conocer la utilidad de los diferentes métodos de
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I. Actividades realizadas
Conocer la utilidad de los diferentes métodos de laboratorio de utilidad
medica en el diagnóstico del SARS-CoV-2
Periodo que cubre el informe:
01 AL 30 DE JUNIO DEL 2021
Objetivo
Particular Meta Actividades Avances de meta
Desarrollar
todos los
métodos de
laboratorio
realizados a
aquellas
personas que
tienen el
diagnóstico
SarsCoV-2,
para dar
seguimiento a
los resultados
de los
pacientes
internos del
Hospital Civil
de Culiacán.
Analizar un
mínimo de
100
pacientes
con COVID-
19 positivos
(internos)
que
ingresen al
Hospital
Civil de
Culiacán de
un periodo
del 1ero de
marzo del
2021 al 31
de enero del
2022.
1- Identificar las
muestras que requieran
las pruebas para el
Covid-19.
2- Descartar las pruebas
negativas, ya que se
enfocará en muestras
positivas y sus métodos
de laboratorio que fueron
necesarias para dar un
diagnóstico (inicio 1 de
marzo de 2021).
3- Analizar las pruebas
positivas en conjunto
con las demás pruebas
relacionadas, para su
posterior seguimiento y
así tratar de evitar un
posible contagio.
1- Se recolectó
información
sobre los
métodos que se
utilizaron para
el desarrollo de
este proyecto,
así mismo se
empezara a
tomar datos
para la
cuantificación
de estos.
2- Se recopilaron
los datos de las
pruebas de
Determinación
de SARS-CoV-
2 en PCR-RT.
Actividades complementarias:
En este quinto mes, me toco realizar las actividades del área de uroanálisis y
copros y bacteriologia del laboratorio de análisis clínicos del HCC.
➢ Uroanálisis y Copros:
En esta área realice los examen general de orina (EGO), el cual consiste
en examinar la orina de los pacientes realizándoles 3 exámenes, los cuales
son examen físico (olor, color, aspecto), químico (pH, nitritos, presencia de
leucocitos, presencia de Hb, cuerpos cetónicos, bilirrubina, urobilinógeno,
proteínas, glucosa, densidad) y examen microscópico (se observa el
sedimento tras estar centrifugada la muestra, observación de células
epiteliales, leucocitos, glóbulos rojos, presencia bacteriana o coliforme,
cristales de diferente índole, cilindros igual de diferente índole, fibras.)
Examen coprológico este consiste en una serie de distintas pruebas que
se le realizan a las heces de los pacientes como, aspecto, color, presencia
de moco, residuos alimenticios, pH, azucares reductores (indicativo para
intolerancia a la lactosa), observación en el microscopio para ver si hay
presencia de huevos de parásitos de distintas índoles, grasa, glóbulos
rojos, leucocitos.
Examen coproparasitoscopico, es una observación al microscopio en una
solución de lugol, para la búsqueda de huevos de parásitos.
➢ Bacteriología
En esta área realice las pruebas necesarias para determinar si un paciente
está cruzando con una infección bacteriana o fúngica (levaduras).
Poniendo en practica las técnicas de cultivos de diferentes muestres,
urocultivo (orinas), cultivo de secreción (heridas u otro tipo de secreción),
hemocultivos, exudados faríngeos y vaginales.
Dado positivo un cultivo, se procede a realizarse una tinción Gram para
determinar si son bacilos o cocos, para así posteriormente emplear las
pruebas bioquímicas adecuadas para obtener el tipo de bacteria y su
antibiograma.
Se realizaron BAAR, para la búsqueda de bacilos mediante una tinción.
II. Metodología aplicada
Biometría Hemática Completa (BHC)
La BHC es una prueba de la sangre periférica que proveen una gran cantidad de
información acerca del sistema hematológico y otros más. Son accesibles y su
realización es sencilla y rápida. La BHC incluye una cuantificación multiple
automatizada de los siguientes estudios, que se revisan por separado:
• Recuento de eritrocitos (GR)
• Hemoglobina
• Hematocrito
• Índices de eritrocitos
o Volumen corpuscular medio (VCM)
o Hemoglobina corpuscular media (HCM)
o Concentración media de hemoglobina corpuscular (CMHC)
• Recuento de glóbulos blancos (GB) y recuento diferencial
o Neutrófilos (células polinucleadas, segmentadas, en banda)
o Linfocitos
o Monocitos
o Eosinófilos
o Basófilos
• Recuento plaquetario
• Volumen plaquetario medio
El Hematocrito (HTC) es una medida indirecta del número y volumen de los
glóbulos rojos (GR). Se utiliza como una cuantificación rápida del recuento
eritrocítico. Se repite de manera seriada en pacientes con sangrado continuo o
como parte sistemática del hemograma. Es una parte integral en la valoración de
pacientes con anemia. Los resultados normales varían, pero en general son:
Hombres: de 40.7% a 50.3% Mujeres: de 36.1% a 44.3%.
La Hemoglobina (HB) esta prueba es una medición de la cantidad total de Hb en
sangre. Se utiliza como una rápida cuantificación indirecta del recuento eritrocítico;
se repite en forma seriada en pacientes con sangrado continuo como parte regular
de la Biometría Hemática Completa (BHC) y es una parte integral de la valoración
de pacientes anémicos. Los valores normales en hombres es de 14 a 18 g/dL y
mujeres de 12 a 16 g/dL.
EL recuento de glóbulos rojos (GR) se relaciona de manera muy cercana con las
concentraciones de hemoglobina y hematocrito y representan diferentes maneras
de determinar el número de glóbulos rojos en la sangre periférica. Se repite de
manera seriada en pacientes con sangrado constante o como parte regular de la
BHC y es una parte integral de la valoración de pacientes anémicos. Los valores
normales en hombres es de 4.2 a 6.2 y mujeres de 4.2 a 5.4 (106/uL).
El recuento de leucocitos (GB) tiene dos componentes. El primero es una
cuantificación del número total de glóbulos blancos en 1 mm3 de sangre venosa
periférica. El otro componente, el recuento diferencial, mide el porcentaje de cada
tipo de leucocito presente en la misma muestra. Un recuento leucocitario >10,000
indica casi siempre infección, inflamación, necrosis de tejidos o neoplasia
leucémica. Los valores normales son de 5,000 a 10,000 /mm3 (109/L), en recuento
diferencial: neutrófilos (55-70%), linfocitos (20-40%), monocitos (8-10%), eosinófilos
(1-4%), basófilos (0-2%).
El recuento plaquetario es la cuantificación real del número de plaquetas
(trombocitos) por milímetro cubico de sangre. Se realiza en pacientes que
desarrollan petequia (pequeñas hemorragias en la piel, sangrado, menstruaciones
cada vez más abundantes o trombocitopenia. Se usa como indicador del curso de
la enfermedad o tratamiento para trombocitopenia o insuficiencia de la médula ósea.
El COVID-19 en la Biometría Hemática Completa modifica varios valores lo cuales
hacen sospecha de que el paciente este cursando por una infección viral, en este
caso infección por el virus SARS-CoV-2, los siguientes valores afectados por este
virus son:
• Aumento de leucocitos
• Aumento de neutrófilos
• Disminución de linfocitos
• Disminución de plaquetas
Tiempos de Coagulación (TP, TTP)
Tiempo de Protrombina (TP)
La hemostasia y el sistema de coagulación representan un equilibrio homeostático
entre factores que favorecen la coagulación y los factores que promueven la
disolución de coágulos.
La primera reacción del organismo ante una hemorragia activa es la constricción de
los vasos sanguíneos; y, en lesiones de vasos pequeños, esto puede ser suficiente
para formar un coágulo que tape de manera prolongada el orificio hasta que la
herida cicatrice. La fase principal del mecanismo hemostático implica la agregación
plaquetaria en el vaso sanguíneo y a ello le sigue la hemostasia. A la primera fase
de reacciones se le conoce como sistema intrínseco; en éste, el factor XII y otras
proteínas forman un complejo en el colágeno subendotelial en el vaso dañado. A
través de una serie de reacciones se forma el factor XI activado (XIa) e induce el
factor IX (IXa). En un complejo formado por los factores VIII, IX y X se integra el
factor X activado (Xa).
Al mismo tiempo, el sistema extrínseco se activa y se forma un complejo entre la
tromboplastina tisular (factor III) y el factor VII, como efecto, se constituye el factor
VII activado (VIIa). El factor VIIa puede activar de forma directa al factor X y, de
manera alternativa, puede activar a los factores IX y X juntos.
En la tercera fase del mecanismo se activa el factor X por medio de las proteasas
formadas mediante las dos reacciones anteriores, y se activa el factor IX. Esta
reacción es una vía común que establece el nexo entre los sistemas intrínseco y
extrínseco.
El TP mide la capacidad de formar coágulos de los factores I (fibrinógeno), II
(protrombina), V, VII y X. cuando estos factores de la coagulación existen en
cantidades deficientes, el TP se trona más prolongado. El tiempo de protrombina
(TP) se utiliza para determinar el buen funcionamiento del sistema extrínseco y la
vía común en el mecanismo de coagulación
Tiempo de Tromboplastina Parcial (TTP)
La primera fase de las reacciones se conoce como sistema intrínseco. El factor XII
y otras proteínas forman un complejo en el colágeno subendotelial del vaso
sanguíneo lesionado. A través de una serie de reacciones se forma el factor
activado XI (XIa) y se activa el factor IX (IXa). En un complejo conformado por los
factores VIII, IX y X se forma el factor X activado (Xa). Al mismo tiempo, el factor
extrínseco se activa y se crea un complejo entre la tromboplastina del tejido (factor
III) y el factor VII. El resultado es el factor activado VII (VIIa). El VIIa puede activar
de manera directa al factor X. De forma alternativa, el VIIa puede activar a los
factores IX y X juntos. El paso final es la vía común en la que se convierte la
protrombina en trombina en la superficie de las plaquetas agregadas. El propósito
principal de la trombina es convertir el fibrinógeno en fibrina que después se
polimeriza en un gel estable. El factor XIII crea un enlace cruzado con los polímeros
de fibrina para formar un coágulo estable. Casi de inmediato, los tres activadores
principales del sistema fibrinolítico actúan sobre el plasminógeno, que antes se
absorbió en el coágulo, para formar plasmina. Esta última degenera el polímero de
fibrina en fragmentos que eliminan a los macrófagos. El TTP cuantifica los factores
I (fibrinógeno), II (protrombina), V, VIII, IX, X, XI y XII. Cuando se combina el TTP
con el tiempo de protrombina, se pueden reconocer casi todas las alteraciones
hemostáticas. Cuando alguno de estos factores existe en cantidades inadecuadas,
como sucede en las hemofilias A y B o en la coagulopatía por consumo, se prolonga
el TTP. Debido a que los factores II, IX y X son dependientes de la vitamina K, la
obstrucción biliar, que impide la absorción GI de la grasa y las vitaminas solubles
en grasa (p. ej., vitamina K), puede reducir su concentración y además prolongar el
TTP. Las enfermedades hepatocelulares también pueden prolongar el TTP, ya que
los factores de coagulación se producen en el hígado.
El COVID-19 en los Tiempos de Coagulación modifica varios valores lo cuales
hacen sospecha de que el paciente este cursando por una infección viral, en este
caso infección por el virus SARS-CoV-2, los siguientes valores afectados por este
virus son:
• Prolongación de tiempo de protrombina (activación de coagulación
sanguínea y/o coagulopatía diseminada).
DIMERO D
El dímero D es un producto final de la degradación de un trombo rico en fibrina
mediada por la acción secuencial de 3 enzimas: trombina, factor XIIIa y plasmina.
Ha emergido como un test rápido y sencillo, con un lugar definido en los algoritmos
de exclusión de la enfermedad tromboembólica venosa (ETEV), en el diagnóstico
de coagulación intravascular diseminada y en los últimos años con aplicación en la
predicción de la recidiva de trombosis venosa profunda.
Las diferentes pruebas de dímero D presentan una elevada sensibilidad y una baja
especificidad (98–100% y 35–39% respectivamente), su verdadera utilidad radica
en su alto valor predictivo negativo (98–100%). Se incluyeron datos de pacientes
con COVID-19 confirmados relacionados con complicaciones tromboembólicas y
niveles de dímero D.
El SARS-CoV-2 infecta células con receptores de enzima convertidora de
angiotensina 2 (ECA 2) como los neumocitos II del alveolo pulmonar, epitelio
intestinal y endotelio vascular. La captación viral está dada por la serina proteasa
transmembrana tipo 2 (TMPRSS2) que activa la proteína espiga del SARS-CoV-2 y
escinde la ECA 2 de la célula. El virus ingresa por endocitosis y libera su ARN para
replicarse, las células infectadas producen respuesta inflamatoria al activar el
sistema de complemento con formación de C3a y C5a lo cual recluta células
liberadoras de citoquinas proinflamatorias, que en aquellos con enfermedad severa
provocarían la “tormenta de citoquinas” producto de alta carga viral El aumento de
angiotensina II en el plasma dado por el alto consumo de ECA 2 por el virus,
producirá activación plaquetaria y más liberación de citoquinas proinflamatorias.
Este exceso de citoquinas proinflamatorias junto al daño endotelial producido por el
virus y la estimulación del mecanismo de muerte celular llegan a sobre activar la
cascada de coagulación con producción de gran cantidad de trombina generando
situaciones clínicas de tromboembolismo venoso (TEV) como embolia pulmonar
(EP), coagulación intravascular diseminada (CID), trombosis venosa profunda
(TVP). La infección por COVID 19 produce un estado de hipercoagulabilidad
sanguínea debido a la activación excesiva de la cascada de coagulación y de las
plaquetas, lo que produce la formación de micro trombos de fibrina a nivel sistémico.
El dímero D surge de la conversión de fibrinógeno a fibrina, de la reticulación de
fibrina por el factor XIII activado y de la degradación de la fibrina por plasmina. Por
lo tanto, la elevación del dímero D depende de la coagulación y de la fibrinolisis. Los
cambios en el curso clínico de pacientes con COVID 19 conllevan a una estancia
más prolongada en hospitalización, ingreso a UCI y altas tasas de mortalidad.
Aquellos con mala evolución clínica son propensos a desarrollar tromboembolismo
venoso (TEV).
PROTEINA “C” REACTIVA ULTRASENSIBLE (PCR-ULTRA)
La proteína C reactiva (PCR) es una proteína que se sintetiza en el hígado y se
libera a la circulación sanguínea. Su concentración aumenta en presencia de
inflamación y de infección, así como después de un infarto agudo de miocardio
(IAM), intervenciones quirúrgicas y traumatismos. Es una de las proteínas a las que
a menudo se conoce con el nombre de reactantes de fase aguda. La prueba
ultrasensible (proteína C reactiva ultrasensible) permite medir la PCR cuando la
proteína se encuentra en cantidades muy pequeñas, siendo su principal utilidad la
de identificar la existencia de un mínimo estado de inflamación, asociado a riesgo
de desarrollar enfermedad cardiovascular.
Existen dos maneras de medir la PCR: la prueba para PCR convencional o estándar
y la prueba ultrasensible (PCR-us). Cada una de estas pruebas mide la misma
proteína en sangre aunque entre unos rangos de concentración distintos y con
distinta finalidad.
La prueba convencional (PCR) mide cantidades elevadas de PCR para detectar
enfermedades o procesos que causan inflamación importante. Mide cantidades de
PCR que oscilan entre los 10 y los 1000 mg/L.
La prueba ultrasensible (PCR-us o us-CRP por sus siglas en inglés) es capaz de
medir concentraciones muy bajas de esta proteína que no llegan a detectarse con
la técnica convencional; la finalidad de la prueba ultrasensible es la de evaluar el
riesgo cardiovascular de un individuo. Mide concentraciones de PCR entre 0.5 y 10
mg/L.
Los niveles séricos elevados de proteína C-reactiva (PCR) son frecuentes en
pacientes con enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19 por su sigla en inglés);
esta variable suele utilizarse para la clasificación de los enfermos y para predecir el
pronóstico. La PCR es una proteína inespecífica de fase aguda, sintetizada por los
hepatocitos; la concentración plasmática de PCR aumenta durante las infecciones
agudas y en los procesos inflamatorios. La liberación de PCR comienza entre 4 y
10 horas después del inicio del evento inflamatorio y alcanza los niveles máximos a
las 48 horas; la vida media es corta, de sólo 19 horas. Los niveles de PCR pueden
aumentar antes de que aparezcan síntomas y de que ocurra el incremento del
recuento de leucocitos. Este biomarcador es comúnmente utilizado con fines
diagnósticos. Se sugirió que los niveles de PCR podrían ser de cierta ayuda para
diferenciar las infecciones virales y bacterianas.
En el contexto de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19 por su sigla en
inglés), los niveles de PCR ≥4 mg/l contribuirían en la clasificación inicial de los
pacientes con diagnóstico presuntivo. Sin embargo, la utilidad pronóstica de este
marcador, en pacientes internados por COVID-19, todavía no se estableció con
precisión.
Sin embargo, los valores de PCR no suelen considerarse para tomar decisiones
terapéuticas, en COVID-19. Se ha sugerido de los niveles de PCR podrían constituir
un marcador pronóstico importante de progresión de la enfermedad en COVID-19;
sin embargo, su distribución nunca ha sido evaluada para comprender si existen
distintos patrones en una población heterogénea. La utilización de los niveles de
PCR como biomarcador en COVID-19 podría representar una herramienta rápida y
fácilmente accesible para el abordaje clínico de los pacientes.
III Técnicas aplicadas
Recopilación de datos en libros, bitácoras de las diferentes áreas del laboratorio,
fuentes de internet confiables, así como poniendo atención a los distintos pacientes
que acuden al laboratorio del HCC a realizarse estudios relacionados con el
diagnóstico del SARS-CoV-2, con el fin de reunir más información que nos sirva
para el cumplimiento del proyecto.
IV. Resultados obtenidos
Actividades Beneficiarios
Resultados Descripción de
resultado Cantidad Población
Identificar las
muestras que
requieran las
pruebas para el
Covid-19.
372 372
En los datos
recabados se
obtuvieron 32
muestras
positivas y 340
muestras
negativas en el
mes de marzo en
pacientes que
acuden al HCC.
Se llevó a cabo
el primer
muestreo
(marzo) de
casos de
COVID-19 en el
HCC, así mismo
verificando a
cada paciente si
anteriormente
se le realizó
algún estudio
previo que llevo
a la decisión de
llevar a cabo el
estudio de
Determinación
de SARS-CoV-2
en PCR-RT.
342 342
En los datos
recabados se
obtuvieron 61
muestras
positivas y 281
muestras
negativas en el
mes de abril en
pacientes que
acuden al HCC.
En el segundo
muestreo (abril),
hubo una
reducción en el
número de
pacientes que
se realización la
prueba de PCR-
RT, así mismo
hubo un
aumento en
casos positivos.
345 345
En los datos
recabados se
obtuvieron 30
muestras
positivas y 315
muestras
negativas en el
mes de mayo en
pacientes que
acuden al HCC.
En el tercer
muestreo
(mayo) se
observó que
hubo una
disminución en
casos de
pacientes que
dan positivo a
SARS-COV-2 y
un ligero
aumento en
pacientes que
se realizaron
dicha prueba.
375 375
En los datos
recabados se
obtuvieron 83
muestras
positivas y 292
muestras
negativas en el
mes de junio en
pacientes que
acuden al HCC.
En este mes
nos percatamos
que hubo un
aumento en la
cantidad de
pacientes que
se realizaron la
prueba y
también hubo
aumento en el
número de
casos positivos
en el mes de
junio.
V. Observaciones
En el mes de junio realice mis acciones desenvolviéndome con más fluidez en las
diferentes áreas del laboratorio de análisis clínicos del HCC, así mismo logrando las
actividades de cada una de estas áreas, también se llevó a cabo la recopilación de
datos de las pruebas de determinación de SARS-CoV-2 en PCR-RT en pacientes
que acuden al HCC.
VI. Evidencias