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Estudio de Sensibilidad Antibiótica

Informe anual

2018-2019-2020

Dra. I. Fernández Natal Comisión Clínica de Infecciones, Profilaxis y Política Antibiótica

Informe de sensibilidad antibiótica de los microorganismos más comunes en el Complejo Asistencial Universitario de León-SACYL. Análisis y tendencias

Años 2018-2019-2020

Microbiología Clínica. Comisión de Infecciones, Profilaxis y Política Antibiótica. CAULE 1

ÍNDICE

1

Presentación 2

Escherichia coli

3

Klebsiella pneumoniae

6

Proteus mirabilis

7

Enterobacter cloacae 7

Morganella morganii

8

Serratia marcescens

8

Salmonella ser Typhimurium y Salmonella ser Enteritidis.

9

Pseudomonas aeruginosa

10

Stenotrophomonas maltophilia

12

Acinetobacter baumannii 12

Bacteroides fragilis

12

Campylobacter jejuni

12

Haemophilus influenzae

13

Staphylococcus aureus

13

Staphylococcus epidermidis

16

Enterococcus faecalis y Enterococcus faecium

17

Streptococcus pneumoniae

18

Streptococcus agalactiae

18

Streptococcus pyogenes

19

Recomendaciones generales

20


Años 2018-2019-2020


PRESENTACIÓN

El análisis conjunto de los resultados obtenidos con las pruebas de susceptibilidad antibiótica realizados en el Laboratorio de Microbiología Clínica del Complejo Asistencial

Universitario de León (CAULE) que viene presentando desde hace años, tiene como objetivo ser útil en el manejo adecuado de los procesos infecciosos, control de la infección nosocomial y

asociada a la asistencia sanitaria así como para establecer criterios adecuados de terapia

antibiótica empírica.

Este informe es uno de los objetivos planteados en la Comisión Clínica de Infecciones,

Profilaxis y Política Antibiótica del CAULE. Se presentan los datos correspondientes a los tres últimos años (2018-2019-2020) referidos a los microorganismos más frecuentemente aislados,

que procesa los estudios microbiológicos solicitados a la totalidad de la población del Área de

Salud de León. La interpretación de los resultados, en su mayoría, se venían realizando hasta el año 2018 según puntos de corte establecidos por Clinical and Laboratory Standards Institute

(CLSI) excepto anaerobios y S. pneumoniae según criterios del European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). A partir de entonces, se aplican criterios EUCAST

para homogeneizar criterios entre los diferentes Laboratorios en contexto del Plan Nacional de

Resistencia Antibiótica (PRAN) del Ministerio de Sanidad y su aplicación en los Programas de

Optimización de Uso de Antibióticos (PROA) de cada Hospital y Atención Primaria.

Este informe incluye los siguientes aspectos:

- Análisis de tendencias de bacterias Gramnegativas y Grampositivas,

comparando estos resultados con los proporcionados en informes previos.

- Comparaciones entre la sensibilidad de microorganismos procedentes de

determinadas Unidades, cuando es pertinente.

- Análisis más preciso de la resistencia antibiótica de las cepas de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (SAMR) que continúa siendo un problema de gran impacto

asistencial con margen de mejora en su control.

- Análisis evolutivo de la resistencia antibiótica en E. faecalis y fundamentalmente en E. faecium debido a la detección en nuestro medio de resistencia a glicopéptidos,

fundamentalmente de origen nosocomial desde el año 2008.

- Inclusión de la resistencia antibiótica de enteropatógenos, patógenos

respiratorios y anaerobios.

Aunque el estudio minucioso de este tema sobrepasa el ámbito de este informe,

aprovechamos para ofrecer a los profesionales sanitarios la posibilidad de obtener análisis

detallados aplicados a situaciones concretas.

Se incluye un último apartado con recomendaciones generales de uso de antibióticos en

nuestro medio, tanto en atención comunitaria como hospitalaria, fusionando datos

microbiológicos de tasas de sensibilidad antibiótica y patología infecciosa que ocasionan.


Años 2018-2019-2020


Escherichia coli (global CAULE)

Antibiótico Porcentaje de cepas SENSIBLES por año

2018

n=4610

2019

n=4883

2020

n=4263

Ampicilina

31.2

37.9

37.1

Amoxicilina-ac. clavulánico

77.6

77.6

77.1

Cefotaxima

85.7

83.9

79.8

Gentamicina

89.2

86.3

85.7

Amikacina 97.6 88.4 89.6

Ciprofloxacino

64.8

63.2

58.6

Cotrimoxazol

66.8

66.4

65.5

Ertapenem 99.9 99.6 99.5

Escherichia coli (UCI)

Antibiótico Porcentaje de cepas SENSIBLES por año

2018

n=85

2019

n=66

2020

n=70

Ampicilina

18.8

45.5

40.0

Amoxicilina-ac. clavulánico

77.6

83.3

78.6

Cefotaxima

67.1

83.3

70

Imipenem

100

98.4

98.6

Gentamicina

84.7

80.3

78.6

Amikacina

96.2

94.7

88.4

Ciprofloxacina

60

72.7

57.1

Cotrimoxazol

62.4

62.1

70.0


Años 2018-2019-2020


Escherichia coli UROPATÓGENO (global CAULE)

Antibiótico

Porcentaje de cepas sensibles por año

2018

n=3089

2019

n=3230

2020

n=2718

Ampicilina

32.9 40.5 40.8

Amoxicilna-ac. clavulánico

79.2 79.7 81.1

Cefotaxima

87.3 87.5 83.0

Gentamicina

90.0 87.8 87.8

Ciprofloxacina

66.4 65.9 60.2

Cotrimoxazol

68.6 68.0 67.6

Fosfomicina

96.1 94.1 92.7

Nitrofurantoína

98.3 98.4 98.6

Escherichia coli UROPATÓGENO en ATENCIÓN PRIMARIA

Antibiótico


2018

n=1914

2019

n=2020

2020

n=1722

Ampicilina

32.7 40.1 42.1


79.4 79.4 82

Cefotaxima

87.2 88.0 84.3

Gentamicina

90.1 87.6 88.9

Ciprofloxacina

64.5 64.8 60.9

Cotrimoxazol

67.8 67.1 68.2

Fosfomicina

96.0 93.8 92

Nitrofurantoína

98.4 98.2 98.5


Años 2018-2019-2020


Bacteriemias por Escherichia coli (CAULE) Antibiótico


2018

n=216

2019

n=354

2020

n=259

Ampicilina

35.1 35.4 38.6


78.7 75.4 71.4

Cefotaxima

85.6 80.8 80.5

Gentamicina

86.2 83.6 84.2

Amicacina

96.7 95.8 93.8

Ciprofloxacina

59.3 58.8 61.0

Cotrimoxazol

64 66.3 61.8

Ertapenem 100

99.4 100

Comentarios:

En E coli global del CAULE se observan variaciones discretas de tasas de sensibilidad frente a la mayoría de antibióticos expuestos. Menor número total de aislados durante 2020, pandemia por SARS CoV-2.

Cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en E. coli global, inferido por los datos de resistencia a la cefotaxima, está en los dos últimos años en torno al 20% y en el 30% en UCI.

Tendencia al incremento respecto años anteriores. Este tipo de resistencia es cruzada con otras cefalosporinas y con el aztreonam.

E. coli uropatógeno:

Se mantiene una alta tasa de sensibilidad a fosfomicina y nitrofurantoína tanto en global como en infecciones comunitarias en los tres últimos años

Alto porcentaje generalizado de resistencia a ciprofloxacino (>34%). Se desaconseja la utilización de antibióticos de la familia de las fluorquinolonas para el tratamiento empírico de las infecciones por E. coli.

El alto porcentaje de cepas sensibles a gentamicina en los últimos tres años (87-90%) no invalida su utilización clínica ni justifica su sustitución por otros aminoglucósidos, pues comparten mecanismo de resistencia en esta enterobacteria.


Años 2018-2019-2020


Klebsiella pneumoniae (CAULE)

Antibiótico Porcentaje de cepas sensibles por año

2018 n=804

2019 n=900

2020 n=778

Ampicilina 0 0 0

Amoxicilina-ac. clavulánico 67.4 66.8 64.1

Cefotaxima 70.8 67.8 63.8

Gentamicina 84.0 79.9 74.1

Tobramicina 74.5 76.2 69.5

Amikacina 94 87.5 85.5

Ciprofloxacina 65.2 63.3 58.0

Cotrimoxazol 73.1 68.1 60.6

Imipenem 93.7 94.4 94.9

Klebsiella pneumoniae (UCI)

Antibiótico


2018 n=23

2019 n=19

2020 n=29

Ampicilina 0 0 0





Amikacina 100 100 89.7



Imipenem 95.7 84.2 89.7

Comentarios: La resistencia a la ampicilina es intrínseca en esta especie. Persisten alta tasas de resistencia a cefotaxima y ciprofloxacino. Incremento generalizado de tasa de resistencia en cepas aisladas en UCI. La presencia de carbapenemasas es observada a nivel nacional. Dada la extrema multirresistencia que presentan estas cepas, es importante mantener las medidas de vigilancia y control.


Años 2018-2019-2020


Proteus mirabilis


2018 n=680

2019 n=764

2020 n=602

Ampicilina 32.2 39.6 35.5





Amikacina 98.6 75.1 81.1



Comentarios: Se observa una tendencia bastante estable para la mayoría de los antibióticos. Destaca la resistencia a ciprofloxacino, ya muy elevada en años precedentes.

Enterobacter cloacae


2018 n=318

2019 n=349

2020 n=248

Ampicilina 0 0 0

Amoxicilina-ac. clavulánico 0 0 0



Tobramicina 95.3 93 92.3

Amikacina 99.1 98.2 96.0


Cotrimoxazol 84 85.7 91.1

Comentarios: La resistencia a la ampicilina y a la combinación amoxicilina-ácido clavulánico es intrínseca en esta especie. Continúa la tendencia ascendente de resistencia a cefalosporinas. La presencia de una betalactamasa cromosómica inducible en esta especie aconseja no utilizar cefalosporinas de primera, segunda o tercera generación como tratamiento único en infecciones graves por esta enterobacteria.


Años 2018-2019-2020


Morganella morganii


2018 n=219

2019 n=235

2020 n=217

Ampicilina 0 0 0





Amicacina 97.6 92.9 92.1



Comentarios: Esta especie se comporta de forma similar a E. cloacae. La resistencia a la ampicilina y a la combinación amoxicilina-ácido clavulánico es universal en esta especie. En los resultados de sensibilidad en los años 2018-2019-2020 se observan porcentajes de resistencia elevados a cefalosporinas y quinolonas como en años precedentes. Se aconseja seguir incrementando la vigilancia epidemiológica de las infecciones por esta especie.

Serratia marcescens


2018 n= 153

2019 n=125

2020 n=128

Ampicilina 0 0 0





Ertapenem 98.6 92.6 97.6

Comentarios: Esta especie se comporta de forma similar a E. cloacae. La resistencia a la ampicilina y a la combinación amoxicilina-ácido clavulánico es universal en esta especie. Por otra parte, produce una enzima cromosómica que le confiere resistencia moderada a tobramicina. Elevada resistencia a cefalosporinas, así como la detección de algunas cepas productoras de carbapenemasas. Esta situación aconseja continuar incrementando la vigilancia epidemiológica de las infecciones por esta especie.


Años 2018-2019-2020


Salmonella ser Enteritidis


2018

2019 n=13

2020 n=19

Ampicilina 70.6 92.3 100


Ceftriaxona 100 100 100

Ciprofloxacina 100 69.2 68.4

Cotrimoxazol 88.2 92.3 100

Salmonella ser Typhimurium


2018 n= 66

2019 n=57

2020 n=34



Ceftriaxona 98.5 98.2 100



Comentarios:

Disminución del número de aislados en el año 2020 de ambos aislados.

Diferentes resultados frente a ampicilina y amoxicilina-ácido clavulánico según especie.

En general, salvo algún caso aislado, no se observan cepas productoras de BLEE en ambas especies.

La sensibilidad a ciprofloxacino ha disminuido, mientras que a cotrimoxazol continúa siendo buena en

ambas especies.


Años 2018-2019-2020


Pseudomonas aeruginosa (global CAULE)


2018 n= 1108

2019 n=972

2020 n=954

Ampicilina 0 0 0


Ceftazidima 88.3 86.9 82.3

Piperacilina-tazobactam 87.3 88.0 82.8

Imipenem 80.6 85.2 79.8

Meropenem 85.0 87.2 81.2



Amikacina 92.9 92.3 68.7


Cotrimoxazol 0 0 0

Pseudomonas aeruginosa (UCI)

Antibiótico


2018 n= 83

2019 n=28

2020 n=126

Ampicilina 0 0 0




Imipenem 50.6 64.3 58.3

Meropenem 56.1 71.4 58.7



Años 2018-2019-2020



Amikacina 89.2 89.3 41.3


Cotrimoxazol 0 0 0

Pseudomonas aeruginosa (CIRUGÍA GENERAL)


2018

2019 n=24

2020 n=41

Ampicilina 0 0 0




Imipenem 72.0 70.8 90.2

Meropenem 76.0 73.9 90.2

Gentamicina 84.0 75 73.2

Tobramicina 96.0 100 92.7

Amicacina 100 100 75.6


Cotrimoxazol 0 0 0

Comentarios: Hasta 2018, por tercer año consecutivo, se mantenía un ligero ascenso de las tasas de sensibilidad a antibióticos antipseudomónicos como piperacilina–tazobactam y ceftazidima; esta tendencia ha cambiado. Amikacina sigue siendo el aminoglucósido más activo frente a esta bacteria. Persisten cepas resistentes a carbapenémicos.

En las cepas de P. aeruginosa aisladas en el Servicio de Cirugía General se observa un nuevo descenso de la sensibilidad frente a ceftazidima y ciprofloxacino. Aunque se observa descenso de cepas productoras de carbapenemasas, su uso empírico está desaconsejado.

Dada la extrema multirresistencia de las cepas productoras de carbapenemasas (MBL), que puede sobrepasar a la familia de los betalactámicos (fluorquinolonas y aminoglucósidos excepto amikacina, en ocasiones) por mecanismos de diseminación compartidos, es importante mantener medidas de vigilancia y control estrictas para evitar su diseminación en el hospital y en UCI en particular


Años 2018-2019-2020


Stenotrophomonas maltophilia


2018 (n=205) 2019 (n=185) 2020 (n=163)


Acinetobacter baumannii


2018 (n=24) 2019 (n=14) 2020 (n=60)

Imipenem 66.7 50 10

Comentarios: Se observa un importante incremento del número de aislados y de la resistencia a

imipenen en 2020.

Bacteroides fragilis

Antibióticos Porcentaje de cepas sensibles por año

2018 (n=124) 2019 (n=52) 2020 (n=49)

Clindamicina 64.5 55.8 68.8

Metronidazol 96 98 98

Comentarios: Se continúa observando buena actividad frente a metronidazol

Campylobacter jejuni


2018 (n=280) 2019 (n=187) 2020 (n=283)

Eritromicina 98.9 99.5 99.6


Comentarios: La resistencia a ciprofloxacino se mantiene muy alta en nuestro medio. La actividad de la eritromicina continúa siendo excelente.


Años 2018-2019-2020


Haemophilus influenzae


2018 (n=280) 2019 (n=273) 2020 (n=214)

Amoxicilina-ac. clavulánico 89.3 93 94.7

Cefotaxima 100 100 100

Levofloxacina 92.2 96 92

Comentarios: La combinación amoxicilina-ácido clavulánico mantiene buena actividad.

Staphylococcus aureus

1. Tendencias en la resistencia a meticilina (cepas SAMR) por peticionario

Peticionarios Porcentaje de cepas SAMR por peticionario y año

2018

n=2331

2019

n=2330

2020

n=1722

GLOBAL CAULE 40.6 40.6 41.3

Atención Primaria 43.5 37.9 50.8

Hospital Monte San Isidro 72.5 70.0 58.5

Hospital Universitario de León 37.1 40.0 36.6

Medicina Interna 63.3 52.9 52.6

Neumología 56.7 51.9 25.5

Cirugía General 30.6 50 31.4

Traumatología 51.9 31.9 32.8

Hematología 44.1 58.8 28.6

Comentarios:

Descenso en el nro total de aislados durante el año 2020 así como del porcentaje de SARM tanto en el Hospital Monte San Isidro como en algunos Servicios del Hospital Universitario atribuible a la situación asistencial excepcional en pandemia por COVID-19.

La alta tasa global de SAMR en el CAULE continúan reflejando una situación endémica. Se recuerda la conveniencia de tomar medidas para controlar la situación.

En cuanto a la tasa mantenida de SAMR en Atención Primaria en los últimos tres años, señalar que no todas las cepas son de adquisición propiamente comunitaria.


Años 2018-2019-2020


2. SAMR global y aislado en sangre. Evolución en los años 2018-2020

Año 2018 Año 2019 Año 2020

% SAMR global

40.6 40.6 41.3

% SAMR bacteriemias (n)

33.3 (98) 36 (139) 27.2 (92)

3. Sensibilidad antibiótica de la cepas de S. aureus resistentes a meticilina (SAMR)

Antibióticos SAMR


2018 2019 2020

Penicilina 0 0 0


Eritromicina 39.1 34.5 38


Vancomicina 100 100 100

Teicoplanina 100 100 100

Cotrimoxazol 98 98.3 95.9


Mupirocina 76 69.7 65.3

Tetraciclina 4.6 5.0 5.5

Comentarios:

Destacar el elevado porcentaje de resistencia observada en SAMR añadida a macrólidos (>60%) y sobre todo fluorquinolonas (>90%).

Patrón de multirresistencia antibiótica (a 4 grupos de antibióticos: betalactámicos, fluorquinolonas, macrólidos y aminoglucósidos) con incremento anual desde 2018 a 2020: 10,7%, 19.1% y 24.2% respectivamente.

Cepas SAMR gentamicina-sensible y tobramicina-resistentes: 18.4% en 2018, 20.9% en 2019 y 16.3% en 2020.


Años 2018-2019-2020


4. Sensibilidad antibiótica de las cepas sensibles a meticilina (SAMS)

Antibióticos SAMS


2018 2019 2020

Penicilina 15 16.3 20.2





Teicoplanina 100 100 100



Comentarios:

Cepas SAMS-2020: en general, se mantienen las altas tasas de sensibilidad observadas en los últimos tres años aunque excepto en los antibióticos del grupo de macrólidos y lincosaminas.

Cepas SAMS en los últimos tres años (2018-2020) gentamicina-sensible y tobramicina-resistentes: rango entre 2.0 y 6.3% Se mantiene el bajo porcentaje de los últimos años.

Cepas SAMS multisensibles 2019 y 2020: sensibilidad simultánea a cuatro grupos de antibióticos: betalactámicos, macrólidos, quinolonas y aminoglucósidos 58.5% y 55.9% respectivamente.


Años 2018-2019-2020


Staphylococcus epidermidis


2018 (n=850) 2019 (n=989) 2020 (n=792)

Penicilina 1.4 4.6 5.2

Cloxacilina 31.1 30.9 25.9




Vancomicina 100 99.8 99.7

Teicoplanina 98.8 89.9 85



Linezolid 93.8 89.9 85.1

Comentarios:

Al igual que se observa con S. aureus, disminución del número de aislamientos e incremento de cepas SEMR en el año 2020 pandémico.

En los últimos 4 años (2017-2018-2019-2020) se observa una evolución progresiva ascendente de la:

-Multirresistencia (resistencia a 4 grupos de antibióticos: betalactámicos, fluorquinolonas, macrólidos y aminoglucósidos): 21.4%, 24.7%, 26.7% y 39.1% respectivamente.

-Resistencias a teicoplanina y linezolid.

Aunque el impacto clínico de SEMR es menor que el de SAMR, es importante su vigilancia porque podría constituir un reservorio de este determinante de resistencia.


Años 2018-2019-2020


Enterococcus faecalis


2018 (n=1211) 2019 (n=1219) 2020 (n=1086)


Vancomicina 99.9 99.9 99.8

Linezolid 99.2 99.2 99.6

Gentamicina de alto nivel 56.6 59.2 61.8

Estreptomicina de alto nivel 61.1 64.4 62.1

Enterococcus faecium


2018 (n=383) 2019 (n=445) 2020 (n=472)


Vancomicina 79.9 89 81.1

Linezolid 99.2 97.1 98.5

Gentamicina de alto nivel 45.4 61.5 78.5

Estreptomicina de alto nivel 26.1 27.8 17.2

Comentarios:

El perfil de sensibilidad de E. faecalis es el esperado. Altas tasas de sensibilidada a ampicilina,

glicopéptidos y linezolid.

E. faecium: destacar la continuidad del alto porcentaje de resistencia a vancomicina. La tasa

de resistencia a ampicilina se mantiene muy alta (>86% en estos tres últimos años).


Años 2018-2019-2020


Streptococcus pneumoniae (global)

Antibiótico Porcentaje de cepas sensibles/intermedias por año

2018 (n=210) 2019 (n=82 ) 2020 (n=92)

Penicilina 91.5/4.3 67.9/12.8 100

Cefotaxima 96.7/1.9 96.1/1.3 97.8



Levofloxacina 95.7 94.3 96.6


Comentarios:

La sensibilidad a macrólidos ha disminuido de nuevo. Se descarta su utilización en el

tratamiento empírico en las infecciones respiratorias de tracto superior (ej.: otitis media aguda)

e inferior.

Streptococcus agalactiae


2018 (n=525) 2019 (n=573)

2020 (n=368)

Penicilina 100 100 100

Cefotaxima 100 100 100

Eritromicina 57.7 68.9 69



Comentarios:

El perfil de sensibilidad de las cepas de S. agalactiae es el esperable: esta especie sigue

manteniendo la sensibilidad a betalactámicos y glucopéptidos.

El porcentaje de cepas resistentes a eritromicina sigue siendo destacable, lo que puede tener

implicaciones en la profilaxis de la infección neonatal por este microorganismo si madres

alérgicas a los betalactámicos.


Años 2018-2019-2020


Streptococcus pyogenes


2016 (n=1339) 2017 (n=1358) 2018-2019-2020

Penicilina 100 100 nd

Cefotaxima 100 100 nd

Eritromicina 86.2 93.0 nd

Clindamicina 87.4 93.3 nd

Vancomicina 100 100 nd

Comentarios:

En 2018 se incorporó la detección de S. pyogenes como Point of Care Test en Urgencias pediátricas hospitalarias y de Atención Primaria, en pacientes con criterios clínicos de faringoamigdalitis. Desde entonces, en el Laboratorio de Microbiología no se dispone de un número suficiente de aislados para presentar datos de sensibilidad antibiótica de este microrganismo en el Área de Salud de León.


Años 2018-2019-2020


RECOMENDACIONES GENERALES

1- El tratamiento antibiótico empírico debe basarse en los datos locales obtenidos del Estudio

de Sensibilidad Antibiótica y, el tratamiento dirigido en el antibiograma.

2- Se debe priorizar el uso de antibióticos de menor espectro.

3- Se desaconseja el uso empírico de ciprofloxacina en infecciones por gramnegativos del tracto

urinario y abdominales, debido a la persistencia de altas tasas de resistencia.

4- En infecciones del tracto urinario causadas por enterobacterias productoras de

betalactamasas de espectro extendido, son opciones válidas:

1) fosfomicina; 2) nitrofurantoína; 3) amoxicilina–ac. clavulánico.

5- El uso empírico de carbapenémicos se debe reservar para los pacientes graves y/o con

importantes factores de riesgo de infección por microorganismos multirresistentes.

6- La tasa global de S. aureus meticilín resistente fue del 41.3% en el año 2020. Se insiste en

la importancia de las medidas de control y uso adecuado de antibióticos.

7- En infecciones por S. aureus meticilín-sensible (SAMS), cloxacilina es el antibiótico de

elección. Está demostrada su mayor eficacia clínica sobre la vancomicina.

8- Se evitará el uso de macrólidos a favor de antibióticos betalactámicos en infecciones

respiratorias del tracto superior e inferior. La alta y mantenida resistencia de Streptococcus pneumoniae a macrólidos en los últimos 5 años (>30%), descarta su utilización en el

tratamiento empírico.

9-Siempre que se sospeche bacteriemia relacionada con cáteter (BRC) la correcta estrategia

diagnóstica en la extracción de hemocultivos es:

a) Si catéter vascular retirado: cultivo de la punta de catéter retirado (3-4 cm distales) más 2

hemocultivos extraídos por venopunción directa.

b) Si catéter vascular no retirado: extracción de al menos un hemocultivo por venopunción y

otro por el/los catéter/es vascular/es.

estudio de sensibilidad antibiÓtica (esa) · informe de sensibilidad antibiótica de los...

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