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Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

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Page 1: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas

Geol. Roberto Bonifaz AlonsoSubdirector de Cómputo para la Investigación

Page 2: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

La DGSCA se integra de 4 áreas:

• Dirección de Cómputo para la Investigación

• Dirección de Cómputo para la Administración Académica

• Dirección de Cómputo para la Docencia

• Dirección de Telecomunicaciones

Page 3: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Infraestructura física

12 licencias de software para cómputo de alto rendimiento

60 programas de usuarios15 programas de dominio público (6 UN)

Page 4: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Infraestructura

Page 5: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Se utilizan programas y aplicaciones comerciales, de dominio público y desarrollados en el laboratorio de visualización para:

Visualización científicaProcesamiento de datosDinámica de fluídosCálculo numéricoReconstrucción tridimensionalModelación químicaOptimización de programas

Page 6: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Infraestructura

1 Sun Silicon Server 10001 Space Station 212 Space Station 41 Space Station Lx2 Sparcitic Classic1 HP Apollo 73043 Pc Personales

Page 7: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Equipo de video

1 videograbadora Betacam1 videograbadora Super VHS1 videograbadora Unimatic2 Minivac1 Monitor NTSO/PALMCableado de red

Page 8: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Software de cálculo numérico

BLAS LAPACKIMSL NAGDiffpack PetscOverture A++/P++Modolef FidspBiblioteca Científica SGI-CRAY

Page 9: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Software para graficación, visualización y procesamiento de imágenes.

Alias y Maya Image visiónExplorer Open GLKhoros PerformerFloor 3D VolumizerEnsight NCARGraphicsIDL VIKAVS Piotentv

Page 10: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Software de visualización de moléculas:

»Unicherm

» Insight II

» Open Mol

» Molecular Inventor

Page 11: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Servicios a instituciones públicas y privadas:

Cenapred, IMTA, IIE, Instituto Mexicano de Psiquiatría, ININ

Usuarios de consulta bibliográfica con acceso a red, Arch. Gral. de la Nación, CINVESTAV

Batelle, Oracle, SunONU, IFE, Embajada de Francia, Inst. Tecn. Celaya, U. Iberoamericana,, UAM,

ILCE, IPN

Page 12: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Premios obtenidos por investigadores

que apoyamos en sus proyectos:

Blanca Aydé Ruíz y Gustavo Ortega

Instituto de Investigaciones biomédicas (UNAM)

“Three dimensional construction of the kringle like domain of the dengue-2 virus envelope protein forund in the proteins associated vith the human blood clottings’s system an dengue hemmorrhagic fever”

Page 13: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Francisco Sánchez Sesnia

Modelado de la respuesta sísmica del Valle de México

Page 14: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Plan de becarios

A lo largo de 5 años se han formado 5 generaciones de becarios (aproximadamente 30 personas por generación)

Actualmente el plan se ha reestructurado.La fase de entrenamiento se llevaba a cabo

en 6 meses, ahora se terminará en 8 meses.

Page 15: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Plan de Estudios

Módulo básico Introducción al Sistema Operativo UNIX Introducción al SupercómputoFortran con métodos numéricosLenguaje CUtilería de UNIX Interfaces gráficos con TK, Perl y Tel Introducción a la visualización

Page 16: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Paseo virtual en Cacaxtla

Las pinturas originales del lugar se están desgastando por la interperie y el tiempo. La realidad virtual reconstruye los murales.

El fin es que la tecnología apoye al experto.

Page 17: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Simulaciones de dinámica molecular

Page 18: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Simulación molecular

Page 19: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Simulación numérica (MHL)

Page 20: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Estudio de la eficiencia de mezclado de un fluído newtoniano encerrado en un cubo en condiciones de frontera oscilatorias.

Se utiliza seguimiento lograngiano de superficies como técnica de visualización y Alias como software para graficar.

Page 21: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Imágenes de cubo en diferentes fases:

Page 22: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Imágenes médicas obtenidas de un tomógrafo:

Page 23: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Tomografía completa

Page 24: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Modelado tridimensional para cirugía reconstructiva

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Modelación y análisis del flujo sanguíneo en aquellas zonas de las arterias que son susceptibles de presentar patología y desarrollar aneurismas.

Proyecto en colaboración con el Hospital Tommas Jefferson, Philadelphia.

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Diagnóstico del comportamiento de la sangre.

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Prototipo desarrollado en la DGSCA para investigaciones psiquiátricas. Se muestra el equipo.

Page 28: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Representación gráfica de la imagen recibida a través del sistema psiquiátrico desarrollado en la DGSCA, UNAM.

Page 29: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Ambientes colaborativos

Page 30: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Realidad Virtual

Page 31: Poder del Cómputo en la UNAM y Aplicaciones Médicas Geol. Roberto Bonifaz Alonso Subdirector de Cómputo para la Investigación

Siguiente generación de Internet:

•Mayor ancho de banda

•Calidad en el servicio

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Página de información sobre Internet II:

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Preguntas y respuestas

[email protected]

http://www.dgsca.unam.mxhttp://www.labvis.unam.mxhttp://www.super.unam.mxhttp://www.internet.unam.mx