althia. d. victor gonzález - jefe de proyectos
DESCRIPTION
D. Victor González - Jefe de ProyectosTRANSCRIPT
Víctor González RumayorJefe de Proyectos
Althia Health SL
FORO DE TRANSFERENCIA TECNOLÓGICA
BIOTRANSFER
Precise Pathology – Personalized Medicine
Granada, octubre 2014
INVESTIGACION EN DIAGNOSTICOINVESTIGACION EN DIAGNOSTICO
• Althia está dedicada a la investigación traslacional y al diagnóstico clínico del cáncer, lesiones pre-cancerosas y enfermedades inflamatorias.
• Soluciones para la investigación de la firma molecular especifica del tumor, estudios de diagnóstico no-invasivo (exosomas y CTC) y uso de técnicas moleculares que definan la mejor terapia
2
Medicina Personalizada
3
La transición de la Medicina Molecular a la Medicina Personalizada pasa por tener un conocimiento profundo de la biología de la
enfermedad y por la incorporación de nuevos retos y tecnologías
• Herramientas para la integración y consolidación de la información clínica
• Soluciones Bioinformáticas
Conveniencia
• Procesamiento automático de datos para diagnóstico y tratamiento
• Algoritmos de Inteligencia Artificial
Objetividad
• Abordaje multidisciplinar y multicéntrico de la oncología
• Redes Colaborativas de Especialistas
Universalidad
DATOS INFORMACION CONOCIMIENTO ACCIÓN
Proyectos en medicina personalizada
4
Mejor estratificación del paciente oncológico a terapias más específicas
Ayudar a la mejor selección de las técnicas de diagnóstico, reduciendo gastos al sistema
Organización estructurada de la información clínica y molecular
Generar modelos predictores de seguimiento y de tratamientos con la mejor elección de la terapéutica
INVESTIGADORES CLINICOS
INVESTIGADORES BASICOS
TECNICOS EN SISTEMAS
DE INFORMACION
ESPECIALISTAS EN MODELOS MATEMATICOS
PROYECTOS
TITLE PARTICIPANTS OBJECTIVES AND RESEARCH AREA PATENT SITUATION
GliomasALTHIA, IDIBELL
Patient stratification through the
applications of molecular and precise
pathology
FINAL REPORT USFINAL REPORT CANOFFICIAL ACTIONS EU
Lymphoma
(DLBCL)ALTHIA, H Clinic
Patient stratification through the
applications of molecular and precise
pathology
OFFICIAL WRITING PROPOSAL (WO)
TradionPALTHIA, INDRA
Lorgen
Prototype expert system for diagnosis
and personalized treatment in cancer
patients
UNDER DEVELOPMENT
Proyectos I+D
5
• ESTUDIO BASADO EN MEDICINA PERSONALIZADA
• MUESTRAS DE CÁNCER DE MAMA, COLORRECTAL Y PULMON
• DOS REGIMENES TERAPEUTICOS•QUIMIO & RADIOTERAPIA•TERAPIA BIOLOGICA
Base de datos
• 451 cáncer de mama (298 biopsias tumor)
• 330 cáncer Colorrectal (250 biopsias tumor)
• 150 cáncer pulmón
PROYECTO TRADIONP PROYECTO TRADIONP
Clínical Data,
Images... (+15,000)
Metilation(+400,000)
Genotyping(+200,000)
PROYECTO TRADIONP
� PROTOTIPO DE SISTEMA EXPERTO
� ALGORTIMOS DE COMBINACION E
INFORMACION
� BBDD CON DATOS CLINICOS Y
MOLECULARES ENTRELAZADOS
DatosInformes
mutaciones
marcadores
Terapias Imágenes
biopsias
pruebas
ESTUDIO RETROSPECTIVO
DATOS CLINICOS CLAVES
INFORMACION MOLECULAR
SELECCIÓN DE PACIENTES
DISEÑO DE ALGORITMOS
COMITÉ CIENTÍFICO
BASE DATOS MULTIMODAL
BBDDSDATOS CLINICOS >15,000
GENOTIPAJE (SNPs)
HISTOLOGIA PRECISA
FISH
MULTIPLEX
SECUENCIASGENES
METILACION
PROYECTO TRADIONPPROYECTO TRADIONP
9
08 Resultados
Muestra
Histología Funcional
Multiplex
FISH
ADN Firma molecular del tumor
Análisis histológico
Mutaciones de baja frecuencia en genes relevantes
Identificación de mutaciones puntuales en secuenciación
Presencia redundante de polimorfismos -SNPs
Posiciones hipo/hipermetiladas en el ADN tumoral
BBDD
Analíticas
10
SISTEMAEXPERTO
??
MINERIA DATOS
¿SURVIVAL?
¿RELAPSED?
¿2, 5, 10 YEARS?
DATOS CLINICOS
DATOSEXPERIMENTALES
HELP DESK
COMBINATORIAL DATA
PROYECTO TRADIONPPROYECTO TRADIONP
PTEN ProbeCEN10 Probe
PROYECTO GLIOMAS
PTEN MEASUREMENT BY FISH
• Cirugia• Radioterapia (RT)
− 3-4 w• Quimioterapia
− temozolomide (TMZ)
• Cirugia• Radioterapia (RT)
− 3-4 w• Quimioterapia
− temozolomide (TMZ)
SELECCIÓN DE PACIENTES QUE RESPONDEN AL FARMACO, Y DE PACIENTES QUE DEBEN USAR TERAPIAS ALTERNATIVAS
LA MEDICINA PERSONALIZADA NOS PERMITEN UNA MEJOR ESTRATIFICACION DE PACIENTES USANDO TÉCNICAS SIMPLES
− 230 pacientes astrocitoma (GBM, AA, y otros)
− Base de datos con informacion clinica & patologica
− IF (EGFR, PTEN, Ki67) + FISH (EGFR, PTEN)
− Supervivenvia & recidiva (estudio retrospectivo)
12
PROYECTO GLIOMAS
0 1000 2000 3000 4000
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
Days from surgery
Sur
viva
l
OTHER (n=25)AMP & LOH<0.4 (n=10)
p-value (log-rank): 0.001
AMP.LOH.combAA
0 500 1000 1500 2000
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
Days from surgery
Sur
viva
l
OTHER (n=73)AMP & LOH<0.4 (n=40)
p-value (log-rank): 0.002
AMP.LOH.combGBM
0 1000 2000 3000 4000
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
Days from surgery
Sur
viva
l
OTHER (n=98)AMP & LOH<0.4 (n=50)
p-value (log-rank): <0.001
AMP.LOH.combALL
PTEN/EGFR (FISH)
GBM/AA patientsEGFR AMP/HPPTEN LOH 10%
Diagnostico y pronostico integral para el Linfoma Difuso de Celulas B grandes(DLBCL) usando patología de precisión
Objetivos • Combinar técnicas de diagnostico IF Mplex y FISH para identificar un fenotipo sólido y asociado a la supervivencia
PROYECTO LINFOMA
235 pacientes diagnosticado y tratados de Diffuse large B cell lymphoma (DLBCL)
• Datos clínicos de 153 pacientes tratados con rituximab CHOP, y seguidos durante 3 años. Análisis con 26 variables
• 3 Hospitales
• VEGF y BCL6 son marcadores predictivos de respuesta a las terapias en uso (R-CHOP)
• CMYC, MUM1 y posiblemente CD68, pueden ser relevantes basados en el estado de la variable IPI (international prognostic index)
PROJECT LYMPHOMA
LA MEDICINA PERSONALIZADA NOS PERMITE ASOCIAR MARCADORES PARTICULARES A LA RESPUESTA ESPECIFICA DEL PACIENTE A LA TERAPIA EN USO.
PROYECTOS EN DESARROLLO
TITLE PARTICIPANTS OBJECTIVES AND RESEARCH AREASTART
ONCOEXPERTINDRA, ALTHIA,
LORGEN, MASTER, ERA7
System for better diagnosis and treatment
April 2013
ADELIS
ROVI, ALTHIA, VAXDYN BIOMEDAL BIONATURIS
Pharmacogenomics to aromatase inhibitor response in
breast cancer
April 2013
Prostate Predict
ALTHIA,
Amadix, H Clinic, H. Valld’Hebron, H 12Oct
Combination of protein markers and miRNA
October 2012
PRECISESADSPROG&SALUD
ALTHIA 22+ Tissue connective pathology Feb 2014
ANXARECUALTHIA, Vall
d´́́́Hebron, IRB Lleida, Formune
Anexine: predictor biomarker for recurrent endometrial cancer
iDOCTUSeDoctores,
ALTHIA, Blueliv
Plataforma ayuda deteccióntemparana enfermedades
infecciosas
R&D Translational Projects
15
Pacientes ProstatectomizadosBúsqueda de marcadores predictores microRNA+proteinas
PROYECTO PROSTATE PREDICTPROYECTO PROSTATE PREDICT
16
� Desarrollo de nuevos algoritmos de respuesta a recidivas. � Identificación de nuevos marcadores “in situ” utilizando patología de sistemas o precisa.� Modelos Predictivos que incluyan miRNA y proteínas de potencial interés.
STARTING Nov 2013--- FINISH 2015
Validación de Anexina 2 como biomarcador para recidiva decáncer de endometrio.
PROYECTO ANXARECUPROYECTO ANXARECU
17
� Validación proteica y transcriptómica (mRNA) en biopsia y aspirado. � Desarrollo de sistema predictivo no o mínimamente invasivo� Desarrollo de algoritmos de integración� Desarrollo de un dispositivo de microfluidica para aislamiento de CTCs y exosomas� Exploración del potencial de Anxa 2 como diana terapéutica
Sistema de detección temprana de enfermedades infecciosas.
PROYECTO iDOCTUSPROYECTO iDOCTUS
18
� Desarrollo de un modelo de análisis de datos microbiológicos basados en técnicas de Big Data� Basado en un sistema de geolocalización de eventos de diagnóstico de enfermedades infecciosas � Desarrollo de un nuevo sistema de recogida de datos basado en hacking ético� Sistema de ayuda a la toma de decisiones mediante aplicaciones móviles con información on-line/ of-line .
MOLECULAR RECLASSIFICATION TO FIND CLINICAL USEFUL BIOMARKERS FOR SYSTEMIC AUTOIMMUNE DISEASES.(lupus, artritis reumatoide, sindrome …etc)
PROYECTO PRECISESADS : IMI. EU-FP7PROYECTO PRECISESADS : IMI. EU-FP7
19
� Coordinador Marta Alarcón-Riquelme, Genyo Granada� 24 partners de 6 diferentes países Europeos y 14 Hospitales� Althia participa en “Tissue based taxonomy and exosomes”.
Nilo1 and Nilo2 antibodiesNilo1 and Nilo2 are hamster monoclonal antibodies directed against
cell surface mouse neural stem cells.
A: neuroblast
B: radial glia
GFAPSOX2 Vimentin
βIII Tub PSA-NCAM DCX
NILO1
NILO2
DCX, PSA-NCAM, MUSH1, NG2, Tuj1
Nestin, GFAP VimentinEGFRSox2
Neurosphere cell growth inhibition
13,5dembryo
Olfactory bulb
neurospheres (passage 5-6)
IP immunization
hamster
Balb/cmyelomaX63.Ag8
hamsterspleen cells X
HAT selection
Flow cytometer
Nilo1 identify human GBM-
derived neurosphere
s
Nilo2 as a marker of brain damage
• Nilo2 identify neuroblast cells in the brain niches. This cells could be followed inside the brain moving into damaged areas
TEM
Nilo1 a somatic stem biomarker
Nilo1+ cells
oligodendrocytes
astrocytes
neurons
NSCneurosphere
NSCNilo1+, Sox2+Neural tissue1
adipocyteschondriocytes
osteocytes
Early MSC progenitors
Nilo1+, Sox2+, CD29+, CD45-
mature MSC
Nilo1-, Sox2-, CD29+, CD45-
Bone marrow tissue
2
3 asymmetric division
Nilo1 labeled f=1/10
5
frac
tion
of n
on
resp
ondi
ng c
ultu
res 1
100 2000
0,1
Cells/well
4 Intestinal crypt
El futuro en I+D: áreas de interés
• Desarrollo de nuevos marcadores de diagnóstico
dirigidos a la medicina personalizada
• Combinación e integración de ómicas para el
desarrollo de algoritmos con capacidad predictiva
• Desarrollo de biosensores robustos que permitan la
automatización de procesos diagnósticos
• Aplicación de TIC al desarrollo de sistemas expertos
de soporte a la toma de decisiones
• Uso de marcadores de células stem somáticas en
diagnóstico y terapia23
El futuro en I+D
24
�Compartir información�Cooperar�Alianzas estratégicas
25
26
Projects granted by: