monte carlo na micro-, nano-dosimetria e...

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Monte Carlo na micro-, nano-dosimetria e radiobiologia Mario Antonio Bernal Rodr´ ıguez 1,2 1 Instituto de F´ ısica Gleb Wataghin. UNICAMP. Brasil. 2 GEANT4-DNA collaboration group. Congresso da Sociedade Brasileira de F´ ısica M ´ edica 13 de Agosto de 2015

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  • Monte Carlo na micro-, nano-dosimetria eradiobiologia

    Mario Antonio Bernal Rodrguez 1,2

    1Instituto de Fsica Gleb Wataghin. UNICAMP. Brasil.

    2GEANT4-DNA collaboration group.

    Congresso da Sociedade Brasileira de Fsica Medica13 de Agosto de 2015

  • Sumario

    1 Por que ainda estudar Radiobiologia?Feixes de IonsFeixes de fotons de baixa energia

    2 Radiobiologia

    3 Como estudar o problema?Metodos de estudoMonte Carlo

    4 Problemas estudados recentementeRBE em mamografiaMicrodosimetria

    5 Trabalho atualDesenvolvimento de modelo atomico do material geneticohumano.

    6 Perspectivas

  • Sumario

    1 Por que ainda estudar Radiobiologia?Feixes de IonsFeixes de fotons de baixa energia

    2 Radiobiologia

    3 Como estudar o problema?Metodos de estudoMonte Carlo

    4 Problemas estudados recentementeRBE em mamografiaMicrodosimetria

    5 Trabalho atualDesenvolvimento de modelo atomico do material geneticohumano.

    6 Perspectivas

  • Hadronterapia

    Instalacoes de hadronterapiaa

    aLoeffler, J. S. & Durante, M. Nat. Rev. Clin. Oncology. 2013

  • Missoes aeroespaciais

    Caminhada espacial

    Protecao radiologica

    Raios cosmicos, desdeprotons ate ons pesados

  • Sumario

    1 Por que ainda estudar Radiobiologia?Feixes de IonsFeixes de fotons de baixa energia

    2 Radiobiologia

    3 Como estudar o problema?Metodos de estudoMonte Carlo

    4 Problemas estudados recentementeRBE em mamografiaMicrodosimetria

    5 Trabalho atualDesenvolvimento de modelo atomico do material geneticohumano.

    6 Perspectivas

  • Feixes de fotons.

    Mamografia

    Efetividade biologica

    Feixes entre 25 e 35 kVp. RBE200kVp de ate 4.3 tem sido

    reportados em trabalhosexperimentaisa

    Possvel impacto emBraquiterapia/novos radioisotopos

    a Frankenberg et al. Rad. Research 157, 99?105(2002)b Kellerer. Rad. Research158, 13?22 (2002)

  • Dano ao DNA

    (DNADamage.mp4)

    Dano directo. Partculasionizantes

    Quebra simples de cadeia(SSB).

    Quebra dupla de cadeia (DSB,dist.< 10 bp).

    Quebra multipla de cadeia(MSB, alto LET ).

    Dano indireto. Especies qumicas.

    Produzidas por especies qumicasproduto da radiolise da agua.

    Podem gerar SSB, DSD e MSBtambem

    DNAdamage.mp4Media File (video/mp4)
  • Dano ao DNA

    (DNADamage.mp4)

    Dano directo. Partculasionizantes

    Quebra simples de cadeia(SSB).

    Quebra dupla de cadeia (DSB,dist.< 10 bp).

    Quebra multipla de cadeia(MSB, alto LET ).

    Dano indireto. Especies qumicas.

    Produzidas por especies qumicasproduto da radiolise da agua.

    Podem gerar SSB, DSD e MSBtambem

    DNAdamage.mp4Media File (video/mp4)
  • Sumario

    1 Por que ainda estudar Radiobiologia?Feixes de IonsFeixes de fotons de baixa energia

    2 Radiobiologia

    3 Como estudar o problema?Metodos de estudoMonte Carlo

    4 Problemas estudados recentementeRBE em mamografiaMicrodosimetria

    5 Trabalho atualDesenvolvimento de modelo atomico do material geneticohumano.

    6 Perspectivas

  • Como estudar o problema?

    Metodos de estudo

    Ensaios experimentais (condicoes restringidas e altasincertezas)

    Tecnicas computacionais (grande flexibilidade ecomplementam os experimentos)

  • Sumario

    1 Por que ainda estudar Radiobiologia?Feixes de IonsFeixes de fotons de baixa energia

    2 Radiobiologia

    3 Como estudar o problema?Metodos de estudoMonte Carlo

    4 Problemas estudados recentementeRBE em mamografiaMicrodosimetria

    5 Trabalho atualDesenvolvimento de modelo atomico do material geneticohumano.

    6 Perspectivas

  • O metodo Monte Carlo no transportede Radiacao

    Bases do metodo Processos estocasticos (interacao da radiacao com a

    materia. Densidade de probabilidade (seccoes eficazes) Gerador de numeros pseudo-aleatorios Metodo de amostragem Ex. GEANT4, PENELOPE, EGSnrc, MCNP...

    Simulacao

  • O metodo Monte Carlo emRadiobiologia

    Bases do metodo

    Codigo de Monte Carlo(GEANT4-DNA)

    Modelo geometrico domaterial genetico

    Modelo biofsico paraligar o proceso fsico aobiologico

    Codigo GEANT4-DNA

    Transporte detalhado(event-by-event)

    Eletrons ate 8 eV Ions (H0,1+, He0,1+,2+,

    C6+ ...) ate 1 keV Fotons ate 50 eV

  • O metodo Monte Carlo em micronanodosimetria

    Bases do metodo

    Codigo de Monte Carlo Modelos geometricos simples Determinacao de grandezas microdosimetricas

    estocasticas.

  • Sumario

    1 Por que ainda estudar Radiobiologia?Feixes de IonsFeixes de fotons de baixa energia

    2 Radiobiologia

    3 Como estudar o problema?Metodos de estudoMonte Carlo

    4 Problemas estudados recentementeRBE em mamografiaMicrodosimetria

    5 Trabalho atualDesenvolvimento de modelo atomico do material geneticohumano.

    6 Perspectivas

  • Problema

    Antecedentes

    A efetividade biologica relativa e tomada como 1 para todosos feixes de fotons (RBE=1)

    A transferencia linear de energia (LET) associada a fotonscresce quando a energia decresce

    A qualidade de referencia para determinar a RBE e Co60

    Energia de feixes de mamografia 20 keV (25-35 kVp) Segundo trabalhos experimentais:

    RBECo60(mam.)=1.15-8.6!

    Trabalho realizado

    Determinacao do RBE de feixes usados en mamografia Simulacao da interacao da radiacao com o DNA

    M. Bernal et al. Phys. Med. Biol. 57 (2012) 1745-1757

  • Problema

    Antecedentes

    A efetividade biologica relativa e tomada como 1 para todosos feixes de fotons (RBE=1)

    A transferencia linear de energia (LET) associada a fotonscresce quando a energia decresce

    A qualidade de referencia para determinar a RBE e Co60

    Energia de feixes de mamografia 20 keV (25-35 kVp) Segundo trabalhos experimentais:

    RBECo60(mam.)=1.15-8.6!

    Trabalho realizado

    Determinacao do RBE de feixes usados en mamografia Simulacao da interacao da radiacao com o DNA

    M. Bernal et al. Phys. Med. Biol. 57 (2012) 1745-1757

  • Modelo geometrico e codigo MC

    Simulacoes MonteCarlo

    Uso del codigoPENELOPE

    Modelo geometricocon (5 niveles deorganizacao delDNA)

    28 kVp, 30 kVp eCo60

    M. Bernal et al. Phys. Med. Biol. 57 (2012) 1745-1757

  • Resultados

    Comparacao com resultados experimentais e teoricos

    Reference Biol. endpoint Quality Reference quality Dose (Gy) RBEOur work DSB 28 kVp Co60 25 1.3 0.1

    30 kVp 1.2 0.1Kuhne et al. DSB 29 kVp Co60

  • Sumario

    1 Por que ainda estudar Radiobiologia?Feixes de IonsFeixes de fotons de baixa energia

    2 Radiobiologia

    3 Como estudar o problema?Metodos de estudoMonte Carlo

    4 Problemas estudados recentementeRBE em mamografiaMicrodosimetria

    5 Trabalho atualDesenvolvimento de modelo atomico do material geneticohumano.

    6 Perspectivas

  • Microdosimetria com TEPC

    Energia media depositadaEnergia linear ponderadana dose e LET

    Burigo et al. Journal of Physics B., 2012

  • Sumario

    1 Por que ainda estudar Radiobiologia?Feixes de IonsFeixes de fotons de baixa energia

    2 Radiobiologia

    3 Como estudar o problema?Metodos de estudoMonte Carlo

    4 Problemas estudados recentementeRBE em mamografiaMicrodosimetria

    5 Trabalho atualDesenvolvimento de modelo atomico do material geneticohumano.

    6 Perspectivas

  • Modelo atomico do B-DNA

    Fundamentos

    Posicao explcita de 4x1011 atomos. Para um par debases, os dados foram tomados de experimentos comdifracao de raios-X (res.0.5 A)

    Packing ratios das estruturas envolvidas (nucleossomos,fibra cromatina de 10 nm e 30 nm)

    Passo entre pares de bases. Empacotamento helicoidal Dimensoes dos atomos segundo seus raios de van der

    Waals.

    M. A. Bernal et al. Comp. Phys. Comm., 2013

  • Modelo atomico del B-DNA

    Optimizacao

    Resultados

    Rnucl = Dchrom/6 154 bp/nucleossomo 46 bp/linker fragment Dchrom = 31.38nm

    M. A. Bernal et al. Comp. Phys. Comm., 2013

  • Modelo atomico del B-DNAHelice de DNA

    Nucleossomo

    M. A. Bernal et al. Comp. Phys. Comm., 2013

  • Modelo atomico do B-DNA

    Fibra de cromatina. VL Fibra de cromatina. VS

    M. A. Bernal et al. Comp. Phys. Comm., 2013

  • Perspectivas. Linha atual.

    Tarefas

    Introduzir a simulacao do dano indireto (especiesqumicas). GEANT4-DNA

    Usar o modelo atomico, junto com um modelo biofsicopara determinar RBE de feixes de fotons e ons.

    Melhorar o modelo biofsico com a informacao extrada docalculo com dinamica molecular quantica

    Levar em conta informacao recente sobre estruturacromossomica (HiC maps).

  • Estrutura do material genetico.HiC maps.

    Metodologia.

  • Estrutura do material genetico.HiC maps.

    HiC maps com diferentes enzimas.

  • Estrutura do material genetico.Cromossomos.

    Modelo do material.

    Zoom das estruturas.

  • Resumo final

    O metodo Monte Carlo e uma ferramenta muito poderosapara estudar problemas sobre interacao da radiacao coma materia.

    Os modelos biofsicos para estudar a interacaoradiacao-DNA sao ainda simples, embora os modelosgeometricos sejan muito sofisticados.

    Ainda falta muito para entender bem os mecanismosmediante os quais as radiacoes ionizantes geram danosno DNA.

  • Agradecimentos

    Fundacao de AuxIlio aPesquisa do Estado deSao Paulo

    Universidade Estadual deCampinas

  • Muito obrigado!Grupo de trabalho.

    (a) Liset de laFuente. Cuba.

    (b) Eder Aguirre.Peru.

    (c) John Tello.Colombia.

    (d) Rodrigo Seraide. Brasil.(e) Rafael Silveira. Brasil.

    Por que ainda estudar Radiobiologia?Feixes de onsFeixes de ftons de baixa energiaRadiobiologiaComo estudar o problema?Mtodos de estudoMonte CarloProblemas estudados recentementeRBE em mamografiaMicrodosimetriaTrabalho atualDesenvolvimento de modelo atmico do material gentico humano.Perspectivas