contribución de la ingeniería genética al mejoramiento de ... · salinidad, heladas y ... en el...

76
Contribución de la Ingeniería Genética al mejoramiento de cultivos en sus características de tolerancia a sequía, salinidad, heladas y rendimiento. El largo camino desde el laboratorio al campo

Upload: hadien

Post on 31-Oct-2018

223 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Contribución de la Ingeniería Genética al mejoramiento de cultivos en sus características de tolerancia a sequía,

salinidad, heladas y rendimiento.

El largo camino desde el laboratorio al campo

Instituto de Agrobiotecnología del Litoral

Edificio del IAL en construcción- octubre de 2013

Calor Frío

Patógenos

Herbívoros

Salinidad

Sequía

Estímulo externo

Modificación

del

Metabolismo

Percepción

Modificación

de la

Expresión Génica

Estímulo externo

Abiótico

Biótico

(Adaptado de Wang y Chen, 2010)

Las vías de señales son redes complejas

Estructura de ADN

El dogma central de la Biología

(Adaptado de Raven y Johnson, 2002)

Se puede insertar un fragmento de ADN de cualquier origen en un plásmido bacteriano utilizando una ligasa

Plásmidos como vectores de clonado Transformación

Hasta 1972 se consideró que E coli era refractaria a la transformación.

Luego se pensó que solo eran transformables las cepas recBC-

Actualmente hay numerosos métodos de transformación química, fisiológica y

mediante pulsos eléctricos.

¿Qué es un gen? ¿Qué es el ADN?

Todo organismo tiene un genoma

El genoma es el conjunto de la información genética que tiene ese organismo

En los organismos eucariotas los genomas están divididos en un número definido de cromosomas

¿Qué es un gen? ¿Qué es el ADN?

Un gen se puede definir como el segmento de ADN necesario y suficiente para generar un ARN o una proteína funcional

Existe un número variable de genes en los distintos organismos

Se conoce la función de unos pocos.

CONICET EN TECNÓPOLIS

¿Qué es un gen? ¿Qué es el ADN?

Conocer la función de un gen nos puede ayudar a conocer el origen de una enfermedad, generar un sistema de diagnóstico y elaborar una posible cura.

Ejemplos: Conocer el gen que codifica la insulina permite hoy en día

tratar adecuadamente a las personas que sufren de diabetes Conocer la función o la presencia de otros genes nos permite

diagnosticar enfermedades prematuramente

CONICET EN TECNÓPOLIS

¿Qué es un gen? ¿Qué es un transgén?

Un transgén es un gen perteneciente a un organismo que se ha introducido en otro organismo distinto.

Los objetivos de introducir genes en organismos homólogos o heterólogos son variados. Entre ellos:

- obtener conocimiento sobre su función - mejorar alguna característica fenotípica del organismo

receptor

CONICET EN TECNÓPOLIS

En el caso de la insulina, el gen de origen humano se introduce en una bacteria. La bacteria es “engañada” y produce la proteína con función hormonal en grandes cantidades como si fuera propia.

En este caso el gen de la insulina se convierte en un transgén en la

bacteria.

Bacteria engañada que fabrica insulina

Hombre/Mujer diabético/o

Hombre/Mujer sano/a dador/a de insulina

Hombre/Mujer tratado/a con insulina humana

Los transgenes en plantas o las plantas transgénicas

En el caso de las plantas la transgénesis se hace para beneficiar al hombre.

El gen puede provenir de cualquier especie inclusive de cualquier planta y ser introducido en otra para generar una nueva planta con una característica distintiva y en general beneficiosa.

Los transgenes en plantas o las plantas transgénicas

Una planta es un organismo eucariota superior y en promedio tiene unos 20000 a 40000 genes distintos.

Con la trangénesis se busca que el agregado de un solo gen exógeno le de una característica particular.

Para esto hay que conocer la función del gen en cuestión, e introducirlo de forma tal de que se exprese en la parte u órgano de la planta que es de interés

CONICET EN TECNÓPOLIS

¿Cómo lo percibe la sociedad?

La genética no es de ahora

El hombre la utilizó desde la

antigüedad, aún sin conocer los mecanismos

involucrados para domesticar plantas

y animales (y microorganismos)

La domesticación del maíz

Laboratorio de Biotecnología Vegetal Instituto de Agrobiotecnología del Litoral

Aislamiento de genes que codifican factores de transcripción en girasol, arroz, Arabidopsis y Medicago truncatula

Estudios funcionales de estos genes Estudios funcionales de sus regiones promotoras Aplicaciones biotecnológicas utilizando estos genes y

sus promotores como herramientas para el mejoramiento de especies de interés agronómico

La regulación de la expresión génica

ARN polimerasa TFIID

GEN TATA

A B C

A B C P

Degradación Modificación Inducción

P Ub

Modificación de la expresión génica

Control transcripcional

Adaptado de Yamaguchi-Shinozaki y Shinozaki, 2005

Señales de reconocimiento, percepción y transducción

Arabidopsis thaliana

Arroz Medicago truncatula

Girasol

Soja

Maíz

Trigo

Organismos modelo

Preparación de ADN

genómico

Clonado del promotor

Clonado de

genes promotores ADN copia

Selección de

transformantes

Transformación de

Arabidopsis thaliana

Fluorometría e

histoquímica Northern blots.

q RT-PCRs

Clonado del ADNc

Preparación de

ARN

microarreglos

Análisis del fenotipo

Metodología utilizada para determinar la función del gen :”gene discovery”

Las plantas transformadas con la construcción 35S:HAHB4 presentan una marcada tolerancia a estrés hídrico

T WT T WT

Dezar et al., Trans. Res. 2005

24 hs después de regadas

WT T WT T

Dezar et al., Trans. Res.2005

Las plantas de Arabidopsis thaliana que expresan el gen HaHB4 de girasol son tolerantes a condiciones extremas de sequía

WT: plantas no

transformadas

TG: plantas

transformadas con el

gen HaHB4

Cuando la intensidad de luz es baja (en la sombra) las plantas transformadas generan más biomasa

Plantas transgénicas expresando HaHB4 son notablemente menos atacadas por larvas de Bradysia

impatiens

Salvajes Transgénicas

Salvajes Transgénicas

pBI121 35S: HAHB4

Manavella et al., Plant J. 2008

Un largo camino…………….. La historia de las plantas tolerantes a sequía

El camino de laboratorio al campo Representación esquemática y optimista del proceso completo necesario para llegar desde el descubrimiento de la función de un gen hasta un producto de mercado.

Arce et al., 2008 Recent patents in Biotechnology

La historia de los factores de transcripción HD-Zip

En 1994 se logró identificar el primer HD-Zip I de girasol, una planta de genoma no secuenciado hasta la fecha

La presentación de patentes

Los cultivos de interés agronómico

Seguimos en el laboratorio y en la cámara de cultivo

Selección de plantas transformadas de maíz con el herbicida BASTA como marcador de selección

Transgénica, resistente al BASTA Control sensible al BASTA

Eligio Morandi et al., resultados no publicados

Ensayo de estrés hídrico en invernáculo

Eligio Morandi et al., resultados no publicados

Medida de fijación de CO2

Eligio Morandi et al., resultados no publicados

Medida del área foliar después del ensayo de estrés hídrico

plantas

transgénicas

plantas no

transgénicas

La respuesta de defensa contra herbívoros está aumentada en el maíz transgénico que expresa HaHB4

Manavella et al., Plant J. 2008

Tratamiento de estrés hídrico a las plantas de soja transgénicas y null

Línea 2: gm a7H Cabello et al., resultados no publicados

Plantas de trigo que expresan el gen HAHB4 Línea 1 Línea 2

Trigo transgénico

Niv

ele

s d

e e

xp

resi

ón

de H

AH

B4

Null heterocigota homocigota Null heterocigota homocigota

Cabello et al., resultados no publicados

Productividad de trigo transgénico que expresa el gen HaHB4 de girasol

Ensayos en el campo

Construcción UBI::HaHB4 Cosecha en diciembre de 2009

Trigo

Trigo Construcción UBI::HAHB4 Cosecha en diciembre de 2009

Ensayo realizado en Monte Buey, Provincia de Córdoba

Línea salvaje; Cadenza

Línea comercial: BI 3004

Fecha de siembra: junio de 2009

Densidad de siembra: 350 semillas por metro cuadrado

Características del suelo; pH 5,8; materia orgánica: 3,0 %

Total de lluvias durante el período de desarrollo; 594,5 mm

Gerónimo Watson y Federico Trucco (Indear)

Trigo Construcción UBI::HAHB4

Gerónimo Watson y Federico Trucco (Indear)

Cosecha en diciembre de 2009 Villalonga-Bs As Niveles de riego y precipitaciones

Trigo Construcción UBI::HAHB4 Cosecha en diciembre de 2009

Ensayo realizado en Monte Buey, Provincia de Córdoba

Gerónimo Watson y Federico Trucco (Indear)

Trigo Construcción UBI::HAHB4 Cosecha en diciembre de 2009 Villalonga-Bs As

Las diferencias de rendimiento de granos entre los tratamientos de irrigación fueron significativas, siendo un 20 % mayor para las plantas

irrigadas

Las diferencias de rendimiento entre líneas fueron significativas con un p-value de 0,007 y como ejemplo, la línea a12 presentó un

aumento de productividad del 38 %

Trigo Construcción UBI::HAHB4 Cosecha en diciembre de 2009 Monte Buey - Córdoba

Se observaron bajos rendimientos generales que se atribuyen a una cosecha tardía y a las altas temperaturas durante la misma

Rendimientos de maíz en Hugues, provincia de Santa Fe, campaña 2010/2011

Rendimientos de soja en Charata-Chaco, campaña 2010/2011

10/12/2013

Trigo 2011/2012 Villalonga

30% de aumento de la productividad

HaHB4 modificado

10/12/2013

Monte Buey 23% aumento de la productividad

Soja 2011

HaHB4 modificado

10/12/2013

Charata 35% aumento de la productividad

Maíz 2011

HaHB4 modificado

Tecnología HaHB1/AtHB13

Raquel Chan

Julieta Cabello

Agustín Arce

Integrantes del equipo de investigación

Contacto: [email protected]

WT TG-A TG-B TG-C TG-D TG-E

Sobrevivientes (%)

22 ± 3 85± 2 75 ± 4 70 ± 3 65 ± 2 60 ± 5

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

Control 30´ 2 hs

Leac

hin

g ra

tio

(L)

Period of time at -8 °C

Membrane stability

wt

TG-A

TG-B

a b

c

Tratamiento: 2 hrs at -8 °C Tratamiento: 7 hrs at -8 °C Plantas no aclimatadas

HAHB1 confiere tolerancia a temperaturas de congelamiento (heladas) estabilizando las membranas

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50 100 200

Leac

hin

g ra

tio

(L)

NaCl (mM)

Membrane stability

wt

TG-A

TG-B

WT TG-A TG-B

a

b Treatment: 350 mM of NaCl A: Transgenic plants membranes stability is higher than WT ones. B: illulstrative photograph of transgenic plants tolerating better high salt concentration.

Plants expressing the transcription factor HAHB1 (35S:HAHB1) are more tolerant of salt stress

Treatment: Severe water stress applied to 30-day-old plants (three independent lines) Transgenic plants tolerate better this stress condition. Illustrative photograph showing a typical drought stress experiment applied to mature plants (5-week-old)

WT TG-A

TG-B TG-C

Plants expressing the transcription factor HAHB1 (35S:HAHB1) are more tolerant of drought

Las plantas transformadas con HaHB1/AtHB13 pierden menos rendimiento que las no transformadas en estrés hídrico moderado

HaHB11, un gen que confiere múltiples tolerancias y aumenta el rendimiento

Raquel Chan

Julieta Cabello

Jorge Giacomelli

Grupo de investigación

Contacto: [email protected]

HaHB11 confiere tolerancia a estrés hídrico severo

Illustrative assay performed with 25-day-old trasnsgenic lines (TG-A, -B, -C) and WT plants, water-starved during 15 days. The illustrative photograph was

taken during the assay. Right: a table showing the survival rate of each genotype. Statistical analysis was performed with 64 plants from each genotype.

HaHB11 confiere tolerancia a estrés salino

21-day-old trasnsgenic lines (TG-A, -B, -C) and WT plants were watered with a NaCl increasing concentration up to 400

mM along 21 days. The photograph was taken 7 days after the end of the assay. Statistics was performed with n=32 plants

for each genotype.

TGB TGA TGC

TGA TGB

TGC

TGC

HaHB11 confiere tolerancia a la inundación del suelo

Phenotype in standard

growth conditions

21-day-old trasnsgenic lines (TG-A, -B, -C) and WT plants grown on soil with their

roots submerged during six days. Photograph was taken and survivor’s percentage

was calculated 6 days after recovery.

21-day-old three independent trasnsgenic lines (TG-A, -B, -C) and WT (101) plants grown

on soil and submerged during six days. The photograph was taken six days after recovery at

standard conditions.

HaHB11 confiere tolerancia a la inundación total de la planta

HaHB11 genera mayor masa foliar en las plantas

Phenotype in standard

growth conditions

A: 40-day-old WT and transgenic plants were

grown on soil and normally irrigated during the

whole life cycle

B: with 50-day-old plants

HaHB11 aumenta significativamente el rendimiento

Rendimiento de plantas crecidas en condiciones normales

El rendimiento fue calculado de un experimento hecho con 12 plantas de cada genotipo

TGC TGA TGB

Muchas gracias

Un homenaje a un Grande, el Negro Fontanarrosa

¡Mozo! Hay un transgén en mi sopa

Investigadores

Raquel Chan Karina Ribichich Javier Moreno

Becarios post-doctorales Julieta Cabello Agustín Arce Jorge Giacomelli Doctorandos Delfina Re Matías Capella Jesica Raineri Pamela Ribone

FCA de la UNR Eligio Morandi Carlos Gosparini Carlos Cairo Andrés Quijano

Investigadores Daniel Gonzalez Carlos Dezar

Doctorandos

Claudia Palena Gabriela Gago

Carlos Dezar Mariana Tioni Pablo Manavella Federico Ariel

Del grupo Indear

Gerónimo Watson Federico Trucco Mariana Chiozza

Ezequiel Marchionni

Miembros del grupo actual Miembros que participaron con anterioridad

Endosulfan in the Namoi River, Australia: Bt cotton start 1996-97

0

0.02

0.04

0.06

0.08

0.1

0.12

0.14

0.16

0.18

1991-92 1992-93 1993-94 1994-95 1995-96 1996-97 1997-98 1998-99 1999-00 2000-01

Year

En

do

su

lfa

n C

on

ce

ntr

ati

on

(u

g/L

)

Los problemas a resolver

Responder las preguntas planteadas y otras que surgirán

Mejorar la percepción pública de los transgénicos Problemas con la presentación de patentes Problemas regulatorios Para nuestro país: Desarrollar tecnologías propias y mecanismos que permitan atravesar el pipeline con mayor rapidez y apoyo

¿Qué soluciones puede ofrecer la biotecnología?

Se calcula que en 2050 habrá 3000 millones de personas más en el mundo que demandarán el doble de alimentos y energía

Sólo queda un 5 % de suelo cultivable

En Argentina, los únicos cultivos aprobados para comercialización son Soja tolerante a herbicida

Maíz tolerante a herbicida

Maíz resistente a insectos

Maíz resistente a insectos y tolerante a herbicida

Algodón tolerante a herbicida

Algodón resistente a insectos

Algodón resistente a insectos y tolerante a herbicida