reconstrucción de imágenes tomográficas mediante machine learning · 2017-10-27 ·...

31
Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David Mera 1 Andrés Gómez 2 1 Centro Singular de Investigación en Tecnoloxías da Información (CiTIUS) 2 Centro de Supercomputación de Galicia (CESGA) Machine Learning Workshop Galicia 2017 citius.usc.es

Upload: others

Post on 09-Jul-2020

4 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Reconstrucción de imágenes

tomográficas mediante Machine

Learning

Xosé Fernández 1 David Mera 1 Andrés Gómez 2

1 Centro Singular de Investigación en Tecnoloxías da Información (CiTIUS)2 Centro de Supercomputación de Galicia (CESGA)

Machine Learning Workshop Galicia 2017citius.usc.es

Page 2: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Índice

1 Introducción

2 Metodología

3 Resultados

4 Conclusiones

Machine Learning Workshop Galicia 2017

Page 3: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Índice

1 Introducción

2 Metodología

3 Resultados

4 Conclusiones

Machine Learning Workshop Galicia 2017

Page 4: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Introducción Tomografía de Impedancia Eléctrica

Permite reconstruir una imagen de corte transversal de la conductividad del objeto

Parte de las mediciones eléctricas tomadas en la superficie

Método no invasivo

Reconstrucción de un tórax humano

Machine Learning Workshop Galicia 2017 1/15

Page 5: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Introducción Obtención del voltaje en los electrodos

Fuente: doi:10.3390/technologies5030048

Machine Learning Workshop Galicia 2017 2/15

Page 6: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Introducción Obtención de la imagen

Existen varios métodos de resolución

. Ejemplo de método lineal:

- Equipotential Back Projection (EBP)

. Ejemplo de método no-lineal:

- Algoritmo Newton-Raphson

. Muy intensos computacionalmente

Machine Learning Workshop Galicia 2017 3/15

Page 7: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Introducción

Objetivo principal

Reconstruir la imagen utilizando Machine Learning

Machine Learning Workshop Galicia 2017 4/15

Page 8: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Índice

1 Introducción

2 Metodología

3 Resultados

4 Conclusiones

Machine Learning Workshop Galicia 2017

Page 9: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Metodología Mallas

Malla vacía Malla con 1 elemento

Machine Learning Workshop Galicia 2017 5/15

Page 10: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Metodología Dataset

Malla con 1 elemento Malla con 1 elemento

Machine Learning Workshop Galicia 2017 6/15

Page 11: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Metodología Dataset

Malla con 2 elementos Malla con 3 elementos

Machine Learning Workshop Galicia 2017 7/15

Page 12: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Metodología Dataset

Casos generados: 20.000

. 70 % conjunto de entrenamiento

. 15 % conjunto de validación

. 15 % conjunto de test

Machine Learning Workshop Galicia 2017 8/15

Page 13: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Metodología Red neuronal

Entrada

Diferencia de potencial obtenida en los

electrodos

208 entradas

Salida

Permeabilidad eléctrica en cada punto de

la malla

844 salidas

Principal dificultad

Desproporción entre el número de entradas y salidas

Machine Learning Workshop Galicia 2017 9/15

Page 14: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Metodología Esquema red neuronal

Capade

salida

Capasocultas

Capade

entrada

? ...

Machine Learning Workshop Galicia 2017 10/15

Page 15: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Metodología Influencia número de neuronas

Ratio de

aprendizaje = 0,1

1 capa oculta

1.000 Epochs

Machine Learning Workshop Galicia 2017 11/15

Page 16: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Índice

1 Introducción

2 Metodología

3 Resultados

4 Conclusiones

Machine Learning Workshop Galicia 2017

Page 17: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Resultados Progresión

Ratio de aprendizaje fijo

1 capa oculta con 700 neuronas

Objetivo

Machine Learning Workshop Galicia 2017 12/15

Page 18: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Resultados Progresión

Inicio Objetivo

Machine Learning Workshop Galicia 2017 13/15

Page 19: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Resultados Progresión

Epoch 5 Objetivo

Machine Learning Workshop Galicia 2017 13/15

Page 20: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Resultados Progresión

Epoch 10 Objetivo

Machine Learning Workshop Galicia 2017 13/15

Page 21: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Resultados Progresión

Epoch 50 Objetivo

Machine Learning Workshop Galicia 2017 13/15

Page 22: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Resultados Progresión

Epoch 100 Objetivo

Machine Learning Workshop Galicia 2017 13/15

Page 23: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Resultados Progresión

Epoch 1000 Objetivo

Machine Learning Workshop Galicia 2017 13/15

Page 24: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Resultados Progresión

Epoch 2000 Objetivo

Machine Learning Workshop Galicia 2017 13/15

Page 25: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Resultados Progresión

Epoch 3000 Objetivo

Machine Learning Workshop Galicia 2017 13/15

Page 26: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Resultados Progresión

Epoch 4000 Objetivo

Machine Learning Workshop Galicia 2017 13/15

Page 27: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Resultados Progresión

Resultado final (MSE conjunto test: 0,23) Objetivo

Machine Learning Workshop Galicia 2017 13/15

Page 28: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Índice

1 Introducción

2 Metodología

3 Resultados

4 Conclusiones

Machine Learning Workshop Galicia 2017

Page 29: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Conclusiones

Resultados prometedores

Amplio margen de mejora

Posibles aplicaciones

. Entornos médicos

. Obtener la distribución de humedad en productos, como por ejemplo, la madera

Machine Learning Workshop Galicia 2017 14/15

Page 30: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

Introducción Metodología Resultados Conclusiones

Referencias

Warsito, W., et al.

Neural network based multi-criterion optimization image reconstruction technique for imaging two- and three-phase flow systems using electrical capacitance tomography.

Measurement Science and Technology, 12(12) (2001) 2198–2210.

Liu, X.,et al.

An extreme learning machine combined with Landweber iteration algorithm for the inverse problem of electrical capacitance tomography.

Flow Measurement and Instrumentation, 45 (2015) 348–356.

Martin, S., & Choi

C. T. M. Nonlinear Electrical Impedance Tomography Reconstruction Using Artificial Neural Networks and Particle Swarm Optimization.

IEEE Transactions on Magnetics, 52(3) (2016) 1–4.

Sun, T. D., et al.

Image Reconstruction of an Electrical Capacitance Tomography System Using an Artificial Neural Network.

1st World Congress on Industrial Process Tomography, (1999) 174–180.

Marashdeh, Q., Warsito, W., Fan, L.-S., & Teixeira

F. L. A nonlinear image reconstruction technique for ECT using a combined neural network approach.

Measurement Science & Technology, 17(8) (2006) 2097–2103.

Denisov, I. V, Kulchin, Y. N., Panov, a V, & Rybalchenko

N. a. Neural network methods of reconstruction tomography problem solutions.

Optical Memory & Neural Networks, 14(1) (2005) 45–58.

Machine Learning Workshop Galicia 2017 15/15

Page 31: Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning · 2017-10-27 · Reconstrucción de imágenes tomográficas mediante Machine Learning Xosé Fernández 1 David

¡Muchas gracias

por su atenció[email protected]

Este trabajo ha sido financiado por la Xunta de Galicia a través de laRede Galega de Tecnoloxías Cloud e Big Data para HPC - R2016/045

Powered by Finisterrae