localización de información científica iv simposio de cardiología del litoral federación...

Localización de Información Científica

IV Simposio de Cardiología del LitoralFederación Argentina de Cardiología

Rafaela, Santa Fe, Argentina, 20 y 21 noviembre de 2003

Prof. Dr. Armando PacherBioingeniería - Universidad Nacional de Entre Ríos

CETIFAC – Centro de Teleinformática de la FAC

•Localización de información científica

•Dónde buscar la información

•Estrategias y tácticas de búsqueda: (AND OR NOT, etc.)

•Utilización de PubMed – Medline y sus herramientas

•La charla de esta mañana puede continuar en forma virtual y permanente en el Foro de Informática en Cardiología:

• cursofac@fac.org.ar

• El material que se proyectará estará en la Web en:

• www.fac.org.ar/fec/cursofac/simlit03

Localización de la información científica

Tipos de información Documentos, imágenes, trabajos científicos

Al ser “no controlada”, Internet tiene contenidos que representan un libre muestrario de la Humanidad: es necesario filtrar para “separar la paja del trigo”

¿Dónde se encuentra la información “filtrada”? En sitios de instituciones académicas y científicas y

bibliotecas: en general se los identifica pues sus direcciones

tienen las extensiones

.edu - .org - .gov *

Localización de la información científica

Se localiza información a través de la Web: accediendo a sitios institucionales y bibliotecas con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline accediendo a Bireme-Lilacs

La información institucional se encuentra “a dos clicks” *

1er click

2do click

Sitios institucionales

A “una distancia de dos clicks”

Sitios institucionales

2do clickSitios institucionales

Organizaciones internacionales “a dos clicks”

Sitios institucionales

Múltiples instituciones “a dos clicks”

Universidades “a dos clicks”

Sitios institucionales

Certificación de ética y calidad en la información científica

Sitios institucionales

Sitios institucionales: Ateneos

Acceso y búsqueda de información en la Web

Se localiza información:

En la Web: accediendo a sitios institucionales con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline *

Buscadores o Searchers

Google Copernic Yahoo! Webcrawler Metacrawler Lycos Excite Infoseek HotBot otros (Magellan, EuroSeek, Altavista, Fast Search, Direct

Hit, YellowPages, Albert, etc., etc. etc.) Información no “filtrada” salvo la de instituciones

científicas y académicas.

Utilizar uno o a lo sumo dos y aprender a fondo sus funcionamientos

(cada uno tiene sus propias reglas)

Buscadores o Searchers

Supongamos una búsqueda de un temade actualidad, como “apoptosis”,

utilizando como buscador a Google

?210.000 citas

Es imprescindible limitar las búsquedas en la Web

Utilización de operadores lógicos

AND

OR

NOT

Recordar la Teoría de ConjuntosConjunto A y Conjunto B

Intersección - Unión - Diferencia

Operador AND (= Y)

A Y Barrhythmia AND ventricular

material que incluya arritmia y ventricular

Limitar las búsquedas en la Web

Intersección

Operador OR (= O)

A OR Barrhythmia OR ventricular

material que incluya o arritmia o ventricular

Limitar las búsquedas en la Web

Unión

Operador NOT ( = NO)

A NOT Barrhythmia NOT ventricular

trabajos que incluyan arritmia pero no ventricular

Limitar las búsquedas en la Web

Diferencia

Operadores AND OR NOT

arrhythmia AND ventricular:

encuentra trabajos de arritmia ventricular

arrhythmia OR ventricular:

encuentra tanto trabajos de arritmia como trabajos que tengan la palabra ventricular

arrhythmia NOT ventricular:

encuentra trabajos de arritmia no ventricular *

Operadores AND OR NOT: combinaciones

arrhythmia AND ventricular NOT ischemia:

encuentra trabajos de arritmia ventricular sin isquemia

arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT ischemia:

encuentra trabajos de tratamiento de arritmia ventricular sin isquemia

arrhythmia AND ventricular NOT sustained AND treatment NOT ischemia :

encuentra trabajos de tratamiento de arritmia ventricular no sostenida sin isquemia *

AND

OR

NOT

167 citas

Limitar las búsquedas en la Web

Equivalencias:

AND = +

OR = ^

NOT = -

Inclusión de frases:

"radiation induced apoptosis”

"human lymphocytes”

Estudiar los comandos de cada Searcher:

? * “” , <frase> () <NEAR> <NEAR/N> etc., etc.

64 citas

Copiado (download) de la información

Mediante el browser, desde el sitio donde se localizó el o los archivos: definir bien la ubicación, para su localizacion posterior

Se disminuye el tiempo de copiado mediante programas específicos:

www.gozilla.com - www.getright.com - www.speedbit.com

Guardar direcciones de sitios de interéslocalizados en la Web

Favoritos - Bookmarks

Los favoritos se pueden copiar en diskettes, enviar por email, etc.

Acceso y búsqueda de información en la Web

Se va de un sitio a otro (“se navega”) mediante programas denominados Navegadores o Browsers

Se localiza información:

En la Web accediendo a sitios institucionales con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline accediendo a BIREME-LILACS *

Medline

Base de datos bibliográfica de la National Library of Medicine - NLM

abarca los campos de medicina, enfermería, odontología, veterinaria, salud pública y ciencias preclínicas o básicas.

contiene citas bibliográficas y resúmenes de aproximadamente 4300 publicaciones biomédicas sumando más de 10 millones de citas desde 1966.

se actualiza mensualmente

es gratuita

PubMed ofrece acceso a dos bases de datos: MEDLINE y PREMEDLINE (datos aún no indexados en MEDLINE)

PubMed se actualiza semanalmente. *

PubMed (Medline)

Búsquedas simples con o sin operadores AND OR NOT

Utilización de “Limits” acotación de los resultados

Journal Browser para hojear revistas

Citation Matcher ubica trabajos conocidos

MeSH Browser búsquedas avanzadas

Clinical Queries mediante categorías (therapy, diagnosis, etiology,

prognosis) y elección de sensibilidad y especificidad.

Cubby almacenamiento y actualización de búsquedas *

arrhythmia

Búsqueda simple: arrhythmia

Arrhythmia: 101.249 citas

Utilización de operadores

AND OR NOT

Arrhythmia AND ventricular: 36.674 citas

Arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT sustained: 15.608

Arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT sustained AND 2001: 1074

Utilización de “Limits”

campo de búsqueda (título, autor, etc.) grupo etario sexo humano o animal idioma disponibilidad de abstracts fechas de publicación o de indexación tipo de publicación (ensayo clínico [clinical trial],

editorial, etc.) Nota: la mayoría descartan PREMEDLINE

Agregando “Limits”

Resultado con “Limits”: 31 citas

Id. anterior, trabajos sólo de 2001: 7 citas

Traducción: buscar ensayos clínicos que tengan abstracs, publicados en 2001, sobre tratamiento en adultos de arritmia ventricular no sostenida.

Journal Browser

Herramienta para hojear publicaciones

Se ingresa el nombre de la publicación, o la abreviatura correspondiente de MEDLINE o el identificador ISSN.

Mediante “Limits” se elige el ejemplar buscado

Ingreso del nombre de la publicación

Codificación de la publicación

Acceso a la totalidad de lo publicado: 17.965 citas

Utilización de Limits: fecha de publicación

Utilización de Limits: fecha de publicación: 55 citas

Citation Matcher

Herramienta para buscar artículos cuando se dispone de la cita

Se ingresan los datos conocidos en los diferentes campos *

Cuando se conoce la cita bibliográfica

Cuando se conoce la cita bibliográfica

Obtención directa cuando se conoce la cita bibliográfica

Abstract del artículo

MeSH Browser - Encabezados de Temas Médicos

Herramienta de mayor complejidad y eficacia: aplica la lógica que utilizan los bibliotecarios.

Cada cita en la sección de MEDLINE en la base de datos de PubMed es indexada con los Medical Subject Headings (o MeSH) que describen el tema contenido en el artículo.

El MeSH Browser permite la búsqueda de citas por términos MeSH.

Los términos MeSH se dividen en

encabezados

subencabezados *

MeSH Browser (actualmente Mesh Database)

Buscar el término MeSH

Muestra los términos que tiene indexados

Verificar el árbol y agregarlo (“Add”) a la búsqueda

Buscar subencabezados o subtérminos MeSH

Incluir subtérminos MeSH, de a uno por vez

Realizar la búsqueda en PubMed

Incluir límites si son necesarios

Verificar el esquema MeSH utilizado (Details)

Opción de guardar la búsqueda MeSH

Guardado de la búsqueda como “Favoritos” o “Bookmarks”

Ej.: Inmunología en la Enfermedad de Chagas congénita

Optar por "MeSH Browser“(actualmente Mesh Database)

Escribir en "Search for:" el término a buscar (Chagas) y hacer clic en "Go"

Elegir en el listado el término MeSH más adecuado (Chagas Disease) y hacer clic en "Browse this term"

Aparece un árbol de categorías MeSH relacionadas con el término a buscar.

Hacer clic en "Add this term to the Search using operator: AND"

Aparece en la nueva ventana "Chagas Disease"[MESH]

Hacer clic en "Detailed display" y agregar, de a uno por vez, los términos/subtítulos MeSH necesarios para acotar la búsqueda

Hacer clic en "PubMed Search"

Si es necesario, incluir "Limits”y/o “Add Terms”

Búsqueda compleja

Búsqueda compleja, que localiza un solo artículo

Traducción de una búsqueda compleja

((((((Hypertension/drug therapy[MESH] AND Clinical Trial[ptyp]) AND English[Lang]) AND "adult"[MeSH Terms]) AND "human"[MeSH Terms]) AND ("2001/02/16 01.46"[EDat] : "2001/03/18 01.46"[EDat])) AND ("2001/02/16"[EDat] : "2001/03/17"[EDat]))

Esta sería la traducción aproximada:

"Buscar trabajos de marzo de 2001, sólo escritos en idioma inglés, que sean ensayos clínicos en humanos, mayores de 19 años, sobre el tema terapia con drogas de la hipertensión arterial”

Que es lo que le pediríamos a una bibliotecaria *

Clinical Queries Filtros de categorías, sensibilidad y especificidad

Cubby Almacenamiento y actualización de búsquedas

Filtros de categorías, de sensibilidad y de especificidad

Almacenamiento y actualización de búsquedas

PubMed (Medline)

Técnicas: Búsquedas simples Utilización de “Limits” Journal Browser Citation Matcher MeSH Browser (actualmente MeSH Database) Clinical Queries Cubby

El material de texto completo (full text) puede ser obtenido en forma gratuita o bajo un arancel.

Esto es sólo la técnica para la búsqueda de información en Pubmed: hay que profundizar en la estrategia. *

Si hay dudas con la ortografía inglesa de los términos a buscar

www.hon.ch

Se escribe en castellano y se traducen los términos MeSH a inglés

Aparecen jerarquías, términos y subtérminos

Se eligen las opciones

Acceso y búsqueda de información en la Web

Se va de un sitio a otro (“se navega”) mediante programas denominados Navegadores o Browsers

Se localiza información:

En la Web accediendo a sitios institucionales con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline accediendo a BIREME-LILACS

Participando en mailing lists *

BIREME-LILACS: “Medline Latinoamericana”Herramientas similares a PubMed

Conceptos básicos finales (“para no marearse”)Dr. Alberto Vázquez, XX Congreso Nacional de Cardiología, Córdoba, 2001

Planificar una estrategia No sentarse a la PC sin un plan; escribir antes la búsqueda, que no deberá ser ni muy amplia ni muy acotada; abrir un solo frente por vez y agotarlo; si se encuentra un buen trabajo, detenerse y leerlo ...

al otro día se hará una mejor búsqueda; escribir todo en inglés (ayudarse con un buen diccionario

y/o con HonSelect).

No es difícil, pero hay que sumar “horas de silla”. *

www.fac.org.ar/ateneos/ateneo1/fig910.htm www.fac.org.ar/ateneos/ateneo1/atennecr.htm www.annals.org/issues/v134n12/toc.html www.fac.org.ar www.fac.org.ar/cvirtual/cvirteng/cienteng/mneng/

mnm3004i/dicarli/dicarli.htm www.acc.org www.asecho.org www.americanheart.org www.worldheart.org www.who.int www.who.int/regions/amro www.paho.org www.cochrane.org www.hon.ch www.hon.ch/MedHunt www.bireme.br/bvs/E/ehome.htm www.uba.ar www.un.edu.ar www.copernic.com www.google.com

www.sghms.ac.uk/depts/immunology/~dash/apoptosis

www.yahoo.com www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi world.altavista.com www.gozilla.com www.getright.com www.speedbit.com www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi cursofac@fac.org.ar www.fac.org.ar/fec/cursofac http://cardiofellows.mc.duke.edu http://dukecardiology.duke.edu/home.asp?divisionID=39 http://www.centerwatch.com/patient/studies/area1.html http://www.nhlbi.nih.gov/guidelines/hypertension/

jncintro.htm http://www.ccs.ca/society/conferences/index.cfm http://www.cardiology.med.ucla.edu/Cardiology/

home.htm http://www.mecme.org/ http://www.fac.org.ar/fec/cursofac/pubmed http://www.hon.ch/HONselect/index_sp.html http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/journals/

loftext_noprov.html

Material proyectado:• www.fac.org.ar/fec/cursofac/simlit03

Direcciones citadas en la exposición