servicio de salud de castilla-la mancha · 2011-12-21 · proyecto serendipia del sescam objetivo...

Servicio de Salud de Castilla-La Mancha La Patología digital en el trabajo asistencial y en la investigación traslacional.

MARCIAL GARCÍA ROJO

Coordinador SSII. Hospital General de Ciudad Real Junta Directiva de la SEIS

Servicio de Anatomía Patológica

martes 20 de diciembre de 11

Servicio de Salud de Castilla-La Mancha 20/12/11 2

Anatomía Patológica

DIAGNÓSTICO

TRATAMIENTO

PRONÓSTICO


Introducción

Las nuevas tecnologías de la información en Patología (sistemas de información, fotografía digital, microscopía virtual) están permitiendo un trabajo más eficiente en los servicios de Anatomía Patológica. Existe una creciente automatización en la especialidad. La imagen digital de gran calidad permite diagnósticos similares al microscopio. El SESCAM creó en 2004 un Centro de Innovación en Tecnología de la Información (CITI) para Patología.


Microscopía virtual. Términos

Digitalización completa de toda la preparación (whole slide imaging, WSI) Preparación digital = Preparación virtual (virtual slide) Componentes:

Escáner (microscopio robotizado) Visor de preparaciones Gestión de imágenes


Cortes histológicos

Las preparaciones convencionales son frágiles, No son permanentes, sobre todo inmunofluorescencia, cristales articulación, … En citología, no es posible distribuir copias.

VENTAJAS DE PREPARACIÓN VIRTUAL

¡ Pequeños aumentos con calidad extraordinaria. ¡ Mapa dinámico de preparación ¡ Enviar imágenes de mayor resolución recibiendo sólo el área seleccionada. ¡ Grabar y reproducir la trayectoria seguida por el patólogo durante su examen de la preparación o laminilla y ¡ Las imágenes quedan almacenadas permanentemente, y sobre ellas es posible realizar anotaciones que también pueden quedar grabadas.

Área de tejido de unos 25 x 20 mm


Nuevas redes de telepatología

Red Europea: Action IC0604: Telepathology Network (EURO-TELEPATH)

http://www.conganat.org/eurotelepath

Red de Telepatología de Castilla-La Mancha.

Proyecto Serendipia del SESCAM Objetivo común: Crear una herramienta de comunicación interprofesional eficiente entre los departamentos de Patología, utilizando una plataforma web estándar.


Los principales objetivos de Serendipia son:

Objetivo de SERENDIPIA

o  Proveer de todo el equipamiento necesario para crear servicios digitales de Anatomía Patológica.

o  La creación de una red regional de telepatología.

Para conseguir estos objetivos Serendipia se ha basado en las principales guías y estándares médicos.


Tipos de imágenes

1

4

5 6

2 4 4 4

3


Características de las Virtual Slide


Hospital General de Ciudad Real’s Aperio images


Alcance y situación actual Implantación en siete hospitales de la comunidad. Tres son hospitales satélite que dependen de los hospitales de referencia (Áreas clínicas). Situación Actual:

o  Suministro de equipamiento informático y dispositivos de adquisición de imágenes.

o  SI que interconecta con los diferentes sistemas y dispositivos de adquisición de imágenes.

o  Implantación en el hospital de Manzanares.


Infraestructura Hospitales de

referencia •  Lectores de códigos de

barras para contenedores, casetes y slide.

•  Sala de autopsias. •  Estación de

Macroscópica.

•  Sala de videoconferencia.

•  Escáner > 50 slide.

•  Almacenamiento (40 TB)

Hospitales Satélites

•  Lectores de códigos de barras. •  Estación de macroscópica.

•  Impresora de etiquetas.

•  Foto microscopia.

•  Escáner > 5 slide.

•  Almacenamiento (8 TB)


Necesidades de Almacenamiento

o  Número de muestras por año: 5.000 - 40000.

o  Tamaño medio de preparaciones virtuales sin comprimir: 30 GB – 40 GB.

o  Media de tamaño por preparaciones virtuales usando JPEG2000 a un aumento de 40X: 0.5 – 4 GB.

o  Digitalización de todas las imágenes salvo las preparaciones virtuales.


Necesidades de Almacenamiento

Estimación de Almacenamiento en 4 años: o  Albacete Hosp. (800 camas) 40 Terabytes.

o  Almansa (100 camas) 8 Terabytes. o  Villarrobledo (100 camas) 8 Terabytes.

o  Alcázar de San Juan (400 camas) 32 Terabytes.

o  Tomelloso (100 camas) 8 Terabytes.


DICOM. Suplemento 122. Fichero único: JPEG2000/JPIP


Sup145 multi-frame tiling (WG26)

In 1 or more DICOM Series

Thumbnail Image

Intermediate Image Tiles

Baseline Image Tiles

Multi-frame image (single object)

Multi-frame image (single object) may include multiple Z-planes, color planes

Single frame image

Use multi-frame image objects (not object per tile)


Aplicaciones desarrolladas

1. El primero es un SI para el gestionar el flujo de trabajo. Próxima versión: Entorno web


S.I. de Patología en entorno Web Visualizar fotos y preparaciones digitales



El segundo SI es un portal Web de Telepatología: o  Segunda opinión



El segundo SI es un portal Web de Telepatología: o  Foro de consulta



El segundo SI es un portal Web de Telepatología: o  Biblioteca pedagógica


Análisis de imagen


Componentes

•  Integrador: SATEC •  SI de Anatomía Patológica (Novopath à VitroPath)

•  PACS 5.6 (Udiat): JPGEG2000 links (JPIP)

•  Aplicación Web J2EE (Satec)

•  Servidor y visualizador de imágenes (Aurora)

•  Escáner de Virtual slide (Aperio)

•  Gestión de usuarios: LDAP, Kerberos


Arquitectura Lógica


Arquitectura: 8 hospitales

ÁREA CLÍNICA 2

CentroHospitalario 2

Servicios Centrales

ÁREA CLÍNICA 1

CentroHospitalario 1

Hospital Dependiente 1.1

SESCAM


Hospital Nodriza 2



Ingestión Imágenes, escaneos locales, consulta de

estudios online.

Consulta Worklist WS

Hospital Nodriza 1(Edificio2)

HIS

PACS

PIS

Portal

Portal

Repositorio imágenes anónimas

Aurora ImageServer

Portal

Aurora ImageServer

PACS de Backup

PÚBLICO PRIVADO

Aurora ImageServer

RepositorioJPEG2K

HIS

PACS

PIS

Portal

Aurora ImageServer

RepositorioJPEG2K

Usuario SESCAM

Usuario Externo

Usuario SESCAM

Segunda opinión y biblioteca pedagógica(incluyendo imágenes)

RepositorioJPEG2K

Repositorio imágenes Aperio







Foro, segunda opinión, biblioteca pedagógica y

escaneos remotos.Inventario e incidencias.

PACS: envío backup.Consulta proxy.

JP2K: backup

Publicación y anonimizaciónde informes, DICOM y JP2K

Storage commitmentde digitalizaciones remotas

Publicación de informese imágenes.

Publicación de informese imágenes.


El S.I. de Patología debe estar integrado con:

¡ Historia clínica electrónica: BBDD pacientes única, petición electrónica, informe en la HCE sin olvidar atención primaria ¡ Dispositivos automáticos del laboratorio ¡ PACS: Servidores de imágenes ¡ Portal de telepatología (telemedicina) ¡ Registro hospitalario de tumores ¡ Biobancos (banco de tumores) ¡ Gestión de calidad ¡ Datawarehouse à Minería de datos


IHE. Actores y Transacciones


Hacia una medicina personalizada

¡ Integración SIAP-Gestión de imágenes: IHE ¡ Información incluida en los ficheros de imágenes (metadatos): DICOM ¡ Codificación: SNOMED ¡ Biblioteca de imágenes ¡ Guías clínicas:

l  Sistema Bethesda 2001 l  Guía de consenso de la ASCCP l  Guía multidisciplinaria cáncer laringe de Holanda l  Informe AP en el cáncer de mama l  Colegio Americano de Patólogos


Gestión del conocimiento

¡ Pilares: Informática y patología basada en pruebas ¡ Documentos de organización (manuales, protocolos) ¡ Enlace a BBDD bibliográficas Medline, Web Of Knowlegde ¡ Portal de telepatología ¡ Portal del empleado


Beneficios del proyecto

¡ Automatizar procesos críticos para optimizarlos y minimizar posibles causas de errores. ¡ Diagnóstico, evaluación terapéutica y pronóstica más rápidos y de más calidad, aspectos especialmente relevantes en los estudios intraoperatorios. ¡ Facilita la consulta intradepartamental y entre diversos especialistas del mismo centro. ¡ Mejor seguimiento del proceso diagnóstico. ¡ Segunda opinión más rápida a los centros de referencia. ¡ Introducir la utilización de herramientas de procesado y análisis de imagen como herramientas de ayuda en el diagnóstico por ordenador en Anatomía Patológica.


Retos en medicina traslacional

Micromatrices de tejido (TMAs) Integración de información genética/molecular Otras modalidades de imagen: Inmunofluorescencia, FISH.


FISH – Un reto tecnológico


o  SERENDIPIA es la primera red de telepatología con fines asistenciales

o  Inclusión dentro de la HCE (MAMBRINO XXI).

o  Mejora la gestión del conocimiento

o  Ayuda a los pacientes a recibir mejores diagnósticos y mejor evaluación pronóstica y a seleccionar las mejores opciones terapéuticas (biomarcadores).

o  Interconexión con otras redes de telepatología.

Conclusiones


http://www.telepathology2010.com


[email protected]

Muchas gracias.

servicio de salud de castilla-la mancha · 2011-12-21 · proyecto serendipia del sescam objetivo...

Documents