Genómica y Proteómica

Evolución del diseño de vacunas

Noemí Párraga Niño

Instituto de Biotecnología y Biomedicina

Desarrollo de vacunas

• Estudio proteínas extracelulares: - Adhesión celular

- Invasión células huésped- Detección condiciones físicas y químicas- Generación señales apropiadas

Estrategias de búsqueda

• Genómica: técnica clásica

– Clonación genes– Sobreexpresión– Purificación– Modelos animales

Estrategias de búsqueda

• Proteómica:1.- Bioinformática: predicción de proteínas

de superficie

Ej. Programa PSORT

Estrategias de búsqueda

• Proteómica:2.- Subproteoma de membrana:

- Fracción membrana plasmática- Extracción proteínas- 2D Electroforesis- Espectrometría de masas

ESTRATEGIA GENERAL PARA EL ANÁLISIS DEL PROTEOMA

1ª Dimensión:

Isoelectroenfoque2ª Dimensión,

geles prehechos

Tinción con nitrato de plata

Análisis por MS, MALDI-TOF

Análisis de imagen

Digestión tríptica

High Mr

Low Mr

Estrategias de búsqueda

• Proteómica:3.- Surfoma: identificación proteínas

expuestas en la superficie bacteriana

Importancia surfoma: tan solo el 6,5% proteínas de membrana están expuestas

Surfoma

• Pionero: Manuel Rodríguez-Ortega

Estudio Streptococcus grupo AImportancia en humanosModelo animal conocido

Surfoma

Surfoma

• Identificación 72 proteinas:- Proteinas ancladas a membrana con motivos LPXTG-like- Lipoproteinas- Proteinas transmembrana- Proteinas secretadas

Identificación 4 proteinas citoplaasmáticas

Surfoma

Surfoma

Proteína M: tasa de supervivencia 90%

Buena diana como posible vacuna