158   768   11               1110415956   778     4             410415984   779     12 10           2210415965   780     1             110415950   793       8           810516117   794       8 2         1010516321   795       16 2         18

100804 Yarará 804         4 1       5100805 Dominante 805         5 3 1     9

10616519   806         8         810616556   807         3 3       610516081   808         1         110716877   824           11       11

100825 Tabarís 825           2 2     4100826 Campeón 826           2 1   3 6

10716851   827           5       510716742   829             6     610716897 B 041 843             16 6   2210817135   850             18     1810817089   854             2     2

100859 Trueno 859             2 1 1 410917530 C 831 871               13   13

100874 Nico 874               1 1 2100875 Palenque 875               3   3

10817073   879                 19 1911017851   881                 1 111017823   882                 5 5

Total 49 47 51 56 25 27 48 24 30 327

1- Hijos por padre a partir 2005

2- distribución por año

Procesamiento ENDOG

Salida ENDOG 2014.xls

Padre Madre

6.83 7.01 6.49 8.06

Padre Madre Padre Madre

Intervalos generacionales para cada vía del mejoramiento

1 2 3 4 5 60.000

0.020

0.040

0.060

0.080

0.100

0.120

Evolución de la consanguinidad por generaciones

FxFcons

Generaciones

Fx

Ge N F POR FP AR NE0 278 0.000 0.0051 842 0.003 0.04 0.066 0.022 198.302 599 0.018 0.51 0.036 0.037 31.703 423 0.030 0.96 0.031 0.049 43.104 275 0.048 1.00 0.048 0.059 26.205 186 0.064 1.00 0.064 0.063 30.106 28 0.100 1.00 0.100 0.065 12.90

1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51 530.000

0.010

0.020

0.030

0.040

0.050

0.060

0.070

0.080

Consanguinidad promedio por año de nacimiento

Año de nacimiento: 1: 1960 ; 54 : 2013

Fx p

rom

edio

Ind. Fenotipico

Incorporación to-ros

Pichuco 1537 859534

8810585

9111430 9412480

971352610014377 10415950 10817135

10114930 10415956 10716877

9813892

10114779 10516081

1021513410516117 10817089

10716897

92118549613073 9914094

10215080 10616519

10315409 10716851

10516321 10817073

9613166 10014350 10315477 10616556

9211893

8810590 91114519512799

9512866

Línea Pichuco (537)

Nacimientos 2013 – destete 2014

Archivo hereford_tot.xls

animal identip identim fechanacsexo linea

pd180 identi

ncampo

n_madre

n_padre

pmadpar

pesona

cpmades

pesodes

edad_ma fechades

11318609 11017823 11017834 28-07-13 1 804 160 18609 3081 5657 882 385 32 400 207 3 01-04-1411318611 11017823 11017880 28-07-13 1 804 138 18611 3083 5658 882 392 30 366 178 3 01-04-1411318683 100859 10917456 21-08-13 1 859 125 18683 3157 5598 859 349 35 335 146 4 01-04-1411318693 100826 10716720 22-08-13 1 826 143 18693 3167 5441 826 452 38 413 167 6 01-04-1411318723 10817073 10516248 31-08-13 1 537 151 18723 3197 5337 879 396 40 411 171 8 01-04-1411318729 10817073 10516362 02-09-13 1 537 141 18729 3203 5343 879 338 36 322 159 8 01-04-1411318763 10817073 10716787 10-09-13 1 537 188 18763 3237 5450 879 405 47 481 206 6 01-04-1411318773 10817073 10716745 11-09-13 1 537 154 18773 3247 5447 879 371 40 385 168 6 01-04-1411318779 10817073 10716866 12-09-13 1 537 194 18779 3253 5452 879 386 43 212 6 01-04-1411318795 10817073 10215102 15-09-13 1 537 157 18795 3269 5119 879 429 37 385 169 11 01-04-1411318809 10817073 10716781 17-09-13 1 537 158 18809 3283 5449 879 352 36 398 169 6 01-04-1411318813 10817073 10616573 17-09-13 1 537 140 18813 3287 5394 879 342 38 354 149 7 01-04-1411318829 10817073 10716844 20-09-13 1 537 128 18829 3303 5451 879 349 29 341 135 6 01-04-1411318857 10817073 10716759 25-09-13 1 537 134 18857 3331 5448 879 352 42 138 6 01-04-1411318863 11017851 10917389 26-09-13 1 804 153 18863 3337 5585 881 464 40 496 157 4 01-04-1411318877 10817073 10817082 03-10-13 1 537 122 18877 3351 5571 879 344 39 338 122 5 01-04-1411318887 10817073 10516076 08-10-13 1 537 164 18887 3361 5325 879 401 34 453 160 8 01-04-1411318614 11017823 11017970 02-08-13 2 804 130 18614 3086 5691 882 468 32 428 164 3 01-04-1411318704 100826 10917408 21-08-13 2 826 159 18704 3178 5596 826 413 44 479 187 4 01-04-1411318706 10817073 10415958 22-08-13 2 537 156 18706 3180 5259 879 428 28 456 186 9 01-04-1411318708 100826 10516220 22-08-13 2 826 157 18708 3182 5334 826 425 36 401 185 8 01-04-1411318740 10817073 10716733 28-08-13 2 537 150 18740 3214 5444 879 408 32 439 174 6 01-04-1411318744 10817073 10215196 29-08-13 2 537 149 18744 3218 5130 879 444 36 450 171 11 01-04-1411318746 10817073 10516268 29-08-13 2 537 159 18746 3220 5341 879 522 39 538 182 8 01-04-1411318750 10817073 10516286 30-08-13 2 537 145 18750 3224 5342 879 428 36 414 165 8 01-04-1411318776 10817073 10616540 07-09-13 2 537 144 18776 3250 5391 879 422 30 383 161 7 01-04-1411318870 10817073 10516258 27-09-13 2 537 143 18870 3344 5339 879 467 39 514 146 8 01-04-1411318621 11017823 11017814 31-07-13 3 804 145 18621 3093 5687 882 450 42 474 182 3 01-04-1411318633 11017823 11017921 05-08-13 3 804 157 18633 3105 5694 882 366 40 417 196 3 01-04-1411318703 100874 10917470 24-08-13 3 874 131 18703 3177 5590 874 393 32 368 153 4 01-04-14

Toro Nombre HBA fechanac padre

Palenque Palenquero Dominante 117 X 409347 16-08-05 Palenquero Felton 59

Dominante Palenquero Felton 59 X 387201 04-08-98 Feltons 480

Nico La Elisa X249 Cerro Cavalier X 392384 24-08-99 Duoble Royal Choice of el Cerro

Mostrar pedigris

padre n_padre ncampo pesonac pesodes PD180

B 041 843 2169 30 171 151.44

C 831 871 2181 33 160 145.61

C 831 871 2193 32 149 140.00

Palenque 875 2219 28 150 148.66

Palenque 875 2237 31 134 135.16

Nico 874 2241 40 160 161.35

Trueno 859 2253 45 139 141.14

C 831 871 2267 24 63 64.58 guacho

C 831 871 2299 36 134 146.25

C 831 871 2301 30 121 132.38

B 041 843 2303 33 95 102.75

C 831 871 2305 32 129 141.81

Toritos nacidos en 2012

Pedigree de los toritos nacidos en 2012

NICOHBA: Px 392384

PALENQUEHBA: X 409347

2241

2219 2237

DominanteHBA: X 387201

871R7

2181

2299

2193

2267

2301 2305

Pichuco (1981)

15134 (757) 2002

13892 (708) 1998

12480 ( 683) 1994

11430 (647) (1991)

10585 (629) (1988)

9534 (581) (1985)

16897 (843) 2007

Usado al abrir el rodeo en 1985 aprox. Seleccionado por pertenecer a las líneas chicas

2169 2303

Trueno (2000)

2253

Valoración Genética Rodeo Hereford para los componentes de peso al

nacer y peso al destete

Qué efectos fijos pueden afectar los valores de peso al nacer y destete?

De qué forma?

Cómo se pueden estimar?

Y corregir?

El peso al nacer afectará el peso al destete?

Efecto Nivel Categoría

Sexo

Machos 1

Hembras 2

novillos 3

Edad de la madre al parto

2-3 1

4 2

5-7 3

8 a más 4

Mes de Nacimiento

5-6-7 1

8 2

9 3

10 a más 4

Valoración genética para peso al nacer y destete (multicarácter) en el rodeo

Hereford de R7

• Efectos fijos: año, sexo, edad madre, mes de nacimiento

• Efectos aleatorios: peso al nacer directo, peso al nacer materno, peso al destete directo, peso al destete materno

• Efecto ambiental aleatorio: ambiente permanente

Evaluación (ej. MTDFREML)

1. MTDFNRM : calcula las relaciones de parentesco

2. MTDFPREP: indica los efectos del modelo y su ubicación en el archivo de datos.

3. MTDFRUN: a partir de información fenotípica y genética brindada predice los valores genéticos y del ambiente permanente.

1 && A -1 (0) ANI SIRE DAM (1) ANI SIRE MGS999999999 && valor maximo ID0 && valor minimo IDPedigree_2013.prn && ficheiro com os dados de genealogiasident.1 && yes recod e calcular consang.3 && variaveis integrass1 && animal2 && pai3 && mae0 && sem grupos

MTDFNRM

Tarjeta de parámetros:

153 0 0 154 0 0 155 0 0 156 0 0 157 0 0 158 0 0 159 0 0 160 0 0 161 0 0------------------------------------------

11318813 10817073 10616573 11318829 10817073 10716844 11318857 10817073 10716759 11318863 11017851 10917389 11318870 10817073 10516258 11318877 10817073 10817082 11318887 10817073 10516076

Ped_Here_2014.prn

Salidas:

MTDF11.txt

MTDF13.txt

MTDF56.txt

Otros de programación

MTDFPREPdatos_here.prn Hereford_2014 && titulo del analisis*6 && variaveis integras2 && variaveis reais2 && n§ caract. analisadosPnd && nome do caract. analisado1 && posicao do caract. analisado0 && quando nao existe 0 && n§ de covariaveis4 && n§ efeitos fixosanio && nome 1§ ef. fixo3 && posicao 1 && yes recodificasexo && nome 2§ ef. fixo4 && posicao 1 && yes recodificaem && nome 3§ ef. fixo5 && posicao 1 && yes recodifica

mn && nome 4§ ef. fixo6 && posicao 1 && yes recodifica1 && posicao ef. animal2631 && n§ elemento A-11 && yes para "seg. ef. animal"pnm && nome "seg. ef. animal"2 && posicao 1 && n§ ef. ambientais aleatorios do caract. analisadopermanente1 && nome dos ef. ambientais aleatorios2 && posicao dos ef. ambientais aleatorios1 && escribe efectos recodificados en 66 Pdd && nome do 2do. caract. analisado2 && posicao do caract. analisado0 && quando nao existe 0 && n§ de covariaveis4 && n§ efeitos fixosanio && nome 1§ ef. fixo3 && posicao 1 && yes recodifica

sexo && nome 2§ ef. fixo4 && posicao 1 && yes recodificaem && nome 3§ ef. fixo5 && posicao 1 && yes recodificamn && nome 4§ ef. fixo6 && posicao 1 && yes recodifica1 && yes para "seg. ef. animal"pdm && nome "seg. ef. animal"2 && posicao 1 && n§ ef. ambientais aleatorios do caract. analisadopermanente2 && nome dos ef. ambientais aleatorios2 && posicao dos ef. ambientais aleatorios1 && escribe efectos recodificados en 661 && yes para recodificar ef. ambientais aleatorios1 && yes para escrever informacao de ef. fixo e cov.1 && yes para escrever informacao de ef. ambientais aleatorios

Salidas:

MTDF21.txt

MTDF22.txt

MTDF66.txt

MTDFRUNHereford_2014 && titulo del analisi*0 && 0 start 1 restart2 && 1 varconp, 2 BVs, 3 ou 40 && constraints0 && data reordered1 8.444 && var. aditiva a12 1.193 && cov aditiva a1a2 3 0.071 && cov a1m14 1.474 && cov a1m25 28.081 && var. aditiva a26 8.020 && cov a2m1 7 22.206 && cov a2m28 4.817 && var materna m1 9 14.558 && cov m1m2 10 128.109 && var materna m2

0 0 && fin de linea1 && confirma valores0 && mantener varianza constante1 0.0002 && var. permanente c12 0.0 && cov. perman c1c23 58.240 && var. permanente c2 0 0 && fin de linea1 && confirma valores0 && mantener varianza constante1 7.789 && var. ambiental e12 26.122 && cov. ambiental e1e23 311.946 && var. ambiental0 0 && fin de linea1 && confirma valores0 && mantener varianza constante1 && ? solucion para ef. fijos1 && ? descodificar ef. fijos1 && ? solucion para animales1 && ? solucion para ef. permanentes1 && ? descodificar ef. permanentes

Salidas:

MTDF76.txt

MTDF77.txt

MTDF78.txt

MTDF79.txt

19601963

19661969

19721975

19781981

19841987

19901993

19961999

20022005

20082011

-50.000

-40.000

-30.000

-20.000

-10.000

0.000

10.000

20.000

30.000

40.000

BLUE´s para el efecto fijo año de nacimiento

Pnd Pdd

Kg.

M.enteros hembras M. castrados

-8.000

-6.000

-4.000

-2.000

0.000

2.000

4.000

6.000

1.022

-1.412

0.000

5.320

-6.561

0.000

BLUE´s para el efecto fijo sexo

sexo

Kg

2-3 años 4 años 5-6-7 años 8 a más

-10.000

-8.000

-6.000

-4.000

-2.000

0.000

2.000

4.000

6.000

8.000

-8.864

-0.151

6.487

0.000

Blue´s para el efecto fijo edad de la madre

Categoría de EM

kg

< = julio agosto sept O-N-D

-8.000

-6.000

-4.000

-2.000

0.000

2.000

4.000

6.000

8.000

1.018 1.123 1.488 2.040

7.007

0.000

-2.216

-6.346

BLUE´s para el efecto fijo mes de nacimiento

Axis Title

Kg

3081

3083

3157

3167

3197

3203

3237

3247

3253

3269

3283

3287

3303

3331

3337

3351

3361

-6.00 -5.00 -4.00 -3.00 -2.00 -1.00 0.00 1.00 2.00 3.00 4.00

EBV_PNd y EBV_PDd machos Hereford nacidos 2013

EBV_pdd EBV_pnd

Yarará

Trueno

Campeon

2169

2181

2193

2219

2237

2241

2253

2267

2299

2301

2303

2305

-5.0000 -4.0000 -3.0000 -2.0000 -1.0000 0.0000 1.0000 2.0000 3.0000 4.0000 5.0000

Valores Genéticos Predichos toritos nacidos 2012

EBV_pddEBV_pnd

BLUP, kg

Torit

os