pubmed. búsqueda bibiográfica en la base de datos medline
DESCRIPTION
Objetivo: Aprender a diseñar y ejecutar estrategias de búsqueda bibliográfica para obtener resultados relevantes en la base de datos MEDLINE, a través de la plataforma PubMed. Descripción: PubMed es la base de datos bibliográfica de la National Library of Medicine de los EEUU. Incluye más de 19 millones de registros de artículos biomédicos de MEDLINE, así como de otras revistas sobre ciencias de la vida. Programa: 1. Acceso personalizado a PubMed a través de Bibliosalut (www.bibliosalut.com). 2. La búsqueda bibliográfica: cómo se interroga una base de datos. Los lenguajes documentales. El ruido y el silencio documental. Los operadores booleanos y de proximidad. Cómo se analizan los resultados. 3. El uso del MeSH (Medical Subject Headings). El tesaurus de Medline. 4. La búsqueda simple y la búsqueda avanzada. 5. Opciones para guardar los resultados y crear citaciones. 6. Los límites. 7. La cuenta personal de PubMed (My NCBI). Creación de colecciones de referencia y de autoalertas. 8. La herramienta para encontrar una citación concreta: Single Citation Matcher.TRANSCRIPT
PubMed Búsqueda bibliográfica en la base de datos
Medline
Comissió de Formació Continuada de les Professions Sanitàries de les Illes Balears
(0,5 crèdits)
www.bibliosalut.com
Objetivo
Aprender a diseñar y ejecutar estrategias de búsqueda
bibliográfica para obtener resultados relevantes en la
base de datos MEDLINE, a través de la plataforma
PubMed.
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Sumario
• Acceso personalizado a través de Bibliosalut. • La búsqueda bibliográfica. • El uso del MeSH (Medical Subject Headings).• La búsqueda simple y la búsqueda avanzada. • Opciones para guardar los resultados y crear
citaciones. • Los límites. • La cuenta personal de PubMed (My NCBI). Creación de
colecciones de referencias y de autoalertas. • La herramienta para encontrar una citación concreta:
el Single Citation Matcher. 3
Esta presentación
Importancia de la MBE
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PubMed
• PubMed es la base de datos bibliográfica de la National
Library of Medicine de los EE.UU. Incluye más de 19
millones de registros de artículos biomédicos de MEDLINE,
así como de otras revistas sobre ciencias de la vida.
• Más de 19 millones de registros de 5.400 revistas de 80
países del mundo, en 37 idiomas. Diariamente se
incorporan entre 2.000 y 4.000 referencias de artículos.
• Años de cobertura: desde 1947 hasta la actualidad.
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Acceso personalizado a Bibliosalut
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Búsqueda bibliográfica
Identificar la necesidad de información
• La pregunta clínica es la herramienta para elaborar la
estrategia de búsqueda y en ella tienen que estar
representados todos los términos relevantes.
• Hay que formularla correctamente para obtener unos
resultados precisos de una manera eficiente y evitar
recuperar un elevado número de artículos
irrelevantes.
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Identificar la necesidad de información
• Cuanto más concreta y concisa sea la pregunta más posibilidades tendremos de obtener unos resultados satisfactorios.
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Algunos ejemplos a mejorar:
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“Prevención del asma”
Algunos ejemplos a mejorar:
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“Prevención del asma en ancianos de más de 80 años
en Calviá”
Algunos ejemplos a mejorar:
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“Prevención del asma en ancianos que padecen alergias crónicas, tratamiento más eficaz y menos adverso, y pronóstico a corto y
a medio plazo”
¿Cómo funciona una base de datos?
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La indexación: identificación del contenido
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El concepto de tesauro y los descriptores
• Los tesauros son herramientas de control terminológico, vocabularios controlados y dinámicos de términos (descriptores) que pueden mantener relaciones entre ellos de jerarquía, asociación y equivalencia.
• Los descriptores son los términos que forman parte de un tesauro y que sirven para identificar el contenido de un documento y recuperarlo.
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El concepto de tesauro y los descriptores
• Los tesauros asociados a bases de datos admiten un
único término para designar un único concepto.
Por ejemplo:
accidente vascular cerebral AVC ictus
apoplegíaaccidente vascular cerebral
Lenguaje libre
Descriptor del tesauro
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El MeSH: el tesauro de PubMed
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El MeSH: el tesauro de PubMed
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Lenguaje natural Lenguaje controlado
Las palabras clave y los descriptores
Palabras clave
Términos libres del lenguaje natural, suficientemente
significativos, extraídos del título o del contenido del
documento.
Descriptores
Términos de un tesauro (vocabulario controlado), utilizado
para la indexación con el fin de identificar el contenido de los documentos: MeSH, DeCS...
RUIDO PRECISIÓN
Protocolo de búsqueda
• La necesidad de información requiere la construcción
de una pregunta simple y concreta con la que poder
dar respuesta bibliográfica a esta necesidad.
Por ejemplo:
¿Puede la motivación de los médicos incidir en la calidad de la asistencia sanitaria que dan a los pacientes?
1º Plantear una pregunta clínica
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2º Identificar las palabras clave
• Se trata de determinar, mediante el lenguaje
libre, las ideas clave que se esconden tras la
pregunta inicial.
Por ejemplo:
Motivación / Incentivos / Médicos / Calidad asistencial
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3º Seleccionar los descriptores en el tesauro
• Tendremos que utilizar el tesauro (por ejemplo, el MeSH de PubMed o el DeCS de BIREME). Se trata de identificar los términos más apropiados que esta herramienta ofrece para cada uno de los términos en lenguaje libre identificados en la pregunta.
Exemple: Motivación / Incentivos / Médicos / Calidad de la atención de salud
(BIREME) Motivation / Incentives / Physician / Quality of healthcare
(Pubmed)
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4º Utilizar máscaras y truncamientos (si procede)• En una búsqueda de texto libre, se puede conseguir un mayor grado de
exhaustividad aplicando los caracteres de truncamiento: (*) o ($)
Por ejemplo:
Para localizar términos relacionados con la “motivación” hay que escribir “motivat*”
(Motivat* OR Incentive*) AND Physician* AND Quality of healthcare
• Ralentiza enormemente la búsqueda.
• Con según que términos es delicado porque se pueden obtener referencias que no
tengan nada que ver con la materia que estamos buscando: (al truncar “phys*”, en
lugar de “physician*”, la búsqueda recupera términos como “physiology“ o
“physics”, que nada tienen que ver con el término “physicians”.
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5º Relacionar los términos
• Una vez identificados los términos (MeSH o DeCS) más pertinentes, hay que combinarlos (utilizado los operadores booleanos) con lógica para poder ejecutar la pregunta a la base de datos.
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Operador “Y” (AND)
• Para la intersección de los dos términos:
Con el operador “Y” se obtienen solo las referencias que contienen ambos términos, pero no las
referencias que contienen solo uno de los términos.
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Motivación Médicos
AND
Operador “O” (OR)
• Para la suma de dos términos:
Con el operador “O” se obtienen las referencias que contienen uno de los dos términos, o el otro o los
dos.
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Motivación Incentivos
OR
Operador NO (NOT)
• Para la exclusión de un término:
Con el operador “NO” se obtienen todas las referencias relativas a “motivación” en cualquier grupo de
profesionales sanitarios excepto en el personal de enfermería, por el hecho de haber excluido
expresamente este grupo mediante el término “enfermeras”.
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Motivación Enfermería
NOT
6º Operadores booleanos: relacionar los términos
Motivation AND Physicians AND Quality of healthcare
7º Ejecutar la búsqueda• Finalmente, hay que llevar a la práctica la estrategia
de búsqueda diseñada y planificada en la teoría, y que se tendrá que adecuar a las características y funcionalidades específicas de cada base de datos.
¿Y si hubiéramos pasado del MESH?
La búsqueda en lenguaje libre vs. lenguaje controlado
Pros y contras del lenguaje libre
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Útil para temas inequívocos, nuevas intervenciones que todavía no han sido indexadas, marcas comerciales de medicamentos y nombres propios.
• Recupera muchos resultados irrelevantes.
• No tiene en cuenta los plurales.• Ignora las diferencias ortográficas.
¿Cómo podemos limitar los resultados?
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¿Cómo podemos limitar los resultados?
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Permiten restringir la búsqueda por:• Tipo de artículo• Disponibilidad del texto completo • Fecha de publicación • Especies• Sexo• Categoría de la revista• Edad• Campo del registro (autor, título,
revista...)
Valoración de los resultados
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Al acabar la búsqueda, es necesario realizar una valoración
de los resultados obtenidos, tanto en lo referente a la
exhaustividad (cuántos de los posibles), como a la precisión
(cuántos de los recuperados) y a la relevancia (cuáles serán
útiles para contestar a nuestra pregunta).
Valoración de los resultados
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Filtros
Acceso al texto completo o al SOD
Estrategia de búsqueda
Formulario de búsqueda básica
Valoración de los resultados
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• Utiliza términos más
específicos.
• Utiliza frases (“”)
• Refina con los límites.
• Marca como Major Topic
los descriptores principales.
• Utiliza términos más amplios.
• Utiliza sinónimos.
• Refina con los límites.
• Si encuentras algún artículo
interesante mira qué
descriptores utiliza.
¿Demasiados resultados? ¿Pocos resultados?
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Acceso al texto completo
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Acceso al texto completo
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Acceso al texto completo
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Acceso al texto completo
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Servicio de Obtención de Documentos: SOD
Tiene como objetivo facilitar a sus usuarios los documentos no
accesibles electrónicamente a través de la biblioteca virtual.
Servicio de Obtención de Documentos: SOD
Servicio de Obtención de Documentos (SOD)
¿Cómo funciona?
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¿Cómo funciona?
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¿Cómo funciona?
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¿Cómo funciona?
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SOD: ¿cómo pedir un documento?
SOD: ¿cómo pedir un documento?
My NCBI
Es una herramienta que permite guardar en un
servidor remoto (accesible en cualquier
momento, solo hay que conectarse a Internet)
estrategias de búsqueda, referencias
bibliográficas, e incluso permite personalizar,
mediante la elección de filtros, el uso de
PubMed. 53
Las autoalertas
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Herramientas web 2.0
Sindicación de contenidos
Es un sistema de intercambio de información
basado en XML.
Conocer las novedades de: Sumarios de revistas Bases de datos Webs oficiales Prensa Blogs ... y en muchos otros lugares
¿Para qué sirve?
Localización
• Explorer
• Firefox
http://www.feedly.com/
http://www.netvibes.com
http://www.bloglines.com/
Algunas herramientas...
Funcionamiento
Funcionamiento de Feedly
Apps de PubMed
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¿Y si queremos una referencia concreta?
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¿Dónde puedo encontrar
aquel artículo que leí el año
pasado en el New England
sobre el trastorno bipolar?
En PubMed Tools
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Ahora ya sabéis! La importancia de consultar la documentación
científica basada en la evidencia.Cómo plantear una pregunta de investigación.Hacer una estrategia de búsqueda bibliográfica. La utilidad del tesauro. Limitar los resultados según nuestra demanda.Crear y gestionar las alertas y los canales RSS. Encontrar un artículo concreto o incompleto.
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Recordad! Bibliosalut es 2.0!
Compartimos lo que os interesa:
• Novedades sobre: Bibliosalut, el uso de bases de datos,
nuevas publicaciones, eventos importantes, formación,
actualizaciones de guías de práctica clínica, etc.
• Nuestro conocimiento: presentaciones y FAQ.
• Vuestra producción científica.
Recordad! Bibliosalut es 2.0!
#PublicaSalutIB es un servicio de difusión a través de Twitter, para dar a conocer
la producción científica más reciente de los profesionales del sistema sanitario
público de las Islas Baleares.
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