la colección nuevas especies mexicanas para la historia de la biología en méxico

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2º Encuentro de Estudiantes de Historia de la Ciencia FES Acatlán 15 al 18 de octubre de 2013 La Colección Nuevas Especies Mexicanas para la historia de la biología en México Presentan: Diana Ramírez Alvarez Layla Michán Laboratorio de Cienciometría, Información e Informática Biológica (CIIB) Facultad de Ciencias, UNAM 1

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2º Encuentro de Estudiantes de Historia de la Ciencia FES Acatlán

15 al 18 de octubre de 2013

La Colección Nuevas Especies Mexicanas para la historia de

la biología en México

Presentan:Diana Ramírez Alvarez Layla MichánLaboratorio de Cienciometría, Información e Informática Biológica (CIIB)Facultad de Ciencias, UNAM

1

Contenido

IntroducciónDiversidad mexicanaHerramientas informáticasPlataforma DspaceEl Sistema de Información Ciencias de la Facultad de Ciencias, UNAM

Material y MétodoElección de la plataforma DspaceDescriptores de la información. Dublin CoreColecciones utilizadas

Resultados

Conclusiones

2

3

Introducción

• México: mega diverso

• Taxonomía

• Descripción de nuevasespecies

• Publicacionestaxonómicas

• Descritas 108, 000especies

• Estiman 220, 000especies

4

• Avance del cómputo

• Modificación de la práctica taxonómica tradicional

• Objetos digitales

• Repositorios/Sistemas de Informaciónresguardarmanejardistribuirpreservar

5

Repositorio Institucional:Deposito de objetos electrónicos alojado en un servidor, que sistematiza, da acceso librea los trabajos de una institución y preserva estos recursos digitales a largo plazo.

¿Por qué usar DSpace?• Interfaz abierta• Robusta• Interoperable• Amigable

http://www.dspace.org/whos-using-dspace

1, 536 Repositorios a nivel mundialusan DSpace

6

• Archivar• Preservar• Clasificar• Compartir en acceso abierto

• Documentos• Metadatos: 15

descriptores básicos

7

• Publicaciones dispersas en tiempo yespacio

• Es difícil la recuperación• Pocos están disponibles para consulta

• Localizar , reunir, sistematizar y difundir• Enriquecer el acervo taxonómico• Herramienta para el estudio de la

historia de la ciencia mexicana

Primera etapa de diseño y prueba de la colección de registros bibliográficossobre nuevas especies en México

Establecer estructura y características de datos y metadatosPosibilidad del sistema para el estudio de la descripción de nuevasespecies en México a través del tiempo

http://repositorio.fciencias.unam.mx:8080/xmlui/handle/11154/139839

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Método

AccesibleConsistenteInteroperableEficienteFácil

Acceso abierto InteroperableWeb 2.0Intercambio de información

1. Revista de la Sociedad Mexicana de Historia Natural2. Nuevas especies descritas por investigadores del

Instituto de Biología, UNAM3. Sinopsis de la Herpetofauna de México de H. Smith

Literatura académicaRevista Entidad académicaMulti-idioma

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Resultados

• 1, 372 registros sistematizados

• Temporalidad 1758 – 2011

• 26 metadatos que describen a cada uno de los registros• 17 son metadatos bibliográficos• 9 son metadatos taxonómicos

• 15 formas diferentes de referirse a una nueva especie en una descripcióndentro de la literatura

10Numero de publicaciones por año en la colección Nuevas Especies Mexicanas

n=1, 372

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Campo Etiqueta del metadato Definición Categorías y ejemplos

Título dc.title Título del documentoEjemplo: A morphologically distinct new species of Pseudoeurycea(Caudata : Plethodontidae) from the Sierra Madre Oriental of Puebla, Mexico.

Autor (es) dc.contributor.authorNombre del investigador o investigadores que realizaron el estudio.

Ejemplo: Parra-Olea, G.

Año dc.date.issued Año en que se publicó el documento Ejemplo: 2004

Revista dc.relation.journalTítulo de la revista en la que se publicó el artículo

Ejemplo: Herpetológica

Volumen, número, páginas

dc.souce.novolpagesVolumen y número del ejemplar de la revista donde está publicado el artículo. Numero de paginas

Ejemplo: 60, 478–484

ISSN dc.identifier.issn Estándar internacional para revistas Ejemplo: 1938-5099

DOI dc.identifier.doi Identificador de Objetos Digitales Ejemplo: 10.1655/03-76

Resumen dc.description.abstractPequeña reseña que abarca todo el contenido del estudio.

Ejemplo: A new species of Pseudoeurycea is described from cloud forests of the Sierra Madre Oriental of Puebla, México. The new species is distinguished from all other Pseudoeurycea by its small size, stout body, short tail, large nostrils, presence of characteristic glandular convergent ridges on the pelvic region and the tail, and by its distinctive limb structure, with very small hands and feet that are extensively webbed and bear prominent but short and pointy middle digits. The only apparent close relative of this species is P. praecellens, from which it differs by the position and distribution of the dorsal and caudal glands, body proportions, nostril size and coloration. All specimens of the new species were found in cloud forest, under a canopy of Liquidambar, Quercus, and arborescent ferns, as well as in a coffee grove. The elevational range for the species is narrow, between 905 and 1400 m, unusually low elevations for Pseudoeurycea.

Ejemplo de metadatos bibliográficos de los registros de la colección Nuevas Especies Mexicanas

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Campo Etiqueta del metadato Definición Categorías y ejemplos

Disciplina dc.coverage.thematicDisciplina a la que se refiere el taxón estudiado

Categorías: Zoología, Botánica, Micología Ejemplo: Zoología

Cantidad de especies descritas

dc.description.spNúmero de especies descritas o analizadas en el artículo

Ejemplo: 1

Categoría taxonómica

dc.description.taxon Taxón de estudioEjemplo: Animalia|Chordata|Amphibia|Caudata|Plethodontidae|Pseudoeurycea|Pseudoeurycea quetzalanensis

Localidad dc.description.taxonlocLocalidad donde fue ubicado el holotipo

Ejemplo: Xocoyolo, 1400 msnm, Municipio de Cuetzalan del Progreso

Latitud dc.description.taxonlatCoordenadas geográficas. Latitud

Ejemplo: 19.9667

Longitud dc.description.taxonlonCoordenadas geográficas. Longitud

Ejemplo: -97.5333

Estado de la República Mexicana

dc.description.taxonstateEstado de la República Mexicana en que se realizó el estudio

Categorías: Aguascalientes, Baja California, Baja California Sur, Campeche, Chiapas, Chihuahua, Coahuila, Colima, Distrito Federal, Durango, Estado de México, Guanajuato, Guerrero, Hidalgo, Jalisco, Michoacán, Morelos, Nayarit, Nuevo León, Oaxaca, Puebla, Querétaro, Quintana Roo, San Luis Potosí, Sinaloa, Sonora, Tabasco, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz, Yucatán, Zacatecas. Ejemplo: Puebla

País del estudio

dc.coverage.spatialPaís en el que se realizó el estudio

Ejemplo: México

Colección dc.description.indexBase de Datos en la que se encuentra el artículo

Ejemplo: UNIBIO Instituto de Biología, UNAM

Ejemplo de metadatos taxonómicos de los registros de la colección Nuevas Especies Mexicanas

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Nube con las variables usadas para la descripción de nuevas especies mexicanasdentro de las publicaciones de la colección

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Registro sobre nueva especie dentro de la

plataforma del Sistema de Información Ciencias, UNAM

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Conclusiones

• Las colecciones bibliográficas representan una de lasherramientas más completas, sofisticadas y útiles para elmanejo de información y textos en la actualidad, lainformación sobre biodiversidad.

• La información sobre la descripción de nuevas especies esestratégica y representa un material indispensable parareconstruir la historia de la biología de nuestro país.

• La inclusión de estas tecnologías ofrece grandesposibilidades a los historiadores de la ciencia, este es unode los propósitos de la colección de Nuevas EspeciesMexicanas del Sistema de Información Ciencias, de laFacultad de Ciencias UNAM.