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VARIABILIDAD GENÉTICA Y GRADO DE ADOPCIÓN DE LA YUC A (Manihot esculenta Crantz) CULTIVADA POR PEQUEÑOS AGRICULTORES DE LA
COSTA ATLÁNTICA COLOMBIANA
ADRIANA MERCEDES ALZATE GUTIERREZ Código 7205001
UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA
FACULTAD DE CIENCIAS AGROPECUARIAS PROGRAMA DE POSTGRADOS
Palmira 2009
VARIABILIDAD GENÉTICA Y GRADO DE ADOPCIÓN DE LA YUC A (Manihot esculenta Crantz) CULTIVADA POR PEQUEÑOS AGRICULTORES DE LA
COSTA ATLÁNTICA COLOMBIANA
ADRIANA MERCEDES ALZATE GUTIERREZ Código 7205001
Trabajo de grado presentado para optar el título de Maestría en Ciencias Agrarias Área de énfasis Fitom ejoramiento
Directores:
HERNAN CEBALLOS PhD. FRANCO ALIRIO VALLEJO PhD.
UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA FACULTAD DE CIENCIAS AGROPECUARIAS
PROGRAMA DE POSTGRADOS Palmira
2009
AGRADECIMIENTOS
Al Dr. Hernán Ceballos, Dr. Juan Carlos Pérez y los integrantes del programa de
Mejoramiento de Yuca de CIAT, en especial, por el apoyo en campo e invernadero
a Eusebio Ortega, Jorge Iván Lenis, Noe Bañon y Nelson Morante.
Al Dr. Martin Fregene y todos los integrantes del Laboratorio de Genética de Yuca
de CIAT.
Al Dr. Franco Alirio Vallejo por la dirección del trabajo en el momento oportuno.
A Martha Cecilia del Pilar Alzate, Myriam Cristina Duque, Juan Bosco Cuasquer,
por sus aportes en el análisis estadístico.
Al Fondo Conmemorativo de Becas Ginés-Mera para Estudios de Postgrado en
Diversidad Biológica por la financiación del proyecto.
Por su apoyo incondicional a Ana Cruz Murillo, Adriana Nuñez, Diana Falla, Jaime
Alberto Marín y Janeth Patricia Gutierrez.
La facultad y los jurados de tesis no se harán responsables de las ideas emitidas por el autor. Artículo 24, resolución 04 de 1974
TABLA DE CONTENIDO
Página
1. INTRODUCCIÓN ........................................................................................... 1 2. OBJETIVOS ................................................................................................... 3
2.1 GENERAL ................................................................................................ 3
2.2 ESPECIFICOS ......................................................................................... 3 3. MARCO TEÓRICO ........................................................................................ 4
3.1 GENERALIDADES DE LA YUCA (Manihot esculenta Crantz) ................. 4
3.1.1 Taxonomía ......................................................................................... 4
3.1.2 Origen, distribución y domesticación ................................................. 5
3.1.3 Producción y área cultivada ............................................................... 6
3.1.4 Usos ................................................................................................... 7
3.1.5 Diversidad y recursos genéticos de la yuca ....................................... 8
3.2 MARCADORES MOLECULARES COMO HERRAMIENTA PARA LA IDENTIFICACIÓN DE LA VARIABILIDAD GENÉTICA ...................... 9
3.2.1 Microsatélites (SSR – Simple Sequence Repeats) .......................... 11
3.3 MEJORAMIENTO GENÉTICO DE LA YUCA EN COLOMBIA ............... 13 4. ANTECEDENTES ........................................................................................ 18
4.1 ESTUDIO DE DIVERSIDAD GENÉTICA DE YUCA USANDO LA TÉCNICA DE MICROSATELITES ........................................................ 18
4.2 VARIEDADES DE YUCA MEJORADAS GENÉTICAMENTE LIBERADAS EN LA COSTA ATLÁNTICA ............................................. 19
4.3 ESTUDIOS QUE HAN DETERMINADO EL GRADO DE ADOPCIÓN DE VARIEDADES DE YUCA MEJORADAS Y LIBERADAS POR CIAT E ICA-CORPOICA EN LA COSTA ATLÁNTICA .......................... 20
5. MATERIALES Y MÉTODOS ........................................................................ 24
5.1 UBICACIÓN ........................................................................................... 24
5.2 METODOLOGÍA ..................................................................................... 24
5.2.1 Metodología de campo ................................................................... 24
5.2.2 Metodología de laboratorio .............................................................. 27
5.2.3 Análisis de datos .............................................................................. 30
6. RESULTADOS Y ANÁLISIS ........................................................................ 32
6.1 RELACIONES GENÉTICAS ENTRE GENOTIPOS .............................. 32
6.2 VARIABILIDAD GENÉTICA ................................................................... 37
6.3 ADOPCIÓN DE VARIEDADES MEJORADAS ....................................... 41
6.3.1 Distribución de variedades mejoradas por departamentos .............. 44
6.3.2 Métodos de adquisición de semilla de yuca ..................................... 46
6.3.3 Finalidad de la producción ............................................................... 48
6.3.4 Asistencia técnica ............................................................................ 50
6.3.5 Principales problemas fitosanitarios del cultivo ................................ 53 7. CONCLUSIONES ........................................................................................ 56 BIBLIOGRAFÍA ................................................................................................ 57 ANEXOS .......................................................................................................... 63
LISTA DE TABLAS
Página
Tabla 1 : Distribución del número de municipios y número de fincas a visitar de pequeños agricultores de la Costa Atlántica según tamaño de muestra. ........................................................................................................... 26
Tabla 2. Características morfológicas de las variedades representativas de los grupos Grupo1, Grupo3, Grupo6 y Grupo5 establecidos en el ACM .... 35
Tabla 3. Variabilidad genética de yuca de pequeños agricultores de la Costa Atlántica Colombiana y ubicación de los 9 loci en los cromosomas del mapa genético de yuca. ............................................................................. 37
Tabla 4. Heterocigosidad esperada de los grupos genéticos definidos en el ACM en la población de yuca de pequeños agricultores de la Costa Atlántica Colombiana ....................................................................................... 38
Tabla 5. Adopción por pequeños agricultores, de las variedades mejoradas de yuca por CIAT en cuatro departamentos de la Costa Atlántica ........................................................................................................... 46
LISTA DE FIGURAS
Página
Figura 1 . Gel de calidad de ADN de 30 muestras escogidas al azar de semilla de yuca de pequeños agricultores de la Costa Atlántica Colombiana. ..................................................................................................... 28
Figura 2 . Prototipo del polimorfismo de los nueve SSRY seleccionados para el estudio de la variabilidad genética de genotipos de yuca de pequeños agricultores de la Costa Atlántica Colombiana. ............................... 29
Figura 3 . Agrupamiento de los 717 genotipos de yuca cultivada por pequeños agricultores de la Costa Atlántica Colombiana, mediante ACM ...... 33
Figura 4 . Distribución de genotipos de yuca en los grupos definidos por el ACM ................................................................................................................. 35
Figura 5 . Distribución de variedades y genotipos de yuca presentes en cultivos de pequeños agricultores de la región de la Costa Atlántica colombiana....................................................................................................... 37
Figura 6 . Adopción de las variedades de yuca mejoradas por CIAT ............... 42
Figura 7 . Porcentaje de variedades de yuca mejorada por departamento ...... 44
Figura 8 . Adquisición de semilla de yuca por los pequeños agricultores de la Costa Atlántica. ............................................................................................ 47
Figura 9 . Finalidad de la producción de yuca de pequeños agricultores de la Costa Atlántica. ............................................................................................ 48
Figura 10 . Asistencia técnica recibida por pequeños agricultores de yuca de la Costa Atlántica ........................................................................................ 51
Figura 11 . Principales problemas fitosanitarios en cultivos de yuca de pequeños agricultores de la Costa Atlántica .................................................... 54
LISTA DE ANEXOS
Página
ANEXO 1. Formato de encuesta realizado a los agricultores en los departamentos de Córdoba, Sucre, Atlántico y Magdalena. ............................... 64
ANEXO 2. Microsatélites para análisis de diversidad y diferenciación genética (Mba et al, 2001). ................................................................................. 65
ANEXO 3. Polymorphic information content – Contenido de Información Polimórfica .......................................................................................................... 66
ANEXO 4. Ubicación de los marcadores : SSRY 12, SSRY 51, SSRY 63, SSRY 82, SSRY 100, SSRY 135, SSRY 179 en el Mapa genético de yuca ...... 67
ANEXO 5. Asociación de grupos según Análisis de Correspondencia Multiple (ACM) de genotipos evaluados de la Costa Atlantica Colombiana ........ 68
ANEXO 6. Distribución general de los diferentes genotipos sembrados por los pequeños agricultores de la Costa Atlántica en los seis grupos identificados en el Análisis de Correspondencia Multiple (ACM) ........................ 69
ANEXO 7. Número de alelos observados en genotipos evaluados de la Costa Atlántica Colombiana ................................................................................ 71
ANEXO 8. Frecuencia alélica y heterocigosidad en genotipos evaluados de la Costa Atlántica Colombiana ....................................................................... 72
RESUMEN La yuca es un producto importante para la seguridad alimentaría de países en vía
de desarrollo. Es preferida por pequeños agricultores por su buen comportamiento
bajo condiciones marginales de clima y suelo.
En Colombia, el tercer país productor de yuca en Latinoamérica, la principal zona
de producción es la Costa Atlántica. Los cultivos que manejan los pequeños
agricultores de ésta región, están conformados por un gran número de genotipos
locales y/o variedades mejoradas existiendo un desconocimiento sobre la
variabilidad genética de éstos materiales y la adopción de las variedades
mejoradas.
En el presente trabajo se evaluaron 717 genotipos provenientes de fincas de
pequeños agricultores de la Costa Atlántica. Se evaluó la diversidad genética por
medio de la técnica molecular microsatélites y se realizó un análisis sobre la
adopción de las variedades mejoradas. Se encontró alta diversidad genética (Ht:
0.61692) y baja adopción de la mayoría de variedades mejoradas.
Palabras claves : Variabilidad genética, microsatélites, heterocigosidad
ABSTRACT
Cassava is an important product for food security in developing countries. It is
preferred by small farmers because of its better performance than other crops
under marginal conditions of climate and soil.
In Colombia, the third leading producer of cassava in Latin America, the main
production area is the Atlantic Coast. Crops grown by small farmers in this region
are composed of a large number of genotypes and improved varieties but there
exists lack of knowledge about the genetic variability of these materials and the
adoption of improved varieties.
In the present study we evaluated 717 genotypes from farms of small farmers in
the Atlantic Coast. We assessed the genetic diversity using molecular
microsatellite analysis and adoption of improved varieties. We found that there was
high genetic diversity (Ht: 0.61692) and low adoption of most improved varieties.
Keyword : Genetic variability, microsatellite, heterozygosity
1. INTRODUCCIÓN
La yuca constituye el cuarto producto básico más importante en la alimentación
mundial después del arroz, trigo y maíz. Juega un papel fundamental en la dieta
de más de 1000 millones de personas (Ceballos, 2002), constituyendo un
importante recurso energético en la alimentación humana.
La yuca es cultivada, en su gran mayoría, por agricultores pequeños. Por su buen
comportamiento bajo condiciones marginales de clima y suelo, es identificada
como un cultivo que puede evitar el hambre y dar seguridad en zonas donde otros
cultivos fallan (Iglesias, et. al, 1994). El conocimiento de la diversidad genética de
los cultivos, incluyendo la yuca, en cualquier región del mundo, permite aportar
información básica en la toma de decisiones para propósitos de mejoramiento y
conservación de la especie.
En Colombia, la principal zona de producción de yuca es la Costa Atlántica con el
42% de la producción nacional (Gottret et. al, 2002). Al igual que en otros países,
en Colombia, la yuca, es manejada por pequeños agricultores, los cuales usan
diferentes cultivares que pocas veces son claramente identificados, los cuales
pueden estar conformados por genotipos locales o variedades mejoradas.
En Colombia, el Centro Internacional de Agricultura Tropical – CIAT, desde
comienzos de la década de 1970, ha realizado trabajos de mejoramiento genético
en yuca y junto con el Instituto Colombiano Agropecuario – ICA y CORPOICA,
entidad encargada de la difusión y liberación de las variedades, han cumplido
tradicionalmente con esta labor (Ceballos et. al, 2002). Sin embargo, teniendo en
cuenta las dos modalidades de evaluación final de materiales mejorados,
esquema tradicional e investigación participativa, no se conoce, si estas
variedades han llegado a los pequeños agricultores de la Costa Atlántica y si las
manejan en una amplia cobertura.
2
En este trabajo se evaluó la variabilidad genética de yuca de los pequeños
agricultores de la Costa Atlántica Colombiana a través del uso de marcadores
moleculares tipo microsatélites. También se identificó los genotipos locales y las
variedades mejoradas que cultivan los agricultores de la región y el análisis de
algunos aspectos que afectan la adopción de las variedades mejoradas como
métodos de adquisición de semilla, asistencia técnica y finalidad del producto.
3
2. OBJETIVOS
2.1 GENERAL
Identificar la variabilidad genética de yuca (Manihot esculenta Crantz) cultivada por
pequeños agricultores de la Costa Atlántica Colombiana.
2.2 ESPECIFICOS
� Analizar la variabilidad genética de yuca cultivada por pequeños agricultores de
la Costa Atlántica Colombiana, mediante marcadores moleculares tipo
microsatélites.
� Determinar el grado de adopción por parte de los pequeños agricultores de
variedades de yuca mejoradas y liberadas por CIAT e ICA-CORPOICA.
� Establecer los departamentos con mayor intensidad en el cultivo de variedades
mejoradas por CIAT.
4
3. MARCO TEÓRICO
3.1 GENERALIDADES DE LA YUCA ( Manihot esculenta Crantz)
La yuca constituye una de las fuentes de energía más importantes en las regiones
tropicales del mundo. Es una especie que es cultivada desde el nivel del mar
hasta los 1800 m.s.n.m. Sus raíces son el principal producto económico pero las
hojas también tienen un excelente potencial y son extensivamente utilizadas en
África y Asia, ya sea para alimentación humana o animal. Además del valor
económico, el cultivo ofrece ventajas como tolerancia a sequía, capacidad de
producir en suelos degradados, resistencia a plagas y enfermedades, tolerancia a
suelos ácidos y flexibilidad en el momento de plantar y cosechar (Ceballos, 2002).
3.1.1 Taxonomía
La yuca presenta la siguiente clasificación taxonómica:
Clase : Dicotyledoneae Subclase: Archichlamydae (perianto poco evolucionado) Orden : Euphorbiales Familia : Euphorbiaceae Tribu : Manihoteae Género : Manihot Especie : Manihot esculenta Crantz
La familia Euforbiaceae está constituida por 7200 especies que se caracterizan
por su notable desarrollo de los vasos laticíferos, compuestos por células
secretoras llamadas galactocitos, las que producen la secreción lechosa que
caracteriza a las plantas de ésta familia.
Una de las tribus más importantes de ésta familia es Manihoteae, representada
por el género Manihot que agrupan arbustos o hierbas de porte alto. Dentro del
5
género Manihot, se han clasificado un centenar de especies, entre las cuales la
única cultivada comercialmente es la yuca Manihot esculenta Crantz.
La yuca es una planta monoica, de ramificación simpodial y porte arbustivo. Según
el cultivar y las condiciones ecológicas, su altura varía de 1 a 5 metros, siendo
más común las plantas entre 1 y 3 metros. Dentro de la especie existen
variedades amargas y dulces, según el contenido de ácido cianhídrico.
M. esculenta muestra una amplia variabilidad, que indica un alto grado de
hibridación intraespecífica; por lo tanto, existen numerosos cultivares de ésta
especie, los cuales se distinguen con base a sus características morfológicas
(Dominguez et. al, 1983).
Se puede hacer una lista con los numerosos nombres vulgares para ésta especie.
En la lengua española se conoce, principalmente, como yuca o mandioca. En
Brasil se distingue la yuca dulce (aipi) de la amarga (mandioca). Otros nombres en
otros idiomas son: cassava, manioc, manioca, tapioca, suahili, mhongo y omowgo
(Ceballos, De la Cruz, 2002).
Todas las especies de la tribu Manihoteae (incluyendo M. esculenta) contienen 36
cromosomas y en la mayoría de los casos el apareamiento de los cromosomas
forma bivalentes, sugiriendo que ésta especie sería diploide. Sin embargo, existe
cierta divergencia por parte de los investigadores en cuanto al grado de ploidía de
ésta especie. Para algunos autores, se trata de una especie diploide (2n=36
cromosomas), mientras que otros la consideran un poliploide, posiblemente un
alopoliploide (ya sea tetra o hexaploide) (Ceballos, De la Cruz, 2002).
3.1.2 Origen, distribución y domesticación
La mayoría de los botánicos y ecólogos consideran la yuca como originaria de
América Tropical, y el Nordeste del Brasil como el más probable centro de origen.
La diversidad más amplia del género Manihot se encuentra el Brasil, suroccidente
de México y Guatemala (Dominguez et.al, 1983).
6
La distribución de la yuca a otros continentes se inició después del descubrimiento
de América. Los portugueses la llevaron desde Brasil a las Costas Occidentales
de África en el siglo XI; posteriormente a finales del siglo XVIII la introdujeron a
Madagascar y luego por la costa oriental. El hecho de que la introducción al África
ha sido por ambas costas, explica la existencia de la amplia dispersión de ésta
especie en el continente Africano.
La introducción al Sureste del continente Asiático ocurrió a principios del siglo XVII
por parte de comerciantes españoles. Finalmente la yuca pasó del África a la India
aproximadamente en 1800; donde se encuentra extensamente difundida y
constituye un reglón importante en la alimentación (Dominguez et. al, 1983).
La yuca ha evolucionado como una especie cultivada por selección natural y por el
cuidado del hombre. La historia de la yuca es todavía en su mayoría tema de
conjeturas. Muy poca pruebas arqueológicas o etnobotánicas se encuentran
disponibles a cerca del momento en que empezó su cultivo. La yuca pudo haber
sido cultivada por primera vez en Brasil, Venezuela o Centro América (Hershey et.
al, 1983). El área de domesticación comprende desde México hasta Brasil y se
ha cultivado desde hace unos 5000 años (Simmonds, 1976).
3.1.3 Producción y área cultivada
La mayor parte de la yuca se produce en fincas de pequeños agricultores y en
áreas agrícolas marginales, por lo que una producción importante no se registra
en las estadísticas de manera adecuada y precisa (Ceballos, 2002). En África se
siembra un 63.8% del total del área mundial y se cosecha el 51.7% de la
producción mundial, en Asia, sin embargo, se siembra el 20.6% y se produce el
31.5% del total mundial indicando una alta productividad. América y el Caribe
siembra el 16.5% de la superficie mundial sembrada con yuca y produce 17.2%
del total mundial (FAO, 2007).
7
En América, Colombia ocupa el tercer lugar tanto en área sembrada con 185.000
ha, como en producción con 2.1 millón de toneladas; después de Brasil, que tiene
1.944.834 ha sembradas y produce 27.312.946 toneladas; seguido de Paraguay,
con 320.000 ha sembradas y 5´100.000 toneladas de producción. Los
rendimientos en estos países son aproximadamente Brasil 14 t/ha, Paraguay 15.9
t/has y Colombia 11.35 t/ha. (FAO, 2007).
En Colombia la principal zona de producción de yuca es la Costa Atlántica con el
42.4% de la producción nacional, seguida de los Llanos Orientales 13.2%, los
Santanderes 13%, el Valle del Cauca 4.6%, Huila y Tolima 2.8% y el Eje Cafetero
2.4% (Gottret et. al, 2002).
En cuanto al área cosechada, la Costa Atlántica participa con el 54% de total
nacional, en esta región el 70% de los productores de yuca son pequeños
agricultores que cultivan en fincas de aproximadamente 0.5 a 2 ha, aunque
también hay productores medianos (2 a 5 ha) y grandes (más de 5 ha). En los
llanos Orientales el área cultivada representa el 11.5% del total nacional y se
concentra en medianos productores con área promedio de finca entre 6 y 8 ha. En
los Santanderes, el área sembrada es 11.3% del total nacional en fincas de 0.5 a 2
ha. En Huila- Tolima y Valle-Cauca hay poca área sembrada con 3.2% y 5.1%
respectivamente y se consideran áreas grandes de cultivos industriales ó muy
pequeñas en laderas (Gottret et. al, 2002).
3.1.4 Usos
La yuca por su adaptabilidad a las difíciles condiciones del suelo (acidez e
infertilidad) y al clima le permite ser un sustento seguro y un ingreso para familias
de escasos recursos, asentadas en tierras marginales sin otra alternativa de
producción agrícola. La yuca cumple ésta función no solo a las personas de
escasos recursos del campo sino de las grandes ciudades (Gottret y Reymond,
2000).
8
La mayor parte de las raíces cosechadas se destina a consumo humano. Otros
usos es la elaboración de concentrados para alimento de animales; a nivel
industrial, como almidón que puede ser nativo y agrio. El almidón nativo tiene
diversos usos, como espesante, aglutinante, estabilizante y mejorador de textura.
El almidón agrio, se usa principalmente en productos tradicionales de panadería y
snacks.
3.1.5 Diversidad y recursos genéticos de la yuca
La diversidad es el número de tipos diferentes en una colección (comunidad,
población, etc) donde los tipos están determinados por la expresión de una
característica bajo consideración (Gregorius, 1987). La diversidad genética es la
variación de los genes dentro de cada especie.
Para estimar la diversidad se usan varias medidas, y un gran porcentaje esta
basado en modelos específicos o en conceptos probabilísticos. Cuando la
variación es medida por diferencias alélicas en varios loci a través de
electroforesis, los medios más usados para medir esta variación son, el número de
alelos y la diversidad genética (heterocigosidad) (Nei, 1987).
El número de alelos es la medida más directa de diversidad y se refiere al número
de estados variantes de un locus dentro del genoma (Ej. Formas alternativas de
una proteína, sitios dentro del genoma que pueden ser cortados con enzimas de
restricción, variación en el número de secuencias repetitivas en el ADN, etc).
La heterocigosidad observada (Ho) se refiere a la proporción de individuos que
son heterocigotos, es decir copias distintas en el mismo locus (este parámetro se
encuentra muy relacionada con la naturaleza reproductiva de la especie
estudiada). La heterocigosidad esperada o diversidad genética (He) es un
concepto introducido por Nei (1978) para referirse a la probabilidad que dos alelos
seleccionados aleatoriamente en un genotipo dado sean diferentes.
9
Teniendo en cuenta el concepto de diversidad, los recursos genéticos constituidos
por la variación genética organizada en el germoplasma de una especie que
incluye variabilidad genética intra e interespecífica, se convierten en una fuente de
materiales con fines de utilización en la investigación en general y especialmente
en el mejoramiento genético.
Los recursos genéticos de la yuca son de invaluable valor para la humanidad y
representan un recurso crítico para el futuro del cultivo (Hillocks et al, 2002). La
conservación del germoplasma a través de bancos de germoplasma permite
preservar, enriquecer y utilizar los recursos genéticos para asegurar la
disponibilidad de germoplasma y de la información para la investigación actual y
futura.
La conservación del germoplasma evita la pérdida de especies silvestres y
cultivadas por problemas de erosión genética, la cual es causada por factores de
presión tales como la adopción de variedades modernas, el desmonte de tierras
para el urbanismo y la alteración del hábitat natural. La conservación permite
también mantener un alto grado de variabilidad genética para utilizar en los
programas de mejoramiento del cultivo. (Jaramillo, 2002).
3.2 MARCADORES MOLECULARES COMO HERRAMIENTA PARA LA IDENTIFICACIÓN DE LA VARIABILIDAD GENÉTICA
La variabilidad genética de un cultivo se puede estimar haciendo una evaluación
indirecta de su genoma por medio de descriptores morfológicos, a través de
marcadores bioquímicos (isoenzimas) o por evaluación directa de su genoma con
marcadores moleculares (RFLP, RAPD, minisatélites, microsatélites, etc.).
En la década de los 60 los marcadores morfológicos fueron ampliamente utilizados
en estudios de genética y mejoramiento pero este sistema no permitía encontrar
asociaciones significativas entre los marcadores y caracteres de importancia
económica a través del estudio de poblaciones segregantes, por lo que era
ocasional identificar marcadores morfológicos ligados a genes de importancia
10
económica, lo cual restringía su empleo en programas de mejoramiento. En
estudios de variabilidad genética los descriptores morfológicos presentan
desventajas como el reducido número de descriptores morfológicos, el efecto
ambiental en la expresión de los descriptores y el enmascaramiento de la
expresión de genes recesivos, estos factores limitan el uso de los marcadores
morfológicos para una efectiva evaluación del genoma vegetal (Ferreira y
Grataplagia, 1998).
El descubrimiento de los marcadores isoenzimáticos amplió el número de
marcadores genéticos. Éstos son útiles para la complementación de la evaluación
de la variabilidad genética por medio de los marcadores morfológicos, pero
presentan limitaciones en la evaluación del genoma vegetal, esto se debe a que
su número es limitado y que, en muchos cultivos se conoce poco sobre la genética
de estos marcadores y el cubrimiento del genoma es muy reducido. Además,
están afectados por el medio ambiente.
Con las técnicas modernas de biología molecular se logró detectar polimorfismo
genético directamente a nivel del ADN. En su orden, las técnicas modernas
comenzaron con el uso de enzimas de restricción que permitieron el análisis del
polimorfismo de longitud de los fragmentos de restricción del ADN (Restriction
Fragment Length Polymorphism – RFLP). Posteriormente, la amplificación en
cadena usando una ADN polimerasa (PCR) permitió la descripción de otros
marcadores moleculares que junto a técnicas de clonación y secuenciamiento del
ADN proporcionaron información abundante sobre la estructura del genoma
monocariótico y eucariótico. El uso de estas técnicas llevó al descubrimiento de
otra fuente de polimorfismo genético, los mini y microsatélites que son secuencias
repetidas de ADN (Ferreira y Grataplagia, 1998).
Los marcadores moleculares permiten el análisis de cada segmento del genoma
vegetal, ya sea de copia única o altamente repetitivo, segmentos codificantes o no
codificantes, segmentos conservados o hipervariables, segmentos del genoma
nuclear u organelar. Algunas secuencias presentan poca variación dentro de las
11
especies de un mismo género, mientras que las secuencias hipervariables
(secuencias polimórficas de cortas repeticiones que presentan alto grado de
polimorfismo) pueden presentar variación genotípica específica (Karp, 1998).
Estudios de diversidad genética en yuca usando las técnicas de marcadores
moleculares se pueden observan en varios trabajos. Ramírez (1991), por medio de
la técnica de isoenzimas, determina duplicados del banco de germoplasma de
yuca de CIAT. Giraldo (1996), con isoenzimas establece como es la diversidad
genética de yuca en clones tradicionales de las zonas colombianas: Costa Norte,
Litoral Pacífico, llanura Amazónica, estrella fluvial del Orinoco y entre ríos
Putumayo y Amazonas.
La técnica de RFLPs fue usada por Bertram et. al (1993) para estudiar las
relaciones filogenéticas entre especies del género Manihot de Latinoamérica y la
yuca (M. esculenta Crantz). Beeching et. al (1993), con RFLPs, evaluó la
diversidad genética de una colección de yuca in vitro en ORSTON, formada por 80
cultivares del género M. esculenta y algunos representantes de M. glaziovvi, M.
caerulescens e híbridos interespecíficos entre M. esculenta y M. glaziovii. Los
RAPD, fueron usados por Zambrano et al. (2003) en estudios de diversidad
genética del Banco de germoplasma de Yuca del CENIAP-INIA.
En cuanto a marcadores microsatélites, se han usado para estudios de diversidad
genética de yuca en diferentes países. En el CIAT, se ha empleado ésta técnica
en diversidad genética, con significativos avances que han aumentado el
conocimiento básico de la variación genética de éste cultivo.
3.2.1 Microsatélites (SSR – Simple Sequence Repeats )
Más del 90% del genoma de plantas y animales consiste en repeticiones en
secuencia. Las repeticiones en secuencia del material del material genético ADN,
es clasificado en tres grandes grupos de acuerdo a su longitud: satélites
(repeticiones en secuencia de fragmentos superiores a las 300 pb), minisatélites
12
(repeticiones en secuencia de fragmentos superiores a las 300 pb) y microsatélites
(repeticiones en secuencias simples de 1-6 pb) (Tautz, 1993. Tomado de Prieto,
2003).
Los SSR, son secuencias cortas repetidas compuestas de 2-5 pares de bases de
longitud y se presentan en grupos de 100 o menos copias repetidas en promedio
(Karp, 1998). Son altamente abundantes en el genoma de eucariontes, pero
también ocurren en procariotes a baja frecuencia (Hoelzel, 1998).
Las di y tri tetranucloótidos son las repeticiones más comunes en los
microsatélites, y se encuentran distribuidas por todo el genoma de la planta o del
animal (Jarne y Lagoda, 1996. Tomado de Prieto, 2003).
Los microsatélites pueden ser clasificados en 3 categorías, puro, compuesto e
interrumpido, de acuerdo a su composición de bases nitrogenadas ininterrumpidas
de un solo motivo, ej. (AT)n. Para los microsatélites compuestos consisten en dos
o mas tipos de repeticiones, ej. (GT)n o (AT)n. Los interrumpidos contienen una
interrupción en la repetición, ej. (GT)n GG (GT)n (Herarne et al, 1992. Tomado de
Prieto, 2003).
Los SSR también se pueden clasificar en dos tipos de acuerdo a su desarrollo, los
genómicos y los génicos. Los microsatélites genómicos son desarrollados a partir
de librerías genómicas, a menudo construidas por clonación de ADN en bacterias.
Lo microsatélites génicos son desarrollados a partir de librerías de cDNA
(Génicas) el cual es obtenido por medio de la transcriptasa reversa (Paterson,
1996. Tomado de Prieto, 2003).
Dado que un microsatélite es una repetición que no codifica para la formación de
proteína y debido a que las secuencias de ADN repetitivo pueden recombinarse y
expandirse más frecuentemente que otros tipos de secuencias, estas regiones son
a menudo altamente variables y consecuentemente útiles para medir similitud
entre especies y variedades muy relacionadas. Pueden o no estar asociadas con
genes (Langecrantz et al, 1993. Tomado de Prieto, 2003).
13
La técnica de marcadores microsatélites requiere el diseño y síntesis de “primers”
lo cual requiere mucho trabajo y es una de las limitaciones en el uso de ésta
técnica.
3.3 MEJORAMIENTO GENÉTICO DE LA YUCA EN COLOMBIA
Colombia es la sede de uno de los pocos programas de mejoramiento genético de
yuca que hay en el mundo. En Colombia, el Centro Internacional de Agricultura
Tropical – CIAT, en su programa de Mejoramiento Genético de Yuca, se encarga
de este trabajo.
Desde 1969 el programa de Mejoramiento Genético de Yuca de CIAT, planteó la
hipótesis de considerar la “variedad” como factor limitativo tecnológico en las
zonas donde regularmente se cultiva yuca. Fue así como surgió la necesidad de
tener alternativas de variedades frente a las locales con potenciales mayores de
rendimiento, almidón, contenido de proteína, resistencia a plagas y enfermedades,
etc. (CIAT, 1981).
En los objetivos planteados en el mejoramiento de la mayoría de los cultivos,
incluyendo la yuca, se busca aumentar el rendimiento por unidad de área,
asegurar la estabilidad de la producción y mantener o mejorar la calidad del
producto para que éste satisfaga las necesidades del consumidor final. La
estabilidad de la producción es importante y se logra cuando el material
desarrollado tiene tolerancia o resistencia genética frente a los principales factores
bióticos y abióticos que limitan la producción.
Como la yuca por lo regular se cultiva en ambientes marginales susceptibles a
sequías o inviernos prolongados, una variedad exitosa deberá poseer cualidades
que le permitan llevar éstas y otras adversidades. Cada ambiente donde se cultiva
la yuca tiene su propia lista de factores limitantes de producción. Por ejemplo, en
la Costa Norte de Colombia, la ausencia de lluvias y la poca disponibilidad de
agua es el principal factor abiótico limitante de la productividad. En cuanto a
14
plagas y enfermedades, los ácaros (Mononychellus tanajoa), los trips (Frankliniella
williamsi) y el gusano barrenador del tallo (Chilomima clarkey) representan los
problemas más comunes. En el Valle del Cauca, en cambio, no hay problema en
la disponibilidad de agua y eso implica que las principales plagas sean, mosca
blanca (Aleurotrachelus sociales Bondar), bacteriosis (Xanthomonas axonopodis
pv. Manihotis), superalargamiento y cuero de sapo.
Todas estas observaciones se integran al proceso de mejoramiento genético para
cada ecoregión, de modo que los materiales resultantes posean buenos niveles de
tolerancia o resistencia a estas adversidades (Ceballos et. al, 2002).
El material genético que se produce debe también satisfacer adecuadamente las
necesidades del consumidor final. Entre éstos, se pueden describir: Consumo
fresco; yuca procesada para alimentación humana; almidones y energía para
dietas animales (Ceballos et. al, 2002).
El proceso de mejoramiento de yuca, se ha desarrollado a partir de dos sistemas,
el sistema convencional y la investigación participativa. El sistema convencional,
es el cruzamiento de clones superiores seguido de un proceso de evaluación
clonal y selección. El material seleccionado en un centro es vegetativamente
distribuido y probado en diferentes localidades (Lozano et al. 1983). En este
proceso, la comunicación del fitomejorador con el sector compra/venta del
producto agrícola, con el procesador y, en última instancia, con el consumidor final
es, generalmente muy limitada.
Sin embargo, en años recientes se ha dado más énfasis en la integración de los
distintos componentes de una determinada cadena productiva, donde el sistema a
través de las metodologías de “investigación participativa” se busca mejorar las
necesidades del agricultor y el usuario final. (Ceballos et. al, 2002).
El proceso de mejoramiento genético de yuca en Colombia, comienza con la
selección de padres para el cruzamiento, que deben ser de gran producción y
adaptación a los ambientes específicos donde serán cultivados. El CIAT cuenta
15
con el Banco Mundial de Germoplasma de Yuca, el cual tiene mas de 6000
variedades provenientes de África, Asia y América, que representan una gran
parte de la variabilidad genética, no solo de Manihot esculenta, sino de numerosas
especies silvestres de las que se pueden extraer valiosos genes. Otros materiales
también usados como parentales son los clones de yuca provenientes del
programa de mejoramiento genético que empezó en la década de 1970, muchos
de estos genotipos elegidos como parentales se caracterizan por su alta
productividad de materia seca, (por ejemplo MTAI-8, SM1565-15 y SM1219-9),
otros por la excelente calidad para la industria de alimentos procesados para
consumo humano (MPER183 y SM1460-1), reconocida capacidad combinatoria
para producir buenas progenies (SM805-15 y SM1565-17), características
especiales como la resistencia a la pudrición de raíces (CM4574-7) ó materiales
con pulpa de coloración amarilla que indican altos contenidos de carotenos. Otros
progenitores, para nuevos genotipos, son los materiales de África, que poseen
resistencia al mosaico africano de la yuca (ACMD), aunque la enfermedad no esta
presente en las Américas, su insecto vector (Bemisia tabaci) se ha detectado en
Brasil, Ecuador, República Dominicana y Puerto Rico (Ceballos et. al, 2002).
Después de seleccionados los progenitores y obtener la semilla botánica, las
progenies son evaluadas para seleccionar los genotipos que superen una o
muchas características a los mejores materiales actualmente disponibles
(Ceballos et. al, 2002).
Los genotipos obtenidos en los cruzamientos son multiplicados en lotes aislados,
hasta obtener 8 clones de cada uno, se identifican adecuadamente y son enviados
a los denominados “campos de observación” en las diferentes zonas de
adaptación específica (por ej. Caribe subhúmedo). Aquí se aprecia la enorme
variabilidad genética obtenida en los cruzamientos de los progenitores
seleccionados. Para explorarla, es necesario evaluar un número grande de
familias segregantes. Actualmente se plantan entre 1500 y 2000 familias en estos
ensayos. Se efectúa una selección muy estricta que reduce hasta un rango de 200
16
a 300 los clones que pasarán a la siguiente etapa de evaluación y selección. Esta
selección se hace con un número pequeño de plantas (hasta 8) y una sola
repetición y se basa principalmente en características altamente heredables.,
como por ej. el tipo de planta.
Una vez hecha la primera selección en el campo de observación, que permite
reducir el número de familias, se inician las evaluaciones con parcelas y
repeticiones más grandes. A medida que el proceso avanza, la selección se
concentrará más en características de baja heredabilidad, como rendimiento.
Después de realizados ensayos preliminares y avanzados de rendimiento, entre
los 5 y 10 mejores genotipos se incorporan en las “pruebas regionales”, es decir,
se plantan en varios sitios representativos de cada ecoregión. Los materiales que
después de 2 años de pruebas regionales, no logran superar los testigos, son
eliminados de las pruebas. Los clones que logran superar, en una o varias
características a los testigos de las pruebas regionales pasan a una evaluación
que los conduce a una posible liberación como variedad. Normalmente este
proceso queda a cargo de CORPOICA, entidad encargada de la difusión y
liberación de las variedades (Ceballos et. al, 2002).
Además del Programa de Mejoramiento de Yuca de CIAT, ICA ha realizado
también trabajos de mejoramiento de yuca. En 1962, realizó cruzamientos entre
variedades promisorias seleccionadas incrementándose en los años 1974 y 1975.
De este programa de cruzamiento se escogieron las variedades CMC9, CMC40 y
CMC76.
ICA, en 1971, obtuvo híbridos de yuca a partir de semilla irradiada de la variedad
CMC9 (Llanera), con el objetivo de incrementar la variación en una forma artificial
y posteriormente evaluar y seleccionar los materiales promisorios. Después de
cinco años de evaluación en pruebas de rendimiento y pruebas regionales se
seleccionaron varios híbridos.
17
En julio de 1975 la variedad Llanera (CMC9) que se adapta bien a alturas de 100
hasta 1200 m.s.n.m. en el Valle del Cauca y Meta, fue seleccionada, recomendada
y registrada como variedad en el Ministerio de Agricultura.
En julio de 1984, entregó oficialmente las variedades CMC40 con el nombre
Manihoica P-11 y CMC76 con el nombre Manihoica P-12, que alcanzan
rendimientos de 29.6 y 25.2 t/ha, respectivamente, en condiciones favorables, se
adaptan entre el nivel del mar y los 1500m de altitud. En diciembre de 1986 se
entregó la variedad P-13 (HMC1) que se adapta muy bien a los valles
interandinos, a alturas entre 700 y 1500 m.s.n.m. (Luna, 1991).
Actualmente CORPOICA, no realiza cruzamientos y/o mejoramiento genético
propiamente dicho, sino que aprovecha los resultados del programa de
mejoramiento de yuca del CIAT y evalúa los materiales promisorios de acuerdo
con las necesidades de Colombia, recomienda cruzamientos de algunas
variedades regionales con otras mejoradas por CIAT, tratando de encontrar o
reunir algunas características deseables.
18
4. ANTECEDENTES
4.1 ESTUDIO DE DIVERSIDAD GENÉTICA DE YUCA USANDO L A TÉCNICA DE MICROSATELITES
Recientemente los marcadores Microsatélites (SSR – Simple Sequence Repeat)
se han usado para estudios de diversidad genética de yuca en diferentes países.
El CIAT ha empleado ésta técnica para evaluar la diversidad genética de la yuca
en centros de producción y diversidad, principalmente en África y Latinoamérica,
los avances en estos trabajos han aumentado el conocimiento de la variación
genética del cultivo.
A partir de varios trabajos de diversidad y diferenciación genética se han
identificado 36 marcadores microsatélites como los de mayor polimorfismo (Mba
et. al, 2001), lo que ha permitido desarrollar estudios en países como Sierra Leona
(Dixon, 2003), Uganda (Kizito, 2003), Nigeria (Dixón, 2002), Ghana (Okay, 2003),
Perú (Alcántara, 2001), Guatemala (Monte, 2003) y Cuba (Beovides, 2004). Los
resultados de éstos trabajos han encontrado altos valores de diversidad en los
países estudiados y se ha evidenciado subestructura en poblaciones Africanas,
aspectos positivos para el mejoramiento del cultivo.
Aunque en algunos de estos trabajos se han incluido variedades colombianas
provenientes del Banco de Germoplasma de CIAT, para determinar diferencias
entre éstas y accesiones de otros países, en Colombia no se han realizado
estudios de diversidad genética que incluyan accesiones de yuca colectadas in
situ, en el país ó alguna región de éste.
19
4.2 VARIEDADES DE YUCA MEJORADAS GENÉTICAMENTE LIB ERADAS EN LA COSTA ATLÁNTICA
El CIAT, y su programa de mejoramiento de yuca, desarrollar trabajos enfocados a
obtener variedades mejoradas de yuca. ICA-CORPOICA, lo estuvo realizando en
algún tiempo, pero ahora se encarga solo de la transferencia y liberación de los
materiales mejorados por CIAT.
Las variedades de yuca mejoradas comienzan a partir de la variedad Venezolana,
ésta fue introducida en la región de forma espontánea en 1968 por agricultores
que habían ido a trabajar al Estado de Zulia (Venezuela). Luego, la variedad fue
caracterizada por el CIAT e introducida en el banco de germoplasma y se
denominó MCOL 2215. Esta variedad fue evaluada por el programa de
Mejoramiento de Yuca del CIAT, en ensayos de rendimiento y pruebas regionales
desde 1979. Debido a su buen comportamiento, fue promovida por las
Instituciones como parte del proyecto integrado de yuca (Gottrer y Henry, 1994).
ICA, en el año 1984, entregó oficialmente la variedad Manihot P-12, que alcanzan
rendimientos promedios de 25.2 t/ha en condiciones favorables. (Luna, 1991).
En 1988, el Programa de Yuca del Centro Internacional de Agricultura Tropical
(CIAT), con la colaboración del Instituto Colombiano Agropecuario (ICA), las
Secretarias de Agricultura de Bolívar y Córdoba, y pequeños productores de la
Costa Atlántica; realizó en esta zona un trabajo sobre “Evaluación de nuevas
variedades de yuca con la participación de agricultores”. Para llevar a cabo esta
actividad, se tuvo en cuenta que los mejoradores desarrollaban variedades
productivas sin asegurar su aceptación y adopción por parte de los agricultores. Lo
anterior conducía a la producción de variedades con poca aceptación debido a la
escasa consideración de los criterios que tienen los agricultores de yuca para
seleccionar y aceptar una nueva variedad (Hernández, 1993).
De éste trabajo, con la participación conjunta de investigadores y productores, se
logró en 1991 la liberación de la variedad ICA Costeña (CG1141-1) y en 1993, ICA
Negrita (CM3306-4) a través del Instituto Colombiano Agropecuario (ICA). Estas
variedades alcanzaron rendimientos hasta de 24 t/ha, 30.4 t/ha respectivamente
20
en tres pruebas regionales en localidades del departamento del Atlántico (Ceballos
et. al, 2002).
En el año 2000 la Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria
CORPOICA, también a través de trabajos de mejoramiento participativo, liberó las
siguientes variedades para consumo fresco e industrial: CORPOICA Colombiana
(CM3306-19), CORPOICA Sucreña (CM 3555-6), CORPOICA Caribeña (SGB
765-2) y CORPOICA Rojita (SGB 765-4), cuyas producciones en raíces frescas en
promedio fueron 25 t/ha, 26 t/ha, 17.4 t/ha y 15.5 t/ha respectivamente (Lopéz et.
al, 2000).
En el año 2004, se liberaron oficialmente, cinco nuevas variedades de yuca para
uso industrial en la región. Las variedades liberadas corresponden a los nombres
de CORPOICA Caiseli, CORPOICA Orense, CORPOICA Tai, CORPOICA
Verónica, y CORPOICA Ginés. Los rendimientos de yuca fresca de estas
variedades obtenidas de evaluaciones en cultivos comerciales manejados por
agricultores fueron en promedio, 33.6 t/ha para CORPOICA Caiseli, 50 t/ha para
CORPOICA Orense, 29.3 t/ha para CORPOICA Tai, 28.6 t/ha para CORPOICA
Verónica y 27.3 t/ha para CORPOICA Ginés (CIAT, CORPOICA, CLAYUCA, MADR,
2001).
4.3 ESTUDIOS QUE HAN DETERMINADO EL GRADO DE ADOPCI ÓN DE VARIEDADES DE YUCA MEJORADAS Y LIBERADAS POR CIAT E ICA-CORPOICA EN LA COSTA ATLÁNTICA
Gottrer y Henry (1994), realizaron un trabajo sobre la importancia de los estudios
de adopción e impacto de nuevas tecnologías. Dentro de los diversos análisis
realizados, reportan el estudio de adopción de variedades mejoradas en la Costa
Norte de Colombia. En este estudio se analiza la adopción de dos variedades
mejoradas de yuca, la variedad Venezolana y la variedad MP12 (CMC76), y una
variedad mejorada de mejorada de maíz para la siembra en asocio con yuca.
Se identificaron áreas con diferente nivel de influencia tecnológica usando dos
criterios: presencia institucional, y número de años y años de operación de las
21
plantas de secado existentes en cada municipio estudiado. Con esta información
el área de estudio se dividió en tres niveles:
Nivel 1: Alto nivel de influencia de tecnología. Municipios donde se han instalado
plantas de secado natural de yuca antes de 1988 y existe buena presencia
institucional (visita de técnicos y acceso a créditos).
Nivel 2: Medio nivel de influencia tecnológica. Municipios donde se han instalado
plantas de secado después de 1988, presencia institucional con capacitación,
investigación, asesoría de técnicos y acceso al crédito.
Nivel 3: Bajo nivel de influencia tecnológica. Municipios donde no existen plantas
de secado y la presencia institucional dedicada a hacer investigación y extensión
en el cultivo de yuca es bastante bajo o ausente.
En este estudio se observó que la primera fase del proceso de adopción de yuca
es larga, y es cuando los agricultores que siembran la variedad, están empezando
a experimentarla y conocerla. La yuca, cuya reproducción vegetativa y tasa de
multiplicación es mas baja, era lógico pensar que esta primera fase del proceso de
adopción fuera lento.
Para el caso de la variedad Venezolana esta fase duró alrededor de diez a doce
años. La variedad MP12 liberada en 1984, se encontraba en su primera fase y
pocos agricultores la estaban sembrando (2.5% de los productores).
En el trabajo se concluye que es necesario buscar formas más eficientes y
efectivas de multiplicar la semilla de yuca de las variedades mejoradas y de que
ésta llegue a los agricultores.
López (1999), realizó un estudio sobre la Adopción de Variedades de Yuca
Generadas por el Mejoramiento Clásico y por la Selección Varietal Participativa en
la Región Caribe de Colombia en los departamentos de Córdoba, Sucre Bolívar y
Atlántico. El objetivo específico fue presentar y discutir el nivel de adopción de
Manihoica P-12, generada por el mejoramiento clásico, y de dos variedades, ICA
Costeña e ICA Negrita, seleccionadas por los agricultores mediante la
metodología IPMY (Investigación Participativa aplicado en Mejoramiento de Yuca).
22
Los agricultores encuestados se clasificaron por estratos, los cuales fueron
definidos según el “nivel tecnológico” de los agricultores de cada municipio. El
estrato alto se definió como agricultores de los municipios donde hay plantas de
secado natural de yuca, hay una buena presencia institucional y se ha liberado
para ellos “semilla” (estacas) de alguna de las tres variedades mencionadas.
El estrato medio, es el grupo de los agricultores de los municipios donde hay
plantas de secado natural de yuca, hay una presencia institucional intermedia y no
se les ha liberado “semilla”; se encuentran, sin embargo, cerca de municipios en
los que se liberó semilla y cuyo nivel tecnológico es bajo.
El estrato bajo, eran agricultores de los municipios donde no existen plantas de
secado, la presencia institucional para la transferencia en el cultivo de la yuca es
bastante baja o está ausente y, además, en esos municipios no se liberó semilla
de ninguna de las tres variedades en estudio.
El estudio concluyó que, las variedades en cuya selección y liberación participaron
los agricultores tiene un incremento relativo de adopción mucho mayor que la
variedad liberada por el mejoramiento clásico, auque su tasa de adopción no haya
sido muy alta.
La adopción varía con el nivel tecnológico: mientras ICA-Negrita fue más adoptada
por agricultores del nivel medio, ICA-Costeña y MP-12, lo fueron en el nivel medio.
La mayor parte de los agricultores que pertenecen al nivel tecnológico bajo no
plantan, ni han plantado las variedades ICA-Costeña e ICA-Negrita; la mayoría de
los que conocen a MP12, la planta aún o la han plantado alguna vez.
Es mayor el porcentaje de agricultores que plantan las variedades en cuya
selección han participado son más, y lo hacen porque éstas dan mayor producción
y más rendimiento que la variedad liberada por el mejoramiento clásico y
tradicional. Este hecho indica que la finalidad para la cual se desarrollaron dichas
variedades se ajustó a las preferencias de los agricultores cultivadores de yuca.
La principal razón que impide a los agricultores plantar las variedades es la difícil
consecución de su “semilla” (estacas); esto ocurre porque la liberación oficial de
las variedades no va acompañada de proyectos efectivos para la producción de
23
“semilla”. Los programas de mejoramiento que deseen lograr la rápida adopción
de una variedad y hacer un impacto verdadero con ella, deben planear la
producción acelerada de “semilla” en las fases finales de la evaluación y en la
primera de la liberación; la tasa de multiplicación normal de la especie (por estaca)
es muy baja y no garantiza una rápida difusión de las nuevas variedades.
24
5. MATERIALES Y MÉTODOS
5.1 UBICACIÓN La colecta de las variedades de yuca sembradas por pequeños agricultores, se
realizó en fincas que comprendían entre 0.5 ha y 12 ha en los departamentos de
Córdoba, Sucre, Atlántico y Magdalena, éstos departamentos están políticamente
organizados por municipios. El departamento de Bolívar se descartó en este
proceso debido a los problemas de orden social. El material colectado fue llevado
y sembrado en invernaderos de CIAT (Centro Internacional de Agricultura
Tropical) ubicado en Palmira (Valle del Cauca). El trabajo para el análisis
molecular, se realizó también en CIAT en el laboratorio del programa de Genética
de Yuca.
5.2 METODOLOGÍA
5.2.1 Metodología de campo Se realizó un muestreo por conglomerados, el cuál consiste en seleccionar
aleatoreamente un cierto número de conglomerados (el necesario para alcanzar el
tamaño muestral establecido) y en investigar después, todos los elementos
pertenecientes a los conglomerados elegidos.
Tipo de Muestreo: Conglomerado polietápico, considerando el conglomerado
como el grupo de cultivadores existente en cada Municipio. El muestreo se aplicó
en dos etapas:
• Etapa 1 se selección aleatoria del municipio en cada Departamento.
• Etapa 2 selección aleatoria de las fincas a visitar dentro del municipio.
Se garantizo la aleatoriedad de selección en cada etapa con el fin de evitar sesgos
de selección.
25
Tamaño de muestra: Se utilizó la formula para le cálculo de tamaños de muestra
en Proporciones teniendo como variable principal P
P= % de fincas con variabilidad genética de yuca sembradas en
cultivos de pequeños agricultores. Además se consideraron los siguientes supuestos.
• Como no se conocía la cantidad total de fincas, se supuso la existencia de
un N= infinito de fincas de pequeños agricultores, esto permitió una muestra
estable en cantidad de muestras de fincas a seleccionar.
• No se disponía de valores previos de la variable principal P se escogió un
valor de 50% (0.5), el cual garantiza un tamaño de muestra
suficientemente grande que cubre la mayor variabilidad existente en una
población.
• Por organización y disponibilidad de recursos logísticos de trasporte,
desplazamiento y seguridad en la zona se dispuso solo visitar 10 fincas en
cada conglomerado (municipio). Para un total de muestra de 400 fincas se
escogieron 40 municipios, distribuidos porcentualmente en cada
departamento (Cuadro 1).
• El efecto de diseño deff se considero en 2 por tener dos etapas de
selección aleatoria.
• La Tasa de Perdida ß es el % esperado de no respuesta de parte de los
agricultores.
• Para el nivel de confianza z se utilizó la distribución Normal Standar.
• El erro d es el esperado por el investigador.
Fórmulas y parámetros utilizados:
Tamaño de Muestra n0 = (z2 pq)/d
2
ajuste de muestra para poblacines finitas n1 = n0 /(1+(n0/N))
Ajuste por tasa de no respuesta (ß) n2 = n1/ (1-ß)
Ajuste por efecto del diseño (deff) n = n2 * deff
26
Tabla 1 : Distribución del número de municipios y número de fincas a visitar de pequeños agricultores de la Costa Atlántica según tamaño de muestra.
DEPARTAMENTO TOTAL DE MUNICIPIOS POR DEPARTAMENTO
No. DE MUNICIPIOS A VISITAR
No. DE ENCUESTAS Y/O
FINCAS A VISITAR
ATLÁNTICO 23 10 100
MAGDALENA 21 9 90
CÓRDOBA 26 11 110
SUCRE 24 10 100
TOTAL 94 40 400
p = 50,0% % de fincas con variabilidad genetica en yuca sembradas en cultivos de pequeños agricultores
q = 50,0% % de fincas sin variabilidad genetica en yuca sembradas en cultivos de pequeños agricultores
N = 20000 Numero infinito de fincas
ß = 7,5% Tasa pérdida
deff = 2 Efecto de diseño
z = 1,64 Nivel de Confianza 90%
d = 0,06 Error del Investigador
n= 400 Muestra de Fincas
m = 40 Número de conglomerados = Municipios
n/m 10 Número de fincas a visitar por Municipio
27
Los municipios visitados en cada departamento fueron:
ATLÁNTICO MAGDALENA CÓRDOBA SUCRE
1. Repelón 1. Santa Marta 1. Buenavista 1. Toluviejo
2. Malambo 2. Sitio Nuevo 2. Pueblo Nuevo 2. San Antonio de Palmitos
3. Baranoa 3. Ciénaga 3. San Pelayo 3. San Pedro
4. Sabanagrande 4. Remolino 4. Planeta Rica 4. Los Palmitos
5. Polonuevo 5. Aracataca 5. Cerete 5. Since
6. Santo Tomas 6. Salamina 6. San Carlos 6. Betulia
7. Palmar de Varela 7. Pivijay 7. Cienaga de Oro 7. Corozal
8. Luruaco 8. Fundación 8. San Andrés 8. Sincelejo
9. Sabanalarga 9. Momil 9. La Unión
10. Ponedera 10. Sahagún 10. Sampues
11. Chinú
La colecta del material en el departamento de Magdalena, fue realizada en época
de lluvia, por lo que era imposible acceder a algunos municipios por el mal estado
de las carreteras, debido a esto, sólo se visitaron 8 municipios y se realizaron 11
encuestas en cada uno.
Las preguntas realizadas en la encuesta (anexo 1), estaban enfocadas al
conocimiento por parte del agricultor de las variedades sembradas en su finca y se
solicitó una muestra de estacas o semilla de cada variedad considerada diferentes
por ellos.
5.2.2 Metodología de laboratorio El análisis de la variabilidad genética de hizo a partir de la técnica de marcadores
moleculares tipo microsatélites. El proceso y la metodología se describen a
continuación:
28
Del material sembrado en invernadero, se colectaron muestras de hojas jóvenes y
cogollos, se secaron en un hormo a 40 °C durante tr es días. Posteriormente, se
extrajo ADN utilizando el método de Dellaporta (Dellaporta et. al, 1983).
La calidad del ADN fue observada en geles de agarosa al 1% (figura 1), se
cuantificó en el fluorómetro y se realizaron diluciones a una concentración de 10
ng/µl de ADN.
Figura 1 . Gel de calidad de ADN de 30 muestras escogidas al azar de semilla de
yuca de pequeños agricultores de la Costa Atlántica Colombiana. Las amplificaciones fueron realizadas en los termocicladores PTC-100 vía PCR
usando el programa 30 ciclos a: 94 °C 30”; 55 °C 30 ”; 72 °C 1 min, y una extensión
de 5 min a 72 °C.
El producto de la amplificación se corrió en geles denaturantes de poliacrilamida
(6% acrilamida) y se hizo un revelado de tinción con plata. Posteriormente se hizo
la lectura de los geles y toma de datos para el análisis estadístico molecular.
Se usaron nueve marcadores microsatélites los cuales se escogieron de un grupo
de 36 SSRY que fueron establecidos en trabajos anteriores de diversidad, como
los de de mayor polimorfismo para análisis de diversidad y diferenciación genética
(anexo 2) (Mba et. al, 2001).
El procedimiento para seleccionar los 9 marcadores se describe a continuación:
Con los 36 marcadores microsatélites se realizó un análisis preeliminar a 30
muestras de la población. Después de obtener las lecturas de los geles de
29
poliacrilamida, se descartaron los monomórficos, y de los polimórficos, se
seleccionaron visualmente 18 SSRY, aquellos que presentaron los mayores
polimorfismos.
Estos 18 SSRY fueron evaluados en el programa de computación CERVUS y se
escogieron los nueve (9) que tuvieran el PIC (Polymorphic Information Content –
Contenido de Información Polimórfica) más alto (anexo 3), adicionalmente se
consideró la ubicación de estos marcadores en el mapa genético de yuca para
tener una buena cobertura del genoma (anexo 4). Los marcadores seleccionados
fueron: SSRY 12, SSRY 51, SSRY 63, SSRY 82, SSRY 100, SSRY 135, SSRY 151,
SSRY 155, SSRY 179 (figura 2).
Figura 2 . Prototipo del polimorfismo de los nueve SSRY seleccionados para el estudio de la variabilidad genética de genotipos de yuca de pequeños
agricultores de la Costa Atlántica Colombiana.
SSRY 135
SSRY 63 SSRY 51 SSRY 12
SSRY 82 SSRY 100
SSRY 151 SSRY 155 SSRY 179
30
Para el estudio molecular también se adicionaron del Banco de Germoplasma de
Yuca de CIAT, 14 genotipos que corresponden a variedades locales y variedades
mejoradas originales, liberadas en la región y proveniente del programa de
mejoramiento. Estas muestras del Banco de Germoplasma fueron el control para
constatar la existencia de dichas variedades en la región. Las variedades fueron:
Corpoica Gines (CM 4843-1), Corpoica Colombiana (CM 3306-19), Corpoica
Sucreña (CM 3555-6), Corpoica Verónica (CM 4919-1), ICA Costeña (CG 1141-1),
ICA Negrita (CM 3306-4), SM 1433-4, ICA P-12 (MCOL 1505), Cubana (CM
4574-7), Venezolana (MCOL 2215), Blanca Mona (MCOL 2253), Secundina
(MCOL 2063), MTAI-8, MVEN-25.
5.2.3 Análisis de datos El número de alelos y la diversidad genética (heterocigosidad) son los medios más
usados para estimar la variación genética cuando ésta es medida por diferencias
alélicas en varios loci por electroforesis (Nei, 1987).
Los marcadores de diversidad que se obtuvieron a partir de los marcadores
codominantes microsatélites fueron: Número de loci polimórficos/número total de
loci analizados; Número promedio de alelos por locus; Heterocigosidad esperada
(He); Heterocigosidad observada (Ho) y coeficiente de diferenciación genética
(Gst).
Las gráficas de ordenación se elaboraron con base en las coordenadas obtenidas
para los individuos con un análisis de correspondencia múltiple (ACM), utilizando
programas elaborados en SAS bajo un ambiente UNIX (CIAT, SAS: Versión 9.1.3).
Los parámetros de diversidad genética: porcentaje de loci polimórficos, número
medio de alelos por locus polimórfico, heterocigosidad promedio observada (Ho), y
diversidad genética promedio (He) (Nei, 1978) fueron estimados con el uso del
programa SAS.
La información colectada en las encuestas fue organizada, seleccionada y
graficada en tablas dinámicas en Excel. Se estableció el porcentaje de adopción
de las variedades mejoradas y liberadas por CIAT e ICA-CORPOICA, y las zonas
31
con mayor intensidad en el cultivo de éstas variedades. De igual forma se logró
realizar un análisis sobre aspectos generales del cultivo como: donde se adquiere
la semilla, finalidad de la producción, asistencia técnica y problemas fitosanitarios
del cultivo.
32
6. RESULTADOS Y ANÁLISIS
Se visitaron y encuestaron 400 agricultores de la Costa Atlántica Colombiana que
incluyeron los departamentos de Atlántico, Magdalena, Córdoba y Sucre. Se
colectaron 1045 genotipos de yuca, de los cuales 717 presentaron información
molecular completa, es decir, aquellas muestras que presentaron alelos en todos
los nueve marcadores microsatélites seleccionados. El análisis fue realizado con
éstos 717 genotipos y 14 variedades control del Banco de Germoplasma de CIAT.
6.1 RELACIONES GENÉTICAS ENTRE GENOTIPOS
Para conocer las relaciones genéticas entre los 717 genotipos y definir los
agrupamientos, se realizó el Análisis de Correspondencia Múltiple (ACM).
La finalidad del ACM, es definir los grupos o categorías que estén separadas unas
de otras y, a su vez que, dentro de cada categoría estén los genotipos más
próximos unos a otros.
Se definieron seis grupos genéticamente diferentes, los cuales explican el 81% de
variación (figura 3, anexo 5). Los grupos fueron definidos como Grupo1, Grupo2,
Grupo3, Grupo4, Grupo5 y Grupo6.
33
Figura 3 . Agrupamiento de los 717 genotipos de yuca cultivada por pequeños
agricultores de la Costa Atlántica Colombiana, mediante ACM
En el Grupo1, el 85.5% de los genotipos corresponden a la variedad Venezolana;
en el Grupo3, el 85% equivale a la variedad ICA Costeña; en el Grupo6, el 71.3%
es de la variedad Banca Mona y en el Grupo5, el 43.3% corresponde a la variedad
ICA P-12 (figura 4).
Teniendo en cuenta los porcentajes de presencia de éstas variedades en cada
grupo es posible considerarlas como representativas de éstos. Los otros genotipos
que se ubican en cada uno de estos grupos están relacionados genéticamente.
Grupo 2
Grupo 1
Grupo 3
Grupo 4
Grupo 5
Grupo 6
Grupo1 Grupo2 Grupo3 Grupo4 Grupo5 Grupo6
34
Grafico4
0,9%
2,2%
2,2%
2,9%
2,9%
3,6%
4,3%
5,0%
5,0%
5,8%
9,4%
12,2%
0,0% 2,0% 4,0% 6,0% 8,0% 10,0% 12,0% 14,0%
OTRAS
Manteca
Guarumera
Santanera
Brasilera
SM 1433-4
Venezolana B
Pie de paloma
Montero
Lengua de venado
Blanca mona C
SECUNDINA (COL 2063)
Grafico5
0,1%
4,5%
4,5%
6,0%
10,4%
20,9%
43,3%
0,0% 20,0% 40,0% 60,0%
OTRAS
Polvo de la prima
Chirosa
Ica negrita
Blanca mona D
Venezolana C
ICA P-12 (MCOL 1505), ICA VERDECITA
Grupo3
0,7%
5,4%
85,1%
0,0% 20,0% 40,0% 60,0% 80,0% 100,0%
OTRAS
Secundina
ICA COSTENA (CG1141-1)
Grupo6
0,1%
3,0%
9,0%
71,6%
0,0% 21,0% 42,0% 63,0% 84,0%
OTRAS
Montero
Sofa
BLANCA MONA (COL2253)
Grupo1
0,5%
1,4%
2,7%
85,5%
0,0% 20,0% 40,0% 60,0% 80,0% 100,0%
OTRAS
Blanca mona A
CORPOICA VERONICA(CM 4919-1)
VENEZOLANA (MCOL2215)
Grafico2
0,7%
1,3%
1,3%
1,3%
1,3%
1,3%
2,0%
2,0%
2,0%
2,7%
2,7%
2,7%
2,7%
3,3%
5,3%
12,0%
14,7%
23,3%
0,0% 5,0% 10,0% 15,0% 20,0% 25,0%
OTRAS
ICA SUCRENA (CM 3555-6)
Montero
Juana la verde
CM 4919-1
CARIBENA (SGB 765-2)
Sabrocita
Polvo de la prima
Blanca mona B
CORPOICA GINES (CM4843-1)
P-12
MVEN 25
Yema de huevo
ICA NEGRITA (CM 3306-4)
Luis
CUBANA (CM 4574-7)
MTAI - 8
Venezolana A
35
Figura 4 . Distribución de genotipos de yuca en los grupos definidos por el ACM
Las características morfológicas de las variedades que representan los grupos
Grupo1, Grupo3, Grupo6 y Grupo5; también identifican, en gran parte, las
diferencias de cada grupo, como se describe en la tabla 2.
Tabla 2. Características morfológicas de las variedades representativas de los grupos Grupo1, Grupo3, Grupo6 y Grupo5 establecidos en el ACM
CARACTERÍSTICA
Grupo/ Variedad representativa Grupo1
COL 2215 Grupo 3
CG 1141-1 Grupo 6
COL 2253 Grupo5
COL 1505 Altura de planta 120 140 210 215 Altura de la primera ramificación 75 105 95 85 Niveles de ramificación 4 2 3 4 Habito de ramificación Tricotomo Tricotomo Tricotomo Tricotomo Angulo de ramificación 47,5 50 57,5 47,5 Color de las ramas terminales Verde Verde Verde Verde Tipo de planta Cilíndrica Parasol Parasol Cilíndrica Color hoja Apical Morada Verde claro Verde oscuro Verde claro Color de la hoja desarrollada Verde oscuro Verde claro Verde Verde claro Color de la nervadura Verde claro Verde Verde Verde claro
Color del pecíolo Verde claro Rojo poco
Verde Rojo poco
Verde Verde claro Longitud del pecíolo 26 28,5 32 35
Forma del lóbulo central Lanceolada Elipt.-
Lanceolada Elipt.-
Lanceolada Lanceolada Longitud del lóbulo 19 16 20,7 18,5 Ancho del lóbulo 4,4 4,9 5,9 4,9 Numero de lóbulos de la hoja 7 7 7 7 Filotaxia Medio Corto Medio Corto (<8cm) Color externo del tallo Verde amarillo Café claro Color de la epidermis del tallo Crema Crema Crema Habito crecimiento del tallo Recto Recto Recto Recto
Forma de la raíz Conca
cilíndrica Conca
cilíndrica Conca
cilíndrica Conca
cilíndrica Color externo de raíz Café oscuro Café oscuro Café claro Café oscuro Color pulpa de la raíz Blanco Blanco Blanco Blanco Color corteza de la raíz Rosada Blanco Blanco Rosada Presencia de pedúnculo de raíz Pendunculado Pendunculado Pendunculado Pendunculado Textura epidermis de la raíz Rugoso Rugoso Rugoso Lisa Pubescencia Presente Presente Presente Presente
Fuente: Nelson Morante. Base de datos del programa de mejoramiento de yuca CIAT
36
El Grupo2 y Grupo4 (figura 4, anexo 6), son los grupos que tienen el mayor
número de genotipos, y se presentan en bajos porcentajes, debido a su
variabilidad es difícil establecer características específicas que identifiquen estos
grupos.
En el análisis de cada uno de los grupos se observó también que algunos
genotipos que tenían nombres iguales a las variedades Venezolana, Blanca mona,
P-12 e ICA Negrita, en el ACM no se agruparon con éstas, sino, que se ubicaron
en otros grupos (figura 4), con los cuales tenían mayor afinidad con sus
características genéticas. Estos genotipos fueron denominados Venezolana A,
Venezolana B, Venezolana C, Blanca mona A, Blanca mona B, Blanca mona C,
Blanca mona D, P-12 A e ICA Negrita A.
En la figura 5, se observa las variedades mas sembradas por el pequeño agricultor
en la Costa Atlántica, Venezolana (26%), seguida de ICA Costeña (9%) y Blanca
Mona (7%). Las variedades P-12, MTAI-8, Cubana y Secundina, se sembraron en
porcentajes menores del 5%. El 46% de la yuca sembrada equivale a varios de
otros genotipos mencionados por los agricultores (anexo 6).
9%
4% 3% 3% 2%
7%
46%
26%
0%
10%
20%
30%
40%
50%
OTROSGENOTIPOS
VENEZOLANA(MCOL2215)
ICA COSTENA(CG 1141-1)
BLANCA MONA(COL 2253)
P-12 ICAVERDECITA
MTAI - 8 CUBANA (CM4574-7)
SECUNDINA(COL 2063)
37
Figura 5 . Distribución de variedades y genotipos de yuca presentes en cultivos de pequeños agricultores de la región de la Costa Atlántica colombiana
6.2 VARIABILIDAD GENÉTICA
Se estudió la variabilidad genética de los 717 genotipos de yuca cultivados por los
pequeños agricultores de la Costa Atlántica Colombiana, usando 9 loci
microsatélites, cada uno con un promedio de 4.6 alelos por locus (AP), variando
entre 3 y 7 alelos para un total de 42 alelos (anexo 7).
Los valores de heterocigosidad observada (Ho), heterocigosidad esperada (He)
por cada loci y la localización de los loci en el mapa (anexo 4), se muestran en la
tabla 3.
Tabla 3. Variabilidad genética de yuca de pequeños agricultores de la Costa Atlántica Colombiana y ubicación de los 9 loci en los cromosomas del mapa genético de yuca.
Loci Ubicación del
loci No. de alelos
por locus Ho
He
Cromosoma* y82 B 6 0,7480 0,53856 y179 F 5 0,3542 0,43596 y135 G 4 0,6744 0,56336 y12 H 4 0,4755 0,40652 y63 H 4 0,4183 0,46355 y51 I 5 0,6172 0,57631 y100 K 7 0,4986 0,53650 y151 nd 4 0,8529 0,55458 y155 nd 3 0,4087 0,44987
AP HI HS HT 4.6 0.56087 0.50280 0,61692
*Letra asignada al cromosoma en el mapa genético de yuca nd: sin dato de ligamiento Ho: Heterocigosidad observada
38
He: Heterocigosidad esperada AP: Número medio de alelos por locus polimórfico HI : Promedio Heterocigosidad observada HS : Promedio ponderado de Heterocigosidad esperada HT : Heterocigosidad total
El promedio de la heterocigosidad observada (HI) fue alta con un valor de 0.56087,
lo cual confirma el entrecruzamiento en la yuca y su naturaleza altamente
heterocigota. El promedio ponderado de la heterocigosidad esperada (Hs) fue
0.50280, representa el nivel de heterocigosidad que se encontraría si se dieran
cruzamientos al azar. La heterocigosidad total (HT) para todos los genotipos fue
alta con un valor de 0.61692, es decir, la heterocigosidad esperada de un individuo
en toda la población (tabla 3) (anexo 8).
A pesar de que se establecieron 6 grupos genéticamente diferentes en el ACM, el
coeficiente de diferenciación fue bajo (Gst: 0.18498), es decir que la variabilidad
no se debe a diferencias entre los grupos, sino dentro de los grupos, lo que se
confirma con los altos valores de Heterocigosidad esperada (He) dentro de cada
grupo (tabla 4).
Tabla 4. Heterocigosidad esperada de los grupos genéticos definidos en el ACM en la población de yuca de pequeños agricultores de la Costa Atlántica Colombiana
Población n He
Grupo1 222 0.37751 Grupo2 159 0.56988 Grupo3 75 0.50052 Grupo4 142 0.60670 Grupo5 68 0.51645 Grupo6 68 0.52690
Gst: 0,18498
39
n : Número de individuos He : Heterocigosidad esperada dentro de cada grupo Gst : Coeficiente de diferenciación genética entre grupos
En la tabla 4, se observa también, que el Grupo1 presenta la mas baja He
(0.37751) lo cual está relacionado con el alto porcentaje de la presencia de la
variedad Venezolana y muy bajo de otras variedades. Los grupos Grupo2 y
Grupo4 presentan los valores más altos de He y efectivamente son los grupos que
presentan el mayor número de genotipos, convirtiéndose en los que tiene una
mayor variabilidad genética (figura 4).
La variabilidad genética de la yuca está relacionada con su polinización cruzada,
cada individuo es naturalmente un híbrido con altos niveles de heterocigosidad.
Esta es realizada típicamente por acción de los insectos (Ceballos, De la Cruz,
2002).
Además de la alta alogamía (polinización cruzada) de la yuca y su reproducción
sexual, se debe tener en cuenta también la reproducción asexual de esta especie
y su amplia distribución geográfica.
La reproducción asexual puede ser una modalidad constante de reproducción,
pero también puede estar combinada con ciclos de reproducción sexual, que
permite la recombinación de la variación actual y, como tal, la generación de
nuevas formas o combinaciones.
Según Nason (2002), la evolución de la estructura genética y su mantenimiento en
el tiempo y en el espacio están sujetos a la acción de tres fuerzas evolutivas con
efectos divergentes. Por un lado, la selección natural y la deriva genética (fuerzas
eminentemente perturbadoras) que favorecen la diferenciación genética de una
población y por el otro, el flujo genético que favorece el intercambio de material
genético entre poblaciones.
La migración también forma parte de las causas en los cambios de las frecuencias
alélicas. Desde una perspectiva genética, el intercambio de genes entre
40
poblaciones debido a la migración de los individuos es un factor importante de
cambio genético. Si dos poblaciones difieren en las frecuencias de los alelos de
algunos de sus genes, entonces el intercambio de individuos producirá un cambio
de las frecuencias de los genes en las poblaciones (Barbadilla, 2009).
La diversidad genética en la Costa Atlántica podría explicarse por éstas causas
naturales de cambios en las frecuencias alélicas. Como caso de migración puede
mencionarse la adopción de variedades como la Venezolana, que fue traída de
otro país (Venezuela) al igual que todos los genotipos que se han ensayado en las
pruebas regionales de mejoramiento, algunos fueron liberados como variedades, y
otros de éstos genotipos simplemente conservados y difundidos por los mismos
agricultores, como el caso de SM1433-4 y MVEN-25, además del intercambio de
genes con todas aquellas especies nativas de la región.
La yuca nativa está distribuida en todo el sector costero entre el Atrato y el
Magdalena, y ha sido tradicionalmente un alimento básico. Para esta zona de la
Costa, se han enumerado variedades como Cartagenera, Momposina, Samaria,
Pie de paloma, Gallinazo, Batea, Solita, Riogrande, Algodón, Camarón, Pie de
perdiz, Chingale y Pascualita (Patiño, 1964). Todas estas variedades locales
contribuyen también a la alta variabilidad encontrada en la Costa Norte de
Colombia.
Como se observó en este estudio, el 46% de la yuca cultivada por pequeños
agricultores equivale a diversos genotipos (figura 5), los cuales fueron
genéticamente diferenciados en los grupos formados en el ACM. La variabilidad a
nivel de finca no es estática sino que con el paso del tiempo hay genotipos que
salen y otros que se incorporan al sistema de producción del agricultor. Esto
refleja el hecho de que los agricultores tienen una disposición de a probar nuevos
materiales, observarlos, y con el tiempo incorporarlos o rechazarlos. Las fuentes
de variabilidad que los agricultores manejan son de 2 tipos; variedades
suministradas por los vecinos o parientes, y clones nacidos en el campo debido a
cruces entre variedades locales. Estos procesos pueden pasar inadvertidos en el
41
corto plazo, pero han constituido la base para la evolución del cultivo (Iglesias et.
al, 1994).
Los resultados de la variabilidad genética (He, Ho, AP, HI, HS, HT) obtenidos en
este estudio, fueron similares a los encontrados en otros trabajos de variabilidad
genética de yuca en los cuales se usaron los microsatélites y se estimaron éstos
parámetro, (Alcántara (2001), Monte (2003), Okay (2003), Dixon (2002), Kizito
(2003), Dixon (2003), Beovides (2004)). Aunque éstos trabajos en su mayoría se
han realizados en países Africanos y algunos latinoamericanos como Perú,
Guatemala y Cuba; se concluye en general el comportamiento heterocigoto de la
yuca y su alta variabilidad genética.
6.3 ADOPCIÓN DE VARIEDADES MEJORADAS Se analizó la adopción de las variedades mejoradas por CIAT y liberadas por ICA.
Estas variedades fueron: Manihot P-12 (CMC76), ICA Costeña (CG1141-1), ICA
Negrita (CM3306-4), CORPOICA Colombiana (CM3306-19), CORPOICA Sucreña
(CM 3555-6), CORPOICA Verónica, CORPOICA Ginés, CORPOICA Caribeña
(SGB 765-2), MTAI-8. Se incluyó el clon SM1433-4 y MVEN-25 los cuales, aunque
no fueron liberados como variedades, formaron parte de genotipos evaluados en
programas de mejoramiento participativo y fueron conservados por los agricultores
multiplicándolos en sus fincas.
39,1%
13,7%
3,1% 3,1% 2,5% 2,5% 1,2% 1,2% 0,6%
18,0%
11,2%
3,7%
0,0%
10,0%
20,0%
30,0%
40,0%
50,0%
ICA C
OSTEÑA (C
G1141
-1)
P-12 (C
OL1505
)TAI-8
CUBANA (CM 45
74-7)
CORPOICA V
ERONICA (C
M 4919
-1)
SM1433
-4
ICA N
EGRITA (C
M 3306-4
)
CORPOICA G
INES (C
M 4843-
1)
MVEN-25
CORPOICA S
UCREÑA (CM 355
5-6)
CORPOICA C
ARIBEÑA (S
GB 765-
2)
CORPOICA C
OLOMBIA
NA (CM 33
06-19
)
42
Figura 6 . Adopción de las variedades de yuca mejoradas por CIAT
Se observa en la figura 6, la variedad ICA Costeña, es la que presenta la mayor
adopción por parte de agricultores, seguida de la variedad P-12, MTAI-8 y
Cubana. Las otras variedades presentan porcentajes de adopción menores del
4%.
La variedad ICA Costeña, fue conocida por los agricultores a partir de 1988. Un
trabajo de adopción de variedades de yuca mejorada, realizado por López (1999),
demuestra que, en 1995, ICA Costeña presentaba adopciones de 7.8%, 5.9% y
0% en niveles alto, medio y bajo de la población de agricultores. Es decir, que se
ha incrementado su adopción por parte de los agricultores.
ICA Costeña, presenta su mayor adopción por parte de los pequeños agricultores
en el departamento del Atlántico (52%) seguida de Magdalena (32%) y baja
adopción en Córdoba (11%) y Sucre (5%) (tabla 5).
La variedad P-12 ocupa el segundo lugar de adopción de las variedades
mejoradas en toda la región. Esta variedad fue desarrollada y liberada oficialmente
en 1984 y su adopción esta por debajo de ICA Costeña que fue liberada años
después.
En cuanto al proceso de adopción de esta variedad, en el año 1991, se
encontraba en su primera fase. En esta fase los agricultores empiezan a
experimentar con la nueva variedad pero conocen poco sobre su comportamiento
en el campo, su aceptación en el mercado y su rentabilidad (Gottret et al, 1994).
López et. al, (2007) reporta que esta variedad durante los primeros cinco años
después de su liberación tuvo porcentajes de adopción menores que las
variedades ICA Costeña e ICA Negrita, lo que el autor relaciona con el método de
mejoramiento utilizado para la selección como variedad. Estas dos variedades,
ICA Costeña e ICA Negrita, fueron seleccionadas a partir de mejoramiento con
investigación participativa e ICA P-12, se hizo por mejoramiento convencional. En
43
1989 P-12 tuvo un incremento en su adopción debió a que un proyecto de
desarrollo rural financiado por el gobierno colombiano, distribuyó semilla a las
cooperativas de agricultores de los departamentos del Caribe Colombiano (López,
1999).
Por departamentos, Córdoba es el que presenta la mayor adopción de esta
variedad (62%) (tabla 5); lo que coincide con un estudio del DANE-ENA (2004), en
el cuál, la variedad P-12 es la que más se siembra en éste departamento para uso
industrial.
Se observa que los clones de MTAI-8, Cubana (CM4574-7), SM 1433-4 y
MVEN25, provenientes del programa de mejoramiento genético y elegidos como
progenitores por sus determinadas características como alta productividad y
resistencia a la pudrición de raíces (Ceballos, 2002), han sido adoptados por los
pequeños agricultores aunque, en las pruebas regionales de ensayos del
programa de mejoramiento, no demostraron ser mejores que otros materiales
evaluados, y se han difundido espontáneamente entre los agricultores a pesar de
no haber sido liberadas como variedades (Ceballos, 2002), excepto la MTAI-8, que
fue liberada como variedad en el año 2004 con el nombre de Corpotica-Tai .
Corpotica-Tai o MTAI-8, es una variedad de uso industrial, la cual, según datos de
DANE-ENA (2004) presenta la mayor área sembrada del total nacional con
33,33%, predominando en el departamento de Córdoba.
A pesar de la alta acogida de la variedad MTAI-8 a nivel industrial, el pequeño
agricultor la ha adoptado en un 13.7%, por debajo de ICA Costeña y P-12 y en su
mayoría, están en el departamento de Atlántico y Sucre con el 45% y 32%
respectivamente (tabla5).
La baja adopción de la variedad MTAI-8 por parte de los pequeños agricultores
puede deberse a que es una variedad con alto contenido de cianuro, lo que la
hace solo de uso industrial y el pequeño agricultor, como se analiza más adelante,
destina la mayor parte de su producción al consumo fresco y por tanto prefiere
variedades dulces.
44
En cuanto a las otras variedades mejoradas, se observa que la variedad ICA
Negrita, a pesar de haber sido liberada en 1993, muy cerca de la liberación de
ICA Costeña, no ha sido altamente adoptada por el pequeño agricultor (3.1 %).
Las otras variedades como Corpoica Sucreña, Corpoica Caribeña y Corpoica
Colombiana liberadas en el 2000B y; Corpoica Verónica y Corpoica Gines
liberadas en 2004, fueron muy recientemente liberadas, y se podría considerar
que apenas están en el proceso inicial de adopción.
Las variedades CORPOICA Rojita (SGB 765-4), CORPOICA Caiseli y
CORPOICA Orense, no fueron mencionadas en este estudio por los agricultores.
6.3.1 Distribución de variedades mejoradas por depa rtamentos En la figura 7 se observa que en el departamento del Atlántico se encuentra el
mayor porcentaje de adopción de variedades mejoradas (32%), seguido del
departamento de Córdoba (26%), Magdalena (22%) y Sucre (19%).
Figura 7 . Porcentaje de variedades de yuca mejorada por departamento
26%
19%22%
32%
0%
5%
10%
15%
20%
25%
30%
35%
ATLANTICO CORDOBA MAGDALENA SUCRE
45
En el departamento del Atlántico se encuentra ubicado el “campo de observación”
del programa de mejoramiento de CIAT. A este sitio llegan los genotipos
provenientes de semillas recombinantes de yuca para ser evaluados (Ceballos et
al., 2002)
Por razones logísticas las actividades de mejoramiento desarrolladas para varias
regiones de Colombia se han centralizado inicialmente en Barranquilla (Atlántico).
Así muchos de los materiales evaluados allí, son luego transferidos al Caribe
Húmedo (Córdoba y Sucre) (Ceballos, 2002).
El hecho de que en el Atlántico este establecido el “campo de observación” donde
se evalúan muchos genotipos, da la oportunidad y facilidad al pequeño agricultor
de este departamento, de conocer y adquirir las variedades mejoradas o
determinados genotipos evaluados del agrado de ellos, permitiendo su
propagación.
Otra característica del departamento del Atlántico es que se encuentra ubicada la
empresa Industrias del Maíz S.A, la cual cuenta con una Biofábrica o Banco de
semillas de yuca, cuya misión es satisfacer la demanda de semilla de yuca
certificada y apoyar la investigación de variedades promisorias, como alternativa
importante para el desarrollo escalonado del cultivo, logrando mantener una
agricultura competitiva, mediante la transferencia de tecnología. El pequeño
agricultor del Atlántico podría estarse beneficiando de la labor promovida por esta
empresa.
En cuanto al departamento de Córdoba, que ocupa el segundo lugar de adopción
de las variedades mejoradas, es donde se encuentra ubicada la Corporación
Colombiana de Investigación Agropecuaria CORPOICA, Centro de Investigaciones
Turipaná. Esta Corporación es la institución acreditada encargada de liberar
oficialmente las variedades mejoradas, por lo que existe una estrecha
colaboración entre CIAT y estas instituciones (Ceballos et al., 2002). CORPOICA
se encarga de garantizar que el conocimiento generado llegue a cada tipo de
usuario a través de metodologías participativas que favorezcan el escalamiento de
las tecnologías y el uso de modelos productivos eficientes. Por tanto, es factible
46
que los agricultores de este departamento por su cercanía con esta institución,
tenga un mayor conocimiento y facilidad de conseguir las variedades mejoradas.
En la tabla 5 se observa el porcentaje de adopción en cada departamento de las
variedades mejoradas de yuca y las que han formado parte de los ensayos de
rendimiento y pruebas regionales.
Tabla 5. Adopción por pequeños agricultores, de las variedades mejoradas de yuca por CIAT en cuatro departamentos de la Costa Atlántica
PORCENTAJE DE ADOPCIÓN (%) ATLANTICO CORDOBA MAGDALENA SUCRE ICA COSTEÑA (CG1141-1) 52 11 32 5 ICA P-12 (MCOL1505) 17 62 7 14 MTAI-8 45 9 14 32 ICA NEGRITA (CM 3306-4) 40 20 40 CORP VERONICA (CM 4919-1) 33 22 44 CUBANA (4574-7) 94 6 CORP GINES (CM4843-1) 83 17 SM 1433-4 20 80 MVEN 25 50 50 CARIBENA (SGB 765-2) 50 50 CORP COLOMBIANA (CM 3306-19) 100 ICA SUCREÑA (CM3555-5) 100
6.3.2 Métodos de adquisición de semilla de yuca El 87.7% de la semilla de yuca que usan los pequeños agricultores de la región de
la Costa Atlántica para establecer un nuevo cultivo de yuca, proviene de las
cosechas anteriores. El 8.8% de los agricultores adquiere la semilla con los
vecinos, comprada o regalada. El 1.8% de la semilla es proporcionada por
instituciones como CIAT y el 0.4% es adquirido en otras instituciones como
CECORA, Corpoica, UMATA e Industrias del Maíz (figura 8).
47
Figura 8 . Adquisición de semilla de yuca por los pequeños agricultores de la Costa Atlántica.
Según estudios realizados por López J. (1994), la yuca por ser un cultivo anual de
propagación vegetativa, cuya siembra generalmente se hace coincidir con la
cosecha del cultivo anterior, los agricultores yuqueros tradicionalmente han
producido su propio material de siembra. En términos generales, no ha existido
tradición de compra-venta de estacas, y cuando los agricultores se quedan sin
semilla casi siempre la han conseguido en calidad de regalo de otros agricultores,
o en caso extremo en trueque por trabajo o por otras semillas.
López (2002) reporta también que la yuca es un cultivo de agricultores con
recursos escasos; el cultivo se incrementa muy lentamente (un año) y su índice de
multiplicación es muy bajo (5-10 estacas por cada estaca sembrada). Como la
naturaleza voluminosa de la semilla es poco conducente para su movimiento entre
regiones y comunidades, implica en que el sistema de abastecimiento tradicional
sea guardar la semilla.
Los yuqueros habitualmente producen su propio material de siembra. El agricultor
que compra semilla de yuca lo hace porque; siembra por primera vez; dejó de
sembrar por un tiempo largo durante el cual no pudo conservar su material de
siembra; desea cambiar de variedad ó desea aumentar considerablemente el
87,7%
8,8%1,8% 0,4%
0,0%
20,0%
40,0%
60,0%
80,0%
100,0%
LA GUARDA VECINOS CIAT OTROS
48
tamaño de su plantación. El volumen de ventas de un productor de semilla de
yuca esta en función de las variaciones de área sembrada que depende del
comportamiento del precio de las raíces.
La consecución de semilla y su escasez, puede constituirse en una barrera muy
seria que afecta también la diseminación y utilización de nuevas variedades, lo
cual puede convertirse en un factor decisivo para la adopción de tecnologías y
desarrollo agrícola.
La aparición de variedades mejoradas y la incorporación del cultivo a nuevos
mercados industriales, constituyen factores positivos que permiten generar un
interés en las semillas mejoradas. Un establecimiento de abastecimiento de
estacas de buena calidad es importante porque, aumenta la productividad del
cultivo, reduce la diseminación de plagas y enfermedades; aumenta el ciclo de
vida de los genotipos y permite un uso mas eficiente de los insumos agrícola
(López, 2002); factores que beneficiarían al pequeño agricultor.
6.3.3 Finalidad de la producción El 81.9% de la producción de yuca de los pequeños agricultores es destinada al
mercado fresco. Un 17.6% es para la industria y solo un 0.5% es destinado a
consumo animal (figura 9).
Figura 9 . Finalidad de la producción de yuca de pequeños agricultores de la Costa Atlántica.
81,9%
17,6%
0,5%0,0%
20,0%
40,0%
60,0%
80,0%
100,0%
MERCADO FRESCO INDUSTRIA CONSUMO ANIMAL
49
La producción de yuca en Colombia se caracteriza por corresponder
predominantemente a un cultivo de economía campesina, de tecnología
tradicional, poco intensiva en el uso de maquinaria agrícola e insumos químicos,
cuya producción se destina a la atención de la demanda del consumo humano
(Quintero et al., 2004).
Los resultados están también relacionados con las investigaciones de Gottret et al.
(2000), quien menciona que, la yuca es un cultivo importante, en todo el mundo
tropical, para los pequeños agricultores con acceso a tierras marginales. Su alta
tolerancia, en comparación con la de otros cultivos, a bajas a precipitaciones
estacionales, altas temperaturas y suelos medianamente fértiles hacen de la yuca
un cultivo importante tanto para seguridad alimentaría como para la generación de
ingresos en regiones con pocas alternativas de producción, como la región
semiárida de la Costa Norte de Colombia.
Según Buitrago (1990), en la mayoría de las zonas productoras de yuca las raíces
se utilizan en forma fresca, como elemento básico de la alimentación humana
diaria; una proporción aproximadamente igual se procesa de diferentes maneras
para utilizarla posteriormente también como alimento.
A nivel de industria la yuca tiene un gran potencial; el producto más importante
elaborado a base de yuca es el almidón. El almidón es útil en la industria textil, y
en la fabricación de papeles y adhesivos, y puede tener potencial en la producción
de dextrosa (Buitrago, 1990). El empleo de la yuca como materia prima en la
fabricación industrial de alimentos para animales es relativamente reciente. En los
últimos años ha habido un creciente interés por la yuca seca para alimento de
consumo animal, especialmente a causa de la devaluación del peso colombiano
que ha encarecido las importaciones de granos; se espera que la yuca sustituya
gran parte de los cereales importados destinados a la producción de alimentos
concentrados para animales (Gottret et al. 2002).
Como materia prima para biocombustible se adelantan proyectos para la
producción de alcohol carburante. Se estima que con una productividad de 30 t
50
raíz/ha, es posible producir 5,000 litros de etanol. Con variedades seleccionadas,
buen manejo del cultivo y en regiones con climas adecuados para la producción
de yuca se pueden obtener rendimientos de 140 a 170 litros de etanol por
tonelada de raíces frescas de yuca. En particular, en la Costa Norte de Colombia;
Sucre, Córdoba, Guajira, Cesar y Atlántico, y en los Llanos Orientales, los
proyectos agroindustriales basados en el cultivo de la yuca se pueden convertir en
excelentes estrategias para aumentar la producción y el consumo de alcohol
carburante en Colombia (CLAYUCA, 2006).
Teniendo en cuenta la gran proyección industrial que tiene la yuca, y según los
resultados de este estudio, el pequeño agricultor todavía no tiene cultura de
siembra de yuca con objetivos industriales, situación que en parte puede darse
por, el alto precio pagado por la yuca para consumo fresco en comparación con la
yuca industrial (Gottret et al. 2002). Además, como se mencionó, es un cultivo que
está relacionado con la seguridad alimentaría del pequeño agricultor, situación que
hace que el agricultor tenga su preferencia por el destino de la producción a
consumo en fresco.
6.3.4 Asistencia técnica
El 83.5% de los pequeños agricultores no reciben asistencia técnica. El 4.1%
recibe asistencia técnica de las UMATA (Unidad Municipal de Asistencia Técnica
Agropecualria), el 3.4% y 2.3% reciben asistencia técnica de CIAT y Corpoica. El
1.1% de los agricultores reciben asistencia de otras instituciones como CECORA
(Central de Cooperativas de la Reforma Agraria Ltda.), Industrias del Maíz,
ANPPY (Asociación Nacional de Productores y. Procesadores de Yuca) y
asistencia particular (figura 10).
51
Figura 10 . Asistencia técnica recibida por pequeños agricultores de yuca de la Costa Atlántica
La UMATA, es la entidad encargada a nivel municipal de prestar asistencia técnica
a los pequeños productores. Sin embargo, debido a que la disponibilidad de
recursos de estas entidades es directamente proporcional al tamaño presupuestal
de los municipios; los municipios más pobres cuentan con menores recursos para
las actividades de transferencia de tecnología. Córdoba y Sucre se encuentran
entre los departamentos más pobres, con mayores índices de ruralidad y con
mayor participación del sector agropecuario dentro de su PIB departamental. En
contraste, los municipios con mayores recursos, los que usualmente tienen un
sector agropecuario pequeño o no lo tienen, cuentan con la mayor disponibilidad
de recursos. Adicionalmente, a este problema las UMATAs no tienen vínculos
formales directos con centros de investigación o con fuentes alternativas de
financiamiento (Gamarra, 2007). Esta situación se ve claramente reflejada al
indagar en esta investigación sobre la asistencia técnica que reciben los pequeños
agricultores, referentes al cultivo de la yuca.
La Costa Atlántica es la región más productora de yuca, a través del tiempo ha
experimentado fuertemente las transformaciones de la economía del país. En el
83,5%
4,1% 3,4% 2,3% 1,1%0,0%
20,0%
40,0%
60,0%
80,0%
100,0%
NO RECIBE UMATA CIAT CORPOICA OTROS
52
periodo de 1975-82, ésta y todas las regiones yuqueras presentaron una
tendencia negativa en la producción, un indicio que la yuca era cultivo de
subsistencia no orientado hacia el mercado. En el periodo siguiente, gracias a la
política de gobierno, el enfoque cambió y el cultivo mejoró su situación general
(Gottret, 2002).
Según Pérez (1989), en este periodo, el gobierno trataría de mejorar el nivel de
vida de los habitantes del campo y así, el Fondo DRI (Desarrollo Rural Integrado)
había considerado la agroindustrialización de la yuca como una forma de
solucionar el problema de mercado que ésta presentaba, especialmente para los
productores de la Costa Atlántica. De esta forma surgió el proyecto de secado
natural de la yuca que operaba desde 1981 con la operación de una planta piloto
localizada en el departamento de Sucre, la factibilidad técnica y económica del
secado natural de las raíces de yuca con destino a la alimentación animal. Los
agricultores a partir de este proyecto recibían asistencia técnica no sólo para la
actividad del secado sino para su propia organización, y para las labores de
producción por parte del DRI. El CIAT también formó parte de la implementación
de estos proyectos.
Con el fin de recuperar hectáreas para la producción agropecuaria, incluyendo la
producción de yuca industrial, el gobierno continuaría con la estrategia de alianzas
productivas entre los pequeños productores organizados, el sector empresarial
(comercial e industrial) y los proveedores de insumos, mediante la consolidación
de acuerdos regionales de competitividad (Hernández, 2003). Además, la creación
de una planta para la producción de almidón de yuca, en el departamento de
Sucre, busca facilitar el tema del empleo y el cultivo de yuca en la región.
Esta situación estará a la expectativa de ver cómo en realidad se verá beneficiado
el pequeño agricultor, no solo en la asistencia técnica, sino en otros aspectos de la
cadena productiva de la yuca, teniendo en cuenta que su tendencia es a la
producción de yuca para consumo fresco y poco para la industrial.
53
6.3.5 Principales problemas fitosanitarios del cult ivo El 43.9% de los cultivos de yuca de pequeños agricultores de la Costa Atlántica
son sanos. El 25.9% presenta problemas de cercospora, el 10.3% bacteriosis, el
9.2% gusano barrenador (Chilomima clarkei Amsel), el 2.5% ácaros
(Mononychellus tanajoa) y el 2.5% gusano cachón (Erinnyis ello). El 0.8% equivale
a la presencia de otros problemas como superalargamiento (Sphaceloma
manihoticola), cuero de sapo, comejen (Heterotermes tenuis y Coptotermes niger),
mosca blanca (Aleurotrachelus socialis), escama (Aonidomytilus albus), hormiga
arriera (Atta sp.) y chinche (Vatiga manihotae), (figura 11).
Cercospora se presenta por varias especies de Cercosporidium que causan
manchas foliares en la yuca, Cercosporidium henningsii Allescher y
Phaeoramularia manihotis Chupp y Ciferri se consideran las más importantes,
tanto por su severidad como por su distribución geográfica. Estos hongos se
presentan en ciertas áreas geográficas y durante época lluviosa. La mancha parda
de la hoja (C. henningsii), es probablemente la mas relevante de todas las
enfermedades foliares de la yuca. Tiene una amplia distribución geográfica
(Álvarez, 2002). Las manchas foliares en la yuca, o mancha parda de la hoja, no
reviste importancia económica para el agricultor.
43,9%
25,9%
10,3% 9,2%
2,5% 2,5% 0,8%0,0%
20,0%
40,0%
60,0%
SANO CERCOSPORA BACTERIOSIS BARRENADORDEL TALLO
ACARO GUSANOCACHON
OTROS
54
Figura 11 . Principales problemas fitosanitarios en cultivos de yuca de pequeños agricultores de la Costa Atlántica
La bacteriosis esta reportada en el 10.3% de la población estudiada. Bacteriosis
vascular o añublo bacteriano (Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis), se
considera una de las enfermedades más limitantes de la producción de yuca en
las áreas afectadas, ocasionando pérdidas que pueden alcanzar 100%. La
severidad de la enfermedad varía mucho según el cultivar, la fertilidad del suelo y
el clima, así como por la cantidad de inóculo presente en la zona. El patógeno
induce una gran variedad de síntomas, en Colombia, la enfermedad fue muy
destructiva en 1971; desde entonces se informa de su presencia en las principales
zonas de cultivo de la yuca del país (Verdier, 2002).
A nivel de insectos, el gusano barrenador (Chilomima clarkei Amsel), los ácaros
(Mononychellus tanajoa) y el gusano cachón (Erinnyis ello), se clasifican como
plagas mayores porque al parecer, han coevolucionado con el cultivo y lo hacen
su principal o único hospedero; estas plagas pueden causar daños severos al
cultivo que se manifiestan en pérdidas de rendimiento (Bellotti et. al, 2002). A este
grupo también pertenecen la mosca blanca (Aleurotrachelus socialis) y el chinche
(Vatiga manihotae), que tuvieron un bajo porcentaje de presencia en este estudio.
Otros insectos y que se mencionan en bajo porcentaje son comején (Heterotermes
tenuis y Coptotermes niger), escama (Aonidomytilus albus) y hormiga arriera (Atta
sp) y Acromyrmex sp.), los cuales pueden ocasionar daños esporádicos o
localizados al cultivo. Estas se consideran plagas menores o generalistas, y
pueden atacar el cultivo en forma oportunista, especialmente en periodos de
sequía cuando la única fuente de alimento disponible es la yuca (Bellotti et. al,
2002).
Las enfermedades superalargamiento y cuero sapo, también presentaron un bajo
porcentaje de presencia en la población estudiada.
El superalargamiento es una enfermedad causada por el hongo Sphaceloma
manihoticola. Crece inicialmente en sobre la epidermis del hospedante; luego de
su penetración, crece en los espacios intercelulares de los tejidos de la epidermis
55
y la corteza. El hongo produce giberelinas, las cuales promueven el crecimiento
exagerado de los entrenudos de la planta. Los perjuicios causados por esta
enfermedad son bastante variables, y depende del nivel de resistencia de los
cultivares, condiciones climáticas, concentración del inóculo inicial y del material
de propagación contaminado. Las pérdidas pueden superar el 80% de la
producción total en plantaciones jóvenes, mientras que en plantaciones con más
de 6 meses no se presentan pérdidas significativas (Álvarez et. al, 2002).
El “cuero de sapo”, es una de las enfermedades mas serias del cultivo de la yuca,
puesto que afecta directamente la producción de raíces causando pérdidas hasta
de 90% o más en el rendimiento. Diversas investigaciones científicas revelan que
es probablemente una enfermedad de etiología viral. La expresión de síntomas en
la planta es variable, según la temperatura y el genotipo. En la mayoría de las
variedades, las plantas afectadas no presentan señales visibles en su parte aérea
y, en algunos casos, hasta pueden lucir sanas y vigorosas. En muchos casos el
tallo es más grueso y vigoro y se reutilizan estas estacas. En general el sistema
radical no alcanza a tener el mismo desarrollo de una planta sana, las raíces
permanecen delgadas, leñosas, de cáscara gruesa y corchosa, y su contenido de
almidón es muy bajo (Calvert, et al. 2002).
56
7. CONCLUSIONES
En el ACM se diferenciaron seis grupos genéticamente diferentes que explican el
81% de la variación, con un coeficiente de diferenciación bajo (Gst 0.18), es decir
que la variabilidad se debe a diferencias dentro de los grupos y no entre los
grupos.
De los seis grupos diferenciados, cuatro (Grupo1, Grupo3, Grupo5 y Grupo6),
fueron representados en un alto porcentaje por una variedad. Los grupos Grupo2 y
Grupo4, presentaron el mayor número de genotipos y la mayor variabilidad
genética de los grupos, no se logró establecer una variedad específica que los
identificara.
La variedad Venezolana, ICA costeña y P-12, son las variedades mejoradas que
más siembran los agricultores en la región. Sin embargo, un alto porcentaje de los
materiales sembrados (46%) equivale a diversos genotipos o variedades locales.
La adopción de variedades mejoradas es un proceso lento que requiere de
muchos años para que una variedad sea acogida altamente por los agricultores.
No existe un adecuado sistema de compra de semilla de yuca certificada, el
agricultor guarda la semilla de cosechas anteriores y la mayor parte de la
producción es destinada al mercado fresco, es un cultivo predominantemente de
tecnología campesina y esta muy comprometido con la seguridad alimentaría.
Existe baja asistencia técnica y aunque se reportó el 43.9% como cultivos sanos,
se encontró principalmente la presencia de enfermedades como cercospora (C.
henningsii) y bacteriosis (Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis) e insectos
como barrenador (Chilomima clarkei Amsel), ácaros (Mononychellus tanajoa) y
gusano cachón (Erinnyis ello).
57
BIBLIOGRAFÍA
Alcántara, J., Guarino, L., Fregene, M. (2001). Análisis de la diversidad genética en Manihot esculenta “Yuca” mediante el uso de marcadores microsatélites–SSR. CIAT. Cali, Colombia. p. 9.
Álvarez, E y Llano Germán, (2002). Enfermedades del cultivo de yuca y métodos de control. En: La yuca en el tercer milenio: Sistemas modernos de producción, procesamiento, utilización y comercialización. Publicación CIAT. Cali, p. 131-147.
Barbadilla A (2009). Genética de Poblaciones. Departamento de Genética y Microbiología. Universidad Autónoma de Barcelona. http://biologia.uab.es/divulgacio/genpob.html#factores. Acceso: 6-04-2009
Bertram, B. R. (1993). Aplication of Molecular Techniques to Genetic Resources of cassava (Manihot esculenta Crantz – Euphorbiaceae): Interspecific Evolutionary Relationships and Intraspecific Characterization. Ph.D. dissertation. University of Maryland, U:S.A. 464 p.
Beeching J., Marmey P., Gavalda M. C., Noirot M., Haysom H., Hughes M., Charrier A. (1993). An assessment of genetic diversity within a collection of cassava (Manihot esculenta Crantz) germplasm using molecular markers. En: Annals of Botany. Vol. 72 No. 6, December 1993.
Bellotti A. Arias B. Vargas O. Reyes J. Guerrero J.M. (2002). Insectos y ácaros dañinos a la yuca y su control. En: La yuca en el tercer milenio: Sistemas modernos de producción, procesamiento, utilización y comercialización. Publicación CIAT. Cali, 160-203 p.
Beovides Y. Barrera E., Gutiérrez J. P., Buitrago C., Marin J., Fregene M.. (2004). Characterization of genetic diversity: Simple Sequence Repeat (SSR) Assessment of Genetic Diversity of Local Cassava Varieties from Cuba. Funding: Cassava Biotechnology Network (CBN). CIAT. Cali. Annual Report: Output: 12-34.
Buitrago, J.A. 1990. La yuca en la alimentación animal. Cali. CIAT. ISBN 958-9183-10-7.
Calvert L. Cuervo M. (2002). Enfermedades virales de la yuca en América del Sur. En: La yuca en el tercer milenio: Sistemas modernos de producción, procesamiento, utilización y comercialización. Publicación CIAT. Cali, p. 262-268.
58
Ceballos H., Morante N., Calle F., Lenis J., Jaramillo G., Perez J. (2002). Mejoramiento genético de la yuca. En: La yuca en el tercer milenio: Sistemas modernos de producción, procesamiento, utilización y comercialización. Publicación CIAT. Cali, Colombia, p. 295-325.
Ceballos H. (2002). La yuca en Colombia y el Mundo: Nuevas perspectivas para un cultivo milenario En: La yuca en el tercer milenio: Sistemas modernos de producción, procesamiento, utilización y comercialización. Publicación CIAT. Cali, Colombia, p. 1-13.
Ceballos H., De la Cruz, G.A. (2002). Taxonomía y morfología de la yuca. En: La yuca en el tercer milenio: Sistemas modernos de producción, procesamiento, utilización y comercialización. Publicación CIAT. Cali, Colombia, p. 17-33.
Ceballos H. (2002). Investigación y Desarrollo para la Yuca Industrial en seis Polos Estratégicos de Colombia. Informe presentado al Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural (MADR), Federación Nacional de Avicultores de Colombia – FENAVI. Reporte técnico de actividades. Centro Internacional de Agricultura Tropical – CIAT, p. 1-113.
CIAT (Centro Internacional de Agricultura Tropical). (1981). CIAT in the 198s. A longrange plant for the Centro Internacional de Agricultura Tropical. Cali, Colombia. p. 182.
CIAT, CORPOICA, CLAYUCA, MADR. 2001. Nuevas variedades de yuca para uso industrial en la región Caribe Colombiana. Publicación de Corpoica. Centro de Investigación Tibaitatá. Córdoba, p.16.
CLAYUCA. (2006). Aprobado proyecto para producción de alcohol carburante En: Boletín electrónico del Consorcio Latinoamericano y del Caribe de Apoyo a la Investigación y Desarrollo de la Yuca. Edición 9 Diciembre del 2006.
DANE-ENA, Encuesta Nacional Agropecuaria – Estudios especiales. (2004). Censo de producción de yuca para uso industrial. Separata de resultados disponibles en: htt://www.dane.gov.co/files/invetigaciones/agropecuario/ena/censo yuca industrial.pdf. Acceso: 12-04-09.
Dellaporta SL, Wood J, Hicks JR (1983). A plant DNA minipreparation: version II. Plant Mol Biol Rep 1: 19-21.
Dixon A., Raji B., Marin J., Ospina C., Buitrago C., Fregene M. (2003). Characterization of genetic diversity: Simple Sequence Repeat (SSR) Assessment of Genetic Diversity of Local Cassava Varieties from Sierra Leone. Annual Report: Development and use of biotechnology tools for cassava improvement. CIAT, Cali – Colombia. Output 8-43.
Dixon, et al. (2002). Simple Sequence Repeat (SSR) Marker Diversity in Cassava (Manihot esculentaCrantz) Landraces form Nigeria. Annual Report:
59
Development and use of biotechnology tools for cassava improvement. CIAT. Cali. Annual Report: Output: 8-43.
Dominguez, O., Ceballos, L. F., Fuentes, C. (1983). Morfología de la planta de yuca. En: Yuca: Investigación, producción y utilización. Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT), Programa de Yuca; Programa de las Naciones Unidas para el desarrollo (PNUD). Cali, p. 29-49.
FAO (Organización de las Naciones Unidas para la Agricultura y la Alimentación). 2007. http://faostat.fao.org/site/567/DesktopDefault.aspx?PageID=567#ancor. Acceso: 24-01-2009.
Ferreira, M. E.; Grattapaglia, D. (1998). Introducción al uso de Marcadores Moleculares en el Análisis Genético. 1 ed. Brasilia: EMBRAPA - CENARGEN. p. 220.
Gamarra J. R. V. (2007). Pobreza rural y transferencia de tecnología en la Costa Caribe. Documentos de trabajo sobre economía regional. Banco de la República. Cartagena de Indias. p 5-21.
Giraldo M. C. (1996). Contribución al entendimiento de la diversidad genética en clones tradicionales de yuca cultivada Manihot esculenta Crantz en Colombia. Universidad del Valle. Facultad de ciencias, programa académico de biología. Cali. 102 p.
Gottret M. V., Escobar Z., Pérez S. (2002). El sector yuquero en Colombia: Desarrollo y competitividad. En: La yuca en el tercer milenio: Sistemas modernos de producción, procesamiento, utilización y comercialización. Publicación CIAT. Cali, Colombia, p. 340.
Gottret M. V., Henry G. (1994). La importancia de los estudios de adopción e impacto, el caso del proyecto integrado de yuca en la Costa Norte de Colombia. En: Interfase entre los programas de mejoramiento, los campos de los agricultores y los mercados de la yuca en Latinoamérica. Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT), Cali, Colombia. p. 193-223.
Gottret M. V.; Raymond M. (2000). Análisis de un Enfoque Integrado de Investigación y Desarrollo en Yuca y su Contribución al Alivio de la Pobreza: El Caso de la Costa Norte de Colombia Proyecto de Desarrollo Agro-empresarial Rural. Centro Internacional de Agricultura Tropical CIAT. Cali, Colombia p. 27.
Gregorius H.. R. (1987). The relationship between the concepts of genetic diversity and differentiation. Theoretical and Applied Genetics 74: 397 – 401.
Hernández L.A. (1993). Evaluación de nuevas variedades de yuca con la participación de agricultores. Documento de trabajo No. 130. Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT), Cali, Colombia, p. 85.
60
Hernández P.N. (2003). El embrujo autoritario. Primer año de gobierno de Álvaro Uribe Vélez. Plataforma Colombiana de derechos Humanos, Democracia y Desarrollo. ISBN: 958-644-087-7. Ediciones Antropos Ltda. Bogotá, Colombia. p. 102-108.
Hershey, C., Amaya, A. (1983). Germoplasma de yuca: Evolución, distribución y colección. En: Manual de producción de yuca. Programa de yuca. Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT). Cali, p. E15-E27.
Hillocks, R.J.; Thresh, J.M.; Bellotti, A.C. (2002). Cassava: biology, production and utilization. CABI publishing, Cambridge, Inglaterra. p. 352.
Hoelzel A. R. (1998). Molecular Genetic Análisis of populations. A practical approach Oxford University Press Inc. New York. United States. 445 p.
Iglesias C., Hernández L. A. (1994). Introducción de diversidad genética mejorada a nivel de campos de agricultores. En: Interfase entre los programas de mejoramiento, los campos de los agricultores y los mercados de la yuca en Latinoamérica. Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT), Cali, Colombia. p. 151-157.
Jaramillo G. (2002). Recursos geneticos de Manihot en el centro Internacional de Agricultura Tropical CIAT. En: La yuca en el tercer milenio: Sistemas modernos de producción, procesamiento, utilización y comercialización. Publicación CIAT. Cali, Colombia. P. 271-294.
Karp G. (1998). Biología Celular y Molecular. McGraw-Hill Interamericana. México. 746p.
Kizito E., Gullberg U., Bua A. Omara J., Egwang M., Castelblanco W., Gutierrez J., Buitrago C., Fregene M. 2003. Simple Sequence Repeat (SSR) Assessment of Genetic Diversity of Local Cassava Varieties from Uganda. Annual Report: Development and use of biotechnology tools for cassava improvement. CIAT, Cali – Colombia. Annual Report: Output: 8-36.
López A. J. (2002). Semilla vegetativa de yuca. En: La yuca en el tercer milenio: Sistemas modernos de producción, procesamiento, utilización y comercialización. Publicación CIAT. Cali, 49-75 p.
López A. J. (1999). Adopción de variedades de yuca generadas por el mejoramiento clásico y por la selección varietal participativa en la región Caribe Colombiana. En: PRGA Program 2000. Fitomejoramiento participativo en América Latina y el caribe. Memorias Simposio Internacional. Quito, Ecuador. Agosto 31 a septiembre 3 de 1999. PRGA Program. Cali, Colombia. CD-ROM.
López A. J.; Hernández L. A.; Iglesias C. (2007). Selección varietal participativa para el mejoramiento de la yuca con agricultores en la región Caribe
61
colombiana: desarrollo de una metodología. En: Revista Corpoica – Ciencia y Tecnología Agropecuaria, 8(2), 32-41.
López A., Jaramillo M. (2000). Corpoica Rojita: Variedades de yuca para consumo fresco e industrial, seleccionada por los agricultores de la región Caribe Colombiana. Plegable promocional. Publicación de CORPOICA, ICA, MINAGRICULTURA. Centro de Investigación Tibaitatá. Córdoba, p.3.
López J. (1994). Esquema de producción de estacas de yuca. En: Interfase entre los programas de mejoramiento, los campos de los agricultores y los mercados de la yuca en Latinoamérica. Documento de trabajo No. 138. Centro Internacional de Agricultura Tropical – CIAT. Cali, p. 161-170.
Lozano, J.C., Byrne, D., Bellotti, A. (1983). Influencia del ecosistema en las estrategias del mejoramiento genético de la yuca. En: Manual de producción de yuca. Programa de yuca. Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT). Cali, p. E49-E55.
Luna, R. J.M (1991). El cultivo de la yuca en Colombia. En: Mejoramiento Genético de la Yuca en América Latina. Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT). Cali, p. 43-58.
Mba R.E.C., Stephenson P., Edwards K., Melzer S., Nkumbira J., Gullberg U., Apel K., Gale M., Tohme J., Fregene M. (2001). Simple sequence repeat (SSR) markers survey of the cassava (Manihot esculenta Crantz) genome: towards an SSR-based molecular genetic map of cassava. Theoretical and Applied Genetics, 102:21–31.
Monte Luis et al. (2003). Simple Sequence Repeat (SSR) Assessment of Genetic Diversity of Local Cassava Varieties from Guatemala. Annual Report: Development and use of biotechnology tools for cassava improvement. CIAT, Cali – Colombia. Annual Report: Output: 8-21.
Nason J. D. (2002). La estructura genética de las poblaciones de árboles. In Guariguata, MR; Kattan, GH Eds. Ecología y conservación de bosques neotropicales. CR, Editorial. p 299–327.
Nei M. (1978). Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics 89: 583 – 590.
Nei M. (1987). Molecular evolutionary genetics. Columbia University Press, New York, p. 512.
Okay E., Otoo J., Buitrago C., Fregene M., Dixon A. (2003). Characterization of genetic diversity: Simple Sequence Repeat (SSR) Assessment of Genetic Diversity of Local Cassava Varieties from Ghana and Predictability of Heterosis. Annual Report: Development and use of biotechnology tools for cassava improvement. CIAT, Cali – Colombia. Annual Report: Output: 8-28.
62
Patiño, V. M. (1964). Plantas cultivadas y animales domésticos en América equinoccial. Tomo 2. Plantas alimenticias, 1 ed. Imprenta departamental, Cali, Colombia, 364 p.
Pérez C. A. (1989). Experiencias Sobre la Agroindustria de la Yuca en Colombia. En: Metodologías aplicadas a proyectos integrados de yuca. Memorias del Congreso Latinoamericano celebrado en México, 26 a 28 de Octubre. Instituto Nacional de Investigaciones Forestales y Agropecuarias (INIFAP), Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT), Programa de las Naciones Unidas para el desarrollo (PNUD), Fundación Ford. 21- 28 p.
Prieto H. S. (2003). Aplicación de marcadores moleculares de tipo ADN para detección de arcelina en Phaseolus vulgars L. Trabajo de grado. Universidad Nacional de Colombia, sede Palmira. 89 p.
Quintero L. E.; Salazar M.; Rodríguez R. (2004). Costos De Producción De Yuca En Colombia. Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural. Documento de trabajo No. 44. Bogotá, Colombia, p. 9.
Ramírez S. O. (1991). Desarrollo de una metodología morfo-bioquímica para identificar duplicados en yuca (Manihot esculenta Crantz). Trabajo de tesis. Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias Agropecuarias, Pamira, Valle del cauda, CO. 163 p.
Simmonds N. (1976). Evolution of crop plants. 3 ed. Longman. London, p. 339.
Verdier V. (2002). Bacteriosis vascular (o Añublo Bacteriano) de la yuca causada por Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis. En: La yuca en el tercer milenio: Sistemas modernos de producción, procesamiento, utilización y comercialización. Publicación CIAT. Cali, p. 148-159.
Zambrano A., Demey J., Fuenmayor F., Segovia V., Gutierrez Z. (2003). Diversidad genética de una colección de yuca a través de marcadores moleculares RAPDS. En: Agronomía Tropical. Vol 53 No. 2, p. 157-173.
63
ANEXOS
64
ANEXO 1. Formato de encuesta realizado a los agricultores en los departamentos de Córdoba, Sucre, Atlántico y Magdalena.
ENCUESTA PARA EVALUACIÓN DE ADOPCION DE ESPECIES DE YUCA (Manihot esculenta) EN LA COSTA ATLÁNTICA DE COLOMBIA
ENCUESTA No. _____________
Nombre del cultivador: ______________________________________
UbICAción de la finca:
Depto.: ___________ Municipio: ___________ Vereda __________
Temperatura ___________ a.s.n.m ___________
Cuantas Ha sembradas de yuca posee: ______ Ha.
Qué variedades siembra y porqué (características de las variedades)
VARIEDAD CARACTERÍSTICA AREA
Donde adquiere la semilla ________________________________________________________________
Cuál es la finalidad de la producción:
Mercado fresco ___ Industria ___ Consumo animal ___ Otro (Cuál) ____________
Recibe asistencia técnica: No ___
Si : Particular____ Institución (cuál) __________________
Principales problemas del cultivo: __________________________________________
_.__________________________________________________________________
_.__________________________________________________________________
65
ANEXO 2. Microsatélites para análisis de diversidad y diferenciación genética (Mba et al, 2001).
Nombre Tipo de repetición Primer R Primer F Tamaño(pb) Temp MgCl2 SSRY4 GA(16) ATAGAGCAGAAGTGCAGGCG CTAACGCACACGACTACGGA 287 55 1.5 SSRY9 GT(15) ACAATTCATCATGAGTCATCAACT CCGTTATTGTTCCTGGTCCT 278 55 1.5 SSRY12 CA(19) AACTGTCAAACCATTCTACTTGC GCCAGCAAGGTTTGCTACAT 266 55 1.5 SSRY19 CT(8)CA(18) TGTAAGGCATTCCAAGAATTATCA TCTCCTGTGAAAAGTGCATGA
214 55 1.5
SSRY20 GT(14) CATTGGACTTCCTACAAATATGAAT TGATGGAAAGTGGTTATGTCCTT
143 55 1.5 SSRY21 GA(26) CCTGCCACAATATTGAAATGG CAACAATTGGACTAAGCAGCA 192 55 1.5 SSRY34 GGC(7) TTCCAGACCTGTTCCACCAT ATTGCAGGGATTATTGCTCG 279 55 1.5 SSRY38 GT(18) GGCTGTTCGTGATCCTTATTAAC GTAGTTGAGAAAACTTTGCATGAG
122 55 1.5
SSRY51 CT(22)CA(8) AGGTTGGATGCTTGAAGGAA GGATGCAGGAGTGCTCAACT 298 55 1.5 SSRY59 CA(20) GCAATGCAGTGAACCATCTTT CGTTTGTCCTTTCTGATGTTC
158 55 1.5
SSRY63 GA(18) TCAGAATCATCTACCTTGGCA AAGACAATCATTTTGTGCTCCA
290 55 1.5 SSRY64 CT(18) CGACAAGTCGTATATGTAGTATTCACG GCAGAGGTGGCTAACGAGAC 194 55 1.5 SSRY69 CT(25) CGATCTCAGTCGATACCCAAG CACTCCGTTGCAGGCATTA
239 55 1.5
SSRY82 GA(24) TGTGACAATTTTCAGATAGCTTCA CACCATCGGCATTAAACTTTG 211 55 1.5 SSRY100 GA(24) ATCCTTGCCTGACATTTTGC TTCGCAGAGTCCAATTGTTG 210 55 1.5 SSRY102 GT(11) TTGGCTGCTTTCACTAATGC TTGAACACGTTGAACAACCA 179 55 1.5 SSRY103 GA(22) TGAGAAGGAAACTGCTTGCAC CAGCAAGACCATCACCAGTTT
272 55 1.5
SSRY105 CT(16)CA(8) CAAACATCTGCACTTTTGGC TCGAGTGGCTTCTGGTCTTC 225 55 1 SSRY106 CT(24) GGAAACTGCTTGCACAAAGA CAGCAAGACCATCACCAGTTT 270 55 1.5 SSRY108 GA(25) ACGCTATGATGTCCAAAGGC CATGCCACATAGTTCGTGCT 203 55 1.5 SSRY110 GT(12) TTGAGTGGTGAATGCGAAAG AGTGCCACCTTGAAAGAGCA 247 55 1.5 SSRY132 CA(8) CTTTTTGCCAGTCTTCCTGC TGTCCAATGTCTTCCTTTCCTT 196 55 1.5 SSRY135 CT(15) CCAGAAACTGAAATGCATCG AACATGTGCGACAGTGATTG 253 45 1.5 SSRY147 GTACATCACCACCAACGGGC AGAGCGGTGGGGCGAAGAGC 113 45 1.5 SSRY148 GGCTTCATCATGGAAAAACC CAATGCTTTACGGAAGAGCC 114 45 1.5 SSRY151 AGTGGAAATAAGCCATGTGATG CCCATAATTGATGCCAGGTT 182 45 1.5 SSRY155 CGTTGATAAAGTGGAAAGAGCA ACTCCACTCCCGATGCTCGC 158 55 1 SSRY161 GT(11)GA(23) AAGGAACACCTCTCCTAGAATCA CCAGCTGTATGTTGAGTGAGC 220 55 1.5 SSRY164 GA(29) TCAAACAAGAATTAGCAGAACTGG TGAGATTTCGTAATATTCATTTCACTT 187 45 1.5 SSRY169 GA(19) ACAGCTCTAAAAACTGCAGCC AACGTAGGCCCTAACTAACCC 100 55 1 SSRY171 GA(23) ACTGTGCCAAAATAGCCAAATAGT TCATGAGTGTGGGATGTTTTTATG 291 55 1.5 SSRY177 CT(21) ACCACAAACATAGGCACGAG CACCCAATTCACCAATTACCA 268 45 1.5 SSRY179 GA(29) CAGGCTCAGGTGAAGTAAAGG GCGAAAGTAAGTCTACAACTTTTCTAA 226 55 1.5 SSRY180 GA(13) CCTTGGCAGAGATGAATTAGAG GGGGCATTCTACATGATCAATAA 163 55 1.5 SSRY181 CT(31) GGTAGATCTGGATCGAGGAGG CAATCGAAACCGACGATACA 199 55 1.5
66
ANEXO 3. Polymorphic information content – Contenido de Información Polimórfica **** Summary statistics **** Number of loci: 18 Number of individuals: 31 Locus k N Hets Homs Hetz. PIC Excl(1) Excl(2) X2 v Null freq SSRY9 4 31 17 14 0.493 0.433 0.121 0.257 0.00 0 -0.0443 k= Number of alleles SSRY12 7 29 26 3 0.831 0.792 0.462 0.637 0.00 0 -0.0478 N=Number of individuals typed SSRY19 3 29 18 11 0.484 0.428 0.113 0.252 0.00 0 -0.1645 Hets= Heterozygotes SSRY34 4 28 11 17 0.660 0.579 0.221 0.371 18.73 1 0.2667 Homs= Homozygotes SSRY51 8 30 28 2 0.828 0.788 0.456 0.631 0.00 0 -0.0700 Hetz=Expected heterozygosity SSRY52 5 30 17 13 0.613 0.552 0.200 0.362 0.69 1 0.0480 PIC= Polymorphic information content SSRY63 3 31 20 11 0.676 0.591 0.221 0.369 0.00 0 0.0136 Excl(1)= Average exclusion probability SSRY64 4 31 15 16 0.656 0.576 0.219 0.367 0.41 1 0.1470 Excl(2)=Average exclusion probability SSRY69 7 31 23 8 0.649 0.610 0.248 0.433 1.02 1 -0.0878 Hardy-Weinberg equilibrium test SSRY82 5 31 25 6 0.797 0.749 0.392 0.571 0.00 0 -0.0211 X2 =Chi-square value SSRY100 6 30 24 6 0.740 0.688 0.323 0.501 1.65 1 -0.0661 v= Degrees of freedom SSRY105 4 30 17 13 0.544 0.483 0.151 0.298 0.00 0 -0.0199 Null freq= Null allele frequency estimate SSRY106 5 30 15 15 0.547 0.504 0.160 0.327 0.00 0 0.0002 SSRY110 4 31 14 17 0.487 0.440 0.120 0.268 0.00 0 0.0203 SSRY135 3 24 21 3 0.669 0.581 0.215 0.361 0.00 0 0.0000 SSRY151 5 28 27 1 0.736 0.682 0.314 0.494 7.91 1 -0.1628 SSRY155 4 30 19 11 0.674 0.615 0.246 0.417 5.64 1 0.0547 SSRY179 3 27 8 19 0.670 0.583 0.216 0.363 0.00 0 0.3815 Mean number of alleles per locus: 4.67 Mean proportion of individuals typed: 0.952 Mean expected heterozygosity: 0.653 Mean PIC: 0.593 Total exclusionary power (first parent): 0.994647 Total exclusionary power (second parent): 0.999940
67
ANEXO 4. Ubicación de los marcadores : SSRY 12, SSRY 51, SSRY 63, SSRY 82, SSRY 100, SSRY 135, SSRY 179 en el Mapa genético de yuca
68
ANEXO 5. Asociación de grupos según Análisis de Correspondencia Multiple (ACM) de genotipos evaluados de la Costa Atlantica Colombiana
microsatelites yuca 2008-faltantes=0 (acm.sas)
Cluster History Norm T RMS RMS i NCL --------------------------------Clusters Joined--------------------------------- FREQ STD SPRSQ RSQ Dist e 733 023_ 024_ 2 0 0.0000 1.00 0 T 19 CL38 CL27 105 0.4112 0.0109 .889 0.4956 18 CL39 CL66 25 0.3718 0.0017 .887 0.5052 17 CL64 CL22 110 0.4106 0.0034 .884 0.5159 16 CL65 CL62 54 0.4071 0.0075 .877 0.5163 15 CL26 CL73 51 0.3538 0.0010 .876 0.5169 14 CL21 CL24 222 0.3578 0.0080 .868 0.5188 13 CL23 CL29 24 0.4533 0.0030 .865 0.5442 12 CL46 855_ 27 0.2970 0.0007 .864 0.5485 11 CL19 CL16 159 0.4881 0.0154 .848 0.5685 10 CL28 CL17 117 0.4341 0.0042 .844 0.5886 9 CL35 CL12 68 0.4684 0.0130 .831 0.6089 8 CL13 CL15 75 0.4929 0.0095 .822 0.6116 7 CL10 CL18 142 0.4916 0.0121 .810 0.6129
69
6 CL20 CL25 68 0.4886 0.0124 .797 0.6311 5 CL11 CL6 227 0.6242 0.0469 .750 0.7728 4 CL9 CL7 210 0.7274 0.0843 .666 0.9488 3 CL14 CL5 449 0.7867 0.2195 .446 0.9871 2 CL3 CL4 659 0.9325 0.2515 .195 1.1029 1 CL2 CL8 734 1.0000 0.1949 .000 1.2707
ANEXO 6. Distribución general de los diferentes genotipos sembrados por los pequeños agricultores de la Costa Atlántica en los seis grupos identificados en el Análisis de Correspondencia Multiple (ACM)
Grupo ACM GENOTIPO No genotipos Grupo ACM GENOTIPO No genotipos Grupo ACM GENOTIPO No genotipos
1 VENEZOLANA (MCOL2215) 188 2 CORPOICA GINES (CM4843-1) 4 2 LA NEGRA 1
1 VERONICA (CM 4919-1) 6 2 ICA P-12 A 4 2 JARTA VIEJO 1
1 BLANCA MONA A 3 2 MVEN 25 4 2 INDIGENA 1
1 ICA COSTENA A 2 2 SABROCITA 3 2 ICA COSTENA II 1
1 ICA NEGRITA (NEGRITA) 2 2 POLVO DE LA PRIMA 3 2 GUARUMERA 1
1 MOMPOSINA 2 2 BLANCA MONA B 3 2 ENANA 1
1 MTAI – 8 A 1 2 ICA SUCRENA (CM 3555-6) 2 2 COGOLLO DE SEIVA 1
1 LENGUA DE VENADO 1 2 YEMA DE HUEVO 4 2 CARTAGENA 1
1 BRASILERA 1 2 MONTERO 2 2 CANILLA DE GOLER 1
1 CM 4843-1 GINES 1 2 JUANA LA VERDE 2 2 CAMARON 1
70
1 YEMA DE HUEVO 1 2 VERONICA 2 2 AMARGA 1
1 PALANCA 1 2 CARIBENA 2 3 BLANCA MONA C 1
1 ROMPECOLETA 1 2 COLOMBIANA (CM 3306-19) 1 3 CHIROSA 1
1 LIGERITA 1 2 VILLA 1 3 ENANA 1
1 MAJATERA 1 2 SM 1433-41 1 3 HERNANDO 1
1 TRES COLORES 1 2 SIN NOMBRE 1 3 LA MONTUNA 1
1 BOTONCITO 1 2 SEIVA 1 3 SABROCITA 1
1 GUAJIRA 1 2 SABANERA 1 3 VENEZOLANA B 1
1 LOMITA 1 1 2 PRIETA 1 3 SECUNDINA A 4
1 PEZ ESPADA 1 2 PININA 1 3 ICA COSTENA (CG 1141-1) 63
1 RIO GRANDE 1 2 PIE SANTO 1 4 SECUNDINA (COL 2063) 17
1 YUCA NEGRA 1 2 PATA PANDA 1 4 BLANCA MONA D 13
1 YUCA VERDE 1 2 PALANCA 1 4 LENGUA DE VENADO 8
2 Venezolana A 35 2 NOTESEVE 1 4 PIE DE PALOMA 7
2 MTAI - 8 22 2 MAJATERA 1 4 MONTERO 7
2 CUBANA (CM 4574-7) 18 2 LOMITA 3 1 4 Venezolana B 6
2 LUIS 8 2 LLANERA 1 4 SM 1433-4 5
2 ICA NEGRITA (CM 3306-4) 5 2 LA REINA 1 4 MANTECA 3
Grupo ACM GENOTIPO No genotipos Grupo ACM GENOTIPO No genotipos Grupo ACM GENOTIPO No genotipos
4 GUARUMERA 3 4 MANANITA 1 5 MTAI – 8 C 1
4 SANTANERA 4 4 LOMITA 2 1 5 JUANA LA VERDE 1
4 BRASILERA 4 4 LIGERITA 1 5 ICA COSTENA B 1
4 ROMPECOLETA 2 4 LENGUA DE LOBO 1 5 CORPOICA ROJITA 1
4 PALANCA 2 4 LAS FLORES 1 5 CARIBENA 1
4 MTAI – 8 B 2 4 LA CARTAGENA 1 6 BLANCA MONA (COL 2253) 48
4 ICA NEGRITA 2 4 JILE 1 6 SOFA 6
4 DOS COLORES 2 4 JARTA VIEJO 1 6 MONTERO 2
4 DESPELUCADA 2 4 GONGORA 1 6 ICA P-12 B 1
4 CUBITA 2 4 EFRAIN 1 6 NEGRITA 1
4 CORPOICA SUCRENA 2 4 CONEJA 1 6 PIE DE PALOMA 1
4 COGOLLO DE SEIVA 2 4 COCO 1 6 YEMA DE HUEVO 1
4 BOTON 2 4 CHINU 1 6 MOMPOSINA 1
4 BETO 2 4 CHINGALE 1 6 MANGO 1
71
4 YUCA BLANCA 1 4 CG 1141-1 1 6 SARDINA 1
4 YEMA DE HUEVO 1 4 CARTAGENA 1 6 BOGOTANA 1
4 TRES COLORES 1 4 CARNE AMARILLA 1 6 COGOLLO VERDE 1
4 SOLITA 1 4 CARAQUENA 1 6 NINA SOFA 1
4 SOFA 1 4 BEDOYANA 1 6 RUIZ 1
4 SIN NOMBRE 1 4 AZULITA 1 TOTAL GENOTIPOS 717
4 SARDINA 1 4 ALKASAR 2 1
4 RODEO 1 4 ALKASAR 1 1
4 RAIZ AMARILLA 1 4 ALGODÓN 1
4 PUNTA ESPADA 1 5 ICA P-12 (MCOL 1505) (ICA VERDECITA) 29
4 PININA 1 5 Venezolana C 14
4 NOTESEVE 1 5 BLANCA MONA E 7
4 MONTERO BLANCO 1 5 ICA NEGRITA A 4
4 MATRIMONIO 1 5 POLVO DE LA PRIMA 3
4 MARIA PRIETA 1 5 CHIROSA 3
4 MARIA CONCE 1 5 SIN NOMBRE 1
4 MANGO 1 5 ORLANDO POLO 1
ANEXO 7. Número de alelos observados en genotipos evaluados de la Costa Atlántica Colombiana
ANALISIS DE PESOS MOLECULARES DIPLOIDES CONVERTIDOS A DATOS BINARIOS (JSBD.SAS) data ib mm Num Obs Name Alelos 1 y82 6 2 y179 5 3 y135 4 4 y12 4 5 y63 4 6 y51 5 7 y100 7
72
8 y151 4 9 y155 3 ANALISIS DE PESOS MOLECULARES DIPLOIDES CONVERTIDOS A DATOS BINARIOS (JSBD.SAS) NUMERO DE ALELOS Y RANGOS DE BANDAS mm Num Banda Banda Obs Name Alelo s Ini Fin 1 y82 6 1 6 2 y179 5 7 11 3 y135 4 12 15 4 y12 4 16 19 5 y63 4 20 23 6 y51 5 24 28 7 y100 7 29 35 8 y151 4 36 39 9 y155 3 40 42
ANEXO 8. Frecuencia alélica y heterocigosidad en genotipos evaluados de la Costa Atlántica Colombiana
ANALISIS DE PESOS MOLECULARES DIPLOIDES CONVERTIDOS A DATOS BINARIOS (JSBD.SAS)
Heterocigosidad g T F r Y R y y y y y O u P E y 1 1 y y y 1 1 1 b p E Q 8 7 3 1 6 5 0 5 5 h s o _ _ 2 9 5 2 3 1 0 1 5 e 1 . 0 734 0.67468 0.57372 0.65305 0.51618 0 .59178 0.63611 0.61946 0.69709 0.59021 0.61692 2 1 1 222 0.52343 0.38875 0.60150 0.14475 0 .22867 0.41011 0.35280 0.54892 0.19864 0.37751 3 2 1 159 0.65852 0.55172 0.60227 0.60150 0 .55894 0.69115 0.45315 0.59208 0.41958 0.56988 4 3 1 75 0.54356 0.41591 0.58124 0.12649 0 .50747 0.61022 0.56107 0.54338 0.61538 0.50052 5 4 1 142 0.52809 0.41998 0.61007 0.62755 0 .64414 0.66683 0.76532 0.53340 0.66487 0.60670 6 5 1 68 0.36624 0.38041 0.22686 0.51730 0 .64782 0.67896 0.64263 0.57958 0.60824 0.51645 7 6 1 68 0.49611 0.43047 0.56704 0.54174 0 .39749 0.52130 0.72005 0.51698 0.55093 0.52690
73
ANALISIS DE PESOS MOLECULARES DIPLOIDES CONVERTIDOS A DATOS BINARIOS (JSBD.SAS)
Obs he_y82 he_y179 he_y135 he_y12 he_y63 he_y51 he_y100 he_y151 he_y155 he 1 0.53856 0.43596 0.56336 0.40652 0.46355 0.57631 0.53650 0.55458 0.44987 0.50280 Obs vh_y82 h_y179 vh_y135 vh_y12 vh_y63 vh_y51 vh_y100 vh_y151 vh_y155 vhe 1 0.006136434 0.003961500 0.011730 0.049322 0.028752 0.014190 0.026103 0.000603435 0.03434 6 0.007893223
ANALISIS DE PESOS MOLECULARES DIPLOIDES CONVERTIDOS A DATOS BINARIOS (JSBD.SAS) Diferenciación
Obs g_y82 g_y179 g_y135 g_y12 g_y63 g_y51 g_y100 g_y151 g_y155 g Hst 1 0.79824 0.75989 0.86265 0.78757 0.7833 1 0.90599 0.86607 0.79557 0.76221 0.81502 Gst 0.20176 0.24011 0.13735 0.21243 0.21669 0. 09401 0.13393 0.20443 0.23779 0.18498
74
ANALISIS DE PESOS MOLECULARES DIPLOIDES CONVERTIDOS A DATOS BINARIOS (JSBD.SAS) ANALISIS DE FRECUENCIAS PARA TIPOS DE ALELOS
The FREQ Procedure Cum ulative Cumulative y82hz Frequency Percent Fr equency Percent --------------------------------------- --------------------- Homocig 185 25.20 185 25.20 Heteroc 549 74.80 734 100.00 Cumu lative Cumulative y179hz Frequency Percent Fre quency Percent ---------------------------------------- -------------------- Homocig 474 64.58 474 64.58 Heteroc 260 35.42 734 100.00 Cumu lative Cumulative y135hz Frequency Percent Fre quency Percent ---------------------------------------- -------------------- Homocig 239 32.56 239 32.56 Heteroc 495 67.44 734 100.00 Cumu lative Cumulative y12hz Frequency Percent Fre quency Percent ---------------------------------------- -------------------- Homocig 385 52.45 385 52.45 Heteroc 349 47.55 734 100.00 Cum ulative Cumulative y63hz Frequency Percent Frequency Percent ---------------------------------------- -------------------- Homocig 427 58.17 427 58.17 Heteroc 307 41.83 734 100.00 Cumu lative Cumulative y51hz Frequency Percent Frequency Percent ---------------------------------------- -------------------- Homocig 281 38.28 281 38.28 Heteroc 453 61.72 734 100.00 Cumu lative Cumulative y100hz Frequency Percent Fre quency Percent ---------------------------------------- -------------------- Homocig 368 50.14 368 50.14 Heteroc 366 49.86 734 100.00 Cumu lative Cumulative y151hz Frequency Percent Fr equency Percent --------------------------------------- --------------------- Homocig 108 14.71 108 14.71 Heteroc 626 85.29 734 100.00 Cumu lative Cumulative y155hz Frequency Percent Fr equency Percent --------------------------------------- --------------------- Homocig 434 59.13 434 59.13 Heteroc 300 40.87 734 100.00
Promedio Heterogeneidad observada: 0.56087