análisis microbiológico de un suelo agrícola mediterráneo tras la aplicación de lodos de...

Upload: angryhamster

Post on 10-Feb-2018

215 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    1/267

    UNIVERSIDAD COMPLUTENSE DE MADRID

    FACULTAD DE FARMACIA

    Departamento de Microbiologa II

    TESIS DOCTORAL

    Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la

    aplicacin de lodos de depuradora urbana

    MEMORIA PARA OPTAR AL GRADO DE DOCTOR

    PRESENTADA POR

    Clarissa Gondim Porto

    Director

    Federico Navarro Garca

    Madrid, 2013

    Clarissa Gondim Porto, 2012

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    2/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    3/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    4/267

    Da. CONCHA GIL, CATEDRTICA Y DIRECTORA DELDEPARTAMENTO DEMICROBIOLOGA II DE LA FACULTAD DEFARMACIADELAUNIVERSIDADCOMPLUTENSEDEMADRID,

    CERTIFICA:QueDa. ClarissaGondim Portoha realizado en elDepartamentodeMicrobiologa IIde laFacultaddeFarmaciade laUniversidadComplutensedeMadriddentrodelProgramadeDoctoradodeMicrobiologa

    yParasitologa

    de

    la

    Facultad

    de

    Farmacia

    bajo

    la

    direccindelDr.FedericoNavarroGarca,eltrabajoque presenta para optar al grado deDoctor por laUniversidadComplutenseconelttulo:

    Anlisis microbiolgico de un suelo agrcolamediterrneo tras la aplicacin de lodos dedepuradoraurbana.

    Yparaqueasconste,firmolapresentecertificacinenMadrida26juniode2012.

    Fdo.Prof.Dra.Da.ConchaGil

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    5/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    6/267

    ESTA TESIS DOCTORAL HA SIDO POSIBLE GRACIAS A LASIGUIENTESAYUDAS: Beca del Ministerio de Asuntos Exteriores yCooperacin Agencia EspaoladeCooperacinInternacional para el Desarrollo (MAECAECID)20082012.

    Concesin de la beca del pago dematrcula delcurso 2007 2008 por la UniversidadComplutensedeMadrid.

    EL TRABAJO DESCRITO HA SIDO FINANCIADO POR LOSPROYECTOS: CGL200613915/CLI, 20062009, Ministerio deCiencia e Innovacin, Impacto sobre el cambioclimticodelaaplicacindelodosdedepuradoraurbana al suelo. Efectos en el secuestro decarbono.

    MMA022/PC08/304.2,20092012,MinisteriodeMedioAmbiente Rural yMarino, Metodologaspara lamonitorizacin de la aplicacin de lodos

    dedepuradora.

    Bioseguridad

    microbiana

    ymodelosde flujoy transportede contaminantes

    solubles.

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    7/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    8/267

    Ami

    familia.

    AmiesposoCarlos.

    AmiinolvidableTioZilyamiprimoAndrLuisquenopudieronverestaTesislista.

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    9/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    10/267

    Despusde lograrterminar latesisdoctoral,solopuedoagradeceratodas laspersonasqueduranteestosaosdetrabajohanestadoami ladoyquehanhechopartedesurealizacincontribuyendodeunaformauotraparaqueestafasellegaraasufin.

    Primeroantesquenada,doygraciasamiDiosporsaberysentirquelestuvopresenteprincipalmenteen losmomentosmsdifciles,yen losmomentosdealegra.Muchasgraciaspor

    fortalecermi

    corazn

    eiluminar

    mi

    mente

    cada

    da

    de

    mi

    vida.

    Agradezco inmensamente ami tutor Prof. Dr. Federico NavarroGarca por habermetransmitidotodossusconocimientosconamabilidad,confianzaypaciencia,teadmiromuchoportu gran capacidad intelectual.Muchas gracias por haberme concedido tu tiempo y tu esfuerzosiempredicindomelascosasconsinceridadypornuncadejarmedesistirdemisueo:terminarlaTesis Doctoral. Fede,muchas gracias por la confianza que has depositado enm, por la granoportunidadquemehasproporcionadoypordarmeeseapoyoconstanteenestoscasicincoaosqueestuveenEspaa,al igualquetubellafamilia:Marta, InsyArturoquemeacogitanbien.Siempreosllevarenmicorazn.

    QuisieraagradeceralProfesorMiguelngelpor losconocimientostransmitidos,portuestrechacolaboracin,portuinmensaayuda,portutranquilidad,serenidadyalegra,portuapoyo

    entoda

    mi

    estancia

    aqu

    en

    Espaa,

    al

    igual

    agradezco

    atu

    linda

    familia.

    Siempre

    llegabas

    am

    con

    palabrasdenimodicindomequealfinaltodosaldramuybien.Teadmiromuchoportufuerzayalegrapermanente.

    Agradezcoa todos losprofesoresdeldepartamentodeMicrobiologa II,enespecial losprofesores y profesorasConchaGil,MaraMolina,Humberto,Vctor, Jess, JosManuel, Luca,Gloria,Angelines,Conchita,Carmina,RebecaquemeacogierontanbiendesdemillegadaaEspaa.AgradezcoenespecialalProfesorRafaelRotgerqueconmuchaamabilidadcontestabamiscorreosdesdeBrasilyquemeencaminallaboratoriodemitutorFedericoNavarroGarca,siempreestaragradecidaporloquehashechoporm.MuchasgraciasespecialmentealaProfesoraCarmendelaRosa por el cario, por la ayuda y por haberme permitido compartir contigo las prcticas deMicrobiologaAmbiental.MuchasgraciasalProfesorJosAntonioporlaayudaconlosRDAsypor

    lasdivertidas

    salidas

    al

    campo.

    Muchas

    gracias

    tambin

    atodos

    los

    profesores

    del

    Departamento

    deEdafologa,especialmenteaMaitequesiempremehatratadocontantocario.

    Muitoobrigadaa todosmeusqueridose inesquecveisProfessoresdomeupasBrasil,

    tantodaUniversidadedeFortalezacomodaUniversidadeFederaldoCear,emespecialaVnia,

    Cristina,Romlia,Renato,PauloGermano,Arlndiaporhaver transmitido vossos conhecimentos

    comtodapacincia!Muitoobrigadapelaconfianadepositadaemmimdurantetodosessesanos

    docursodeFarmciaedaespecializaoemHematologiaClnicaepelascartasderecomendaes

    que me enviaram para que pudesse conseguir a bolsa de estudos! Em especial, agradeo

    enormemente ao meu querido Professor Everardo que me encaminhou a Madri para fazer o

    doutorado me ajudando com os contatos, a quem deveria escrever e dando excelentes

    recomendaes minhas aos outrosprofessores. Nunca me esquecerei dessa grande ajuda! No

    possoesquecer

    me

    de

    agradecer

    atodas

    as

    pessoas

    que

    me

    ajudaram

    no

    estgio

    realizado

    no

    Laboratrio Central do Cear (Lacen), em especial a minha me Maria Lcia Gondim Porto

    (obrigadamamepormemostrarcomo lindaanossaprofisso.Vocaminha inspirao,te

    amo muito!), a Creuza e Iracema pelos conhecimentos transmitidos, pelo carinho e pacincia

    sempre!

    MuchasgraciasamisqueridosamigosycompaerosdetrabajoLetiyNachoquesiempreme apoyaron, ayudndome en diversos experimentos (nunca olvidar las siembras, al finalterminbamos rindonosde todo),porcompartir conocimientos y tambinmomentosalegres ytristes.Muchasgraciasporlasrisas(Leti,nuncaolvidartussonrisasquealegrabaneldaatodoelmundo), las bromas, los cafezinhos de todas lasmaanas (elmejormomento) y por hacermiestanciaenEspaaagradabley feliz.Nuncaolvidaredenuestrosmomentosen laU7.Losquiero

    mucho,les

    deseo

    todo

    de

    lo

    mejor

    en

    la

    vida,

    siempre

    os

    llevar

    en

    mi

    corazn!

    No

    podra

    dejar

    de

    agradeceramiqueridocompaerolvaroBarnuevo(Menino)decuandotodoempez,muchas

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    11/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    12/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    13/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    14/267

    Resumen

    Loslodos

    de

    depuradora

    son

    los

    residuos

    slidos

    obtenidos

    del

    tratamiento

    de

    las

    aguasresiduales.Paraelreciclajedeestosproductos,elIIPlanNacionalIntegradodeResiduos(PNIR 20072015) exige que se lleve a cabo un tratamiento previo para concentrar la faseslidayeliminarposibles agentespatgenos.EnEspaa,el65%del totaldeestos lodosesutilizadocomoenmiendaagrcola,aunquesuusopuedeentraarposiblesriesgosparaelserhumano y elmedio ambiente que no han sido suficientemente evaluados. Por esa razn,hemosanalizado suefectoen lamicrobiologadeun sueloagrcolamediterrneoutilizandodistintas dosis (40, 80 y 160 tha1) y tipos (anaerobio y aerobio) mediante tcnicasdependientesdecultivoymoleculares.Desdeelpuntodevistasanitario,nuestrosresultadosmuestranquelasdosisbajaseintermediasproducenunincrementotransitoriodelnmerodebacteriaspatgenasyderesistentesaampicilinaquedisminuyehastanivelessimilaresa los

    delsuelo

    control

    odesaparecen

    al

    cabo

    de

    dos

    aos.

    Por

    el

    contrario,

    las

    dosis

    altas

    provocan

    quelosvaloresdeesosmicroorganismosseansuperioresalosdelsuelocontrolhastaelfinaldelexperimento.Desdeelpuntodevistaambiental,seproduceun fenmenopeculiarenelqueapesardequeelnmerodemicroorganismoscopiotrficosyheterotrficosaumentaenlossuelosenmendadoscon lasdosismsaltasde lodos,surespiracinybiomasadisminuye.Encambio,lossuelosenmendadoscondosisbajaseintermediaspresentanmayorestasasderespiracinconelconsiguiente incrementoen laemisindeCO2,gasqueproduceelefectoinvernadero e influye en el llamado cambio climtico. Por otro lado, se produce una granmodificacindelaspoblacionesbacterianasquecomponenelsueloagrcolatraslaadicindelodosquehapodidosermedidamediantetcnicasmoleculares.As,losfilosbacterianosmsafectadoscorrespondenaAcidobacteriayProteobacteria,quejuntoaActinobacteriason los

    msabundantes

    en

    el

    suelo

    control.

    El

    incremento

    de

    bacterias

    de

    la

    clase

    GammaproteobacteriajuntoconladisminucindelaproporcindelasdelaclaseGp6delfiloAcidobacteria,constituyenlosprincipalesmarcadoresdelaalteracindelsueloporlaadicinde lodosdedepuradoraa largoplazo.A cortoplazo sehaencontradoun incrementode lapresencia de diversas bacterias del filo Firmicutes (Bacilli) que puede ser utilizado comoindicador de una contaminacin reciente. En las muestras tratadas con dosis bajas eintermedias las principales modificaciones se detectan en los primeros muestreos y vandesapareciendogradualmentehastaasemejarsealadelsuelocontroldosaosdespusdelaaplicacin,fenmenoquenosucedeenlasparcelasconmayoresdosis(sobretodoANAE160).Podemos concluir,por tanto,que la aplicacinde lodosdedepuradora en suelos agrcolasprecisa todava de ser evaluada en profundidad puesto que se producen importantes

    alteracionessanitarias

    yambientales

    que

    pueden

    influir

    negativamente

    en

    la

    salud

    del

    ser

    humanoeinfluirenelcambioclimtico.

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    15/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    16/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    17/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    18/267

    1

    NDICE

    1. EL SUELO Y LOS LODOS DE DEPURADORA. ..................................................................................... 7

    1.1 ESTRUCTURAYCOMPOSICINQUMICADELSUELO. .............................................................. 9

    1.2 LADIVERSIDADMICROBIANADELSUELO. .............................................................................. 101.2.1 BACTERIAS. .................................................................................................................. 111.2.2 HONGOS. ..................................................................................................................... 141.2.3 OTROS MICROORGANISMOS PRESENTES EN EL SUELO. .............................................. 15

    1.3 VARIACIONESENLACOMPOSICINDELAMICROBIOTA DELSUELO. ..................................... 161.4 LOSLODOSDEDEPURADORACOMOENMIENDASENSUELOSAGRCOLAS. ........................... 18

    1.4.1 LOS LODOS DE DEPURADORA PUEDEN INTRODUCIR MICROORGANISMOSPATGENOS Y RESISTENTES A ANTIBITICOS EN LOS SUELOS AGRCOLAS? .............. 21

    2. EFECTOS A LARGO PLAZO EN LAS PROPIEDADES MICROBIANAS DE UN SUELO AGRCOLAMEDITERRNEO TRAS LA APLICACIN DE LODOS DE DEPURADORA URBANA. .............................. 25

    2.1 RESUMEN ................................................................................................................................ 272.2 INTRODUCCIN ...................................................................................................................... 292.3 OBJETIVOS .............................................................................................................................. 312.4 MATERIALESYMTODOS ....................................................................................................... 32

    2.4.1 LOCALIZACIN DE LAS PARCELAS. ............................................................................... 322.4.2 PREPARACIN DE PARCELAS DE ENSAYO. ................................................................... 332.4.3 RECOGIDA DE MUESTRAS. ........................................................................................... 342.4.4 ANLISIS DE LAS MUESTRAS DE SUELO MEDIANTE SIEMBRAS. .................................. 362.4.5 IDENTIFICACIN DE BACTERIAS PATGENAS. ............................................................. 392.4.6 MICROORGANISMOS TOTALES (OLIGOTRFICOS Y COPIOTRFICOS), HONGOS Y

    BACTERIAS RESISTENTES A AMPICILINA. ..................................................................... 402.4.7 PREPARACIN Y MEDICIN DE LA BIOMASA Y RESPIRACIN MICROBIANA. .............. 402.4.8 ANLISIS DE LOS DATOS. ............................................................................................. 43

    2.5 RESULTADOS ........................................................................................................................... 442.5.1 ANLISIS DE LA POBLACIN MICROBIANA DE LAS PARCELAS DEL ESTUDIO. .............. 442.5.2 EVOLUCIN DE LOS MICROORGANISMOS PATGENOS ANALIZADOS. ....................... 562.5.3 INFLUENCIA DE LOS LODOS DE DEPURADORA EN LA MICROBIOTA DE BACTERIAS

    RESISTENTES A AMPICILINA DE LOS SUELOS. .............................................................. 632.5.4 CORRELACIONES ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS, ACTIVIDADES

    MICROBIANAS Y PARMETROS AMBIENTALES. .......................................................... 702.5.5 INFLUENCIA DE LOS PARMETROS AMBIENTALES EN LAS PROPIEDADES

    MICROBIANAS ANALIZADAS. ....................................................................................... 732.6 DISCUSIN .............................................................................................................................. 86

    2.6.1 ALTERACIONES GENERALES DE LAS POBLACIONES MICROBIANAS DEL SUELO TRAS LAAPLICACIN DE LODOS DE DEPURADORA. .................................................................. 86

    2.6.2 SE TRANSMITEN Y MANTIENEN DETERMINADOS PATGENOS ENTRICOS EN LOS

    SUELOS TRAS LA ADICIN DE LODOS? ......................................................................... 922.6.3 LA APLICACIN DE LODOS DE DEPURADORA INCREMENTA EL NMERO Y LA

    PROPORCIN DE BACTERIAS RESISTENTES A AMPICILINA EN EL SUELO AGRCOLA. .. 952.6.4 ES AMBIENTAL Y SANITARIAMENTE SEGURO UTILIZAR LODOS DE DEPURADORA

    URBANA COMO ENMIENDA AGRCOLA? ..................................................................... 982.7 CONCLUSIONES ..................................................................................................................... 100

    3. LA ADICIN DE LODOS DE DEPURADORA MODIFICA LA ESTRUCTURA DE LAS POBLACIONESMICROBIANAS DURANTE UN LARGO PERIODO DE TIEMPO. ........................................................ 101

    3.1 RESUMEN .............................................................................................................................. 1033.2 INTRODUCCIN .................................................................................................................... 1053.3 OBJETIVOS ............................................................................................................................ 107

    3.4 MATERIALESYMTODOS ..................................................................................................... 1083.4.1 ANLISIS MOLECULAR DE LAS MUESTRAS DE SUELO ................................................ 108

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    19/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    20/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    21/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    22/267

    5

    NDICEDETABLAS

    TABLA 1.TEXTURA DEL SUELO AGRCOLA MEDITERRNEO ANALIZADO. ..................................................................... 33TABLA 2.CARACTERSTICAS FISICOQUMICAS DE LOS LODOS DE LAS DEPURADORAS. ................................................... 33TABLA 3.PARCELAS QUE FUERON ANALIZADAS EN ESTE TRABAJO. ........................................................................... 34

    TABLA 4.FECHAS Y ESTACIONES DEL AO DE LOS MUESTREOS. ................................................................................ 35TABLA 5.MEDIOS DE CULTIVO UTILIZADOS EN ESTE TRABAJO. ................................................................................. 38TABLA 6.MICROORGANISMOS OLIGOTRFICOS (R2A). ........................................................................................ 47TABLA 7.MICROORGANISMOS OLIGOTRFICOS (ETD). ......................................................................................... 48TABLA 8.MICROORGANISMOS COPIOTRFICOS (AGAR ACTINOMICETOS). ............................................................... 49TABLA 9.BACTERIAS OLIGOTRFICAS (R2AC). .................................................................................................... 49TABLA 10.HONGOS (SABOURAUD CLORANFENICOL). ........................................................................................... 50TABLA 11.COLIFORMES FECALES (TTC). ............................................................................................................. 57TABLA 12.ENTEROCOCOS (BILIS ESCULINA). ....................................................................................................... 58TABLA 13.CLOSTRIDIOS SULFITOREDUCTORES (HIERRO SULFITO). .......................................................................... 58TABLA 14.BACTERIAS RESISTENTES A 32 GML-1 DE AMPICILINA. .......................................................................... 63TABLA 15.BACTERIAS RESISTENTES A 64 GML-1 DE AMPICILINA. .......................................................................... 64

    TABLA 16.BACTERIAS RESISTENTES A 1 G L-1 DE AMPICILINA. ................................................................................. 64TABLA 17.CORRELACIONES ENTRE LOS TIPOS DE MICROORGANISMOS Y LA BIOMASA, RESPIRACIN Y HUMEDAD EN TODOS

    LOS MUESTREOS DEL ESTUDIO. .......................................................................................................... 71TABLA 18.CORRELACIONES ENTRE LOS TIPOS DE MICROORGANISMOS Y LA BIOMASA, RESPIRACIN Y HUMEDAD EN TODOS

    LOS MUESTREOS DEL ESTUDIO, SIN LOS DATOS DE AE160 Y ANAE160. .................................................. 72TABLA 19.ANLISIS DE LA INFLUENCIA DE LAS CARACTERSTICAS DEL SUELO Y DEL TRATAMIENTO APLICADO EN LAS

    POBLACIONES Y ACTIVIDADES MICROBIANAS DE LOS SUELOS ANALIZADOS. ................................................ 84TABLA 20.NDICES DE BIODIVERSIDAD Y SUS RESPECTIVAS FRMULAS. .................................................................. 113TABLA 21.DIRECCIONES DE LAS PGINAS EN INTERNET DE LOS PROGRAMAS UTILIZADOS PARA EL ANLISIS DE SECUENCIAS.

    ................................................................................................................................................. 114TABLA 22.COMPARACIONES ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS MS ABUNDANTES DEL SUELO CONTROL EN JUNIO DE

    2007(T0) Y EL RESTO DE LOS MUESTREOS. ...................................................................................... 119

    TABLA 23.COMPARACIONES ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS MS ABUNDANTES DEL SUELO CONTROL EN OCTUBREDE 2007(T1) Y EL RESTO DE LOS MUESTREOS. .................................................................................. 121

    TABLA 24.COMPARACIONES ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS MS ABUNDANTES DEL SUELO CONTROL EN FEBRERODE 2008(T2) Y EL RESTO DE LOS MUESTREOS.. ................................................................................. 122

    TABLA 25.COMPARACIONES ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS MS ABUNDANTES DEL SUELO CONTROL EN JUNIO DE2008(T3) Y EL RESTO DE LOS MUESTREOS. ...................................................................................... 124

    TABLA 26.COMPARACIONES ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS MS ABUNDANTES DEL SUELO CONTROL EN OCTUBREDE 2008(T4) Y EL RESTO DE LOS MUESTREOS. .................................................................................. 124

    TABLA 27.COMPARACIONES ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS MS ABUNDANTES DEL SUELO CONTROL EN FEBRERODE 2009(T5) Y JUNIO DE 2009(T6). ............................................................................................. 124

    TABLA 28.DIFERENCIAS ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS CARACTERSTICAS EN EL SUELO CONTROL EN T5COMPARADA CON EL RESTO DE LOS MUESTREOS. ............................................................................... 125

    TABLA 29.COMPARACIONES ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS MS ABUNDANTES DE SOIL Y LAS MUESTRASTRATADAS CON LODO AEROBIO Y ANAEROBIO. .................................................................................. 168TABLA 30.COMPARACIONES ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS MS ABUNDANTES DE AE40 Y EL RESTO DE LAS

    MUESTRAS TRATADAS CON LODO AEROBIO Y ANAEROBIO. ................................................................... 170TABLA 31.COMPARACIONES ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS MS ABUNDANTES DE AE80 Y EL RESTO DE LAS

    MUESTRAS TRATADAS CON LODO AEROBIO Y ANAEROBIO. ................................................................... 171TABLA 32.COMPARACIONES ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS MS ABUNDANTES DE AE160 Y EL RESTO DE LAS

    MUESTRAS TRATADAS CON LODO ANAEROBIO. .................................................................................. 172TABLA 33.COMPARACIONES ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS MS ABUNDANTES DE ANAE40 Y EL RESTO DE LAS

    MUESTRAS TRATADAS CON LODO ANAEROBIO. .................................................................................. 173TABLA 34.COMPARACIONES ENTRE LAS POBLACIONES MICROBIANAS MS ABUNDANTES DE ANAE80 Y EL RESTO DE LAS

    MUESTRAS TRATADAS CON LODO ANAEROBIO. .................................................................................. 174TABLA 35.COMPARACIONES ENTRE LOS FILOS BACTERIANOS MENOS ABUNDANTES Y RAROS DE SOIL Y EL RESTO DE LAS

    MUESTRAS TRATADAS CON LODO AEROBIO Y ANAEROBIO. ................................................................... 176

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    23/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    24/267

    7

    CAPTULO I

    1.El suelo y los lodos de depuradora.

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    25/267

    8

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    26/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    27/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    28/267

    11

    textura del suelo. Las bacterias y los hongos son los dos grupos ms numerosos en elsuelo. Estos microorganismos son esenciales para los procesos de los ciclosbiogeoqumicos, tienen la capacidad de degradar compuestos contaminantes(principalmente los actinomicetos) y son responsables de la degradacin de la materiaorgnica presente en el suelo (Atlas y Bartha, 2002; Six et al., 2006; Lal, 2007; Maier et

    al., 2009; Prosser, 2010). Debido a la enorme diversidad de la microbiota del suelo,hasta la fecha, ha sido imposible identificar todos los microorganismos presentes, perose ha podido estimar mediante diversas tcnicas. As, se ha estimado que en un sueloorgnico puede haber un total de 2,6 x 1029 clulas microbianas y entre ellas, 1012bacterias, 104 protozoos y 25 km de hifas de hongos (Young y Crawford, 2004;Voroney, 2007). Esta gran diversidad de microorganismos es utilizada como unindicador de la calidad del suelo, ya que los microorganismos responden rpidamentea los cambios de las condiciones ambientales en el suelo (Rees et al., 2001).

    Lgicamente, al tener una gran diversidad, el suelo tiene que ser por fuerza unnicho complejo y competitivo. Hay una serie de factores que influyen en la actividad dela gran cantidad de microorganismos presentes en el suelo que como consecuencia,tienen que adaptarse al estrs del ambiente. Por ello, las poblaciones microbianas delsuelo son dinmicas y sufren un cambio continuo (Lavelle y Spain, 2003). Estos factorespueden ser biticos (p.ej. la competicin con otros microorganismos) o abiticos (lascaractersticas fsicas y qumicas del suelo, temperatura, humedad, pH, potencialredox) (Maier et al., 2009). Otros factores como las fuentes de energa y carbono, lapresin, la composicin inica y la interaccin gentica entre microorganismostambin son capaces de afectar a la ecologa, actividad y la dinmica de laspoblaciones de microorganismos en el suelo (Nannipieri et al., 2003).

    Los microorganismos presentes en el suelo son factores clave en los ciclos dela mayora de los nutrientes presentes en la Tierra, especialmente en el ciclo delcarbono, nitrgeno, azufre y fsforo. En el caso del ciclo del carbono, son responsablesde la descomposicin de residuos orgnicos y de la degradacin de compuestosorgnicos contaminantes presentes en el suelo, siendo muy frecuente la utilizacin decosustratos como las enmiendas orgnicas para su activacin (Atlas y Bartha, 2002;Ros et al., 2010). La energa presente en el ecosistema del suelo deriva, entre otroscompuestos, de esa descomposicin de la materia orgnica por estos microorganismos(Nielsen y Winding, 2002; Pepper y Gerba, 2005). Otra de las funciones importantes delas bacterias es la secrecin de sustancias adherentes en forma de polisacridos queayudan en la formacin de micro y macroagregados que proporcionan estabilidad a laestructura del suelo (Voroney, 2007).

    1.2.1 BACTERIAS.Las bacterias son los microorganismos ms numerosos en la superficie del

    suelo y su cantidad y tipo vara dependiendo de las condiciones ambientales en l,principalmente la temperatura y la humedad (Paul, 2007; Voroney, 2007; Maier et al.,2009). Se estima que la poblacin bacteriana del suelo puede llegar a exceder de las1010 clulas por gramo de suelo. Estos microorganismos pueden ser cultivables (de

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    29/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    30/267

    13

    Existen otros aspectos, generalmente fisiolgicos o metablicos, que permitenclasificar y distinguir las poblaciones de microorganismos presentes en el suelo. Uno deestos aspectos es la utilizacin del oxgeno, las bacterias del suelo pueden ser aerobias,anaerobias y anaerobias facultativas (Pepper y Gerba, 2005). En la superficie del suelo,las bacterias aerobias estn en mayor cantidad que las anaerobias, estimndose que el

    nmero de stas se incrementa con la profundidad del suelo, pero raramentepredominan a menos que el suelo est saturado (Maier et al., 2009).

    En cuanto a la utilizacin de los nutrientes, las bacterias del suelo pueden serclasificadas en oligotrficas y copiotrficas. Las primeras necesitan de una pequeaconcentracin de nutrientes y utilizan lentamente la materia orgnica. Las bacteriascopiotrficas, por el contrario, son aquellas que necesitan una gran concentracin denutrientes y se adaptan a intervalos de latencia y rpido crecimiento dependiendo dela disponibilidad de estos sustratos (Atlas y Bartha, 2002; Maier et al., 2009). Lapresencia de esas bacterias en el suelo va a depender de la disponibilidad denutrientes en ese ecosistema, aunque la mayora de los suelos representan unambiente oligotrfico (Whalen y Sampedro, 2010).

    Respecto a la descomposicin de sustancias presentes en el suelo, losactinomicetos son muy efectivos en esa actividad. Esas bacterias pertenecientes al filo

    Actinobacteria son capaces de descomponer compuestos presentes en el estircol,herbicidas o pesticidas que son utilizados en el suelo y de degradar muchas sustanciasresistentes como lignina, pectina, queratina, celulosa, hemicelulosa y cidos hmicosmediante la produccin de enzimas hidrolticas y oxidativas (Prosser et al., 2007; Maieret al., 2009; Whalen y Sampedro, 2010). Son bacterias Gram-positivas filamentosasmuy abundantes en el suelo (el 10-33 % del total) que se caracterizan por poseer un

    micelio parecido al de los hongos pero de menor tamao, y cuya clasificacin estbasada en la estructura del aparato vegetativo (micelio) y el patrn de reproduccin(por fragmentacin, formacin de conidios vegetativos o esporangios sexuales)(Lavelle y Spain, 2003; Maier et al., 2009). Los actinomicetos son generalmenteresistentes a la desecacin y son termotolerantes, pudiendo sobrevivir en suelosdesrticos. El pH neutro o alcalino favorece su crecimiento (Atlas y Bartha, 2002;Pepper y Gerba, 2005). De todos los actinomicetos aislados del suelo, el 90 %pertenece al grupo de los estreptomicetos, siendo el ms diverso (Killham y Prosser,2007). En el caso del nitrgeno, nutriente que usualmente es limitante en el medioambiente, las cianobacterias tienen la capacidad de fijarlo y sus caractersticas son muysimilares a las de las algas (Maier et al., 2009).

    Adems de la actividad de las bacterias en procesos generales descritospreviamente, estos microorganismos presentan otras caractersticas importantes. Unade ellas, relevante para nuestro estudio, es la capacidad de producir antibiticos. Lafinalidad de la produccin de antibiticos presumiblemente es la de competir ysealizar su presencia a otros microorganismos del suelo siendo un tipo de estrsbitico (Davies, 2006). Por ejemplo, los actinomicetos pueden producir antibiticoscomo eritromicina, neomicina, tetraciclina, anfotericina y estreptomicina. Las bacteriasdel gnero Bacillus presentes en el suelo tambin son capaces de producir antibiticoscomo la polimixina o bacitracina (Killham y Prosser, 2007). Adems, algunos patgenos

    de plantas y rizobacterias como Erwinia, Serratia, Flavobacterium, Pseudomonas,

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    31/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    32/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    33/267

    16

    Tobamovirus, que causa graves enfermedades en plantas llegando a provocar necrosisgeneralizada, es capaz de persistir en el suelo y de sobrevivir a esterilizacin del suelopor autoclave (Bloem et al., 2006; Whalen y Sampedro, 2010). La utilizacin deestircoles o lodos de depuradora como fertilizantes orgnicos en suelos agrcolas esuna forma de introducir virus que producen enfermedades en mamferos y humanos

    en ese ecosistema, aunque los enterovirus por ejemplo, se inactivan tras periodos dedas o semanas en el suelo. Los hongos presentes en el suelo tambin pueden verseafectados por los virus (como por ejemplo, los micovirus) (Whalen y Sampedro, 2010).

    Y por ltimo, el grupo de las arqueas es similar a las bacterias solamente en sutamao y forma, siendo muy diferentes gentica y bioqumicamente (Maier et al.,2009). Los gneros ms representativos son: Halobacterium, Natronobacterium,Methanobacterium, Methanospirillum y Methanococccus (metangenos);

    Archeoglobus, Thermococcus y Thermoplasma (termfilos extremos); Sulfolobus yAcidothermus (termoacidfilos); y Pyrodictium (anaerobios estrictos) (Paul, 2007).Estos microorganismos predominan en ecosistemas con altas temperaturas ohipersalinos (Sylvia, 2005), pero tambin han sido detectados en ambientes noextremos en suelos prstinos de China y Amrica (Fan et al., 2006).

    1.3 VARIACIONES EN LA COMPOSICIN DE LA MICROBIOTADEL SUELO.

    La composicin del suelo puede ser alterada tanto por diversas actividadesantropognicas como por aspectos naturales (condiciones abiticas y biticas) en la

    forma y la biodisponibilidad de los nutrientes del suelo y, como consecuencia, en laspoblaciones microbianas presentes en l (Blanco y Lal, 2010).

    Las condiciones ambientales caractersticas de cada clima parecen producircambios temporales en la comunidad microbiana del suelo (Feng et al., 2003). Estosfactores ambientales pueden ser divididos en dos grupos respecto a sus efectos: losque afectan directamente a la estructura de la comunidad microbiana del suelo y susactividades (humedad, temperatura, pH, contenido de materia orgnica) y otrosfactores que producen efectos indirectos (latitud, elevacin, clima, textura,profundidad y minerales del suelo, posicin topogrfica y naturaleza de la vegetacinpresente) (Brockett et al., 2011). Entre esas variables ambientales, el pH del suelo hasido frecuentemente correlacionado con la estructura de la comunidad microbiana delsuelo, particularmente las bacterias (Lauber et al., 2009; Rousk et al., 2009b; Brockettet al., 2011).

    En lneas generales, los cambios de las condiciones ambientales del suelopueden ser perjudiciales para la comunidad microbiana presente en ese ecosistema.Un ejemplo de cambio ambiental importante es la sequa. Ese tipo de estrs es quiz elms comn para los organismos que pertenecen al suelo. La regin mediterrnea es unejemplo de clima semirido donde los periodos de sequa son muy frecuentes (Schimelet al., 2007). El aumento de la erosin del suelo y las altas temperaturas que se

    produce en esta regin conlleva la prdida del carbono de los suelos. En climas ridos ysemiridos la prdida de carbono del suelo es an mayor, comparada con la que se

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    34/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    35/267

    18

    incremento temporal en el contenido en materia orgnica y nutrientes que favorecenla recolonizacin vegetal y la recuperacin de las propiedades fsicas, qumicas ymicrobiolgicas (Guerrero et al., 2001; Villar et al., 2004; Bastida et al., 2007b).

    1.4 LOS LODOS DE DEPURADORA COMO ENMIENDAS ENSUELOS AGRCOLAS.

    El trmino original usado para describir todos los residuos de una planta detratamiento de aguas residuales fue lodos. De hecho, lodo es el componente slido osemilquido de algunos tipos de efluentes residuales. El trmino residualse usa ahorapara describir todos los residuos del proceso de una planta de tratamiento, bien seanlquidos, slidos o gaseosos. La cantidad de los residuos slidos o lquidos generadosen el tratamiento de plantas de aguas residuales depende de diversos aspectos como

    la cantidad del agua bruta, la dosis de productos qumicos, el rendimiento del procesode tratamiento, los mtodos de remocin de lodos, la eficiencia de la sedimentacin yla frecuencia del limpieza del filtro (retrolavados) (Cornwell, 2002). Actualmente, eltratamiento y vertido de residuos de una planta de tratamiento de agua es parteintegral de las operaciones de estas plantas debido a que las reglamentaciones localesy estatales tienen normas ms restrictivas para los programas de gestin de residuostradicionalmente practicados. En Estados Unidos de Amrica, el vertido de residuos notratados a la mayora de aguas superficiales est severamente restringido por elSistema Nacional de Eliminacin de Vertidos Contaminantes (NPDES) del Acta del AguaLimpia (Cornwell, 2002).

    Los lodos de depuradora de aguas residuales (LDAR) estn generalmentecompuestos por slidos generados durante el tratamiento de aguas residuales queson, bsicamente, biomasa microbiana. A pesar de tener una composicin qumicavariable, los LDAR son ricos en materia orgnica y nutrientes esenciales para lasplantas y microorganismos. Dependiendo del origen de las aguas residuales, estosresiduos pueden contener altos niveles de metales como Zn, Cu y Cd y xenobiticos,adems de microorganismos patgenos para animales y humanos y por eso, esnecesario que estos residuos sean tratados adecuadamente (Bitton, 2005b; Lambais ydo Carmo, 2008).

    Los lodos suelen ser eliminados de tres maneras: utilizacin como enmiendasen suelos agrcolas (como fertilizante orgnico), eliminacin en vertederos eincineracin (Grn et al., 2007; Wolna-Maruwka et al., 2007). Estos dos ltimosmtodos son tcnicas que acarrean efectos negativos para el clima, porque laacumulacin en vertederos genera gas metano y la incineracin, CO2 y, adems, lamateria orgnica y los nutrientes presentes en estos residuos son eliminados en lugarde ser reciclados (Grn et al., 2007). Actualmente en Espaa el 65 % de los LDAR sonutilizados como enmiendas en los suelos y el 60 % en los Estados Unidos de Amrica.Segn la clasificacin realizada por la Agencia de Proteccin del Medio Ambiente deEstados Unidos (US EPA, United States Environmental Protection Agency), los lodos dedepuradora tratados se les denominan bioslidos y se clasifican en dos tipos:

    bioslidos de clase A y de clase B. Los bioslidos de clase A son tratados hasta el puntoen que la concentracin de patgenos se reduce a niveles tan bajos que no se

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    36/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    37/267

    20

    patgenos en el producto final. El paso siguiente es el acondicionamiento de los LDARque puede hacerse por tratamientos qumicos (se aaden acondicionantes) o por calor(tratados a una temperatura de 175-230oC). Este paso facilita la separacin de losslidos de la fase lquida y reduce la afinidad del lodo con el agua. Posteriormente, sedeshidrata el lodo por filtracin o mediante lechos de secado. Tras este proceso los

    LDAR ya estarn listos para ser utilizados como enmiendas en suelos agrcolasposteriormente a su extraccin manual o mecnica despus del secado. El tratamientode los LDAR y su eliminacin son operaciones costosas en el tratamiento de aguasresiduales de plantas (Bitton, 2005b).

    Figura 2. Esquema del tratamiento de lodos de depuradora de aguas residuales.Modificado de (Bitton, 2005b).

    La aplicacin de estos desechos tratados en los suelos agrcolas es la formams utilizada y ms econmica, y constituye una oportunidad de reciclar estosresiduos e incrementar la materia orgnica del suelo, mejorando as la produccin de

    los cultivos (Catricala et al., 1996; Grn et al., 2007). Adems, podra facilitar larecuperacin de los suelos mediterrneos que tienden a una prdida de nutrientes porerosin y, por tanto, evitar la prdida de carbono y mejorar su calidad. Los suelosmediterrneos son muy pobres en materia orgnica (contienen menos de 1% decarbono orgnico total) y su contenido en metales pesados es relativamente bajo, loque abre amplias posibilidades de reciclaje de una parte importante de los lodos dedepuradora (PNIR 2008-2015) (Grn et al., 2007; Secretara de Estado de CambioClimtico, 2009). Por lo tanto, la utilizacin de enmiendas de lodos de depuradora ensuelos puede ser tambin una manera de recuperar suelos degradados de todo tipo(Ros et al., 2003; Larchevque et al., 2005).

    Sin embargo, de esta aplicacin tambin pueden surgir problemasmedioambientales porque no se conoce completamente hasta qu punto la utilizacinde los LDAR puede ocasionar consecuencias perjudiciales para los suelos o laatmsfera: la mineralizacin del carbono aadido, la adicin de patgenos y/omicroorganismos resistentes a antibiticos que son capaces de contaminar acuferos ocultivos y la modificacin de la comunidad microbiana del suelo. Son problemasimportantes, puesto que se podra incrementar la emisin de CO2 a la atmsferaaumentando as, el cambio climtico, y a la vez podra producir modificaciones en laspoblaciones microbianas naturales de los suelos.

    Por tanto, su utilizacin debe hacerse con las mximas garantas de seguridad

    para la salud pblica y los lodos deben ser evaluados tal y como recomienda lalegislacin vigente y la Organizacin Mundial de la Salud (RD 13/10/1990) (BOE 1990)

    Espesamiento

    Estabilizacin

    (Digestin aerbica

    o anaerbica)

    Acondicionamiento Deshidratacin LDAR

    Aplicacin a

    suelos

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    38/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    39/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    40/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    41/267

    24

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    42/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    43/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    44/267

    27

    Efectos a largo plazo en las propiedades microbianas deun suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de

    lodos de depuradora urbana.

    2.1 RESUMENINTRODUCCIN: Los suelos que se encuentran en la regin mediterrnea se caracterizan porser ms propensos a la degradacin por erosin debido a las condiciones climticascaractersticas como, por ejemplo, altas temperaturas, perodos de sequa y precipitacionesirregulares. La utilizacin de lodos de depuradora de aguas residuales (LDAR) es una buenaopcin para mejorar las caractersticas del suelo. Sin embargo, no se conocen completamentelos efectos nocivos en la microbiota indgena del suelo, ya que en la composicin de estosresiduos pueden existir metales pesados, xenobiticos, bacterias patgenas y resistentes adiversos antibiticos.

    MATERIALES Y MTODOS: Hemos estudiado la influencia de la aplicacin de lodos dedepuradora aerobio y anaerobio (40, 80 y 160 t ha-1) en diversas propiedades del suelo y de lamicrobiota presente en la superficie del suelo (0-20 cm) en parcelas de suelo agrcola.Mediante siembra en medios generales y especficos hemos determinado la presencia demicroorganismos oligotrficos y copiotrficos, bacterias indicadoras de contaminacin fecal ybacterias resistentes a distintas concentraciones de ampicilina. Adems, comprobamos elefecto de los lodos sobre la biomasa microbiana y sus niveles de respiracin. Estos anlisisfueron llevados a cabo durante 2 aos tras la aplicacin de los lodos, coincidiendo con lasestaciones de verano, otoo e invierno (cada 4 meses).

    RESULTADOS: Hemos observado un incremento de la biomasa y la respiracin basal en lasparcelas tratadas con menores dosis de lodos, en concreto el aerobio, y una disminucin en lastratadas con mayores dosis. Por el contrario, tanto los microorganismos oligotrficos ycopiotrficos totales como los patgenos tuvieron recuentos superiores en los suelos tratadoscon mayores dosis de LDAR, incluso dos aos despus de la aplicacin de los lodos a los suelos.El nmero y el porcentaje de bacterias resistentes a ampicilina fueron superiores en lasmuestras tratadas con lodo aerobio hasta el ltimo anlisis del estudio, principalmente en lasparcelas tratadas con mayores dosis.

    CONCLUSIONES: La aplicacin de los lodos, sobre todo los aerobios, influy notablemente enla microbiota del suelo incluso dos aos despus de su aplicacin, principalmente a dosiselevadas (160 t ha-1) llevando a una diseminacin de bacterias patgenas y su mantenimientoen el suelo incluso 2 aos despus. El incremento de la microbiota resistente a antibiticos con

    la mayor dosis de lodo aerobio debe hacer reflexionar sobre la utilizacin de dosis elevadas enla fertilizacin de los suelos agrcolas. Sin embargo, las dosis bajas tampoco estn exentas deproblemas puesto que se incrementa la emisin de CO2 en las parcelas as tratadas,provocando un incremento del efecto invernadero y del cambio climtico, por lo que esnecesario reevaluar la aplicacin de lodos en su totalidad.

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    45/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    46/267

    29

    2.2 INTRODUCCINLos suelos que se encuentran en la regin Mediterrnea se caracterizan por

    ser ms propensos a la degradacin por erosin debido a la gran variabilidad climticaque sufren, como, por ejemplo, largos periodos de sequa (aumentando los riesgos deincendios) e inconstancia en la frecuencia de las precipitaciones (de Paz et al., 2006).

    Muchos estudios han mostrado que la utilizacin de enmiendas orgnicas ensuelos con esas caractersticas puede mejorar su calidad, a travs del incremento de laestabilidad de los agregados, del ciclo de nutrientes, de la cobertura vegetal, de labiodiversidad, de la capacidad de almacenamiento de agua, de la biomasa, de laactividad microbiana, de la fertilidad y de la productividad del suelo agrcola (Ros et al.,2003; Prez-Piqueres et al., 2006; Prez-de-Mora et al., 2006; Lal, 2007; Bastida et al.,2009).

    Los lodos de depuradora urbana (LDAR) pueden ser uno de estos residuos

    orgnicos reutilizados como fertilizantes en suelos agrcolas y adems, es la mejorforma de reciclarlos porque es el procedimiento ms econmico y prctico (Rauch yBecker, 2000). En Espaa, la legislacin para el uso de los LDAR indica que la opcinms sostenible es la aplicacin como enmiendas en suelos agrcolas. Un 65 % del totales utilizado de esta manera (Secretara de Estado de Cambio Climtico, 2009). Las otrasformas de eliminar los LDAR son su acumulacin en vertederos o la incineracin (Grnet al., 2007; Wolna-Maruwka et al., 2007). Sin embargo, estos mtodos acarreanefectos negativos para el clima, porque la acumulacin en vertederos genera gasmetano y la incineracin, CO2, entre otros gases txicos y, adems, la materia orgnicay los nutrientes presentes en estos residuos son eliminados en lugar de ser reciclados

    (Bitton, 2005a; Turovskiy y Mathai, 2006; Grn et al., 2007).Sin embargo, la utilizacin de los LDAR como enmiendas agrcolas depende de

    sus caractersticas biolgicas y qumicas y aunque sea la opcin ms utilizada, no seconoce completamente cul es la influencia de la liberacin de estos residuos en elmedio ambiente. Los aspectos que se han estudiado con ms intensidad correspondena los que ejercen una influencia ms clara en la salud pblica, como son lacontaminacin con metales pesados o xenobiticos (Barajas-Aceves y Dendooven,2001; Barajas-Aceves et al., 2002; Mantovi et al., 2005; Prez-de-Mora et al., 2006;Martnez et al., 2009) o la liberacin de patgenos capaces de contaminar acuferos ocultivos (Bhattacharyya et al., 2005; Gerba y Smith, Jr., 2005; O'Connor et al., 2005). En

    Espaa todava no existe ninguna legislacin que indique valores mximos permitidosde microorganismos patgenos en los LDAR. Sin embargo, en otros pases como en losEstados Unidos de Amrica, la Agencia Nacional de Proteccin al Medio Ambiente (US-EPA), indica que el nivel mximo permitido de coliformes fecales presentes en loslodos digeridos anaerbicamente puede llegar hasta 2x106 NMP g-1 de lodo seco(United States Environmental Protection Agency, 1995).

    Aunque los tratamientos aplicados a estos lodos previamente a su salida delas depuradoras deberan asegurar la eliminacin de estos microorganismospatgenos, stos se encuentran presentes y son transmitidos al suelo subyacente(Entry y Farmer, 2001; Estrada et al., 2004; Lemunier et al., 2005) y comoconsecuencia, ste debera ser un aspecto preocupante para las autoridades sanitarias.

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    47/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    48/267

    31

    2.3 OBJETIVOSEl objetivo general de este trabajo consiste en analizar los efectos sobre las

    poblaciones microbianas derivados de la utilizacin de enmiendas de lodos dedepuradora urbana en un suelo agrcola mediterrneo, mediante el uso de tcnicasmicrobiolgicas dependientes de cultivo. Estos objetivos han sido desarrollados atravs del proyecto de investigacin CGL2006-13915/CLI en el que estudiamos laevolucin de la microbiota de un suelo agrcola tras la adicin de lodos de depuradoraurbana.

    Los objetivos concretos de este captulo son los siguientes:

    Determinar las alteraciones provocadas en la poblacin microbiana presente enel suelo agrcola control tras la aplicacin de distintas cantidades y tipos delodos de depuradora, mediante recuentos en medios de cultivo especficos y lamedicin de la biomasa y la respiracin microbiana.

    Determinar la evolucin y persistencia de algunos microorganismos patgenos(coliformes, enterococos, clostridios) en los suelos enmendados con lodos dedepuradora.

    Analizar la evolucin de microorganismos resistentes a distintasconcentraciones de ampicilina en los suelos tratados con lodos de depuradorarespecto del suelo agrcola control.

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    49/267

    32

    2.4 MATERIALES Y MTODOS2.4.1 LOCALIZACIN DE LAS PARCELAS.

    Este trabajo se llev a cabo entre los meses de junio de 2007 y junio de 2009en el Centro de Experimentacin Agraria La isla dependiente del Instituto Madrileode Investigacin y Desarrollo Rural, Agrario y Alimentario (IMIDRA) de la Comunidadde Madrid en Arganda del Rey (Figura 4). Las coordenadas son 40,31468347(latitud), -3,49746376 (longitud).

    Figura 4. Localizacin de las parcelas. Localizacin y disposicin de las parcelas en elCentro de Experimentacin Agraria La isla del IMIDRA. En la ampliacin se muestrauna fotografa de satlite de la finca en la que se han dispuesto los tres bloques (Roja,Amarilla y Azul) cada una de ellas con 8 parcelas con diversos tratamientos.

    El terreno sobre el que se localiza la finca est formado por sedimentoscuaternarios del ro Jarama, fundamentalmente arenas y limos. Estos sedimentos deorigen aluvial han dado lugar a un antiguo Fluvisol calcrico que en la actualidadpresenta caractersticas propias de Antrosol (IUSS Working Group WRB, 2007), y secaracteriza por tener una marcada influencia humana debido a su uso agrcola.Morfolgicamente se diferencian tres horizontes, un horizonte Ap (0-40 cm) conpropiedades anlogas a un horizonte Anthragric, con un contenido en carbonoorgnico prximo al 1 %, un pH moderadamente bsico (pH = 8), baja pedregosidadsuperficial y alta permeabilidad. Un horizonte subsuperficial (40-80 cm) concaractersticas de suelo de labor o compactacin subsuperficial por el uso de

    maquinaria agrcola de manera intensiva, aunque tambin se aprecianmorfolgicamente cambios texturales de acumulacin de arcillas. Este horizonte se

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    50/267

    33

    puede denominarAnthraquic ya que presenta un aumento significativo de los valoresde densidad aparente, lo que se traduce en una disminucin de la permeabilidad eficazy un menor contenido en carbono. A continuacin, de 80 a 240 cm, existen diversoshorizontes C que se diferencian por cambios texturales de los materiales, y provienendel transporte fluvial.

    La textura del suelo se describe en la Tabla 1.

    TEXTURA CANTIDADES (%)

    % Arena fina% Limo

    % Arena% Arcilla

    Clase textural

    7,841,323,627,3

    Franco Arcilloso

    Tabla 1. Textura del suelo agrcola mediterrneo analizado. Datos cedidos por elgrupo del Profesor Casermeiro del Departamento de Edafologa de la Facultad deFarmacia.

    2.4.2 PREPARACIN DE PARCELAS DE ENSAYO.Los lodos de depuradora urbana escogidos proceden de las depuradoras de

    Campo Real (11000 kg, aerobio) y Guadarrama medio (9000 kg, anaerobio), ambas delCanal de Isabel II de la Comunidad de Madrid.

    Las caractersticas qumicas de los lodos se muestran en la Tabla 2.

    Lodo ms% MO N Norg pH Cd Cr Cu Hg Ni Pb Zn P Fe K Ca MgAnaerobio 17 76 9,9 6,3 7,5 1,1 16 354 0,6 16 29 523 1,2 0,7 0,26 1,7 0,25

    Aerobio 14 75 5,9 4,2 8,2 0,8 17 91 0,1 21 28 237 1,7 0,4 0,54 3,5 0,30

    Tabla 2. Caractersticas fisicoqumicas de los lodos de las depuradoras. ms%,porcentaje de materia seca; MO, materia orgnica; N (nitrgeno total, ); Norg,nitrgeno orgnico; y metales pesados, en mg/kg de lodo seco; Fe (hierro total), P, K,Ca, Mg y, en % sobre materia seca.

    Los lodos se distribuyeron en las parcelas a las concentraciones establecidas el5 de junio de 2007 de una manera aleatorizada. Su aplicacin se realiz manualmentey se mezcl con el horizonte superficial del suelo mediante el uso de una vertederasimple. A partir de ese momento comenzaron los anlisis subsiguientes.

    La distribucin de las parcelas consisti en 3 bloques con 8 parcelas deaplicacin cada uno como se indica en la Figura 5. Los bloques de 8 parcelas estnseparados por pasillos de 10 metros que han sido frecuentemente desbrozados por elpersonal del Centro de Experimentacin Agraria del IMIDRA La Isla. Cada parcelamide 2,5 x 5 metros y se encuentra distanciada de la siguiente parcela adyacente poruna separacin de 5 metros. De esta manera, se pretendi evitar posibles influencias o

    contaminaciones cruzadas entre unas parcelas y otras.

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    51/267

    34

    Figura 5. Esquema de la distribucin

    aleatorizada de los lodos aerobios yanaerobios. Bloque tipo. AE40, AE80 yAE160 son las parcelas a las que se hanaadido, respectivamente, 40, 80 y160 t ha-1 de lodo aerobio (AE), mientrasque ANAE40, ANAE80 y ANAE160 son lasparcelas a las que se han aadido,respectivamente, 40, 80 y 160 t ha-1 delodo anaerobio (ANAE). El suelo sin tratares Soil.

    Finalmente, se obtuvieron 7 tipos de suelo con distintas cantidades de lodosde depuradora aerobio y anaerobio (toneladas/hectrea), como se indica en la Tabla 3.

    NOMENCLATURA TIPO DE LODOCANTIDAD DE LODO

    (TONELADAS*/HECTAREA)

    SOIL - -AE40 Aerobio 40AE80 Aerobio 80

    E160 Aerobio 160ANAE40 Anaerobio 40ANAE80 Anaerobio 80

    ANAE160 Anaerobio 160

    Tabla 3. Parcelas que fueron analizadas en este trabajo. Soil, Suelo agrcola control.AE, aerobio. ANAE, anaerobio. * Peso seco.

    2.4.3 RECOGIDA DE MUESTRAS.Las muestras se tomaron cada 4 meses comenzando tras la aplicacin de los

    lodos en junio de 2007 (T0), seguido de muestreos en octubre de 2007 (T1), febrero de2008 (T2), junio de 2008 (T3), octubre de 2008 (T4), febrero de 2009 (T5) y junio de2009 (T6), conforme la metodologa previamente descrita (Paetz y Wilke, 2005). Lasfechas exactas de la recogida de muestras estn especificadas en la Tabla 4.

    La temperatura media y precipitaciones a lo largo del periodo de estudio, ascomo los porcentajes de humedad de las muestras recogidas estn especificados en laFigura 6 y Figura 7, respectivamente.

    ANAE40

    AE40

    AE80

    ANAE160

    Soil AE160

    ANAE

    80 Soil

    5 m 5 m 5 m

    7,5 m

    2,5

    m

    5 m 5 m

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    52/267

    35

    MUESTREO FECHA ESTACIN

    T0 25-JUN-2007 VERANO

    T1 15-OCT-2007 OTOOT2 16-FEB-2008 INVIERNOT3 22-JUN-2008 VERANOT4 14-OCT-2008 OTOOT5 24-FEB-2009 INVIERNOT6 01-JUN-2009 VERANO

    Tabla 4. Fechas y estaciones del ao de los muestreos.

    Figura 6. Temperatura y precipitacin en las parcelas durante el periodo de estudio. Los datos han sido obtenidos de la estacin meteorolgica existente en la finca deexperimentacin del IMIDRA La Isla. Las fechas de muestreo se indica con diversoscolores: en verde, muestreo microbiolgico; en naranja, muestreo de respiracin(Li-COR 8100) y edafolgico; en violeta, muestreo de lixiviacin.

    Se utiliz un cilindro de 20 centmetros de profundidad (5 cm de dimetro)(Eijkelkamp) para obtener tres muestras de suelo de puntos distintos de cada parcelaque se mezclaron en una bolsa estril distinta para cada una de ellas. Despus demezcladas, se transfiri cada muestra a un recipiente estril de 2 litros de capacidad.De la misma mezcla, se recogieron dos tubos de plstico de 50 mL de volumen (falcon)por muestra que se congelaron rpidamente in situ en nieve carbnica, reservandoestas muestras para los anlisis de las poblaciones microbianas por mtodos debiologa molecular. Las muestras destinadas a anlisis dependientes de cultivo sealmacenaron a 4oC. Las muestras destinadas a anlisis molecular se congelaron y

    mantuvieron a -80oC.

    Jun

    07

    Jul

    07

    Ag

    07

    Sep

    07

    Oct

    07

    Nov

    07

    Dic

    07

    En

    08

    Feb

    08

    Mar

    08

    Abr

    08

    May

    08

    Jun

    08

    Ju l

    08

    Ag

    08

    Sep

    08

    Oct

    08

    Nov

    08

    Dic

    08

    En

    09

    Feb

    09

    Mar

    09

    Abr

    09

    May

    09

    Jun

    09

    Jul

    09

    0

    10

    20

    30

    40

    50

    60

    70

    -10

    -5

    0

    5

    10

    15

    20

    25

    30

    35

    Precipitacin(mm)

    Temperaturamedia(C)

    Temperatura y precipi tacin en La Isla (Arganda , Madrid, Espaa)

    Precipitacin Temperatura media (C)

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    53/267

    36

    Figura 7. Porcentaje de humedad en los distintos muestreos del estudio.

    2.4.4 ANLISIS DE LAS MUESTRAS DE SUELO MEDIANTE SIEMBRAS.2.4.4.1MEDIOS DE CULTIVO.

    Se utilizaron diversos tipos de medios de cultivo para detectar distintos tiposde microorganismos. Los medios utilizados fueron generales (Atlas, 2004) o bienespecficos, de acuerdo a diversas normativas indicadas para cada tipo demicroorganismo (vase 2.4.5. IDENTIFICACIN DE BACTERIAS PATGENAS.).

    Los medios de cultivo que se utilizaron en este trabajo estn descritos en laTabla 5. Se esterilizaron a 121oC durante 20 minutos a excepcin de los mediosSlanetz-Bartley y Bilis Esculina que se esterilizaron conforme a las normas delfabricante. Cuando se utilizaron antibiticos, se aadieron despus de la esterilizacincuando la temperatura del medio alcanz 55oC, aproximadamente.

    0,00

    5,00

    10,00

    15,00

    20,00

    25,00

    Jun/2007

    (T0)

    Oct/2007

    (T1)

    Feb/2008

    (T2)

    Jun/2008

    (T3)

    Oct/2008

    (T4)

    Feb/2009

    (T5)

    Jun/2009

    (T6)

    Porcentaje de humedad

    Soil AE40 AE80 AE160 ANAE40 ANAE80 ANAE160

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    54/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    55/267

    38

    Bilis Esculina (BE)(Laboratorios CONDA)

    Extracto de levadura 5 g L-1Peptona 3 g L-1

    Triptona 17 g L-1

    Bilis de buey 10 g L

    -1

    Esculina 1 g L-1Citrato frrico amnico 0,5 g L-1

    NaCl 5 g L-1Azida de sodio 0,15 g L

    -1

    Agar 15 g L-1

    Agua destilada csp 1000 mL

    Confirmacin de Enterococcus spp pueshidrolizan la esculina.

    Incubacin a 440C/2 horas.

    Hierro Sulfito (HS-Concentracin Doble)

    Triptona 20 g L-1

    Sulfito sdico 1,5 g L

    -1

    Citrato frrico 1,5 g L-1

    Agar 30 g L

    -1

    Agua destilada csp 1000 mL

    Deteccin de clostridios (bacterias reductorasde sulfito produciendo sulfuro de hierro).

    Incubacin a 370C/2 das en anaerobiosis (capade agar agua).

    LBXGALIPTG

    AMPICILINA

    Triptona 10 g L-1

    Extracto de levadura 5 g L

    -1

    NaCl 5 g L-1

    Agar 18 g L

    -1

    Agua destilada csp 1000 mLDespus de atemperado, se aadieron almedio 100 g mL-1 de ampicilina, 0,5 mM

    de IPTG y 80 g mL-1

    de X-Gal

    Seleccin de bacterias con plsmidos deresistencia a ampicilina. El plsmido tiene el gen

    lacZque codifica la beta-galactosidasa quedegrada la lactosa. Cuando el plsmido no tieneinserto de DNA se expresa el gen LacZcompletoy se produce la degradacin del sustrato X-Gal,

    produciendo un precipitado azul. Cuando elplsmido contiene DNA insertado, el gen lacZ

    no se expresa y las colonias tienen color blanco.Se utiliz el medio LB con ampicilina parasembrar los transformantes en una placa

    multipocillo (backup).

    SOC

    Triptona 10 g L-1Extracto de levadura 5 g L

    -1

    NaCl 0,5 g L-1

    KCl 0,25 M 10 mL

    Agua destilada csp 1000 mLSe ajust el pH del medio con 0,2 mL de

    NaOH 5M. Se aadi en esterilidad 5 mL deuna solucin estril de Cl2Mg 2M y 20 mL

    de una solucin estril de glucosa 1M.

    Transformacin de E. coli.Incubacin a 37

    0C/15 minutos.

    TB SALES

    Triptona 12 g L-1

    Extracto de levadura 24 g L

    -1

    Glicerol 4 mLAgua destilada csp 1000 mL

    Solucin de sales:K2HPO4 12,59 g 100 mL

    -1

    KH2PO4 2,31 g 100 mL-1

    Se aadi la solucin de sales cuando elmedio estaba atemperado para que no

    precipitara.

    Siembra de los transformantesy extraccin de DNA plasmdico.

    Incubacin a 370C/18 horas.

    Tabla 5. Medios de cultivo utilizados en este trabajo.

    2.4.4.2PREPARACIN DE LAS MUESTRAS PARA CULTIVO.Para cada muestra, se prepararon seis botellas con 90 mL de agua estril

    (diluciones: -1 a -6).

    Se pesaron 10 gramos de suelo de cada una de las muestras en un recipienteestril. Se resuspendieron con 90 mL de agua estril y la solucin resultante seintrodujo en una bolsa estril para su homogeneizacin.

    Se introdujo la bolsa en un aparato homogeneizador Stomacher 400 (A.J.Seward) eliminando las posibles burbujas de aire. Se homogeneiz tres veces

    durante un minuto con un minuto de reposo entre cada una de ellas. Se

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    56/267

    39

    devolvi el lquido resultante al recipiente original. De esta manera se obtuvo ladilucin (1) de cada muestra.

    A continuacin, se hicieron diluciones decimales tomando 10 mL de la dilucin(1) y aadindolo a una botella con 90 mL de agua estril para obtener la

    dilucin (2). Se procedi de la misma manera, hasta obtener la dilucin (-6).

    Se comenzaron las siembras por la muestra de mayor dilucin (-6) para evitarerrores, inoculndose 100 L en cada placa de medio de cultivo. Realizamos lasiembra por triplicado para cada dilucin con bolas pequeas de vidrioestriles, haciendo movimientos en zig-zag.

    2.4.5 IDENTIFICACIN DE BACTERIAS PATGENAS.Una vez dispuestos los lodos en las parcelas procedimos al anlisis de los

    patgenos en el suelo en la parcela Soil (control) y las tratadas con lodos dedepuradora. El primer muestreo (T0) se realiz 15 das despus de la aplicacin de lasenmiendas de lodos de depuradora.

    2.4.5.1COLIFORMES FECALES.Los coliformes fecales fueron detectados mediante siembra de las muestras

    del estudio en medio TTC (descrito en la Tabla 5). Para ello, se llevo a cabo una

    modificacin del protocolo descrito en la Norma UNE-EN ISO 9308-1:2000, utilizando100 L de la dilucin correspondiente y sembrndolos directamente en el medio TTC,por triplicado, en lugar de filtrar 100 mL de cada dilucin como describe la norma.

    Tras la incubacin a una temperatura de 44oC durante 48 horas, se hizo elrecuento de las bacterias fermentadoras de lactosa que crecieron en ese medio. Estasbacterias crecen dejando a su alrededor un halo amarillo debido al viraje de unindicador de pH (azul de bromotimol) presente en el medio tras la fermentacin de lalactosa. Se hicieron tinciones de Gram para identificar cada una de las bacterias y acontinuacin, se sembraron por estra en medio Agar Nutritivo que se incub a 37 oCdurante 24 horas. Tras esa siembra, se hicieron pruebas bioqumicas especficas

    (prueba de la oxidasa, indol, Voges-Proskauer, rojo de metilo y citrato - IMVIC) paraidentificar y confirmar la presencia de coliformes fecales (Koneman y Allen, 2008).

    2.4.5.2ENTEROCOCOS FECALES.La presencia de enterococos en los suelos se llev a cabo mediante una

    modificacin del protocolo descrito en la Norma UNE-EN ISO 7899-2:2001 filtrandosolamente 10 mL de cada dilucin en lugar de 100 mL como describe la norma.Brevemente, se tomaron 10 mL de las diluciones adecuadas de cada muestra y se

    filtraron a travs de un filtro Millipore con un tamao de poro de 0,22 m. Despus, el

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    57/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    58/267

    41

    entre el 30 y el 60 % de la capacidad de campo (capacidad de campo: cantidad de aguamxima que puede captar el suelo o cantidad de agua que satura el suelo). Tras lahumectacin, se mantuvieron las muestras de suelo en una cmara a 24C durante 48horas previamente a su utilizacin en los anlisis descritos a continuacin (Campbell etal., 2003).

    Los valores de biomasa y respiracin de las poblaciones microbianaspresentes en las muestras del estudio se obtuvieron por medio de la medicin de larespiracin en el sistema MicrorespTM (MSC Ltd). En el caso de la biomasa mediante laincubacin con una solucin de extracto de levadura (YE) (Fierer et al., 2003a),mientras que en el caso de la respiracin basal, mediante la adicin de agua ultrapuraestril. Este mtodo se basa en la captura del CO2 producido por el suelo en un gel conun indicador que vira de color en funcin de la cantidad que captura (Figura 8). Lamedicin de ese color con un espectrofotmetro de luz visible a 595 nm (Microplatereader Model680, Biorad) y la utilizacin de unas curvas patrn nos permiten calcularla cantidad de CO2 producido en ambos procesos.

    Para ello, se reparti la placa multipocillo en dos mitades: las 6 primerascolumnas para medicin de la biomasa inducida por sustrato (extracto de levadura al16 %) y las 6 ltimas columnas para la medicin de la respiracin basal (agua ultrapuraestril). Se reserv la ltima columna de cada bloque para la medicin sin muestra(slo con YE y agua) como control de la esterilidad del proceso. La placa indicadora semidi 4 horas despus de la adicin de los sustratos.

    Figura 8. Esquema de la determinacin de CO2 en un pocillo del sistemaMicrorespTM. Modificado de (Campbell et al., 2003).

    2.4.7.1MEDICIN DE LA RESPIRACIN Y LA BIOMASA.La medicin de la respiracin basal (con agua ultrapura) y de la respiracin

    inducida a partir de una solucin de extracto de levadura estril (YE) al 16 % se llev acabo de la siguiente manera:

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    59/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    60/267

    43

    2.4.8 ANLISIS DE LOS DATOS.Los datos de recuentos de microorganismos (CFU g-1 de suelo), biomasa y

    respiracin fueron procesados usando Excel 2007 (Microsoft Corporation). Eltratamiento estadstico de los datos comenz con la comprobacin de que seguan una

    distribucin normal mediante el test de Kolmogorov-Smirnov. A continuacin serealizaron los anlisis de las medidas de dispersin. Se comprob la homogeneidad delas varianzas por medio del test de Levene y si eran homogneas, se analizaban lasmedias utilizando el ANOVA de un factor para las comparaciones entre las sietemuestras. Se aplic el test post-hoc Tukey para la obtencin de subgruposhomogneos con un nivel de confianza superior al 95 % (p

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    61/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    62/267

    45

    Figura 9. Biomasa microbiana (SIR) demuestras de las parcelas del estudio.Anlisis realizado con el sistemaMicroresp y una solucin estril deextracto de levadura (16 %). Serepresenta la media junto con su errorestndar (SEM). Soil, suelo control; AE40,80 y 160, parcelas tratadas con lodoaerobio a 40, 80 o 160 t ha-1; ANAE40, 80

    y 160, parcelas tratadas con lodoanaerobio a 40, 80 o 160 t ha-1.

    Biomasa T0

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    0

    5

    10

    15

    20

    bc

    b

    a a a

    b

    gC-CO2

    g-1s

    oilh-1

    Biomasa T1

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE160

    0

    5

    10

    15

    20

    bcd

    bc abccd

    a ab

    gC-CO2

    g-1s

    oilh-1

    Biomasa T2

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE40

    ANAE80

    ANAE160

    0

    5

    10

    15

    20

    b b

    cd

    b

    a

    d

    bc

    gC-CO2g-1s

    oi

    lh-1

    Biomasa T3

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    0

    5

    10

    15

    20

    a

    bc

    d

    e

    a

    cd

    ab

    gC-CO2g-1s

    oilh-1

    Biomasa T4

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE40

    ANAE80

    ANAE1

    60

    0

    5

    10

    15

    20

    aab

    b

    ab

    cc

    a

    gC-CO2g-1s

    oilh-1

    Biomasa T5

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    0

    5

    10

    15

    20

    a

    cd

    bc bc bc

    c

    ab

    gC-CO2g-1s

    oilh-1

    Biomasa T6

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    0

    5

    10

    15

    20

    a

    d

    cd

    b

    c c

    b

    gC-CO2g-1s

    oilh-1

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    63/267

    46

    Figura 10. Respiracin en las parcelas delestudio. Anlisis realizado con el sistemaMicroresp. Se representa la media juntocon su error estndar (SEM). Lanomenclatura se describe en la Figura 9.

    Respiracin Basal T0

    SOIL

    AE

    40

    AE

    80

    AE

    160

    ANAE

    40

    ANAE

    80

    ANAE

    160

    0

    1

    2

    3

    dbc

    ab

    a a

    cd

    gC-CO2g-1soilh-1

    Respiracin Basal T1

    SOIL

    AE

    40

    AE

    80

    AE

    160

    ANAE

    40

    ANAE

    80

    ANAE

    160

    0

    1

    2

    3

    a

    bcd

    e

    de

    abbcdbc

    gC-CO2g-1soilh-1

    Respiracin Basal T2

    SOIL

    AE

    40

    AE

    80

    AE

    160

    ANAE

    40

    ANAE

    80

    ANAE

    160

    0

    1

    2

    3

    ab a

    c

    cd

    dd

    gC-CO2g-1so

    ilh-1

    Respiracin Basal T3

    SOIL

    AE

    40

    AE

    80

    AE

    160

    ANAE

    40

    ANAE

    80

    ANAE

    160

    0

    1

    2

    3

    a a

    bc

    a

    bbc

    d

    gC-CO2g-1s

    oilh-1

    Respiracin Basal T4

    SOIL

    AE

    40

    AE

    80

    AE

    160

    ANAE

    40

    ANAE

    80

    ANAE

    160

    0

    1

    2

    3

    a a

    c

    d

    b

    a

    b

    gC-CO2g-1s

    oilh-1

    Respiracin Basal T5

    SOIL

    AE

    40

    AE

    80

    AE

    160

    ANAE

    40

    ANAE

    80

    ANAE

    160

    0

    1

    2

    3

    ab

    a a

    c

    bb

    gC-CO2g-1soilh-1

    Respiracin Basal T6

    SOIL

    AE

    40

    AE

    80

    AE

    160

    ANAE

    40

    ANAE

    80

    ANAE

    160

    0

    1

    2

    3

    b

    d

    cc c bc

    agC-CO2g-1soilh-1

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    64/267

    47

    2.5.1.2MICROORGANISMOS OLIGOTRFICOS Y COPIOTRFICOS.Hemos determinado el nmero de microorganismos oligotrficos en los

    medios R2A y ETD y los microorganismos copiotrficos, en medio Agar Actinomicetos.

    En el medio R2A, con el que hemos cuantificado los microorganismosoligotrficos totales (Tabla 6 y Figura 11), se detect la existencia de algunasalteraciones importantes en la microbiota oligotrfica total del suelo entre la muestracontrol (Soil) y las muestras tratadas con lodos de depuradora en el primer muestreo(junio de 2007 T0), aunque no estadsticamente significativas. Las diferenciasimportantes y apreciables comenzaron a partir del muestreo de octubre de 2007 (T1)donde se apreciaron diferencias estadsticamente significativas principalmente entre lamuestra control (Soil) y las muestras tratadas con mayores dosis de lodo (AE160 yANAE160), existiendo un mayor nmero de microorganismos en esas muestras (Tabla6 y Figura 11). Estas diferencias se mantuvieron hasta el ltimo muestreo (T6), siendomayor el incremento del nmero de microorganismos oligotrficos totales en lamuestra tratada con mayor concentracin de lodo aerobio (AE160).

    En las parcelas tratadas con dosis intermedias se detectaron diferencias entreSoily AE80 en los muestreos de octubre de 2007 T1 y de junio de 2008 - T3 (Tabla 6 yFigura 11) siendo superior en AE80. Entre las muestras Soil y ANAE80, existi unincremento del nmero de microorganismos en el muestreo de junio de 2009 - T6.Apenas hemos observado diferencias estadsticamente significativas entre Soily AE40,aunque entre Soily ANAE40 s existen en los ltimos muestreos (octubre de 2008 - T4,febrero de 2009 T5 y junio de 2009 T6) (Tabla 6 y Figura 11). En cuanto a la parcelacontrol (Soil), el nmero de microorganismos oligotrficos totales fue similar en casi

    todos los anlisis realizados.

    R2A (x109 CFU g-1 suelo)MUESTRA T0 T1 T2 T3 T4 T5 T6

    SOIL 1,09 (0,01) 1,27 (0,23) 1,58 (0,22) 1,32 (0,42) 1,43 (0,26) 0,76 (0,35) 1,59 (0,44)AE40 2,04 (0,30) 1,97 (0,31) 24,70 (19,90) 2,54 (1,12) 3,35 (0,90) 1,83 (0,34) 1,79 (0,40)AE80 5,00 (0,67) 3,46 (0,78) 5,84 (0,82) 2,79 (0,71) 2,43 (0,59) 2,09 (0,69) 2,34 (0,46)

    AE160 7,84 (1,10) 10,30 (0,57) 8,40 (1,34) 11,20 (6,06) 11,50 (1,63) 3,06 (0,87) 6,04 (0,84)ANAE40 0,68 (0,16) 1,65 (0,13) 4,15 (1,10) 1,93 (0,58) 4,89 (0,85) 2,50 (1,04) 3,61 (0,31)ANAE80 1,19 (0,13) 2,42 (0,39) 4,18 (0,33) 2,30 (0,30) 1,76 (0,87) 1,93 (0,61) 5,34 (0,95)

    ANAE160 2,86 (0,50) 8,04 (0,69) 18,70 (1,64) 9,93 (0,62) 3,39 (1,85) 2,01 (1,04) 3,53 (0,72)

    Tabla 6. Microorganismos oligotrficos (R2A). Se indica la media y entre parntesis ladesviacin estndar. La media se representa en la Figura 11.

    En el medio ETD (Figura 12) hemos obtenido resultados similares a losencontrados con el medio R2A ya que, en la mayora de los muestreos, el nmero demicroorganismos oligotrficos totales fue mayor en las muestras tratadas con mayordosis (AE160 y ANAE160). Sin embargo, a diferencia del anlisis con R2A, en losmuestreos de octubre de 2008 y junio de 2009 (T4 y T6) el nmero demicroorganismos oligotrficos totales en la muestra control (Soil) fue superior al de lasmuestras de mayor concentracin de lodos (Tabla 7 y Figura 12). En las parcelas

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    65/267

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    66/267

    49

    AGAR ACTINOMICETOS (x109 CFU g-1 suelo)MUESTRA T0 T1 T2 T3 T4 T5 T6

    SOIL 1,42 (0,60) 1,33 (0,11) 2,16 (0,11) 1,43 (0,44) 0,81 (0,11) 0,67 (0,04) 1,46 (0,35)AE40 2,59 (0,11) 2,73 (0,62) 4,22 (0,66) 2,73 (0,48) 2,87 (0,62) 1,43 (0,18) 1,72 (0,01)AE80 7,32 (3,02) 7,05 (2,73) 4,15 (0,76) 2,51 (0,43) 2,17 (0,41) 1,48 (0,19) 2,51 (0,32)

    AE160 3,49 (1,26) 16,20(3,04) 12,50 (3,70) 7,28 (0,33) 2,52 (0,52) 3,11 (0,33) 5,21 (0,30)ANAE40 2,33 (0,32) 3,16 (0,80) 3,28 (0,45) 1,43 (0,25) 1,86 (0,35) 1,45 (0,31) 1,76 (0,19)ANAE80 1,87 (0,15) 5,72 (2,10) 3,28 (0,41) 1,73 (0,24) 2,67 (0,19) 1,34 (0,28) 2,51 (0,32)

    ANAE160 15,3 (2,48) 11,50(0,92) 13,50 (1,13) 9,69 (2,28) 3,88 (0,63) 1,64 (0,25) 2,47 (0,54)

    Tabla 8. Microorganismos copiotrficos (Agar Actinomicetos). Se indica la media yentre parntesis la desviacin estndar. Datos representados grficamente en laFigura 13.

    2.5.1.3BACTERIAS Y HONGOS.Con el fin de determinar si los efectos son ms acusados en las poblaciones

    bacterianas o en las fngicas, hemos realizado recuentos en medios especficos paracada uno de ellos: para bacterias, R2AC que contiene cicloheximida, un inhibidor de lasntesis de protenas eucariota, y para hongos, Sabouraud-Cloranfenicol, que contienecloranfenicol, un inhibidor de la sntesis de protenas bacteriana.

    El nmero de bacterias oligotrficas totales en medio R2AC(Tabla 9 y Figura14) fue superior en las muestras tratadas con mayores dosis (AE160 y ANAE160). Estadiferencia se mantuvo hasta el ltimo muestreo (junio de 2009 T6) siendo los valoresde ANAE160 superiores a los de AE160 en algunos de ellos (T1, T2, T3 y T4). En las

    parcelas tratadas con menores dosis de lodos el incremento de la poblacin bacterianaslo ocurri en los primeros anlisis (Tabla 9 y Figura 14).

    R2AC (x109 CFU g-1 suelo)MUESTRA T0 T1 T2 T3 T4 T5 T6

    SOIL 0,99 (0,02) 0,76 (0,41) 1,41 (0,18) 1,17 (0,15) 1,37 (0,31) 0,77 (0,09) 1,52 (0,32)AE40 1,16 (0,10) 1,91 (0,93) 14,00 (12,1) 2,36 (0,36) 5,45 (0,21) 1,71 (0,10) 1,94 (0,75)AE80 6,47 (1,41) 1,83 (0,42) 5,77 (2,32) 1,75 (0,12) 3,77 (0,67) 2,41 (0,50) 2,57 (0,21)

    AE160 7,79 (1,17) 6,53 (0,80) 8,23 (1,04) 3,44 (0,87) 7,33 (1,13) 2,23 (0,58) 3,14 (0,40)ANAE40 2,74 (0,14) 2,25 (1,02) 4,15 (1,25) 1,65 (0,24) 3,11 (0,90) 1,93 (0,52) 2,58 (0,75)ANAE80 1,46 (0,11) 4,51 (0,49) 5,30 (0,92) 2,17 (0,53) 3,36 (0,67) 2,41 (0,70) 6,13 (0,64)

    ANAE160 5,79 (0,45) 11,5 (0,35) 17,00 (1,44) 11,40 (2,99) 11,80 (0,50) 2,48 (0,87) 3,64 (0,70)

    Tabla 9. Bacterias oligotrficas (R2AC). Se indica la media y entre parntesis ladesviacin estndar. Datos representados grficamente en la Figura 14.

    El efecto en la poblacin fngica fue muy similar al detectado en losanteriores anlisis. Como se puede observar en la Figura 15, tras la aplicacin de loslodos en los suelos en junio de 2007 (T0), el nmero de hongos en las parcelasenmendadas fue muy similar al del suelo sin tratar. En cambio, a partir de febrero de2008 (T2) s hemos detectado un valor superior de estos microorganismos en las

    muestras tratadas con lodo aerobio respecto a Soil, principalmente en las que seaplicaron 80 y 160 t ha-1 (AE80 y AE160) llegando incluso, a ser un orden de magnitud

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    67/267

    50

    mayor en la mayora de los anlisis en AE160 (T2, T3, T4, T5, T6) (Tabla 10 y Figura 15).En algunos muestreos (T2, T3, T6), el nmero de hongos fue similar entre la parcelaAE80 y AE160 (Tabla 10 y Figura 15). En cuanto a las parcelas tratadas con mayoresdosis de lodo anaerobio (ANAE160), el nmero de hongos solo fue mayor en algunosmuestreos (T4 y T6). Sin embargo, los valores en ANAE160 fueron siempre inferiores

    respecto a AE160 (Tabla 10yFigura 15). En las muestras tratadas con dosis menores eintermedias se observ un mayor nmero de hongos en algunos muestreos.

    Parece existir una relacin entre el incremento del nmero de hongos y el tipode residuo utilizado en el estudio. El aumento de la poblacin de estosmicroorganismos pareci estar ms fuertemente relacionado con aplicacin de lodoaerobio, principalmente en aquellas tratadas con mayores dosis y ese patrn fueobservado hasta el ltimo muestreo en junio de 2009 (T6).

    SABOURAUD CLORANFENICOL (x106 CFU g-1 suelo)MUESTRA T0 T2 T3 T4 T5 T6

    SOIL 0,56 (0,08) 5,26 (2,30) 3,11 (0,23) 2,53 (0,46) 1,97 (0,16) 3,80 (1,35)AE40 0,69 (0,14) 4,60 (0,94) 3,12 (0,27) 1,80 (0,30) 2,17 (1,61) 2,83 (1,22)AE80 0,62 (0,25) 11,50 (1,87) 19,90 (6,92) 3,93 (0,87) 4,12 (2,64) 22,50 (4,30)

    AE160 0,79 (0,05) 9,37 (1,06) 27,60 (3,76) 49,10 (16,90) 22,10 (8,13) 26,40 (7,06)ANAE40 1,09 (0,44) 3,65 (0,93) 1,91 (0,15) 2,02 (0,60) 1,91 (0,57) 2,35 (0,43)ANAE80 0,43 (0,02) 3,24 (0,55) 7,41 (3,05) 1,33 (0,23) 3,42 (1,04) 20,60 (7,09)

    ANAE160 0,80 (0,20) 5,26 (0,47) 7,10 (5,48) 9,57 (2,19) 4,26 (0,23) 14,60 (3,71)

    Tabla 10. Hongos (Sabouraud Cloranfenicol). Se indica la media y entre parntesis ladesviacin estndar. Datos representados grficamente en la Figura 15. No se

    realizaron recuentos de hongos en octubre de 2007 T1.

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    68/267

    51

    Figura 11. Microorganismos oligotrficos.El recuento se realiz 7 das despus de lasiembra en medio R2A. Se representa lamedia junto con su error estndar (SEM)en escala logartmica. La nomenclatura sedescribe en la Figura 9.ns, no significativoa p 0,05.

    R2A T0

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011

    ns

    CFUg-1s

    oil

    R2A T1

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011

    aa

    b

    d

    aab

    c

    CFUg-1s

    oil

    R2A T2

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011

    a

    ab bcab

    ab

    abc

    ac

    CFUg-1s

    oil

    R2A T3

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011

    aab b

    c

    ab ab

    c

    CFUg-1s

    oil

    R2A T4

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011

    a

    abab

    cb

    a

    ab

    CFUg-1s

    oil

    R2A T5

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011

    a

    ab abb b ab ab

    CFUg-1s

    oil

    R2A T6

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE40

    ANAE80

    ANAE160

    108

    109

    1010

    1011

    a aab

    cb

    cb

    CFUg-1s

    oil

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    69/267

    52

    Figura 12. Microorganismos oligotrficos.

    El recuento se realiz 7 das despus de lasiembra en medio Extracto de TierraDiluido (ETD). Se representa la media

    junto con su error estndar (SEM) enescala logartmica. La nomenclatura sedescribe en la Figura 9.

    ETD T0

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011

    aab b a

    c

    dc

    CFU

    g-1s

    oil

    ETD T1

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011

    a

    bc b

    d

    cbc

    e

    CFUg-1s

    oil

    ETD T2

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011

    a b c c a b

    d

    CFUg

    -1s

    oil

    ETD T3

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011

    ac c

    d

    c b

    d

    CFUg

    -1s

    oil

    ETD T4

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011

    d

    ab a

    c

    b a

    c

    CFUg-1soil

    ETD T5

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011

    cab

    a

    bc

    aab abc

    CFUg-1soil

    ETD T6

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011

    abc

    bcabc

    bcbc

    d

    CFUg-1s

    oil

  • 7/22/2019 Anlisis microbiolgico de un suelo agrcola mediterrneo tras la aplicacin de lodos de depuradora urbana

    70/267

    53

    Figura 13. Microorganismos copiotrficos.El recuento se realiz 7 das despus de lasiembra en medio Agar Actinomicetos. Serepresenta la media junto con su errorestndar (SEM) en escala logartmica. Lanomenclatura se describe en la Figura 9.

    AGAR ACTINOMICETOS T0

    SOIL

    AE4

    0

    AE8

    0

    AE1

    60

    ANAE4

    0

    ANAE8

    0

    ANAE1

    60

    108

    109

    1010

    1011ns

    CFUg-1s

    oil

    A