Anàlisi de taules amb SPSS

Dissenys de cohorts: RR Dissenys de casos y controls: OR Mesures de concordança Mesures de correlació Mesures d’associació Anàlisi de taules grans

Introducció de taules en SPSS

Tabla de contingencia Risc * Malaltia

Recuento

23 12 35

16 33 49

39 45 84

Exposat

No exposat

Risc

Total

Malalts Sans

Malaltia

Total

En un estudi de cohorts es disposa dels següents resultats:

• Com s’introdueixen en SPSS?• Com es pot obtenir una estimació del risc relatiu?

Introducció de taules en SPSS

• Definició de les files (Risc) i les columnes (Malaltia).• Poseu els decimals a 0.

Definiu etiquetes de valorP.e. a la variable Risc

1: Exposat2: No exposat

Introducció de taules en SPSS

Introducció de dades

Introducció de taules en SPSS

Cal indicar que cada cas representa un conjunt d’observacions:Datos > Ponderar casos

Introducció de taules en SPSS

Obtenció de la taula de contingènciaAnalizar > Estadisticos descriptivos > Tabla de contingencia

Situar la variable que conté els grups de risc a les files i la variable que conté informació sobre la malaltia en les columnes.

Tabla de contingencia Risc * Malaltia

Recuento

23 12 35

16 33 49

39 45 84

Exposat

No exposat

Risc

Total

Malalts Sans

Malaltia

Total

Introducció de taules en SPSS

Obtenció de les proporcionsAnalizar > Estadisticos descriptivos > Tabla de contingencia

Opció Casillas

Marqueu els percentatges de files (Proporció de malalts per cada grup de risc)

Taula 2x2Disseny de cohorts

Tabla de contingencia Risc * Malaltia

23 12 35

65,7% 34,3% 100,0%

16 33 49

32,7% 67,3% 100,0%

39 45 84

46,4% 53,6% 100,0%

Recuento

% de Risc

Recuento

% de Risc

Recuento

% de Risc

Exposat

No exposat

Risc

Total

Malalts Sans

Malaltia

Total

013.2327.0

657.0

327.0)|(

657.0)|(

RR

RMP

RMP

Taula 2x2Disseny de cohorts: Estimació del RR

Analizar > Estadisticos descriptivos > Tabla de contingenciaOpció Estadísticos

Estimación de riesgo

3,953 1,578 9,905

2,013 1,260 3,213

,509 ,309 ,838

84

Razón de las ventajas para Risc (Exposat / No exposat)

Para la cohorte Malaltia = Malalts

Para la cohorte Malaltia = Sans

N de casos válidos

Valor Inferior Superior

Intervalo de confianzaal 95%

013.2327.0

657.0

327.0)|(

657.0)|(

RR

RMP

RMP

Taula 2x2Disseny de cohorts: Estimació del RR

Estimación de riesgo

3,953 1,578 9,905

2,013 1,260 3,213

,509 ,309 ,838

84

Razón de las ventajas para Risc (Exposat / No exposat)

Para la cohorte Malaltia = Malalts

Para la cohorte Malaltia = Sans

N de casos válidos

Valor Inferior Superior

Intervalo de confianzaal 95%

RR: 2.013 (IC 95% 1.26, 3.21)

Amb una confiança del 95%, el RR podem afirmar que l’exposició al factor de risc fa augmentar entre 1.26 i 3.21 cops la probabilitat de desenvolupar la malaltia

Taula 2x2Disseny de cohorts: Estimació del RR

Tabla de contingencia Risc * Malaltia

2 123 125

1,6% 98,4% 100,0%

1 133 134

,7% 99,3% 100,0%

3 256 259

1,2% 98,8% 100,0%

Recuento

% de Risc

Recuento

% de Risc

Recuento

% de Risc

Exposat

No exposat

Risc

Total

Malalts Sans

Malaltia

Total

Estimación de riesgo

2,163 ,194 24,149

2,144 ,197 23,353

,991 ,965 1,018

259

Razón de las ventajas para Risc (Exposat / No exposat)

Para la cohorte Malaltia = Malalts

Para la cohorte Malaltia = Sans

N de casos válidos

Valor Inferior Superior

Intervalo de confianzaal 95%

Intervals de confiança molt amplis indiquen que cal augmentar la mida de la mostra

Taula 2x2Disseny de cohorts: Prova de Chi-quadrat

Analizar > Estadisticos descriptivos > Tabla de contingenciaOpció Estadísticos

Pruebas de chi-cuadrado

,412b 1 ,521

,004 1 ,952

,418 1 ,518

,611 ,474

,410 1 ,522

259

Chi-cuadrado de Pearson

Corrección por continuidada

Razón de verosimilitudes

Estadístico exacto de Fisher

Asociación lineal por lineal

N de casos válidos

Valor glSig. asintótica

(bilateral)Sig. exacta(bilateral)

Sig. exacta(unilateral)

Calculado sólo para una tabla de 2x2.a.

2 casillas (50,0%) tienen una frecuencia esperada inferior a 5. La frecuencia mínima esperada es 1,45.b.

Podem acceptar que les proporcions observades són iguals?

p=0.521

Pruebas de chi-cuadrado

,412b 1 ,521

,004 1 ,952

,418 1 ,518

,611 ,474

,410 1 ,522

259

Chi-cuadrado de Pearson

Corrección por continuidada

Razón de verosimilitudes

Estadístico exacto de Fisher

Asociación lineal por lineal

N de casos válidos

Valor glSig. asintótica

(bilateral)Sig. exacta(bilateral)

Sig. exacta(unilateral)

Calculado sólo para una tabla de 2x2.a.

2 casillas (50,0%) tienen una frecuencia esperada inferior a 5. La frecuencia mínima esperada es 1,45.b.

Grau de significació (p) : Mesura la probabilitat d’haver observat un resultat igual a que hem obtingut o més allunyat que el que hem obtingut respecte a la hipòtesi nul·la.

En aquest cas, mesura la probabilitat d’haver obtingut els percentatges discrepants que hem obtingut a la taula, o un resultat encara més discrepant (respecte a la hipòtesi que la probabilitat de malaltia fos igual independentment de l’exposició).

p=0.521, indica que el resultat no s’allunya significativament d’un resultat que es pugui esperar acceptant que la malaltia és independent de l’exposició

Pruebas de chi-cuadrado

,412b 1 ,521

,004 1 ,952

,418 1 ,518

,611 ,474

,410 1 ,522

259

Chi-cuadrado de Pearson

Corrección por continuidada

Razón de verosimilitudes

Estadístico exacto de Fisher

Asociación lineal por lineal

N de casos válidos

Valor glSig. asintótica

(bilateral)Sig. exacta(bilateral)

Sig. exacta(unilateral)

Calculado sólo para una tabla de 2x2.a.

2 casillas (50,0%) tienen una frecuencia esperada inferior a 5. La frecuencia mínima esperada es 1,45.b.

Tabla de contingencia Risc * Malaltia

2 123 125

1,6% 98,4% 100,0%

1 133 134

,7% 99,3% 100,0%

3 256 259

1,2% 98,8% 100,0%

Recuento

% de Risc

Recuento

% de Risc

Recuento

% de Risc

Exposat

No exposat

Risc

Total

Malalts Sans

Malaltia

Total

Estimación de riesgo

2,163 ,194 24,149

2,144 ,197 23,353

,991 ,965 1,018

259

Razón de las ventajas para Risc (Exposat / No exposat)

Para la cohorte Malaltia = Malalts

Para la cohorte Malaltia = Sans

N de casos válidos

Valor Inferior Superior

Intervalo de confianzaal 95%

NS

Inclou el 1

IC i prova Chi-quadratDos aspectes del mateix problema

Disseny de cohorts

Tabla de contingencia Risc * Malaltia

33 12 45

68,8% 20,3% 42,1%

15 47 62

31,3% 79,7% 57,9%

48 59 107

100,0% 100,0% 100,0%

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Exposat

No exposat

Risc

Total

Casos Controls

Malaltia

Total

Disseny de cohorts: OR

Tabla de contingencia Risc * Malaltia

33 12 45

68,8% 20,3% 42,1%

15 47 62

31,3% 79,7% 57,9%

48 59 107

100,0% 100,0% 100,0%

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Exposat

No exposat

Risc

Total

Casos Controls

Malaltia

Total

Estimación de riesgo

8,617 3,574 20,773

3,031 1,886 4,872

,352 ,212 ,583

107

Razón de las ventajas para Risc (Exposat / No exposat)

Para la cohorte Malaltia = Casos

Para la cohorte Malaltia = Controls

N de casos válidos

Valor Inferior Superior

Intervalo de confianzaal 95%

617.81215

4733

59/1248/15

59/4748/33

)|()|(

)|()|(

MRPMRP

MRPMRPOR

No inclou el 1

Disseny de cohorts: OR

Tabla de contingencia Risc * Malaltia

33 12 45

68,8% 20,3% 42,1%

15 47 62

31,3% 79,7% 57,9%

48 59 107

100,0% 100,0% 100,0%

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Exposat

No exposat

Risc

Total

Casos Controls

Malaltia

Total

Estimación de riesgo

8,617 3,574 20,773

3,031 1,886 4,872

,352 ,212 ,583

107

Razón de las ventajas para Risc (Exposat / No exposat)

Para la cohorte Malaltia = Casos

Para la cohorte Malaltia = Controls

N de casos válidos

Valor Inferior Superior

Intervalo de confianzaal 95%

No inclou el 1

Pruebas de chi-cuadrado

25,454b 1 ,000

23,506 1 ,000

26,399 1 ,000

,000 ,000

25,216 1 ,000

107

Chi-cuadrado de Pearson

Corrección por continuidada

Razón de verosimilitudes

Estadístico exacto de Fisher

Asociación lineal por lineal

N de casos válidos

Valor glSig. asintótica

(bilateral)Sig. exacta(bilateral)

Sig. exacta(unilateral)

Calculado sólo para una tabla de 2x2.a.

0 casillas (,0%) tienen una frecuencia esperada inferior a 5. La frecuencia mínima esperada es 20,19.b.

S: p<0.05

OR ajustats

Tabla de contingencia Risc * Malaltia * Genere

33 12 45

68,8% 20,3% 42,1%

15 47 62

31,3% 79,7% 57,9%

48 59 107

100,0% 100,0% 100,0%

23 12 35

53,5% 20,3% 34,3%

20 47 67

46,5% 79,7% 65,7%

43 59 102

100,0% 100,0% 100,0%

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Exposat

No exposat

Risc

Total

Exposat

No exposat

Risc

Total

GenereHomes

Dones

Casos Controls

Malaltia

Total

OR ajustatsTabla de contingencia Risc * Malaltia * Genere

33 12 45

68,8% 20,3% 42,1%

15 47 62

31,3% 79,7% 57,9%

48 59 107

100,0% 100,0% 100,0%

23 12 35

53,5% 20,3% 34,3%

20 47 67

46,5% 79,7% 65,7%

43 59 102

100,0% 100,0% 100,0%

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Recuento

% de Malaltia

Exposat

No exposat

Risc

Total

Exposat

No exposat

Risc

Total

GenereHomes

Dones

Casos Controls

Malaltia

Total

Estimación de riesgo

8,617 3,574 20,773

3,031 1,886 4,872

,352 ,212 ,583

107

4,504 1,883 10,776

2,201 1,420 3,412

,489 ,301 ,793

102

Razón de las ventajas para Risc (Exposat / No exposat)

Para la cohorte Malaltia = Casos

Para la cohorte Malaltia = Controls

N de casos válidos

Razón de las ventajas para Risc (Exposat / No exposat)

Para la cohorte Malaltia = Casos

Para la cohorte Malaltia = Controls

N de casos válidos

GenereHomes

Dones

Valor Inferior Superior

Intervalo de confianzaal 95%

OR ajustat per gènere

Estimación de riesgo

8,617 3,574 20,773

3,031 1,886 4,872

,352 ,212 ,583

107

4,504 1,883 10,776

2,201 1,420 3,412

,489 ,301 ,793

102

Razón de las ventajas para Risc (Exposat / No exposat)

Para la cohorte Malaltia = Casos

Para la cohorte Malaltia = Controls

N de casos válidos

Razón de las ventajas para Risc (Exposat / No exposat)

Para la cohorte Malaltia = Casos

Para la cohorte Malaltia = Controls

N de casos válidos

GenereHomes

Dones

Valor Inferior Superior

Intervalo de confianzaal 95%

Estimación de la razón de las ventajas común de Mantel-Haenszel

6,219

1,828

,314

,000

3,359

11,513

1,212

2,443

Estimación

ln(estimación)

Error típ. de ln(estimación)

Sig. asintótica (bilateral)

Límite inferior

Límite superior

Razón de ventajascomún

Límite inferior

Límite superior

ln(Razón de ventajascomún)

Intervalo de confianzaasintótico al 95%

La estimación de la razón de las ventajas común de Mantel-Haenszel se distribuye demanera asintóticamente normal bajo el supuesto de razón de las ventajas común igual a1,000. Lo mismo ocurre con el log natural de la estimación.

Pruebas de homogeneidad de la razón de las ventajas

1,056 1 ,304

1,054 1 ,304

Breslow-Day

De Tarone

Chi-cuadrado glSig. asintótica

(bilateral)Homes i dones presenten un OR similar (p>0.05)

Estimació de l’OR ajustat per gènere

Mesures de concordança

Es disposa de dades de diferents observadors sobre els mateixos subjectes.

Volem avaluar si hi ha concordança. Kappa:

1 si la concordança és perfecte 0 si no hi ha concordança

Exemple

Tabla de contingencia Obs1 * Obs2

23 6 29

37,7% 9,8% 47,5%

7 25 32

11,5% 41,0% 52,5%

30 31 61

49,2% 50,8% 100,0%

Recuento

% del total

Recuento

% del total

Recuento

% del total

(+)

(-)

Obs1

Total

(+) (-)

Obs2

Total

Medidas simétricas

,573 ,105 4,481 ,000

61

KappaMedida de acuerdo

N de casos válidos

ValorError típ.

asint.a

T aproximadab

Sig.aproximada

Asumiendo la hipótesis alternativa.a.

Empleando el error típico asintótico basado en la hipótesis nula.b.

El coeficient kappa mesura el grau d’acord. La significació de p indica que els resultats no són compatibles amb un valor de kappa=0

p<0.05 indica concordança entre els resultats (millor com més s’apropi kappa al valor 1)

Exemple

Tabla de contingencia Obs1 * Obs2

23 6 29

30,3% 7,9% 38,2%

35 12 47

46,1% 15,8% 61,8%

58 18 76

76,3% 23,7% 100,0%

Recuento

% del total

Recuento

% del total

Recuento

% del total

(+)

(-)

Obs1

Total

(+) (-)

Obs2

Total

Medidas simétricas

,041 ,083 ,482 ,630

76

KappaMedida de acuerdo

N de casos válidos

ValorError típ.

asint.a

T aproximadab

Sig.aproximada

Asumiendo la hipótesis alternativa.a.

Empleando el error típico asintótico basado en la hipótesis nula.b.

p>0.05 indica que els resultats no són concordants (podem admetre kappa = 0)

Mesures de correlació

Tabla de contingencia Dosi * Resposta

23 12 5 40

57,5% 30,0% 12,5% 100,0%

12 33 12 57

21,1% 57,9% 21,1% 100,0%

5 12 34 51

9,8% 23,5% 66,7% 100,0%

40 57 51 148

27,0% 38,5% 34,5% 100,0%

Recuento

% de Dosi

Recuento

% de Dosi

Recuento

% de Dosi

Recuento

% de Dosi

D1

D2

D3

Dosi

Total

+ ++ +++

Resposta

Total

Pruebas de chi-cuadrado

53,302a 4 ,000

50,581 4 ,000

38,550 1 ,000

148

Chi-cuadrado de Pearson

Razón de verosimilitudes

Asociación lineal por lineal

N de casos válidos

Valor glSig. asintótica

(bilateral)

0 casillas (,0%) tienen una frecuencia esperada inferior a 5. Lafrecuencia mínima esperada es 10,81.

a.

Una p<0.05 el la prova Chi-quadrat indica diferències en les proporcions de resposta per dosi.

Hi ha correlació entre la dosi i la resposta?

Mesures de correlació

Tabla de contingencia Dosi * Resposta

23 12 5 40

57,5% 30,0% 12,5% 100,0%

12 33 12 57

21,1% 57,9% 21,1% 100,0%

5 12 34 51

9,8% 23,5% 66,7% 100,0%

40 57 51 148

27,0% 38,5% 34,5% 100,0%

Recuento

% de Dosi

Recuento

% de Dosi

Recuento

% de Dosi

Recuento

% de Dosi

D1

D2

D3

Dosi

Total

+ ++ +++

Resposta

Total

Coeficient de correlació de Spearman.

Un valor de p<0.05 indica correlació

La correlació perfecta correspon a un valor 1. El valor 0 indica resultats no correlacionats

Medidas simétricas

,512 ,069 7,204 ,000c

,514 ,069 7,247 ,000c

148

R de PearsonIntervalo por intervalo

Correlación de SpearmanOrdinal por ordinal

N de casos válidos

ValorError típ.

asint.a

T aproximadab

Sig.aproximada

Asumiendo la hipótesis alternativa.a.

Empleando el error típico asintótico basado en la hipótesis nula.b.

Basada en la aproximación normal.c.

Mesures de correlació

Medidas simétricas

,512 ,069 7,204 ,000c

,514 ,069 7,247 ,000c

148

R de PearsonIntervalo por intervalo

Correlación de SpearmanOrdinal por ordinal

N de casos válidos

ValorError típ.

asint.a

T aproximadab

Sig.aproximada

Asumiendo la hipótesis alternativa.a.

Empleando el error típico asintótico basado en la hipótesis nula.b.

Basada en la aproximación normal.c.

Tabla de contingencia Dosi * Resposta

23 12 5 40

57,5% 30,0% 12,5% 100,0%

5,1 -1,3 -3,4

12 33 12 57

21,1% 57,9% 21,1% 100,0%

-1,3 3,8 -2,7

5 12 34 51

9,8% 23,5% 66,7% 100,0%

-3,4 -2,7 6,0

40 57 51 148

27,0% 38,5% 34,5% 100,0%

Recuento

% de Dosi

Residuos corregidos

Recuento

% de Dosi

Residuos corregidos

Recuento

% de Dosi

Residuos corregidos

Recuento

% de Dosi

D1

D2

D3

Dosi

Total

+ ++ +++

Resposta

Total

El residuals tipificats corregits permeten identificar en quines caselles hi ha una variació significativa (amunt si són positius i avall si són negatius) del percentatge. Valors absoluts més grans que 2 indiquen una diferència significativa.

Un exemple de resultats que no correlacionen amb la dosi

Tabla de contingencia Dosi * Resposta

23 12 5 40

57,5% 30,0% 12,5% 100,0%

,2 -,3 ,1

25 18 5 48

52,1% 37,5% 10,4% 100,0%

-,6 1,0 -,5

43 22 10 75

57,3% 29,3% 13,3% 100,0%

,4 -,6 ,4

91 52 20 163

55,8% 31,9% 12,3% 100,0%

Recuento

% de Dosi

Residuos corregidos

Recuento

% de Dosi

Residuos corregidos

Recuento

% de Dosi

Residuos corregidos

Recuento

% de Dosi

D1

D2

D3

Dosi

Total

+ ++ +++

Resposta

Total

Medidas simétricas

,003 ,079 ,034 ,973c

-,004 ,079 -,053 ,958c

163

R de PearsonIntervalo por intervalo

Correlación de SpearmanOrdinal por ordinal

N de casos válidos

ValorError típ.

asint.a

T aproximadab

Sig.aproximada

Asumiendo la hipótesis alternativa.a.

Empleando el error típico asintótico basado en la hipótesis nula.b.

Basada en la aproximación normal.c.

Un valor de = -0.004 amb p>0.05 indica una correlació no significativa

El residuals ajustats no superen, en valor absolut, el valor 2.

Un exemple amb correlació negativa

Tabla de contingencia Dosi * Resposta

3 12 34 49

6,1% 24,5% 69,4% 100,0%

-5,7 -1,6 8,0

12 33 5 50

24,0% 66,0% 10,0% 100,0%

-2,7 6,0 -3,4

43 5 2 50

86,0% 10,0% 4,0% 100,0%

8,4 -4,3 -4,6

58 50 41 149

38,9% 33,6% 27,5% 100,0%

Recuento

% de Dosi

Residuos corregidos

Recuento

% de Dosi

Residuos corregidos

Recuento

% de Dosi

Residuos corregidos

Recuento

% de Dosi

D1

D2

D3

Dosi

Total

+ ++ +++

Resposta

Total

Medidas simétricas

-,733 ,050 -13,079 ,000c

-,735 ,050 -13,148 ,000c

149

R de PearsonIntervalo por intervalo

Correlación de SpearmanOrdinal por ordinal

N de casos válidos

ValorError típ.

asint.a

T aproximadab

Sig.aproximada

Asumiendo la hipótesis alternativa.a.

Empleando el error típico asintótico basado en la hipótesis nula.b.

Basada en la aproximación normal.c.

Un valor de r = -0.735 i p<0.05 indica una correlació significativa. En aquest cas a més dosi menys resposta (correlació negativa).

Els residuals ajustats permeten visualitzar aquesta tendència.