Nota técnica

Base de datos de casos sospechosos y positivos de COVID-19 en las 32 entidades federativas de México

Obtención, procesamiento, manejo y análisis estadístico de datos

Abril 15, 2020

Objetivo: Construir, describir y analizar la base de datos de casos sospechosos y positivos registrados por la Secretaría de Salud.

Medio de verificación: Comunicado Técnico Diario COVID-19 del 15 de abril de 2020, disponible en

https://www.gob.mx/cms/uploads/attachment/file/546843/Comunicado_Tecnico_Diario_COVID-19_2020.04.15.pdf

Capacidad, experiencia o habilidad a desarrollar, mejorar o practicar: Traslado de información en forma de listado en formato PDF a una base de datos en STATA.

Algunos usos potenciales de la base de datos:

i) Análisis estadístico univariado nacional y estatal con la variable número de casos. ii) Análisis estadístico bivariado nacional y estatal con las variables número de casos y sexo (dicotómica).iii) Análisis estadístico trivariado nacional y estatal con las variables número de casos, sexo (dicotómica) y tipo de diagnóstico

(dicotómica).iv) Combinar con otras variables en bases de datos agregadas a nivel estatal para realizar cruces múltiples de correlación, regresión,

análisis espacial, etc.

Procedimiento:

1) Descargamos las tablas de casos positivos y sospechosos del sitio oficial de la Secretaría de Salud que se encuentran en:

https://www.gob.mx/salud/documentos/coronavirus-covid-19-comunicado-tecnico-diario-238449

Nota: Estas tablas las encontrará de acuerdo a la última actualización disponible a la fecha de consulta. En ésta nota trabajamos con las tablas que se publicaron al cierre del 15 de abril.

Los links de la Tabla_casos_sospechosos_COVID-19_2020.04.15 y la Tabla_casos_positivos_COVID-19_resultado_InDRE_2020.04.15 son respectivamente

https://www.gob.mx/cms/uploads/attachment/file/546842/Tabla_casos_sospechosos_COVID-19_2020.04.15.pdf

https://www.gob.mx/cms/uploads/attachment/file/546841/Tabla_casos_positivos_COVID-19_resultado_InDRE_2020.04.15.pdf

2) Convertir los archivos PDF a Excel con cualquier convertidor, por ejemplo el que se encuentra en https://www.ilovepdf.com/es/pdf_a_excel

3) Abrir los dos archivos Excel obtenidos de la conversión y unir los registros de casos confirmados y sospechosos en una misma hoja

4) Insertar un renglón con nombres cortos de variables y eliminar los renglones de encabezados y los de la fuente.

De acuerdo con la figura anterior, la descripción de variables es la siguiente:

Variable Descripciónnumcaso N° Casoestado Estadosexo Sexoedad Edadfisint Fecha de Inicio de síntomasrprueba Identificación de COVID-19 por RT-PCR en tiempo real

5) Guardar en la carpeta C:\Coronavirus\ la base Excel tiene forma de base de datos.

6) Mediante el siguiente comando en STATA, abrimos la base de datos que ha sido guardada en formato Excel

import excel using "C:\Coronavirus\Casos COVID-19 Mx Abr15.xlsx", clear firstrow

7) Describimos la base de datos

8) Etiquetamos las variables y la base de datos

label variable numcaso "N° Caso"label variable estado "Estado"label variable sexo "Sexo"label variable edad "Edad"label variable fisint "Fecha de Inicio de síntomas"label variable rprueba "Identificación de COVID-19 por RT-PCR en tiempo real"label data "Casos confirmados y sospechosos a enfermedad por COVID-19"d

9) Tabulamos la variable rprueba y validamos con la información de la página 2 del comunicado, como medio de verificación y así validamos el tamaño de la base de datos que se integró a partir de las dos tablas.

tabulate rprueba

10) Tabla de contingencia trivariada.

table estado sexo rprueba, row col

---------------------------------------------------------------------------------------- | Identificación de COVID-19 por RT-PCR en tiempo real and Sexo | ---------- Confirmado --------- ---------- Sospechoso --------- Estado | FEMENINO MASCULINO Total FEMENINO MASCULINO Total--------------------+------------------------------------------------------------------- AGUASCALIENTES | 32 33 65 38 45 83 BAJA CALIFORNIA | 213 251 464 351 339 690BAJA CALIFORNIA SUR | 75 90 165 152 107 259 CAMPECHE | 7 36 43 17 19 36 CHIAPAS | 12 36 48 34 37 71 CHIHUAHUA | 30 53 83 96 111 207 CIUDAD DE MÉXICO | 664 1,022 1,686 1,203 1,161 2,364 COAHUILA | 87 108 195 501 445 946 COLIMA | 3 4 7 13 19 32 DURANGO | 7 9 16 61 36 97 GUANAJUATO | 50 41 91 101 85 186 GUERRERO | 36 61 97 65 60 125 HIDALGO | 24 40 64 24 18 42 JALISCO | 71 105 176 352 213 565 MICHOACÁN | 30 40 70 104 85 189 MORELOS | 26 30 56 42 43 85 MÉXICO | 283 376 659 514 530 1,044 NAYARIT | 15 12 27 20 23 43 NUEVO LEÓN | 49 101 150 907 1,108 2,015 OAXACA | 27 23 50 35 27 62 PUEBLA | 135 156 291 187 160 347 QUERETARO | 31 38 69 44 38 82 QUINTANA ROO | 94 175 269 78 104 182 SAN LUIS POTOSÍ | 27 29 56 68 61 129 SINALOA | 126 166 292 170 155 325 SONORA | 41 37 78 94 64 158 TABASCO | 105 105 210 161 204 365 TAMAULIPAS | 29 31 60 92 124 216 TLAXCALA | 27 31 58 44 51 95 VERACRUZ | 49 57 106 241 196 437 YUCATÁN | 58 70 128 84 79 163 ZACATECAS | 5 13 18 36 41 77 | Total | 2,468 3,379 5,847 5,929 5,788 11,717----------------------------------------------------------------------------------------

11) Distribución de casos en grupos quinquenales de edad y género. Tablas y pirámide poblacional.

recode edad (0/4=1) (5/9=2) (10/14=3) (15/19=4) (20/24=5) (25/29=6) (30/34=7) (35/39=8) (40/44=9) (45/49=10) (50/54=11) (55/59=12) (60/64=13) (65/69=14) (70/74=15) (75/79=16) (80/84=17) (85/89=18) (90/94=19) (95/99=20) (100/104=21) (105/109=22), gen(g_edad)

label define g_edad 1 "0 a 4 años" 2 "5 a 9 años" 3 "10 a 14 años" 4 "15 a 19 años" 5 "20 a 24 años" 6 "25 a 29 años" 7 "30 a 34 años" 8 "35 a 39 años" 9 "40 a 44 años" 10 "45 a 49 años" 11 "50 a 54 años" 12 "55 a 59 años" 13 "60 a 64 años" 14 "65 a 69 años" 15 "70 a 74 años" 16 "75 a 79 años" 17 "80 a 84 años" 18 "85 a 89 años" 19 "90 a 94 años" 20 "95 a 99 años" 21 "100 a 104 años" 22 "105 a 109 años"

label values g_edad g_edad

table g_edad sexo rprueba, f(%6.0fc) row col----------------------------------------------------------------------------------- | Identificación de COVID-19 por RT-PCR en tiempo real and Sexo RECODE of edad | ---------- Confirmado --------- ---------- Sospechoso ---------(Edad) | FEMENINO MASCULINO Total FEMENINO MASCULINO Total---------------+------------------------------------------------------------------- 0 a 4 años | 7 18 25 112 160 272 5 a 9 años | 9 10 19 68 67 135 10 a 14 años | 16 13 29 63 72 135 15 a 19 años | 28 32 60 124 121 245 20 a 24 años | 114 131 245 404 365 769 25 a 29 años | 252 266 518 716 665 1,381 30 a 34 años | 258 366 624 732 716 1,448 35 a 39 años | 252 390 642 735 650 1,385 40 a 44 años | 271 385 656 705 640 1,345 45 a 49 años | 273 415 688 680 562 1,242 50 a 54 años | 246 379 625 506 496 1,002 55 a 59 años | 231 304 535 354 378 732 60 a 64 años | 174 206 380 262 286 548 65 a 69 años | 144 191 335 159 194 353 70 a 74 años | 68 136 204 115 153 268 75 a 79 años | 68 76 144 76 116 192 80 a 84 años | 39 39 78 54 76 130 85 a 89 años | 12 17 29 37 41 78 90 a 94 años | 3 5 8 18 23 41 95 a 99 años | 3 3 4 6 10100 a 104 años | 4 4105 a 109 años | 1 1 2 | Total | 2,468 3,379 5,847 5,929 5,788 11,717-----------------------------------------------------------------------------------

keep if rprueba=="Sospechoso"gen hom=-(sexo=="FEMENINO")gen muj=(sexo=="MASCULINO")collapse (sum) hom muj, by(estado g_edad)gen cero=0

twoway (bar hom g_edad, horizontal) (bar muj g_edad, horizontal) (scatter g_edad cero, msymbol(i) mlabel(g_edad) mlabcolor(black)), title("Casos sospechosos COVID-19 en México") subtitle("Distribución por grupo quinquenal de edad") xlabel(-160 "160" -140 "140" -120 "120" -100 "100" -80 "80" -60 "60" -40 "40" -20 "20" 0 20 40 60 80 100 120 140 160) yscale(off) ylabel(,nogrid) legend(off) saving("C:\Coronavirus\Pirámide_poblacional_Sospechosos_Nacional.GPH",replace)

replace hom=-hom

table g_edad, c(sum hom sum muj) f(%9.0fc) row col

0 a 4 años5 a 9 años

15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años

70 a 74 años

80 a 84 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años90 a 94 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años

25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años

80 a 84 años85 a 89 años90 a 94 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años90 a 94 años95 a 99 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años90 a 94 años

0 a 4 años

10 a 14 años

20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años

60 a 64 años65 a 69 años

75 a 79 años

90 a 94 años

0 a 4 años

20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años

70 a 74 años

85 a 89 años90 a 94 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años90 a 94 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años

0 a 4 años

10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años

60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años90 a 94 años95 a 99 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años

90 a 94 años95 a 99 años

0 a 4 años

15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años

90 a 94 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años90 a 94 años

100 a 104 años

10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años

85 a 89 años90 a 94 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años90 a 94 años95 a 99 años100 a 104 años105 a 109 años

0 a 4 años

15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años

70 a 74 años75 a 79 años

90 a 94 años95 a 99 años100 a 104 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años

0 a 4 años

15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años

95 a 99 años

0 a 4 años

10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años

75 a 79 años80 a 84 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años90 a 94 años95 a 99 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años90 a 94 años

0 a 4 años5 a 9 años

15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años

0 a 4 años

10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años

95 a 99 años

0 a 4 años

10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años

90 a 94 años95 a 99 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años90 a 94 años

0 a 4 años5 a 9 años10 a 14 años15 a 19 años20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años90 a 94 años

0 a 4 años5 a 9 años

20 a 24 años25 a 29 años30 a 34 años35 a 39 años40 a 44 años45 a 49 años50 a 54 años55 a 59 años60 a 64 años65 a 69 años70 a 74 años75 a 79 años80 a 84 años85 a 89 años

160 140 120 100 80 60 40 20 0 20 40 60 80 100 120 140 160

Distribución por grupo quinquenal de edadCasos sospechosos COVID-19 en México

Fuente: Elaboración con datos de la Secretaría de Salud, consulta del 15 de abril 2020