polimorfismo de adn[1]

Fernández Tesen Yuri

Guevara Linares Pamela

Rivas Marchán Yadira

OBJETIVOS GENERALES :

Identificación del polimorfismo del ADN

Identificación de sus causas y uso como medio de diagnostico

Reconocimiento de los diversos métodos de tinción para su reconocimiento

OBJETIVOS ESPECIFICOS:

Identificación del uso de polimorfismos en el uso de identificación paterna y su uso en la medicina forense

Reconocimiento de uso en el fármaco genético.

Alelo

Relación entre locus y alelo

Diferentes alelos en un gen

Relación entre locus y alelo

Para que un locus sea considerado polimórfico, el

alelo más común de ese locus debe aparecer con una

frecuencia poblacional menor del 99%. De acuerdo

con la ley de Hardy-Weinberg, al menos el 2% de la

población debe ser heterocigoto para ese locus (Hardy, 1908; Weinberg 1908).

Hace referencia a la existencia en una población de múltiples alelos de un gen.

Es una variación en la secuencia de un lugar determinado del ADN entre los individuos de una población.

La variación debe aparecer al menos en el 1% de la población.

Puede consistir en la sustitución de una simple base nitrogenada o puede ser más complicado como la repetición de una secuencia determinada de ADN, donde un porcentaje de individuos tenga un determinado número de copias de una determinada secuencia.

Polimorfismo

Características del polimorfismo

1. Polimorfismo de nucleótidos simple (SNP, Single

Nucleotide Polymorphism).

2. Polimorfismos en el número de repetición en tandem

(VNTRs, Variable Number Tandem Repetition).

Minisatélites

Microsatélites ó STRs (short tandem repeats)

(repeticiones cortas en tandem)

Son diferencias de un solo nucleótido o una base que aparecen en la secuencia del DNA entre individuos de una población.

Los SNP forman hasta el 90% de todas las variaciones genómicas humanas, y aparecen cada 1,300 bases en promedio, a lo largo del genoma humano.

Dos tercios de los SNP corresponden a la sustitución de una citosina (C) por una timina (T).

Debido a que los SNP no cambian mucho de una generación a otra, es sencillo seguir su evolución en estudios de poblaciones.

También se utilizan en algunos tipos de pruebas genéticas y su estudio es de gran utilidad para la investigación médica en el desarrollo de fármacos.

Polimorfismo de nucleótido único o SNP

Polimorfismo de nucleótido único o SNP

Si este cambio de nucleótido afecta el sitio de restricción de

una enzima estamos en presencia de los llamados polimorfismos de restricción ó RFLPs (restriction

fragment length polymorphisms) (polimorfismos de longitud de los fragmentos de restricción). Las secuencias de restricción presentan usualmente

patrones de distancia, longitud y disposición diferentes en el ADN de diferentes individuos de una población, por lo que se dice que la población es polimórfica para estos fragmentos de restricción.

Cuando el cambio de un nucleótido altera la diana para una

determinada enzima de restricción podemos detectar el polimorfismo en función de la variación que éste genera

en el patrón de restricción.

Polimorfismo de nucleótido único o SNP

VNTR minisatélites

VNTR microsatélites o STR

En ambos casos presentan un número variable de

repeticiones en tándem de una secuencia.

Polimorfismos de repetición ó VNTRs (variable number of tandem repeats)

- Los minisatélites son secuencias de ADN de unas pocas decenas

de nucleótidos repetidas en tandem.

- El número de dichas repeticiones puede variar de cromosoma a

cromosoma.

- Lasingularidad más especial de este tipo de polimorfismos radica

en que para cada locus pueden observarse muchas variantes

alélicas.

- No están distribuidos por todo el genoma y por lo tanto sólo pueden ser

utilizados en el diagnóstico de un número muy reducido de

enfermedades.

- Aplicación en la determinación de la paternidad y en los protocolos de identificación genética en el marco judicial.

Son por excelencia los polimorfismos utilizados en el diagnóstico

genético.

Corresponden a la repetición en tandem de secuencias de entre 2 y 5 nucleótidos.

Están distribuidos de forma casi homogénea por todo el genoma

Presentan un número elevado de variantes alélicas con frecuencias similares entre sí, de forma que la probabilidad de que un individuo sea heterocigota es muy elevada (presentan una alta heterocigosidad).

Los polimorfismos óptimos para la realización de estudios de

segregación serán los que se localicen dentro del gen de interés

(intragénicos), lo que sugiere que habrá “desequilibrio de

ligamiento” (estarán ligados) entre la secuencia polimórfica y la

enfermedad.

VNTRs microsatelites o STRs (short tandem repeats)

repeticiones cortas en tandem

las regiones repetitivas son variables entre las

muestras mientras las regiones flanqueantes son

aquellas donde los cebadores de la PCR se unen y son

constantes

7 repeticiones

8 repeticiones

AATG Homocigoto = 7 - 7

Heterocigoto = 7 - 8

Técnica que permite amplificar secuencias específicas de ADN multiplicando el número de copias que se pueden obtener en un fragmento de ADN.

Es una técnica empleada en neoplasias para detectar translocaciones cromosómicas observadas en el cariotipo y asociadas a un tipo de tumor , permitiendo la identificación de genes responsables

La técnica RFLP se usa como marcador para identificar grupos particulares de personas con riesgo a contraer ciertas enfermedades genéticas, en ciencia forense, en pruebas de paternidad y en otros campos, ya que puede mostrar la relación genética entre individuos.

Si un alelo contiene un punto de reconocimiento para una enzima de restricción mientras que otro no, la digestión de los dos alelos genera fragmentos de diferente longitud.

Marcadores en el mapeo de genes

Diagnóstico presintomático y prenatal de enfermedades

hereditarias

Detección de heterocigotos de riesgo

Pruebas de paternidad

Medicina forense

Aplicaciones del

Polimorfismo

•En Antropología Molecular: son indicadores estables de

la historia humana desde el punto de vista evolutivo.

•En Genética Forense: para la identificación individual

humana en casos de filiación, delitos sexuales,

identificación de restos, entre otros.

En Genética Poblacional: para establecer la biodiversidad

de la población , así como la diferenciación entre grupos

y subgrupos étnicos.

Fármaco genética

Fármaco genética conceptos

En un estudio de prueba directa, el supuesto SNP responsable de una enfermedad es genotipificado directamente. El reto de este tipo de estudios es predecir o determinar a priori cuáles SNP’s son los responsables del fenotipo de interés.

Los estudios indirectos de asociación genética

se basan en un análisis de ligamiento genético el cual utiliza “marcadores neutrales”, y no hace predicciones sobre la localización del gen responsable de la enfermedad en estudio.

A partir de las pruebas indirectas existen dos estrategias que han sido utilizadas para identificar los genes y los polimorfismos que están implicados con el desarrollo de ciertas enfermedades: el análisis de ligamiento y estudios de asociación de genes candidatos.

El análisis de ligamiento requiere el reclutamiento de familias afectadas, mientras que el estudio de genes candidatos es probado por estudios de asociación de sujetos no relacionados.

El análisis de ligamiento o escaneo genómico es un método en el cual se hace una búsqueda aleatoria en el genoma para tratar de encontrar los genes asociados a una enfermedad. Requiere cuando menos dos generaciones de las familias afectadas.

En los estudios de asociación genética se buscan polimorfismos individuales de genes implicados en la patogénesis de la enfermedad y, así, determinar si existe algún tipo de relación con ella, para lo que primero se deben identificar genes candidatos que se crea o se sepa son importantes en la patogénesis de una condición.

Los genes relacionados con receptores para los

neurotransmisores presentan 6 polimorfismos

Los polimorfismos ha supuesto un avance muy

importante para el fármaco genético

El polimorfismo de un solo nucleótido por su alta

frecuencia en el genoma humano como por no estar

relacionado a genotipos de enfermedades es fisiológico.