Principios de aditividad y contribuciones de grupoElide Viviana Cotugno Herreo

Interacciones y transformaciones fsicasDepartamento de QumicaFacultad de CienciasUniversidad Nacional de Colombia

Contenido1. Introduccin3Esquemas de aditividad de grupo:

Evaluacin de las propiedades termodinmicas: estructura molecular.Explica: diferencias experimentales, interacciones intramoleculares de grupos funcionales en la molculas.[2]

El principio de aditividad de grupo: cada grupo constituyente de una molcula interacta con el disolvente circundante independientemente de grupos adyacentes.La contribucin a la propiedad termodinmica de los grupos constituyentes es obtenida usando datos termodinmicos de pequeos solutos que son utilizados para modelar la molcula de inters[1].compuestos modelo: tamao, rea superficial, carga y la hidrofobicidad muy cercanas a la de las fracciones de la molcula objetivo.

[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution, Biophysical Chemistry (2003), 100, 239-260.[2]Lepori, L. and Gianni, P.: Partial molar volumes of ionic and nonionic organic solutes in water: A simple additivity scheme based on the intrinsic volume approach, J. Solution Chem., 29, 405-447, 2000. 2. Determinacin del volumen molar parcial de solutos inicos y no inicos en agua: el volumen de van der Waals de iones y molculas

4El volumen de Van Der Waals Vw es el volumen contenido dentro de una superficie impenetrable por el solvente.(calculado por el mtodo de Bondi el cual utiliza el radio de van der Waals rw [3]). [3] A. Bondi, J. Phys. Chem. 68, 441 (1964). [4] A. Bondi, J. Phys. Chem. 68, 441 (1964).[5] R. A. Pierotti, Chem. Rev. 76, 717 (1976).]

Para iones orgnicos rw no se afecta por la carga.No se toman en cuenta puentes de hidrgeno.5Determinacin del volumen molar parcial de solutos inicos y no inicos en AGUA: la contribucin de grupo

Nuevo set de Vw :con in crementos de porciones de hidrocarburos como CH3 fueron obtenidos a partir de Vw para hidrocarburos.Vw reproducible en +/- 0,2.[2]Lepori, L. and Gianni, P.: Partial molar volumes of ionic and nonionic organic solutes in water: A simple additivity scheme based on the intrinsic volume approach, J. Solution Chem., 29, 405-447, 20006Determinacin del volumen molar parcial de solutos inicos y no inicos en agua: enfoque del volumen intrnseco.

[2]Lepori, L. and Gianni, P.: Partial molar volumes of ionic and nonionic organic solutes in water: A simple additivity scheme based on the intrinsic volume approach, J. Solution Chem., 29, 405-447, 20007

[2]Lepori, L. and Gianni, P.: Partial molar volumes of ionic and nonionic organic solutes in water: A simple additivity scheme based on the intrinsic volume approach, J. Solution Chem., 29, 405-447, 2000Clculo de las capacidades calorficas parciales molares de protenas desplegadas en soluciones acuosas

8Propiedades termodinmicas a partir de contribuciones de grupo de varios residuos de aminoacidos[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution, Biophysical Chemistry (2003), 100, 239-260.Limitaciones:

protenas con aminocidos neutrosSolo funciona a 25C

Eleccin de compuesto modelo: (Gly)-X-(Gly) donde X es uno de los 20 aminocidos.

Clculo de las capacidades calorficas parciales molares de protenas desplegadas en soluciones acuosas: modelo de aditividad basado en un grupo de pptidos.

La capacidad calorifica molar parcial de cualquier cadena lateral R de la proteina esta dada por:9Interacciones con NH3+ o COO-.Las capacidades calorficas usando los valores Cp20 de de los tetra pptidos GlyPheGlyGly y GlyGlyAlaGly y de los pentapptidos GlyGlyLeuGlyGly y GlyGlySerGlyGly son idnticas

[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution, Biophysical Chemistry (2003), 100, 239-260.10Clculo de las capacidades calorficas parciales molares de protenas desplegadas en soluciones acuosas: modelo de aditividad basado en un grupo de pptidos.

La contribucin a la capacidad calorifica de un polipeptido en la forma de grupos terminales inicos esta dada por:

Teniendo la contribucin a la capacidad calorfica de la cadena principal,del pptido principal y de los grupos terminales se reemplaza en la ecuacin 1 para obtener la capacidad calorfica molar parcial de una protena desplegada de secuencia desconocida.La capacidad calorfica del pptido principal, CHCONH, esta dada por :

[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution, Biophysical Chemistry (2003), 100, 239-260.Clculo de las capacidades calorficas parciales molares de protenas desplegadas en soluciones acuosas: determinacin de la capacidad calorfica parcial molar.

La capacidad calorfica molar parcial la cadena con cada uno de los 20 aminocidos se calculo por la ecuacin 2.

11

[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution, Biophysical Chemistry (2003), 100, 239-260.12

[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution, Biophysical Chemistry (2003), 100, 239-260.13

[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution, Biophysical Chemistry (2003), 100, 239-260.Conclusiones