presentacion de taller 2015 1.pdf
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Diapositivas de la presentación oral del Taller "Cienciometría, Información e Informática para Ciencias Biológicas" el día 02 de julio de 2014 en el Anfiteatro Alfredo Barrera de la Facultad de Ciencias, UNAMTRANSCRIPT
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Taller: Cienciometría, información e
informática para Ciencias Biológicas
Profesores:Dra. Layla Michán AguirreM. en C. Patricia Magaña RuedaBiól. Diana Ramírez ÁlvarezBiól. Eduardo Alvarez López
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Disciplina científica especializada en caracterizar, estudiar, recolectar, sistematizar, preservar, curar, recuperar, clasificar, evaluar, procesar, compartir, usar, publicar, visualizar y analizar cualitativa y cuantitativamente por procesos computacionales la literatura biológica, los datos y los conocimientos asociados a ésta, de manera innovadora y óptima para la obtener nuevo conocimiento, resolver problemas y tomar decisiones.
Informática Biológica
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Meta-análisisManejo
Recuperación
Búsqueda
Métodos
Análisis de las Ciencias Biológicas
Impacto de la revolución digital en
biología
Difundir
•Estructura•Desarrollo•Tendencias•Métodos•Patrones•Relaciones
Herramientas electrónicasBibliometría
Análisis de redes
Minería de textos
Semántica
Teorías
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Estudios métricos de la información
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Objetivo general
El estudiante realizará una investigación de informática basado en el análisis cuantitativo y cualitativo de literatura biológica y los metadatos asociados para resolver un problema biológico en el área de biomedicina o biodiversidad, durante 2 años (4 niveles) de taller.
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Nivel I. Web para Bibliografía
Nivel III. Meta-análisis de literatura
Nivel II. Colecciones bibliográficas
Nivel IV. Tesis
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Nivel Criterios
I y II 95% Asistencia indispensable para presentar los exámenes40% Dos exámenes parciales: uno teórico y uno práctico40% Trabajo final (Revisión escrita y presentación oral del trabajo)20% Tareas
III 95% Asistencia indispensable para presentar los exámenes30% Dos exámenes parciales: uno teórico y uno práctico50% Trabajo final: tema de tesis tentativo (Revisión escrita y presentación oral del trabajo)20% Tareas
IV 95% Asistencia indispensable para presentar los exámenes20% Dos exámenes parciales: uno teórico y uno práctico60% Trabajo final: avance de tesis (pregunta documental, evaluación de colecciones, hipótesis, método establecido, resultados)20% Presentación oral de los avances de tesis (Incluyendo resultados)
Evaluación
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PROYECTOS ACTUALES
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Biodiversidad
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Creacion de colecciones de literatura en biodiversidadConceptualización coleccionesEstandarización y curación de información biodiversidadEstablecimiento de metadatos
Objetos digitales
Análisis de la información en biodiversidadEstudios métricos de la informaciónObtención de indicadores bibliométricosTendencias de investigación en biodiversidad
Biodiversidad
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Biomedicina
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Estructuración de información biomédicaCreación de tesauros Creación de catálogosEstándares en biomedicina
Bases de datos biomédicas
Creación de colecciones biomédicasCiberinfraestructura en las bases de datos biomédicas
Biomedicina
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➢ Creación de tesauros farmacológicos.➢ Identificación y modificación de plantilla de estándares para curación de
datos farmacológicos. ➢ Diseño de estructura para datos farmacológicos. ➢ Adecuación de estándares internacionales a plantillas y catalogación de
datos farmacológicos. ➢ Curación de datos biomédicos. ➢ Elaboración de vocabularios controlados para reacciones adversas y
efectos secundarios para creación de calculadoras de posología. ➢ Análisis y tendencias de la literatura especializada en biomedicina.➢ Análisis y recuperación de información de bases de datos biomédicas.➢ Generación de competencias informacionales para profesionales,
académicos y comunidad que utiliza información para ciencias biomédicas.
Biomedicina
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➢ Revisión de temas fármaco-fisio-cardiovasculares➢ Revisión de patentes para cardiología➢ Revisión bibliográfica sobre fármaco-fisio-cardiovasculares
➢ Revisión sobre la Superfamilia Conoidea➢ Revisión de
○ Conotoxinas (Conidae) ○ Augertoxinas (Terebridae) ○ Turritoxinas (Turridae)
➢ Revisión bibliográfica sobre venenos de animales marinos➢ Revisión de trabajos sobre Venómica de animales marinos
➢ Revisión bibliográfica de polimorfismos (SNP´s) mexicanos ○ Base de datos bibliográfica y SNP´s en cáncer
Biomedicina
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Mineria de textos
Se refiere al proceso de derivar información de alta calidad a partir de texto, por medio de la detección de tendencias y patrones cualitativa y cuantitativamente en documentos.
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Mineria de textosObtención de patrones de reacciones adversas entre medicamentos oncológicos
Minería de términos estructurados farmacológicos para la determinación de interacciones
Descubrimiento de conocimiento basado en literatura de recursos no maderables de importancia forestal en México
Análisis de la colección bibliográfica de la RSMHN por medio de la minería de textos
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Semántica terminología estructura
INTEROPERABLES
Integración de la información
Integración de la terminología
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Semántica
Las redes de relaciones como fuente de conocimiento, recuperado por web.● Capa XML: se encuentra en el nivel
inferior y es la que permitirá estructurar los datos.
● Capa RDF: es la capa siguiente, tiene a su cargo la definición de la semántica de los datos.
● Capa Ontology: luego viene la capa que define las relaciones entre los recursos.
● Capa Logical: es la capa superior y define las reglas y mecanismos para hacer inferencias sobre los datos.
● Capas Proof y Trust: ejecutan y evalúan juntas las reglas de la capa lógica para determinar la fiabilidad del recurso. Aquí es donde interviene la firma digital, el concepto de comercio seguro.
TOMADO DE. Interacciones.com.ar, (2003). Web semántica, ontologias y rdf | Interacciones. [en línea] Disponible en: http://www.interacciones.com.ar/web-semantica-ontologias-y-rdf/ [Consultado 11 mayo 2014].
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Resultados
En proceso de titulación
9 tesistas CIIB2 tesistas en colaboración
Actualmente
6 publicaciones CIIB5 publicaciones en colaboración
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Apoyos
Proyecto PAPIME “Web 2.0 y 3.0 para el dominio de la literatura biológica”
Proyecto CONACYT “El impacto de las Tecnologías de la Información y la Comunicación (TICs) en las Ciencias Biológicas 1980-2011”
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Reunion informativaDía: Lunes 04 de agosto de 2014Hora: 10:00 amLugar: Laboratorio CIIB Edificio B de Biología Tercer Piso
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ContactoDra. Layla Michán [email protected]
M. en C. Patricia Magaña [email protected]
Biól. Diana Ramírez Á[email protected]
Biól. Eduardo Alvarez Ló[email protected]
Edificio B de Biología Tercer Piso Tel. 56228222 ext. 44707http://ciib.unam.mx:8080/