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BIOLOGÍA MENCIÓN BM-13 E XPRESIÓN G ÉNICA

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BIOLOGÍA MENCIÓN

BM-13

E X P R E S I Ó N G É N I C A

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INTRODUCCIÓN

La expresión génica es el proceso mediante el cual la información almacenada en el DNA es

usada para dirigir la síntesis de un producto génico específico (proteínas; RNAr; RNAt).

Este producto génico es el responsable de llevar a cabo una función celular específica, la que

terminará manifestándose como un rasgo fenotípico adquirido por la célula en la que esta

información genética se expresa.

Sin embargo, el momento en que esta información genética es expresada, se encuentra altamente

regulada por diversos factores (entre ellos, estímulos ambientales, la acción reguladora de

ciertas hormonas, el grado de condensación de la cromatina, etc.), lo que permite controlar, en

todo momento, la producción adecuada de proteínas, para cuando ellas sean requeridas por el

metabolismo celular.

Durante el proceso de diferenciación celular, la expresión génica se regula de modo que ciertos

genes se "encienden" y otros se "apagan", permitiendo a las células modificar su contenido

proteico y, por lo tanto, su propio fenotipo, que es el requisito necesario para transformar un

tipo celular en otro diferente, lo que da origen a las distintos tipos celulares que constituyen a un

individuo.

Las mutaciones pueden alterar la información almacenada en los genes, originando a partir de

un gen inicial, distintas versiones del mismo (llamadas genes alelos). Estos genes alelos son los

responsables de las variaciones fenotípicas (diversidad biológica) que manifiestan las

poblaciones de seres vivos, sobre las que actúa el proceso de selección natural durante la

evolución de los seres vivos.

1. LOS EXPERIMENTOS QUE DEMOSTRARON QUE EL DNA ES EL

MATERIAL GENÉTICO

Hacia 1887 los investigadores habían llegado a la conclusión de que la base física de la herencia

se hallaba en el núcleo. Se demostró que la cromatina consistía en ácidos nucleicos y proteínas

pero no se sabía con certeza cuál de las dos sustancias era el material genético.

Mientras los químicos procuraban resolver la estructura del DNA, los biólogos trataban de

identificar la fuente de información genética. Se llevaron a cabo experimentos con bacterias y

con virus, que proporcionaron la evidencia fundamental de que el material genético no era la

proteína sino el DNA.

Descubrimiento del principio de transformación

En 1928, F. Griffith observó que la bacteria Streptococcus pneumoniae, productora de la

neumonía humana, se presentaba en dos cepas distintas. Una de ellas es virulenta (provoca la

enfermedad), presenta capsula y forma colonias con aspecto liso; denominada cepa IIIS y a la

otra variante de neumococo, que no presenta cápsula, no produce la enfermedad y forma colonias

rugosas se denominó cepa IIR. Con estas dos cepas Griffith realizo el siguiente experimento

(Figura 1).

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Figura 1. Experimento de Griffith que puso en evidencia la existencia de un principio transformante

El experimento hizo que Griffith llegara a la conclusión de que las bacterias de tipo IIR se

habían transformado de algún modo y habían adquirido la virulencia genética de las bacterias

muertas de tipo IIIS. Esta transformación produjo un cambio genético permanente en las

bacterias, sin embargo Griffith no comprendió la naturaleza de la transformación y supuso que

alguna sustancia de la cubierta de polisacáridos de las bacterias muertas podría explicar el

cambio. A esta sustancia la denominó principio de transformación.

Pregunta: ¿un extracto de bacterias muertas

puede transformar genéticamente células vivas?

Experimento

Conclusión: una sustancia presente en las bacterias virulentas muertas por

acción del calor transformó genéticamente las bacterias de tipo IIR en

bacterias de tipo IIIS virulentas vivas,

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Pregunta: ¿cuál es la naturaleza química de la

sustancia de transformación?

Experimento

Conclusión: dado que solo la DNasa

destruyó la sustancia de transformación, la

sustancia responsable de la transformación

es el DNA.

Identificación del principio de transformación Posteriormente y tras diez años de investigación Avery junto con MacLeod y MacCArty pudieron aislar y purificar esta sustancia. Demostraron que su composición química correspondía al DNA y diferente de las proteínas.

Sometieron a la sustancia a la acción de diversas enzimas, como la tripsina y la quimiotripsina, las cuales actúan en la degradación de las proteínas, pero no tenían ningún efecto sobre esta sustancia. Lo mismo sucedía con la ribonucleasa; enzima que destruye al RNA. Sin embargo las enzimas capaces de destruir el DNA eliminaron la actividad biológica de la sustancia de transformación. (Figura 2). Además los científicos demostraron que la sustancia de transformación purificada se precipitaba con la misma velocidad que el DNA purificado y absorbía la luz ultravioleta en la misma longitud de onda que el DNA. Estos resultados publicados en 1944, fueron la primera evidencia convincente que el principio transformante y por ende la información genética está en el DNA.

Pese a que esta prueba demostraba que el DNA era el principio transformante, muchos biólogos se resistían en aceptar esta idea y preferían la hipótesis de que el material genético era la proteína. Esto principalmente porque las proteínas presentan 20 aminoácidos diferentes para estructurarlos, asegurando con ello una gran diversificación.

Figura 2. Experimentos de Avery, MacLeod

y MacCarty para la identificación del principio de transformación.

El calor mata a las bacterias virulentas, se homogeniza y se filtra.

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Segunda evidencia: Experimento con virus de Hershey - Chase

Frente a la resistencia de muchos biólogos, en 1952 Alfred Hershey y Martha Chase

proporcionaron una segunda evidencia de que el DNA es el material genético.

Estos científicos realizaron un trabajo experimental con el virus T2, un bacteriófago que infecta a

la bacteria Escherichia coli, el cual se reproduce uniéndose a la pared externa de la bacteria,

inyectando su DNA dentro de ella donde se replica y dirige la síntesis de las proteínas propias del

fago. El DNA del fago se encapsula dentro de las proteínas y produce los fagos, que lisan o

rompen la célula y liberando los fagos de la progenie.

En ese momento los biólogos no comprendían con exactitud cómo se reproducían los fagos. Si

sabían que los fagos T2 se componían de un 50 % de proteínas y de un 50 % de ácidos nucleicos

y que los fagos ingresaban a las bacterias y se reproducían. Como la progenie portaba los mismos

rasgos de infección, el material genético de este debía transmitirse a la descendencia, pero se

desconocía el mecanismo.

Hershey y Chase idearon una serie de experimentos para determinar que se transmite durante la

reproducción del fago: la proteína o el DNA.

Para rastrear el destino de las moléculas en la reproducción viral, utilizaron formas radioactivas

(isótopos) del fósforo y azufre. Un isótopo radioactivo puede utilizarse como marcador para

identificar la ubicación de una molécula específica, porque cualquier molécula que contenga el

isótopo es radioactiva y, por ende, fácil de detectar. El DNA contiene fósforo, pero no azufre, por

lo tanto se utilizó 32P para marcar el DNA, en cambio la proteína tiene azufre, pero no fósforo,

por lo que se utilizó 35S .El desarrollo del trabajo experimental de Hershey y Chase se presentan

en la figura 3.

Este trabajo les permitió a los científicos concluir que es el DNA y no la proteína la que entra en la

bacteria durante la reproducción del fago y que solo el DNA se transmite a los fagos de la

progenie.

No obstante, continuaba resultando necesario demostrar cómo un compuesto tan simple podía

almacenar y transmitir tanta información. La respuesta la proporcionó el progresivo conocimiento

de su estructura. Desde que, en 1953, J. Watson y F. Crick mostraron su modelo de estructura

de doble hélice, que explicaba cómo se podía almacenar y transmitir la información genética,

nadie dudó de la función y la importancia del DNA.

El DNA es la macromolécula portadora de los genes. Un gen se define como el factor genético

que contribuye a determinar una característica, las secuencias de ADN que codifica una

molécula de ARN o la secuencia completa del DNA requerida para transcribir y codificar una molécula de RNA.

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Figura 3. Experimento de Hershey y Chase para identificar si el material genético era la proteína o el DNA.

Pregunta: ¿qué parte del fago –el DNA o la proteína- sirve como material genético y se transmite a su progenie?

Experimento

Conclusión: el material genético de los bacteriófagos no es la proteína sino el DNA.

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Exón 3 Exón 1 Exón 2 Exón 4 Promotor Intrón 1 Intrón 2 Intrón 3 Termino

Gen Eucarionte (Unidad de transcripción)

2. CONCEPTO DE GEN

En la actualidad se cuenta con nuevos elementos que permiten precisar algunas definiciones, lo

cual no significa que estos conceptos sean únicos y definitivos, ni que estas concepciones sean las

únicas imperantes.

Los genes tienen diferente longitud y no están ubicados en forma equidistante. Cada gen es una

porción de una molécula de DNA y no tiene extremos físicos. Los genes no son contiguos, sino que

están separados por regiones no codificantes de DNA. Algunos están agrupados y otros aislados

en diferentes regiones del cromosoma.

Una de las posibles definiciones de gen corresponde a todo segmento de DNA que se

encuentra luego de un promotor y que puede ser transcrito por una RNA polimerasa y

originar un RNA funcional (mRNA, rRNA, tRNA, snRNA, ribozima y otros tipos de RNA).

Figura 4. Representación de un gen eucariontes y sus componentes básicos.

Como se observa, muchos genes codifican RNA que nunca se traducen en proteínas, como los

tRNA, los rRNA y los RNA que forman parte de los snRNP. Así, las definiciones clásicas no se

ajustan a los conocimientos actuales.

Los nuevos procedimientos y modelos de la biología molecular nos llevan a revisar

constantemente los conceptos y definiciones que alguna vez resultaron útiles. Esto demuestra,

una vez más, que la biología molecular, tanto como las otras ramas de la biología, es una ciencia

que se construye por medio de un proceso de cuestionamiento permanente, formulando

modelos que pueden ser perfectibles. A su vez, es importante considerar que la biología

molecular brinda un nivel de aproximación de los fenómenos biológicos, pero que existen otros

niveles de organización que influyen y son influidos por los fenómenos que ocurren a nivel de las

bases moleculares de vida.

Los genes que contienen la información que se expresan en la producción regulada de

enzimas y proteínas estructurales permiten controlar las reacciones bioquímicas y la

forma de los organismos.

El material genético se manifiesta dando forma y función a las proteínas, y debe replicarse con la

suficiente fidelidad como para asegurar la continuidad de las especies, pero al mismo tiempo

permitir algunos cambios (variaciones) que sirven de sustrato en la evolución.

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3. RELACIÓN ENTRE GENOTIPO Y FENOTIPO

Primero se definirán ambos términos.

Genotipo: corresponde a la constitución genética de una sola célula o de un organismo con

referencia a una sola característica o a un conjunto de características; la suma total de todos

los genes de un individuo.

Fenotipo: corresponde a las características observables de un organismo que resulta de las

interacciones entre el genotipo y el ambiente.

La relación de genotipo y fenotipo en sus distintos niveles se presenta en la siguiente secuencia

de conceptos:

El fenotipo de un organismo depende del fenotipo de sus partes, que a su vez está determinado

por el fenotipo de sus células componentes.

El fenotipo de una célula está determinado por su química interna, que es controlada por las

enzimas que catalizan sus reacciones metabólicas.

La función de una enzima depende de su estructura tridimensional específica, además depende

de su secuencia lineal específica de aminoácidos.

Las enzimas y las proteínas estructurales, presentes en una célula, están determinadas por el

genotipo de la célula.

Los genes especifican la secuencia lineal de aminoácidos en las proteínas y por lo tanto los

genes determinan el fenotipo.

El fenotipo está determinado por el genotipo más la acción ambiental.

4. FLUJO DE LA INFORMACIÓN GENÉTICA

F. Crick enunció lo que él llamó “el dogma central”, según el cual la información fluye del DNA a

las proteínas en una única dirección.

DNA transcripción

RNA traducción

Proteínas

Así, el genotipo determina el fenotipo, dictando la composición de las proteínas. F. Crick fue

criticado por utilizar el término “dogma” ya que un dogma es algo que no se pone en duda. El

científico reconoció más tarde que debió llamarlo hipótesis central.

Una gran diversidad de experimentos han demostrado que el dogma se cumple, salvo en unas

pocas excepciones. La principal excepción corresponde a la transcripción inversa, en la cual la

información codificada por ciertos virus que contienen RNA se transcribe al DNA por la acción de la

enzima transcriptasa inversa. Por ello el dogma o hipótesis central hoy se presenta así.

DNA transcripción

(transcriptasa

inversa)

RNA traducción

Proteínas replicación

El genoma humano es la totalidad de la información del Homo sapiens, es decir, la

secuencia de ADN contenida en 23 pares de cromosomas en el núcleo de

cada célula humana diploide y la secuencia del ADN mitocondrial.

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5’

3’

DNA

RNA polimerasa

cadena de DNA transcrita

5’ RNA transcrito

Región promotora

3’

5’

5’

3’

5’

Reenrollamiento del DNA

cadena de DNA no transcrita

Desenrollamiento del DNA

3’

Sentido de la transcripción

DNA

3’ 3’

5’

3’ 5’

(no forma parte del marco de lectura)

TRANSCRIPCIÓN O SÍNTESIS DEL RNA

La transcripción consiste en la síntesis de una molécula de RNA a partir de una de las cadenas del

DNA; esta cadena se denomina complementaria, molde, no-codificadora o templado; la otra

hebra del DNA se denomina no complementaria o codificadora (Figura 5). Figura 5. Representación del proceso de transcripción. Observe que la dirección de la trascripción siempre

es de 5´ a 3´, es decir, la elongación o crecimiento de la molécula de RNA es siempre por el extremo 3´.

Es importante destacar que los RNA que se sintetizan a partir de un fragmento de hebra molde o

templada de DNA puede terminar como: RNA mensajero, RNA de transferencia y/o RNA

ribosomal; estos dos últimos no llevan información genética de una proteína, pero son imprescindibles en el proceso de síntesis de ella.

Cuestiones básicas sobre la síntesis de RNA:

Todos los RNAs se sintetizan por medio de reacciones catalizadas por RNA polimerasas,

gracias a la información contenida en el DNA que sirve de patrón o molde. La dirección

de la transcripción siempre va en el sentido 5’ a 3’.

La síntesis se produce por complementariedad de bases. La cadena de RNA que se forma

es complementaria a un fragmento de una de las cadenas de DNA. En la cadena de RNA

no aparecerá la base timina que será sustituida por uracilo.

Existen notables diferencias en la transcripción de células procariontes y eucariontes.

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Etapas de la transcripción:

Se estudió inicialmente en Escherichia coli y el proceso consta de cuatro fases:

A) Iniciación o ensamblaje de moléculas.

B) Elongación o crecimiento de la molécula de RNA.

C) Terminación o conclusión de la cadena de RNA.

Post transcripción.

Maduración o transformación del RNA transcrito.

Se hará un breve análisis de cada una de ellas.

A) Iniciación

La RNA polimerasa se une fuertemente cuando entra en contacto con una secuencia específica de

DNA, llamada promotor. En el promotor se encuentran dos cortas secuencias situadas entre -35 y

-10 nucleótidos del inicio (0) de la transcripción. La misión de las secuencias promotoras es indicar

dónde se inicia la transcripción, en cuál de las dos hebras del DNA y en qué lugar (Figura 6).

Figura 6. Centros promotores y sitio de inicio de la transcripción en la hebra molde o templado de DNA.

B) Elongación

Después de unirse al promotor, la RNA polimerasa abre una región localizada de la doble hélice,

de forma que expone los nucleótidos de ambas cadenas de una pequeña zona del DNA. Una de las

dos cadenas expuestas del DNA actúa como patrón para el apareamiento de las bases

complementarias y se inicia la formación de una cadena de RNA. De esta forma, la cadena de

RNA va creciendo nucleótido a nucleótido en dirección 5’ a 3’ (Figura 7). El proceso de elongación

de la cadena continúa hasta que la enzima encuentra una segunda secuencia especial del DNA, la

señal de terminación.

Inicio de la transcripción

-35 -

0

TTGACA TATATT

DNA -10

Durante la elongación de la cadena de RNA, la polimerización alcanza una velocidad

de 30 nucleótidos por segundo a 37º C. Por consiguiente, una cadena de RNA de

5.000 nucleótidos tarda unos tres minutos en sintetizarse.

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mRNA

Transcrito primario

Transcripción

Cadena no transcrita

Cadena transcrita mRNA

(copia

complementaria

de la cadena de

DNA

transcrita)

DNA

Figura 7. Síntesis de una molécula de mRNA.

C) Terminación

Existen diversas señales de terminación en el DNA molde que son secuencias que desencadenan

la separación de la enzima RNA polimerasa de la cadena molde y del RNA transcrito.

D) Maduración

En procariontes el RNA mensajero, antes de terminar el proceso de transcripción empieza a

ser traducido, por lo tanto no necesita de maduración, habitualmente son policistrónicos. Los

RNA ribosomal y de transferencia se forman a partir de transcritos primarios. La maduración

consiste en modificaciones tales como rupturas de la cadena y añadidos de nucleótidos (-CCA)

en el extremo terminal 3’. Un solo tipo de RNA polimerasa permite transcribir todos los tipos de

RNA y es distinta a las observadas en eucariontes.

En eucariontes cada gen eucariota se transcribe separadamente (monocistrónico), con un

control transcripcional independiente para cada uno. Las células eucariontes poseen tres tipos

distintos de RNA polimerasas cada una de los cuales es responsable de la transcripción de los

diferentes tipos de RNA: La RNA polimerasa I transcribe el rRNA (RNA ribosomal) la RNA

polimerasa II el pre –mRNA y algunos snRNAy la polimerasa III el tRNA.

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Los distintos RNA transcritos en los eucariontes presentan una serie de especializaciones no

encontradas en procariontes. A medida que transcurre la transcripción, las moléculas de mRNA,

llamadas transcritos primarios, son modificadas. Esto ocurre antes de que sean transportadas

al citoplasma, que es el sitio donde ocurre la traducción. Las modificaciones son varias e incluyen:

1. Adición del CAP: Un nucleótido modificado de guanina (CAP) se añade al extremo 5’ del

mensajero. Este “protección” es imprescindible para la unión del mRNA al ribosoma y

protege al mRNA de la degradación por exonucleasas citoplasmáticas.

2. Poliadenilación: En el extremo 3’ del mRNA hay una secuencia señal (AAUAAA) a la que se

unen factores específicos y la enzima poli-A polimerasa. Esta enzima estimula la escisión en

un sitio ubicado 10 a 35 nucleótidos hacia el extremo 3’ de la señal. Luego, la enzima

agrega, de a uno, una cola de ribonucleótidos de adenina (cola de poli-A) y así se genera el

extremo 3’ del mRNA maduro. Esta cola de poli-A, contiene 100-250 nucleótidos y parecería

que influyen en la estabilidad y en la capacidad de que los mRNA sean traducidos en el

citoplasma.

3. Corte y empalme o splicing: Durante la transcripción, el mRNA sufre un proceso de corte

y eliminación de secuencias que no llevan información llamadas intrones, y el

posterior empalme de los exones; secuencias que si llevan información. En un primer paso

se unen al mRNA inmaduro unas pequeñas partículas de RNA nucleares asociadas con

proteínas denominadas snRNP (del inglés, small nuclear ribonucleo-protein particles). Las

snRNP se unen a secuencias cortas ubicadas entre los intrones y los exones. Luego se

añaden más proteínas y forman un gran complejo con el RNA que se denomina spliceosoma.

Además de desempeñar funciones de reconocimiento de esas secuencias, las snRNP llevan a

cabo funciones catalíticas.

Figura 8. Procesamiento del mRNA en eucariontes.

CAP Protección

5’

5’

CAP Protección

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El proceso de splicing, catalizado por spliceosomas, ocurre solo en organismos eucariotas. Las

secuencias que se eliminan son los intrones, mientras que las secuencias que permanecen y

forman parte del mRNA maduro son los exones.

Figura 9. Procesamiento diferencial del RNA mensajero.

En muchos casos, un mismo transcrito primario o pre mRNA (RNA heteronuclear) puede ser

procesado por splicing en más de una forma. Este empalme alternativo permite obtener

moléculas de mRNA maduro diferentes a partir de moléculas de mRNA inmaduro originalmente

idénticas, lo cual da por resultado polipéptidos con distintas funciones; un mismo gen puede

producir una proteína en un tejido y otra distinta en otro tejido.

Esto es posible porque algunos genes producen moléculas de pre-mRNA que tienen múltiples

patrones de empalme. Se ha observado que estos pre-mRNA presentan un segmento que puede

ser Intrón o Exón. Este procesamiento diferencial del RNA nuclear permite, a las células de cada

tejido, producir su propia versión de mRNA correspondiente al gen específico (Figura 9).

El investigador Thonas R. Cech y sus colaboradores, en los Estados Unidos, estudiando el splicing

del rRNA en un ciliado de agua dulce llamado Tetrahymena, encontraron que en estos organismos

unicelulares eucariontes el propio intrón del rRNA inmaduro actúa como catalizador de la escisión

y el empalme, es decir, se produce un empalme autocatalítico. Esta secuencia de RNA se pliega

formando una estructura compleja que funciona como enzima, que se ha denominado ribozima.

Se han encontrado otros ejemplos de empalme autocatalítico en varios organismos, en RNA

codificados por genes mitocondriales o de cloroplastos, en algunos genes nucleares de eucariontes

unicelulares y en algunos genes de bacteriófagos, pero no en eucariontes multicelulares.

De gran importancia es el hecho que los genes eucariontes poseen en su estructura exones

e intrones, situación no observada en procariontes. El número de intrones varía para cada

gen, sin embargo, su número aumenta a medida que el organismo es más complejo y de

reciente evolución. Se ha propuesto que los intrones promueven la recombinación genética

(vía crossing-over), y por lo tanto aumentan la velocidad de evolución (de cambio).

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GENES INTERRUMPIDOS POR INTRONES

En las células eucariontes existen secuencias llamadas intrones que interrumpen a los

exones. Estos intrones se transcriben a moléculas de ARN, pero se escinden antes de la

traducción en proteínas por medio del proceso corte y empalme; los exones en cambio

persisten en el ARN maduro. El número y tamaño de los intrones por gen varía

considerablemente: por ejemplo el gen que codifica la ovoalbúmina, una proteína muy

abundante de los huevos de las aves posee siete intrones largos, mientras el gen para una

de las subunidades de la hemoglobina en mamíferos, la globina beta tiene solo dos

intrones. A continuación se presenta un trabajo de hibridación de un fragmento de DNA

con su ARN mensajero maduro, que pone en evidencia los siete intrones.

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C

ARN

Hebra ADN molde

¿Sentido de la reacción?

ARN polimerasa

ACTIVIDAD 1

1. El siguiente esquema muestra etapas de la transcripción del DNA.

¿Cuál es el orden del proceso? Anote la letra que corresponda en la línea de puntos.

1°………………………… 2°……….…………….. 3°…………………………… 4°……………………………

2. La figura representa el proceso de transcripción.

Al respecto:

¿Cuál es el sentido de la reacción? Rellene la punta correcta de la flecha.

Las hebras del ADN son antiparalelas. Pinte la hebra que va de 3’ a 5’

¿Cuál extremo de la doble hélice de ADN se va desenrollando el de su izquierda o el de su

derecha? Justifique

………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

Anote en cada extremo del ARN, ¿cuál es el extremo 5’ y cuál extremo es el 3’? Justifique su

respuesta.

………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

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5. CÓDIGO GENÉTICO

El código genético es el “diccionario” usado para lograr la traducción de la información genética,

escrita en lenguaje nucleotídico de cuatro bases nitrogenadas, a un “idioma” aminoacídico

escrito con un abecedario de veinte letras. Los veinte aminoácidos que encontramos formando

parte de las proteínas de un ser vivo, están representados en el código genético de la agrupación

de tres bases nucleotídicas (triplete o codón) de las cuatro existentes. Este código fue “descifrado”

por Marshall, Nirenberg, Heinrich Matthaei, Robert Holley y Har Gobind Khorana, 10 años

después que James D. Watson y Francis Crick “desentrañaran” el misterio de la estructura del

DNA.

Cada triplete constituye un codón; existen en total 64 codones; 61 de ellos codifican

aminoácidos y 3 son codones de término para el cese de la traducción. Tal cantidad deriva de una

relación matemática simple: los cuatro nucleótidos (A, U, C y G) se combinan de a tres, por lo que

pueden generarse 64 (43) combinaciones; en cambio la relación de 41 o 42 nucleótidos, no

permitirá generar una cantidad adecuada de combinaciones para codificar los 20 aminoácidos.

El código genético es universal, degenerado (redundante) y no traslapado.

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6. TRADUCCIÓN O SÍNTESIS DE LAS CADENAS POLIPEPTÍDICAS

La síntesis de las cadenas polipeptídicas es la segunda etapa observada en el dogma central, y es

el proceso por el cual la información lineal, escrita con cuatro letras (A, U, G, C), se traduce en

información tridimensional, escrita con 20 letras (20 aminoácidos). Si bien esta etapa es, en sus

fundamentos, similar entre procariontes (bacterias) y eucariontes, existen diferencias que serán

mencionadas a medida que se avance en el desarrollo del tema.

mRNA, el transportador de la información

El mRNA es la molécula responsable de transportar la información lineal, que debe traducirse a

información tridimensional (proteínas). En bacterias, el mRNA es traducido, sin mayor

modificación, aun cuando su síntesis no haya concluido. Por esto, se puede decir que en bacterias

la transcripción y traducción son eventos paralelos, que ocurren en un mismo compartimiento (en

el citoplasma celular). En el caso de los eucariontes, los eventos de transcripción y traducción se

hallan separados, espacial y temporalmente.

Los mRNA se sintetizan fundamentalmente en el núcleo de la célula eucarionte y se combinan con

diversas proteínas, formando complejos ribonucleoproteicos heterogéneos nucleares o hnRNP.

Ribosoma, “la fábrica de proteínas”

Microscópicamente, la estructura sub-celular relacionada con la síntesis proteica es un corpúsculo

denominado ribosoma (Figura 10). Esta estructura está formada por una sub-unidad menor y una

mayor.

La sub-unidad menor presenta el sitio de reconocimiento y unión al mRNA y la sub-unidad

mayor posee la enzima que efectúa la unión peptídica (peptidil transferasa) y los sitios para los

tRNA, denominados: sitio P (por peptidil), sitio A (por aminoacil) y sitio E (por exit, salida)

Figura 10.

Figura 10. Anatomía de un ribosoma.

Subunidad mayor

Subunidad menor

Subunidad mayor ribosomal

Sitio E

Sitio P Sitio

A

Sitio de unión del ARNm

P

Subunidad menor

del ribosoma

E P A

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tRNA, el vehículo de los aminoácidos

Los tRNA son las moléculas adaptadoras que permiten traducir el código de nucleótidos a

aminoácidos para la síntesis de proteínas. Reconocen tripletes de nucleótidos (codones) por un

extremo de su molécula (anticodón) y en el otro extremo (3’) llevan un determinado

aminoácido, que el ribosoma se encarga de unir covalentemente con otros aminoácidos, siguiendo

en este caso el molde de tripletes que trae el mRNA. Figura 11.

Figura 11. Codón y anticodón.

Aminoacil-tRNA sintetasa, una enzima clave

El aminoácido se une a su correspondiente tRNA por la acción de una enzima llamada aminoacil-

tRNA sintetasa.

Cada aminoácido se activa por su aminoacil-tRNA sintetasa correspondiente. Hay 20 enzimas

distintas ,una para cada aminoácido.

Aminoácido + ATP + tRNA Aminoacil + tRNA + AMP + PPi

Aminoacil + tRNA sintetasa

Algunos investigadores se refieren a esta reacción como la carga del tRNA. La energía usada en

la carga del aminoácido a su correspondiente tRNA, queda depositada en la unión química entre el

aminoácido y el tRNA. Esta energía será utilizada posteriormente por la actividad de la peptidil

transferasa presente en la subunidad mayor del ribosoma para la formación del enlace peptídico.

Codón

3’

Anticodón

Aminoácido leucina

ARNm

5’ …

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Etapas de la síntesis de cadenas polipeptídicas

En términos generales, se puede afirmar que la traducción es similar en procariontes y

eucariontes, salvo algunas particularidades que los diferencian. En las secciones siguientes se

concentrará la explicación en la maquinaria traductora de la bacteria Escherichia coli. En dichas

secciones, se mencionarán las diferencias con el sistema eucarionte.

A) Iniciación

Es la unión de la subunidad menor a la región del mRNA que contiene el codón de inicio AUG.

Posteriormente se une el tRNA iniciador cargado con el residuo N-formilmetionina. Por este

motivo, el primer aminoácido incorporado durante la síntesis de muchas proteínas bacterianas es

una metionina modificada, la N-formilmetionina (Figura 12).

El inicio es algo diferente en los eucariontes, donde el mRNA es reconocido por la subunidad

menor solo cuando ésta ha unido previamente la molécula de tRNA iniciador cargado con el

residuo aminoacídico metionil, y algunos factores de iniciación eucarióticos.

Figura 12. Formación del complejo de iniciación.

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B) Elongación

El proceso de elongación de la cadena polipeptídica sobre un ribosoma se puede considerar como

un ciclo de tres etapas (Figura 13):

1) El tRNA cargado que se introduce en el sitio A, vacío, quedará cerca de la N-fornilmetionil-

tfMetRNA, que está localizada en el sitio P.

2) Formación del primer enlace peptídico cuando la N-formilmetionina del tRNA iniciador se une

al residuo aminoacídico unido al segundo tRNA ubicado en el sitio A. El ribosoma se desplaza

tres nucleótidos en dirección del extremo 3´ del mRNA, quedando libre un nuevo sitio A.

3) Los procesos citados se repiten de forma sucesiva codón tras codón. Se calcula que se agregan

a la cadena, en promedio, cinco aminoácidos por segundo, deteniéndose la incorporación

cuando al sitio A llega alguno de los codones de término.

Figura 13. Elongación de la cadena polipeptídica.

C) Terminación

En esta etapa, el sitio A del ribosoma es abordado por alguno de los codones de término y

ocupado por un factor de terminación, RF en las bacterias y eRF (eucaryotic releasing factor) en

eucariontes. La cadena polipeptídica terminada se libera del último tRNA. Se disocian las sub-

unidades ribosomales y el mRNA, quedando disponibles la subunidades ribosomales para ser

utilizados en una nueva síntesis (Figura 14).

Figura 14. Terminación de la traducción.

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Traducción y Polirribosomas

Tanto en las células procariontes y eucariontes las moléculas de mRNA se traducen por la

acción de múltiples ribosomas, las estructura resultante –un mRNA con varios ribosomas -se

denomina polirribosma o polisoma. Cada ribosoma se une sucesivamente al sitio que une

ribosomas en el extremo 5’ del mensajero y se mueve hacia el extremo 3’; el polipéptido

asociado con cada ribosoma progresivamente se torna más largo a medida que el ribosoma

se mueve sobre el mRNA.

En las células procariontes la transcripción y traducción son simultáneas; por tanto, pueden

unirse múltiples ribosomas al extremo 5’ del mRNA, mientras que la transcripción aun está en

proceso en el extremo 3’.

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ACTIVIDAD 2

1. En un trabajo de investigación microinyectó RNA de secuencia 5’ UUU UUU UUU 3’ en

células bacterianas de Listeria monocytogenes y se formó un polipéptido con una secuencia

de un aminoácido único y en células de roble Chileno (Nothofagus oblicua) se formó otro

polipéptido también con una secuencia de aminoácidos única, pero totalmente diferente al

anterior. ¿Qué propiedad del código genético podría ser cuestionada con este hipotético

resultado experimental?

……………………………………………………………………………………………………………………………………………………….

……………………………………………………………………………………………………………………………………………………….

2. En este ribosoma en plena traducción se observan tres ARNt.

Al respecto, conteste:

a) ¿Cuál es el anticodón que posee y el aminoácido que trae el ARNt que se está ubicando

en el sitio A?

………………………………………………………………………………………………………………………………………………

b) ¿Cuál es el anticodón que posee y el aminoácido que trajo el ARNt que está ubicado en

el sitio P?

………………………………………………………………………………………………………………………………………………

c) ¿Cuál es el anticodón que posee y el aminoácido que trajo el ARNt que está saliendo del

sitio E?

………………………………………………………………………………………………………………………………………………

Ribosoma

ARNt

Anticodón

3’ Codones 5’

U U U U C G G G G

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7. MUTACIONES GÉNICAS O PUNTUALES

Las mutaciones en los organismos unicelulares se transmiten necesariamente a la descendencia.

En los organismos pluricelulares solo se transmite a la descendencia una mutación si esta ocurre

en las células germinales, es decir, aquellas que darán lugar a gametos.

En las mutaciones génicas se afecta la secuencia de pares de bases de un gen, estas mutaciones

pueden ser consecuencia de: sustituciones, adiciones o deleciones.

Sustituciones: se cambia una base por otra, según sea el problema causado, se clasifican

como: neutras, con sentido erróneo y sin sentido.

Neutras: al cambiar la base, cambia el triplete pero codifica el mismo aminoácido

Con sentido erróneo: al cambiar una base cambia el triplete y este codifica otro aminoácido.

Sin sentido: aparece un triplete de término que pone fin a la síntesis de la proteína por adelantado.

Tipo de Sustituciones

Mensaje original

ADN 3’ TAC TCA AAC ACG ATA

ARN 5’ AUG AGU UUG UGC UAU

Proteína met ser leu cys tyr

Sustitución neutra

ADN 3’ TAC TCA GAC ACG ATA

ARN 5’ AUG AGU CUG UGC UAU

Proteína met ser leu cys tyr

Con sentido erróneo

ADN 3’ TAC TCA AGC ACG ATA

ARN 5’ AUG AGU UCG UGC UAU

Proteína met ser ser cys tyr

Sin sentido

ADN 3’ TAC TCA ATC ACG ATA

ARN 5’ AUG AGU UAG UGC UAU

Proteína met ser Stop

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Deleción y Adición de bases: En estos tipos de mutaciones puntuales se corre el marco de

lectura de los tripletes del ARNm, y aparecen proteínas muy distintas .En la deleción se pierde

un par de bases del DNA indicándose en el esquema con una flecha la perdida correspondiente a

la base de la hebra molde y en la adición se incorpora un par de bases en el ADN, también

indicándose en el esquema con una flecha la base que se adicionó en la hebra molde.

DELECIÓN Mensaje original

ADN 3’ TAC TCA AAC ACG ATA

ARN 5’ AUG AGU UUG UGC UAU

Proteína met ser leu cys tyr

ADN 3’ TAC TCA AA

C

A CGA TA...

ARN 5’ AUG AGU UUU GCU AU

Proteína met ser phe ala

ADICIÓN

Mensaje original

ADN 3’ TAC TCA AC ACG ATA

ARN 5’ AUG AGU UUG UGC UAU

Proteína met ser leu cys tyr

ADN 3’ TAC TCA AA CAC GAT …..A

ARN 5’ AUG AGU GUU GUG CUA….. U

Proteína met ser val val leu

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GLOSARIO

Codón (triplete): Secuencia de tres nucleótidos en el mRNA que codifica para un aminoácido. Expresión génica: Proceso por el cual la información codificada en los genes se convierte en las estructuras operacionales presentes en las células. Los genes expresados incluyen a aquellos que han sido transcritos a mRNA y luego traducidos a proteínas y aquellos que han sido transcritos a RNA pero no traducidos a proteínas (p.ej. tRNA y rRNA). Exón: Porción de una molécula de DNA en eucariontes que codifica parte de un polipéptido. Genes: Unidades hereditarias que conforman los cromosomas. Estos segmentos específicos de DNA controlan las estructuras y funciones celulares; la unidad funcional de la herencia. Secuencia de bases de DNA que usualmente codifican para una secuencia polipeptídica de aminoácidos. Inserción: Tipo de mutación en la cual se intercalan una o más bases de DNA en una secuencia de bases de DNA preexistente. Esto produce un corrimiento del marco de lectura en el proceso de síntesis proteica dando, por lo general, como resultado una proteína alterada. Intrón: La secuencia de bases de DNA en eucariontes que interrumpe la secuencia de un gen que codifica para una proteína, esta secuencia se transcribe al mRNA pero en un proceso de "corte y empalme" se separa del mismo antes que el mRNA sea traducido a proteína. Mutación: El cambio de un gen de una forma alélica a otra, cambio que resulta heredable. Modificación hereditaria del material genético espontánea o inducida. Mutágeno: Agente desencadenante de mutaciones. Polimerasa (DNA o RNA): Enzimas que catalizan la síntesis de ácidos nucleicos en base a templados preexistentes, utilizando ribonucleótidos para el RNA y desoxirribonucleótidos para el DNA. Promotor: Sitio del DNA donde se unirá la RNA polimerasa para iniciar la transcripción. RNA (ácido ribonucleico): Ácido nucleico formado por una cadena polinucleotídica. Su nucleótido, consiste en una molécula del azúcar ribosa, un grupo fosfato, y una de estas cuatro bases nitrogenadas: adenina, uracilo, citosina y guanina. RNA mensajero: "Molde" para la síntesis proteica que es copiado de una de las hebras de DNA y que se traduce en los ribosomas en una secuencia proteica. Se abrevia mRNA. RNA polimerasa: Complejo enzimático que cataliza la síntesis de RNA (transcripción) utilizando como molde la cadena de una molécula de DNA. En eucariontes existen tres RNA polimerasas: la I sintetiza rRNA de gran tamaño; la II es la que forma al mRNA; y la III se encarga de transcribir rRNA pequeños y tRNA. Secuencia de bases: el orden de las bases de los nucleótidos en una molécula de DNA. Traducción: La síntesis de una proteína sobre un "molde" de mRNA, consiste en tres etapas: iniciación, elongación y terminación. Transcripción: síntesis de RNA.

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Revisión de preguntas oficiales PSU DEMRE con referencia curricular y

comentario

1. Si en una célula se inhibe la transcripción y al cabo de unas horas, sus componentes

moleculares se comparan con los de una célula intacta, se constatará que la primera tendrá

una menor cantidad de

I) ARNt.

II) ARNm.

III) Proteínas.

A) Solo I

B) Solo II

C) Solo III

D) Solo II y III

E) I, II y III

FICHA DE REFERENCIA CURRICULAR

Módulo Electivo

Contenido: Flujo de la información génica.

Eje temático: Organización, Estructura y Actividad Celular.

Curso: 4º Año Medio.

Clave: E

Habilidad intelectual medida: Aplicación.

Dificultad: Alta; fue contestada correctamente sólo por el 12% de los postulantes. Presentó una

omisión del 18%.

COMENTARIO:

Los resultados obtenidos en esta pregunta muestran un conocimiento parcial de los aspectos

fundamentales de un proceso biológico central, como es el flujo de la información biológica. Este

flujo es resumido en el dogma central de la biología molecular, que hoy se expresa correctamente

como:

ADN ARN Proteína

De acuerdo a este esquema, el postulante debe saber que la Transcripción corresponde a la

síntesis enzimática de un polinucleótido de ARN utilizando como molde una hebra de ADN. En este

sentido todos los tipos de ARN (mensajero, transferencia, ribosomal y los pequeños, como los que

forman parte de la estructura de la partícula SRP o de la maquinaria de corte y empalme de

exones) son generados por Transcripción y por lo tanto, están codificados en genes. Luego el

ARNm, el ARNt y el ARNr participan en la Traducción, que es el proceso en donde se determina el

orden de aminoácidos de una proteína, que es el principal fenotipo biológico encargado de las

funciones vitales. Como se señala en el diagrama, la replicación del ADN y la Transcripción se

llevan a cabo gracias a proteínas, lo mismo que el metabolismo de lípidos y glúcidos, los que no

aparecen en el diagrama, no obstante ser componentes esenciales de la célula. De acuerdo a esto

la Traducción es dependiente de la Transcripción y, en un sentido temporal asincrónico, la

Transcripción es dependiente de que se hayan expresado los genes encargados de producir la

Transcripción. En resumen, para responder correctamente la pregunta, el postulante debe inferir

que un procedimiento que inhibe la Transcripción traerá como consecuencia no sólo una

disminución en la cantidad de los distintos tipos de ARN (se debe recordar que las moléculas

tienen una vida media finita), sino que también redundará en la no aparición de nuevas proteínas.

Como era de esperar, el principal distractor resultó ser la alternativa B, que incluye el tipo de ARN

mencionado siempre como principal producto resultante de la Transcripción.

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2. Considere las siguientes secuencias de oligonucleótidos:

Secuencia 1: 5’- ACGGCCTTCAAGTCAGG -3’

Secuencia 2: 5’- ACGGCCTTCAAGGGACT -3’

Si la secuencia 1 de ADN mutó a la secuencia 2 durante el ciclo de vida de una célula,

entonces, es correcto afirmar que el nuevo ADN ha sufrido una

A) duplicación.

B) inversión.

C) traslocación.

D) deleción.

E) inserción.

FICHA DE REFERENCIA CURRICULAR

Módulo electivo

Eje temático: Organización, estructura y actividad celular.

Contenido: La relación entre estructura y función de las proteínas estructurales como

expresiones de la información genética. Mutaciones, proteínas y enfermedad.

Curso: 4 Año Medio.

Clave: B.

Habilidad cognitiva: Análisis, síntesis y evaluación.

Dificultad: Alta.

COMENTARIO:

A pesar de que los diversos tipos de cambio que ocurren a nivel genético son tratados a partir del

segundo año de enseñanza media y luego el tema se retorna en cuarto año, desde el punto de

vista molecular, esta pregunta resultó ser de alta complejidad para los postulantes. Sólo un 13%

contestó correctamente y el porcentaje de omisión alcanzó un 31,55% del total. Ello no, refleja

directamente un desconocimiento sobre este tema, sino más bien conceptos mal adquiridos o

poco aplicados.

Esta pregunta fue contestada correctamente (clave B) por aquellos postulantes con más alto

puntaje. El distractor C fue el que atrajo mayor cantidad de postulantes, y fue elegido por el

segundo grupo de más alto puntaje, lo que denota una posible confusión de los distintos tipos de

cambios que pueden ocurrir a nivel genético. El distractor D tuvo menor aceptación dentro del

universo de postulantes, lo cual permite inferir que los postulantes supieron descartar un cambio

o mutación que involucra una pérdida de cierto segmento en una secuencia.

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3. Después de agregar un compuesto C a un cultivo celular, se hicieron mediciones, en distintos

tiempos, de los niveles intracelulares de ADN (curva 1), ARN mensajero (curva 2) y proteínas

(curva 3), como se muestra en el gráfico:

De acuerdo con los resultados mostrados en la gráfica, es posible inferir correctamente que el

compuesto C

A) favorece la transcripción.

B) favorece la duplicación del ADN.

C) inhibe la transcripción.

D) inhibe la traducción.

E) inhibe la síntesis del ADN.

FICHA DE REFERENCIA CURRICULAR

Módulo: Electivo

Área / Eje temático: Organización, estructura y actividad celular.

Nivel: IV Medio.

Contenido: Traducción del mensaje de los genes mediante el flujo de la información genética del

gen a la síntesis de proteínas.

Habilidad cognitiva: Análisis, síntesis y evaluación.

Clave: D.

Dificultad: Alta.

COMENTARIO

Esta pregunta requiere, fundamentalmente, que los estudiantes sean capaces de analizar los

resultados de una situación experimental a través de un gráfico, entender los resultados que éste

presenta, y a partir de ellos, ser capaces de llegar a algunas conclusiones. Por lo tanto, los

postulantes deben hacer uso de las habilidades cognitivas de mayor desarrollo, como son el

análisis, síntesis y evaluación de la información entregada.

Además, para contestar correctamente, deben también conocer el significado de algunos

conceptos, como replicación o duplicación de ADN, transcripción y traducción.

El gráfico muestra que el proceso de replicación (curva 1) no es afectado por el compuesto C, por

lo tanto se descartan las opciones B) y E). Tampoco se altera la transcripción (curva 2), por lo que

las opciones A) y C) son también incorrectas. La curva 3, sin embargo, muestra una caída

importante en los niveles de proteínas. Ello significa que el compuesto C está interfiriendo el

proceso de traducción, por lo que la opción D) es correcta.

La pregunta resultó de alta dificultad, ya que sólo el 13% de los postulantes respondió la clave.

El alto porcentaje de omisión con el cual resultó la pregunta, que alcanzó el 63,5%, indica la falta

de manejo de los contenidos por parte de los postulantes, y a la vez, la carencia del desarrollo de

las habilidades cognitivas anteriormente mencionadas. DMCA-BM13

Unid

ades a

rbitra

rias

Tiempo 0

10

3

1

2