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ENZIMAS 2
La función de una proteína depende de la unión de ligandos
Sustrato
Macromoléculas
Complejos supramacromoleculares
Inhibidores, activadores
Factores alostéricos
Protones, contraiones, agua
Cofactores, coenzimas
Coenzimas
Cofactores
La unión del ligando a la proteína consiste:
1. Difusión del ligando a la entrada al sitio de unión
2. Difusión del ligando a través de la proteína hacia el sitio de unión
3. Reordenamiento del ligando para finalmente unirse a la proteína
Superficie
(amarillo)
Surcos
(fucsia)
Los surcos conducen a cavidades...
Diversidad Conformacional
E. Fischer, 1894
D. Koshland, 1958
Monod, Wymanand Changeux, 1965
Sitios activos
La característica principal de las enzimas es la de catalizar reacciones químicas
Estabilización del sustrato(modelo llave-cerradura)
Desestabilización del sustrato(modelo ajuste inducido o modelo de Monod)
Estabilización del estado de transición (modelo ajuste inducido o modelo de Monod)
Energía de unión=∆GB
∆GB
Especificidad de unión
Fuerza de unión
Mecanismo de reacción
Visión estática: TST
Kcat
Km
Visión dinámica: Efecto tunel
Longuitud de onda=Lamda=h/(2mE)1/2
La probabilidad del efecto tunel aumentacon la disminución del ancho de la barrera energética y no con la disminución del alto
S
P
Vibraciones