filogenia de la familia felidae

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Breve resumen de la filogenia de la familia Felidae

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RELACIONES FILOGENETICAS DEL GENERO PANTHERA DE LA FAMILIA FELIDAELaura Alejandra Pabn Viteri1*[email protected]*Pontificia Universidad Javeriana, Bogot, Colombia, Estudiante Facultad de CienciasResumen El gnero panthera consiste de len (P. leo), tigre (P. tigris), jaguar (P. onca), leopardo (P. pardus) y leopardo de las nieves (P. uncia). El linaje panthera divergi del actual grupo de felidae hace aproximadamente menos de 11millones aos. Debido a la gran radiacin de panterinos en el Plioceno, no se tiene claro sus relaciones evolutivas. Se ha usado genes mitocondriales para reconstruir estas relaciones filogenticas. IntroduccinGran parte de las especies de la familia Felidae son consideradas como especies que corren peligro, esto esta muy denotado en los panterinos (Baillie et al, 1996; Davis et al, 2010). Actualmente se est buscando usar la informacin gentica de dichas especies, con el fin de buscar alternativas de conservacin (Schipper et al, 2008; Davis et al, 2010). Los panterinos han sido el linaje que ha evolucionado ms recientemente, divergido hace aproximadamente 1-8 millones de aos, adems es de los grupos ms grandes de la familia Felidae. El gnero panthera est conformado por grandes flidos y de mediano tamao. Se han asignado de 2 a 13 gneros clasificados bajo diferentes esquemas (Nowak, 1999; Yu et al, 2005), aunque las relaciones que se han designado has sido muy controversiales.

Fig 1. Hiptesis filogenticas del genero Panthera. Basados morfolgicamente (A-B). Basados en estudios bioqumicos y moleculares (C-M). (Davis et al, 2010) Existe un registro fsil que provee muy poca informacin sobre los flidos. Estos tuvieron una gran propagacin en el Plioceno, los procesos de especiacin sucedan en un periodo de tiempo que poda llegar a ser menor a 1 millos de aos (Johnson et al, 2006; Davis et al, 2010). Se han tratado de establecer las relacin filogenticas usando caractersticas morfolgicas, bioqumicas y moleculares (Yu et al, 2005). Los marcadores moleculares se han usado para el estudio estructural de las poblaciones, variacin intra especfica, y relaciones filogenticas (Avise, 1994; Heup et al 2001). El DNA mitocondrial, es una molcula circular cerrada de 15-20kb. La regin de control, es una regin que no codifica, esta es la regin que evoluciona ms rpidamente en el DNA mitocondrial (Lopez et al, 1997, Heup et al, 2006). Existen dos casos datados en los que se usan numts (secuencia homologas al genoma mitocondrial), en Felidae, se han hecho en gatos domstico (Felis catus) (Lopez et al, 1994; Heup et al, 2006)Resultados y DiscusinSe seleccionaron los marcadores moleculares, a partir del genoma del gato domstico, ya que este ya ha sido secuencia completamente. Los espacios encontrados en el alineamiento de la secuencia de cDNA felino relativos al genoma humano y a los ratones fueron usados para aproximar la ubicacin de los lmites de los exones y de los intrones. Se asignaron los primers, para secuencias del jaguar, y posteriormente se secuencio su genoma. Se secuenciaron tres segmentos de genes, para todas las esecies de panterinos. Con las secuencias se constriyo una matriz incluyendo todas las redundancias representadas por nuevas secuencias. Se realizaron arboles de probabilidad de similitud: Los arboles de los genes se estimaron independientemente para cada locus (Davis et al, 2010). Fig. 2. Probabilidad de emparentamiento teniendo en cuenta los datos usado para armar la matriz, . (Davis et al, 2010)ConclusinSe desarroll una filogenia para intependiente para los panterinos, usando informacin previamente publicada como complemento. Se sacaron inferencias filogenticas, a partir de las probabilidades de emparentamiento y de la inferencia filogentica Bayesiana. Se construy una topologa para el gnero pantera ms exacta partiendo de una cantidad considerable de regiones genmicas. Se demostr que la interpretacin que se tena de la filogenia del genero Panthera en publicaciones previas presenta varias inconsistencias. Los tiempos de divergencia entre las especies fueron estimados. Con la matriz armada, se apoya la monofilia de los leones, leopardos y jaguares, considerando tambin rasgos morfolgicos (Davis et al, 2010).

Bibliografa:Avise, J.C., 1994. Molecular Markers, Natural History and Evolution, Chapman and Hall, New York.

Baillie, J., Groombridge, B., 1996. IUCN red list of threatened animals. International Union for Conservation of Nature and Natural Resources, Gland, Switzerland.Schipper, J., Chanson, J.S., Chiozza, F., Cox, N.A., Hoffmann, M., Katariya, V., Lamoreux, J., Rodrigues, A.S.L., Stuart, S.N., Temple, H.J., Baillie, J., Boitani, L., Lacher Jr., T.E., Mittermeier, R.A., Smith, A.T., Absolon, D., Aguiar, J.M., Amori, G., Bakkour, N., Baldi, R., Berridge, R.J., Bielby, J., Black, P.A., Blanc, J.J., Brooks, T.M., Burton, J.A., Butynski, T.M., Catullo, G., Chapman, R., Cokeliss, Z., Collen, B., Conroy, J., Cooke, J.G., da Fonseca, G.A.B., Derocher, A.E., Dublin, H.T., Duckworth, J.W., Emmons, L., Emslie, R.H., Festa-Bianchet, M., Foster, M., Foster, S., Garshelis, D.L., Gates, C., Gimenez-Dixon, M., Gonzalez, S., Gonzalez- Maya, J.F., Good, T.C., Hammerson, G., Hammond, P.S., Happold, D., Happold, M., Hare, J., Harris, R.B., Hawkins, C.E., Haywood, M., Heaney, L.R., Hedges, S., Helgen, K.M., Hilton-Taylor, C., Hussain, S.A., Ishii, N., Jefferson, T.A., Jenkins, R.K.B., Johnston, C.H., Keith, M., Kingdon, J., Knox, D.H., Kovacs, K.M., Langhammer, P., Leus, K., Lewison, R., Lichtenstein, G., Lowry, L.F., Macavoy, Z., Mace, G.M., Mallon, D.P., Masi, M., McKnight, M.W., Medellin, R.A., Medici, P., Mills, G., Moehlman, P.D., Molur, S., Mora, A., Nowell, K., Oates, J.F., Olech, W., Oliver, W.R.L., Oprea, M., Patterson, B.D., Perrin, W.F., Polidoro, B.A., Pollock, C., Powel, A., Protas, Y., Racey, P., Ragle, J., Ramani, P., Rathbun, G., Reeves, R.R., Reilly, S.B., Reynolds III, J.E., Rondinini, C., Rosell-Ambal, R.G., Rulli, M., Rylands, A.B., Savini, S., Schank, C.J., Sechrest, W., Self-Sullivan, C., Shoemaker, A., Sillero- Zubiri, C., De Silva, N., Smith, D.E., Srinivasulu, C., Stephenson, P.J., van Strien, N., Talukdar, B.K., Taylor, B.L., Timmins, R., Tirira, D.G., Tognelli, M.F., Tsytsulina, K., Veiga, L.M., Vie, J.-C., Williamson, E.A., Wyatt, S.A., Xie, Y., Young, B.E., 2008. The status of the worlds land and marine mammals: diversity, threat, andknowledge. Science 322, 225230.Brian W. Davis, Gang Li; William J. Murphy. 2010. SUpermatrix and species tree methods resolve hylogenetic relationships within the big cats, Panthera (Carnivora: Felidae). Molecular Phylogenetics and Evolution 56: 64-76.Jae-Heup Kim, Agistinho Antunes, Shu-Jin Luo, Joan Menninger, William G. Nash, Stephen J. OBrien, Warren E. Johnson., 2006. Evolutionary analysis of a large mtDNA translocation (numt) into the nuclear genome of the Panthera genus species. Gene. 366: 292- 302.

Kim Jae-Heup, E. Eizirik, S.J. OBrien, W.E. Johnson., 2001. Sttruture and patterns of sequence variaation in mitochondrial DNA control regin of great cats.Mitochondrion 14: 279-292.

Lopez, J.V., Yuhki, N., Masuda, R., Modi, W., O'Brien, S.J., 1994. Numt, a recent transfer and Tandem amplification of mitochondrial DNA to the nuclear genome of the domestic cat. J. Mol. Evol. 39 (2), 174190.

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Nowak, R.M., 1999. In: Walkers Mammals of the World, sixth ed., vol. 2. Johns Hopkins University Press, Baltimore, MD