medidas de similaridad y distancia capítulo 6 de mccune y grace 2002, y páginas 37-44 de...
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Medidas de similaridad y distancia
Capítulo 6 de McCune y Grace 2002, y páginas 37-44 de Ruokolainen et al. 2004
Similaridad en composición de las comunidades o unidades de
muestra
Especies A B C
Parcela1 5 3 2
Parcela2 28 12 0
Parcela3 0 0 15
Composición, similaridad y distancia (o disimilaridad)
Espacio de especiesEspacio de muestras
Medidas de distancia
• Categorías:– Métricas:
• Distancia es 0 cuando los objetos son idénticos• Cuando son distintos la distancia es positiva• Distancia entre A y B = distancia entre B y A• Distancia entre 2 de 3 objetos no es > que la suma
de las otras 2 distancias (axioma de la desigualdad del triángulo)
– Semimétricas: puede violar el 4to criterio– Nométricas: viola uno o más de los otros
criterios
Medidas de distancia multidimensional
• Distancia euclidiana– Versión multidimensional del Teorema de
Pitágoras: c2 = a2 + b2 c = √ a2 + b2
Distancia euclidiana =
Species 1
Distancia a lo largo de bloques de ciudad
• Ecuación general:
Species 1
Coeficientes de proporciones
• Estos se pueden convertir a medidas de distancia a lo largo de bloques.– Coeficiente de Jaccard– Coeficiente de Sorensen
Similaridad Jaccard
• Jaccard para presencia/ausencia
• Jaccard =
• Jaccard = spp compartidas / total spp
• Jaccard cuantitativo (incluyendo abundancia de especies)
Similaridad Sorensen
• Sorensen para presencia/ausencia
• Sorensen =
• Sorensen cuantitativo (como distancia):
Distancia Chi cuadrada
• Problemática porque da mucha importancia a especies con poca abundancia.
• Utilizada en programas de multivarianza bien populares (e.g., DCA, CCA)
• Distancia Chi cuadrada:
Desempeño de medidas de distancia
• Si las especies responden a su ambiente, una gráfica de distancias entre comunidades debe reflejar un patrón lineal a lo largo del gradiente ambiental principal
Desempeño de medidas de distancia: euclidiana
Beta bajaBeta alta
Desempeño de medidas de distancia: Sorensen
Beta bajaBeta alta
Desempeño de medidas de distancia: Beta baja
Desempeño de medidas de distancia: Beta alta